2014.4 PubMed の 使 い 方 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?otool=ijputmlib (PubMed 東 大 ) 初 めての PubMed - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - p.2 PubMed のレコードについて - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - p.3 PubMed へのアクセス - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - p.4 Ⅰ. 基 本 の 検 索 1) 主 題 で 検 索 - - - - - - - - - - - - - - - p.5 2) 著 者 名 で 検 索 - - - - - - - - - - - - - p.6 3) 雑 誌 名 で 検 索 - - - - - - - - - - - - - p.6 4) 検 索 項 目 を 限 定 した 検 索 - - - - - - - - p.7 Ⅴ.フルテキストの 入 手 方 法 1) 電 子 ジャーナルでフルテキストを 入 手 する - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - p.14 2) 図 書 館 で 文 献 を 入 手 する - - - - - - - p.15 3) 文 献 を 取 り 寄 せる - - - - - - - - - - - - p.15 Ⅱ. 拡 張 機 能 を 用 いた 検 索 1)Filter 機 能 を 用 いた 検 索 - - - - - - - - p.7 2)Search Builder を 用 いた 検 索 - - - - - p.8 3)History 機 能 を 用 いた 検 索 - - - - - - - p.8 Ⅵ. 便 利 な 関 連 サービス 1)Journals in NCBI Databases - - - - - p.16 2)Single Citation Matcher - - - - - - p.16 3)Clinical Queries - - - - - - - - - - - - - - p.16 Ⅲ.MeSH 用 語 を 用 いた 検 索 1)MeSH とは - - - - - - - - - - - - - - - - - - p.9 2)MeSH 用 語 の 検 索 方 法 - - - - - - - - - p.9 Ⅳ. 検 索 結 果 画 面 1) 検 索 式 の 確 認 - - - - - - - - - - - - - - - - p.11 2) 検 索 結 果 レコード( 書 誌 情 報 )の 見 方 - - - - - - - - - - - - - - - - p.12 3) 表 示 形 式 件 数 並 び 順 の 変 更 - - - p.13 4) 保 存 メール 転 送 - - - - - - - - - - - - p.13 5) 印 刷 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - p.14 Ⅶ.My NCBI ~PubMed をカスタマイズして 使 う 1) 初 期 登 録 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - p.17 2)サインイン - - - - - - - - - - - - - - - - - p.17 3) 検 索 式 の 保 存 とメール 送 信 設 定 - - p.17 4) 検 索 レコードの 保 存 - - - - - - - - - - p.18 5) 確 認 各 種 変 更 - - - - - - - - - - - - - - p.18 6)サインアウト - - - - - - - - - - - - - - - p.18 マニュアル 参 考 書 - - - - - - - - - - - - - - p.18 医 学 図 書 館 PubMed マニュアル http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/manual/pubmedmanual.pdf
PubMed の 基 礎 知 識 PubMed(パブメド)とは? PubMed とは NLM( 米 国 国 立 医 学 図 書 館 :National Library of Medicine) 内 の NCBI( 国 立 生 物 科 学 情 報 センター:National Center for Biotechnology Information)が 作 成 しているデータベースで す データベース 統 合 検 索 システム Entrez(NCBI 作 成 )の 一 部 として 提 供 されており 世 界 の 主 要 医 学 系 雑 誌 等 に 掲 載 された 文 献 を 検 索 することができます MEDLINE とNon-MEDLINE(MEDLINE に 収 載 されないもの データ 整 備 前 のレコード 出 版 社 が 直 接 提 供 するレコード 等 )が データソースとなっています MEDLINE(メドライン)とは? PubMed の 主 な 構 成 要 素 となっている 医 学 文 献 のデータベースです 1965 年 以 前 の OLD MEDLINE と 1966 年 以 降 の MEDLINE に 分 かれています MEDLINE は PubMed 以 外 でも 様 々な プラットフォームから 利 用 できます 例 えば 東 京 大 学 附 属 図 書 館 で 導 入 している 有 料 データベース OVID SP EBSCO host からも 利 用 できます <2013.9 現 在 > 収 録 分 野 生 物 医 学 (biomedicine) ヘルス(health) ( 医 学 看 護 学 歯 学 獣 医 学 薬 学 健 康 科 学 介 護 なども 含 む) 収 録 誌 約 5,700 誌 37 言 語 (ただしデータの 90% 以 上 が 英 語 2010 年 時 点 ) 収 録 期 間 1946 年 ~ 現 在 データ 更 新 出 版 社 から 届 くデータは 随 時 索 引 作 業 済 データは 週 5 回 ( 火 ~ 土 曜 日 ) アクセス インターネットを 通 じて 世 界 中 から 利 用 できる 日 本 語 の 雑 誌 は 74 誌 が 継 続 的 に 収 録 されている ( 医 中 誌 Web は 収 録 中 止 タイトルも 含 めて 約 6,000 誌 ) 収 録 雑 誌 リスト List of Journals Indexed for MEDLINE 現 在 MEDLINE に 収 録 している 雑 誌 リスト MEDLINE /PubMed Resources Guide http://www.nlm.nih.gov/bsd/pmresources.html >JOURNALS >List of Journals Indexed for MEDLINE List of All Journals Included in PubMed http://www.nlm.nih.gov/bsd/serfile_addedinfo.html PubMed 収 録 誌 一 覧 MEDLINE OLDMEDLINE MEDLINE 収 録 外 の 各 タイトル 現 在 索 引 されていない タイトルを 含 む List of Serials Indexed for Online Users http://www.nlm.nih.gov/tsd/serials/lsiou.html PubMed MEDLINE をもっと 詳 しく 知 りたいときは MEDLINE /PubMed Resources Guide http://www.nlm.nih.gov/bsd/pmresources.html Factsheets http://www.nlm.nih.gov/pubs/factsheets/pubmed.html MEDLINE, PubMed, and PMC (PubMed Central): How are they different? http://www.nlm.nih.gov/pubs/factsheets/dif_med_pub.html IndexCat http://indexcat.nlm.nih.gov/ ( 古 い 医 学 系 文 献 を 検 索 する) MEDLINE の 前 身 である Index-Catalogue のオンライン 版 収 録 期 間 1880 年 から 1961 年 まで 収 録 対 象 モノグラフ 61 万 冊 学 位 論 文 47 万 件 などを 含 む - 2 -
PubMed のレコード PubMed Status (レコードの 状 態 ) PubMed で 検 索 できる 論 文 情 報 (レコード)は およそ 次 のような 順 番 で 状 態 が 変 化 していきます 順 番 状 態 レコードの 状 態 表 示 1 雑 誌 出 版 社 から 提 供 されたばかりのレコード [PubMed as supplied by publisher] 2 データ 整 備 作 業 中 のレコード 書 誌 事 項 の 確 認 [PubMed in process] 索 引 付 け(MeSH 用 語 の 付 与 ) 等 が 行 われる 3 MEDLINE データとして 登 録 されたレコード [PubMed indexed for MEDLINE] (データ 整 備 作 業 が 終 わったもの) 他 MEDLINE データとして 登 録 しないレコード [PubMed] PubMed に 提 供 されたレコードのうち MEDLINE データとして 扱 うことに 決 まったレコードは 2 の 作 業 に 進 みます この 時 点 で 専 門 スタッフが 論 文 情 報 に 索 引 付 け(キーワードの 付 与 )を 行 います MeSH と 呼 ばれるシソーラスに 基 づいて 文 献 の 主 題 を 表 すキーワード MeSH 用 語 が 付 与 されます MEDLINE レコード 以 外 には 索 引 付 けがなされません レコードの 構 造 PubMed に 集 められている 論 文 情 報 (レコード)は およそ 次 のようなデータ 構 造 になっています PubMed Unique Identifier ISSN 出 版 年 月 日 論 題 抄 録 第 一 著 者 の 住 所 等 著 者 名 言 語 出 版 タイプ 雑 誌 名 MeSH 用 語 ( 索 引 語 ) PMID- 20080893 STAT- MEDLINE IS - 1535-5667 (Electronic) IS - 1535-5667 (Linking) DP - 2009 Jan 15 TI - In Vivo Measurement of Vesicular Monoamine Transporter Type 2 Density in Parkinson Disease with 18F-AV-133. AB - PET provides a noninvasive means to evaluate the functional integrity of the presynaptic monoaminergic system in the living human brain.( 以 下 略 ). AD - Department of Nuclear Medicine and Centre for PET, Austin Health, Melbourne, Victoria, Australia; Mental Health Research Institute, University of Melbourne, Melbourne, Victoria, Australia. AU - Mulligan RS( 以 下 略 ) LA - eng PT - Journal Article DEP - 20090115 TA - J Nucl Med JT - Journal of nuclear medicine : official publication, Society of Nuclear Medicine SO - J Nucl Med. 2009 Jan 15. MH - Case-Control Studies MH - Cohort Studies MH - Dopamine/*metabolism <MEDLINE 形 式 の 画 面 表 示 例 : 一 部 抜 粋 内 容 を 加 工 したレコード> 先 頭 のアルファベットの 部 分 ( 黄 色 )が 情 報 の 項 目 を 表 すタグです 1つの 論 文 についての 情 報 が 項 目 ごとに 整 理 されて 登 録 されます データ 整 備 作 業 で 論 文 のキーワードとして MeSH 用 語 が 付 与 される MH - Parkinson Disease/*enzymology/*genetics/pathology - 3 -
PubMed へのアクセス インターネットに 接 続 するブラウザからアクセス: 東 大 専 用 URL があります http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?otool=ijputmlib 医 学 図 書 館 HP の PubMed へのリンクボタンをクリックしてご 利 用 ください 東 大 専 用 URL から 利 用 すると ( 東 京 大 学 学 術 論 文 リンク) が 表 示 され 電 子 ジャ ーナル 等 へのアクセスが 容 易 になります CSLS Search からアクセス( 東 京 大 学 生 命 科 学 構 造 化 センターによるサービス) http://www.csls.c.u-tokyo.ac.jp/ PubMed に 専 門 用 語 の 日 本 語 表 示 機 能,ブックマーク 機 能 などを 搭 載 した 高 機 能 検 索 システムです <PubMed の 画 面 構 成 > 個 人 向 けツール 検 索 ボックス 詳 細 検 索 へ 使 い 方 ツール より 多 くの 情 報 資 源 クイックマニュアル 論 文 の 入 手 方 法 FAQ チュートリアル( 自 己 学 習 ) 最 新 情 報 モバイル 用 PubMed 特 定 論 文 の 簡 単 検 索 複 数 の 論 文 の 書 誌 一 括 検 索 臨 床 医 学 領 域 における EBM 文 献 検 索 特 定 のトピックに 絞 った 検 索 MeSH データベース Journals データベース 臨 床 試 験 情 報 E-Utilities(インターフェイスを 利 用 せずデータを 取 り 込 む) リンクアウト - 4 -
Ⅰ. 基 本 の 検 索 検 索 ボックスに 思 いつく 用 語 ( 医 学 用 語 疾 患 名 薬 品 名 雑 誌 名 著 者 名 など)をキーワードとし て 入 力 し Search をクリックします 大 文 字 でも 小 文 字 でも 構 いません Automatic Term Mapping( 自 動 マッピング 機 能 )が 働 き 入 力 したキーワードを 自 動 的 に 索 引 語 である MeSH 用 語 や 雑 誌 名 などに 変 換 して 検 索 してくれます 候 補 語 表 示 機 能 (Auto Suggest) 検 索 ボックスに 入 力 された 語 から 類 推 し これまで 検 索 された 頻 度 の 高 い 用 語 が 例 示 されます 目 的 の 語 をクリッ クすると 検 索 が 実 行 されます ただし 候 補 語 から 適 切 な 検 索 結 果 を 得 られるとは 限 りません 論 理 演 算 子 (AND,NOT,OR)を 用 いた 検 索 もできます 大 文 字 で 入 力 括 弧 ( )も 利 用 可 論 理 演 算 子 基 本 の 確 認 #1 AND #2 論 理 積 #1 OR #2 論 理 和 #1 NOT #2 論 理 差 1) 主 題 で 検 索 入 力 形 asthma ips cells ips cells egg AND allergy nurs* 語 尾 変 化 に 600 パター ン 以 上 ある 場 合 は 警 告 が 表 示 されます 説 明 入 力 した 検 索 式 にフレーズがある 場 合 自 動 的 にフレーズとして 認 識 さ れます 語 によっては 認 識 されません (ダブルクォーテーション)で 囲 むと 必 ずフレーズ 検 索 を 行 います 語 が 指 定 した 順 序 で 出 現 するレコードを 検 索 します egg allergy とフレーズ 認 識 されるのを 回 避 する 場 合 は 論 理 演 算 子 (AND,OR,NOT: 大 文 字 )を 使 って 分 ける 指 示 を 明 確 にします *(アスタリスク)をキーワードの 後 ろにつけると 前 方 一 致 検 索 ができます nurse, nurses, nursing など 語 尾 変 化 を 意 識 しない 検 索 ができます ただし 自 動 マッピング 機 能 MeSH 下 位 語 を 含 んだ 検 索 (explode)は 行 われません parkinson therapy disease キーワードが 複 数 ある 場 合 スペースで 区 切 って 入 力 すると 自 動 的 に AND 検 索 になります parkinson disease AND (infant OR newborn) 論 理 演 算 子 と 括 弧 ( )を 用 いることで 複 雑 な 検 索 式 を 作 成 できます 通 常 の 処 理 は 左 から 右 に 行 われますが ( )を 用 いると 優 先 順 位 が 変 更 されます - 5 -
parkinson disease[mh] AND japanese[la] 検 索 項 目 を 限 定 するタグ[ ]を 利 用 した 検 索 もできます p.7 検 索 項 目 を 限 定 した 検 索 文 字 入 力 ~ 応 用 編 ギリシャ 文 字 は 読 みの 英 語 綴 りで 入 力 する α alpha β beta(2010 年 9 月 以 降 の 新 規 データ はそのままギリシャ 文 字 も 認 識 します) ウムラウト(ä) アクサンテーギュ(é)などのアクセント 記 号 は 省 略 し a,e と 入 力 する (ハイフン)の 代 わりにスペースを 入 力!? %$などの 記 号 は 省 略 する 分 子 式 は 次 のように H 2 O H2O 39 39 degrees C ローマ 数 字 は 小 文 字 で 入 力 Ⅰ ⅰ Ⅸ ⅸ 2) 著 者 名 で 検 索 ラストネーム( 姓 )とイニシャル( 名 ) (+ミドルネームのイニシャル)を 記 入 します 名 のイニシャル は 自 動 的 に 前 方 一 致 検 索 となります 著 者 名 入 力 形 説 明 清 水 孝 雄 shimizu t ラストネーム( 姓 )をフルで ファーストネーム( 名 )と Paul E. O'Brien O brien PE ミドルネームはイニシャルで 入 力 する 姓 と 名 の 間 にはスペース 名 とミドルネームは 続 けて 入 力 する Andrew J. Baker Baker A 姓 が Baker 名 前 の 頭 文 字 が A の 著 者 が 検 索 され Alissa C. Baker ます Baker AJ や Baker AC などミドルネームがあ る 場 合 も 含 む Alison Baker Baker A@ ミドルネームのある 著 者 は 検 索 されません Amanda Baker Baker A だけに 限 定 されます St. Clair M St clair M Smith AB 3d Smith AB 3rd Smith AB Ⅲ その 他 特 殊 な 著 者 名 の 入 力 Vaart JM van der Van der Vaart JM 2002 年 以 降 出 版 の 文 献 で 原 著 に 記 載 があれば フルネームで 検 索 ができます ラストネーム ファーストネームどちらが 先 でも 検 索 可 能 です 2000 年 以 降 は 全 著 者 が 収 録 されていますが それ 以 前 は 刊 行 年 によって 登 録 著 者 数 に 制 限 があります 3) 雑 誌 名 で 検 索 入 力 例 説 明 New England journal of medicine 正 式 誌 名 (of も 必 要 The は 抜 く) N Engl J Med 省 略 形 0028-4793 ISSN( 雑 誌 に 付 与 された 8 桁 の 国 際 標 準 番 号 ) 真 ん 中 の -(ハイフン) も 必 要 です cell [ta] 検 索 項 目 を 雑 誌 名 に 限 定 するタグ[ta]を 付 与 雑 誌 名 が 不 確 かな 場 合 は Journals in NCBI Databases で 確 認 ができます p.16-6 -
4) 検 索 項 目 を 限 定 した 検 索 特 定 の 項 目 を 対 象 に 検 索 したいときは 検 索 項 目 を 指 定 するタグをつけて 検 索 します 検 索 項 目 タグ 入 力 例 説 明 affiliation [ad] university of tokyo[ad] bunkyo-ku[ad] 原 著 に 示 されている 第 一 著 者 の 所 属 や 住 所 等 を 検 索 author [au] fish[au] 著 者 名 first author [1au] fish[1au] 第 一 著 者 に 限 定 して 検 索 journal title abbreviation [ta] science[ta] 雑 誌 名 略 誌 名 ISSN language [la] english[la] 文 献 が 記 述 された 言 語 Mesh Subject Headings [mh] asthma[mh] 索 引 語 (MeSH 用 語 ) p.9 Mesh Major Topic [majr] asthma[majr] 論 文 の 中 心 的 主 題 を 表 す 索 引 語 p.9 publication date [dp] 2007[dp] 文 献 が 発 表 された 日 付 publication type [pt] clinical trials[pt] 出 版 タイプ unique identifiers [uid] 19920236[uid] PubMed 文 献 番 号 ( 各 レコードに 付 与 ) < 主 な Publication Type( 出 版 タイプ)> Case Reports 症 例 報 告 Letter レター 論 文 Clinical Trial 臨 床 試 験 Meta-Analysis メタアナリシス Controlled Clinical Trial 比 較 臨 床 試 験 Practice Guideline 診 療 ガイドライン Guideline ガイドライン Randomized Controlled Trial ランダム 化 比 較 試 験 Journal Article 雑 誌 記 事 Review レビュー 論 文 Ⅱ. 拡 張 機 能 を 用 いた 検 索 1)Filter( 絞 り 込 み) 機 能 を 用 いた 検 索 ( 検 索 結 果 画 面 左 側 から 使 用 p.11 参 照 ) 条 件 を 追 加 した 検 索 ができます デフォルト 以 外 の 項 目 は Show additional filters で 表 示 させます 記 事 の 種 類 言 語 電 子 ジャーナル 無 料 電 子 ジャーナル 抄 録 がある 文 献 に 限 定 PubMed からのリンクがあるかどうか で 絞 り 込 みます 東 大 の 電 子 ジャー ナル 契 約 は 反 映 しません 参 加 者 が 付 与 した コメントの 有 無 性 別 雑 誌 分 野 や 記 事 のテーマ 収 載 誌 の 種 類 出 版 時 期 の 限 定 絞 り 込 みたい 項 目 にチェックを 入 れ Show をクリック 対 象 年 齢 ヒトまたは 動 物 プルダウンメニューで 検 索 項 目 を 指 定 - 7 -
Filter を 設 定 すると 解 除 するまで 全 ての 検 索 に 適 用 されます 検 索 結 果 画 面 左 もしくはヒット 件 数 下 の Clear all か 各 項 目 の Clear で 随 時 変 更 してください < 検 索 結 果 画 面 例 Filter が 設 定 されている 場 合 > 2)Search Builder を 用 いた 検 索 (Advanced Search 画 面 から 利 用 ) 検 索 項 目 を 選 び 検 索 語 の 一 部 を 入 力 して Show index list をクリックすると 候 補 語 が 表 示 さ れます 語 尾 の 変 化 用 語 があいまいなときの 補 助 ツールとしても 利 用 できます プルダウンメニュ ーから 希 望 する 検 索 項 目 (フィー ルド)を 選 びます /の 後 ろは 副 標 目 (Subheading)を 表 します 文 字 を 入 力 してクリックすると 候 補 語 が 表 示 されます 3)History 機 能 を 用 いた 検 索 (Advanced Search 画 面 から 利 用 ) それまでに 検 索 した 履 歴 ( 検 索 語 と 検 索 結 果 数 )を 見 ることができます この 履 歴 を 利 用 して 論 理 演 算 子 (AND, OR, NOT)を 用 いた 検 索 集 合 の 組 み 合 わせが 容 易 にできます 検 索 式 作 成 後 Search をクリックすると 検 索 結 果 ( 文 献 リスト)が 表 示 されますが Add to history をクリックすると 履 歴 欄 に 検 索 式 とヒットした 文 献 数 (Items found)が 表 示 されます 文 献 数 をクリックすると 検 索 結 果 が 表 示 されます ヒット 件 数 を 見 ながら 検 索 式 を 作 成 検 討 する 際 に 利 用 す ると 便 利 です Search をクリックすると 検 索 し Add to history をクリックすると 下 部 の 検 索 履 歴 に 追 加 されます <History 画 面 例 > 1 番 目 と2 番 目 と3 番 目 の 検 索 式 の 論 理 積 (AND) Add to history をクリックすると 履 歴 に 検 索 内 容 とヒット 文 献 数 (Results)が 表 示 されます 検 索 結 果 画 面 へは 移 行 しません 検 索 式 の 番 号 必 ず#をつけます クリックすると 論 理 演 算 子 (AND,OR,NOT)の 利 用 や Delete( 一 覧 から 式 を 削 除 する)などが 行 えます クリックすると 検 索 結 果 ( 文 献 リスト) が 表 示 されます - 8 -
MEDLINE Ⅲ.MeSH 用 語 を 用 いた 検 索 1)MeSH とは NLM( 米 国 国 立 医 学 図 書 館 )が 作 成 するシソーラス Medical Subject Headings( 医 学 主 題 見 出 し) の 略 称 です シソーラスとは 様 々な 医 学 用 語 を 統 一 して 上 位 語 下 位 語 を 整 理 した 統 制 語 辞 書 のこ とです MeSH は 主 題 による 階 層 構 造 になっており 下 位 に 行 くほど 用 語 がより 詳 細 になります また 医 療 や 医 学 専 門 用 語 の 変 化 に 対 応 させるために 定 期 的 に 更 新 されています MeSH の 階 層 構 造 < 例 :Skin Neoplasms> 上 位 語 より 広 い 意 味 のキーワード Neoplasms の 下 位 語 と して 展 開 された 階 層 下 位 語 より 狭 い 意 味 のキーワード 該 当 する 用 語 から 見 て この 例 のように 1 つの 用 語 が 複 数 の 階 層 ツリーに 存 在 する 場 合 もあります Skin and Connective Tissue Diseases の 下 位 語 として 展 開 された 階 層 階 層 構 造 MEDLINE に 収 録 されている 書 誌 情 報 (レコード)は 適 切 に 検 索 できるよう MeSH に 基 づいて 索 引 付 け 作 業 が 行 われています 索 引 付 け 作 業 では 論 文 の 主 題 を 表 す 検 索 語 (キーワード)として MeSH 用 語 ( 医 学 主 題 見 出 し 用 語 ) が 付 与 されます(1 文 献 につき 約 10~20 語 ) その 中 でも 中 心 的 主 題 を 表 すキーワードは Major Topic とよばれ 2~3 語 付 与 されます 癌 を 扱 った 論 文 Cancer Tumor Neoplasm 表 現 がバラバラ の 収 載 対 象 レ コー ド 論 文 内 容 を 表 す 言 葉 として MeSH 用 語 Neoplasms を 付 与 し キーワードを 統 一 レコードを 統 制 管 理 2)MeSH 用 語 の 検 索 方 法 MeSH 用 語 で 検 索 する 方 法 としては 下 記 の 3 つがあります 1 自 動 マッピング 機 能 を 利 用 する p.5 主 題 からの 検 索 2MeSH 用 語 に 限 定 して 検 索 する p.7 検 索 項 目 を 限 定 した 検 索 [mh] [majr] 3MeSH 用 語 を 選 んで 検 索 する (MeSH Database を 利 用 する) 次 頁 - 9 -
3MeSH 用 語 を 選 んで 検 索 する (MeSH Database を 利 用 する) プルダウンメニューから MeSH を 選 択 し 検 索 ボックスにキーワードを 入 力 Search をクリック キーワードから MeSH 候 補 語 が 導 き 出 されます 用 語 をクリックすると 詳 細 画 面 が 開 きます Link をクリックすると 各 データベースを 選 択 検 索 実 行 ができます <MeSH Database 画 面 > 簡 単 な 説 明 MeSH 用 語 として 新 設 された 年 用 語 をクリックすると 詳 細 画 面 へ 選 んだ 副 標 目 と 組 み 合 わせた 検 索 語 が 検 索 ボックスに 入 力 される 下 の Search PubMed で 検 索 実 行 MeSH 用 語 だけ 検 索 副 標 目 :Mesh 用 語 と 組 み 合 わせる 副 次 的 用 語 各 データベースへ リンクして 検 索 この 用 語 が Major topic( 論 文 の 中 心 的 主 題 )として 索 引 され た 文 献 だけを 検 索 MeSH Major Topic だけ 検 索 MeSH 用 語 が 論 文 の 中 心 的 主 題 とし て 索 引 されている 文 献 を 検 索 します この 用 語 の 下 位 語 を 含 めないで 検 索 NLM MeSH Browser MeSH 用 語 に 関 する 詳 細 情 報 が 参 照 できます 精 密 この 用 語 を 使 う 以 前 に 採 用 されていた 索 引 語 ( 古 い 文 献 を 検 索 する 場 合 注 意 ) な 検 索 を 行 う 際 は Annotation, Scope note 等 を 確 認 してください シソーラス( 上 位 語 下 位 語 の 表 示 ) 階 層 構 造 上 位 語 該 当 する 用 語 から 見 て 下 位 語 (この 場 合 下 位 語 はなし) - 10 -
Ⅳ. 検 索 結 果 画 面 検 索 結 果 のデフォルトは Summary 形 式 で PubMed 登 録 日 の 降 順 に 1 ページにつき 20 件 ずつ 表 示 されます これらは Display settings で 変 更 できます < 論 文 情 報 (レコード) Summary 形 式 > 書 誌 事 項 ( 論 題 著 者 名 雑 誌 名 発 行 年 巻 号 頁 ) PubMed ID ( 各 レコード 固 有 の 番 号 ) PubMed Status ( 各 レコードの 状 態 ) 関 連 文 献 リスト Full Text へのアクセスリンク 等 < 検 索 結 果 画 面 の 説 明 Summary 形 式 > > 検 索 結 果 にフィルターを かけることができます 表 示 形 式 件 数 並 び 順 の 変 更 保 存 メール 転 送 表 示 件 数 /ヒット 件 数 検 索 結 果 の レコ タイトルをクリックすると 詳 細 表 示 へ ー ド ( 論 文 情 報 ) 検 索 式 を 修 正 し Search をクリックすると 再 検 索 できます 検 索 式 の 確 認 1) 検 索 式 の 確 認 どのような 検 索 が 行 われたか 検 索 式 を 確 認 します ここで 式 を 修 正 し Search をクリックすると 再 検 索 することができます See more をクリックすると 検 索 式 の 詳 細 画 面 が 表 示 されます 検 索 式 を 修 正 し Search ボタンをクリックすると 再 検 索 できます 数 字 をクリックすると 検 索 結 果 画 面 へ 戻 ります URL ボタンをクリックすると 検 索 結 果 画 面 の URL に Query Translation の 式 が 追 加 されます この URL をブックマークしておけば ブックマークをクリック するだけで 再 検 索 が 簡 単 にできます 翻 訳 された 検 索 式 キーワードとして 入 力 された 語 - 11 -
< 検 索 式 の 詳 細 > "parkinson disease"[mesh Terms] 1 OR ("parkinson"[all Fields] AND "disease"[all Fields]) 2 OR "parkinson disease"[all Fields] 3 1 parkinson disease の MeSH 用 語 である "parkinson disease" を 索 引 語 として 含 む または 入 力 したキーワード キーワードから 翻 訳 された MeSH 用 語 2 " parkinson "と" disease "の 両 方 を 全 項 目 のどこかに 含 む または 3 "parkinson disease"という 語 を 全 項 目 のどこかに 含 む 今 回 は 入 力 したキーワードと MeSH 用 語 が 同 じ 異 なる 場 合 は 自 動 マッピング 機 能 によ り MeSH 用 語 に 翻 訳 されて 検 索 されます ただし 略 語 薬 品 名 を 検 索 する 際 はうまくい かないことがあるので 注 意 が 必 要 です 索 引 語 として MeSH 用 語 が 付 与 されているのは MEDLINE 登 録 レコードのみなので 1MeSH 用 語 の 検 索 を 行 っただけでは 検 索 漏 れが 出 てしまいます ( 新 しい 概 念 最 新 の 情 報 古 い 概 念 は 検 索 できません ) そのため23の 検 索 式 で 他 の 項 目 ( 論 題 や 抄 録 など)でこれらの 用 語 が 使 用 され ている 論 文 を 検 索 しています 2) 検 索 結 果 レコード( 書 誌 情 報 )の 見 方 <Summary 形 式 のレコード 一 覧 > 論 題 著 者 Print 版 未 掲 載 電 子 版 にフルテキストあり 関 連 論 文 へのリンク PubMed Unique Identifier ( 各 レコード 固 有 の 番 号 ) 1 PubMed Status(レコードの 状 態 ) 1 出 版 社 から 提 供 されたばかりのレコード [ ] で 囲 まれた 論 題 は 英 語 に 翻 訳 されたもの 本 文 の 言 語 は 英 語 以 外 言 語 ( 英 語 以 外 ) 収 載 誌 ( 略 誌 名 ). 出 版 年 月 ; 巻 ( 号 ): 掲 載 頁. フルテキスト 有 2 2 書 誌 事 項 のチェックや MeSH 用 語 を 付 与 するなど MEDLINE 登 録 作 業 中 のレコード 電 子 版 のページ Publication type (Review のみ 表 示 ) The Biochemical journal 略 誌 名 にカーソルを 合 わせると 正 式 名 称 が 見 られます 3 3MEDLINE 収 録 レコード 書 誌 事 項 のチェッ クと MeSH 用 語 の 付 与 が 済 んだもの *Limits( 絞 り 込 み)を 指 定 すると この 状 態 のレコード が 検 索 される - 12 -
3) 表 示 形 式 件 数 並 び 順 の 変 更 Display settings をクリックすると 表 示 設 定 画 面 が 出 ます Format 等 を 選 択 し Apply をクリックします 事 前 にレコード 番 号 脇 の にチェックを 入 れたレコードが 対 象 になります チェックを 入 れなかった 場 合 は 全 部 のレコードが 対 象 になります (text) :テキスト 形 式 の 表 示 印 刷 に 利 用 Abstract: 詳 細 表 示 ( 抄 録 MeSH など) 1 件 だけ 詳 細 表 示 にする 場 合 は 文 献 リストの 論 題 を クリックする MEDLINE: 全 項 目 のタグ 付 き 表 示 RefWorks 等 の 文 献 管 理 ソフトへの 取 り 込 みに 利 用 する PMID List:PubMed ID のみの 表 示 4) 保 存 メール 転 送 Send to をクリックすると 表 示 設 定 画 面 が 出 ます 希 望 するアクションを 選 択 します 事 前 にレコード 番 号 脇 の にチェックを 入 れたレコードが 対 象 になります チェックを 入 れなかった 場 合 は 全 部 のレコード が 対 象 になります ファイルのダウンロード メール 転 送 ( 最 大 200 件 ) データ 形 式 データ 形 式 ソートキー クリップボード ソートキー メールアト レス 件 名 メモ スパム 防 止 の 画 像 認 証 データの 一 時 保 存 最 大 500 件 8 時 間 まで Items をクリックすると Clipboard に 保 存 したレコードが 表 示 されます - 13 -
5) 印 刷 PubMed には 印 刷 機 能 がありません Display settings で Text 形 式 の 表 示 等 に 変 更 し ブラウザの 印 刷 メニューをご 利 用 ください 表 示 を 変 更 せずに 印 刷 すると 不 必 要 な 枠 画 像 が 印 刷 されますのでご 注 意 ください 事 前 にレコード 番 号 脇 の にチェックを 入 れてから 表 示 を 変 更 すると チェックしたデータのみが 変 更 した 形 式 で 表 示 されます チェックを 入 れなかった 場 合 は 1ページに 表 示 されたレコードが 対 象 になります 適 宜 表 示 件 数 を 増 やして 印 刷 してください Ⅴ.フルテキストの 入 手 方 法 1) 電 子 ジャーナルでフルテキストを 入 手 する PubMed の 検 索 結 果 からフルテキストを 入 手 できる 場 合 があります 東 大 専 用 URL からアクセスすると ( 東 京 大 学 学 術 論 文 リンク)が 表 示 されます 文 献 リストを 詳 細 表 示 にすると リンクアイコンが 表 れます <Display settings で Abstract 表 示 に 変 更 した 例 > 電 子 ジャーナルへのリンクアイコンが 表 示 されるのでクリックする 有 料 のものも 表 示 される 無 料 のものは Free, Open Access など の 表 示 がある 事 が 多 い 抄 録 外 部 のデータベースへリンク クリックすると 展 開 PDF と 書 いてある 場 所 を 探 してクリック 出 版 タイプ UTokyo Article Link へ 有 料 のものでも 東 大 で 契 約 している 場 合 は PDF までたどり 着 くことができます キーワード( 索 引 語 ) *は 論 文 の 中 心 的 主 題 を 表 すキ ーワード(MeSH Major Topic)であ ることを 示 しています 電 子 ジャーナルがあれば Full Text リンクと 同 様 電 子 ジャーナルのページに 直 接 ジャンプします 電 子 ジャーナルがない 場 合 は 他 の 情 報 源 や 文 献 複 写 取 寄 せ 申 込 画 面 へのリンクなどに 誘 導 するナビゲーション 画 面 が 表 示 されます 詳 細 は 次 のページをご 覧 ください - 14 -
UTokyo Article Link とは 文 献 データベースの 検 索 結 果 から 本 文 入 手 へのアクセスを 案 内 するサ ービスです 欲 しい 論 文 に 表 示 された ボタンをクリックすると Google Scholar で の 検 索 や 冊 子 の 所 蔵 検 索 図 書 館 への 文 献 取 寄 せ 申 込 画 面 などへのリンクが 表 示 されます <UTokyo Article Link 画 面 : 利 用 手 順 1~3> 目 的 の 論 文 の 情 報 デ ー タ ベー ス で 見 つ けた 1 ジャーナル のリンクをクリックして 目 的 の 論 文 を 電 子 ジャーナルで 入 手 する データベースの 検 索 結 果 から 直 接 電 子 ジャーナル のページに 飛 ばなくても ジャーナル のリンクか ら 目 的 の 論 文 にたどり 着 けることがあります 同 じ 論 文 が 複 数 のデータベースに 収 録 されている こともあります 電 子 ジャーナルを 提 供 する データベースへリンク 紙 の 雑 誌 の 所 蔵 を 調 べる のリンクから 東 京 大 学 OPAC を 検 索 し 図 書 館 で 入 手 する 3 他 キャンパスからコピーを 取 り 寄 せるには 学 内 の 取 寄 せ サービスを 使 う 他 大 学 から 取 り 寄 せるには 他 大 学 か ら 論 文 のコピーを 入 手 する のリンクから 申 込 画 面 に 進 む ( 要 利 用 申 請 ) 東 京 大 学 OPAC へリンク 2 OAIster や Google Scholar 経 由 で 本 文 が 入 手 できる 可 能 性 もある 電 子 ジャーナルがうまく 入 手 できない 不 具 合 が 生 じる 頁 が 抜 けて いるなどのお 問 い 合 わせは ASK サービスへ 担 当 する 図 書 館 職 員 が 回 答 いたします 2) 図 書 館 で 文 献 を 入 手 する 東 京 大 学 OPAC で 蔵 書 を 検 索 してください (または UTokyo Article Link 手 順 3の 一 番 上 のリンク) 3) 文 献 を 取 り 寄 せる 医 学 図 書 館 HP 医 学 部 病 院 の 方 > 文 献 図 書 を 取 り 寄 せる をご 覧 ください http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/medicine/ill.html - 15 -
Ⅵ. 便 利 な 関 連 サービス 1)~3)は PubMed トップ 画 面 の PubMed Tools ないし More Resources から 選 択 可 能 です または Advanced Search 画 面 の 一 番 上 More Resources から 選 択 2) 3) 1) 1) 2) 3) 1)NLM Catalog 検 索 語 を 入 力 雑 誌 名 を 知 りたいときに 利 用 します 正 式 誌 名 略 誌 名 などが 検 索 できます Pubmed トップ 画 面 の 下 方 More Resources から Journals in NCBI Databases をクリック 調 べたい 名 称 ISSN タイトルをクリックすると 詳 細 へ 等 を 入 力 し 検 索 します 検 索 語 からヒットした 雑 誌 リストが 表 示 されます 2)Single Citation Matcher 書 誌 情 報 を 確 認 したいときに 利 用 します 収 載 誌 名 著 者 名 タイトル 中 のキーワードなどを 検 索 キーとして 断 片 的 な 情 報 から 類 推 した 文 献 情 報 を 見 つけることができます 3)Clinical Queries 目 的 のテーマにぴったりの 文 献 を 短 時 間 に 数 件 ヒットさせたいときに 便 利 です 臨 床 医 学 の 文 献 検 索 を 想 定 した 検 索 機 能 です 疾 患 についての 病 因 や 予 後 診 断 治 療 について 簡 単 に 検 索 できます 一 つのキーワードに 対 して 3 種 類 の 検 索 フィルターをかけて 一 括 して 検 索 できます 病 因 診 断 治 療 予 後 臨 床 予 測 指 針 プルダウンメニュー で 研 究 カテゴリーと 検 索 範 囲 を 設 定 広 く 洩 れなく 狭 く 正 確 に システマティックレビュー( 同 一 のテーマに 関 する 複 数 のラン ダム 化 比 較 試 験 などを 統 計 的 に 処 理 して 総 合 評 価 した 結 果 をまとめた 論 文 )を 検 索 - 16 - 遺 伝 学 関 係 の 文 献 を 検 索 選 択 すると そのカテ ゴリーに 最 適 な 遺 伝 学 関 係 のキーワードが 自 動 的 に 追 加 される
Ⅶ.My NCBI ~PubMed をカスタマイズして 使 う NCBI で 提 供 しているデータベース 各 種 (そのうちの 一 つが PubMed)を ユーザーの 使 用 方 法 に 合 わせてカスタマイズできるツールです < 主 な 機 能 > 1 検 索 結 果 検 索 式 の 保 存 2 保 存 した 検 索 式 の 検 索 結 果 を 定 期 的 にメールで 受 け 取 る 3PubMed の 各 種 設 定 の 変 更 <Filter 検 索 結 果 の 初 期 画 面 > 4 検 索 結 果 の 長 期 保 存 公 開 1) 初 期 登 録 画 面 右 上 にある Sign in to NCBI をクリック Sign in の 画 面 に 移 ります Google 等 のアカウントを 持 っ ていれば MyNCBI で 使 用 す ることもできます アカウントを 登 録 します アカウント 登 録 後 設 定 したメールアドレスに 確 認 メールが 届 き ます メールに 表 示 された URL をクリックすると 登 録 完 了 です 2)サインイン 画 面 右 上 にある Sign in をクリック 登 録 したユーザー 名 パスワードでログインすると 右 上 の 表 示 に 登 録 名 が 表 示 されます 登 録 名 3) 検 索 式 の 保 存 とメール 送 信 設 定 検 索 式 を 保 存 します 検 索 した 結 果 を 定 期 的 にメールで 受 け 取 ることができます 検 索 式 に 名 称 をつけます 頻 度 形 式 メール 送 信 時 のテキストの 追 加 - 17 -
4) 検 索 レコードの 保 存 恒 常 的 に 保 存 したいレコードにチェックをつけます Send to メニューから Collections を 選 択 し 保 存 します いずれかを 選 択 5) 確 認 各 種 変 更 保 存 したデータの 確 認 各 種 設 定 変 更 は My NCBI Home から 行 うことができます 6)サインアウト 右 上 Sign Out をクリックして 終 了 します フィルターの 項 目 も 各 自 で 変 更 できます クリックして 確 認 変 更 <マニュアル 参 考 文 献 > PubMed Quick Start Guide (PubMed のトップページより) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?otool=ijputmlib 東 邦 大 学 医 学 メディアセンター PubMed の 使 い 方 (2008/9/4) http://www.mnc.toho-u.ac.jp/mmc/pubmed/index.htm 慶 応 義 塾 大 学 信 濃 町 メディアセンター PubMed@KEIO : 基 本 から 上 級 テクニックまで (2014/4/1) http://www.med.lib.keio.ac.jp/pdf/ug/ug_pubmed.pdf 図 解 PubMed の 使 い 方 : インターネットで 医 学 文 献 を 探 す / 岩 下 愛, 山 下 ユミ 共 著 改 訂 第 6 版 2013.11 ISBN 9784931222199 医 図 請 求 記 号 W:26.5:ZU 登 録 番 号 4311325544 超! 文 献 管 理 ソリューション : PubMed/ 医 中 誌 検 索 からクラウド 活 用 まで / 讃 岐 美 智 義 著 2011.6 ISBN 9784780908435 医 図 請 求 記 号 W:26.5:CH 登 録 番 号 4311301503 阿 部 信 一.MEDLINE/PubMed の 索 引 と 検 索. 情 報 の 科 学 と 技 術 2008, vol. 4, p. 172-177. 阿 部 信 一. 知 っておきたい MeSH での 検 索 法. EBM ジャーナル 2004, vol. 5, No.3, p. 100-105. 名 郷 直 樹.MEDLINE と PubMed. EBM ジャーナル 2004, vol. 5, No.1, p. 98-99. - 18 -