プレゼンテーション3

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14 1. AAAAAAAA 2.

15 NCBI Ensembl UCSC Genome browser

16 UCSC Genome browser

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20 Genome browser :download

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22 26250

23 1. EST 2.

24 InterProScan

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26 InterProScan

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29 WoLF PSORT

30 cdna CDS

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32 Oligo-capping AP- 5

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38 Case 1 5 UTR ORF ignored Case 2 TSS with max number of clones Median locus of TSS ignored

39 DBTSS ver. 5

40 Weblogo SEQLOGO Weblogo

41 Ribosomal protein mrna TSS -10~+10 45

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43 Ribosome protein (45 ) (880

44 A B C D

45 TRANSFAC Public DBTSS Link JASPAR

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51 1. FASTA 2. 3.submit

52 sequence logo

53 sequence logo 4.

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58 pre-mature

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60 参考文献 Database issue Web server issue

61 UNIX R Perl, ruby, python, C++, C

62 refgene.txt cut -f 3 refgene.txt sort uniq -c Mac OSX 2 refgene.txt 3. cd ~/Desktop 4. cut -f 3 refgene.txt sort uniq -c

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