ヒトゲノム情報を用いた創薬標的としての新規ペプチドリガンドライブラリー PharmaGPEP TM Ver2S のご紹介 株式会社ファルマデザイン

Size: px
Start display at page:

Download "ヒトゲノム情報を用いた創薬標的としての新規ペプチドリガンドライブラリー PharmaGPEP TM Ver2S のご紹介 株式会社ファルマデザイン"

Transcription

1 ヒトゲノム情報を用いた創薬標的としての新規ペプチドリガンドライブラリー PharmaGPEP TM Ver2S のご紹介 株式会社ファルマデザイン

2 薬剤の標的分子別構成 核内受容体 2% DNA 2% ホルモン 成長因子 11% 酵素 28% イオンチャンネル 5% その他 7% 受容体 45% Drews J,Science 287, (2000) G 蛋白質共役受容体 (GPCR) はターゲットとして非常に重要 世界の医薬品売上上位 20 品目のうち 13 品目が GPCR をターゲット

3 ヒトゲノム上の GPCR 創薬の対象となりうる GPCR ClassA ClassB ClassC total リガンド既知の GPCR において 4 割近くがペプチドリガンド Liganded 192( 71) 20( 20) ( 91) Orphan Total IUPHAR (): ペプチドリガンドを持つ GPCRの数 オーファンGPCR134 種類が創薬ターゲット候補 したがって ペプチドリガンドを持つオーファン GPCR は %=50 個くらい存在? しかし 従来の生体試料を用いた探索では ペプチドリガンドが微量なため探索が困難 そこで... リガンド同定を支援するために ヒトゲノム情報をもとに バイオインフォマティクスを駆使し ペプチドリガンドライブラリーを構築 PharmaGPEP TM

4 PharmaGPEP によるオーファン GPCR ペプチドリガンド探索の利点 従来技術生体試料からの抽出 精製による探索 新技術 (PharmaGPEP TM ) ヒトゲノム情報に基づくゲノムワイドなペプチドリガンドの探索 AGCTTTAGCATTCTTC CAATATAGAAGTCGTC AGCTTTAGTATTCATC CTATGTAGCACTCCTC GCATTATC 問題点 ターゲットとなるペプチドの単離が困難 ペプチドのサンプルが微量しか抽出できない サンプルを大量に必要とするハイスループット スクリーニングには不向き 新規なオーファン GPCR のペプチドリガンド探索は困難 利点 候補ペプチドの合成が可能 充分な濃度のサンプルを調製することができ より高精度なスクリーニングが可能 サンプルが大量に用意できるためハイスループット スクリーニングが可能 より高効率かつ高精度にペプチドリガンドの探索が可能

5 PhramaGPEP TM 探索の手順 1. 網羅的な前駆体候補の探索 ヒトゲノム情報から リガンド前駆体の配列的特徴をもとに探索 2. ペプチドリガンド候補の抽出 ペプチドリガンドの生合成 前駆体候補から ペプチドリガンドの配列的特徴をもとに抽出

6 ペプチドリガンドの生合成 ペプチドリガンド前駆体 BB Gln BB BB GlyBB シグナルペプチターゼ BB Gln BB BB GlyBB プロセッシング Gln Gln グルタミンシクラーゼ pyrogln BB カルボキシペプチターゼ ペプチドリガンド GlyBB Gly アミダーゼ NH2 前駆体にはペプチドリガンドが活性化される特徴的な配列が存在する B: 塩基性残基 (K[ リジン ],R[ アルギニン ])

7 パターンマッチングを用いた ペプチドリガンド候補の探索 予備検討として典型的な切断部位パターンを用いて配列データベースからペプチド候補を探索 配列データベース :IPIVer ,530 本ペプチド残残基数 :8-60a.a 切断部位パターン [KR][ KR]X(7,59){G }[KR][KR]160,864 [KR][KR]X(8,60)G[KR][KR] 19,042 [KR][KR]X(8,60 )*> 60,903 合計 240,809 単純なパターンマッチングではペプチド候補が膨大な数となり これをすべて合成すると莫大な費用がかかる バイオインフォマティクスとデータマイニングを用いてペプチド候補を絞り込む必要がある!! PROSITE 表記 [KR] K あるいはR {G} G 以外のアミノ酸 X 任意のアミノ酸 > STOP

8 PhramaGPEP TM におけるペプチドリガンド候補探索 既知ペプチドリガンド前駆体 73 配列 バイオインフォマティクス 既知ペプチドリガンド前駆体から配列的特徴を抽出 切断部位のプロファイル HMM を用いた配列予測 データマイニング & バイオインフォマティクス ペプチドリガンド候補 タンパク質配列データベース IPI,ensembl, 完全長 cdna,h -Invitational 総数 585,931 本 2004 年 5 月 ( 重複有 ) 既知ペプチドを含む 機能既知前駆体の除去 SS 結合数残基数 (6-40a.a) ライブラリ候補 1390 本 データマイニングとバイオインフォマティクスを活用することにより 効率的にペプチド候補を取得できる そして より生物的活性をもつペプチドを探索するため SS 結合に着目

9 SS 結合を持つペプチド -1- 既知ペプチドリガンドには SS 結合を含むペプチドが多く存在 以下は予測できた主なペプチドリガンド Peptide_Name Adrenomedullin. Calcitoningene-relatedpeptide I. Calcitoningene-relatedpeptide II. Islet amyloidpolypeptide. Calcitonin. Orexin-A. Somatostatin-28. Melanin-concentrating hormone. Cortistatin-17. UrotensinII. Oxytocin. Arg-vasopresin. Urotensin-2B Peptide_Seq YRQSMNFQGLRSFGCRFGTCTVQKLAHQIYQFTDKDKDNVAPRSKISPQGY ACDTATCVTHRLAGLSRSGVVKNNFVPTNVGSKAF ACNTATCVTHRLAGLSRSGMVKSNFVPTNVGSKAF KCNTATCATQRLANFLVHSSNNFGAILSSTNVGSNTY CGNLSTCMLGTYTQDFNKFHTFPQTAIGVGAP QPLPDCCRQKTCSCRLYELLHGAGNHAAGILTL SANSNPAMAPRERKAGCKNFWKTFTSC DFDMLRCMLGRVYRPCWQV DRMPCRNFFWKTFSSCK ETPDCFWKYCV CYIQNCPLG CYFQNCPRG ACFWKYCV *inter chain のみ * 色文字が Cys( 同一色で SS 結合を架橋 ) * 赤文字下線のペプチドは創薬ターゲットとして上市

10 SS 結合を持つペプチド 予測に用いた既知ペプチドリガンド SS 有の比率 18.37% SS 結合数 2/ ペプチド総残基数 9.71% Uniprot / SwissProt SS 有の比率 17.55% SS 結合数 2/ 総残基数 1.85% 前駆体の SS 結合を含む比率は同じ程度だが ペプチド内に出現する SS 結合の頻度は高い ライブラリ候補のうち SS 結合を含むペプチドは 112 配列 化学合成し ライブラリ化 PharmaGPEP TM Ver2S

11 PharmaGPEP TM Ver2S の製品特長 HPLC による精製 純度 60% 以上 HPLC 精製を行うことによって不純物の含量が少なくなり より高精度にペプチド本体の活性を評価することが可能 修飾 SS 結合が保持されるよう合成 ペプチド含量 各ペプチドにつき 100nmol 供給 濃度依存性 または多くの検体にアッセイ可能 cf) FLIPR calcium assay kit を用いて接着細胞に測定する場合 10μM 10-6 M 96 ウエル 200 アッセイ可能 ( 理論値 ) 384 ウエル 400 アッセイ可能 ( 理論値 )

12 PharmaGPEP TM Ver2S 製品仕様 アミノ酸残基数 6-40 残基 本数 99 本 修飾 SS 結合を保持 配列的特徴から N 末端ピログル化 C 末端アミド化処理 形態

核内受容体遺伝子の分子生物学

核内受容体遺伝子の分子生物学 核内受容体遺伝子の分子生物学 佐賀大学農学部 助教授和田康彦 本講義のねらい 核内受容体を例として脊椎動物における分子生物学的な思考方法を体得する 核内受容体遺伝子を例として脊椎動物における遺伝子解析手法を概観する 脊椎動物における核内受容体遺伝子の役割について理解する ヒトや家畜における核内受容体遺伝子研究の応用について理解する セントラルドグマ ゲノム DNA から相補的な m RNA( メッセンシ

More information

本日の内容 HbA1c 測定方法別原理と特徴 HPLC 法 免疫法 酵素法 原理差による測定値の乖離要因

本日の内容 HbA1c 測定方法別原理と特徴 HPLC 法 免疫法 酵素法 原理差による測定値の乖離要因 HbA1c 測定系について ~ 原理と特徴 ~ 一般社団法人日本臨床検査薬協会 技術運営委員会副委員長 安部正義 本日の内容 HbA1c 測定方法別原理と特徴 HPLC 法 免疫法 酵素法 原理差による測定値の乖離要因 HPLC 法 HPLC 法原理 高速液体クロマトグラフィー 混合物の分析法の一つ 固体または液体の固定相 ( 吸着剤 ) 中で 液体または気体の移動相 ( 展開剤 ) に試料を加えて移動させ

More information

Microsoft PowerPoint - 2_(廣瀬宗孝).ppt

Microsoft PowerPoint - 2_(廣瀬宗孝).ppt TrkA を標的とした疼痛と腫瘍増殖 に効果のあるペプチド 福井大学医学部 器官制御医学講座麻酔 蘇生学領域 准教授 廣瀬宗孝 1 研究背景 癌による痛みはWHOの指針に沿って治療すれば 8 割の患者さんで痛みが取れ 残りの内 1 割は痛みの専門医の治療を受ければ痛みが取れる しかし最後の1 割は QOLを良好に保ったまま痛み治療を行うことは困難であるのが現状である TrkAは神経成長因子 (NGF)

More information

<4D F736F F D B82C982C282A282C482512E646F63>

<4D F736F F D B82C982C282A282C482512E646F63> サンプル条件および固定化分子の選択 Biacoreの実験ではセンサーチップに固定化する分子をリガンド それに対して結合を測定する分子をアナライトと呼びます いずれの分子をリガンドとし アナライトとするかは 実験系を構築する上で重要です 以下にサンプルに適したリガンド アナライトの設計方法やサンプルの必要条件などをご紹介します アナライト リガンド センサーチップ (1) タンパク質リガンドとしてもアナライトとしても用いることができます

More information

thermofisher.com mirVana miRNA mimics/inhibitors 検索マニュアル

thermofisher.com mirVana miRNA mimics/inhibitors 検索マニュアル thermofisher.com mirvana mirna mimics/inhibitors 検索マニュアル 2018 年 10 月版 The world leader in serving science mirna mimics/inhibitors 製品ラインナップ mirna mimics / inhibitors の製品ライナップ : Mimics : Gain-of-function

More information

Microsoft PowerPoint - 3rd-jikken-vscreen [互換モード]

Microsoft PowerPoint - 3rd-jikken-vscreen [互換モード] 生命情報実験第一 ( 情報系 ) バイオインフォマティクスの道具箱 タンパク質化合物相互作用解析: バーチャルスクリーニング 慶應義塾大学生命情報学科榊原康文, 佐藤健吾 リード化合物探索とインフォマティクス High Throughput Screening 実験的検証 リード化合物 = 薬剤候補 薬剤標的タンパク質 初期候補 実験的検証 + インフォマティクス 1. 大量化合物の探索 2. 成功率向上

More information

1. 背景血小板上の受容体 CLEC-2 と ある種のがん細胞の表面に発現するタンパク質 ポドプラニン やマムシ毒 ロドサイチン が結合すると 血小板が活性化され 血液が凝固します ( 図 1) ポドプラニンは O- 結合型糖鎖が結合した糖タンパク質であり CLEC-2 受容体との結合にはその糖鎖が

1. 背景血小板上の受容体 CLEC-2 と ある種のがん細胞の表面に発現するタンパク質 ポドプラニン やマムシ毒 ロドサイチン が結合すると 血小板が活性化され 血液が凝固します ( 図 1) ポドプラニンは O- 結合型糖鎖が結合した糖タンパク質であり CLEC-2 受容体との結合にはその糖鎖が 参考資料配布 2014 年 11 月 10 日 独立行政法人理化学研究所 国立大学法人東北大学 血小板上の受容体 CLEC-2 は糖鎖とペプチド鎖の両方を認識 - マムシ毒は糖鎖に依存せず受容体と結合 - 本研究成果のポイント レクチンは糖鎖とのみ結合する というこれまでの考え方を覆す CLEC-2 受容体は同じ領域でマムシ毒とがんに関わる糖タンパク質に結合 糖鎖を模倣したペプチド性薬剤の設計への応用に期待

More information

Dr, Fujita

Dr, Fujita 免疫組織化学染色における抗原賦活の原理について考える 東京医科大学病理学講座 藤田浩司 はじめにパラフィン切片により証明される抗原の種類は, この十数年のうちに飛躍的に増加した. 元来, 免疫組織化学法は凍結切片やアセトンを用いた固定により抗原温存を図っていたが, 現在ではホルマリン固定材料のパラフィン切片によっても多くの抗原の同定が可能となった. その理由には, 1) ホルマリン固定に抵抗性の抗原を認識するモノクローナル抗体の開発

More information

プロジェクト概要 ー ヒト全遺伝子 データベース(H-InvDB)の概要と進展

プロジェクト概要 ー ヒト全遺伝子 データベース(H-InvDB)の概要と進展 個別要素技術 2 疾患との関連情報の抽出 予測のための 技術開発 平成 20 年 11 月 18 日産業技術総合研究所バイオメディシナル情報研究センター分子システム情報統合チーム 今西規 1 個別要素技術 2 課題一覧 1 大量文献からの自動知識抽出と文献からの既知疾患原因遺伝子情報の網羅的収集 2 疾患遺伝子情報整備と新規疾患遺伝子候補の予測 3 遺伝子多型情報整備 1 大量文献からの自動知識抽出と

More information

5_motif 公開版.ppt

5_motif 公開版.ppt 配列モチーフ 機能ドメイン 機能部位 機能的 構造的に重要な部位 は進化の過程で保存 される傾向がある 進化的に保存された ドメイン 配列モチーフ 機能ドメイン中の特徴的な 保存配列パターン マルチプルアライメント から抽出 配列モチーフの表現方法 パターン プロファイル 2 n n n n n n n n ENCODE n PROSITE パターンの例 n C-x(2,4)-C-x(3)-[LIVMFYWC]-x(8)-H-x(3,5)-H.

More information

Microsoft PowerPoint - プレゼンテーション1

Microsoft PowerPoint - プレゼンテーション1 A A RNA からタンパク質へ mrna の塩基配列は 遺伝暗号を介してタンパク質のアミノ酸の配列へと翻訳される trna とアミノ酸の結合 RNA 分子は 3 通りの読み枠で翻訳できる trnaは アミノ酸とコドンを結びつけるアダプター分子である (Ψ; プソイドウリジン D; ジヒドロウリジンどちらもウラシルが化学修飾したもの ) アミノアシル trna 合成酵素によって アミノ酸と trna

More information

受精に関わる精子融合因子 IZUMO1 と卵子受容体 JUNO の認識機構を解明 1. 発表者 : 大戸梅治 ( 東京大学大学院薬学系研究科准教授 ) 石田英子 ( 東京大学大学院薬学系研究科特任研究員 ) 清水敏之 ( 東京大学大学院薬学系研究科教授 ) 井上直和 ( 福島県立医科大学医学部附属生

受精に関わる精子融合因子 IZUMO1 と卵子受容体 JUNO の認識機構を解明 1. 発表者 : 大戸梅治 ( 東京大学大学院薬学系研究科准教授 ) 石田英子 ( 東京大学大学院薬学系研究科特任研究員 ) 清水敏之 ( 東京大学大学院薬学系研究科教授 ) 井上直和 ( 福島県立医科大学医学部附属生 受精に関わる精子融合因子 IZUMO1 と卵子受容体 JUNO の認識機構を解明 1. 発表者 : 大戸梅治 ( 東京大学大学院薬学系研究科准教授 ) 石田英子 ( 東京大学大学院薬学系研究科特任研究員 ) 清水敏之 ( 東京大学大学院薬学系研究科教授 ) 井上直和 ( 福島県立医科大学医学部附属生体情報伝達研究所准教授 ) 内山進 ( 大阪大学大学院工学研究科准教授 ) 2. 発表のポイント :

More information

論文題目  腸管分化に関わるmiRNAの探索とその発現制御解析

論文題目  腸管分化に関わるmiRNAの探索とその発現制御解析 論文題目 腸管分化に関わる microrna の探索とその発現制御解析 氏名日野公洋 1. 序論 microrna(mirna) とは細胞内在性の 21 塩基程度の機能性 RNA のことであり 部分的相補的な塩基認識を介して標的 RNA の翻訳抑制や不安定化を引き起こすことが知られている mirna は細胞分化や増殖 ガン化やアポトーシスなどに関与していることが報告されており これら以外にも様々な細胞諸現象に関与していると考えられている

More information

(案-1)

(案-1) 薬食審査発 0930 第 1 号 平成 26 年 9 月 30 日 各都道府県衛生主管部 ( 局 ) 長殿 厚生労働省医薬食品局審査管理課長 ( 公印省略 ) 医薬品の一般的名称について 標記については 医薬品の一般的名称の取扱いについて ( 平成 18 年 3 月 31 日薬食発第 0331001 号厚生労働省医薬食品局長通知 ) 等により取り扱っているところであるが 今般 我が国における医薬品一般的名称

More information

13FG-生物-問題_H1.indd

13FG-生物-問題_H1.indd 平成 25 年度次世代の科学技術を担う人材育成事業 福岡県 高校生科学技術コンテスト 総合問題 生物 注意事項 1 試験開始の合図があるまで, この問題冊子の中を見てはいけません 2 試験中に問題冊子の印刷不鮮明, ページの落丁 乱丁及び解答用紙の汚れなどに気付いた場合は, 挙手をして監督者に知らせなさい ただし, 問題内容にかかわる質問は, 受け付けません 3 解答用紙には, 解答欄以外に次の記入欄があるので,

More information

Microsoft Word - タンパク質溶液内酵素消化 Thermo

Microsoft Word - タンパク質溶液内酵素消化 Thermo タンパク質の溶液内酵素溶液内酵素消化 ( 質量分析用サンプル調製 ) 質量分析計によるタンパク質解析においては 一般的にタンパク質を還元 アルキル化した後にトリプシン等で酵素消化して得られた消化ペプチドサンプルが用いられます 本資料ではこのサンプル調製について 専用キットを用いて行う方法 各種試薬や酵素を用いて行う方法 また関連情報として タンパク質の定量法についてご紹介しています 内容 1 培養細胞の酵素消化

More information

スライド 1

スライド 1 タンパク質 ( 生化学 1) 平成 29 年 4 月 20 日病態生化学分野 分子酵素化学分野教授 山縣和也 生化学 1のスケジュール 4 月 20 日 講義開始 6 月 1 日 中間試験 9 月 25 日 生化学 1 試験 講義日程 内容は一部変更があります 講義資料 ( 山縣 吉澤分 ): 熊本大学病態生化学 で検索 ID: Biochem2 パスワード :76TgFD3Xc 生化学 1 の合否判定は

More information

研究の背景と経緯 植物は 葉緑素で吸収した太陽光エネルギーを使って水から電子を奪い それを光合成に 用いている この反応の副産物として酸素が発生する しかし 光合成が地球上に誕生した 初期の段階では 水よりも電子を奪いやすい硫化水素 H2S がその電子源だったと考えられ ている 図1 現在も硫化水素

研究の背景と経緯 植物は 葉緑素で吸収した太陽光エネルギーを使って水から電子を奪い それを光合成に 用いている この反応の副産物として酸素が発生する しかし 光合成が地球上に誕生した 初期の段階では 水よりも電子を奪いやすい硫化水素 H2S がその電子源だったと考えられ ている 図1 現在も硫化水素 報道解禁日時 : 平成 29 年 2 月 14 日 AM5 時以降 平成 29 年 2 月 10 日 報道機関各位 東京工業大学広報センター長岡田 清 硫化水素に応答して遺伝子発現を調節するタンパク質を発見 - 硫化水素バイオセンサーの開発に道 - 要点 地球で最初に光合成を始めた細菌は 硫化水素を利用していたと推測 硫化水素は哺乳類で 細胞機能の恒常性維持や病態生理の制御に関わるが 詳細なシグナル伝達機構は不明

More information

■リアルタイムPCR実践編

■リアルタイムPCR実践編 リアルタイム PCR 実践編 - SYBR Green I によるリアルタイム RT-PCR - 1. プライマー設計 (1)Perfect Real Time サポートシステムを利用し 設計済みのものを購入する ヒト マウス ラットの RefSeq 配列の大部分については Perfect Real Time サポートシステムが利用できます 目的の遺伝子を検索して購入してください (2) カスタム設計サービスを利用する

More information

底膜は基板上にラミニン由来の接着ペプチドを結合させることにより, 基底膜の機能 を模倣した膜である. 応用例として皮膚移植が挙げられ, 移植医療などに利用される ことが期待されている. 2. 目的これまで, ラミニンから多くの細胞接着ペプチドが同定されているが, 上述した EF1 ペプチドは α2β

底膜は基板上にラミニン由来の接着ペプチドを結合させることにより, 基底膜の機能 を模倣した膜である. 応用例として皮膚移植が挙げられ, 移植医療などに利用される ことが期待されている. 2. 目的これまで, ラミニンから多くの細胞接着ペプチドが同定されているが, 上述した EF1 ペプチドは α2β 氏名 ( 本籍 ) 山田寛尚 ( 東京都 ) 学位の種類博士 ( 生命科学 ) 学位記番号学位授与の日付学位授与の要件学位論文題目論文審査委員 博第 101 号平成 29 年 3 月 15 日学位規則第 4 条第 1 項該当分子動力学法を用いたラミニン由来ペプチドの構造解析 ( 主査 ) 高須昌子教授 小島正樹教授 野水基義教授 森本高子准教授 論文内容の要旨 1. 背景生体内を構成するオルガネラ,

More information

先端生物工学演習Ⅱ 「タンパク質の電気泳動」

先端生物工学演習Ⅱ  「タンパク質の電気泳動」 先端生物工学演習 Ⅱ タンパク質の電気泳動 2008 年 10 月 14 日 ( 旧 ) 進化生命システム学塚田幸治 1 話の中身 電気泳動という手法 ( 一般 ) アミノ酸の電荷とタンパク質の電荷 具体的な実験手法について ( 原理 ) Native( ( 構造や機能が破壊されていないタンパク質 ) SDS( ( 変性条件下でのタンパク質 ) 応用例 等電点電気泳動法と二次元電気泳動 非特異的染色法と特異的染色法

More information

5-53 -

5-53 - 5-53 - プロテオームプロファイリング ( タンパク質組成分析 ) は組織 血液などのペプチドやタンパク質の検出を目指す技術です 液体クロマトグラフィー タンデム質量分析法に基づき タンパク質の混合物を質量分析法で同定し データ解析が行われます トランスクリプトーム解析とともに 生体システムにおけるダイナミックな変化を網羅的に解析できます 高解像度と高精度 : 解像度は 10 5 超 精度は 1ppm

More information

Microsoft PowerPoint - DNA1.ppt [互換モード]

Microsoft PowerPoint - DNA1.ppt [互換モード] 生物物理化学 タンパク質をコードする遺伝子 (135~) 本 PPT 資料の作成には福岡大学機能生物研究室のホームページを参考にした http://133.100.212.50/~bc1/biochem/index2.htm 1 DA( デオキシリボ核酸 ) の化学的特徴 シャルガフ則とDAのX 線回折像をもとに,DAの構造が予測された (Watson & Crick 1953 年 ) 2 Watson

More information

Untitled

Untitled 上原記念生命科学財団研究報告集, 26 (2012) 3. 糸状菌の未利用遺伝子発現による天然物創出 大島吉輝 Key words: 糸状菌, 二次代謝物, 未利用遺伝子, エピジェネティクス 東北大学大学院薬学研究科医薬資源化学分野 緒言医薬品開発にとって重要な役割を果たしている糸状菌 ( カビ類 ) のゲノム解読が進むにつれ, 二次代謝物の生産に関わる多くの未利用生合成遺伝子の存在が明らかになってきた.

More information

DiovNT

DiovNT Peptide Antisera and Monoclonal Antibodies (2) Antisera of Yanaihara Institute Inc. Monoclonal Antibodies Peptide Antisera and Antisera of Yanaihara Institute Inc. 274 Manufacturer: YANAIHARA INSTITUTE

More information

FMO法のリガンド-タンパク質相互作用解析への応用

FMO法のリガンド-タンパク質相互作用解析への応用 2010 年 10 月 8 日学術総合センター 地球シミュレータ産業利用シンポジウム 2010 フラグメント分子軌道 (FMO) 法の創薬に おける分子シミュレーションへの応用 小澤基裕 * 1 小沢知永 * 1 半田千彰 * 1 辻英一 * 1 岡崎浩輔 * 1 新宮哲 * 2 数納広哉 * 2 上原均 * 2 *1 キッセイ薬品工業株式会社創薬研究部創薬基盤研究所 *2 独立行政法人海洋研究開発機構

More information

報道発表資料 2007 年 8 月 1 日 独立行政法人理化学研究所 マイクロ RNA によるタンパク質合成阻害の仕組みを解明 - mrna の翻訳が抑制される過程を試験管内で再現することに成功 - ポイント マイクロ RNA が翻訳の開始段階を阻害 標的 mrna の尻尾 ポリ A テール を短縮

報道発表資料 2007 年 8 月 1 日 独立行政法人理化学研究所 マイクロ RNA によるタンパク質合成阻害の仕組みを解明 - mrna の翻訳が抑制される過程を試験管内で再現することに成功 - ポイント マイクロ RNA が翻訳の開始段階を阻害 標的 mrna の尻尾 ポリ A テール を短縮 60 秒でわかるプレスリリース 2007 年 8 月 1 日 独立行政法人理化学研究所 マイクロ RNA によるタンパク質合成阻害の仕組みを解明 - mrna の翻訳が抑制される過程を試験管内で再現することに成功 - 生命は 遺伝子の設計図をもとにつくられるタンパク質によって 営まれています タンパク質合成は まず DNA 情報がいったん mrna に転写され 次に mrna がタンパク質の合成工場である

More information

Microsoft Word - Fluo4 Direct Calcium Assay Kits_J1_3Apr2009.doc

Microsoft Word - Fluo4 Direct Calcium Assay Kits_J1_3Apr2009.doc Fluo-4 Direct Calcium Assay Kit カタログ番号 F10471 F10472 F10473 表 1. 製品内容および保存方法 試薬 Fluo-4 Direct カルシウムアッセイ試薬 (Component A) 量 F10471 F10472 F10473 10 10 ml 1 100 ml 1 1 L 水溶性プロベネシド (Component B) 2 77 mg 2

More information

大学院博士課程共通科目ベーシックプログラム

大学院博士課程共通科目ベーシックプログラム 平成 30 年度医科学専攻共通科目 共通基礎科目実習 ( 旧コア実習 ) 概要 1 ). 大学院生が所属する教育研究分野における実習により単位認定可能な実習項目 ( コア実習項目 ) 1. 組換え DNA 技術実習 2. 生体物質の調製と解析実習 3. 薬理学実習 4. ウイルス学実習 5. 免疫学実習 6. 顕微鏡試料作成法実習 7. ゲノム医学実習 8. 共焦点レーザー顕微鏡実習 2 ). 実習を担当する教育研究分野においてのみ単位認定可能な実習項目

More information

60 秒でわかるプレスリリース 2007 年 1 月 18 日 独立行政法人理化学研究所 植物の形を自由に小さくする新しい酵素を発見 - 植物生長ホルモンの作用を止め ミニ植物を作る - 種無しブドウ と聞いて植物成長ホルモンの ジベレリン を思い浮かべるあなたは知識人といって良いでしょう このジベ

60 秒でわかるプレスリリース 2007 年 1 月 18 日 独立行政法人理化学研究所 植物の形を自由に小さくする新しい酵素を発見 - 植物生長ホルモンの作用を止め ミニ植物を作る - 種無しブドウ と聞いて植物成長ホルモンの ジベレリン を思い浮かべるあなたは知識人といって良いでしょう このジベ 60 秒でわかるプレスリリース 2007 年 1 月 18 日 独立行政法人理化学研究所 植物の形を自由に小さくする新しい酵素を発見 - 植物生長ホルモンの作用を止め ミニ植物を作る - 種無しブドウ と聞いて植物成長ホルモンの ジベレリン を思い浮かべるあなたは知識人といって良いでしょう このジベレリンをもう少し紹介すると ほうれん草やレタスなどの野菜や小麦などの穀物にも威力を発揮し 細胞を生長させる働きがあります

More information

の活性化が背景となるヒト悪性腫瘍の治療薬開発につながる 図4 研究である 研究内容 私たちは図3に示すようなyeast two hybrid 法を用いて AKT分子に結合する細胞内分子のスクリーニングを行った この結果 これまで機能の分からなかったプロトオンコジン TCL1がAKTと結合し多量体を形

の活性化が背景となるヒト悪性腫瘍の治療薬開発につながる 図4 研究である 研究内容 私たちは図3に示すようなyeast two hybrid 法を用いて AKT分子に結合する細胞内分子のスクリーニングを行った この結果 これまで機能の分からなかったプロトオンコジン TCL1がAKTと結合し多量体を形 AKT活性を抑制するペプチ ド阻害剤の開発 野口 昌幸 北海道大学遺伝子病制御研究所 教授 広村 信 北海道大学遺伝子病制御研究所 ポスドク 岡田 太 北海道大学遺伝子病制御研究所 助手 柳舘 拓也 株式会社ラボ 研究員 ナーゼAKTに結合するタンパク分子を検索し これまで機能の 分からなかったプロトオンコジンTCL1がAKTと結合し AKT の活性化を促す AKT活性補助因子 であることを見い出し

More information

計画研究 年度 定量的一塩基多型解析技術の開発と医療への応用 田平 知子 1) 久木田 洋児 2) 堀内 孝彦 3) 1) 九州大学生体防御医学研究所 林 健志 1) 2) 大阪府立成人病センター研究所 研究の目的と進め方 3) 九州大学病院 研究期間の成果 ポストシークエンシン

計画研究 年度 定量的一塩基多型解析技術の開発と医療への応用 田平 知子 1) 久木田 洋児 2) 堀内 孝彦 3) 1) 九州大学生体防御医学研究所 林 健志 1) 2) 大阪府立成人病センター研究所 研究の目的と進め方 3) 九州大学病院 研究期間の成果 ポストシークエンシン 計画研究 2005 2009 年度 定量的一塩基多型解析技術の開発と医療への応用 田平 知子 1) 久木田 洋児 2) 堀内 孝彦 3) 1) 九州大学生体防御医学研究所 林 健志 1) 2) 大阪府立成人病センター研究所 研究の目的と進め方 3) 九州大学病院 研究期間の成果 ポストシークエンシング時代のゲノム科学研究では 多因子性 遺伝性疾患の関連解析による原因遺伝子探索が最重要課題であ 1.

More information

表紙.indd

表紙.indd No. 陽イオン交換クロマトグラフィーを用いたペプチドの分離 目 次 ページ. はじめに. ペプチドの性質. カラム. 検出波長. 溶離液. 溶離条件の影響 -. カラム種類の影響 -. 有機溶媒濃度の影響 -. 有機溶媒種類の影響 -. 塩種類の影響 -. 温度の影響 -. 溶離液の p の影響. 他の分離モードとの比較. まとめ 東ソー株式会社 . はじめにペプチド医薬品は その分子サイズから中分子医薬品とも呼ばれ

More information

PowerPoint プレゼンテーション

PowerPoint プレゼンテーション 細胞の情報伝達 (1) 何を学習するか細胞が環境からシグナル ( 刺激 ) を受けて 細胞の状態が変化するときに 細胞内でどのような現象が起きているか を知る分子の大変複雑な連続反応であるので 反応の最初の段階を中心に見ていく ( 共通の現象が多いから ; 疾患の治療の標的となる分子が多い ) これを知るために (2) リガンドの拡散様式 ( 図 16-3) リガンドを発現する細胞とこれを受け取る細胞との

More information

Microsoft PowerPoint - 翻訳後修飾

Microsoft PowerPoint - 翻訳後修飾 N 末端 Gly ミリスチル化 タンパク質のアミノ酸残基の翻訳後修飾 N-グリコシル化 O-グリコシル化ジスルフィド結合 Ser/Thr Asn Cys Cys Ser/Thr Tyr リン酸化 アセチル化 Lys Lys メチル化 Arg Cys GPI 付加 C 末端 ユビキチン化 SUMO 化脂肪酸の付加 ポリユビキチン化モノユビキチン化 ビタミン K 依存性凝固因子のプロセシング グルタミン酸の

More information

<4D F736F F F696E74202D F88A497D58B5A D94C797E189EF5F5F96C F A8A8889BB82C982C282A282C45F8DC58F492E707074>

<4D F736F F F696E74202D F88A497D58B5A D94C797E189EF5F5F96C F A8A8889BB82C982C282A282C45F8DC58F492E707074> 免疫染色 賦活化について 2009 年 6 月 20 日愛臨技病理研究班例会 西尾市民病院中村広基 染色性に影響を与える素因 固定 組織 染色手技 種類 状態 内因性酵素活性 試薬 実施 ホルマリン アルコール 過固定固定不良 細胞外への抗原の遊出ペルオキシダーゼアルカリフォスタファーゼビオチン 一次抗体の保存 濃度検出系抗体の種類 賦活化の方法 時間 緩衝液内因性酵素活性の除去抗体反応の温度 時間実施中の乾燥洗浄不良

More information

_PressRelease_Reactive OFF-ON type alkylating agents for higher-ordered structures of nucleic acids

_PressRelease_Reactive OFF-ON type alkylating agents for higher-ordered structures of nucleic acids 令和元年 6 月 20 日 東北大学多元物質科学研究所 DNA の特殊構造選択的な化学修飾に成功反応性 OFF-ON 型核酸アルキル化剤を開発 発表のポイント 創薬標的である核酸の高次構造をピンポイントに化学修飾できる新しいアルキル化剤の開発に成功した 高次構造の例として 抗がん剤の標的であるグアニン四重鎖構造 遺伝性神経筋疾患の一因であるチミン-チミン (T-T) ミスマッチ構造で選択的な化学修飾を実現した

More information

負荷試験 検体採取 患者の検査前準備 検体採取のタイミング 記号 添加物 ( キャップ色等 ) 採取材料 採取量 測定材料 F 凝固促進剤 + 血清分離剤 ( 青 細 ) 血液 3 ml 血清 H 凝固促進剤 + 血清分離剤 ( ピンク ) 血液 6 ml 血清 検体ラベル ( 単項目オーダー時 )

負荷試験 検体採取 患者の検査前準備 検体採取のタイミング 記号 添加物 ( キャップ色等 ) 採取材料 採取量 測定材料 F 凝固促進剤 + 血清分離剤 ( 青 細 ) 血液 3 ml 血清 H 凝固促進剤 + 血清分離剤 ( ピンク ) 血液 6 ml 血清 検体ラベル ( 単項目オーダー時 ) 1081000 8. その他の検体検査 >> 8A. 負荷試験 機能検査 >> 負荷試験 parathyroid hormone intact 連絡先 : 3495 基本情報 4C025 PTH-I(PTH-INTACT) 分析物 JLAC10 診療報酬 識別材料 023 血清 測定法 052 化学 生物発光イムノアッセイ (CLEIA) 結果識別 第 2 章 特掲診療料 D287 内分泌負荷試験

More information

<4D F736F F D DC58F49817A83743F838C A838A815B83585FE0568DE88DC58F492E646F63>

<4D F736F F D DC58F49817A83743F838C A838A815B83585FE0568DE88DC58F492E646F63> 学生中心の大学地域にあって輝く大学 PRESS RELEASE 平成 27 年 6 月 11 日愛媛大学 創薬ターゲット GPCR に対するモノクローナル抗体の新しい作製技術を確立 GPCR 抗体医薬開発の新機軸として期待 このたび, 愛媛大学プロテオサイエンスセンターの竹田浩之助教, 澤崎達也教授らの共同研究チームは, 愛媛大学発の技術であるコムギ無細胞タンパク質合成技術を応用し,GPCR(G タンパク質共役受容体

More information

,...~,.'~ 表 2.6.2.2-26 試験管内 PAE 菌株薬剤 MIC (µg/ml) PAE (h) 1 MIC 4 MIC STFX 0.025 0.92 2.35 S. aureus FDA 209-P LVFX 0.20 0.68 2.68 CPFX 0.20 1.05 1.59 SPFX 0.10 0.35 1.07 STFX 0.025 2.33 1.14 E. coli KL-16

More information

Microsoft Word - 【基データ】概要01

Microsoft Word - 【基データ】概要01 分 の 体構造から 圧調節の仕組みを原 レベルで解明 圧症の新しい治療法の開発へ 概要京都 学 学院医学研究科浅 秀基特定助教 岩 想教授らは 圧の調節に重要なペプチドホルモンであるアンジオテンシンが結合したアンジオテンシンⅡ 受容体の 体構造を世界に先駆けて明らかにしました アンジオテンシンは 圧を調節する作 を持つ 理活性ペプチド ( ホルモン ) であり アンジオテンシン Ⅱ 受容体と結合することで

More information

2

2 u u u u u u u u u u u 2 s s s 3 s s s s 4 e 5 s s ss s s s s s s s u aa eaa u u u e u 6 7 8 u u 9 u u 0 A A 2 2 3 t 6 t t t t A 2 3 d d d d A A 4 5 444444444444444444444444444 4444444444444444444444444444444444

More information

Microsoft Word - FMB_Text(PCR) _ver3.doc

Microsoft Word - FMB_Text(PCR) _ver3.doc 2.PCR 法による DNA の増幅 現代の分子生物学において その進歩に最も貢献した実験法の1つが PCR(Polymerase chain reaction) 法である PCR 法は極めて微量の DNA サンプルから特定の DNA 断片を短時間に大量に増幅することができる方法であり 多大な時間と労力を要した遺伝子クローニングを過去のものとしてしまった また その操作の簡便さから 現在では基礎研究のみならず臨床遺伝子診断から食品衛生検査

More information

Untitled

Untitled 上原記念生命科学財団研究報告集, 25 (2011) 86. 線虫 C. elegans およびマウスをモデル動物とした体細胞レベルで生じる性差の解析 井上英樹 Key words: 性差, ストレス応答,DMRT 立命館大学生命科学部生命医科学科 緒言性差は雌雄の性に分かれた動物にみられ, 生殖能力の違いだけでなく形態, 行動などそれぞれの性の間でみられる様々な差異と定義される. 性差は, 形態や行動だけでなく疾患の発症リスクの男女差といった生理的なレベルの差異も含まれる.

More information

生物学に関する実験例 - 生化学 / 医療に関する実験例 ラジオアッセイ法によるホルモン測定 [ 目的 ] 本実習では, 放射免疫測定 (Radioimmunoassay,RIA) 法による血中インスリンとイムノラジオメトリックアッセイ ( 免疫放射定測定 Immunoradiometric ass

生物学に関する実験例 - 生化学 / 医療に関する実験例 ラジオアッセイ法によるホルモン測定 [ 目的 ] 本実習では, 放射免疫測定 (Radioimmunoassay,RIA) 法による血中インスリンとイムノラジオメトリックアッセイ ( 免疫放射定測定 Immunoradiometric ass 生物学に関する実験例 - 生化学 / 医療に関する実験例 ラジオアッセイ法によるホルモン測定 [ 目的 ] 本実習では, 放射免疫測定 (Radioimmunoassay,RIA) 法による血中インスリンとイムノラジオメトリックアッセイ ( 免疫放射定測定 Immunoradiometric assay, IRMA) 法による血清中のレニンを定量を通して 今日用いられている種々のインビトロ検査法の原理並びに両者の違い等を理解する

More information

分析報告書の例 分析課題名 : LC-MS/MS を用いたタンパク質バンドの同定弊社分析コード : P**** ( 株 ) メディカル プロテオスコープ 分析報告書 分析情報 分析課題名 LC-MS/MS を用いたタンパク質バンドの同定 弊社分析コード P***** 分析の目的 SDS ゲルから切り

分析報告書の例 分析課題名 : LC-MS/MS を用いたタンパク質バンドの同定弊社分析コード : P**** ( 株 ) メディカル プロテオスコープ 分析報告書 分析情報 分析課題名 LC-MS/MS を用いたタンパク質バンドの同定 弊社分析コード P***** 分析の目的 SDS ゲルから切り 分析報告書 分析情報 分析課題名 LC-MS/MS を用いたタンパク質バンドの同定 弊社分析コード P***** 分析の目的 SDS ゲルから切り出した染色バンドに含まれるタンパク質を同定 する 報告書提出日 20** 年 * 月 ** 日 分析担当者 - 分析委託者機関名 - ご担当者名 - ご所属 - ご所属先住所 - - 分析施設 236-0004 横浜市金沢区福浦 3-9 横浜市立大学先端医科学研究センター産学連携ラボ内

More information

Chemical Glycosylation of Peptides (Japanese Version)

Chemical Glycosylation of Peptides (Japanese Version) ペプチドへの 糖鎖付加技術 合成糖ペプチド 新たな糖鎖修飾技術によりペプチドの物理化学的特性を優位に改変します 糖鎖構造および位置を高度に制御する事によりペプチドの生物学的有用性を向上させます 多くの糖タンパクにみられるアスパラギンに結合した糖鎖を用いる事が可能です 発現技術を用いずに 高度に規定された糖ペプチドを合成する事が可能です これにより 糖鎖構造および付加位置の最適な選択を可能にします バッケム社と

More information

37-4.indd

37-4.indd ISSN 0916-3328 東京大学アイソトープ総合センター VOL. 37 NO. 4 2007. 3. 26 アイソトープ総合センターの将来展望 40 18 18 20 3 800 1/3 1300 14 18 20 3 19 2 生きた細胞内の分子過程を 時間 空間計測する蛍光プローブの開発 1. はじめに Fura-2 Fura-2 198 1, 2 3, 4 2. 生体脂質分子の機能とその分析

More information

パーキンソン病進行抑制療法の候補分子絞り込みに成功

パーキンソン病進行抑制療法の候補分子絞り込みに成功 100-8150 東京都千代田区丸の内 1-6-5( 丸の内北 ビルディング ) Tel:03-5657-1017 Fax:03-5657-1020 www.ushio.co.jp 2019 年 5 月 8 日東北大学株式会社プロトセラ 東北大学と大学とプロトセラプロトセラ パーキンソン病パーキンソン病進行抑制療法の進行抑制療法の候補候補分子分子絞り込みに成功 5 分子を特許出願 東北大学大学院医学系研究科神経内科学分野の長谷川隆文

More information

Microsoft Word - レポート模範例.docx

Microsoft Word - レポート模範例.docx 生物学レポート ヒトとウシのヘモグロビン α 鎖と酵素タンパク質 trypsin について 一次構造と高次構造を調べ比較する 畜産学科 1 年学籍番号 00000000 氏名藍愛子 提出日 :2012 年 6 月 27 日 1 はじめに レポートの課題説明に記述されていた このレポートの課題は以下のように要約される 大学でそれぞれの科目を学習する大きな目的と意義は ある学問体系の中で 何がわかっていて

More information

Polyoxometalateが有するcysteine検出能の検討及びジスルフィド結合形成反応への展開

Polyoxometalateが有するcysteine検出能の検討及びジスルフィド結合形成反応への展開 チオールを特異的に酸化し 発色する 山形大学理工学研究科バイオ化学工学専攻准教授今野博行 金属酸化物クラスターアニオン ポリオキソメタレート Polyoxometalate (POM) 金属元素に酸素が6個配位した MO6を基本骨格とする金属酸化物 1 nm クラスターアニオン MO6 (octahedron) ( PxMyOz )n 構造 構成元素 対カチオン等を 制御することで 様々な機能性を

More information

国際塩基配列データベース n DNA のデータベース GenBank ( アメリカ :Na,onal Center for Biotechnology Informa,on, NCBI が運営 ) EMBL ( ヨーロッパ : 欧州生命情報学研究所が運営 ) DDBJ ( 日本 : 国立遺伝研内の日

国際塩基配列データベース n DNA のデータベース GenBank ( アメリカ :Na,onal Center for Biotechnology Informa,on, NCBI が運営 ) EMBL ( ヨーロッパ : 欧州生命情報学研究所が運営 ) DDBJ ( 日本 : 国立遺伝研内の日 生物情報工学 BioInforma*cs 3 遺伝子データベース 16/06/09 1 国際塩基配列データベース n DNA のデータベース GenBank ( アメリカ :Na,onal Center for Biotechnology Informa,on, NCBI が運営 ) EMBL ( ヨーロッパ : 欧州生命情報学研究所が運営 ) DDBJ ( 日本 : 国立遺伝研内の日本 DNA データバンクが運営

More information

広報さっぽろ 2016年8月号 厚別区

広報さっぽろ 2016年8月号 厚別区 8/119/10 P 2016 8 11 12 P4 P6 P6 P7 13 P4 14 15 P8 16 P6 17 18 19 20 P4 21 P4 22 P7 23 P6 P7 24 25 26 P4 P4 P6 27 P4 P7 28 P6 29 30 P4 P5 31 P5 P6 2016 9 1 2 3 P4 4 P4 5 P5 6 7 8 P4 9 10 P4 1 b 2 b 3 b

More information

Ligases の 分類クラス下に階層構造として表 検索機能を持つ 公共データベースサイトへのリンクと構成タンパク質の LSKB 内リンクにより 当該タンパク質をターゲットとする化合物をさまざまな角度から ることができるほか タンパク質を構成するドメインや PDB 複合体リガンド 文献を参照できる

Ligases の 分類クラス下に階層構造として表 検索機能を持つ 公共データベースサイトへのリンクと構成タンパク質の LSKB 内リンクにより 当該タンパク質をターゲットとする化合物をさまざまな角度から ることができるほか タンパク質を構成するドメインや PDB 複合体リガンド 文献を参照できる LSKB Version 4.3.0 リリースノート このリリースノートには LSKB -Life Science Knowledge Bank の新機能 問題点の修正などが記 載されています [ 新機能 ] 1. トップ画面の "Gene & Proteins" に以下のメニューの追加あるいは改良 Browser (Metabolizing) EC Classification GPCR SARfari

More information

TaKaRa PCR Human Papillomavirus Typing Set

TaKaRa PCR Human Papillomavirus Typing Set 研究用 TaKaRa PCR Human Papillomavirus Typing Set 説明書 v201703da 本製品は さまざまなタイプの Human Papillomavirus(HPV) において塩基配列の相同性の高い領域に設定したプライマーを consensus primer として用いることにより HPV の E6 と E7 を含む領域 (228 ~ 268 bp) を共通に PCR

More information

問 1. 次の文章を読み 以下の設問 (1)~(3) に答えよ タンパク質 X の N 末端にヒスチジンタグを付加し これを大腸菌で大量発現して精製する実験を計画している (1) その準備として 遺伝子 x を PCR で増幅し T7 プロモーターを持つベクター (pet28a) の NdeI と

問 1. 次の文章を読み 以下の設問 (1)~(3) に答えよ タンパク質 X の N 末端にヒスチジンタグを付加し これを大腸菌で大量発現して精製する実験を計画している (1) その準備として 遺伝子 x を PCR で増幅し T7 プロモーターを持つベクター (pet28a) の NdeI と 2016 年 7 月 17 日実施 2017 年度 ( 夏季 ) 理学研究科博士課程前期課程生命理学専攻入学試験問題 ( 生命理学 ) [ 注意 ] 合図があるまでこのページをめくらないこと すべての解答用紙に受験番号を記入すること 解答はすべて解答用紙に記入し 問題 1 問につき解答用紙 1 枚を使用すること 解答用紙の裏面を使用してもよいが その場合には裏面にも解答が記入されていることを 表面の下部に

More information

Slide 1

Slide 1 転写 1. タンパク合成における RNA の役割酵素誘導 2. RNA ポリメラーゼ鎖型への結合転写開始鎖延長転写終結真核生物の RNA ポリメラーゼ 3. 原核生物における転写制御プロモーターカタボライト ( 異化代謝産物 ) 抑制オペロン 4. 転写後修飾プロセシング RNA ポリメラーゼ ( 鎖型への結合 ) プロモーターに特異的に結合 大腸菌の代表的なプロモーターのセンス鎖の配列 RNA ポリメラーゼ

More information

著者 : 黒木喜美子 1, 三尾和弘 2, 高橋愛実 1, 松原永季 1, 笠井宣征 1, 間中幸絵 2, 吉川雅英 3, 浜田大三 4, 佐藤主税 5 1, 前仲勝実 ( 1 北海道大学大学院薬学研究院, 2 産総研 - 東大先端オペランド計測技術オープンイノベーションラボラトリ, 3 東京大学大

著者 : 黒木喜美子 1, 三尾和弘 2, 高橋愛実 1, 松原永季 1, 笠井宣征 1, 間中幸絵 2, 吉川雅英 3, 浜田大三 4, 佐藤主税 5 1, 前仲勝実 ( 1 北海道大学大学院薬学研究院, 2 産総研 - 東大先端オペランド計測技術オープンイノベーションラボラトリ, 3 東京大学大 PRESS RELEASE (2017/4/4) 北海道大学総務企画部広報課 060-0808 札幌市北区北 8 条西 5 丁目 TEL 011-706-2610 FAX 011-706-2092 E-mail: kouhou@jimu.hokudai.ac.jp URL: http://www.hokudai.ac.jp 異なるクラスの MHC 分子の特徴的構造をあわせ持つ免疫抑制タンパク質 HLA-G

More information

Microsoft Word - ç´°è…žã†®æ…–å€±ã‡»ã…³ã‡µã…¼ã†®åŁºæœ¬å”Łç’ƒã‡™è§£æŸ”ï¼‹æœ•çµ‡ç¨¿ï¼›.docx

Microsoft Word - ç´°è…žã†®æ…–å€±ã‡»ã…³ã‡µã…¼ã†®åŁºæœ¬å”Łç’ƒã‡™è§£æŸ”ï¼‹æœ•çµ‡ç¨¿ï¼›.docx 令和元年 5 月 30 日 報道機関各位 東北大学大学院薬学研究科日本医療研究開発機構 細胞表面の情報センサーの基本原理を解明 センサータンパク質に作用するくすりの開発に貢献 発表のポイント くすりの主要な標的となる 細胞表面のセンサータンパク質が細胞に情報を伝える仕組みを明らかにした 機械学習を用いて 遺伝子情報 ( アミノ酸配列 ) から細胞表面センサーの機能を予測する手法を開発した 細胞に特定の情報を入力することのできる人工センサーを創製した

More information

PowerPoint プレゼンテーション

PowerPoint プレゼンテーション 2013 年 11 月 20 日 ( 水 ) バイオ情報解析演習 ウェブツールを活用した生物情報解析 (4) 遺伝子のクローニング設計 有用物質生産菌を合理的に作ろう! 設計 試作 ベンチテスト 完成 プラスミド 効率的な代謝経路を設計する 文献調査代謝パスウェイの探索代謝シミュレーション 実際に微生物に組み込む データベースから有用遺伝子を探索する遺伝子組換え技術 培養をして問題点を突き止める 培養代謝物量

More information

7-1(DNA配列から遺伝子を探す).ppt

7-1(DNA配列から遺伝子を探す).ppt DNA 配列の中から遺伝子を探す Blast 解析.6 Query DNA 塩基配列アミノ酸配列 DNA 塩基配列をアミノ酸配列に変換アミノ酸配列 DNA 塩基配列をアミノ酸配列に変換 データベース DNA 塩基配列アミノ酸配列アミノ酸配列 DNA 塩基配列をアミノ酸配列に変換 DNA 塩基配列をアミノ酸配列に変換 1. 2. 3. TATGGCTTA---- T G L TATGGCTTA----

More information

2. PQQ を利用する酵素 AAS 脱水素酵素 クローニングした遺伝子からタンパク質の一次構造を推測したところ AAS 脱水素酵素の前半部分 (N 末端側 ) にはアミノ酸を捕捉するための構造があり 後半部分 (C 末端側 ) には PQQ 結合配列 が 7 つ連続して存在していました ( 図 3

2. PQQ を利用する酵素 AAS 脱水素酵素 クローニングした遺伝子からタンパク質の一次構造を推測したところ AAS 脱水素酵素の前半部分 (N 末端側 ) にはアミノ酸を捕捉するための構造があり 後半部分 (C 末端側 ) には PQQ 結合配列 が 7 つ連続して存在していました ( 図 3 報道発表資料 2003 年 4 月 24 日 独立行政法人理化学研究所 半世紀ぶりの新種ビタミン PQQ( ピロロキノリンキノン ) 理化学研究所 ( 小林俊一理事長 ) は ピロロキノリンキノンと呼ばれる物質が新種のビタミンとして機能していることを世界で初めて解明しました 理研脳科学総合研究センター ( 甘利俊一センター長 ) 精神疾患動態研究チーム ( 加藤忠史チームリーダー ) の笠原和起基礎科学特別研究員らによる成果です

More information

細胞骨格を形成するタンパク質

細胞骨格を形成するタンパク質 タンパク質に関する練習問題総まとめ 第 1 回タンパク質の一次構造と高次構造 1. ペプチド結合部分は平面構造を取る 2. 分子シャペロンは タンパク質の ( ) をする働きをもつ 3. 動物種が違っても 同じ作用を持つタンパク質は 同一のアミノ酸配列からなる 4. ある 2 つのタンパク質間の相同性 (%) は それらのホモロジー (%) より高い 5. 加熱処理により タンパク質を安定化している

More information

公益財団法人京都大学教育研究振興財団 会長辻井昭雄様 京都大学教育研究振興財団助成事業成果報告書 所属部局 化学研究所 平成 30 年 4 月 26 日 職名助教 氏名渡辺文太 助成の種類 平成 29 年度 研究活動推進助成 申請時の科研費研究課題名 細胞運動を阻害する新規低分子化合物の作用メカニズ

公益財団法人京都大学教育研究振興財団 会長辻井昭雄様 京都大学教育研究振興財団助成事業成果報告書 所属部局 化学研究所 平成 30 年 4 月 26 日 職名助教 氏名渡辺文太 助成の種類 平成 29 年度 研究活動推進助成 申請時の科研費研究課題名 細胞運動を阻害する新規低分子化合物の作用メカニズ 公益財団法人京都大学教育研究振興財団 会長辻井昭雄様 京都大学教育研究振興財団助成事業成果報告書 所属部局 化学研究所 平成 30 年 4 月 26 日 職名助教 氏名渡辺文太 助成の種類 平成 29 年度 研究活動推進助成 申請時の科研費研究課題名 細胞運動を阻害する新規低分子化合物の作用メカニズムの解明と癌治療への応用 上記以外で助成金 を 充 当 し た 研 究 内 容 助成金充当に関わる共同研究者

More information

報道発表資料 2006 年 8 月 7 日 独立行政法人理化学研究所 国立大学法人大阪大学 栄養素 亜鉛 は免疫のシグナル - 免疫系の活性化に細胞内亜鉛濃度が関与 - ポイント 亜鉛が免疫応答を制御 亜鉛がシグナル伝達分子として作用する 免疫の新領域を開拓独立行政法人理化学研究所 ( 野依良治理事

報道発表資料 2006 年 8 月 7 日 独立行政法人理化学研究所 国立大学法人大阪大学 栄養素 亜鉛 は免疫のシグナル - 免疫系の活性化に細胞内亜鉛濃度が関与 - ポイント 亜鉛が免疫応答を制御 亜鉛がシグナル伝達分子として作用する 免疫の新領域を開拓独立行政法人理化学研究所 ( 野依良治理事 60 秒でわかるプレスリリース 2006 年 8 月 7 日 独立行政法人理化学研究所 国立大学法人大阪大学 栄養素 亜鉛 は免疫のシグナル - 免疫系の活性化に細胞内亜鉛濃度が関与 - 私たちの生命維持を行うのに重要な役割を担う微量金属元素の一つとして知られていた 亜鉛 この亜鉛が欠乏すると 味覚障害や成長障害 免疫不全 神経系の異常などをきたします 理研免疫アレルギー科学総合研究センターサイトカイン制御研究グループと大阪大学の研究グループは

More information

「蛋白質発現・相互作用解析技術開発」産業科学技術研究開発基本計画

「蛋白質発現・相互作用解析技術開発」産業科学技術研究開発基本計画 ( 健康安心プログラム ) 新機能抗体創製技術開発 基本計画 1. 研究開発の目的 目標 内容 (1) 研究開発の目的本研究開発は 遺伝子やタンパク質等の生体分子の機能 構造解析等を行うとともに それらの研究を強力に推進するためのバイオツールやバイオインフォマティックスの開発 成果を高度に利用するためのデータベース整備や先端技術を応用した高度医療機器開発等により テーラーメイド医療 予防医療 再生医療の実現や画期的な新薬の開発

More information

ごあいさつ バイオシミラーの課題 バイオ医薬品は 20 世紀後半に開発されて以来 癌や血液疾患 自己免疫疾患等多くの難治性疾患に卓抜した治療効果を示し また一般にベネフィット リスク評価が高いと言われています しかしその一方で しばしば高額となる薬剤費用が 患者の経済的負担や社会保障費の増大に繋がる

ごあいさつ バイオシミラーの課題 バイオ医薬品は 20 世紀後半に開発されて以来 癌や血液疾患 自己免疫疾患等多くの難治性疾患に卓抜した治療効果を示し また一般にベネフィット リスク評価が高いと言われています しかしその一方で しばしば高額となる薬剤費用が 患者の経済的負担や社会保障費の増大に繋がる ごあいさつ バイオシミラーの課題 バイオ医薬品は 20 世紀後半に開発されて以来 癌や血液疾患 自己免疫疾患等多くの難治性疾患に卓抜した治療効果を示し また一般にベネフィット リスク評価が高いと言われています しかしその一方で しばしば高額となる薬剤費用が 患者の経済的負担や社会保障費の増大に繋がると指摘されています こうした中 バイオシミラーの普及は 拡大する医療費の抑制に貢献するとともに 経済的な理由でバイオ医薬品による治療を躊躇されている患者に対する治療アクセスの改善を約束します

More information

ナノの技術をバイオに応用

ナノの技術をバイオに応用 本日まで お試し期間 なので 出席は取りません 現代生物学概論 2 遺伝子 ( プログラム ) と蛋白質 ( ナノマシン ) 先進理工学科 化学生物学研究室 准教授 生体機能システムコース 瀧真清 1 本日の概要 : 蛋白質生合成の全スキーム D から蛋白質への情報の流れ アミノ酸から蛋白質への物質の流れ 転写 D 本日は詳細は省略 アミノアシル tr 合成酵素 (RS) 翻訳 mr コドンーアンチコドンの対合

More information

Microsoft PowerPoint - 04 池袋 一典 教授

Microsoft PowerPoint - 04 池袋 一典 教授 1 アプタマーの ヒトゲノム情報からの探索 及びコンピューター内進化 東京農工大学 大学院工学研究院 生命機能科学部門 教授 池袋一典 研究の背景 3 叉路型アプタマー 高い結合能を示すアプタマーの例 Target Library K d (nm) HIV-1 integrase RNA 10 FIV reverse transcriptase RNA 4.2 HIV-1 reverse transcriptase

More information

( 図 ) IP3 と IRBIT( アービット ) が IP3 受容体に競合して結合する様子

( 図 ) IP3 と IRBIT( アービット ) が IP3 受容体に競合して結合する様子 60 秒でわかるプレスリリース 2006 年 6 月 23 日 独立行政法人理化学研究所 独立行政法人科学技術振興機構 細胞内のカルシウムチャネルに情報伝達を邪魔する 偽結合体 を発見 - IP3 受容体に IP3 と競合して結合するタンパク質 アービット の機能を解明 - 細胞分裂 細胞死 受精 発生など 私たちの生の営みそのものに関わる情報伝達は 細胞内のカルシウムイオンの放出によって行われています

More information

井上先生 報告書 清水

井上先生 報告書 清水 派遣研究室 : ボン大学 Life and Medical Sciences(LIMES) Institute, Prof.Michael Hoch 研究室 研究 交流概要近年 TAL effector nuclease (TALEN) や CRISPR/Cas9 システムが効率的で簡便なゲノム編集技術として注目されている 派遣者は TALEN を用いてゼブラフィッシュに遺伝子変異を導入する実験を行った

More information

研究成果報告書

研究成果報告書 様式 C-19 科学研究費補助金研究成果報告書 研究種目 : 基盤研究 (C) 研究期間 :2007 2008 課題番号 :19570157 研究課題名 ( 和文 ) 生体高分子間相互作用構造推定のため情報抽出法の開発 平成 21 年 5 月 31 日現在 研究課題名 ( 英文 )Development of a method to obtain information for prediction

More information

thermofisher.com Silencer Select pre-designed / validated siRNA 検索マニュアル

thermofisher.com Silencer Select pre-designed / validated siRNA 検索マニュアル thermofisher.com Silencer Select pre-designed / validated sirna 検索マニュアル 2018 年 10 月版 The world leader in serving science Silencer Select sirna の保証内容 Silencer Select predesigned sirna: 同一ターゲット遺伝子に対する 2

More information

多様なモノクロナル抗体分子を 迅速に作製するペプチドバーコード手法を確立 動物を使わずに試験管内で多様な抗体を調製することが可能に 概要 京都大学大学院農学研究科応用生命科学専攻 植田充美 教授 青木航 同助教 宮本佳奈 同修士課程学生 現 小野薬品工業株式会社 らの研究グループは ペプチドバーコー

多様なモノクロナル抗体分子を 迅速に作製するペプチドバーコード手法を確立 動物を使わずに試験管内で多様な抗体を調製することが可能に 概要 京都大学大学院農学研究科応用生命科学専攻 植田充美 教授 青木航 同助教 宮本佳奈 同修士課程学生 現 小野薬品工業株式会社 らの研究グループは ペプチドバーコー 多様なモノクロナル抗体分子を 迅速に作製するペプチドバーコード手法を確立 動物を使わずに試験管内で多様な抗体を調製することが可能に 概要 京都大学大学院農学研究科応用生命科学専攻 植田充美 教授 青木航 同助教 宮本佳奈 同修士課程学生 現 小野薬品工業株式会社 らの研究グループは ペプチドバーコードという新しい標識を用いて遊離型の 抗体を試験管内で生産し 個体生体内での多様な抗体の結合能を有するモノクロナル抗体を迅速かつ簡単にス

More information

014E83AC26AFE ACA001C23F

014E83AC26AFE ACA001C23F 平成 10 年 ( 行ケ ) 第 393 号特許取消決定取消請求事件判決原告サイオスインコーポレイテッド代表者 A 訴訟代理人弁理士山本秀策被告特許庁長官 B 指定代理人 C D E F 主文原告の請求を棄却する 訴訟費用は原告の負担とする この判決に対する上告及び上告受理申立てのための付加期間を30 日と定める 事実及び理由第 1 原告の求めた裁判 特許庁が平成 8 年異議第 70722 号事件について平成

More information

血漿エクソソーム由来microRNAを用いたグリオブラストーマ診断バイオマーカーの探索 [全文の要約]

血漿エクソソーム由来microRNAを用いたグリオブラストーマ診断バイオマーカーの探索 [全文の要約] Title 血漿エクソソーム由来 microrna を用いたグリオブラストーマ診断バイオマーカーの探索 [ 全文の要約 ] Author(s) 山口, 響子 Issue Date 2017-03-23 Doc URL http://hdl.handle.net/2115/66158 Type theses (doctoral - abstract of entire text) Note この博士論文全文の閲覧方法については

More information

培養細胞からの Total RNA 抽出の手順 接着細胞のプロトコル 1. プレート ( またはウエル ) より培地を除き PBSでの洗浄を行う 2. トリプシン処理を行い 全量を1.5ml 遠心チューブに移す スクレイパーを使って 細胞を掻き集める方法も有用です 3. 低速遠心 ( 例 300 g

培養細胞からの Total RNA 抽出の手順 接着細胞のプロトコル 1. プレート ( またはウエル ) より培地を除き PBSでの洗浄を行う 2. トリプシン処理を行い 全量を1.5ml 遠心チューブに移す スクレイパーを使って 細胞を掻き集める方法も有用です 3. 低速遠心 ( 例 300 g Maxwell RSC simplyrna Cells / Tissue Kit ( カタログ番号 AS1340/AS1390) 簡易マニュアル 注意 : キットを受け取りましたら 1-Thioglycerolを取り出し キット箱は室温で保存してください 取り出した1-Thioglycerolは2~10 で保存してください ご用意いただくもの 細胞 組織の両方の場合で共通 ボルテックスミキサー ピペットマン

More information

A Constructive Approach to Gene Expression Dynamics

A Constructive Approach to Gene Expression Dynamics 配列アラインメント (I): 大域アラインメント http://www.lab.tohou.ac.jp/sci/is/nacher/eaching/bioinformatics/ week.pdf 08/4/0 08/4/0 基本的な考え方 バイオインフォマティクスにはさまざまなアルゴリズムがありますが その多くにおいて基本的な考え方は 配列が類似していれば 機能も類似している というものである 例えば

More information

タンパク質の合成と 構造 機能 7 章 +24 頁 転写と翻訳リボソーム遺伝子の調節タンパク質の構造弱い結合とタンパク質の機能

タンパク質の合成と 構造 機能 7 章 +24 頁 転写と翻訳リボソーム遺伝子の調節タンパク質の構造弱い結合とタンパク質の機能 タンパク質の合成と 構造 機能 7 章 +24 頁 転写と翻訳リボソーム遺伝子の調節タンパク質の構造弱い結合とタンパク質の機能 タンパク質の合成 セントラル ドグマによると 遺伝子が持つ情報は タンパク質を合成することで発現 (Expression) される それは 2 段階の反応で進行する DNA 転写 (Transcription) DNA の塩基配列から mrna の塩基配列へ染色体の

More information

P06011

P06011 平成 20 年度実施方針 P06011 バイオテクノロジー 医療技術開発部 1. 件名 : プログラム名健康安心プログラム ( 大項目 ) 機能性 RNA プロジェクト 2. 根拠法 独立行政法人新エネルギー 産業技術総合開発機構法第 15 条第 1 項第二号 3. 背景及び目的 目標近年の研究により 我々哺乳類を含む高等生物の細胞中には 従来のタンパク質をコードするRNAとは異なり タンパク質をコードしていないにもかかわらず転写される

More information

Microsoft PowerPoint マクロ生物学9

Microsoft PowerPoint マクロ生物学9 マクロ生物学 9 生物は様々な化学反応で動いている 大阪大学工学研究科応用生物工学専攻細胞動態学領域 : 福井希一 1 生物の物質的基盤 Deleted based on copyright concern. カープ分子細胞生物学 より 2 8. 生物は様々な化学反応で動い ている 1. 生命の化学的基礎 2. 生命の物理法則 3 1. 生命の化学的基礎 1. 結合 2. 糖 脂質 3. 核酸 4.

More information

第4回独立行政法人評価委員会技術基盤分科会製品評価技術基盤機構部会 参考資料N2-1 平成15年度NITE業務実績表参考資料集 表紙~P19

第4回独立行政法人評価委員会技術基盤分科会製品評価技術基盤機構部会 参考資料N2-1 平成15年度NITE業務実績表参考資料集 表紙~P19 参考資料 N2-1 平成 15 年度 NITE 業務実績表 参考資料集 A-1-(4) インドネシアにおける新規微生物資源に関する共同研究プロジェクト (2003 年 ) の結果 インドネシアと日本の真菌と放線菌の分類学および生態学の共同研究プロジェクト 独立行政法人製品評価技術基盤機構 (NITE) は 平成 15 年 4 月 インドネシア科学研究所 (LIPI) との間で標記プロジェクトの実施内容に関する合意書

More information

Microsoft Word - Fluo4 NW Calcium Assay KitsJ1_20Jun2006.doc

Microsoft Word - Fluo4 NW Calcium Assay KitsJ1_20Jun2006.doc 製品情報 2006 年 10 月 20 日改訂 Fluo-4 NW Calcium Assay Kit(F36205 F36206) F36205 Fluo-4 NW Calcium Assay Kit (high-throughput) *for 100 microplates* F36206 Fluo-4 NW Calcium Assay Kit (starter pack with buffer)

More information

手順 ) 1) プライマーの設計 発注変異導入部位がプライマーのほぼ中央になるようにする 可能であれば 制限酵素サイトができるようにすると確認が容易になる プライマーは 25-45mer で TM 値が 78 以上になるようにする Tm= (%GC)-675/N-%mismatch

手順 ) 1) プライマーの設計 発注変異導入部位がプライマーのほぼ中央になるようにする 可能であれば 制限酵素サイトができるようにすると確認が容易になる プライマーは 25-45mer で TM 値が 78 以上になるようにする Tm= (%GC)-675/N-%mismatch Mutagenesis 目的 ) 既存の遺伝子に PCR を利用して変異を導入する 1 点変異導入方法 ) Quik Change Site-Directed Mutagenesis Kit(Stratagene) のプロトコールを流用 http://www.stratagene.com/products/showproduct.aspx?pid=131 Kit 中では DNA polymerase

More information

300927_課_薬生薬審発0927第3号_核酸医薬品の品質の担保と評価において考慮すべき事項について

300927_課_薬生薬審発0927第3号_核酸医薬品の品質の担保と評価において考慮すべき事項について 薬生薬審発 0927 第 3 号 平成 30 年 9 月 27 日 各都道府県衛生主管部 ( 局 ) 長殿 厚生労働省医薬 生活衛生局医薬品審査管理課長 ( 公印省略 ) 核酸医薬品の品質の担保と評価において考慮すべき事項について 厚生労働省では 革新的な医薬品 医療機器及び再生医療等製品の実用化を促進するため 平成 24 年度から 最先端の技術を研究 開発している大学 研究機関等において レギュラトリーサイエンスを基盤とした安全性と有効性の評価方法の確立を図り

More information

機能的ゲノミックスに向けた新たなアプローチ ブルースブルンバーグ 米国カリフォルニア大学アーバイン校 菅野先生 御紹介ありがとうございます 私はこの会合へご招待くださった主催者 ならびに特に菅野先生と井上先生に感謝の意を表したいと思います 本日お話するのは 私の研究室で取り組んでいる比較的新しい方法

機能的ゲノミックスに向けた新たなアプローチ ブルースブルンバーグ 米国カリフォルニア大学アーバイン校 菅野先生 御紹介ありがとうございます 私はこの会合へご招待くださった主催者 ならびに特に菅野先生と井上先生に感謝の意を表したいと思います 本日お話するのは 私の研究室で取り組んでいる比較的新しい方法 機能的ゲノミックスに向けた新たなアプローチ ブルースブルンバーグ 米国カリフォルニア大学アーバイン校 菅野先生 御紹介ありがとうございます 私はこの会合へご招待くださった主催者 ならびに特に菅野先生と井上先生に感謝の意を表したいと思います 本日お話するのは 私の研究室で取り組んでいる比較的新しい方法です 我々の研究目標の1つは ゲノム研究と高スループットスクリーニングの間のギャップを埋めることです

More information

DNA/RNA調製法 実験ガイド

DNA/RNA調製法 実験ガイド DNA/RNA 調製法実験ガイド PCR の鋳型となる DNA を調製するにはいくつかの方法があり 検体の種類や実験目的に応じて適切な方法を選択します この文書では これらの方法について実際の操作方法を具体的に解説します また RNA 調製の際の注意事項や RNA 調製用のキット等をご紹介します - 目次 - 1 実験に必要なもの 2 コロニーからの DNA 調製 3 増菌培養液からの DNA 調製

More information

本文3/YA8183E

本文3/YA8183E pp. N Tom Tom Tom - Tom µm Soft interaction for the recognition of mitochondrial targeting signal Daisuke Kohda Division of Structural Biology, Medical Institute of Bioregulation, Kyushu University, Maidashi,

More information