ソフト活用事例③自動Rawデータ管理システム

Size: px

Start display at page:

Download "ソフト活用事例③自動Rawデータ管理システム"

ただきよすわ
5 years ago
Views:

1 ソフト活用事例 3 自動 Raw データ管理システム ACD/Labs NMR 無料講習会 & セミナー 2014 於 ) 東京 / 大阪富士通株式会社テクニカルコンピューティングソリューション事業本部 HPC アプリケーション統括部

2 ACD/Spectrus をご選択頂いた理由 (NMR 領域 ) パワフルな解析機能ベンダーニュートラルな解析環境直感的なインターフェース高精度なスペクトル予測による解析支援自社データベース構築構造式スペクトルで検索可能解析結果とともに蓄積再解析可能なデータ業務効率化自動処理による解析スピード削減過去の解析データを活用する事による解析スピード向上 2

3 Spectrus で業務効率化って何が出来るの? NMR 領域での作業フロー NMR 測定測定データの整理蓄積測定データの解析解析データの整理管理 3

4 Spectrus で業務効率化って何が出来るの? NMR 作業フローにおける効率化ポイント波形処理作業の効率化業務効率化測定作業の効率化解析作業の効率化 4

5 Spectrus で業務効率化って何が出来るの? 1) 装置設定に依存 2) 各自で管理 NMR 領域での作業フロー実体基本的な波形処理は自動化 ( 装置機能 ) 解析は手動で NMR 測定測定データの整理蓄積測定データの解析解析データの整理管理 1) 報告書作成 2) 個人管理 5

6 Spectrus で業務効率化って何が出来るの? 1) 装置設定に依存 2) 各自で管理負荷小 NMR 領域での作業フロー実体基本的な波形処理は自動化 ( 装置機能 ) 解析は手動で負荷大 NMR 測定測定データの整理蓄積測定データの解析負荷大解析データの整理管理 1) 報告書作成 2) 個人管理 6

7 Spectrus が支援出来るところは? 1) 装置設定に依存 2) 各自で管理 NMR 領域での作業フロー実体基本的な波形処理は自動化 ( 装置機能 ) 解析は手動で負荷小負荷大 NMR 測定測定データの整理蓄積測定データの解析負荷大解析データの整理管理 1) 報告書作成 2) 個人管理 7

8 1) 装置設定に依存 2) 各自で管理 Spectrus が支援出来るところは? NMR 領域での作業フロー基本的な波形処理は自動化 ( 装置機能 ) 解析は手動で負荷小スペクトルデータベースによるデータの管理自動処理による解析作業の負荷大効率化 NMR 測定測定データの整理蓄積測定データの解析装置から独立した作業環境による装置の効率化負荷大解析データの整理管理現在のワークフローを部分的に支援する効率化 1) 報告書作成 2) 個人管理 8

9 2) もっとすばやくデータを取り出したい!! Spectrus が支援出来るところは? NMR 解析処理効率だけを効率化させた場合 NMR 測定測定データの整理蓄積 1) 解析データ作成の生産性が向測定データの解析上どうやってデータを整理するか? 誰がデータを整理するか? 3) もっとすばやくデータをしまいたい!! 解析データの整理管理 9

10 メリット業務効率化現状の作業を Spectrus を利用して断片的に効率化する改善ポイントがわかりやすく着手しやすい短期的な効果は上がるデメリット現在の作業のうち部分的に効率化されるため新たなボトルネックが発生する新たに発生するボトルネックに対する対策は? 10

11 ACD/Labs プロフェッショナルサービス ACD/Labs Spectrus 製品の機能を利用した様々なカスタマイズを実施実作業の効率化 ( 自動化 ) はもとよりファイル管理データベース構築ワークフロー管理まで適用可能 NMR 解析においてどのような適用が出来るか? 11

12 ACD/Labs プロフェッショナルサービス段階的適応できるプランが提示可能 Step1) 自動ファイル回収分析装置ディスクの監視 Raw データの回収パラメータに応じた振り分け Step2) 自動ファイル変換 ACD 形式への変換 ( スペクトルファイル / データベース ) Step3) さらに要望に応じて自動波形処理自動検索結果レポート作成自動検証作業 12

13 ACD/Labs プロフェッショナルサービス NMR 領域での作業フロー Step1) 自動ファイル回収 Step2) 自動ファイル変換 NMR 測定測定データの整理蓄積測定データの解析解析データの整理管理 13

14 1) 自動ファイル回収基本機能対象の測定データの作成されるディスクを監視処理対象のファイル / フォルダを検出し処理を実行ファイル位置ファイル名パラメータなどから処理内容を判別導入効果完全自動のファイル整理確実なファイル整理の実行ステップ 2( 自動ファイル変換 ) のための準備どこにどのくらいの量のどのような分析データがあるかを網羅的に調査可能分析データの保管ルールの整備 14

Normalized Intensity 0.80 0.75 0.70 0.65 0.60 0.55 0.50 0.45 0.40 0.35 0.30 0.25 0.20 0.15 0.10 0.05 0-0.05-0.10-0.15-0.20-0.25-0.30-0.35-0.40-0.45-0.50-0.55-0.60-0.65-0.70-0.75-0.80-0.85-0.90-0.95-1.

02 11 10 9 8 7 6 5 4 3 2 1 0-1 Chemical Shift (ppm) 2.0 2.5 1.03 1.03 1) 自動ファイル回収 : システム構成例 Step.1 RAW データファイルは測定後装置端末に生成保存 ACD/Automation Server は RAW データファイルの生成を監視しデータを自動で取得 Step.

15 Normalized Intensity CATECHIN Time (sec) Normalized Intensity CATECHIN.ESP Chemical Shift (ppm) ) 自動ファイル回収 : システム構成例 Step.1 RAW データファイルは測定後装置端末に生成保存 ACD/Automation Server は RAW データファイルの生成を監視しデータを自動で取得 Step.2 RAW データファイルが持つ情報 ( 測定者 ID 等 ) を自動で認識しあらかじめ指定されたルールに則りファイルサーバへ RAW データファイルのコピーを保存 Step.3 Spectrus Processor の Open File Panel のお気に入り登録から保存場所へダイレクトにアクセスし解析 NMR 測定装置 Step.2 ファイルサーバデータ処理用端末 Step.3 Step.1 ACD/Automation Server(Automated File Transfer) 15

16 1) 自動ファイル回収 : システム構成例サーバ要件自動処理用 Windows Server 2008 R2 マルチプロセッサ 2 コア以上 4GB 以上メモリ (4 コア以上は 6GB 以上 ) 動作用に HDD 50GB 以上の空き領域.net( 対象の分析装置に依存 ) ファイルサーバ用 Disk サイズ格納予定の Raw データのサイズを配慮高速ネットワーク導入費用例ソフトウェア費用 ( 分析装置 10 台まで ) 年間使用権 : 863,000 購入 : 2,157,000 構築支援作業ファイル回収ルールの設計構築 ( 対象のルールの種類条件判断の要因に依存 ) システム設置 ( ファイルサーバ各対象の分析装置 ) 1,000,000~ 16

17 2) 自動ファイル変換基本機能 ( 自動ファイル転送に加え ) ファイル形式を変換 ( よりファイルを探索展開するスピードを向上 ) データベース形式にすることで検索も可能導入効果 ( 自動ファイル転送に加え ) 素早い取り出し (1 ファイル化されているため ) 任意の情報で必要なデータが抽出可能な環境 (DB) 解析後のデータも意識せずに更新格納させる事も可能 17

18 Normalized Intensity CATECHIN Time (sec) Normalized Intensity CATECHIN.ESP Chemical Shift (ppm) ) 自動ファイル変換 : システム構成例 Step.1 RAW データファイルは測定後装置端末に生成保存 ACD/Automation Server は RAW データファイルの生成を監視しデータを自動で取得 Step.2 RAW データファイルが持つ情報 ( 測定者 ID 等 ) を自動で認識しあらかじめ指定されたルールに則りファイルサーバへ RAW データファイルのコピーを保存併せて Spectrus DB に格納 Step.3 Spectrus Processor から Spectrus DB へアクセスし任意の条件でスペクトルを開き解析 Step.4 解析終了後は esp ファイルを指定した場所へ保存 Step.5 Automation Server が解析済みファイルを検出し対応した DB レコードへ上書き格納 NMR 測定装置 Step.2 Step.3 ファイルサーバデータ処理用端末 Step.5 Step.1 ACD/Automation Server(Automated File Converter) Step.4 18

19 2) 自動ファイル変換 : システム構成例サーバ要件自動処理用 Windows Server 2008 R2 マルチプロセッサ 2 コア以上 4GB 以上メモリ (4 コア以上は 6GB 以上 ) 動作用に HDD 50GB 以上の空き領域.net( 対象の分析装置に依存 ) ファイルサーバ用 Disk 格納予定の Raw データのサイズデータベースのサイズを配慮高速ネットワーク導入費用例 ( 本構成で新規に導入する場合 ) ソフトウェア費用 ( 分析装置 10 台まで ) 年間使用権 : 1,725,000 購入 : 4,313,000 構築支援作業ファイル回収ルールの設計構築 ( 対象のルールの種類条件判断の要因に依存 ) データベースの設計構築 ( データベースを利用する場合 ) システム設置 ( ファイルサーバ各対象の分析装置 ) 1,500,000~ 19

20 2) 自動ファイル変換 : システム構成例その他留意事項同時利用 10 名以上の環境で DB を運用する場合は Enterprise 版のご利用を推奨します別途 Oracle Spectrus DB Enterprise などが必要になります 20

21 3) さらに要望に応じてスペクトルデータを使った様々な作業を行わせる究極のワークフロー支援システムとして利用可能です要望に応じて必要なシステム構成作業が異なります本日ご紹介した Fragment Base Drug Design システムや検証機能を利用した自動検証システム NMR 定量などの実績があります 21

22 3) さらに要望に応じて結果の出力測定データの自動回収外部データから情報の抽出 NMR スペクトルの自動解析 22

23 まとめスペクトルデータ活用の作業効率化は作業全体を見通した作業フローが望ましい ACD/Spectrus はスポット対応だけでなく全体を網羅する支援ツールが準備されている監視対象装置台数が 10 台まで拡張されたことにより閲覧環境整備とともに初期導入費用の負担が大きく軽減 23

24 ACD/Labs を最大限活用した作業環境を 24

Arcserve Backup r16 新機能テープブロックサイズの拡張効果実測 Arcserve Japan 1.5 版

Arcserve Backup r16 新機能テープブロックサイズの拡張効果実測 Arcserve Japan 1.5 版 Arcserve Backup r16 新機能テープブロックサイズの拡張効果実測 Arcserve Japan 1.5 版新機能テープブロックサイズの拡張とその効果実測 1. はじめに 2. バックアップを高速化! テープブロックサイズの拡張 3. 効果測定 4. 測定結果からの考察補足情報 : A) 検証環境 B) 設定方法 C) 考慮注意事項 D) 富士通株式会社とArcserve