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- わんど かやぬま
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7 図8SINEの SINEと3'末 親 と な って い るLINEの 系 統 関係 端 を共 有 して い るLINEは 赤 色 で 示 す, 報 告 さ れ て い るす べ て のLINEは11の ら れ る.そ れ ぞ れ のLINEの グル ー プ に分 け あ い だ にお い て 水 平 的 な交 流 が な い と仮 定 す る と,こ の11に 分 け られ る こ のLINE え て,最 近 に な っ て 報 告 さ れ たL2,Rex1,NeSL-1,そ てGenie/Gilの15の L2ク 大 き な グ ル ー プ に 分 け ら れ た30). レ ー ド(分 類 群)はCR1か の 各 グ ル ー プ は真 核 生 物 と同 じ く らい古 く,そ れ ぞ れ の る 新 た な グ ル ー プ で あ り,脊 祖 先 は 先 カ ン ブ リア 紀 まで さか の ぼ る と考 え ら れ る.図 昆 虫 ま で 広 く分 布 域 を も つLINEを 8は,報 Rex1は 告 さ れ て い る ほ ぼ す べ て のLINEを 解 析 した 結 果 を 示 した も の で あ る が,こ 詳細 に系統 の解 析 に よる と,先 行 研 究 に よ っ て 明 らか に さ れ た11グ 2086 蛋 白質 核 酸 酵 素Vol.49No,13(2004) ルー プに加 し ら顕 著 に 分 岐 して い 椎 動 物,棘 皮 動 物,そ して 含 む も の で あ る. メ キ シ コ 産 熱 帯 魚 プ ラ ッ テ ィ フ ィ ッシ ュ の ゲ ノ ム か ら 単 離 さ れ た も の で,断 続 的では あるが魚類ゲ ノム 中 に 広 く分 布 し て い る31).Rex1は 現 在 ま で に 知 られ て
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10 19) 21, (2002) Kajikawa, M., Ohshima, K., Okada, N. : Mol. Biol. Evol., 14, (1997) 20) Kido, Y., Himberg, M., Takasaki, N., Okada, N.: J. Mol. 1) Weiner, A. M., Deininger, P. L., Efstratiadis, A. : Annu. Rev. Biochem., 55, (1986) 2) International Human Genome Sequencing Consortium Nature, 409, (2001) 3) Esnault, C., Maestre, J., Heidmann, T. : Nature Genet., 24, (2000) 4) Kajikawa, M., Okada, N. : Cell, 111, (2002) 5) Ohshima, K., Hamada, M., Terai, Y., Okada, N.: Mol. Cell. Biol., 16, (1996) 6) Okada, N., Hamada, M., Ogiwara, I., Ohshima, K. : Gene, 205, (1997) 7) Sakamoto, K., Okada, N. : J. Mol. Evol., 22, (1985) 8) Endoh, H., Okada, N. : Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 83, (1986) 9) Matsumoto, K., Murakami, K., Okada, N. : Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 83, (1986) 10) Kido, Y., Aono, M., Yamaki, T., Matsumoto, K., Murata, S., Saneyoshi, M., Okada, N. : Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 88, (1991) 11) Ohshima, K., Koishi, R., Matsuo, M., Okada, N. : Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90, (1993) 12) Yoshioka, Y., Matsumoto, S., Kolima, S., Ohshima, K., Okada, N., Machida, Y. : Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90, (1993) 13) Okada, N. : Trends Ecol. Evol., 6, (1991) 14) Okada, N., Ohshima. K. : in The Impact of Short Interspersed Elements (SINEs) on the Host Genome (ed. Maraia, R. J.), pp , R. G. Landes, Austin (1995) 15) Shedlock, A. M., Okada, N. : BioEssays, 22, (2000) 16) Ullu, E., Tschudi, C.: Nature, 312, (1984) 17) Luan, D. D., Korman, M. H., Jakubuczak, J. L., Eickbush, T. H. : Cell, 72, (1995) 18) Cost, G. J., Feng, Q., Jacquier, A., Boeke, J. D. : EMBO J., Biol., 241, (1994) 21) Ogiwara, I., Miya, M., Ohshima, K., Okada, N.: Genome Res., 12, (2002) 22) Terai, Y., Takahashi, K., Okada, N. : Mol. Biol. Evol., 15, (1998) 23) Okada, N., Hamada, M. : J. Mol. Evol., 44, S52-56 (1997) 24) Moran, J. V., Holmes, S. E., Naas, T. P., DeBerardinis, R. J., Boeke, J. D., Kazazian, H. H., Jr. : Cell, 87, (1996) 25) Eickbush, T. H.: Science, 277, (1997) 26) Buzdin, A., Gogvadze, E., Kovalskaya, E., Volchkov, P., Ustyugova, S., Illarionova, A., Fushan, A., Vinogradova, T., Sverdlov, E. : Nucleic Acids Res., 31, (2003) 27) Hamada, M., Takasaki, N., Reist, J. D., DeCicco, A. L., Goto, A., Okada, N. : Genetics, 150, (1998) 28) Takasaki, N., Murata, S., Saitoh, M., Kobayashi, T., Park, L., Okada, N. : Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 91, (1994) 29) Malik, H. S., Burke, W. D., Eickbush, T. H.: Mol. Biol. Evol., 16, (1999) 30) Ohshima, K., Okada, N. : in Retrotransposable Elements and Genome Evolution (ed. Volff, J.-N.), S. Karger, Basel, in press 31) Volff, J.-N., Korting, C., Schartl, M. : Mol. Biol. Evol., 17, (2000) 32) Brosius, J. : Genetica, 118, (2003) 33) Lorenc, A., Makalowski, W.: Genetica, 118, (2003) 34) Schmid, C. W. : Nucleic Acids Res., 26, (1998) 35) Shimamura, M., Yasue, H., Ohshima, K., Abe, H., Kato, H., Kishiro, T., Goto, M., Munechika, 388, (1997) I., Okada, N. : Nature, 36) Shimamura, M., Abe, H., Nikaido, M., Ohshima, K., Okada, N.: Mol. Biol. Evol., 16, (1999) 37) Shimamura, M., Nikaido, M., Ohshima, K., Okada, N. : Mol. Biol. Evol., 15, (1998) 38) Namba, T., Sugimoto, Y., Negishi, M., Irie, A., Ushikubi, F., Kakizuka, A., Ito, S., Ichikawa, A., Narumiya, S. : Nature, 365, (1993) 39) Ohshima, K., Hattori, M., Yada, T., Gojobori, T., Sakaki, Y., Okada. N. : Genome Biol.. 4, R74 (2003)
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