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3 1305ィィ 5 ィャィィィェ 0708ィィ ィコ06ィャィェィ ィーィェ06ィヲ ィー02ィャ070208ィ ィーィョ0802, ィィ0601ィィ ツ0209ィコィィ 0909ィー080701ィィ09ィ ィ ィー02ィャ 0202ィェィー08ィィ00ィョ00ィィ080609ィ 05ィィ 0708ィィ ィャィ ィコ09ィィィャィ 05ィケィェ06ィヲ 09ィコ ィーィィ, ィェ0609ィーィケ06 ィョィ ィィ08ィ 05ィィ 09ィョ070208ィェィ ィーィ ィェィー, 0609ィ 0106ィコ 09ィョ090702ィェ01ィィ080609ィ 05ィィ ィャィコ05 08ィ 09ィー090608ィ 02 (05ィーィ ィェ0605 ェ 25 %, ィィ ィ ィェ0605 ェ 25 %, NaCl ェ 100 ィャM, 0608ィィ09-HCl ェ 10 ィャM; ,0), 0202ィェィー08ィィ00ィョ00ィィ080609ィ 05ィィ, ィェ0609ィーィケ06 06ィーィ ィィ08ィ 05ィィ 09ィョ070208ィェィ ィーィ ィェィー, 0609ィ 0106ィコ ィョ090702ィェ01ィィ080609ィ 05ィィ 09 05ィーィ ィェ060502, ィーィケ 0202ィェィー08ィィ00ィョ00ィィ080609ィ 05ィィ ィィ ィェ0609ィーィケ06 ィョ01ィ ィィ 09ィョ070208ィェィ ィーィ ィェィー. 0209ィ 0106ィコ ィョ03ィィ09ィ 05ィィ ィェィ ィョ ィー02 ツ02ィェィィ02 15 ィャィィィェ, 0106ィ ィ ィィ 50 ィャィコ ィィ08ィョ06ィエ ィ ィョ000208ィ (0608ィィ09-HCl ェ 10 ィャM, EDTA ェ 1 ィャM; ,0) ィィ ィ 05ィィ ィョィャ020802ィェィェ06ィャィョ 0909ィー080701ィィ09ィ ィェィィ06 ィェィ ィー02ィコ ィー02 ツ02ィェィィ02 30 ィャィィィェ ィー ィ 08ィ ィェィー08ィィ00ィョ00ィィ080609ィ 05ィィ ィィ 06ィーィ ィィ08ィ 05ィィ 09ィョ070208ィェィ ィーィ ィェィー, ィィ04ィ 0200ィ ィ 01ィ ィェィィ07 06ィコィィ09ィィ ィコ0802ィャィェィィ ツィィィエ02ィェィェ04ィヲ ィ 08ィ ィー ィィ 0902ィコ0902ィェィィ080609ィ ィェィィィィ ィェィョィコ050206ィーィィ01ィェ ィ ィー0205ィケィェ0609ィー02ィヲ 06 ツィィィエ02ィェィェ04ィヲ ィ 08ィ ィー ィョ03ィィ05 ィャィ ィー08ィィ0202ィヲ ィ ィコ02ィィィィ ィョィェィィ ィ 05ィケィェ04ィャィィ 0708ィ ィヲィャ0208ィ ィャィィ ィコ 09ィ 08ィィィ ィ 0205ィケィェ06ィャィョ ィョ ツィ 09ィーィコィョ V4 0002ィェィ 16S (F515 ェ GTGCCAGCMGCCGCGGTAA, R806 ェ GGATACVSGGGTATCTAAT) (7) ィ ィ ィェィィ02ィャ 0605ィィ0006ィェィョィコ050206ィーィィ01ィェ0401 ィィ0102ィェィーィィ00ィィィコィ ィー ィコィ ィヲ ィ 04 ィィ 0905ィョ0302ィ ィェ ィ ィー0205ィケィェ0609ィー02ィヲ, ィェ0206ィ ィィィャ ィィ ィコ0902ィェィィ080609ィ ィェィィ ィー06ィコ0605ィョ 00Roche03 (010902ィヲ02ィ 08ィィ07) ィケ04ィョ02ィャ ィ ィヲィャ ィ 0405ィィ 09ィコ06ィェ09ィー08ィョィィ080609ィ ィェ04 ィェィ 0609ィェ ィ ィェィ 05ィィ04ィ ィ ィー0205ィケィェ0609ィー02ィヲ ィコィ ィコ ィ ィ ィコィー0208ィィィヲ, ィーィ ィコ ィィ ィ ィヲ ィー0609ィコィョ ィ ィィ 0902ィコ0902ィェィィ080609ィ ィェィィ ィィ05ィィ ィェィ 0708ィィィ GS Junior (00Roche03, ィヲ02ィ 08ィィ07) ィ 09ィェ ィコ06ィャ02ィェ01ィ 02ィィィィ ィィ ィィィー ィーィ ィコ0906ィェ06ィャィィ ツ0209ィコ06ィヲ ィィ0102ィェィーィィ00ィィィコィ 02ィィィィ ィ ィー0205ィケィェ0609ィー02ィヲ ィェィィィー0205ィケィェ06 ィーィ ィコ ィケ040609ィ 05ィィ09ィケ ィ ィ 0406ィヲ 01ィ ィェィェ0401 RDP (Ribosomal Database Project, ィ 09ィェィィィー0205ィケィェ04ィヲ ィ ィェィ 05ィィ04 ィャィィィコ0806ィ ィェ ィ ィエ0209ィー ィェ0705ィィ 09 ィィ ィケ040609ィ ィェィィ02ィャ ィョ0809ィ VAMPS (Visualization and Analysis of Microbial Population Structure, ィーィョ0702ィェ ィェィ 09ィ ィヲィー ィャ06ィエィケ06 09ィィ09ィー02ィャ04 VAMPS ィョ ツィィ05ィィ ィーィ ィ 05ィィ0204, ィ ィエィィ02 04ィェィ ツ02ィェィィ ィィ ィィ0102ィェィーィィ00ィィ02ィィ080609ィ ィェィェ0401 ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ ィコィ ィヲ ィ 02, ィェィ 0609ィェ0609ィ ィェィィィィ ィコ06ィー ィ 0405ィィ ィー080602ィェ04 ィィィー ィィィ 0008ィ ィャィャ ィャ07ィケ06ィー0208ィェィョ06 06ィ 08ィ ィ 06ィーィコィョ ィョ ツ02ィェィェ ィョ05ィケィーィ ィー ィコ0902ィェィィ080609ィ ィェィィ07 ィェィョィコ050206ィーィィ01ィェ ィ ィー0205ィケィェ0609ィー02ィヲ, ィョ01ィ 0502ィェィィ02 ィィ04 ィィ ィーィ 09ィ ィャ02ィー06ィコ ィィ 0708ィ ィヲィャ ィョィエ0209ィー ィィ ィ 09ィェ06 ィャ02ィー0601ィィ ツ0209ィコィィィャ 0802ィコ06ィャ02ィェ01ィ 02ィィ07ィャ ィィ ィェィィィィ Ribosome Database Project (RDP) Pipeline (8) ィェ0705ィィ ィ 09ィェィィ09ィ ィェィィ02 ィェィョィコ050206ィーィィ01ィェ ィ ィー0205ィケィェ0609ィー02ィヲ, ィー080602ィェィィ02 ィャィ ィー08ィィ ィェ02ィーィィ ツ0209ィコィィ01 08ィ 0909ィー0607ィェィィィヲ ィィ ィコ05ィ 09ィー0208ィェ04ィヲ ィ ィェィ 05ィィ ィ ィー0205ィケィェ0609ィー02ィヲ ィィィャ02ィェ02ィェィィ02ィャ ィ ィィィーィャィ 00average neighbor03. 02ィ ィィ05ィィ ィコ05ィ 0909ィィ00ィィィコィ 02ィィ ィ ィー0205ィケィェ0609ィー02ィヲ ィェィ OTU (Operational Taxonomic Unit) 09 ィィ ィケ040609ィ ィェィィ02ィャ ィコ08ィィィー0208ィィ07 97 % ィー09ィ ィョィエ0209ィー090502ィェィィ07 00ィ ィィィェィ 08ィェ ィャ0705ィィィェ00ィ 03 ィィ04 ィコィ ィヲ ィ ィィィ 05ィィ06ィー02ィコィィ ィ 08ィ 05ィィ 0905ィョ ツィ ィヲィェィョ ィ 0608ィコィョ ィィ ィ ィー0205ィケィェ0609ィー02ィヲ, ィェ0608ィャィ 05ィィ04ィィ08ィョ07 ィ ィィィ 05ィィ06ィー02ィコィィ ィョ06ィエ ィ 09ィェ02ィェィィ07, ィィ ィ 09ィ 05ィィ 06ィ ィイ0201ィィィェ02ィェィェ0402 ィ ィィィ 05ィィ06ィー02ィコィィ 0706 ィコィ ィャィョ ィィ ィ 08ィ ィェィェ ィ ィコィー ィィィ 05ィィ06ィー02ィコィィ 0908ィ 09ィェィィ09ィ 05ィィ ィィ ィェィィィィ RDP 00LibCompare03 ( 06ィ ィコィィィャ 06ィ 08ィ 0406ィャ ィ 0405ィィ ィャィィ080609ィ ィェ04 ィーィ ィ 05ィィ ィコィ ィャィョ 00ィ ィコィー0608ィョ, ィ ィエィィ02 01ィ ィェィェ ィェィ ツィィィャ0609ィーィィ 08ィ 0405ィィ ツィィィヲ ィャ020301ィョ 0109ィョィャ07 ィ ィィィ 05ィィ06ィー02ィコィ ィャィィ, 06ィ ィイ0201ィィィェ02ィェィェ04ィャィィ ィー0902ィー09ィー09ィョ06ィエ02ィャィョ 00ィ ィコィー0608ィョ ィェィコィィ 04ィェィ ツィィィャ0609ィーィィ 0905ィィ07ィェィィ07 00ィ ィコィー0608ィ ィィ05ィィ 08ィ 09ィェ04ィャ 0,05 ( ィコィ 04ィ ィー0205ィィ ィー ィ ィェ02 06ィー08ィ 03ィ 05ィィ 04ィェィ ツィィィャ ィ 0405ィィ ツィィィヲ ィィ ィェィ 06ィ ィー) ィョ05ィケィーィ ィー04. 02ィ 08ィ ツ ィーィ 02ィィ06ィェィ 08ィェ06ィャ ィャ ィー ィィィャ ィィィャィィ ィ 06ィーィ ィィ08ィ 05ィィ ィ ィャィィ 05ィケィェィ ィィ 0604ィィィャ06ィヲ 0803ィィ, 09 ィィ ィーィコ0609ィ ィェィィ02ィャ ィィ ィ 0204, 09 ィョ ィィ ィ ィーィ ィィ ィ 0204 ィェ (ィーィ ィ 05.). 87

4 1309ィ 08ィ ィコィー0208ィィ09ィーィィィコィ ィィ ィ ィェィェ ィ 08ィ ツ0904 (09ィーィ 02ィィ06ィェィ 08ィェ04ィヲ ィヲ ィー ィィィヲ09ィコ ィョ01ィ 0809ィー0902ィェィェ ィ 0008ィ 08ィェ ィョィェィィ ィィィー02ィーィ ェ ィィィャ ィィィャィィ ィ, ィコ09ィ, ィィ06ィェィケ ィ ) 01 ァ爲 08ィ 0402ィ ィーィコ0609ィ ィェィィ ィ ィー 08ィョ05ィケィーィョ08ィ チィィ ィェィョィコ050206ィーィィ01ィェ ィ ィー0205ィケィェ0609ィー02ィヲ ィケ モ ィケ ィェ モ ィェ モ1 6モ1 0902ィェ モ1 0902ィェ モ1 6モ ィケ モ ィケ ィィィャ02 ツィ ィェィィ ィィ 006モ103 ェ ィー0902ィー09ィー0902ィェィェ06 ィェィ 05ィィ ツィィ02 ィィ 06ィー09ィョィー09ィー09ィィ ィヲ09ィー09ィョ06ィエ ィ ィコィー0608ィ ィィ ィ ィェィィ02 00ィィ05 (08) ィィ (09) ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ ィ 08ィ 0402ィ ィャ 0706 ツ0904 ( ィ ィェィェ04ィャ ィコ ィィ ィィィー0205ィケィェ ィコ0902ィェィィ080609ィ ィェィィ07 ィ ィィィ 05ィィ06ィー02ィコ 0002ィェィ 16S ): 1 ェ 09 ィィ ィーィコ0609ィ ィェィィ02ィャ ィィ ィ 0806ィー06ィャ, 2 ェ ィ ィー06ィャ, 3 ェ ィ ィ ィーィ, 4 ェ 09 ィィ ィーィコ0609ィ ィェィィ02ィャ ィ ィ ィーィ ( ィケ06); 5 ェ 09 ィィ ィーィコ0609ィ ィェィィ02ィャ ィィ ィ ィー06ィャ, 6 ェ ィ ィー06ィャ, 7 ェ ィ ィ ィーィ, 8 ェ 09 ィィ ィーィコ0609ィ ィェィィ02ィャ ィ ィ ィーィ ( ィケィェ06ィャ) (09ィーィ 02ィィ06ィェィ 08ィェ04ィヲ ィヲ ィー ィィィヲ09ィコ ィョ01ィ 0809ィー0902ィェィェ ィ 0008ィ 08ィェ ィョィェィィ ィィィー02ィーィ ェ ィィィャ ィィィャィィ ィ, ィコ09ィ, ィィ06ィェィケ ィ ) ィーィ ィ ィエ0209ィー09ィ ィ 0405ィィ 06ィ ィェィ 08ィョ0302ィェ ィーィ 09ィィィー0205ィィ 19 00ィィ05 ィャィィィコ-

5 ィ ィェィィ04ィャ0609 (08ィィ09. 1, 08), ィィ ィコ06ィー ィ ィィ ィーィ ィィ ィェ02ィ 0605ィケ03ィョ (06ィー % 09 04ィ 09ィィ09ィィィャ0609ィーィィ 06ィー 06ィ 08ィ 0402ィ ). 0308ィィ 05ィー06ィャ ィョ02ィー 06ィーィャ02ィーィィィーィケ 09ィェィィ0302ィェィィ02 ツィィ0905ィ ィ ィヲ 09 06ィ 08ィ 0402ィ ィ ィャ02ィェィェ06ィヲ ィコィョ05ィケィーィョ0806ィヲ 0604ィィィャ06ィヲ 0803ィィ ィィ ィ ィ ィコィー0208ィィィヲ ィェィ ィィィ ィィ0806ィコ06 06ィコィ 04ィ 05ィ 09ィケ ィーィ ィェィ 00ィィ05ィ Proteobacteria 09 09ィコ05ィ 0106ィャ ィ ィエ0209ィー ィコ %, 04ィ ィェ02ィヲ ィ 05ィィ Actinobacteria (06ィコ %), Acidobacteria (5 %) ィィ Firmicutes (5 %) ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ0609, ィェ02 ィィ0102ィェィーィィ00ィィ02ィィ08ィョ02ィャ ィィ0504, ィーィ ィ 0708ィィィャ0208ィェ % ィェ06 ィーィ ィコ ィィィーィケ ィェ0209ィコ0605ィケィコ06 00ィィ05, ィェィ ィコ06ィー ィ ィエ0209ィー ィィ010601ィィ050609ィケ 06ィコ % ェ 05ィー06 Crenarcheota, Verrucomicrobia, Bacteroidetes ィィ Gemmatimonadetes. チィィ090502ィェィェ0609ィーィケ ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ0609 ィィ ィーィ 05ィケィェ ィィ ィ ィエ0209ィー09ィ 01 ィェ ィーィィ00ィ 05ィ 1 % ィャ ィィ05ィィ 06ィコ ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ0609 (09ィャ. 08ィィ09. 1, 09), 0708ィィ ツ02ィャ ィ 0605ィケ03ィョ ィィ04 ィェィィ01 (06ィコ %) ィーィ ィィ ィー02, ィコ06ィー ィ ィー0205ィケィェ0609ィーィィ ィェ02 ィョ01ィ ィケ ィィ0102ィェィーィィ00ィィ02ィィ080609ィ ィーィケ ィ. 0308ィィ 08ィ 0909ィャ06ィー0802ィェィィィィ ィ ィエ0209ィー09ィ ィェィ ィョ080609ィェ ィ 09 00ィィ0502 Proteobacteria 0106ィャィィィェィィ080609ィ 05ィィ ィーィ 09ィィィー0205ィィ Rhizobium (ィィ ィ ィェィィ02 09ィ 08ィケィィ080609ィ ィ %), Sphingomonas sp., Pseudomonas sp., ィ ィーィ ィコ0302 ィェ02 ィィ0102ィェィーィィ00ィィ02ィィ08ィョ02ィャ ィ ィーィ 09ィィィー0205ィィ ィコ05ィ 0909ィ Proteobacteria ィ 08ィ 0402ィ ィ ィャィィ 0604ィィィャ06ィヲ 0803ィィ ィェィー 08ィィ0406ィ ィィィヲ ツ ィィ05ィケィェ06 09ィ 08ィケィィ080609ィ ィ ィェィィ ィィィャ06ィヲ 0803ィィ ィ ィー ィィ090601ィィ0506 ィコ ィョ090205ィィ ツ02ィェィィ06 ツィィ090502ィェィェ0609ィーィィ 08ィィ0406ィ ィィィヲ, 09 ィー ィャ07 ィコィ ィコ 0502ィェ ィェ02 06ィコィ ィ 05 ィーィ ィコ ィィ07ィェィィ07 ィェィィ 09 ィョ ィィ ィ ィーィ, ィェィィ ィ 0204 ィェ ィャ ィャ0603ィェ06 06ィーィャ02ィーィィィーィケ ィ ィコィョ06 ツィィ090502ィェィェ0609ィーィケ 08ィィ0406ィ ィィィヲ ィ ィー02, ツィー ィェ02 06ィ ィイ0709ィェィィィャ06, ィコ0605ィケィコィョ 0601ィェ06ィヲ ィィ04 ィコィョ05ィケィーィョ08 09 ィェ02ィャ ィ 0405 ィコ ィィ0502 Actinobacteria ィ 0605ィケ03ィョ ィ ィェィィィャィ 05ィィ ィェ02ィィ ィーィェ ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ0609 ィィ ィャ02ィヲ09ィー09 Acidimicrobidae ィィ Actinobacteridae, ィ ィーィ ィコ ィ ィャ02ィーィェ04ィヲ 09ィコ05ィ 01 09ィェ0609ィィ05ィィ Arthrobacter sp. ( ィ ィャィィ 05ィケィェィ ィ ィェィィ02 06ィコィ 04ィ ィケ , ツ02ィャ ィ ィャィィ 0604ィィィャ06ィヲ 0803ィィ), Solirubrobacter sp., Terrabacter sp. ィィ Nocardioides sp ィィ Acidobacteria 0106ィャィィィェィィ080609ィ 05ィィ ィーィ 09ィィィー0205ィィ GP1, GP16, GP3, GP4 ィィ GP ィ 08ィ ィ ィ 08ィ ィコィー0208ィェ06 06ィ ィエ ィェィィ0302ィェィィ02 ツィィ090502ィェィェ0609ィーィィ Acidobacteria 0708ィィ ィィ ィーィコ0609ィ ィェィィィィ 0706 ツ ィ ィコ 06ィーィャ02 ツィ 06ィー C.L. Lauber ィ 09ィー. (9), ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ04 ィィ04 00ィィ0504 Acidobacteria ィ ィェ04 ィコ 06ィ ィィィーィ ィェィィ ィィ ィ ィコィィ ィェィ ツ02ィェィィ0701 ph, ィィ 05ィーィィィャ ィャ0603ィェ06 06ィ ィイ0709ィェィィィーィケ 09ィェィィ0302ィェィィ02 ィィ01 ツィィ090502ィェィェ0609ィーィィ 09 06ィ 08ィ 0402ィ ィィ ィーィコ0609ィ ィェィィ02ィャ 0706 ツ ィケ03ィィィェ09ィー ィーィ 09ィィィー020502ィヲ 00ィィ0504 Firmicutes ィーィ ィィ ィェ02 ィィ0102ィェィーィィ00ィィ02ィィ080609ィ ィェィェ ィ ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ04 ィィ04 ィコ05ィ Bacilli ィィ Clostridia, ィ ィーィ ィコ Paenibacillus sp. ィィ Bacillus sp. 08ィェィ 05ィィ04 01ィ ィェィェ ィコ0902ィェィィ080609ィ ィェィィ ィコィ 04ィ 05, ツィー ツ0902ィェィェ0602 ィャィィィコ0806ィ ィェ ィ ィエ0209ィー ィ 05ィ 01ィ 02ィー 06 ツ02ィェィケ ィェ06ィヲ 09ィー08ィョィコィーィョ0806ィヲ, 0202 ィィ04ィャ02ィェ02ィェィィ07 06ィー 06ィ 08ィ 0402ィ ィコ 06ィ 08ィ 0402ィョ ィェ ィ 06 ツ0209ィィ01ィェ04, ィー06ィャィョ ィェィィィコ05ィ ィェ0206ィ ィィィャ0609ィーィケ ィョ ツィィィーィケ ィョ ツ02ィェィェ04ィヲ ィャィ ィー0208ィィィ 05, ツィー06ィ ィィィーィケ ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ04, ィェィ ィィィ ツィョ0909ィー09ィィィー0205ィケィェ0402 ィコ 0102ィヲ09ィー09ィィ ィェィェ ィコ ィィ ツ0209ィコ ィ ィコィー0608ィ ィー06ィャ ィィ ィ ィェィィィィ ィャ ィィ05ィィ ィィ ィケ040609ィ ィーィケ ィャ02ィー ィ ィィィェィ 08ィェ ィャ0705ィィィェ00ィ 03, 0708ィィィェ02ィィ07 ィコ06ィー ィ ィィ09ィ ィェ ィケ040609ィ ィェィェ04ィヲ ィィ05 ィェィ ィャ ィィィーィケ 0008ィョ ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ0609, ィェィェ0402 ィィ05ィィ ィェ ィェィェ ィィ07ィェィィ ィ 08ィ ィェィェ0401 ィェィ ィャィィ 05ィコ ィィ ツ0209ィコィィ01 00ィ ィコィー (ィコィィ090506ィーィェ0609ィーィケ 0706 ツ0904, ィ ィー0201ィェィィィコィ ィィ ィ 02ィャィ 07 ィコィョ05ィケィーィョ08ィ ). 06ィェィー ィェ06 06ィーィャ02ィーィィィーィケ, ツィー06 09 ィコ0605ィィ ツ0209ィー0902ィェィェ06ィャ 06ィーィェ060302ィェィィィィ 0008ィョ0707ィ ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ0609, ィィ04ィャ02ィェ0706ィエィィ ィィ07ィェィィ02ィャ ィィ04ィョ ツ02ィェィェ ィ ィコィー , 06ィコィ 04ィ 05ィ 09ィケ 0708ィィィャ0208ィェ06 08ィ 09ィェィ 0008ィョ ィェ02 ィィ04ィャ02ィェ0706ィエィィ ィヲ09ィー09ィィ02ィャ 05ィーィィ01 00ィ ィコィー (08ィィ09. 2). 0201ィェィ ィコ06 05ィーィィ 0008ィョ ィィ05ィケィェ06 08ィ 0405ィィ ツィ 05ィィ09ィケ 0706 ィコィ ツ0209ィー0902ィェィェ06ィャィョ ィーィ 09ィョ: 0008ィョ0707ィ, ィェィェィ ィィ07ィェィィ06, ィ 0405ィ ィ ィェ ィェィ. 06ィ ィコィィィャ 06ィ 08ィ 0406ィャ, ィャ0603ィェ06 ィョィー ィ ィーィケ, ツィー ィヲ09ィー09ィィ ィ 02ィー0907 ィェ02 06 ツ02ィェィケ ィ 0605ィケ03ィ 07 ツィ 09ィーィケ ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ0609, ィ ツィィ090502ィェィェ0609ィーィケ 0108ィョ00ィィ ィーィ 02ィー0907 ィ ィィ05ィィ ィャ02ィェ

6 1309ィーィ ィ ィィ05ィケィェ06ィヲ. 04ィィ (%) 09ィィ ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ ィ 08ィ 0402ィ ツ0904, ィェ ィェィェ0401 (ィ ) ィィ ィェィェ0401 (ィ ) 0905ィィ07ィェィィ06 ィィ ィョ02ィャ ィ ィコィー ( ィ ィェィェ04ィャ ィコ ィィ ィィィー0205ィケィェ ィコ0902ィェィィ080609ィ ィェィィ07 ィ ィィィ 05ィィ06ィー02ィコ 0002ィェィ 16S ): I, II ィィ III ェ ィー0902ィー09ィー0902ィェィェ06 ィィ ィーィコ0609ィ ィェィィ02, ィ ィー ィィ ィ 02ィャィ 07 ィコィョ05ィケィーィョ08ィ (09ィーィ 02ィィ06ィェィ 08ィェ04ィヲ ィヲ ィー ィィィヲ09ィコ ィョ01ィ 0809ィー0902ィェィェ ィ 0008ィ 08ィェ ィョィェィィ ィィィー02ィーィ ェ ィィィャ ィィィャィィ ィ, ィコ09ィ, ィィ06ィェィケ ィ ) ィーィ 09ィィィー0205ィィ ィー ィィ05 ェ Acidobacteria, Actinobacteria, Proteobacteria ィ 0405ィィ ィャィェ ツィィ090502ィェィェ ィ 08ィ 0402ィ 01 ィィ ィェ ィィ07ィェィィ ィィ ィョ02ィャ ィ ィコィー ィェィー ィェ06 06ィーィャ02ィーィィィーィケ 00ィィ05ィョ Gemmatimonadetes (10): ィエィィィヲ 09 ィェ ィィ01 Gemmatimonas sp. 06ィコィ 04ィ ツィョ0909ィー09ィィィー0205ィケィェ04ィャ ィコ ィヲ09ィー09ィィ ィ ィコィー ィィ 08ィ 0909ィャィ ィー08ィィ09ィ ィーィケ 0905ィィ07ィェィィ02 05ィコ ィィ ツ0209ィコィィ01 00ィ ィコィー ィェィ ィ ィ ィコィー0208ィィィヲ, ィャ0603ィェ ィィィーィケ ィィィェィー ィェ ィ ィコ06ィェ06ィャ0208ィェ0609ィー02ィヲ (08ィィ09. 3). 06ィ ィコ, Rizobium sp. ィィ Gemmatimonas sp. ツィョ0909ィー09ィィィー0205ィケィェ04 ィコ ィャ ィー0802ィャ ィィ04ィョ ツ02ィェィェ04ィャ ィェィ ィャィィ 00ィ ィコィー0608ィ ィャ (ィィ ィーィコ0609ィ ィェィィ02, ィ ィー, ィコィョ05ィケィーィョ08ィ 08ィ 09ィー02ィェィィィヲ). 0005ィィ07ィェィィ ィー ィ ィコィー ィェ04 ィーィ ィコ ィ 0405ィィ ツィェ ィーィ 09ィィィー0205ィィ 00ィィ0504 Acidobacteria ィャ06ィー0807 ィェィ ィー06, ツィー ィェィィ02, ィコィ ィコ ィョ ィーィャ02 ツィ ィケ, ツィィィーィ 06ィー ィ ィコィィ0905ィョ ィョ 06ィ ィィィーィ ィェィィ07 (9), 09ィィ01ィェ06, ツィー06 ィェ ィーィ 09ィィィー0205ィィ 05ィー06ィヲ 00ィィ ィィ05ィィ ツィョ0909ィー09ィィィー0205ィケィェ0609ィーィケ ィコ ィィ04ィャ02ィェ02ィェィィ06 ィコィィ090506ィーィェ0609ィーィィ 0706 ツ ィケィコ06 ィョ Gp1 ィィ Gp2 ツィィ090502ィェィェ0609ィーィケ 09 06ィ 08ィ 0402ィ ィィ ィーィコ0609ィ ィェィィ02ィャ ィョィャ02ィェィケ03ィ 05ィ 09ィケ, 0609ィーィ 05ィケィェ0402 ィ 02ィィ0106ィ ィ ィコィー0208ィィィィ 06ィコィ 04ィ 05ィィ09ィケ ィョ09ィー06ィヲ ツィィ0904ィャィィ ィコ ィィ04ィャ02ィェ02ィェィィ ィャ02 ィー060006, 09ィー06ィィィー 06ィーィャ02ィーィィィーィケ ィィ04ィャ02ィェ02ィェィィ07 ツィィ090502ィェィェ0609ィーィィ Sphingomonas sp., Streptomyces sp. ィィ Nocardioides sp., ィェィ ィコ06ィー ィィ0705ィィ 05ィィ03ィケ 00ィ ィコィー060804, ィ ィェィェ ィ 02ィャ06ィヲ ィコィョ05ィケィーィョ0806ィヲ ィィ ィ ィー06ィャ. 0604ィャ02ィェ02ィェィィ ィェ0204ィェィ ツィィィー0205ィケィェ06 09ィコィ 04ィ 05ィィ09ィケ ィェィ 05ィーィィ01 09ィィ01ィ 01 ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ0609. Arthrobacter sp. ィ 0405 ツィョ0909ィー09ィィィー020502ィェ ィコ ィヲ09ィー09ィィ ィ ィーィ ィィ ィ ィエィィ09ィ 02ィャ06ィヲ ィコィョ05ィケィーィョ ィーィコ0609ィ ィェィィ02 09ィェィィ03ィ 0506 ツィィ090502ィェィェ0609ィーィケ ィ ィ ィコィー0208ィィィヲ ィィ Solirubrobacter, Paenibacillus, Bradyrhizobium. 04ィィ ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ0609, ィェィェ ィィ07ィェィィ06 ィィ ィーィコ0609ィ ィェィィ07, ィ ィーィ ィィ ィ 02ィャ06ィヲ ィコィョ05ィケィーィョ0804 (ィー0802ィョ000605ィケィェィィィコィィ ェ ィケ, ツ0208ィェ0402 ィコ08ィョ03ィコィィ ェ 0502ィェ), ィコ06ィー ィ 0405ィィ ィェ04 09 ィィ ィ ィェィェ ィ 08ィ 0402ィ ツ ィ ィェィェ04ィャ ィコ ィィ ィィィー0205ィケィェ ィコ0902ィェィィ080609ィ ィェィィ07 ィ ィィィ 05ィィ06ィー02ィコ 0002ィェィ 16S ィャ06ィョ000605ィケィェィィィコィ ィャィィ 06ィーィャ02 ツ02ィェ , ツィョ0909ィー09ィィィー0205ィケィェ0402 ィコ ィャ ィー0802ィャ 00ィ ィコィー0608ィ ィャ (09ィーィ 02ィィ06ィェィ 08ィェ04ィヲ ィヲ ィー ィィィヲ09ィコ ィョ01ィ 0809ィー0902ィェィェ ィ 0008ィ 08ィェ ィョィェィィ ィィィー02ィーィ ェ ィィィャ ィィィャィィ ィ, ィコ09ィ, ィィ06ィェィケ ィ ). 0005ィィ07ィェィィ ィ ィーィ 06ィコィ 04ィ 05ィ 09ィケ ィェィ ィーィ ィー06 ツィェ06 06ィ 03ィィ08ィェィ ィョ0707ィ ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ0609, ィィ ィコ06ィー Nocardioides sp., Spartobacteria sp., Hyphomicrobium sp., Streptomyces sp. ィィ ィケ09ィコ ィヲ09ィー0902ィェィェィ 07 ィコィョ05ィケィーィョ08ィ (09 ィェィ 0302ィャ 0905ィョ ツィ ィェ ィィ 0604ィィィャィ ィケ) 0905ィィ0702ィー ィェィ Nocardioides sp., Sphi- 90

7 13ngomonas sp., Streptomyces sp. ィィ ィェィ ィコ ィィィコ 0907ィィ0906ィコ ィィ ィー0201 ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ0609, ィコ06ィー ィェ02 ツィョ0909ィー09ィィィー0205ィケィェ04 ィコ ィョィコィ 04ィ ィェィェ06ィャィョ 00ィ ィコィー0608ィョ ィィ ィ ィ ィコィー0208ィィィヲ, ィョ09ィー06ィヲ ツィィ ィコ ィヲ09ィー09ィィ ィー ィ ィコィー , ィャ0603ィェ ィィィーィケ ィーィ ィコィィ01 ィィ ィーィェ ィーィ 09ィィィー020502ィヲ 0706 ツ0902ィェィェ06ィヲ ィャィィィコ0806ィ ィィ06ィー04, ィコィ ィコ Pseudomonas sp., Bacillus sp., Rubrobacter sp. 06ィ ィコィィィャ 06ィ 08ィ 0406ィャ, ィィ ィ ィェィェ0402 ィェィ ィャィィ 00ィ ィコィー ィコィ ィ 05ィィ 09ィィ05ィケィェ ィヲ09ィー09ィィ02 ィェィ ィーィ 09 ィャィィィコ0806ィ ィェ ィ ィエ0209ィー09ィ, 01ィ 09ィ ィィィャィョィエ0209ィー ィ 0409ィィィーィィィィ ィェィェ04ィャ 0008ィョ0707ィ ィャ ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ0609, ィィィャ0206ィエィィ01 ィー02 00ィィ04ィィ ィィ ツ0209ィコィィ ィ 02ィェィェ0609ィーィィ, ィコ06ィー ィー ィィィャ 04ィ ィェィィィャィ ィーィケ 04ィェィ ツィィィー0205ィケィェィョ06 ツィ 09ィーィケ 05ィコ ィィ ツ0209ィコ06ィヲ ィェィィ03ィィ. 05ィョィエ0209ィー09ィョ02ィー ィィ03ィェィ 0703 ツィ 09ィーィケ ィャィィィコ0806ィ ィェ ィ ィエ0209ィー09ィ 0706 ツ0904, 09 ィェ ィー ィェィ ィィィ ィャィェ ツィィ090502ィェィェ ツ0902ィェィェ0401 ィ ィ ィコィー0208ィィィヲ, ィーィ ィコィィ02 ィコィ ィコ Rhizobium, Arthrobacter (09ィャ. 08ィィ09. 3). 06ィーィ ィ ィコィーィィ09ィェィ ィョ0707ィ ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ0609 ィャ060302ィー ィ 04ィーィケ 04ィ 0102ィヲ09ィー090609ィ ィェィ ィェ0609ィェ ツ090606ィ 08ィ ィ ィー0205ィケィェ ィ 01 ィィ ィー06ィャィョ ィ ツィョィーィコ ィ 00ィィ08ィョ02ィー ィェィ 09ィャ02ィェィョ ィョ ィィィヲ 06ィコ08ィョ03ィ 06ィエ02ィヲ ィー ィャ ツ ィー0607ィェィェ ィ ィェ0702ィー ィョ ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ0609, ィコ06ィー060804ィヲ 0905ィョ03ィィィー ィィ09ィー06 ツィェィィィコ06ィャ ィー0607ィェィェ ィコィ ツ0209ィー0902ィェィェ ィィ ィコ0605ィィ ツ0209ィー0902ィェィェ ィィ04ィャ02ィェ02ィェィィ ィーィ 09ィ ィャィィィコ0806ィ ィェ ィ ィエ0209ィー09ィ ィャ06ィー0807 ィェィ 06ィ ィェィ 08ィョ0302ィェィェ0402 ィィ04ィャ02ィェ02ィェィィ ィー08ィョィコィーィョ ツ0902ィェィェ06ィヲ ィャィィィコ0806ィ ィィ06ィー04, ィャ0603ィェ06 09ィコィ 04ィ ィーィケ, ツィー06 05ィー ィ ィエ0209ィー0906, ィョ09ィー06ィヲ ツィィ ィコ 0102ィヲ09ィー09ィィ06 ィャィェ0600ィィ01 09ィェ0203ィェィィ01 00ィ ィコィー (ィコィィ090506ィーィェ0609ィーィケ, ィョ ィィ07, ィ 09ィ 02ィャ ィー09ィィ ィィィャ02ィェ02ィェィィ07 ィ ィー0201ィェィィィコィィ) ィ ィコ0506 ツ02ィェィィ02 06ィーィャ02ィーィィィャ, ツィー ィィィーィケ 0008ィョ ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ0609, ツィョ0909ィー09ィィィー0205ィケィェ0402 ィコ 0102ィヲ09ィー09ィィ06 04ィ 01ィ ィェィェ ィコ ィィ ツ0209ィコ ィ ィコィー0608ィ, ィョ01ィ 02ィー0907 ィェ ィ ィー06ィャィョ ィェィ ィャィィ ィ ィ 0609ィ ィェ ィャ02ィー ィ ィィィェィ 08ィェ ィャ0705ィィィェ00ィ 03, ィエィィィヲ ィ ィョィ 06ィコ06 ィ ィェィ 05ィィ04ィィ080609ィ ィーィケ ィィ 09ィィ09ィー02ィャィ ィーィィ04ィィ080609ィ ィーィケ 01ィ ィェィェ ィィ ィコ0902ィェィィ080609ィ ィェィィ ツ0902ィェィェ06ィヲ ィェ ィィ ィ ィーィケ ィィ04ィャ02ィェ02ィェィィ07 09 ツィィ090502ィェィェ0609ィーィィ ィコ06ィェィコ0802ィーィェ0401 ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ ィィ07ィェィィ02ィャ 05ィコ ィィ ツ0209ィコィィ01 00ィ ィコィー ィャ ィェ02 ィャ02ィェ0202, ィィィェ060001ィ ィェ020706ィェ07ィーィェ06, 0706 ツ02ィャィョ ィーィ ィィ05ィィ ィィィェィ ィョ0707ィ ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ0609 ツィョ0909ィー09ィィィー0205ィケィェィ 05ィィィ 06 ィェ02 ツィョ0909ィー09ィィィー0205ィケィェィ ィコ 0102ィヲ09ィー09ィィ06 05ィコ ィィ ツ0209ィコ ィ ィコィー0608ィ, ィコ0605ィケィコィョ ィェィコィィ 05ィー ィー0802ィ ィョ02ィー ィェィ ィェィィ02 00ィィ04ィィ ィィ ツ0209ィコィィ ィ 02ィェィェ0609ィー02ィヲ ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ ィ ィーィケ 00ィョィェィコ02ィィ06ィェィ 05ィケィェィョ06 09ィー08ィョィコィーィョ08ィョ ィェ0202, ツ02ィャ ィーィ ィコ0906ィェ06ィャィィ ツ0209ィコィョ06, ィー06ィャィョ ィェ0206ィ ィィィャ ィ ィェィィ ツィィィーィケ ィコ08ィョ00 ィィ04ィョ ツィ 02ィャ0401 ィャィィィコ ィ ィェィィ04ィャ0609 ィィ 08ィ 0909ィャィ ィー08ィィ09ィ ィーィケ ィー0605ィケィコ06 ィー02 ィィ04 ィェィィ01, ィコ06ィー ィ 00ィィ08ィョ06ィー ィェィ ィィ04ィャ02ィェ02ィェィィ02 00ィ ィコィー ィコ08ィョ03ィ 06ィエ02ィヲ ィー0601ィィィコィ ィェィェ ィェィ ィャィィ ィィ ィ ィェィィ ィーィ ィー 0906ィ 06ィヲ ィヲ 03ィ ィー06ィャ ィェィ 0708ィ ィェィィィィ, ィーィ ィコ ィコィ ィコ 01ィ 02ィー ィャ0603ィェ0609ィーィケ ィーィェ0209ィーィィ ィコ06ィェィコ0802ィーィェ0402 ィィ04ィャ02ィェ02ィェィィ07 09 ィーィ ィコ0906ィェ06ィャィィ ツ0209ィコ06ィヲ 09ィー08ィョィコィーィョ ィ ィエ0209ィー09ィ ィヲ09ィー09ィィ02ィャ ィェィェ ィコ ィィ ツ0209ィコ ィ ィコィー0608ィ. 06ィーィ ィコ, ィェィ 0609ィェ ィ ィェィ 05ィィ04ィ 01ィ ィェィェ ィコ ィィ ィィィー0205ィケィェ ィィ ィコ0902ィェィィ080609ィ ィェィィ ィェ ィ ィェ04ィヲ ィ ィェィ 05ィィ04 ィーィ ィコ0906ィェ06ィャィィ ツ0209ィコ06ィヲ 09ィー08ィョィコィーィョ0804 ィャィィィコ0806ィ ィェ ィ ィエ0209ィー09ィ 09 09ィィ09ィー02ィャ02 ィャィェ ィーィェ ィーィ 02ィィ06ィェィ 08ィェ ィーィ ィィィヲ09ィコ ィョ01ィ 0809ィー0902ィェィェ ィ 0008ィ 08ィェ ィョィェィィ ィィィー02ィーィ ェ ィィィャ ィィィャィィ ィ ( ィケィャィィ 09ィ 08ィィィ ィェィーィ 01, 06ィー08ィ 03ィ 06ィエィィ01 05ィコ ィィ ツ0209ィコ ィィ07ィェィィ02 08ィ 0405ィィ ツィェ ツ02ィーィ ィェィィィヲ ィー ィ ィー0201ィェィィ ツ0209ィコィィ01 00ィ ィコィー ェ ィ 02ィャ06ィヲ ィコィョ05ィケィーィョ0804, ィ ィーィ ィィ ィィ ィーィコ0609ィ ィェィィ ツ0904). 0308ィィ ィ ィェィ 05ィィ0402 ィィ 09ィィ09ィー02ィャィ ィーィィ04ィ 02ィィィィ ィョ05ィケィーィ ィー ィィ ィコ0902ィェィィ080609ィ ィェィィ ツ0902ィェィェ06ィヲ ィ ィ 0609ィ ィェ ィャ02ィー ィ ィィィェィ 08ィェ ィャ0705ィィィェ00ィ 03, ツィー06 01ィ ィャ0603ィェ0609ィーィケ ィィィーィケ 0008ィョ ィ ィェィィ04ィャ0609, ツィョ0909ィー09ィィィー0205ィケィェ0401 ィコ 0102ィヲ09ィー09ィィ06 04ィ 01ィ ィェィェ ィ ィコィー ィコィ 04ィ ィェ06, ツィー ィ 00ィ 02ィャ04ィヲ ィー ィーィェ0209ィーィィ ィィ04ィャ02ィェ02ィェィィ07 09 ィーィ ィコ0906ィェ06ィャィィ ツ0209ィコ06ィヲ 09ィー08ィョィコィーィョ0802 ィャィィィコ0806ィ ィェ ィ ィエ0209ィー09ィ ィェィェ04ィャ 09ィェ0203ィェィィィャ ィヲ09ィー09ィィ02ィャ ィィィヲ09ィコィィィヲ ィケ09ィコ ィヲ09ィー0902ィェィェ06ィヲ ィャィィィコ0806ィ ィィ ィィィィ ィケ010604ィ ィコィ 0102ィャィィィィ, ィィ07, ィ ィェィコィー-0302ィー0208ィ ィョ0800 ェ03ィョ03ィコィィィェ, ィ 0205ィケ09ィコ060006, 3, ィーィョ07ィィ05ィ ィ ィコ02ィィ06 28 ィィ06ィェ ィ 91

8 13Sel ッskokhozyaistvennaya biologiya [Agricultural Biology], 2013, 01 5, pp THE MAIN TRENDS IN DYNAMICS OF SOIL MICROBIOM DURING A LONG-TERM FIELD EXPERIMENT AS INDICATED BY HIGH THROUGHPUT SEQUENCING THE 16S-rRNA GENE LIBRARIES 92 V.A. Dumova, E.V. Pershina, Ya.V. Merzlyakova, Yu.V. Kruglov, E.E. Andronov All-Russian Research Institute of Agricultural Microbiology, Russian Academy of Agricultural Sciences, 3, sh. Podbelskogo, Saint Petersburg-Pushkin, Russia, doumova@gmail.com Received June 28, 2012 doi: /agrobiology eng Acknowledgements: Supported by Ministry of Education and Science of the Russian Federation, and Russian Foundation for Basic Research Abstract A biodiversity of soil microbial communities now is being widely studied. Since 1912, the influence of different agrotechnical factors on soil is being examined in the stationary field experi-ment in the Moscow Agricultural Academy. We investigated an effect of different combination of three factors, i.e. plants (flax and winter rye), crop rotation and soil acidity, to the soil microbiom. To estimate a biodiversity, the throughput sequencing was used. Also an original approach, the bi-nary sampling, was suggested to analyze the data of throughput sequencing. It was shown the number of microorganisms which changed under the influence of studied factor is approximately equal to those staying unchanged. But a taxonomic composition of these two groups differed, and the impacted group was more uniform. Thus, we can conclude that the less part of microorganism is sensitive to the acting factors, and the rest ones keep their number unchanged, more or less. The taxonomic groups of microorganisms, sensitive to each of studied factors, were revealed. The binary sampling, suggested herein, allows finding out a relation between an action of some ecological fac-tor and varying taxonomic structure of microbial population. Keywords: soil microbiom, high throughput sequencing. REFERENCES 1. Pace N.R. Mapping the tree of life: progress and prospects. Microbiology and Molecular Biology Reviews, 2009, 73(4): Tyson G.W., Banfield J.F. Cultivating the uncultivated: a community genomics perspective. Trends in Microbiology, 2005, 9(13): Kakirde K.S., Parsley L.C., Liles M.R. Size does matter: application-driven approaches for soil metagenomics. Soil Biol. Biochem., 2010, 42: Lombard N., Prestat E., Elsas J.D.V., Simonet P. Soil-specific limitations for access and analysis of soil microbial communities by metagenomics. FEMS Microbiol. Ecol., 2011, 78: Wooley J.C., Ye Y. Metagenomics: Facts and artifacts, and computational challenges. Journal of Computer Science and Technology, 2010, 1(25): Mardis E.R. Next-generation DNA sequencing methods. Annual Review of Genomics and Human Genetics, 2008, 9: Bates S.T.D., Berg-Lyons J.G., Caporaso W.A. et al. Examining the global distribution of dominant archaeal populations in soil. ISME Journal, 2010, 5: Cole J.R., Wang Q., Cardenas E. et al. The Ribosomal Database Project: improved alignments and new tools for rrna analysis. Nucl. Acids Res., 2009, 37: D141-D Lauber C.L., Strickland M.S., Bradford M.A., Fierer N. The influence of soil properties on the structure of bacterial and fungal communities across land-use types. Soil Biol. Biochem., 2008, 40: Zhang H., Sekiguchi Y., Hanada S. et al. Gemmatimonas aurantiaca gen. nov., sp. nov., a gramnegative, aerobic, polyphosphate-accumulating micro-organism, the first cultured representative of the new bacterial phylum Gemmatimonadetes phyl. nov. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbioly, 2003, 53(4): ィ ィョ ツィェ ィ 08ィ ィェィィ07 THE 2 nd PLANT GENOMICS CONGRESS (12-13 May, 2014, London, UK) Attracting experts working in next generation sequencing, plant genomics/sciences, epigenetics, bioinformatics and data management, the conference will continue to examine the latest NGS platforms and technologies suitable for progressing plant based research as well as tools to enable successful analysis. 06ィェ000608ィャィ 02ィィ07:

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Kniga9.vp 13Education in and for the Information Society UNESCO Publications for the World Summit on the Information Society Author: Cynthia Guttman 1300ィィィェィィ09ィー020809ィー0906 ィコィョ05ィケィーィョ0804 ィィ ィャィ 090906090401

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