情報解析技術室

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ゆきそや
6 years ago
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1 Kaoru Fukami Yuichi Obata

日本人由来不死化細胞株研究用ヒト間葉系幹細胞といった新しいリソースの提供開始に伴いその提供業務を支援するシステムの開発を行った既存の細胞提供業務と提供事務システムについては利用者からの意見要望を取り入れより使いやすいシステムへの改善を行っているまた各リソースデータベースに格納さ

2 情報解析技術室 BRC Annual Report 後列左から江木中田福田野口松野石山一石太田深海室長岩瀬年次計画と成果 Ⅰ. リソース情報事業平成１４年度から開始された実験動物実験植物の提供業務を支援するシステムの開発を引き続き行っているまた実験動物についてはより多くの特性情報を提供出来かつ検索性のより優れたシステムを実験植物については扱うデータタイプを拡張した検索システムを開発したさらに研究用ヒト臍帯血幹細胞日本人由来不死化細胞株研究用ヒト間葉系幹細胞といった新しいリソースの提供開始に伴いその提供業務を支援するシステムの開発を行った既存の細胞提供業務と提供事務システムについては利用者からの意見要望を取り入れより使いやすいシステムへの改善を行っているまた各リソースデータベースに格納された所在情報ならびに特性情報の更新を随時行い常に最新の情報が提供されるようにしている当センターが収集してきた多くのリソースには研究者により作成された特性情報が添付されておりそれらは研究を遂行する上で非常に有用性が高いこのように当センターは研究材料とそれに付随する特性情報を同時に提供できる利点を持っているこの利点をさらに高めるため個体から細胞遺伝子までの特性情報を有機的に結びつけたデータベースの作成を計画中である 96

3 . * 1. Sakaki Y, Watanabe H, Taylor T, Hattori M, Fujiyama A, Toyoda A, Kuroki Y, Itoh T, Saitou N, OOta S, Kim CG, Kitano T, Lehrach H, Yaspo ML, Sudbrak R, Kahla A, Reinhardt R, Kube M, Platzer M, Taenzer S, Galgoczy P, Kel A, Bloecker H, Scharfe M, Nordsiek G, Hellmann I, Khaitovich P, Paabo S, Chen Z, Wang SY, Ren SX, Zhang XL, Zheng HJ, Zhu GF, Wang BF, Zhao GP, Tsai SF, Wu K, Liu TT, Hsiao KJ, Park HS, Lee YS, Cheong JE, Choi SH; Chimpanzee Chromosome 22 Sequencing Consortium. Human versus chimpanzee chromosome-wide sequence comparison and its evolutionary implication. Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 2003; 68: * 2. Fukami-Kobayashi K, Tateno Y, Nishikawa K; Parallel evolution of ligand specificity between LacI/GalR family repressors and periplasmic sugar-binding proteins. Molecular Biology and Evolution 2003; 20: * 3. Watanabe H, Fujiyama A, Hattori M, Taylor TD, Toyoda A, Kuroki Y, Noguchi H, BenKahla A, Lehrach H, Sudbrak R, Kube M, Taenzer S, Galgoczy P, Platzer M, Scharfe M, Nordsiek G, Blocker H, Hellmann I, Khaitovich P, Paabo S, Reinhardt R, Zheng HJ, Zhang XL, Zhu GF, Wang BF, Fu G, Ren SX, Zhao GP, Chen Z, Lee YS, Cheong JE, Choi SH, Wu KM, Liu TT, Hsiao KJ, Tsai SF, Kim CG, OOta S, Kitano T, Kohara Y, Saitou N, Park HS, Wang SY, Yaspo ML, Sakaki Y; DNA sequence and comparative analysis of chimpanzee chromosome 22. Nature May 27; 429(6990): * 97

4 4. Kashiwagi K, Fukami-Kobayashi K, Shiba K, Nishikawa K; Construction and characterization of chimeric proteins composed of type-1 and type-2 periplasmic binding proteins MglB and ArgT. Biosci Biotechnol Biochem. 2004; 68(4): * 5. Imanishi T, Itoh T, Suzuki Y, O'Donovan C, Fukuchi S, Koyanagi KO, Barrero RA, Tamura T, Yamaguchi-Kabata Y, Tanino M, Yura K, Miyazaki S, Ikeo K, Homma K, Kasprzyk A, Nishikawa T, Hirakawa M, Thierry-Mieg J, Thierry-Mieg D, Ashurst J, Jia L, Nakao M, Thomas MA, Mulder N, Karavidopoulou Y, Jin L, Kim S, Yasuda T, Lenhard B, Eveno E, Suzuki Y, Yamasaki C, Takeda J, Gough C, Hilton P, Fujii Y, Sakai H, Tanaka S, Amid C, Bellgard M, Bonaldo Mde F, Bono H, Bromberg SK, Brookes AJ, Bruford E, Carninci P, Chelala C, Couillault C, de Souza SJ, Debily MA, Devignes MD, Dubchak I, Endo T, Estreicher A, Eyras E, Fukami-Kobayashi K, Gopinath GR, Graudens E, Hahn Y, Han M, Han ZG, Hanada K, Hanaoka H, Harada E, Hashimoto K, Hinz U, Hirai M, Hishiki T, Hopkinson I, Imbeaud S, Inoko H, Kanapin A, Kaneko Y, Kasukawa T, Kelso J, Kersey P, Kikuno R, Kimura K, Korn B, Kuryshev V, Makalowska I, Makino T, Mano S, Mariage-Samson R, Mashima J, Matsuda H, Mewes HW, Minoshima S, Nagai K, Nagasaki H, Nagata N, Nigam R, Ogasawara O, Ohara O, Ohtsubo M, Okada N, Okido T, OOta S, Ota M, Ota T, Otsuki T, Piatier-Tonneau D, Poustka A, Ren SX, Saitou N, Sakai K, Sakamoto S, Sakate R, Schupp I, Servant F, Sherry S, Shiba R, Shimizu N, Shimoyama M, Simpson AJ, Soares B, Steward C, Suwa M, Suzuki M, Takahashi A, Tamiya G, Tanaka H, Taylor T, Terwilliger JD, Unneberg P, Veeramachaneni V, Watanabe S, Wilming L, Yasuda N, Yoo HS, Stodolsky M, Makalowski W, Go M, Nakai K, Takagi T, Kanehisa M, Sakaki Y, Quackenbush J, Okazaki Y, Hayashizaki Y, Hide W, Chakraborty R, Nishikawa K, Sugawara H, Tateno Y, Chen Z, Oishi M, Tonellato P, Apweiler R, Okubo K, Wagner L, Wiemann S, Strausberg RL, Isogai T, Auffray C, Nomura N, Gojobori T, Sugano S; Integrative annotation of 21,037 human genes validated by full-length cdna clones. PLoS Biol Jun; 2(6): * (2003) No. 2:

5 1. - GTOP "Detection of positive Darwinian selection in human chromosome 21 by using chimpanzee chromosome 22" Setsuko Mise-Omata, Shigeru Iwase, Nathan Mise, Yuichi Obata, Takahiro Doi.: "The strong reduction of PTEN expression by a specific RNA interference induced loss of adhesion of the cells." 57 5 (2004) 5. STR 7 12 (2004) 99

Integrative Annotation of 21,037 Human Genes Validated by Full-Length cDNA Clones

Title Integrative Annotation of 21,037 Human Genes Validat Imanishi, Tadashi; Itoh, Takeshi; Suzuki, Yutaka; O' Roberto A.; Tamura, Takuro; Yamaguchi-Kabata, Yumi; Kazuho; Homma, Keiichi; Kasprzyk, Arek;