Windows で Virtualbox 上に Lin4Neuro を簡単に インストールする方法 09-Jan-2016 根本清貴 Acknowledgment 本スライドは 包括脳 MRI チュートリアル UNIX 基礎のチューターの方々に検証をしていただきました 石川和宏太田深秀岡田直大門田宏

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1 Windows で Virtualbox 上に Lin4Neuro を簡単に インストールする方法 09-Jan-2016 根本清貴 Acknowledgment 本スライドは 包括脳 MRI チュートリアル UNIX 基礎のチューターの方々に検証をしていただきました 石川和宏太田深秀岡田直大門田宏後藤政実松田幸久森田健太郎山田貴志山本真江里吉田篤司 茨城県立こころの医療センター国立精神 神経医療研究センター神経研究所疾病研究第三部東京大学大学院医学系研究科精神医学分野高知工科大学総合研究所北里大学医療衛生学部金沢医科大学総合医学研究所プロジェクト研究センター戦略的研究部東京大学大学院医学系研究科精神医学分野国際電気通信基礎技術研究所名古屋大学精神科北海道大学病院放射線診断科 2

2 Windows のバージョン VirtualBox で Lin4Neuro を動作させるには 64 ビットの Windows である必要があります コントロールパネル システムとセキュリティ システムから お使いのシステムが 64 ビットであるかどうかを確認できます 3 VirtualBox のダウンロード VirtualBox は仮想化ソフトウェアです チュートリアルでは 解析ソフトがすでに設定済みの Lin4Neuro を VirtualBox 上で動作させます より VirtualBox と Extension Pack をダウンロードします 4

3 ふたつのファイルをダウンロードしてください 2016 年 01 月 06 日時点では ですが さらにアップデートされていたら最新版をダウンロードしてください 5 VirtualBox のインストール VirtualBox-5.xxx-Win.exe をダブルクリックしてインストーラーを起動します 6

4 VirtualBox のインストール (1) ダブルクリックでインストールします 通常のソフトウェアと同様です 7 VirtualBox のインストール (2) 途中 上のような Warning が出ますが気にする必要はありません ネットワークが一時途切れますと言っているだけです 8

5 VirtualBox のインストール (3) 上の画面が出たら インストール をクリックしてください 9 VirtualBox のインストール (4) この画面も同様に インストール をクリックしてください もう一度出てきますが それも同じです 10

6 VirtualBox のインストール (5) インストール終了です チェックをはずして Finish をクリックしてください 11 Extension Pack のインストール Oracle_VM_VirtualBox_ Extension_Pack-5.xxx.vbox-extpack をダブルクリックして Extension Pack のインストーラーを起動してインストールします 12

7 Extension Pack のインストール VirtualBox が起動し Extension Pack のインストールのための画面があらわれます 指示に従ってインストールします 13 こうなっていれば 正しくインストールされています 14

8 仮想マシンの準備 皆様が最低限の作業ですむように すでに構築されたシステムを ひとつのファイル ( 仮想アプライアンス ) にまとめてあります "L4N-VM.ova" が仮想アプライアンスです L4N-VM.ova を包括脳のサイトからダウンロードしてデスクトップに保存します 15 16

9 デスクトップにある "L4N-VM.ova" を選択します 17 18

10 ここまで来れば基本インストールは完了です あとは 共有フォルダの設定とチュートリアルのデータの準備をします 19 共有フォルダの作成 仮想マシンと共有するフォルダを作成します ご自身のパソコン (Windows) の ドキュメント のすぐ下に "cbsn" というフォルダを作成します (cbsn は包括脳の略称です ) 20

11 ドキュメントのすぐ下に "cbsn" というフォルダを作成します 21 チュートリアルデータのダウンロード 各コースのデータをウェブサイトからダウンロードし 今し方作成した cbsn ディレクトリに移動します データのファイル名は以下の通りです UNIX の基礎と応用 cbsn_tutorial_2015_unix1.zip cbsn_tutorial_2015_unix2.zip DTI 解析 cbsn_tutorial_2015_tbss.zip Resting-state fmri cbsn_tutorial_2015_rsfmri.zip 22

12 共有フォルダの設定 仮想マシンから 今設定した共有フォルダを見ることができるように設定します VirtualBox マネージャーの 設定 から設定します 23 L4N-VM を選んでから 設定 をクリックします 24

13 左の 共有フォルダ を選択してから 右にあるアイコンをクリックします 25 先ほど作ったフォルダを指定します C: ユーザー名 Documents cbsn になるはずです フォルダー名は自動で決まります 自動マウントにチェックを入れます 26

14 27 これで設定は完了です 起動 をクリックしてください 28

15 パスワードは brain です 29 ターミナルはここから起動します 練習がてら 起動してみましょう 30

16 cd /media/sf_cbsn とタイプします 31 共有フォルダに移動しました ls とタイプするとチュートリアルのデータフォルダが見えます 32

17 データの解凍 チュートリアルのデータを解凍します ターミナルから unzip コマンドを使ってデータを解凍します以下の赤字をタイプします UNIX の基礎と応用 $ unzip cbsn_tutorial_2015_unix1.zip $ unzip cbsn_tutorial_2015_unix2.zip DTI 解析 $ unzip cbsn_tutorial_2015_tbss.zip Resting-state fmri $ unzip cbsn_tutorial_2015_rsfmri.zip 33 データを解凍します UNIX 系 OS の基礎と応用の受講者は ターミナルから unzip cbsn_tutorial_2015_unix1.zip unzip cbsn_tutorial_2015_unix2.zip とタイプしてください TBSS と rs-fmri も同様です 34

18 共有フォルダはここからもアクセスできますダブルクリックしてください 35 UNIX 系 OS の基礎と知識 :unix, fsl-first TBSS: tbss Rs-fMRI: rs-fmri というフォルダが作成されていることを確認してください ( 上の画面ではまだひとつしか解凍していません ) 36

19 FSL を起動してみましょう "fsl" とタイプすれば FSL が起動します 37 左下のメニューから 脳画像解析 を選ぶと 事前に設定がすんでいるソフトウェアを起動できます 38

20 エラーが出てしまった場合 このようなエラーが出た場合は コンピューターの BIOS の設定を変更する必要があります 一度 コンピューターをシャットダウンしてください 39 BIOS 画面の入り方 (1) メーカーにより BIOS の入り方は異なります 各 PC の取り扱い説明書もしくはサポートサイトをご覧になっていただき BIOS を起動してください ( 参考 ) Lenovo: 電源を押したら F1 NEC: 電源を押したら F2 Vaio: F3 もしくは F4 を押しながら電源を押す 40

21 BIOS 画面の入り方 (2) 参考 :Panasonic Let s Note Windows 8 or 8.1 [Windows ロゴ ] キー +[C] キーを押し [ 設定 ]-[PC 設定の変更 ] をクリック Windows 8.1 の場合 [ 保守と管理 ]-[ 回復 ] をクリック Windows 8 の場合 [ 全般 ] をクリック PC の起動をカスタマイズする の [ 今すぐ再起動する ] をクリック [ トラブルシューティング ]-[ 詳細オプション ]-[UEFI ファームウェアの設定 ]-[ 再起動 ] をクリック 41 Intel Virtualization Technology BIOS 画面において Intel Virtualization Technology もしくは Intel VT-x という項目を探します その項目が 無効 もしくは Disabled になっていると思いますので 有効 もしくは Enabled に変更します 変更した後 F10 を押して変更を保存し 一度電源を切ります その後 再起動します 42

22 BIOS の例 Lenovo: Security の下に Intel Virtualization Technology の項目あり Vaio および NEC: Advanced の下に Intel Virtualization Technology もしくは Intel VT-x の項目あり 43 もしわからなかったら VirtualBox 上で Lin4Neuro のエラーが出るようであれば 包括脳のウェブサイトに記載されているメールアドレスにメールをください サポートさせていただきます 44

23 仮想マシンの削除の方法 不要になったら仮想マシンは簡単に削除できます VirtualBox マネージャーで仮想マシンを選択し 右クリックで除去を選択し すべてのファイルを削除 をクリックします 45