ペプチド関連データベース
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- としなり ふくだ
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1 PRF/LitCloud システム ユーザーズマニュアル 一 般 財 団 法 人 蛋 白 質 研 究 奨 励 会
2 目 次 はじめに... 3 PRF/LITCLOUD とは... 3 動 作 環 境... 3 PRF/LITCLOUD システムの 概 要... 4 本 マニュアルについて... 4 PRF/LITCLOUD サービス... 5 ログイン... 5 サービスメニュー... 6 Database Search... 7 文 献 情 報 の 詳 細 表 示 文 献 詳 細 表 示 のコントロール 機 能 ボタン 文 献 情 報 の 編 集 検 索 結 果 の 電 子 書 籍 化 Literature List View 文 献 情 報 の 詳 細 表 示 文 献 リストの 電 子 書 籍 化 Literature Database 文 献 情 報 の 新 規 登 録 (Add New Entry) Direct Input Digital Object Identifier (DOI) PubMED ID Medline Format Text File Medline Format Text File の 作 成 について( 参 考 ) 文 献 情 報 の 修 正 (Edit Entry) Data Clip (E-Books) Literature Data Clip Personal Data Clip Profiles データクリップサービス (LITERATURE DATA CLIP) データクリップサービスとは データクリップサービスの 利 用 について PRF/LitCloud 電 子 書 籍... 36
3 雑 誌 調 査 サービス (CONTENTS SHEET SERVICE) 雑 誌 調 査 サービスとは 雑 誌 調 査 サービスの 利 用 について 電 子 書 籍 PRF/LitCloud への 登 録 について LITCLOUDS サーバーシステムの 導 入 について 免 責 連 絡 先
4 はじめに PRF/LitCloud とは PRF/LitCloud は [Protein Research Foundation/Literature Database on Clouds System]から 名 付 けられました PRF/LitCloud を 使 うことで ユーザー 独 自 の 文 献 データベースを 構 築 し イ ンターネットを 通 じてどこからでも 必 要 な 文 献 情 報 にアクセスして 簡 単 に 有 効 利 用 するこ とができます また 学 術 文 献 だけでなく 各 種 マニュアル 等 文 書 類 を 研 究 室 や 部 署 で 共 有 し 利 用 する ことができるので 文 書 管 理 共 同 利 用 システムとしてお 使 いいただくこともできます 動 作 環 境 PRF/LitCloud システムは ウェブブラウザから 利 用 することができます ウェブブラウザ が 動 作 する 環 境 であれば コンピュータのオペレーティングシステムやハードウェアは 問 いません 本 サービスを 有 効 に 利 用 するためには インターネット 接 続 環 境 が 必 要 となります 動 作 確 認 済 みウェブブラウザ マイクロソフト インターネットエクスプローラ (MS/Internet Explorer) グーグル クローム (Google/Chrome) モジラ ファイアフォックス (Mozilla/Firefox ) PRF/LitCloud システムでは データベースの 検 索 結 果 を 電 子 書 籍 として 出 力 することが できます また PubMED 文 献 データベースの 検 索 代 行 サービス (Literature Data Clip サー ビス)では 検 索 結 果 を 電 子 書 籍 として 提 供 しています 現 在 PRF/LitCloud サービスで 提 供 している 電 子 書 籍 のフォーマットは 以 下 の 3 種 類 です PDF フォーマット (Adobe Reader など) epub フォーマット(SONY Reader, Kobo など) MOBI フォーマット (Amazon Kindle など) 注 意 : 本 システムは 改 良 のため 予 告 なく 仕 様 を 変 更 することがあります 3
5 PRF/LitCloud システムの 概 要 科 学 研 究 において 各 種 の 文 献 情 報 を 効 率 的 に 収 集 管 理 利 用 することは 大 変 重 要 で あり 現 在 多 くの 文 献 データベースが 構 築 されてきています また インターネットの 普 及 に 伴 いウェブベースのデータベース 検 索 サービスも 多 くのサイトで 構 築 されています し かしながら これらの 文 献 情 報 を 一 元 的 に 管 理 し 利 用 するためには ユーザーが 文 献 管 理 シ ステムを 導 入 する 必 要 があります 当 財 団 では より 簡 便 にユーザーがデータベースを 構 築 し 利 用 できるようなサービスが 科 学 研 究 において 重 要 性 を 増 してきていると 考 え PRF/LitCloud サービスの 提 供 を 始 めました PRF/LitCloud サービス の 特 徴 は 次 の 通 りです ユーザーが 独 自 の 文 献 データベースを 構 築 し インターネットを 通 じて 利 用 すること ができます インターネット 接 続 環 境 とウェブブラウザが 動 作 すれば 従 来 型 のパーソナルコンピ ュータ 以 外 にも タブレット PC やスマートフォンからも 利 用 できます PRF/LitCloud 文 献 データベースから 抽 出 したデータを 電 子 書 籍 化 して 利 用 できます インターネットに 接 続 できない 時 も 文 献 情 報 の 確 認 ができます PRF/LitCloud 文 献 データベースを 検 索 抽 出 したデータを 他 の 文 献 管 理 システムで 利 用 することができます 本 マニュアルについて 本 マニュアルでは Windows 7 上 で 動 作 している Google Chrome の 表 示 を 例 にしておりま す お 使 いのコンピュータ オペレーティングシステム ウェブブラウザによっては 表 示 が 異 なる 可 能 性 があります 4
6 PRF/LitCloud サービス ログイン PRF/LitCloud サービスを 利 用 するためには ウェブブラウザで 当 財 団 のサービス URL にア クセスします ユーザーID とパスワードを 入 力 して [Login] ボタンをクリックします 初 回 ログイン 時 には サービス 申 し 込 み 時 にお 知 らせしたユーザーIDとパスワードを 入 力 してください パスワードは ログイン 後 にメイン 画 面 の Profiles から 変 更 できます 入 力 したユーザーID あるいはパスワードが 一 致 しない 場 合 以 下 の 画 面 が 表 示 されます [ 戻 る]ボタンをクリックして ログインをやり 直 してください ユーザーID とパスワードの 保 管 には 十 分 ご 注 意 ください 画 面 の 例 は Google Chrome のものです お 使 いのブラウザによって 若 干 表 示 が 異 な る 場 合 があります 5
7 サービスメニュー ログインするとサービスメニューが 表 示 されます ログインしたままで コンピュータを 放 置 することは 大 変 危 険 ですのでおやめ ください ログインした 状 態 でコンピュータが 30 分 以 上 放 置 された 場 合 ログインが 無 効 とな り サービスの 利 用 ができなくなります その 場 合 は 最 初 からログインをやり 直 してください 6
8 Database Search サービスメニュー 内 の Database Search では 文 献 データベースを 検 索 します Search Fields を 選 択 し Search Terms を 入 力 して [Search]ボタンをクリックすると 文 献 データベースを 検 索 することができます Search Fields: 文 献 検 索 の 対 象 となる 項 目 ( 検 索 項 目 )を 選 択 します 複 数 選 択 すること ができます 選 択 した 項 目 が 複 数 の 場 合 は 各 項 目 についての OR 検 索 を 行 います すなわち 選 択 したいずれかの 項 目 が 該 当 する 文 献 が 検 索 さ れます Search Fields は 少 なくとも 一 つ 選 択 する 必 要 があります Bibliography Author Title/Abstract Memo Latest Issue 書 誌 事 項 を 検 索 します 雑 誌 名 巻 号 年 ページ 執 筆 者 名 を 検 索 します タイトルとアブストラクトを 検 索 します ユーザーが 文 献 に 追 加 登 録 したメモの 内 容 を 検 索 します 検 索 範 囲 をデータクリップサービスで 作 成 した 最 新 のデー タに 限 定 します Search Terms: テキストボックス 内 に 検 索 する 語 句 ( 検 索 条 件 )を 入 力 します 複 数 の 語 を 入 力 したときは すべての 単 語 の AND 検 索 を 行 います すなわち 入 力 した 単 語 をすべて 含 んでいる 文 献 が 検 索 されます 検 索 語 として 英 語 以 外 の 言 語 の 入 力 も 可 能 です 7
9 Bookmarked Case Insensitive Case Sensitive ユーザーがブックマークをつけた 文 献 を 検 索 します 検 索 語 として Bookmarked を 選 択 した 場 合 他 の 検 索 条 件 は 無 視 されます 検 索 語 の 大 文 字 小 文 字 を 区 別 しません 検 索 語 の 大 文 字 小 文 字 を 区 別 します Search Fields を 選 択 せずに[Search]ボタンをクリックするとエラーになります [ 戻 る]ボタ ンをクリックして Search Fields を 選 択 してください Search Terms を 入 力 しない 状 態 すなわち Bookmarked の 選 択 も 検 索 語 句 の 入 力 もしない 状 態 で[Search]ボタンをクリックするとエラーになります [ 戻 る]ボタンをクリックして Search Terms を 入 力 してください 選 択 した Search Fields や 入 力 した Search Terms などを 削 除 して 最 初 の 状 態 に 戻 したいと きは [Clear]ボタンをクリックしてください 8
10 検 索 例 :Title/Abstract に peptide, synthesis を 含 む 文 献 を 検 索 する Search Fields で[Title/Abstract]を 選 択 し Search Terms に[peptide synthesis]を 入 力 し [Search] ボタンをクリックすると 検 索 結 果 がリスト 表 示 されます 文 献 番 号 ボタン クリックすると 文 献 内 容 が 詳 細 表 示 され ます データクリップ 作 成 ボタン 検 索 結 果 を 電 子 書 籍 化 します サービスメニューに 戻 り ます 検 索 結 果 は 文 献 の 書 誌 事 項 とタイトルのリスト 表 示 です [Return to Menu]ボタンをクリックするとサービスメニューに 戻 ります 9
11 文 献 情 報 の 詳 細 表 示 各 文 献 の 文 献 番 号 ボタンをクリックすると その 文 献 の 詳 細 情 報 が 表 示 されます Database Search の 検 索 語 が 強 調 表 示 されます 10
12 Literature Information: 文 献 情 報 です ユーザーが 追 加 した 情 報 があれば それらも 表 示 されます ID Bookmark Journal Link Articles (Ref.4) Title Author Abstract Address Memo 文 献 整 理 のための 文 献 番 号 です 文 献 登 録 時 に 自 動 的 に 付 加 さ れます ユーザーが 文 献 につけるブックマークです ブックマークのつ いた 文 献 だけを 抽 出 することもできます 文 献 の 書 誌 事 項 です 雑 誌 名 巻 号 ページ 年 です 有 用 なデータベースへのリンク 情 報 があれば 表 示 されます PubMED: PubMeD へのリンクです クリックすると PubMed デ ータベースの 該 当 する 情 報 が 表 示 されます (Ref. 1) DOI: 文 献 に Digital Object Identifier 情 報 があれば 表 示 されま す クリックすると 出 版 元 の 該 当 する 文 献 情 報 が 表 示 されます 文 献 PDF 等 の 付 加 情 報 が 得 られることがあります (Ref.2) OpenAccess: 文 献 が Open Access となっていれば リンクが 表 示 されます クリックすると 文 献 の 公 開 状 況 が 表 示 されます PDF がすでに 公 開 済 みであれば 文 献 PDF が 表 示 されます (Ref.3) ユーザーが 登 録 した 文 献 に 関 連 する 情 報 ファイルです 一 文 献 について 2 件 までの 関 連 ファイルを 登 録 できます 文 献 PDF や 参 考 文 献 ファイルを 登 録 しておくと 便 利 です リンクをクリッ クすると 開 くことができます 文 献 のタイトルです 文 献 の 著 者 です 文 献 のアブストラクトです 著 者 の 所 属 連 絡 先 です ユーザーが 文 献 につけたメモです 日 本 語 も 使 用 できます Additional Information: ユーザーが 文 献 に 付 加 する 情 報 を 入 力 修 正 します Memo 文 献 に 付 加 するメモを 入 力 修 正 します Reference 1 文 献 に 付 加 する 関 連 情 報 ファイルを 修 正 追 加 削 除 します Reference 2 文 献 に 付 加 する 関 連 情 報 ファイルを 修 正 追 加 削 除 します 文 献 情 報 を 修 正 した 結 果 は 文 献 表 示 画 面 から 移 動 したときに 自 動 的 にデータベースに 反 映 されます 11
13 リンク 情 報 付 加 ファイルの 表 示 画 面 ( 参 考 例 ) Ref. 1: 該 当 する PubMED 情 報 の 表 示 Ref. 2: DOI 経 由 の 文 献 情 報 の 表 示 ( 出 版 元 の 情 報 ) Ref. 3: Open Access 情 報 Ref. 4: 登 録 した 付 加 情 報 ファイル ( 文 献 PDF が 出 版 元 で 公 開 されている) ( 文 献 PDF をデータベースに 付 加 ) 12
14 文 献 詳 細 表 示 のコントロール 機 能 ボタン Edit Literature Data Prev Next Return to List Return to Menu クリックすると 登 録 されている 文 献 情 報 のすべての 項 目 を 編 集 する 画 面 が 表 示 されます 詳 細 表 示 画 面 で 入 力 したデータ 修 正 は 無 視 されて オリ ジナルのデータが 表 示 されます ひとつ 前 の 文 献 の 詳 細 表 示 を 行 います 詳 細 表 示 画 面 で 修 正 されたデータが データベースに 登 録 されます ひとつ 後 の 文 献 の 詳 細 表 示 を 行 います 詳 細 表 示 画 面 で 修 正 されたデータが データベースに 登 録 されます 検 索 結 果 のリストに 戻 ります 詳 細 表 示 画 面 で 修 正 されたデータが データベースに 登 録 されます サービスメニュー 画 面 に 戻 ります 詳 細 表 示 画 面 で 修 正 されたデータが データベースに 登 録 されます 13
15 文 献 情 報 の 編 集 [Edit Literature Data]ボタンをクリックすると 文 献 情 報 のすべての 項 目 を 編 集 することが できます また 文 献 データを 削 除 することができます Save Clear Delete Entry Return to Menu 修 正 した 文 献 情 報 が データベースに 登 録 されます 入 力 したデータがすべて 初 期 化 されて 変 更 前 の 状 態 に 戻 ります 表 示 している 文 献 情 報 をデータベースから 削 除 します ボタンをクリックすると 直 ちにデータを 削 除 します 削 除 したデータは 元 に 戻 すことができませんので ご 注 意 ください サービスメニュー 画 面 に 戻 ります 14
16 検 索 結 果 の 電 子 書 籍 化 [Data Clipping]ボタンをクリックすると 検 索 結 果 を 電 子 書 籍 化 することができます この 機 能 をつかうことで 文 献 データベースからとりだした 必 要 な 文 献 情 報 だけをまとめて 効 率 的 に 利 用 することができます Data Set File Name Data Format データの 抽 出 内 容 検 索 条 件 が 表 示 されています 作 成 する 電 子 書 籍 のファイル 名 を 入 力 します ファイル 名 に 日 本 語 はつかえません 作 成 する 電 子 書 籍 のファイル 形 式 を 選 択 します 複 数 選 択 する こともできます PDF Format: Adobe Reader などで 閲 覧 できます MOBI Format: Amazon Kindle 等 で 閲 覧 できます epub Format: SONY Reader, Kobo 等 で 閲 覧 できます Mail スマートフォンやタブレットでも 上 記 ファイルを 閲 覧 するた めのアプリが 開 発 されています 作 成 した 電 子 書 籍 を 登 録 メールアドレスに 送 信 するかどうかを 選 択 します Sending をチェックすると 作 成 した 電 子 書 籍 が 登 録 している 電 子 メールアドレス 宛 に 送 信 されます (Profile を 参 照 してく ださい ) ファイル 名 の 入 力 と 出 力 データ 形 式 の 選 択 がおわったら [Next]ボタンをクリックします 電 子 書 籍 ファイルが 作 成 されます 15
17 [Clear]ボタンをクリックすると 入 力 項 目 を 元 に 戻 すことができます Mail で Sending をチェックしたときは 作 成 したファイルが Profile で 登 録 した 電 子 メ ールアドレス 宛 に 添 付 書 類 として 送 信 されます また サービスメニューの Data Clip (E-Books) の Personal Data Clip に 登 録 されています ここから 電 子 書 籍 データをダウンロー ドすることもできます [Return to Menu]ボタンをクリックすると サービスメニューにもどります 16
18 Literature List View 文 献 データベースを 一 覧 表 示 することができます Literature Data Clip で 登 録 された 文 献 情 報 を 1 号 としてまとめています データクリップサービスを 利 用 すると 定 期 的 に 文 献 情 報 を 検 索 し 電 子 書 籍 化 するとともに PRF/LitCloud のデータベースにも 登 録 されます データクリップサービスで 定 期 的 に 登 録 された 文 献 情 報 をチェックするときに 便 利 な 機 能 です Latest Issue Select Issue to browse Literature Data Clip の 最 新 刊 が 一 覧 表 示 されます 一 覧 表 示 したい Literature Data Clip を 選 択 します [Browse]ボタンをクリックすると 選 択 した Literature Data Clip が 一 覧 表 示 されます [Clear] ボタンをクリックすると 元 の 状 態 に 戻 ります 17
19 検 索 結 果 は 文 献 の 書 誌 事 項 とタイトルのリスト 表 示 です [Return to Menu]ボタンをクリックするとメニューに 戻 ります Literature Data Clip の 巻 号 が 表 示 され ています 文 献 番 号 ボタン メニューに 戻 ります 文 献 情 報 の 詳 細 表 示 各 文 献 の 文 献 番 号 ボタンをクリックすると その 文 献 の 詳 細 情 報 が 表 示 されます 文 献 表 示 の 内 容 や 機 能 については Database Search での 文 献 表 示 と 同 じです 詳 細 については Database Search の 記 載 を 参 照 してください Literature Data Clip Service の 検 索 語 が 強 調 表 示 されます 文 献 リストの 電 子 書 籍 化 Literature List View では 表 示 内 容 を 個 別 に 電 子 書 籍 化 する 機 能 はありません 18
20 Literature Database 文 献 データベースへの 文 献 情 報 の 新 規 登 録 ( 追 加 )と 格 納 されている 文 献 情 報 を 編 集 を 行 います 文 献 情 報 の 新 規 登 録 (Add New Entry) 文 献 データベースに 新 規 の 文 献 情 報 を 登 録 します [Add New Entry]をチェックして [Next] ボタンをクリックすると 文 献 情 報 の 入 力 方 法 の 選 択 画 面 が 表 示 されます 19
21 データの 入 力 方 法 を 選 択 して [Next]ボタンをクリックすると 選 択 した 方 法 によって 文 献 情 報 の 入 力 ができます Direct Input 文 献 情 報 のすべての 項 目 を 直 接 入 力 します 例 えば 文 献 PDF などからコピー&ペースト して 文 献 を 登 録 するときに 便 利 な 入 力 方 法 です データ 入 力 完 了 後 に[Save]ボタンをクリックすると 文 献 情 報 が 登 録 されます 日 本 語 を 使 用 することもできます 文 献 番 号 は 自 動 的 に 付 加 されます [Clear]ボタンをクリックすると 入 力 前 の 状 態 に 戻 ります [Return to Menu]ボタンをクリックするとメニューに 戻 ります 入 力 中 のデータはすべて 破 棄 されます 20
22 文 献 を 追 加 登 録 のため データを 入 力 必 要 なデータを 入 力 後 [Save]ボタンをクリックすると データが 登 録 されます 21
23 Digital Object Identifier (DOI) データベースに 登 録 したい 文 献 の DOI が 分 かっている 場 合 は DOI を 入 力 するだけで 文 献 情 報 を 登 録 することができます Digital Object Identifier (DOI)をチェックする DOI の 番 号 を 入 力 する Digital Object Identifier (DOI)をチェックして IDのテキストボックスに DOI の 番 号 を 入 力 してください [Next]ボタンをクリックすると 公 開 データベースを 検 索 して 該 当 する 文 献 のデータを 収 集 し データ 登 録 をします 文 献 の DOI が 分 かっているときは この 機 能 を 使 うことで 文 献 情 報 の 入 力 を 簡 単 におこなうことができます 登 録 しようとした 文 献 情 報 がすでに 登 録 済 みであれば データの 追 加 は 行 いません また 入 力 した DOI に 該 当 する 文 献 データがない 場 合 も データ 追 加 は 行 いません 22
24 また DOI の ID を 複 数 登 録 したテキストファイルを 準 備 すれば 一 度 に 複 数 の 文 献 を 登 録 することができます DOI を 1 行 に 1 件 ずつ 入 力 したテキストファイルをメモ 帳 などのテキストエディタをつか って 準 備 します Digital Object Identifier (DOI)をチェックする [ファイルを 選 択 ]ボタ ンをクリックする ID File: で[ファイルを 選 択 ]をクリックします (お 使 いのブラウザによっては 異 なる 表 記 がされている 可 能 性 があります )ファイル 選 択 の 画 面 が 表 示 されます DOI リストのファイルを 選 択 して [ 開 く]をクリックします 23
25 選 択 したファイルが 表 示 されています ファイルが 間 違 っていないことを 確 認 して [Next]ボタンをクリックします 文 献 情 報 がデータベースに 登 録 されます DOI リストに 記 載 されている 文 献 の 中 にすでに 登 録 済 みの 文 献 があった 場 合 は [ 登 録 済 み] 表 示 されます 登 録 済 みの 文 献 は 2 重 に 登 録 さ れることはありません 未 登 録 の 文 献 だけが データベースに 追 加 されます 文 献 の 同 一 性 のチェックは PubMED ID で 行 っています そのため 手 作 業 による 文 献 入 力 などで PubMED ID が 記 載 されていない 場 合 は 同 一 の 文 献 が 重 複 してデータベースに 格 納 されることがあります 24
26 PubMED ID データベースに 登 録 したい 文 献 の PubMED ID が 分 かっている 場 合 は PubMED ID を 入 力 するだけで 文 献 情 報 を 登 録 することができます PubMed ID をチェックする PubMed ID を 入 力 する PubMed ID をチェックして IDのテキストボックスに PubMed ID の 番 号 を 入 力 してくだ さい [Next]ボタンをクリックすると 公 開 データベースを 検 索 して 該 当 する 文 献 のデータを 収 集 し データ 登 録 をします 文 献 の PubMed ID が 分 かっているときは この 機 能 を 使 うこ とで 文 献 情 報 の 入 力 を 簡 単 におこなうことができます 登 録 しようとした 文 献 情 報 がすでに 登 録 済 みであれば データの 追 加 は 行 いません 25
27 また PubMed ID を 複 数 登 録 したテキストファイルを 準 備 すれば 一 度 に 複 数 の 文 献 を 登 録 することができます PubMed ID を 1 行 に 1 件 ずつ 入 力 したテキストファイルをメモ 帳 などのテキストエディタ をつかって 準 備 します PubMed ID をチェックする [ファイルを 選 択 ]ボタ ンをクリックする ID File: で[ファイルを 選 択 ]をクリックします (お 使 いのブラウザによっては 異 なる 表 記 がされている 可 能 性 があります )ファイル 選 択 の 画 面 が 表 示 されます PubMed ID リストのファイルを 選 択 して [ 開 く]をクリックします 26
28 選 択 したファイルが 表 示 されています ファイルが 間 違 っていないことを 確 認 して [Next]ボタンをクリックします 文 献 情 報 がデータベースに 登 録 されます PubMed ID リストに 記 載 されている 文 献 の 中 に すでに 登 録 済 みの 文 献 があった 場 合 は [ 登 録 済 み] 表 示 されます 登 録 済 みの 文 献 は 2 重 に 登 録 されることはありません 未 登 録 の 文 献 だけが データベースに 追 加 されます 文 献 の 同 一 性 のチェックは PubMED ID で 行 っています そのため 手 作 業 による 文 献 入 力 などで PubMED ID が 記 載 されていない 場 合 は 同 一 の 文 献 がデータベースに 格 納 される ことがあります 27
29 Medline Format Text File Medline Format の 文 献 情 報 ファイルを 文 献 データベースに 取 り 込 むことができます Medline Format は 多 くの 文 献 管 理 システムで 採 用 されている 一 般 的 なフォーマットです Medline Text Format をチェ ックする [ファイルを 選 択 ]ボタ ンをクリックする ID File: で[ファイルを 選 択 ]をクリックします (お 使 いのブラウザによっては 異 なる 表 記 がされている 可 能 性 があります )ファイル 選 択 の 画 面 が 表 示 されます Medline Format の 文 献 情 報 テキストのファイルを 選 択 して [ 開 く]をクリックします 選 択 したテキストファイル が 表 示 されています 28
30 ファイルが 間 違 っていないことを 確 認 して [Next]ボタンをクリックします 文 献 データが 追 加 されました 注 1)PubMed 検 索 では 未 発 行 の 文 献 も 表 示 されています 未 発 行 の 文 献 には 巻 号 ページが 表 記 されていません 注 2)Medline Format Text を 用 いた 文 献 追 加 では 未 発 行 の 文 献 も 追 加 されます Medline Format Text File の 作 成 について( 参 考 ) PubMed の 文 献 検 索 システムを 使 って Medline Format で 検 索 結 果 を 出 力 することができま す ここでは 一 例 として PubMed で 文 献 検 索 して その 結 果 を Medline Format で 出 力 する 過 程 を 示 します PubMed 検 索 の 詳 細 については PubMed ホームページを 参 照 してください URL: 検 索 語 を 入 力 して Search ボタ ンをクリックします 例 として [peptide solid phase synthesis]を 検 索 します [Search]ボタンをクリックすると 検 索 結 果 がリスト 表 示 されます 29
31 ファイル 出 力 したい 文 献 をチェック します 複 数 の 文 献 を 選 択 できます Send to ボタンをクリックします ファイル 出 力 したい 文 献 をチェックして Send to をクリックすると 出 力 先 の 選 択 が 表 示 されます (Choose Desitnation) Choose Destination で File をチェックすると ファイル 形 式 の 選 択 が 表 示 されます File を 選 択 します MEDLINE を 選 択 します Create File をクリックします 30
32 Format で MEDLINE を 選 択 します Sort by で 文 献 の 出 力 順 を 設 定 することができます Create File をクリックすると 選 択 した 文 献 情 報 が Medline Format のテキストファイルが 作 成 され ダウンロードされます 文 献 ファイルがダウンロ ードされます 検 索 選 択 された 文 献 情 報 の Medline Format のテキストファイルです PubMed 検 索 では 未 発 行 の 文 献 情 報 も 表 示 されています 未 発 行 の 文 献 には 巻 号 ページが 表 記 されません 表 示 例 は 未 発 行 の 文 献 です 31
33 文 献 情 報 の 修 正 (Edit Entry) 文 献 データベースの 文 献 情 報 を 修 正 します 編 集 したい 文 献 データの 文 献 番 号 が 分 かって いるときに 直 接 文 献 番 号 を 入 力 して データ 修 正 を 行 います [Edit Entry]をチェックし ID:のテキストボックスに 文 献 番 号 を 入 力 します Edit Entry をチェックします 文 献 番 号 を 入 力 します [Next]ボタンをクリックすると 該 当 する 文 献 情 報 の 修 正 画 面 が 表 示 されます 文 献 情 報 の すべての 項 目 を 修 正 することができます また 文 献 データの 削 除 をすることもできます Save Clear Delete Entry Return to Menu 修 正 した 文 献 情 報 が データベースに 登 録 されます 入 力 したデータがすべて 初 期 化 されて 元 の 状 態 に 戻 りま す 表 示 している 文 献 情 報 をデータベースから 削 除 します ボタンをクリックすると 直 ちにデータを 削 除 します 削 除 したデータは 元 に 戻 すことができませんので ご 注 意 ください サービスメニュー 画 面 に 戻 ります 32
34 Data Clip (E-Books) 電 子 書 籍 をダウンロードします 当 財 団 の Literature Data Clip サービスで 定 期 的 に 作 成 した 電 子 書 籍 (Literature Data Clip)とユーザーがデータベースを 検 索 した 結 果 をまとめた 電 子 書 籍 (Personal Data Clip)があります Literature Data Clip Literature Data Clip サービスは ユーザーが 指 定 した 条 件 をもちいて 当 財 団 が 定 期 的 に 文 献 調 査 を 行 った 結 果 をユーザーのデータベースに 格 納 するサービスです また データ 格 納 と 同 時 に 電 子 書 籍 (PDF, MOBI, epub フォーマット)を 作 成 して ユーザーに 電 子 メールで 送 付 しています それらの 電 子 書 籍 のバックナンバーをダウンロードすることができます ダウンロードする 電 子 書 籍 の 号 とファイル 形 式 を 選 択 して [Download]ボタンをクリック するとファイルをダウンロードすることができます ファイ ル 形 式 は PDF, MOBI, epub の 3 種 類 があります ファイル 形 式 に 合 わせて 適 当 な 電 子 書 籍 リーダーや ソフトウェア を 利 用 してください 左 図 は PDF 形 式 のファイルをダウンロ ードした 場 合 の 例 です Adobe Reader で 表 示 しています 33
35 Personal Data Clip 文 献 データベースを 検 索 した 結 果 をユーザーが 電 子 書 籍 としてまとめることができます 電 子 書 籍 化 の 操 作 の 詳 細 については 本 マニュアルの [Database Search] - [ 検 索 結 果 の 電 子 書 籍 化 ]の 項 を 参 照 してください ダウンロードする 電 子 書 籍 の 号 とファイル 形 式 を 選 択 して [Download]ボタンをクリック するとファイルをダウンロードすることができます ファイル 形 式 は PDF, MOBI, epub の 3 種 類 があります ファイル 形 式 に 合 わせて 適 当 な 電 子 書 籍 リーダーや ソフトウェアを 利 用 してください PDF 形 式 のファイルをダウンロードした 場 合 の 例 です Adobe Reader で 表 示 しています Personal Data Clip の 電 子 書 籍 は 削 除 することができます 削 除 したい 電 子 書 籍 の 号 を 選 択 して [Delete E-Book]ボタンをクリックすると 該 当 するすべてのデータフォーマットの 電 子 書 籍 を 削 除 します ボタンをクリックすると 直 ちにファイルは 削 除 されます 削 除 したファイルを 元 に 戻 すこ とはできませんので ご 注 意 ください 34
36 Profiles ユーザー 情 報 が 表 示 されています ユーザー 情 報 を 変 更 したいときは [Change Profile]ボ タンをクリックします Theme User ID Name Password Institute Section Literature Data Clip サービスで 文 献 を 検 索 する 条 件 です 変 更 したいときは 当 財 団 まで 遠 慮 なくご 連 絡 ください PRF/LitClouds サービスを 利 用 するときのユーザーIDです 変 更 できません ユーザー 名 です PRF/LitClouds サービスを 利 用 するときのパスワードです 確 認 のために 同 じパスワードを 2 回 入 力 してください 安 全 のため 定 期 的 な 変 更 をお 勧 めします パスワードの 強 度 にご 注 意 ください 所 属 を 入 力 します 空 欄 のままでもかまいません 部 署 を 入 力 します 空 欄 のままでもかまいません 連 絡 のためのメールアドレスです 電 子 書 籍 を 添 付 して 送 りますので 添 付 書 類 を 受 け 取 る ことのできるアドレスを 登 録 してください 35
37 データクリップサービス (Literature Data Clip) データクリップサービスとは PRF/LitCloud サービスは 文 献 情 報 を 管 理 利 用 するためのシステムです ユーザーが 必 要 とする 文 献 情 報 を 簡 単 に 登 録 できるように 各 種 の 機 能 を 備 えていますが 個 別 に 必 要 な 文 献 情 報 を 検 索 しデータベース 登 録 するのは やはり 煩 雑 な 作 業 となりがちです そこで 当 財 団 では PRF/LitCloud サービスのユーザーに 無 料 で PubMED 文 献 データベ ースの 検 索 代 行 サービス(データクリップサービス) をご 利 用 いただけるようにしていま す このサービスはユーザーが 設 定 した 検 索 条 件 で 定 期 的 に PubMED 文 献 データベースを 検 索 し ユーザーがお 使 いの PRF/LitCloud サービスのデータベースに 検 索 結 果 の 文 献 情 報 を 格 納 するとともに 電 子 書 籍 化 してユーザーあてにメール 配 信 をおこなうサービスです データクリップサービスの 利 用 について PRF/LitCloud 検 索 結 果 は ユーザーの PRF/LitCloud サーバーのデータベースに 格 納 されています PRF/LitCloud にログインし Literature List View 機 能 を 使 って 検 索 結 果 を 一 覧 利 用 するこ とができます また Database Search をすることもできます 詳 細 については 本 マニュア ルの PRF/LitCloud の 項 目 を 参 照 してください 電 子 書 籍 文 献 検 索 の 結 果 を 電 子 書 籍 化 して 登 録 されたメールアドレス 宛 に 送 信 します メールに 添 付 する 電 子 書 籍 には PDF 形 式 epub 形 式 MOBI 形 式 の3 種 類 を 用 意 しています 電 子 書 籍 を 閲 覧 するためには 適 応 する 電 子 書 籍 リーダーが 必 要 です お 使 いのPC,タ ブレットにあわせて 電 子 書 籍 リーダーをお 使 いください 推 奨 電 子 書 籍 リーダー アプリケーション 形 式 パーソナルコンピュータ タブレット PC 電 子 書 籍 リーダー PDF Adobe Reader SONY Reader, Amazon Kindle, Kobo Reader Adobe Reader, Perfect Viewer など MOBI Mobipocket Reader, Kindle for Amazon kindle PC Kindle for Android, Kindle for ipad など epub Calibre, Adobe Digital Edition SONY Reader FBReader, Aldiko Book Reader など 36
38 上 記 のほかにも 多 くのアプリケーションや 書 籍 リーダーがあります また ご 利 用 の 端 末 からインターネットに 接 続 することができると データクリップサービスをさらにご 活 用 いただけます データクリップサービス 電 子 書 籍 PDF 形 式 MOBI 形 式 epub 形 式 (Adobe Reader) (Mobipocket Reader) (Calibre) データクリップサービス 電 子 書 籍 内 容 例 (PDF 形 式 ) インターネットに 接 続 できる 環 境 であれば [PubMED] [DOI]をクリックすることで そ れぞれの 公 共 文 献 データベースの 文 献 情 報 を 閲 覧 することができます 文 献 がオープンアク セスとなっている 場 合 には[OpenAccess]が 表 示 されます 37
39 PubMED DOI 定 期 検 索 の 検 索 条 件 の 変 更 や 単 発 で 検 索 条 件 を 設 定 して 文 献 検 索 を 行 うことも 可 能 です 検 索 条 件 の 設 定 についてのご 相 談 も 承 っております 遠 慮 なく 担 当 者 までご 連 絡 ください 38
40 雑 誌 調 査 サービス (Contents Sheet Service) 雑 誌 調 査 サービスとは PRF/LitCloud サービスのユーザーは 無 料 で 雑 誌 調 査 の 代 行 サービス( 雑 誌 調 査 サービス) をご 利 用 いただけます ユーザーが 特 に 興 味 を 持 っている 雑 誌 について 定 期 的 にコンテン ツ( 書 誌 事 項 タイトル アブストラクト)を 電 子 書 籍 化 してユーザーあてにメール 配 信 を おこなうサービスです 雑 誌 調 査 サービスの 結 果 については PRF/LitCloud のデータベースへのデータの 自 動 登 録 は 行 いません データベースへは 電 子 書 籍 から 個 別 に 登 録 することができます 雑 誌 調 査 サービスの 利 用 について 電 子 書 籍 文 献 検 索 の 結 果 を 電 子 書 籍 化 して 登 録 されたメールアドレス 宛 に 送 信 します メールに 添 付 する 電 子 書 籍 には PDF 形 式 epub 形 式 MOBI 形 式 の3 種 類 を 用 意 しています 電 子 書 籍 を 閲 覧 するためには 適 応 する 電 子 書 籍 リーダーが 必 要 です お 使 いのPC,タ ブレットにあわせて 電 子 書 籍 リーダーをお 使 いください 推 奨 電 子 書 籍 リーダー アプリケーション 形 式 パーソナルコンピュータ タブレット PC 電 子 書 籍 リーダー PDF Adobe Reader SONY Reader, Amazon Kindle, Kobo Reader Adobe Reader, Perfect Viewer など MOBI Mobipocket Reader, Kindle for Amazon kindle PC Kindle for Android, Kindle for ipad など epub Calibre, Adobe Digital Edition SONY Reader FBReader, Aldiko Book Reader など 上 記 のほかにも 多 くのアプリケーションや 書 籍 リーダーがあります また ご 利 用 の 端 末 からインターネットに 接 続 することができると 雑 誌 調 査 サービスをさらにご 活 用 いただ けます 39
41 雑 誌 調 査 サービス 電 子 書 籍 PDF 形 式 MOBI 形 式 epub 形 式 (Adobe Reader) (Mobipocket Reader) (Calibre) 雑 誌 調 査 サービス 電 子 書 籍 内 容 例 (PDF 形 式 ) 調 査 雑 誌 :Cell, Journal of Bacteriology インターネットに 接 続 できる 環 境 であれば [PubMED] [DOI]をクリックすることで そ れぞれの 公 共 文 献 データベースの 文 献 情 報 を 閲 覧 することができます 文 献 がオープンアク セスとなっている 場 合 には[OpenAccess]が 表 示 されます PRF/LitCloud への 登 録 について インターネットに 接 続 できる 環 境 であれば [LitCloud]をクリックすると ユーザーの PRF/LitCloud データベースに 該 当 する 文 献 情 報 が 登 録 されます すでに 登 録 済 みの 文 献 を2 重 に 登 録 することはありません 40
42 登 録 結 果 は PRF/LitCloud サービスから 利 用 することができます 41
43 LitClouds サーバーシステムの 導 入 について PRF/LitCloud サービスは インターネットを 通 じて 一 般 財 団 法 人 蛋 白 質 研 究 奨 励 会 内 の 文 献 管 理 データベースにアクセスして 文 献 情 報 を 管 理 利 用 するためのシステムです 本 サ ービスでは ユーザーの 登 録 データ 文 献 データベースおよび 利 用 システムは 当 財 団 内 に 設 置 されたサーバーに 格 納 されています 当 財 団 では データおよび 個 人 情 報 の 管 理 に 十 分 注 意 しておりますが ユーザーの 社 内 規 定 などにより 外 部 のサーバーの 利 用 が 難 しい 情 報 デ ータもあるかとおもいます 社 内 で 独 自 に LitCloud サービスを 立 ち 上 げて 利 用 していただくことができるように 当 財 団 では LitCloud システム( 管 理 システム 利 用 システム)のサーバーの 販 売 もしておりま す サーバーの 内 容 や 設 置 方 法 などの 詳 細 については 当 財 団 までお 問 い 合 わせください なお 社 内 で 独 自 サーバーを 構 築 利 用 される 場 合 には データクリップサービスと 雑 誌 調 査 サービスの 電 子 書 籍 はご 利 用 いただけますが LitCloud システムへのデータ 導 入 はご 利 用 いただけません 42
44 免 責 当 財 団 の 提 供 する PRF/LitCloud サービスでは ユーザーの 文 献 データベース アップロー ドされたリファレンスファイル 等 を 細 心 の 注 意 をもって 管 理 いたしますが 完 全 な 保 管 をお 約 束 するものではありません 天 変 地 異 などによりデータベースやリファレンスファイルの 消 失 や データ 内 容 の 破 損 のため 復 元 できなくなる 可 能 性 もございます 最 終 的 なデータの バックアップについては ユーザーで 行 っていただきますようお 願 い 申 しあげます 連 絡 先 一 般 財 団 法 人 蛋 白 質 研 究 奨 励 会 情 報 室 担 当 者 : 磯 山 正 治 大 阪 府 箕 面 市 稲 Phone: FAX: misoyama@prf.or.jp URL: 43
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