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れれむらかわ
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Reaxys 基本検索ガイド 018.4 エルゼビアジャパン株式会社目次 1. 概要. Reaxys 検索方法 - Reaxys へのアクセス 3.

検索結果の Export / Save / Alert の利用 7. Quick Search: テキストサーチ 8. Query Builder 9.

1 Reaxys 基本検索ガイドエルゼビアジャパン株式会社目次 1. 概要. Reaxys 検索方法 - Reaxys へのアクセス 3. Quick Search: 反応検索 4. Synthesis Planner 5. Quick Search : 物質物性値検索 6. 検索結果の Export / Save / Alert の利用 7. Quick Search: テキストサーチ 8. Query Builder 9. Query Builder 検索事例 - 条件の掛け合わせ ( 天然物抗菌活性分子式 ) - ノイズの除去 - 条件の掛け合わせ ( 用途 ) 10. Appendix - 無機化合物の検索 - 化合物の表記方法 - 動作環境

万以上の化合物とその物性 ( 物性値スペクトル生物活性データなど )5 億 5 千万件を収録 4,100 万件以上の反応情報 ( 反応条件溶媒

2 概要 : 新しくなった Reaxys Reaxys とは? 化学研究で実際に必要なデータを集めたデータベース化学関連論文や特許から必要な情報そのものを的確に抽出して提供 9,000 万以上の化合物とその物性 ( 物性値スペクトル生物活性データなど )5 億 5 千万件を収録 4,100 万件以上の反応情報 ( 反応条件溶媒触媒収率など ) を収録 500 万件以上のライフサイエンスマテリアルエンジニアリング薬理学環境科学などに関連する文献を 16,000 誌のジャーナルや特許から収録 Chemistry fundamentals Uses across disciplines 4

3 Reaxys の特徴 Reaxys 情報の収集より活用にフォーカスし必要な時間を短縮書誌データベース???? 検索に対応した書誌情報リストを提示リストの中から文献を選定内容を精査する作業が発生膨大な時間を要する Reaxysは研究者が必要とする適切な情報をあらかじめ抽出関連性の高いデータから提示詳細な実験条件を含む反応情報化合物の詳細な実測物性値データ 5 Reaxys 開発の歴史 ( 基礎となった情報源 ) 6

ユーザーニーズを満たすインターフェースやデータ構造 1 ユーザーフレンドリーなインターフェース構造検索キーワード検索などユーザーが使いやすい方法に対応構造 +キーワードなどの検索にもドラッグアンドドロップで対応直観的に利用可能詳細なインデキシングにより整理されたデータ細部まで行き届いた詳細なインデキシングによるデータ構成で迅速な情報の入手を実現

4 ユーザーニーズを満たすインターフェースやデータ構造 1 ユーザーフレンドリーなインターフェース構造検索キーワード検索などユーザーが使いやすい方法に対応構造 +キーワードなどの検索にもドラッグアンドドロップで対応直観的に利用可能詳細なインデキシングにより整理されたデータ細部まで行き届いた詳細なインデキシングによるデータ構成で迅速な情報の入手を実現関連する情報を俯瞰的にとらえることが可能 3 Reaxys 独自のタキソノミーとデータ構成化学に関連したReaxys 独自のタキソノミーを構築しデータの階層化により効率的な検索を実現ニーズに応じた使いやすいフィルタリングの機能を搭載し必要な情報に短時間で到達 7 コンテンツ学術論文 1 約 450 誌強の雑誌タイトルから専門家が人手で注意深く実用的な価値を持つ実験データを抽出有機化学 1771 年 ~ 無機化学有機金属錯体 177 年 ~ 化合物の実測物性値情報化学反応情報 8

コンテンツ学術論文 15,000 誌のジャーナルのフルテキストから構造情報やキーワード化学関連のコンセプトを収録自然言語処理技術を用いて情報を抽出 015 年 ~ 化合物名

Engineering EMBASE: Biomedicine & Pharmacology GeoBase: Geosciences & Environment

情報を整理し収録網羅的な選択肢を提示実際に探している情報を簡単に効率よく収集分野を超えた新たな化学的見識の発見年間約 30 万化合物の継続的な情報拡充

収録化合物情報の大幅な拡大 * 国際特許分類が以下の 4 種に該当する特許を収録 C07 ( 有機化学 ) A01N ( 殺菌剤殺虫剤除草剤 ) A61K ( 医薬品

5 コンテンツ学術論文 15,000 誌のジャーナルのフルテキストから構造情報やキーワード化学関連のコンセプトを収録自然言語処理技術を用いて情報を抽出 015 年 ~ 化合物名反応分類 ( 酸化還元重合縮合など ) 人名反応物性値名などジャーナルの全文情報を最先端の技術により処理し収録 Compendex: Technology & Engineering EMBASE: Biomedicine & Pharmacology GeoBase: Geosciences & Environment MedLine: Life Sciences & Medicine * インデキシングに使用 1 Reaxys 独自のタキソノミー検索から導かれ得る複数の 3 を使用情報を整理し収録網羅的な選択肢を提示実際に探している情報を簡単に効率よく収集分野を超えた新たな化学的見識の発見年間約 30 万化合物の継続的な情報拡充加速的に増加し続ける情報量に迅速に対応 9 コンテンツ特許特許公報からのデータ収録 WO/US/EP に出願された英文特許から抽出アジアの特許公報に基づく化合物の収録を開始収録化合物情報の大幅な拡大 * 国際特許分類が以下の 4 種に該当する特許を収録 C07 ( 有機化学 ) A01N ( 殺菌剤殺虫剤除草剤 ) A61K ( 医薬品歯科用又は化粧用製剤 ) C09B( 染料 ) 毎年公開される特許のうち多くをアジアが占めるアジアの特許公報由来の化合物数の増加予定 016 年 7 月 016 年 9 月 016 年 11 月 017 年 90K 36K 59K 1M 10

6 収録対象 IPC 一覧 Main IPC C07 (without C07H1 and C07K) Main IPC A61K31 with secondary IPC C07 Main IPC A61K without A61K31 and without secondary IPC C07 Main IPC C09B Main IPC A01N There are other more specific IPCs that are covered in Reaxys too: A01N - preservation of bodies of humans, animals, plants or parts thereof, and biocides. A61K - preparations for medical, dental, or cosmetics. C07B - general methods of organic chemistry, apparatus thereof. C07C - acyclic or carbocyclic compounds. C07D - heterocyclic compounds. C07F - acyclic or carbocyclic compounds or heterocyclic compounds containing elements other than carbon, hydrogen, halogen, oxygen, nitrogen, sulfur, selenium, or tellurium. C07G - compounds of unknown constitution. C07H - sugars, derivatives thereof, nucleosides, nucleotides, nucleic acids (without C07H1 nucleic acids). C07J - steroids. C07M - indexing scheme associated with subclasses C07B to C07K, relating to specific properties of organic compounds. C09B - organic dyes or closely-related compounds for producing dyes, mordants, lakes コンテンツ収録項目特許および約 450 誌のジャーナル専門家が人手で実用的な価値を持つ実験データを抽出 < 反応情報 > 反応式収率反応条件実施例 < 化合物情報 > 物性値融点沸点溶解度分配係数 400 種類以上スペクトルデータ NMR UVスペクトルマススペクトル生物活性データ毒性 PKデータ環境毒性 * 約 500 項目 5 億 5000 万件以上のデータ市販情報 1

7 Reaxys のデータ構造複数ある情報源から化合物反応に関するすべての情報を1レコードとして集約それぞれの情報源へのスムーズなアクセス 13 ユーザーの検索に合わせ最適化されたインターフェース Quick Search 多くの研究者が利用する構造検索とキーワード検索に対応したシンプルかつ直観的なインターフェステキスト検索はキーワードだけではなく文中の言葉の前後関係を考慮した自然言語処理に対応 14

ユーザーが必要とする情報を優先的に表示検索例 :esterification of benzoic acid 1 自然言語を認識目的の検索結果に加え関連ある選択肢を追加で提案自然言語処理により Benzoic acid のエステル化の検索であることを認識 3 上記の検索関連のある他の 3 つの選択肢提示 15

8 ユーザーが必要とする情報を優先的に表示検索例 :esterification of benzoic acid 1 自然言語を認識目的の検索結果に加え関連ある選択肢を追加で提案自然言語処理により Benzoic acid のエステル化の検索であることを認識 3 上記の検索関連のある他の 3 つの選択肢提示 15 複雑な掛け合わせの検索にもドラッグ & ドロップで対応 Query Builder 4 検索条件を設定して検索複数物性構造やキーワードの組み合わせ検索履歴との掛け合わせなどが容易に 1 検索条件リスト 3 演算子を使用して掛け合わせドラッグ & ドロップで検索画面に追加必要な条件だけを選んで掛け合わせ 16

9 1 レコードで多くの情報を提供インデックスされた用語を表示被引用情報一覧 (Scopus 由来 ) 化合物情報のリンク反応情報化合物情報関連する反応情報市販情報 Reference 一覧反応条件の確認物性情報一覧 17 フィルターと分析機能による情報への迅速なアクセス詳細な項目の絞り込みフィルター絞り込む前に検索結果の傾向分析が可能 18

10 フィルターと分析機能による情報への迅速なアクセス階層化されたフィルター項目 19 Reaxys 検索方法

11 Reaxys へのアクセス URL: ログインする場合 URL: 1 Reaxys の画面テキスト入力構造式反応式入力 Quick search: 構造検索キーワード検索 Query builder: 構造式数値などの掛け合わせの検索検索履歴の掛け合わせ検索 Results: 検索結果ユーザーが必要とする情報を優先的に表示 Synthesis planner: 逆合成的にルートを検索 History: 検索履歴の閲覧

12 Reaxys の演算子演算子例 OR A OR B A B どちらかを含むもの AND A AND B A B 両者を含むもの NOT A NOT B A から B を除く PROXIMITY A PROXIMITY B A と B が対応するデータであるもの NEXT A NEXT B A と B がこの順番で隣接しているもの NEAR A NEAR B A と B が順序を問わず近接しているもの * 一部対応するフィールドが限定されている演算子もあります 3 Quick Search: 反応検索

13 反応条件の設定 1 Reaxys では全反応半反応出発物質生成物のいずれからも反応が検索できます名称をから構造式を自動的に作画することも可能です検索例 : エソメプラゾール (Esomeprazole) とその類縁体の合成方法を探す 1 Create Structure or Reaction Drawing をクリックして構造式作画画面に移動します Create structure template from name をクリックします 5 反応条件の設定名称の入力画面 : esomeprazole と入力し虫メガネアイコンをクリックします化合物名称は下記から選択可能 - 完全一致 (is) - 前方一致 (starts with) - 後方一致 (ends with) - 部分一致 (contains) 複数候補化合物が表示される場合は必要なものを選択構造式の編集 : 自動的に名称から構造式が生成されますここではesomeprazoleの骨格を含むものを検索したいので作画ソフトで編集を行います環上の置換基を全て削除し骨格部分を検索に利用します *Marvin JS 操作方法の詳細は別添のテクニック集をご参照ください 6

atoms: 全てのアトム上に - Similarity: 類似反応検索その他の検索オプション - Tautomers: 互変異性体を含む - Stereo: 立体を含む - Additional ring closure:

14 反応条件の設定 3 検索オプションを設定し Transfer to query ボタンをクリックします * 検索オプションの説明は次ページをご参照ください検索を行います構造式が検索画面に反映されます Find ボタンをクリックして検索を行います 7 検索オプション 1 1 構造検索オプション - As Drawn: 描画通りの構造 - Substructure: 部分構造検索 - on heteroatoms: ヘテロアトム上に - on all atoms: 全てのアトム上に - Similarity: 類似反応検索その他の検索オプション - Tautomers: 互変異性体を含む - Stereo: 立体を含む - Additional ring closure: 追加の縮環を含む - Related Markush: 関連する Markush を含む - Salts: 塩を含む - Mixtures: 混合物を含む - Isotopes: アイソトープを含む - Charges: 荷電分子を含む - Radicals: ラジカルを含む 8

検索結果の表示 Reaxysがqueryから判断した検索結果を表示します例えば構造式で検索した場合化合物の検索結果と反応の検索結果の両方を表示しますここではエソメプラゾール (Esomeprazole) とその類縁体の合成方法を探そうとしているので ReactionのView Resultsボタンをクリックしますこの場合化合物の検索結果と反応の検索結果が表示されている

15 検索結果の表示 Reaxysがqueryから判断した検索結果を表示します例えば構造式で検索した場合化合物の検索結果と反応の検索結果の両方を表示しますここではエソメプラゾール (Esomeprazole) とその類縁体の合成方法を探そうとしているので ReactionのView Resultsボタンをクリックしますこの場合化合物の検索結果と反応の検索結果が表示されている <Preview Results> Preview Results を展開すると top 3 の結果が表示される 9 検索結果画面エソメプラゾール (Esomeprazole) とその類縁体の合成方法の検索結果がレコードごとに表示されます検索結果の絞り込みなどの軌跡をナビゲーションする機能や各種フィールドを活用したフィルター機能も用意されています検索結果からフルテキスト引用情報などにアクセス可能なリンクも付与されています項目 1 レコードごとに表示された検索結果 3 物質が購入可能なことを示すカートマーク実験手順の記載検索結果の軌跡をナビゲート 5 フィルター機能 : - 各種反応情報書籍情報などでの絞り込みが可能 6 エクスポートボタン 1 7 検索結果の並べ替え - デフォルトは Reaxys Ranking による並び - 昇順降順を選択可能 3 30

反応検索の場合 5 フィルター機能構造収率試薬触媒溶媒触媒クラス溶媒クラス生成物の使用可能反応物の使用可能反応クラスソースの種類 ( 文献特許

16 検索結果の閲覧 1 並べ替えメニュー - Reaxys Ranking - Referenceの数 - 反応物の利用可能 - 生成物の利用可能 - 生成物の分子量 - 収率 - 出版年度 7 検索結果の並べ替え 3Experimental Procedure の表示 31 検索結果の閲覧フィルターとして利用可能なフィールド反応検索の場合 5 フィルター機能構造収率試薬触媒溶媒触媒クラス溶媒クラス生成物の使用可能反応物の使用可能反応クラスソースの種類 ( 文献特許 ) 発行年 1ステップ反応のみの絞り込み * フィルター機能では検索結果で多くヒットした条件が降順で表示されています絞り込み機能以外に傾向を知る簡易ツールとしても利用可能です 3

17 検索結果の閲覧 3 結果の閲覧 1の続き : レコード1の詳細を確認しています Full Text: フルテキストリンク ( 次ページ ) Cited 1 times: 被引用数クリックすることで引用文献が表示されます Details: 論文のAbstract Index Term Indexされた化合物や反応 (35ページ) Abstract:Abstract 33 検索結果の閲覧 4 Full Text をクリックすると論文本文へのリンクが表示されます 34

18 検索結果の閲覧 5 Deatils をクリックすると論文の Abstract Index Term の詳細論文に含まれる物質反応フルテキストへのリンクが表示されます 35 検索結果の閲覧 6 著者のリンクをクリックすると Scopus の著者詳細結果が表示されます *Scopus の契約がない場合はプレビューのみ表示 Scopus とは Scopus はエルゼビアが提供する世界最大級の書誌引用情報データベース Reaxys で見つけた文献を引用して書かれた文献を調べることが可能 36

19 Synthesis Planner 合成ルートの作成 1 合成計画ツール (Synthesis Planner): ある物質を最終生成物して合成ルートを逆合成的に計画することができます - 複数の合成ルート候補を一画面で表示できるので比較検討に便利 - 化合物検索の結果からも合成計画ツールを利用することが可能検索例 : エソメプラゾール (Esomeprazole) の合成法を探す反応検索結果から合成ルートの作成を行いますをクリックし Manually または Autoplan を選択 38

合成ルートの作成 Autoplan Autoplan を選択するとオプション設定画面が表示されます 1 3 4 5 Numbers of plans to create -

number of steps - 設定範囲 : 1~10まで Stop searching if starting material is commercially

カーソルでパーセンテージを変更 Create Plans をクリックすると合成ルートが表示されます 39 合成ルートの作成 3 Manually ( 合成手法の手動選択 )

20 合成ルートの作成 Autoplan Autoplan を選択するとオプション設定画面が表示されます Numbers of plans to create - 設定範囲 :1~10まで Max. alternative branches - 設定範囲 : 1~10まで Max. number of steps - 設定範囲 : 1~10まで Stop searching if starting material is commercially available - はいいいえで選択可能 Default yield for reactions without a given yield - カーソルでパーセンテージを変更 Create Plans をクリックすると合成ルートが表示されます 39 合成ルートの作成 3 Manually ( 合成手法の手動選択 ) Manually を選択すると合成法の候補一覧が表示されます - 反応条件を比較した後に採用したい反応式のチェックボックスを選択 ( 複数選択可 ) - 必要な反応を選択し SynPlan をクリックすると選択した合成ルートが表示されます 40

21 合成ルートの作成 4 合成計画画面の続き : 前画面で追加した合成ルートが表示されています 1 1 合成ルートの拡大縮小表示矢印にカーソルを当ててクリックするとメニューが開く Show conditions - 実験条件詳細 Hide preparation - 調製方法を隠す Show preparation - 再表示 Add preparation - 調製方法を追加 Remove preparation: - 調製方法を削除 3 合成ルートはでドラッグすることにより移動できます 41 合成ルートの作成その他の機能 : 1 合成計画を Import 合成計画を Save Save したファイルを Reaxys ユーザー間で共有可能 3 合成計画を Export 出力形式は選択可能 - PDF/Print - Microsoft Word - Electronic Lab Notebook - RD File 4

22 Quick Search: 物質物性値検索検索条件の設定 1 Reaxys では化学構造式物質名物性値書誌情報などから物質物性値の検索を行うことができます検索例 : メバスタチン (Mevastatin) の類似化合物を検索する 1 Create structure or Reaction Drawing をクリック Generate structure template from name のアイコンをクリック 44

操作方法の詳細については別添のテクニック集をご参照ください 45 検索結果の表示 Reaxysがqueryから判断した検索結果を表示しますここではメバスタチン (mevastatin) とその類縁体の物質

23 検索条件の設定名称の入力画面 : Mevastatin と入力しクリックします虫メガネアイコンを構造式の編集 : 自動的に名称から構造式が生成されますここでは mevastatin の骨格を含むものを検索したいので作画ソフトで編集を行います検索オプションを設定し編集後 Transfer query ボタンをクリックすると Reaxys の検索画面に転記されます Find ボタンをクリックして検索を行います *Marvin JS 操作方法の詳細については別添のテクニック集をご参照ください 45 検索結果の表示 Reaxysがqueryから判断した検索結果を表示しますここではメバスタチン (mevastatin) とその類縁体の物質物性値を探そうとしているので Substanceの View Results ボタンをクリックしますこの場合化合物の検索結果と反応の検索結果が表示されている <Preview Results> Preview Results を展開すると top 3 の結果が表示される 46

検索結果画面 1 メバスタチン (Mevastatin) とその類縁体の物質物性値の検索結果がレコードごとに表示されます - 検索結果は表形式で表示される - 構造式化学名収録されているデータ項目などの他各化合物の合成法誘導体の合成方法もワンクリックでチェック可能

6 3 4 5 7 - 各種化合物情報書誌情報での絞り込みが可能 3 表示サイズ切替え 4 検索結果ソート機能 - 参考文献数フラグメント数分子量分子式発行年商業的入手可能性 5 Database 変更機能 6 各化合物の合成法物性値などの情報へのリンク 7

24 検索結果画面 1 メバスタチン (Mevastatin) とその類縁体の物質物性値の検索結果がレコードごとに表示されます - 検索結果は表形式で表示される - 構造式化学名収録されているデータ項目などの他各化合物の合成法誘導体の合成方法もワンクリックでチェック可能 - ブレッドクラムと呼ばれる検索結果の絞込みなどの軌跡をナビゲーションする機能や各種フィールドを活用したフィルター機能も用意 - 検索結果からフルテキスト引用情報などにアクセス可能なリンクも付与されている検索結果画面 : 1 検索結果の軌跡をナビゲートフィルター機能各種化合物情報書誌情報での絞り込みが可能 3 表示サイズ切替え 4 検索結果ソート機能 - 参考文献数フラグメント数分子量分子式発行年商業的入手可能性 5 Database 変更機能 6 各化合物の合成法物性値などの情報へのリンク 7 Grid 表示への切り替え 47 検索結果画面フィルター機能 : 3 表示サイズの切り替え : 構造物質分類分子量フラグメント数入手可能性 supplier Dbへの登録有無反応物性等のデータ資料の種類 ( 文献特許 ) 発行年 *3 段階でサイズ変更が可能 48

25 検索結果画面 3 4 検索結果のソート機能 : 5 表示 Database 変更機能 : 降順昇順切替え参考文献数フラグメント数分子量分子式発行年商業的入手可能性 Reaxys 登録番号 * デフォルトでは Reaxys になっています 49 検索結果の閲覧 1 1 検索結果画面 : 1 件目のレコードを詳細表示させました 1 構造式化学名 3 収録されているデータ 4 この化合物が生成物となる反応 5 この化合物を含む反応 6 参照文献数ここでは Physical Data をクリックして物性値を確認しますさらに融点のデータを確認するために Melting Point をクリックします

検索結果の閲覧融点のデータ : 様々な論文特許から実測値が収録されています - 異なる情報源からの値を一覧で表示できるので比較検討が容易 Cited のリンクをクリックすると Scopus の被引用文献情報を閲覧することができます様々な論文特許から実測値を収録異なる情報源からの値を一覧で表示比較検討が容易

26 検索結果の閲覧融点のデータ : 様々な論文特許から実測値が収録されています - 異なる情報源からの値を一覧で表示できるので比較検討が容易 Cited のリンクをクリックすると Scopus の被引用文献情報を閲覧することができます様々な論文特許から実測値を収録異なる情報源からの値を一覧で表示比較検討が容易 51 検索結果の閲覧 3 NMR スペクトル情報 : Spectra のリンクからは NMR スペクトルなどのスペクトル情報を表示させることができます NMR スペクトルデータでは核種溶媒などの測定条件に加えてケミカルシフト値も収録されているため ( 特許由来レコードのみ ) 原著を参照することなく詳細情報を入手可能 5

27 検索結果の閲覧 4 をクリックすることで Synthesize のメニューを選択できます Manually もしくは Autoplan を選択し Synthesis Planner で逆合成的にルートを検討することができますまた Preparations Reactions] をクリックすることでこの物質を合成する反応この物質を含む反応もワンクリックで表示可能です 53 検索結果の Export / Save / Alert の利用

検索結果の Export1 検索結果を見やすい PDF 形式や XML Word Excel

エクスポートの設定画面 : 出力形式出力範囲出力内容オプションを選択し Export ボタンをクリックします

Export の進捗状況が表示されます - 準備が整うと Download リンクが表示されるので

28 検索結果の Export1 検索結果を見やすい PDF 形式や XML Word Excel などのファイル形式でエクスポートすることができます検索結果画面で Export をクリックしますエクスポートの設定画面 : 出力形式出力範囲出力内容オプションを選択し Export ボタンをクリックします検索結果から任意のレコードやフィールドを選択してエクスポートすることも可能 55 検索結果の Export Export の進捗状況が表示されます - 準備が整うと Download リンクが表示されるのでクリックしてローカルに保存する Download が終了したら Cancel をクリックします * 続けて別の結果を Export する場合 Cancel されていないと Export ができません 56

29 検索結果の Export3 エクスポート形式の設定詳細 : Choose a format: エクスポート先のファイル形式 - PDF/Print - XML - Microsoft Word - Microsoft Excel - Literature Management System - Electronic Lab Netbook - RD File Range: 出力する範囲を選択 - 上限は 5,000 データまで Export: 出力するデータの種類を選択 - All available data - Hit data only: フィルターなどで絞り込んだデータ Additional option: エクスポート対象に含める項目を選択 - Include structure - Include abstract - Include reaction - Include front page information - Include a description in the document 57 検索履歴の保存検索結果における任意のレコードを保存することができます - 保存したレコードは History 画面で閲覧することが可能 ( ログインして利用している場合セッション終了後も削除されない ) 画面最上部の History のタブを開きます保存したいレコードの列にマウスを近づけるとメニューが表示されます Save のアイコンをクリックします Result set の名前を入力し Save をクリックします * 名前は日本語でも入力することも可能 Saved タブをクリックすると保存データの管理画面が表示されます登録したデータが一覧表示されます 58

Alert 機能 Alertは検索条件を登録しておくとデータベースの更新タイミングに合わせて条件に一致した検索結果が自動的に配信されるサービスです - 同じ条件で反応や物質物性に関する情報をモニタリングしたい場合に便利です - Alert 結果は登録されたEmailアドレスに配信されます他の利用者にも同じAlert

各種オプションが表示されますので Alert をクリックします 59 Alert の設定管理 Alert の設定 : Alert name: Alert 名称 Send alerts to: 配信先メールアドレス ( 複数入力可 ) Frequency: 配信頻度 - After each update - Monthly -

30 Alert 機能 Alertは検索条件を登録しておくとデータベースの更新タイミングに合わせて条件に一致した検索結果が自動的に配信されるサービスです - 同じ条件で反応や物質物性に関する情報をモニタリングしたい場合に便利です - Alert 結果は登録されたアドレスに配信されます他の利用者にも同じAlert 結果を配信して共有することもできます *Alertのご利用にはログインが必要となります( ログイン方法については別紙参照ください ) Alert の設定 : 1 Alert を設定したい検索を実行したのちに History を開きます History 画面で Alert を設定したい検索履歴を選択します検索履歴にマウスオーバーすると各種オプションが表示されますので Alert をクリックします 59 Alert の設定管理 Alert の設定 : Alert name: Alert 名称 Send alerts to: 配信先メールアドレス ( 複数入力可 ) Frequency: 配信頻度 - After each update - Monthly - Deactivate From databases: 情報源のデータベースを選択上記を設定し Create Alert をクリックします Alert の管理 : 画面右上部のをクリックするとAlertの管理画面が表示されます登録しているAlertが一覧で確認できます Alert 名をマウスオーバーすると Edit Deleteの機能が選択可能になります 60

31 Quick Search: テキストサーチテキストサーチ 1 Reaxys では構造式だけではなくテキストサーチでも反応物性や文献を検索できます検索例 : キシリトールの融点情報を調べる 1 Quick Search で Search Reaxys に melting point of xylitol と入力し Find で検索検索したいのは融点情報なので Substance の View Results をクリックし検索結果を表示する Hit Data として Melting Point が表示される 6

テキストサーチ検索例 : 安息香酸 (Benzenic acid) エステル化の検索 1 Quick Search で Search Reaxys に esterification of benzoic acid と入力し Find で検索検索したい対象によって Reaction または Documents の View Results を選択 * 今回の検索では Document

32 テキストサーチ検索例 : 安息香酸 (Benzenic acid) エステル化の検索 1 Quick Search で Search Reaxys に esterification of benzoic acid と入力し Find で検索検索したい対象によって Reaction または Documents の View Results を選択 * 今回の検索では Document の検索結果は下記に分類されている Title, Abstracts, Keywords がそれぞれ 1 esterification, benzoic acid esterification 3 benzoic acid 63 テキストサーチ 3 検索例 :HPLC で分析した結果をもつ化合物を検索 1 Quick Search で Search Reaxys に hplc glutamine と入力し Find で検索今回は化合物を探しているので Substances の View Results で検索結果を表示 Glutamine と hplc の掛け合わせの結果だけではなく property hplc のみも提示 64

Query Builder Query Builder1 構造式物性値などの掛け合わせ検索に対応できます複雑な掛け合わせの検索にもドラッグ & ドロップで対応できます 3 1 1

33 Query Builder Query Builder1 構造式物性値などの掛け合わせ検索に対応できます複雑な掛け合わせの検索にもドラッグ & ドロップで対応できます検索フィールド検索条件 ( 構造分子構成 CAS registry number Document Basic Index) 3 検索条件 ( キーワード数値が入力可能 ) 66

34 Query Builder Query Builderには検索用項目が用意されています Find search fields and forms にキーワードを入力することで探すこともできます Physical Data や Natural Product などのプリセットのフォームも用意検索履歴との掛け合わせも可能 67 Query Builder: 検索事例 1 条件の掛け合わせ ( 天然物抗菌活性分子式 ) ノイズの除去 3 条件の掛け合わせ ( 用途 )

の化合物を検索したいので is を選択しますその他の構造は未知なので C30* と入力します 69 Query Builder での検索 1- * キーワードで項目を探すことも可能 3 4 Isolation from

35 Query Builder での検索 1-1 条件の掛け合わせ : 天然物から抽出された化合物で実験結果から炭素が 30 の化合物であることがわかっているこの化合物が抗菌活性を測定されたことがあるかを検索 1 Molecular Formula をクリックして検索ボックスを呼び出します ( または検索条件リストから Molecular Formula を選択しクリックします ) Molecular Formula が炭素 30 の化合物を検索したいので is を選択しますその他の構造は未知なので C30* と入力します 69 Query Builder での検索 1- * キーワードで項目を探すことも可能 3 4 Isolation from Natural Product の項目を検索します Natural と入力すると Isolation from Natural Product の項目が表示されます項目をクリックすると検索フィールドに追加され先にあったボックスとの間に演算子が表示されます 70

Query Builder での検索 1-3 5 6 7 Basic Indexesから Substance Basic Index をクリックし検索フィールドに表示します

化合物文献の中から該当するものを選択し SearchをクリックしますここではSubstance を選択します 71 Query Builder での検索 1-4 検索結果画面 :

36 Query Builder での検索 Basic Indexesから Substance Basic Index をクリックし検索フィールドに表示します *Basic Index: 検索結果の画面内をキーワード検索する機能 ( 検索対象ではないフィールドでも検索が可能 ) antimicrobi* ( 抗菌活性 ) と入力します反応化合物文献の中から該当するものを選択し SearchをクリックしますここではSubstance を選択します 71 Query Builder での検索 1-4 検索結果画面 : 構造式化学名収録されているデータ項目などの他に合成方法誘導体の合成方法も確認できます検索結果の絞り込みの軌跡をナビゲーションする機能や各種フィールドを活用したフィルター機能もついています 7

Query Builder での検索 -1 検索結果からノイズを除去する検索方法 : イソキノリンの骨格を作る反応を検索するただし出発物質に既に目的骨格が含まれている反応 ( ノイズ ) を除去したい 1 * ノイズに相当する検索を行い Query Builder を利用して全体の検索結果から除くことができます Quick search で以下の検索を行います 1

37 Query Builder での検索 -1 検索結果からノイズを除去する検索方法 : イソキノリンの骨格を作る反応を検索するただし出発物質に既に目的骨格が含まれている反応 ( ノイズ ) を除去したい 1 * ノイズに相当する検索を行い Query Builder を利用して全体の検索結果から除くことができます Quick search で以下の検索を行います 1 イソキノリン骨格を作る反応を検索イソキノリン骨格を出発物質とする反応を検索 *Searchメニューでは As substructureを選択反応の検索結果が得られるので View Result で結果を閲覧します 73 Query Builder での検索 - つの検索を実施後 Query Builder のタブを開き History を選択します History タブで表示されていた二つの検索結果の履歴が Query Builder タブでも表示されます 1イソキノリン骨格を作る反応を検索した履歴ですイソキノリン骨格を出発物質とする反応を検索した履歴です 1 * イソキノリンの骨格を作る反応を検索したいと思っていますがイソキノリン骨格を持つものを出発物質とする反応には単なる置換反応が多く含まれてしまいますノイズに共通項はないか探しその共通項の検索を行いもとの検索結果から差し引くことでノイズを除くことができます 74

Query Builder での検索 -3 1 3 4 イソキノリン骨格を作る反応を検索した履歴をクリックして検索フィールドに入れます同様にイソキノリン骨格を出発物質とする反応を検索した履歴を検索フィールドに入れます

イソキノリン骨格を持つものを生成する反応結果が得られます History を用いず Query Builder 上で反応式同士を演算する方法も考えられる結果例 75 Query Builder での検索 3 食物

38 Query Builder での検索イソキノリン骨格を作る反応を検索した履歴をクリックして検索フィールドに入れます同様にイソキノリン骨格を出発物質とする反応を検索した履歴を検索フィールドに入れますイソキノリン骨格を作る反応を検索した結果からノイズであるイソキノリン骨格を出発物質とする反応を検索した結果を除きたいので NOT を選択します SearchでReactionを選択しますイソキノリン骨格をもたないものからイソキノリン骨格を持つものを生成する反応結果が得られます History を用いず Query Builder 上で反応式同士を演算する方法も考えられる結果例 75 Query Builder での検索 3 食物 (Food) とサプリメント (Supplement) を用途に含む化合物を探す Use を選択し条件を入力して Search Substances で検索をする用途として Food と Supplement の記載のある化合物がヒット 76

39 Appendix - 無機化合物の検索 - 化合物の表記方法 - 動作環境無機化合物の検索無機化合物の場合構造式ではなく Molecular Formula Field に分子式を入力して検索する方法を推奨しています Query builderで Molecular Formulaを選択し分子式を入力して検索を行います 78

40 化合物の表記方法 1 検索対象表記方法検索式例検索結果元素 Fe Fe 簡単な分子 HCl HCl 無機塩 NaCl NaCl 付加化合物配位化合物付加する分子を * でつなぐ CoCl*4NH3 Fe(C5H5) 固溶体混合する分子を # でつなぐ NaSO4#CsSO4 CaCO3#CaMg(CO3) Mixture Solid Solution すべての金属元素 M MX NaCl, KI, KBr ハロゲン X または (hal) 複数の原子団を許容例 ) (CH3)O (CH5)O 許容する原子団を (XX, YY) と列挙して表記 (ch3, ch5)o 周期表番号やグループ名で表記 (1b), (alk), (act) (1b)Cl (alk)cl AgCl, CuCl など KCl, LiCl, NaCl など遷移元素 (trm) 不特定の元素を含む物質?? で 1 種類???? で種類の元素を表記 Pb???? Pb 以外に種類の元素を含む化合物 PbSO4, Pb(NO3), PbTiO3 など 79 化合物の表記方法検索対象表記方法検索式例検索結果特定の元素を含む物質特定の元素のみで構成される物質 * で表 Tm* Tm, TmCl3 など? で表記 ( 数の制限はなし ) 電荷をもつ物質正電荷 : (?+) または (*+) 負電荷 : (?-) または (*-) ゼロ電荷でないもの (?) または (*) S? S, S, S8 など (?+)Na または (*+)Na 電荷をもたないもの (0+) (0+)Na Na 原子の数をレンジで指定 Na3+, Na+ など (x-y) FeCl(-3) FeCl, FeCl3, FeCl4 原子の数を指定 (x,y) FeCl(,4) FeCl, FeCl4 複数の元素についてそれぞれの原子数を指定 AxBy, x=,3 y=-4 FexOy x=,3 y=-4 FeO, FeO3, Fe3O, Fe3O4 など複数の元素についてそれぞれの原子数を指定 AnB1-n n=0-1 数式での表記 FenPd1-n n=0-1 FePd, Fe0.Pd0.8, Fe0.5Pd0.5 など Fe を含む合金ドープ物質など Fe# Fe# Fe と Ni を含む合金混合する元素を # でつなぐ Fe#Ni 80

41 化合物の表記方法 3 物質の種類検索式結果例多成分系 ZnO#TiO mixture (composition partially given): Titaium(IV) oxide zinc oxide PbSO4#PbO#SiO mixture (composition partially given): lead (II) oxide silica gel lead (II) sulfate 溶液 NaCl#HO mixture (composition partially given): water sodium chloride 水和物 CoCl,(HO)? cobaltous chloride hexahydrate cobalt(ii) chloride hexahydrate CoCl, 6HO ガラスセラミック物資 ( 10-15% の BO3 および 10-15% の AlO3 を含む Silica spheres) 合金 (96%Fe および 4%Cr を含む鉄合金 ) BO3(10-15W%)#AlO3(10-15W%)#SiO# Fe(96W%)#Cr(4W%) mixture (composition partially given): lithium oxide aluminum oxide diboron trioxide silica gel Titanium(IV) oxide mixture (composition partially given): iron chromium 81 動作環境 - ReaxysはJava-Free 環境でご利用いただけます - Windows Macintoshの以下のブラウザでご利用可能です Firefox (version 49 以上 ) Chrome (version 53 以上 ) Edge (version 14 以上 ) Safari (version 9) Internet Explorer (version 11) 8

42 お問い合わせ先 Reaxys のご利用に関するご質問はエルゼビアジャパン株式会社ヘルプデスクまでお問い合わせくださいお問い合わせフォーム : 電話番号 : Reaxys に関する情報は以下のサポートページ上に随時掲載されています 83

Microsoft Word - 第4章.doc

Microsoft Word - 第4章.doc 第 4 章反応検索 I. 検索条件の設定 Reaxys では全反応半反応のどちらも検索可能です構造式作画ソフトで出発物質や生成物を作画したり名称から自動的に構造式を作画させることもできます検索例 : エソメプラゾール (Esomeprazole) とその類縁体の合成法を探す 1. 反応検索画面です Generate structure from name のアイコンをクリックします反応検索では