まずは登録しよう My NCBIの登録
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- みいか おおばま
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1 日 本 大 学 歯 学 部 図 書 館 PubMed Manual Contents PubMed とは まずは 登 録 しよう My NCBI 手 軽 に 使 ってみる Search from Top page 特 定 の 文 献 を 素 早 く 探 す Single Citation Matcher テーマから 探 す Advanced Search P1 P2 P5 P6 P7 本 文 を 読 みたい 学 部 内 から 読 む/ 学 外 から 読 む P9 検 索 結 果 を 絞 り 込 みたい フィールド 指 定 Limits キーワードを 探 したい, 知 りたい Mesh Database 雑 誌 名 を 調 べたい, 雑 誌 を 探 したい Journal in NCBI Database これぞ,という 論 文 をもとに 探 したい Related Citation P12 P15 P17 P18 エビデンスレベルの 高 い 文 献 を 素 早 く 探 す Clinical Queries P19 検 索 の 手 順 Search Procedure P20 検 索 記 録 文 献 の 保 管 と 管 理 Saving and Managing Bibliographies P21 主 要 画 面 説 明 P22 検 索 フィールドとタグ 一 覧, 入 力 方 法 資 料 種 類, 参 考 文 献 P24 P25
2 PubMedとは? "PubMed"とは 世 界 で 最 も 利 用 されている, 生 命 科 学 に 関 する 書 誌 情 報 データベース "Medline"の 無 料 検 索 システムのことです アメリカ 国 立 医 学 図 書 館 (NLM: National Library of Medicine)の 一 部 門 である 国 立 生 物 工 学 情 報 センター(NCBI:National Center for Biotechnology Information)が 提 供 しています 1946 年 以 降 に 登 録 された 約 2300 万 件 の 文 献, 約 5600 誌 の 学 術 雑 誌 の 書 誌 情 報 ( 文 献 の 情 報 )が 検 索 できます(2014 年 現 在 近 年 は 1 年 間 に 約 70 万 件 ずつ 増 加 ) 90% 以 上 が 英 語 論 文 です インターネット 登 場 以 前 は, 図 書 館 に 論 文 を 調 べるための 専 門 の 雑 誌 ( 索 引 誌 )があり, 医 学 の 分 野 では,1879 年 に 創 刊 された Index Medicus"が 中 心 的 存 在 でした この 索 引 誌 のオンライン 版 が"Medline"です Medline は 様 々なプラットフォームから 利 用 できます Ovid SP, EBSCO host, J Dream Ⅲからも 学 内 から 利 用 可 能 です 1997 年 から Medline を 誰 でも 無 料 で 検 索 できるように 提 供 されたのが,PubMed です PubMed を 利 用 すれば,Medline 登 録 前 の 文 献 や Medline 以 外 の NLM データベースなどにも アクセスでき, 世 界 の 生 命 科 学 文 献 情 報 を 随 時 検 索 できるメリットがあります また, 協 力 出 版 社 の 原 著 フルテキストジャーナルとも 有 料 無 料 でリンクしており, 日 本 大 学 歯 学 部 も しくは 他 学 部 の 契 約 状 況 により 全 文 へのアクセスができるものがあります 近 年 は NCBI が 提 供 する PubMed Central という 全 文 フリーアクセスのデジタルアーカイブが 収 録 論 文 数 を 拡 大 しています PubMed のデータは, 出 版 社 から 雑 誌 発 行 とほぼ 同 時 に 送 られてくる 生 のデータを 基 に, 索 引 付 けや 各 種 番 号 付 与 等 が 行 われます この 作 業 が 終 わるまでは,MeSH 用 語 は 付 与 されま せんので MeSH を 使 う 検 索 はできません 検 索 結 果 は 新 しいものから 順 に 表 示 されるので, 最 初 の 方 のデータにはよく[as supplied by publisher]の 表 示 がでることがあります データ の 状 態 は 順 次 変 化 していきます 順 番 データの 状 態 画 面 表 示 1 雑 誌 出 版 社 から 提 供 されたばかりのレコード [PubMed-as supplied by publisher] 2 データ 整 備 作 業 中,MeSH の 付 与, 書 誌 事 項 確 認 [PubMed-in process] 3 Medline データとして 登 録 [PubMed-indexed formedline] 他 Medline データとして 登 録 しないレコード [PubMed] PubMed は 頻 繁 に 改 定 を 行 うので, 最 新 情 報 は 以 下 を 参 照 New and Noteworthy (PubMed top page より) MEDLINE/PubMed Resources Guide
3 まずは 登 録 しよう My NCBI PubMed にはインターネットが 接 続 されている 環 境 があればどこからでも 無 料 でアクセスでき ます ネット 上 の 住 所 URL は 利 用 する 場 合, 学 部 内 のネットワーク 内 から 歯 学 部 図 書 館 のホームページを 経 由 してアクセスすると, 大 学 内 の 所 蔵 へナビゲートするアイコン(SFX)が 利 用 できるので 便 利 です ( 歯 学 部 図 書 館 URL= 頻 繁 に 利 用 する 場 合 は 登 録 するこ とをお 勧 めします 登 録 は 無 料 で す Pub Med トップ 画 面 右 上 の Sign In をクリック My NCBI の 画 面 へ Register for an account をクリック 必 要 事 項 を 入 力 後,Register をクリック 電 子 メールアドレスを 入 力 (オプション)すると, N LM(PubMed の 運 営 機 関 )から 確 認 のメールが 来 ます - 2 -
4 登 録 しておけば,1 検 索 結 果 の 長 期 保 存 2 検 索 式 を 記 録, 更 新 情 報 の 受 け 取 り( 保 存 した 検 索 式 の 結 果 を 定 期 的, 自 動 的 に 受 け 取 ることができる)など 便 利 な 機 能 が 使 えます ( 注 意 )PubMed は 無 料 の 書 誌 検 索 エンジンなので, 使 用 や 秘 密 保 持 に 関 する 契 約 はありません, 自 己 責 任 で 利 用 し てください 1 検 索 結 果 の 長 期 保 存 検 索 結 果 の 一 覧 から 保 存 したい 文 献 にチェックをつける Send to メニューから Collection を 選 択 し,Add to Collection をクリック My NCBI にサインインをしていないときは,Username/Password の 画 面 が 表 示 されるので 入 力 する Create new collection を 選 び Collection 名 を 付 けて Save をクリッ ク 既 存 のコレクションに 入 れる 場 合 は Append to an existing collection を 選 ぶ 一 時 的 な 保 存 は Send to から Clipboard を 使 う(8 時 間 保 存 可 能 ) もしくは, 検 索 結 果 から 論 文 のタイトルをクリック 論 文 の 抄 録 画 面 右 上 Save items 欄 の Favorite から 保 存 することもできる - 3 -
5 2よく 使 う 検 索 式 を 記 録, 更 新 情 報 の 受 け 取 り 検 索 を 実 行 後, 検 索 ボックス 下 の Save search をクリック 検 索 式 の 名 前 をつけて Save をクリック 詳 細 設 定 画 面 に 変 わる 保 存 した 検 索 式 を 自 動 実 行 して 電 子 メー ルへ 結 果 を 送 信 させる 設 定 ができる My NCBI 画 面 の 右 上 Help から 詳 細 な 説 明 が 得 られる 自 分 の 好 みに 合 わせたカスタマイズが 可 能 例 えば Filter your results( 絞 り 込 み) 機 能 を 設 定 しておくとかなり 便 利 Free Full Text や Review など 任 意 に 設 定 できる - 4 -
6 手 軽 に 使 ってみる Search from Top page PubMed による 検 索 の 基 本 は, 思 いつくキーワードを 検 索 ボックスに 入 力 することです 複 数 入 力 するときはスペースで 区 切 って(AND 検 索 ~P11 参 照 ) 入 力 します 例 えば 検 索 ボックスに 探 したい 文 献 の 著 者 名 を 入 力 して Search をクリック { 著 者 名 検 索 ~ラストネーム( 姓 )をフル で,ファーストネームとミドルネームはイ ニシャルで 入 力 2002 年 以 降 出 版 の 文 献 はフルネームで 検 索 できる} すると,その 著 者 名 を 含 む 文 献 が 新 しいものから 順 に 表 示 される 右 の 表 示 結 果 は 156 件 のうち の 50 件 Display Setting をクリックして 表 示 形 式 を 詳 細 表 示 などに 変 えることもできる 156 件 では 多 すぎるので, 接 着 を 表 すキー ワード(adhesive OR bonding)をスペース で 区 切 って 追 加 24 件 になった (OR 検 索 についてはP12 を 参 照 ) 絞 り 込 みの 方 法 はいろいろあり 自 分 で 考 えて 試 してみることが 重 要 安 易 に 絞 り 込 むと 欲 し い 文 献 が 漏 れることもあるので 注 意 が 必 要 - 5 -
7 特 定 の 文 献 を 素 早 く 探 す Single Citation Matcher 文 献 の 書 誌 情 報 から 論 文 を 探 す 場 合,PubMed では Single Citation Matcher を 使 うと 素 早 く 探 せ ます まず, 書 誌 情 報 を 見 て 刊 行 年, 巻 号, 開 始 ページ 数 を 記 録 します Van Meerbeek B, Peumans M, Verschueren M, Gladys S, Braem M, Lambrechts P. Clinical status of ten dentin adhesive systems. J Dent Res 1994; 73: ここでは, という 数 字 をメモ PubMed ト ッ プ ペ ー ジ か ら Single Citation Matcher をクリック 刊 行 年 巻 号, 開 始 ページ 数 を 入 れ,Search をクリ ック この 数 字 による 検 索 方 法 は 入 力 された 条 件 に 合 った 文 献 がすべて 検 索 されるが, 大 抵 は 一 桁 以 内 の 文 献 数 で 検 出 される 該 当 するものが 見 つからないときは 手 元 の 情 報 が 間 違 っている 可 能 性 があるので, 入 力 条 件 を 減 らす 変 える 等, 工 夫 してみる(PubMed 未 収 録 の 可 能 性 も 念 頭 に 置 く) - 6 -
8 テーマから 探 す Advanced Search 研 究 テーマのキーワードなどから 探 す 場 合, 検 索 式 と 検 索 件 数 を 表 示 させ,それをもとにかけ 合 わせていく 方 法 が 効 率 的 です トップ 画 面 から Advanced をクリック Advanced Search Builder の 検 索 ボックスにキーワードを 入 力 し,Add to history をクリック 画 面 下 部 History に 検 索 式 と 検 索 件 数 が 表 示 される この 作 業 を 繰 り 返 してゆく. History の 項 目 に 検 索 式 (キーワード)をひとつずつ 入 れ 終 えたら, それらをかけあわせてみる Add をクリックすると Builder に 番 号 が 追 加 されて, 自 動 的 に 1AND 2 などの 検 索 式 が 作 られていく Builder 左 のプルダウンを 使 っ て AND, OR, NOT(AND, OR 等 に ついてはP12 を 参 照 )を 指 定 して 検 索 をする - 7 -
9 #1~#3 を 掛 け 合 わせて,#4 にまとめた 検 索 件 数 をクリックすると 結 果 表 示 画 面 になる なぜ,この Advanced Search が 効 率 的 かというと,1 検 索 件 数 が 掌 握 できる2それをもとに 検 索 の 戦 略 を 立 てることができる3 検 索 結 果 に 納 得 できない 場 合,コトバの 組 み 合 わせを 変 えるな どのやり 直 しができることがあげられます 検 索 を 的 確 に 行 うことにつながります 単 一 のクエリーボックスに 複 数 のコトバを 入 れる 方 法 (P4)は, 検 索 行 為 が 偶 然 性 に 左 右 され がちです 予 備 検 索 やちょっとした 検 索 では 手 軽 で 有 用 ですが, 腰 をすえて 網 羅 的 に 調 査 をした い 場 合 は,Advanced Search を 利 用 するほうがより 良 い 結 果 を 得 られます 網 羅 的 に 検 索 をしたい 場 合 には,その 概 念 を 表 す 複 数 のコトバ( 同 義 語 )について OR 検 索 を 用 いて 検 索 をする 必 要 があります そのようなときにこの Advanced Search を 使 った ひとつず つ 検 索 が 有 効 な 手 段 となります 例 ) 抗 菌 物 質 について 考 えられる 物 質 名 を OR でつなぐ 唾 液 saliva と 掛 け 合 わせ(AND 検 索 )をすることにより 唾 液 抗 菌 物 質 に 関 する 文 献 を 検 索 初 めは 難 しく 面 倒 くさく 感 じられますが 慣 れると 検 索 が 楽 になります - 8 -
10 本 文 を 読 みたい 学 部 内 から 読 む PubMed で 検 索 した 文 献 の 本 文 を 読 みたい 場 合 は 文 献 の 詳 細 表 示 から 画 面 右 上 の Full text links を 利 用 します 1 出 版 社 のアイコン クリックをすると 出 版 社 のサイトへ 飛 ぶ このアイコンは PubMed と 協 力 関 係 にある 出 版 社 がつけているア イコンなので 日 本 大 学 歯 学 部 で 見 られるとは 限 らない 本 文 アクセスの 途 中 で ID/PW を 求 められるもしくは 価 格 の 表 示 が 出 るようであれば, 本 学 部 契 約 外 の ジャーナルである 可 能 性 が 高 い 2 SFX( 日 本 大 学 が 用 意 しているリンクリゾルバ) 出 版 社 アイコンで 本 文 にアクセスで きなかった 場 合 は SFX アイコンをク リック SFX とは 電 子 ジャーナルへ のリンクや 日 本 大 学 の 所 蔵 を 横 断 的 に 検 索 するシステム 学 部 内 のネットワークからであれ ば SFX アイコンが 表 示 される ここ から 調 べるのが 最 も 確 実 な 方 法 SFX をクリックして 上 から 調 べていく フルテキスト( 電 子 ジャーナルでの 本 文 )がない 場 合 は 日 本 大 学 蔵 書 目 録 横 断 検 索 システムをクリック - 9 -
11 日 本 大 学 各 学 部 の 検 索 結 果 一 覧 が 表 示 されるので この 中 から 歯 学 部 を 探 す 図 の 例 では 電 子 冊 子 とも 所 蔵 がある ことがわかる アイテムを 読 み 込 み を クリックすると 歯 学 部 OPAC へ 飛 ぶ 探 している 文 献 の 所 蔵 状 況 を 確 認 して 電 子 体 をダウンロードもしくは 冊 子 体 を 書 棚 へ 探 しに 行 く 電 子 ジャーナルの 場 合 は e journal アイ コンをクリックして 出 版 社 サイトへ 飛 ぶ 雑 誌 の 所 蔵 は 欠 けている 巻 号 受 入 をしていな い 年 次 倉 庫 所 蔵 などがあるので 注 意 をする 当 館 に 所 蔵 がない 場 合 他 学 部 を 含 む 外 部 へ 複 写 の 依 頼 をすることになる 複 写 の 依 頼 は 図 書 館 カウンターで 直 接 申 込 をするか, 図 書 館 ホームページ メールできいてみる からメー ルで 申 込 ができる 学 外 から 読 む 雑 誌 によっては 学 認 を 利 用 して 学 外 からのアク セスが 可 能 な 電 子 ジャーナルがあります 図 書 館 ウェブサイトトップページの 電 子 リソースから 日 本 大 学 オンラインジャー ナル へアクセス
12 学 認 マークがあるデータベースは 学 外 閲 覧 が 可 能 です 学 外 の 端 末 から,PubMed の 文 献 を 辿 って 電 子 ジャーナルのサイトへアクセスした 場 合,サイト により 表 示 方 法 は 異 なりますが,ID/Password を 求 める 表 示 がでます Athens/Institution log in という 表 示 があればクリックして 以 下 の 画 面 のように log in をします NU-MAIL の ID/PW を 入 力 してアクセスができます ID/PW は 各 自 でしっかりと 管 理 し 他 人 に 知 ら せないようにしてください 不 正 利 用 があった 場 合 には 大 学 全 体 で 利 用 の 差 し 止 めになるこ とがあります
13 検 索 結 果 を 絞 り 込 みたい フィールド 指 定 Limits データベースの 検 索 でキーワードを 組 み 合 わせるには, 論 理 演 算 子 を 使 います 論 理 演 算 子 には, AND( 論 理 積 ),OR( 論 理 和 ), NOT( 論 理 差 )の 3 種 類 があります 検 索 ボックスにキーワードを 入 れ,スペ ースを 空 けて 違 うキーワードを 入 れる と 自 動 的 に AND 検 索 になる Search details で 実 際 にどのような 検 索 をしたかをチェック See more をクリッ クすると, 詳 細 な 検 索 式 が 表 示 される PubMed は, 自 動 用 語 マッピングとい う 機 能 により, 入 力 されたキーワード を 自 動 的 に 解 析 し 漏 れのない 検 索 結 果 になるように 設 計 されている 漏 れのない= 検 索 件 数 が 多 い というのが PubMed の 特 徴 である 一 般 的 に 検 索 のコツは,まずヒットさ せて 絞 り 込 むことだが PubMed の 場 合 はどう 絞 り 込 むかがポイントになる フィールドを 指 定 して 絞 り 込 む フィールドとは 字 句 どおり, 検 索 する 場 所 を 意 味 します 通 常 は All Fields に 設 定 されていますが, 検 索 フィールドを 指 定 することにより 効 果 的 な 絞 込 みができます 最 も 正 確 な 情 報,あるいは 核 となりうる 事 項 をもとに 絞 込 みをします クエリーボックス 左 のプルダウンメ Advanced Search 画 面 へ ニューから 項 目 が 選 べる
14 例 えば Date-Publication を 選 択 する と, 新 たに 年 代 指 定 のボックスが 現 れ 期 間 を 指 定 することができる 他 にも 論 文 タイトルと 抄 録 から 雑 誌 タイトル などいろいろな 活 用 が 考 えられる その 他 の 方 法 タグを 直 接 入 力 してフィールド 指 定 Dr.Crick が 1993 年 に 出 版 した DNA についての 論 文 を 探 す 場 合 dna[mh] AND crick[au] AND 1993[dp] AND はスペースでも OK タグの 内 容 と 種 類 については P22 参 照 詳 細 は PubMed トップページから PubMed Help へ 行 き Search Field Descriptions and Tags の 項 目 を 参 照 キーワードをダブルクォーテーションで 囲 む 長 い 熟 語 を 字 句 どうり 調 べたいときや 自 動 マッピング 機 能 を 働 かせたくないとき alpha methyl p tyrosine その 特 定 の 語 句 のみの 検 索 になる 前 方 一 致 検 索 *トランケーションを 使 う 探 したい 語 が 曖 昧 で, 自 動 マッピング 機 能 を 働 かせたくないとき acute hepatitis c* キーワードの 最 後 にアスタリスク(*)をつけると,その 後 にはどんな 文 字 が 続 いてもすべて 検 索 するという 意 味 になる Search Details の 編 集 前 ページで 紹 介 した Search Details のボックス 内 を 直 接 修 正 して 検 索 OR でつないでいる 部 分, 語 句 の 揺 れを 補 完 している 項 目,[All Fields] または[Mesh Terms]の 部 分 を 消 去 することなどで 絞 り 込 みができる Filter を 使 う 検 索 結 果 の 左 側 に 絞 込 みを 行 うための 各 種 フィルターが 表 示 されます 全 文 へのリンク, 抄 録 の 有 無, 雑 誌 の 出 版 年, 言 語, 年 齢,などで 絞 込 みができます この 機 能 は 解 除 するまで 有 効 なので 注 意 が 必 要 フィルターをかけている 場 合 は Result の 下 に 表 示 が 出 ます 設 定 を 解 除 し たいときは,clear all をクリックします
15 !このフィルター 設 定 は, 記 憶 させることができます P2のMy NCBI 画 面 で 登 録 を 済 ませ る Sign in してから 検 索 画 面 を 表 示 さ せ る 結 果 表 示 右 側 の Managed Filters をクリック 初 期 設 定 は Free Full Text( 無 料 の 電 子 ジャーナル 文 献 ), Review(レビ ュー 文 献 )のフィルター 設 定 My NCBI では,15 種 類 までのフィル ターを 個 人 設 定 することができる Select category で 4 種 類 のカテゴリーの いずれかを 選 択 下 に 詳 細 設 定 画 面 が でるので, 反 映 させたいフィルター 項 目 にチェック Your PubMed filter list に 貯 めていくことができる Create custom filter をクリック 複 数 のフィルターを 組 み 合 わせた 独 自 の 設 定 を 作 り 保 存 できる 自 分 好 みのフィルター 設 定 をしてお けば, 検 索 結 果 が 自 動 的 にフィルタ リングされ,グループが 形 成 される 検 索 結 果 右 側 のフィル ター 表 示 件 数 を 見 なが ら, 検 索 式 を 評 価, 検 討,また 各 グループの 結 果 を 表 示 させること ができる
16 キーワードを 探 したい, 知 りたい MeSH Database MeSH とは 索 引 語 として 使 うために 開 発 された 医 学 用 語 集 です 1 論 文 あたりに 中 心 的 テー マとして 2~3 語,その 他 10~20 語 の MeSH が 付 与 されています 例 えば 癌 という 言 葉 は cancer, neoplasm, tumor などいくつかの 用 語 で 表 現 されますが,MeSH により neoplasms に 統 一 されています PubMed では, 入 力 された 用 語 を 自 動 的 に MeSH に 変 換 する 仕 組 みが あり,MeSH を 意 識 しなくてもそれなりに 検 索 はできます しかし,MeSH の 仕 組 みや 個 々 の 意 味 を 理 解 しているとさらに 効 果 的 な 検 索 ができ, 検 索 結 果 を 評 価 することもできます また,キーワードが 定 まらない 場 合 などにも,MeSH Database を 用 いることにより,その 研 究 テーマにおける 広 い 意 味 の 用 語 や 特 定 の 狭 い 意 味 の 用 語, 関 連 する 用 語 などを 明 らか にすることができます トップページから MeSH Database をクリック,またはクエリーボック ス 左 のプルダウンメニューから MeSH を 選 択 して 検 索 をする 右 の 例 では,dopamine について MeSH で 調 べた 結 果 85 件 表 示 され た 表 示 された MeSH 用 語 をクリッ クすると 次 ページの 画 面 になる もし 適 切 な MeSH 用 語 がなければ, 同 義 語 や 違 うスペルで 再 検 索 する か, 自 由 語 検 索 (MeSH を 想 定 しな いオールフィールド 検 索 )を 行 っ て,Search detail の 検 索 式 に 表 示 さ れた MeSH を 調 べる,あるいは, 検 索 された 文 献 の MeSH 用 語 を 確 認 す るといった 方 法 も 有 効 論 文 の abstract 表 示 画 面 クリックするとこの 論 文 の MeSH 語 などが 表 示 される
17 MeSH Database 内 dopamine についての 詳 細 表 示 選 択 した MeSH 用 語 についての 説 明 選 択 した MeSH が major topic として 索 引 さ れた 文 献 だけを 検 索 したいときにチェック Subheadings とは 治 療 (therapy)や 診 断 (diagnosis)のように MeSH 用 語 と 組 み 合 わせることのできるキーワードのこと 選 んだ MeSH と 組 み 合 わせることにが できる Subheadings が 表 示 されるので 必 要 なものにチェックを 入 れる 選 択 した MeSH の 下 位 語 を 含 め ないで 検 索 するときにチェック たいときにチェック 画 面 下 方 には 階 層 構 造 が 表 示 されている よ り 広 い 概 念 ( 上 位 語 )から 狭 い 概 念 ( 下 位 語 ) へ 並 べてられている この 図 を 見 て 上 位 語 に 下 位 語 に 変 更 する この MeSH Database 画 面 をもとに MeSH 用 語 とい う 視 点 から PubMed で 検 索 ができる 下 図 では Subheadings の secretion にチェックを 入 れ,Add to search builder をクリック ボックス 内 に 検 索 式 が 入 力 他 の MeSH 用 語 を 加 えながら 複 数 の MeSH を 組 み 合 わせた 式 も 可 能 検 索 式 ができたら search PubMed で 検 索 実 行 MeSH は 毎 年 改 定 作 業 が 行 われており 新 設 語 や 削 除 語 変 更 語 が 存 在 する 新 しく 発 見 された 疾 患 や 治 療 法 などには 対 応 が 遅 れることがある また 全 ての 概 念 に MeSH が 存 在 するとは 限 らない
18 雑 誌 名 を 調 べたい, 雑 誌 を 探 したい Journals in NCBI Database 雑 誌 名 が 不 確 かな 場 合, 略 称 から 正 式 名 を 知 りたい 場 合, 電 子 化 の 有 無 を 知 りたい 場 合, 関 心 のある 領 域 の 雑 誌 を 探 したい 場 合 などには Journals in NCBI Databases が 便 利 です トップページの Journals in NCBI Database をクリック ボックスに 調 べたい 雑 誌 名 またはキーワードを 入 力 わかっている 部 分 だけでも 入 力 すれば,その 語 句 やテーマを 含 む 雑 誌 名 がリスト 表 示 される 雑 誌 の 情 報 画 面 付 与 された MeSH を 見 ることにより 雑 誌 の 内 容 についてある 程 度 の 掌 握 ができる 雑 誌 評 価 の 引 用 情 報 をもとにした 位 置 づけを 知 りたい 場 合 は 図 書 館 H P の 電 子 リ ソ ー ス か ら Journal Citation Reports を 使 う 収 録 されている 雑 誌 にも MeSh 語 が 付 与 されているため 図 例 のように アスタリスクを 使 った 前 方 一 致 検 索 で ぺリオ 関 連 雑 誌 を 検 出 できる Electronic Links の URL が 表 示 されていれ ば, 電 子 版 にアクセスすることもできる 本 文 閲 覧 の 可 否 は 雑 誌 による
19 これぞ,という 論 文 をもとに 探 したい Related Citation 探 しているテーマにぴったりの 文 献 が 手 元 にあるときは,それを 手 がかりに 関 連 のある 文 献 を 検 索 したり,MeSH 用 語 を 特 定 して 検 索 に 活 かしたりすることができます 文 献 のリスト 表 示 の 場 合 は 一 番 下 の Related citations を ク リ ッ ク Related citations は,MeSH,タイトル, 抄 録 中 の キーワードを 自 動 的 に 分 析 して, 関 連 性 の 高 い 文 献 へリンクする 機 能 文 献 の Abstract 形 式 の 画 面 では, 右 上 に Related citations in PubMed という 項 目 があ り, 関 連 性 の 高 い 順 に 5 件 の 文 献 が 表 示 See all をクリック 関 連 文 献 リスト 表 示 へ Cited by PubMed Central articles は PubMed Central に 収 録 された 全 文 の 参 考 文 献 を 手 が かりにして,この 文 献 を 引 用 している 他 の 文 献 を 表 示 画 面 下 方 の Publication Types, MeSH Terms, Substance の+ボタンをクリック それぞ れのデータが 表 示 論 文 の 内 容 を 素 早 く 把 握 できる 特 に 論 文 に 付 与 された MeSH を 用 いて 検 索 を 再 試 行 することは 求 めている 文 献 に 到 達 するための 近 道 となる Web of Science を 使 う 引 用 関 係 をもとに 関 連 文 献 を 探 す 場 合 には 文 献 検 索 データベース Wed of Science が 適 しています 図 書 館 HP の 電 子 リソースから Web of Science にアクセ ス PubMed 画 面 から 該 当 論 文 のタイトルをコピーして Web of Science の 検 索 ボックスに 貼 り 付 けると 簡 単 に 該 当 論 文 が 表 示 される(Web of Science 収 録 誌 のみ) この 論 文 が 引 用 した 177 件 の 論 文 と, 引 用 された 49 件 の 論 文 の 詳 細 を 簡 単 に 調 べる ことができる
20 エビデンスレベルの 高 い 文 献 を 素 早 く 探 す Clinical Queries 根 拠 に 基 づいた 医 療 ~Evidence-Based Medicine を 実 践 する 上 で,EBM の 手 法 に 耐 えう る 研 究 デザインによる 文 献 情 報 の 検 索 は 中 核 となる 大 切 なステップとなります Clinical Queries は, 研 究 デザインやシステマティックレビューに 特 化 した 検 索 クエリ ーがあらかじめ 用 意 された 検 索 画 面 です 網 羅 的 な 文 献 の 収 集 には 向 きませんが, 関 連 文 献 の 調 査 などを 目 的 とした 予 備 検 索 に 活 用 することができます PubMed トップページからアクセス クエリーボックスに 調 べたい 疾 患 などの キーワードを 入 力 Clinical Study Categories では 病 因 診 断 治 療 予 後 Clinical prediction guides を 選 択 できる 図 の 例 では 歯 周 病 と 喫 煙 について 病 因 ( 因 果 関 係 ) の 側 面 から 検 索 をした Scope の 項 目 で 検 索 件 数 を 調 節 できる Narrow ノイズを 減 らすことができるが 漏 れも 生 じる Broad 漏 れを 少 なく 検 索 するがノイズも 増 える システマティックレビューとは,あるテ ーマに 関 する 複 数 のランダム 化 比 較 試 験 のデータを 評 価 した 結 果 をまとめた 論 文 最 もエビデンスレベルが 高 い 研 究 デ ザインとされる Systematic Reviews の 画 面 では,システマ ティックレビューに 関 連 する 文 献 ( 臨 床 試 験 のレビューやガイドライン 等 )を 広 く 検 索 する
21 検 索 の 手 順 Search Procedure 検 索 を 偶 然 性 に 左 右 されない 的 確 で 確 実 なものにするためには 戦 略 を 立 てることが 大 切 です また 検 索 の 過 程 でメモを 取 る 文 献 情 報 の 保 管 場 所 を 決 めておくことなども 継 続 性 のある 情 報 探 索 にとって 重 要 なこととなります Question 臨 床 / 研 究 専 門 家 に 訊 く ガイドラインを 参 照 EBM 資 源 を 使 う PubMed で(とり あえず) 検 索 既 知 の 情 報 試 行 錯 誤 MeSH 用 語 を 利 用 検 索 語 の 決 定 図 は Agoritsas T.(2012) Sensitivity and predictive value of 15 PubMed search strategies to answer clinical questions rated against full systematic reviews.(pmid: ) より 加 工 して 引 用 論 理 演 算 子 (AND OR )の 利 用 検 索 戦 略 = PICO による 概 念 分 け AND Filters AND 検 索 後 の 戦 略 P-Patient,Population I-Intervention,Exposure C-Controls,Comparators AND Outcomes Limits : 言 語 研 究 デザイン 出 版 時 期 AND 用 意 されたフィルター 機 能 Clinical Queries -Type Narrow/Broad -Category :Therapy,Diagnosis,etc. Related Articles in PubMed 他 のデータベースの 利 用 -Web of Science, Google Scholar 等 で 引 用 情 報 を 辿 る PICO とは 目 の 前 の 患 者 から 生 じる 疑 問 や 問 題 を わかりやすい 形 に 整 理 するための 方 法 論 です 文 献 検 索 の 際 に 臨 床 上 の 疑 問 を 整 理 するために 使 いますが 検 索 したい 概 念 に 分 けてからコトバを 選 んでいく という 過 程 が 大 切 であり P= 主 体 I= 介 入 C= 比 較 O = 結 果 という 概 念 を 便 宜 的 に 使 います 必 ずしも P.I.C.O. 全 てを 抽 出 する 必 要 はなく ま た 臨 床 研 究 以 外 にもこの 概 念 分 け を 意 識 した 検 索 は 有 効 です
22 検 索 記 録 文 献 の 保 管 と 管 理 Saving and Managing Bibliographies 検 索 記 録 の 保 存 (P3 も 参 照 のこと) PubMed で 検 索 した 記 録 は 自 動 的 に 蓄 積 されていきます PubMed Advanced Search Builder 画 面 から 検 索 記 録 をエクセル 形 式 で 保 存 することができます My NCBI に 未 登 録 でもこの 操 作 はできるので 急 ぎのときには 使 えます 文 献 管 理 文 献 管 理 は2 種 類 あります 書 誌 事 項 の 管 理 と 書 誌 事 項 を 含 めた 論 文 本 体 の 管 理 で す PubMed の My NCBI では 書 誌 事 項 の 管 理 が 簡 単 にできます(P3 参 照 ) 書 誌 事 項 を 含 めた 論 文 本 体 の 管 理 については 以 下 のツールがお 勧 めです ENDNOTE オンライン( マニュアル Mendeley ( マニュアル 日 本 大 学 所 属 の 学 生 教 職 員 は Google 提 供 の NU-AppsG を 利 用 することができ ます 電 子 ジャーナル 文 献 等 の 保 存 は 紙 への 印 刷 や USB/PC に 保 存 するより Google ドライブ への 保 存 が 便 利 です 例 えば 図 書 館 の 検 索 用 PCでダウンロードした 文 献 を 印 刷 せず Google ドライブにアク セスをして 保 存 をするという 習 慣 をつけると 文 献 を 効 率 的 に 管 理 できます ipad などにも Google ドライブアプリを 入 れておけるので 本 文 アクセスができれば ipad で 文 献 保 存 もで きます 文 献 を Web 上 に 置 いておけば ネット 環 境 があるところならどこからでもアクセスができ て 便 利 です
23 検 索 の 途 中 でマークをクリ ックするとトップページ へ 戻 る 主 要 画 面 説 明 PubMed の 主 要 な 画 面 の 説 明 です 検 索 実 行 Enter キー でも OK My NCBI へのリンク Pubmed 以 外 のデー 詳 細 検 索 検 索 ボックス Help マ ニ ュ ア ル 画 面 へ タベース 選 択 Pubmed のマニュアルは 分 かり やすく 有 用 クイックマニュアル 動 画 でのマニュアル 詳 細 なマニュアル 最 新 情 報 など Pubmed モバイル 特 定 論 文 検 索 PMID を 特 定 する 検 索 臨 床 医 学 領 域 における 検 索 特 定 のトピックに 絞 った 検 索 Mesh データベース Journal データベース 臨 床 試 験 情 報 E-Utilities(インターフ ェイスを 使 用 せずデータ を 取 り 込 む) リンクアウト Pubmed 以 外 の NLM の 各 種 データベースへのリンク 表 示 形 式 の 変 更 検 索 結 果 の 表 示 検 索 結 果 に 関 連 したフ ィルターを 表 示 検 索 件 数 ( 新 しい 順 に 表 示 ) 雑 誌 名, 出 版 年 月, 巻 号,ページ 論 題 著 者 名 PMID は pubmed 固 有 の 番 号 データ 整 備 作 業 中 この 番 号 のみで 文 献 を hit させ ることができる 詳 しい 検 索 経 過 を 表 示,この 検 索 式 を 直 接 編 集 して 再 検 索 することができる
24 検 索 結 果 の 表 示 ( 抄 録 付 き) 雑 誌 名, 年, 月, 巻, 号,ページ 保 存 先 を 選 ぶ 電 子 体 へのリンク 学 内 所 蔵, 電 子 体 の 利 用 に 関 する 情 報 本 文 の 言 語 が 英 語 以 外 の 場 合, 論 題 が[ ]で 囲 まれ, 収 録 ページ 数 の 後 に 言 語 種 類 が 表 示 される 関 連 文 献 (MeSH,タイトル, 抄 録 中 のキーワードによる) PubMed central 中 の 関 連 文 献 (こ の 論 文 を 引 用 しているもの) PMID, レコードの 状 態 様 々な 情 報 源 やサービスへのリンク MeSH などを 表 示 My NCBI 画 面 My NCBI をカスタマイズ, 検 索 結 果 ここから 検 索 ができる を 自 分 好 みにアレンジできる 保 存 した 検 索 式 を 表 示 どの 項 目 も Manage~をクリックして 空 欄 のまま Search を 押 すと pubmed トップ 画 面 へ 編 集 できる 文 献 単 位 でのリストを 作 成 する PubMed 以 外 の 文 献 情 報 も 手 入 力 で 作 成 できる 検 索 結 果 の 長 期 保 存 最 近 実 行 した 検 索 行 動 を 表 示 よく 使 用 する 絞 り 込 み 条 件 を 15 種 類 まで 設 定 できる
25 検 索 フィールドとタグの 種 類, 入 力 方 法 検 索 フィールド(P11 参 照 )とは 詳 細 検 索 画 面 検 索 ボックス 左 にあるプルダウンメニューから 選 べる 検 索 対 象 となる 項 目 です タグは 検 索 ボックスに 入 力 したキーワードの 後 ろに 直 接 [ ]で 囲 んで 示 す 検 索 対 象 で, 検 索 フィールド 指 定 と 同 義 です 以 下 は 主 なフィールドと 検 索 項 目 のタ グ 一 覧, 入 力 方 法 です [ 大 文 字 小 文 字 の 区 別 はなし ハイフン(-)はスペースに,アポストロフィー( ),ウムラウト ( ),アクサンテギュ( )は 省 略 ギリシャ 文 字 は 読 みの 英 語 綴 りで ] Affiliation[ad] : 第 一 著 者 の 所 属 機 関, 住 所, 電 子 メールアドレス 例 ) nihon univ[ad] 著 者 名 だけでは 識 別 できないときに 使 うと 便 利 Article Identifier[aid] : 文 献 番 号 [doi]タグを 使 って,DOI 番 号 で 検 索 することもできる Author[au] : 著 者 名 ラストネーム( 姓 )とイニシャル( 名 )をスペースを 挟 んで 記 入 自 動 的 に 前 方 一 致 で 検 索 される 完 全 一 致 は で 囲 むか@を 後 ろにつける 例 ) yamada t[au] baker a[au] baker a@[au] o brien j [au] Full Author Name[fau] : 著 者 のフルネーム 2002 年 以 降 の 文 献 については 検 索 可 能 Journal[ta] : 掲 載 雑 誌 の 略 誌 名, 正 式 名,ISSN 番 号 例 ) new england journal of medicine[ta] 正 式 名 称 は of 必 要,the は 不 要 N engl j med[ta] 省 略 形 [ta] ISSN はハイフン 必 要 Issue[ip] : 文 献 が 掲 載 された 雑 誌 の 号 数 Language[la] : 文 献 が 記 述 された 言 語 例 ) jpn[la] MeSH Terms[mh] : MeSH 用 語 (P14 参 照 )NLM が 作 成 する 医 学 分 野 の 統 制 語 彙 集 特 定 の 狭 い 語 から 一 般 的 な 広 い 語 までの 階 層 構 造 を 持 ち,サブヘディングとの 組 み 合 わせで 用 いることも 可 能 例 ) neoplasms/diet therapy[mh] MeSH Subheadings[sh] : サブヘディングは 文 献 の 主 題 をより 的 確 に 表 すために 通 常 は MeSH と 組 み 合 わせて 用 いられるが,タグで 別 に 検 索 することで 広 い 検 索 ができる 例 ) therapy[sh] MeSH Major Topic[majr] : 文 献 の 主 要 トピックを 表 す MeSH 用 語 文 献 には 通 常 3~4 個 付 与 さ れている PMID[uid] : pubmed のID 番 号 タグを 付 けなくても,この 番 号 を 直 接 入 力 すると 該 当 文 献 が 検 索 される 検 索 ボックスにスペースで 区 切 って 入 力 すると,OR 検 索 になる Publication Date[dp] : 出 版 年 期 間 を 指 定 して 入 力 したいときは:で 挟 む 例 ) 1996:1998[dp] 1998/01:1998/04[dp] Publication Type[pt] : 文 献 の 資 料 種 類 例 ) review[pt] clinical trial[pt] 次 ページ 参 照 Title[ti] : 文 献 のタイトルに 含 まれる 言 葉 や 数 字 Title/Abstract[tiab] : 文 献 のタイトルや 抄 録 に 含 まれる 言 葉 や 数 字
26 主 な 資 料 種 類 Randomized Controlled Trial ランダム 化 比 較 試 験 Controlled Clinical Trial 比 較 臨 床 試 験 Multicenter Study 多 施 設 共 同 研 究 Case Reports 症 例 報 告 Congresses 会 議 録 Editorial エディトリアル Publication Types タグは[pt] Practice Guideline 診 療 ガイドライン Guideline ガイドライン Review レビュー 論 文 In Vitro インビトロ Journal Article 雑 誌 論 文 Technical Report テクニカルレポート Government Publications 政 府 出 版 物 この Manual は 簡 易 版 です わからないことがあったら 図 書 館 に 訊 こう 図 書 館 窓 口 メール PubMed Manual ( 改 定 第 3 版 )2014 日 本 大 学 歯 学 部 図 書 館 発 行 参 考 文 献 マニュアル PubMed Help(PubMed Top Page より) 岩 下 愛 山 下 ユミ 共 著 (2013) 図 解 PubMed の 使 い 方 インターネットで 医 学 文 献 を 探 す 第 6 版 紀 伊 國 屋 書 店 縣 俊 彦 編 著 (2005) 上 手 な 情 報 検 索 のための PubMed 活 用 マニュアル 改 訂 第 2 版 南 江 堂 東 京 慈 恵 会 医 科 大 学 学 術 情 報 センター(2012) PubMed の 使 い 方 基 礎 & 応 用 東 京 大 学 医 学 図 書 館 (2014)PubMed の 使 い 方
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