ソフトウェアの概要 322 ゲル画像解析ソフトウェア 323 ゲル画像解析
ソフトウェアの概要 ソフトウェアの概要 See Also 画像解析装置 : P.306-319 Bio-Plex Manager software: P.342 マイクロプレートマネージャー : P.380 バイオ ラッドは画像撮影 画像解析 データ管理など実験室における様々なニーズに応えるためのソフトウェアを提供しています いくつかの画像解析用ソフトウェアは 最適な画像を取得するための撮影機能も兼ね備えています 画面に現れるウィザードや クイックガイドを利用することで誰でも簡単迅速に表示を最適化し 画像を印刷することができます これらのソフトウェアはWindows/MacOSの両方に対応しており ツールバーやプルダウンメニューなど使いやすいグラフィカルなインターフェイスを持っています (FPQuestはWindows 版のみの対応です ) Image Lab ソフトウェアを使用したデータ解析 / レポート表示 ソフトウェアアプリケーションガイド Image Lab P.323 Gel Analysis Quantity One P.325 PDQuest P.326 画像検出 ー 自動解析 1 次元電気泳動ゲル解析 ー コロニーカウンティングー ー ドット / スロット ブロット解析 ー 2 次元電気泳動ゲル解析 ー ー ゲルの切出し (EXQuest 使用 ) ー 1 次元電気泳動のゲル クラスター分析 / 系統樹ツール ー ー ー データ統合 ー ー ー 米国 FDA 21 CFR Part 11 対応ツールー コントロール可能な機種 GelDoc EZ ー ー GelDoc XR Plus * ー ChemiDoc XRS Plus * ー ChemiDoc MP ー ー PharosFX / PMI ー GS-800 ー ー EXQuest ー * オプション 解析のみ対応可能 322 ゲル画像解析 www.bio-rad.com
ゲル画像解析ソフトウェア バイオ ラッドはゲル電気泳動やブロッティング 関連アプリケーションから画像を取得し 解析するためのソフトウェアを提供しています Quantity One ソフトウェアはバイオ ラッド社製のすべての画像解析装置を制御し 画像撮影を行うことができます また基本的な 1 次元電気泳動ゲルの解析 コロニーカウンティング アレイ解析の機能も搭載されています PDQuest ソフトウェアは2 次元電気泳動の画像解析をハイスループットで行えるソフトウェアです Quantity OneとPDQuestは全自動スポット切り出し装置 EXQuestを制御することもできます Image Lab ソフトウェアはボタン一つで自動的に画像を撮影し 解析までを行うことができる最新の1 次元電気泳動ゲル解析ソフトウェアです 革新的な機能を搭載しており 専用アルゴリズムを利用して高い再現性と正確性を持った画像データを簡単に取得することができます Image Lab ソフトウェア Image Labソフトウェアは電気泳動ゲルやブロッティングメンブレンから画像データを取得し 自動解析することができます このソフトはGelDoc EZゲルイメージャー GelDoc XR Plus ChemiDoc XRS Plus ChemiDoc MPの4つのシステムを制御することができます 各装置の中にサンプルを設置した後は 簡単な操作のみで撮影条件が自動的に最適化された画像が得られます あらかじめ設定しておけば 撮影と同時にバンドを検出 分子量を解析し レポートの作成までを全自動で実行できます Image Labには詳細なチュートリアルがインストールされているため 撮影経験がなくても必要最小限のトレーニングで撮影と解析を行うことができます Image Lab ソフトウェアを使用した簡単なプロトコールセットアップ すべての操作が自動化対応 マウスをワンクリックするだけで 画像撮影から各種解析 レポート表示までを自動的に行うことができます 撮影条件を保存しておけば いつでも条件を呼びだして同じ条件で撮影することが可能です 画像撮影や解析のステップを自動化することで 結果を得るまでの時間を節約します 個人差が出にくく 高い再現性が得られます 撮影条件の最適化 各種検出手法に最適な撮影条件があらかじめプリセットされており プルダウンメニューから手法を選択するだけで設定が完了します 撮影範囲を指定するだけで自動的に焦点が合う特別なアルゴリズムを搭載 ピント調整は不要です 撮影範囲を指定するだけで 自動的に焦点が合う革新的なアルゴリズムを採用 フラットフィールディング機能により 光源の影響やレンズのゆがみを補正します www.bio-rad.com ゲル画像解析 323
データ解析 画像解析のすべてのステップを自動化することができます バンド検出やバックグラウンド補正レベルを再調整したい時にはマニュアル操作にて解析を行うことも可能です マニュアル操作でパラメータを調整すると 画像上にすぐに変更が反映されます 分子量または塩基対の計算 サンプルの純度計算 各バンドの濃度定量などの解析結果を画面上に表示することができます 解析結果の表示と表示内容の選択 ゲルの解析を実行したり 解析パラメータの変更を行ったりすると バンドとレーンの情報 画像情報などがレポート形式で表示されます 得られた解析データはPDFファイルやExcelファイルなど複数 の形式で保存可能です 画像の表示形式変更や 表示する項目の設定 テキスト情報付加などを行う便利なツールが搭載されており 論文やプレゼンテーション用のデータを簡単に作成することができます データ解析 / レポート 解析ソフトウェアに必要なシステム条件 Component Minimum Recommended Operating system Windows XP SP3 Windows 7 Mac OSX 10.6 Windows XP SP3 Professional Windows 32-bit Vista SP2 Ultimate Windows 7 Professional Mac OSX 10.6 Processor Pentium 4 or equivalent (Windows), 2.0 GHz Core 2 Duo, 2.0 GHz or higher Hard disk space 20GB >100GB Memory (RAM) 1,024MB >1,024MB Ports for connecting instrument 1 USB 2.0 port 1 USB 2.0 port Other software (optional) Microsoft Excel 2000 or later (Windows) Office 2008 or iwork software (Mac) Microsoft Excel 2000 or later (Windows) Office 2008 or iwork software (Mac) *2010 年 1 月現在の仕様です See Also イメージング機器 : P.306-319 EXQuestスポットカッター : P.319 電気泳動システム : P.209 324 ゲル画像解析 www.bio-rad.com
Quantity One 1-D 解析ソフトウェア Quantity Oneはバイオ ラッドのイメージング装置のコントロール 画像の取り込みから 画像の最適化 ゲルイメージの解析を行うことができるソフトウェアです Quick Guideというガイドに従って解析すれば 定量解析 分子量解析 コロニーカウンティングなどを誰でも簡単に行うことができます さらにバイオ ラッドの自動スポット切り出し装置 EXQuestをコントロールすることが可能で 解析データをそのまま利用して興味のあるバンドだけを素早く切り出すことができます 主な機能 バイオ ラッドのすべてのイメージング装置の制御撮影から解析まで1つのソフトウェアで実行可能です 異なる画像を最大 3 枚まで色を変えて重ね合わせ表示可能 定量解析 PAGEやウェスタンブロットのバンドを指定し定量化することができます 分子量解析レーンとバンドを自動認識し 分子量やRf 値を計算することができます コロニーカウントコロニーの自動検出を行い White/Blueなどの色調を識別して個別にカウントできます ファイル形式の変換解析した結果はテキストファイルとして 画像はTIFFやJPEG 形式で出力できます またTIFF 形式のファイルであれば読み込んで解析することができます イメージの合成化学発光バンドと可視スタンダードのように撮影条件の違う画像を1つのイメージ上の重ね合わせた合成イメージを作成できます コロニーカウンティング マクロアレイ解析各種ウェル数に対応したマクロアレイの定量解析ができます セキュリティ対応 ( オプション /Windows 版限定 ) CFR Part11に対応可能 詳しい情報は Bulletin 3002 をご参照ください 解析ソフトウェアに必要なシステム条件 PC Macintosh Operating system Windows XP, Vista Mac OS X 10.5 Processor/model Pentium 4 Intel Mac RAM 512MB 512MB Hard disk space 30GB 30GB Monitor 17", 1,024 768 resolution (absolutely required), true color 17", 1,024 768 resolution (absolutely required), millions of colors USB port Required for the hardware security key Required for the hardware security key アレイ解析 *2010 年 1 月現在の仕様です Ordering Information カタログ番号 品名 価格 ー Quantity Oneソフトウェア 170-9615 Quantity One CFRセキュリティーモジュール 500,000 マークはお問い合わせください www.bio-rad.com ゲル画像解析 325
See Also イメージング機器 : P.306-319 EXQuestスポットカッター : P.319 PDQuest 2-D 解析ソフトウェア, Version 8.0 PDQuestは2 次元電気泳動ゲルイメージを複数枚同時に解析するためのソフトウェアです 2 次元電気泳動ゲルイメージの解析とデータ管理を快適に行うための機能が搭載されています 精巧に設計された解析ツールは ゲル間の微妙な差異も検出することが可能で 例えばヒートショック 培養条件検討 刺激応答 経時変化などを研究するのにとても有効です 画面に表示されるウィザードをクリックしていくだけで スポットの検出から発現量比較解析までを簡単に行うことができます スポット検出はGaussian Fitting( 正規分布近似 ) によって行われており 正確に発現量比較解析を行うことができます フレキシブルなライセンス解析を迅速に行うための機能をすべて盛り込んだAdvancedライセンスと 必要な機能だけに絞り込んだBasicの2 系統のライセンスをご用意いたしました Advancedではイメージワーピングを行うことによりBasicよりも高いオートマッチングレート ( 一致率 ) を得ることが可能なだけでなく ディファレンシャルを視覚的に認識することができます EXQuestのコントロールさらにバイオ ラッドの自動スポット切り出し装置をコントロールすることが可能で 解析データをそのまま利用して興味のあるスポットだけを素早く切り出すことができます またPDQuestは情報管理ツールの機能も充実しており スポットごとに様々な情報を表示したり ( アノテーション ) インターネット上のデータベースにリンクさせたりすることも可能です また PDQuest Version 6.X/7.X などの古いソフトウェアから AdvancedやBasicへのアップグレードも対応可能となっています 詳しくはお問い合わせください 実験ウィザード ( 上 ) とイメージワーピングを使ったマルチチャンネルビュー ( 下 ) 詳しい情報は Bulletin 3121 をご参照ください PDQuest AdvancedとBasicの機能一覧機能 Advanced Basic 最大解析枚数 無制限 15 枚 解析ウィザード 解析プロトコールの繰り返し利用 ー 自動スポット検出 オートマッチング 3step 2step イメージワーピング ー マルチフルオレッセンスゲル (DIGE) の解析 ー スポット切り出し装置のコントロール Ordering Information カタログ番号 品名 価格 170-9630JA PDQuest Advancedソフトウェア 1,800,000 170-9645 PDQuest CFRセキュリティーモジュール 950,000 170-9620JA PDQuest Basicソフトウェア 980,000 170-9660JA PDQuestアップグレード 7.X to 8.0 Basic 350,000 170-9670JA PDQuestアップグレード 7.X to 8.0 Advanced 1,000,000 解析に必要なコンピューターの仕様等はお問い合わせください 326 ゲル画像解析 www.bio-rad.com