資料 4-3 国際ヒトエピゲノムコンソーシアムの動向 2011 年 3 月 7 日科学技術振興機構 Japan Science and Technology Agency All Rights Researved. ( 出典 ) 図は IHEC ポリシーより

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ひさともそめや
4 years ago
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1 資料 4-3 国際ヒトエピゲノムコンソーシアムの動向 2011 年 3 月 7 日科学技術振興機構 Japan Science and Technology Agency All Rights Researved. ( 出典 ) 図は IHEC ポリシーより

2 1. エピゲノムの歴史的経緯米国 NIH ロードマップ / エピゲノミクス Nat. Biot EU エピゲノム拠点プログラムヒトゲノムプロジェクト米国癌学会エピゲノムタスクフォース ~ ヒトエピゲノムプロジェクトを提案 ~ ( 出典 ) IHEC2010 年 1 月立ち上げ会合資料より Japan Science and Technology Agency All Rights Researved. 2

3 2. 国際ヒトエピゲノムコンソーシアム (IHEC) < コンソーシアムの主要な目的 > 1. 健康と疾患に関連する重要な細胞の状態に関するヒトエピゲノムについてリファレンスマップの作成を取りまとめるヒトエピゲノムを十分にカバーするため国際ヒトエピゲノムコンソーシアム (IHEC) は今後 7~10 年の間に少なくとも 1000 のエピゲノムを解読するという野心的なゴールを設定するこのゴールを達成するためにコンソーシアムは堅固かつ有効な技術を用いて次のものを作成する情報を含むヒストン修飾の非常に高解像度のマップ高解像度の DNA メチル化マップたんぱく質をコードしている遺伝子すべての転写開始サイトのランドマークマップ non-coding RNA と small RNA の完全な一覧および発現パターンヒトの健康および疾患に関連するモデル生物のエピゲノムマップ比較分析 2. IHEC は幹細胞 ( としての性質 ) 不死増殖分化老化およびストレスなどの重要な細胞の状態に焦点を置くことにより健康の研究や再生医療における進展を触媒する新しい知識を生み出す個体家系遺伝的に同一な双子を調べることでゲノムおよびエピゲノムにおける世界規模のバリエーションの関係を決定できるだろう長期的な IHEC のゴールはどの程度エピゲノムは世代を超えてまた環境に適応してヒトの個体群を形作ってきたのかを決定することである IHEC は ENCODE(DNA エレメントの百科事典 ) などの他の進行中プロジェクトとは異なるようにまた補完的であるように運営される ENCODE プロジェクトはゲノムの中の機能的な DNA 配列を定義することに重点を置いているが一方で IHEC はそれらの配列についてさまざまな初代培養細胞の中で起こっているエピジェネティックな制御パターンを定義する 3. この新しい知識を健康や疾患に適用するためにすぐに極力制限なくデータを研究コミュニティ全体が使えるようにする IHEC はこの重要な国際的取り組みによって生み出されるエピゲノムデータ全体を体系づけ統合し公開するためにバイオインフォマティクスの共通スタンダードデータモデルおよび分析ツールの確立に向けて調整する 4. IHECはこの国際的取り組みを統合する効率的な仕組みを立ち上げ参加している個人コンソーシアムファンディングエージェンシーや国家に対応する IHECは世界中のさまざまなエピゲノムに関する取り組みとの間の重複を避ける IHECはそれらの他の国際的プロジェクト ( 国際ガンゲノムコンソーシアムやENCODE) の取り組みと交流し協力する ( 出典 ) IHECポリシーより Japan Science and Technology Agency All Rights Researved. 3

3. 国際エピゲノムコンソーシアムの組織構成実行委員会 (EXEC) ファンディングメンバーの代表により構成され大所高所の立場から問題を解決する ISSC と連携する国際科学運営委員会 (ISSC) 科学者により構成され科学的な調整や評価などを行うファンディングメンバー 5 年以上にわたって最低 1,000 万ドル相当 ( 間接経費等を除く

4 3. 国際エピゲノムコンソーシアムの組織構成実行委員会 (EXEC) ファンディングメンバーの代表により構成され大所高所の立場から問題を解決する ISSC と連携する国際科学運営委員会 (ISSC) 科学者により構成され科学的な調整や評価などを行うファンディングメンバー 5 年以上にわたって最低 1,000 万ドル相当 ( 間接経費等を除く ) の資金を IHEC の目的に沿ったプログラムに提供するファンディングエージェンシー科学者グループセンターワーキンググループデータ統合センター Japan Science and Technology Agency All Rights Researved. IHEC Transition Meeting (Dec. 15, 2010) 資料より 4

5 4. 国際エピゲノムコンソーシアムのターゲット 1000 エピゲノム DNA メチル化, ヒストンマーク, ヒストン変異体, RNA, クロマチン関連タンパク質 1000 エピゲノム (1 つ当たり $100,000) $100,000,000 リファレンス正常ヒト細胞, モデル動物幹細胞ヒト ES 細胞, ips 細胞環境感染毒栄養ストレスガン肥満動脈硬化自己免疫疾患疾患自閉症精神病ぜんそく依存症老化データ統合アクセスアーカイブ品質管理 $30,000,000 研究成果をヒトの健康の改善へ ( 出典 ) IHEC2010 年 1 月立ち上げ会合資料より Japan Science and Technology Agency All Rights Researved. 5

6 5.IHEC において解析対象となる修飾 Recommended technology Bisulfite Sequencing RNA Sequencing DnaseⅠ Profile ChIP-seq Epigenetic modification DNA メチル化 non-coding RNA Chromatin accessibilities H3K4me3 H3K9me3 H3K27me3 H3K27ac H3K4me1 H3K36me3 ヒストン修飾 6 種老男細胞 1 細胞 2 老女若男若女老男老女若男若女 ( 出典 ) IHEC Recommendations for Epigenomic Japan Science and Technology Agency All Rights Researved. 6 AnalysisよりJST/CRDS 作成

ドイツが正式参加表明 2 月中旬英国が正式参加表明 3 月上旬カナダが正式参加表明準備 Japan Science and Technology

7 6.IHEC の立ち上げスケジュール主な参加国 : 米国カナダ EU イギリスドイツフランスイタリアオランダ日本韓国中国オーストラリアファンディングエージェンシー等の出席があった国 : 米国カナダ EU イギリスドイツフランスイタリア日本韓国オーストラリア下線は参加表明済 1 月下旬ドイツが正式参加表明 2 月中旬英国が正式参加表明 3 月上旬カナダが正式参加表明準備 Japan Science and Technology Agency All Rights Researved. IHEC Transition Meeting (Dec. 15, 2010) 資料よりJST/CRDS 作成 7

8 7. 各国の対応状況参加表明済参加未表明 (2011 年 3 月の Executive Committee に参加 ) 国名米国 EU ドイツイギリスイタリアカナダ韓国日本オーストラリア予算公募状況 2008 年 NIH ロードマップエピジェネティクスを予算額 1 億 9 千万ドルで開始その一部で IHEC を実施 2010 年第 7 フレームワークプログラムの枠組みでハイインパクト研究イニシアチブとして IHEC および関連する研究に 3,000 万ユーロを支援 2011 年 1 月下旬 IHEC への参加を目的としたファンドの公募開始 Japan Science and Technology Agency All Rights Researved. 8

9 8.IHEC への参加申請手続き < 提出する情報 > ファンディング機関名および Executive Committee に参加する代表者名予定予算額 Scientific Steering Committee に参加する研究者名 ( 可能な範囲で ) プログラムの簡単な説明およびその中でマッピングが提案されている細胞 / 組織のリスト ( 出典 ) IHECポリシーより Japan Science and Technology Agency All Rights Researved. 9

試験中試験中試験中 12 月下旬試験中試験中試験中 12 月下旬試験中試験中試験中 1 月中旬試験中試験中試験終了 12 月中旬試験中試験中試験中 1 月上旬試験中試験中試験中 1

試験中試験中試験中 12 月下旬試験中試験中試験中 12 月下旬試験中試験中試験中 1 月中旬試験中試験中試験終了 12 月中旬試験中試験中試験中 1 月上旬試験中試験中試験中 1 003826 試験中試験中試験中 12 月下旬 005138 試験中試験中試験終了 12 月中旬 011409 試験中試験中試験中 1 月下旬 025402 試験中試験中試験中 12 月下旬 028179 試験中試験中試験中 1 月上旬 035854 試験中試験中試験終了 1 月上旬 038417 試験中試験中試験中 1 月上旬 040584 試験中試験中試験終了 12

資料 4-3 国際ヒトエピゲノムコンソーシアムの動向 2011 年 3 月 7 日 科学技術振興機構 Japan Science and Technology Agency All Rights Researved. ( 出典 ) 図は IHEC ポリシーより

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