英語論文を探す ~ PubMed ~ 例題 PubMed ips 細胞 ( 人工多能性幹細胞 ips cell) についての英語論文を探す 検索結果に UTokyo Article Link ボタンが出る (p. 5 参照 ) 学内から GACoS でデータベースの先頭文字 P から

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1 薬学研究のための文献検索 : 上級編 実習問題 & 解説 講習会の進め方 (60 分 ) テーマや著者名等から雑誌論文を探す - 英語論文 : PubMed 例題 Web of Science コアコレクション 例題 例題 文献を管理する (RefWorks 教材別紙 ) - 文献データの取込 - 文献リスト自動作成 自宅からデータベースや電子ジャーナルを利用する 配布資料 実習問題 & 解説 ( この資料 ) 文献リストをサクっと作成 ~RefWorks を使うには ~ Web of Science CORE COLLECTION クイック レファレンス ガイド レポート 論文支援ブック : ここから始めよう 自宅からデータベースや電子ジャーナルを使うには?( レポート 論文支援ブック 別冊 ) データベースの入口薬学図書館 GACoS( ガコス ) 学内 学外 OK 東京大学 OPAC 画面上部の データベース からもリンクしています GACoS( ガコス ) 東大で利用できるデータベースのリンク集 この資料に関するお問合せ : 東京大学本部情報基盤課 [ 学術情報リテラシー担当 ] TEL: ( 内線 :649) メール : literacy@lib.u-tokyo.ac.jp

2 英語論文を探す ~ PubMed ~ 例題 PubMed ips 細胞 ( 人工多能性幹細胞 ips cell) についての英語論文を探す 検索結果に UTokyo Article Link ボタンが出る (p. 5 参照 ) 学内から GACoS でデータベースの先頭文字 P から 東大専用入口 学外から 東大専用入口は SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス ( 要アカウント ) またはフリーアクセス 検索画面で検索語を入力 ( 必要に応じて 論理演算子 (AND/OR/NOT) を半角大文字で入力 ) Search ボタンをクリック 検索結果一覧が表示される (Display Settings で表示形式を Abstract などに変更可能 ) 4 必要に応じ Filters で絞り込み条件を設定 5 論文名をクリックすると詳細画面が開く 6 本文を見るには Full Text ボタンまたは UTokyo Article Link ボタンをクリック ips cell 精度の高いフレーズ検索の場合は ( ダブルクォーテーション ) が必要 ほとんどの場合は無くても自動的にフレーズ検索 ( 検索式の確認が必要 次ページ参照 ) 選択したデータの保存 メール送信など 表示形式の変更 File: データのダウンロード Citation manager: 文献管理ツールへ保存 Clipboard: 一時保存 ( ブラウザの印刷機能でまとめ印刷 ) メール送信 Filters( 絞り込み ) 全解除 4 レビュー論文 ( 総説 ) に絞り込み 過去 5 年間の論文に絞り込み ( 日付範囲指定も可能 ) Filters の項目画面表示を加除

3 5 6 データベース側で付与した MeSH 用語 ( シソーラス用語 ) 検索式の確認 検索結果一覧画面の Search details から 検索した後 どのような検索式が実行されたかを Search Details で確認 必要なら修正して再検索 入力した語だけでなく 対応するシソーラス用語でも自動的に検索 参考 : CABG( 冠動脈バイパス術 coronary artery bypass graft) と入力して検索した場合 MeSH=Medical Subject Headings 米国国立医学図書館作成のシソーラス ( 用語集 ) 入力した検索語 (cabg) だけで検索されている このように Mesh 用語を自動的に検索しない場合もあるので注意 MeSH Terms( シソーラス用語 ) MeSH に基づいて付与された 論文の内容を表すキーワード 自動マッピング機能により 適切なものがあれば 入力した検索語だけでなく 関連する MeSH Terms でも自動的に検索してくれる

4 シソーラス用語をマスターしよう 論文の内容を表すキーワード 専門スタッフがシソーラス ( 上位語 下位語を整理した用語集 ) に基づいて 統制されたキーワードを各論文に付与している これによって検索漏れを防ぐことや 探したい主題の論文に絞り込むことができる 例えば ガンに関する論文を探したい 悪性腫瘍? 癌? 肉腫? 癌腫? 思いついたことばだけで検索するとそのことばが論文のタイトルや抄録等に無ければ ヒットしない 検索モレが生じる 悪性腫瘍 肉腫 癌腫 ひとつの概念に対して表現が複数ある場合 表現を統一 シソーラス用語 ( 統制語 ) 上位語 : 腫瘍 ( 広義 ) ツリー構造 論文 癌 下位語 : 乳癌 ( 狭義 ) : 子宮癌 : 肺癌 : 皮膚癌 精度の高い検索ができる! データベース提供側で各論文にシソーラス用語を付与 検索モレの防止 多様な検索が可能に シソーラス用語癌 : 4

5 ( 補足 ) UTokyo Article Link の使い方 文献検索ツールを検索して 本文へのリンクが無い場合は UTokyo Article Link ボタンをクリックしてください UTokyo Article Link は その論文を 東京大学で利用できる電子ジャーナルや東京大学 OPAC で探してくれるサービスです 手順 UTokyo Article Link ボタンをクリック UTokyo Article Link 経由で本文が見られるサイトが開く PDF 等 論文の全文を読めるリンクがあればクリック 4 で本文が見られない場合は 画面上部の 本文が見つからない場合はこちらをクリック をクリック 5 開いた画面の 本文へのリンク 論文 等をクリックして入手 4 本文提供データベースの画面 ここで本文が見られる 見られない場合は 5 UTokyo Article Link の画面 必要に応じて論文情報を修正 電子ジャーナルへのリンク 論文 論文へ直接リンク ジャーナル 該当雑誌のトップページへ データベース 収録データベースへ リンクがない時は 電子ジャーナルへのリンクがない場合はこちらへ や 他の情報資源 等へ ログインせずに検索結果だけ見る場合はここから 5 ここから MyOPAC にログインして 学内の図書館所蔵の紙の資料を探すと そのままコピー取寄せ PDF 閲覧の申込も可能

6 ちょっと上級編 MeSH 検索 : シソーラス用語による検索 トップ画面において Search のプルダウンメニューで検索対象を MeSH に選択 ( または More Resources で MeSH Database をクリック ) 検索語を入力し Search ボタンをクリック 検索結果の MeSH 用語一覧に適切なものがあれば選択して検索 ~ 5 : MeSH 用語をクリックすると 上 下位語 関連語や Subheading( 副標目 ) 等が表示されるので 適宜組み合わせをして検索することも可能 対応する MeSH 用語へ誘導 Subheadings を複数選択する場合の検索方法 MeSH 用語をクリック Subheadings を選択 画面右上の Add to search builder で Subheadings をどのように組合わせるか選択 4 と を繰り替えす ( 画面上部に検索式が表示される 必要なら修正可 ) 5 Search PubMed ボタンをクリック 選択した MeSH 用語の Subheadings( 副標目 ) やツリー構造の表示画面へ 組合せると 多様な検索が可能 選択した MeSH 用語 ( 例.Stomach Neoplasms) で PubMed を検索 選択した MeSH 用語 ( 例.Stomach Neoplasms) を中心主題とする文献を PubMed で検索 チェックを付けなければ下位語も自動的に検索 4 5 MeSH 用語の上位語 下位語表示 Stomach Neoplasms は最下位語として位置づけられている 6

7 複数検索語の掛け合わせ 薬学図書館 / 本部情報基盤課 [ 学術情報リテラシー担当 ] 共催 PubMed の効果的な検索のために AND 検索 OR 検索 NOT 検索 PubMed の場合 検索用の演算子 (and, or, not など ) は半角大文字で入力 stomach cancer AND nutrition stomach stomach cancer cancer OR OR stomach stomach ulcer ulcer surgery NOT endoscopic surgery 参考 スペースでも AND 検索になるが 例えば egg allergy と入力するとフレーズとして認識されて検索される 論理演算をしたい場合は egg AND allergy と入力すると 指示が明確になる 絞り込み Filters 機能を活用して条件を指定 文献タイプ 言語 動物 / 人間 性別 収録誌の種類 年齢等による限定が可能 検索項目を限定した検索 特定の項目を対象に検索する場合は タグをつけて検索 タグ検索では自動マッピング機能は働かない 項目名 タグ 入力例 備考 smith re[au]( ミドルネームあり ) miyazono k[au] 著者 [au] smith r@[au](smith r だけをヒット ) miyazono kohei[au] 00 年以降ならフルネームでも検索可 所属機関 [ad] university of tokyo[ad] 第一著者のみ 論文タイトル [ti] stomach cancer[ti] 収録誌名 [ta] british medical journal[ta] The は入れない bmj[ta] 略称形も可 出版年 [dp] 0[dp] 008:0[dp] 008/09:0/0[dp] 出版タイプ [pt] review[pt] MeSH [mh] stomach neoplasms[mh] 4 Advanced Search タグを知らなくても プルダウンメニューで検索項目を限定して検索することが可能 検索履歴の掛け合わせ検索が可能です 例 ) # AND # 5 前方一致検索 複数形のような語尾変化などに対応 自動マッピング機能は働かない 例 ) bacter* bacteria bacterium など bacter で始まるものを検索 * もっと詳しく知りたい方は 医学図書館作成のマニュアル PubMed の使い方 を参照 医学図書館ホームページ掲載 7

8 番外篇 : こんな機能も 薬学図書館 / 本部情報基盤課 [ 学術情報リテラシー担当 ] 共催 臨床医学分野の文献を 目的のテーマで短時間に検索するのに便利です < アクセス > TOP PubMed Tools Clinical Queries 臨床研究カテゴリー therapy( 治療 ) diagnosis( 診断 ) etiology( 病因 ) prognosis( 予後 ) clinical prediction guides ( 臨床予測指針 ) 論文情報 ( 雑誌名 巻号等 ) から特定の論文をピンポイントで探せます < アクセス > TOP PubMed Tools Single Citation Matcher 例 ) J Allergy Clin Immunol () p. に掲載された論文を探す 雑誌の略称名から正式名称を調べることができます < アクセス > TOP More Resources Journals in NCBI Databases 例 ) 雑誌の略称名 Mol Cancer Res の正式名称を調べる 選択した雑誌名で PubMed を検索 参考 CSLS search(pubmed に専門用語の日本語表示やクラスタリング機能等を搭載した検索システム ) ( 東京大学教養学部附属教養教育高度化機構生命科学高度化部門が提供 ) GACoS データベースの先頭文字 P PubMed[ 東大専用入口 ] 案内文下方にもリンクがあります 8

9 英語論文を探す ~ Web of Science コアコレクション ~ 著者名検索 Web of Science コアコレクション ( 全分野 ) 学内から GACoS 定番データベース から 学外から SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス ( 要アカウント ) 例題 池谷裕二先生の論文を探す Web of Science コアコレクションクイックレファレンスガイド p. 苗字名前のイニシャル * イニシャルの前方一致検索で フルネームもイニシャルのみもヒット 検索漏れを防ぐため略称と正式名称の OR 検索 所属機関は 論文発表時 のものとなるため変遷がある場合等は注意 検索結果から 論文掲載誌の分野などで著者を絞り込む方法 絞り込み : Web of Science の分野 ( その他のオプション をクリックすると上記画面) 該当する分野にチェックを付けて 絞り込み をクリックまたは 明らかに異なる分野にチェックを付けて 除外 をクリック ( 複数チェック可能 アルファベット順に並べ替えることもできる ) 9

10 引用文献検索 例題 0 年ノーベル化学賞受賞者ロバート レフコウィッツの下記論文を引用している文献を探す Lefkowitz RJ, Constitutive activity of receptors coupled to guanine nucleotide regulatory proteins. Trends in Pharmacological Sciences, 99; 4(8): 検索画面の切替から 引用文献検索 をクリック 引用文献検索では雑誌論文 著者名 出版物名 出版年等を入力 だけでなく 図書も検索 OK 検索ボタンをクリック 4 該当する文献にチェックを付けて選び 選択した文献で検索 ボタンをクリック 5 引用文献検索の結果 (4で選択した文献を引用している論文の一覧) が表示される Web of Science コアコレクションクイックレファレンスガイド p.4 苗字名前のイニシャル * 雑誌名 ( 省略形 ) や書名を入力 * を付けて検索の幅を広げる 図書の場合は重版により出版年が複数あり得るのであえて空欄に 雑誌名省略形は 短縮形リストを表示 で確認 検索条件の追加も可能 ( 厳密にしすぎないことを推奨 ) 4 最終的な検索の前に文献の候補が表示される 引用のバリエーションがある場合は ここに複数の候補が表示される 同一文献であっても 引用した人によって書名の書き方が異なる場合や 出版年の違い 雑誌論文の巻 ページを間違えて引用された場合などがあり得るので 注意して選ぶ 使用後はログアウト 0 巻やページ数が異なるが おそらく同一文献と思われる

11 Web of Science の効果的な検索のために 複数検索語の掛け合わせ AND 検索 OR 検索 NOT 検索 genetic (and) resource genetic or heritable genetic not genetic counseling AND 検索 NEAR 検索 フレーズ検索 and 複数の検索語が含まれるレコードを検索 near 複数の検索語が指定した語数内にあるレコードのみ検索 ( 指定なしは 5 語以内 ) フレーズ 複数の検索語が入力したとおりの語順に並んでいるレコードのみ検索 検索結果多 少 検索結果の絞り込み /( スラッシュ ) の後に指定の数字 genetic near/0 resource 絞り込み条件を指定 Web of Science の分野 ドキュメントタイプ 研究分野 著者名 グループ著者名 編集者 出版物名 シリーズタイトル 出版年 著者所属 - 拡張 助成金提供機関 言語 国 / 地域による限定が可能 Web of Science の分野 と 研究分野 は共に論文掲載誌の分野 ( 論文そのものの分野ではない ) で Web of Science の分野 のほうがやや細かい区分となっている 条件ごとに上位 5 項目を表示 それ以降を見る場合は その他のオプション をクリック 詳細検索 特定の項目を対象に検索する場合は フィールドタグをつけて検索 タグを知らなくても 検索画面のドロップダウンメニューで項目を限定して検索することが可能だが ドロップダウンメニューにない項目もある 下表は主な項目 項目名 タグ 入力例 著者名 au au = koshiba m* 著者所属 - 拡張 og og = univ tokyo タイトル ti ti = genetics 出版物名 so so = nature 出版年 py py = 0 国 cu cu = japan 4 検索履歴の利用 検索履歴の掛け合わせ検索が可能 例 ) # AND # # OR # 5 前方一致検索 語尾変化などに対応 部分一致も可能 例 ) bacter* bacteria bacterium など bacter で始まるものを検索 単数形と複数形 (computer computers) 米国式英国式綴りのバリエーション (color colour) などは * なしでもトピック タイトルは自動検索される ただしフレーズ検索では無効になるので注意 * もっと詳しく知りたい方は 画面右上の ヘルプ をご覧ください

12 検索結果をまとめて印刷 ダウンロード等 検索で見つけた論文を マークリスト に入れておくと 最後にまとめて印刷 ダウンロード等ができる リストに入れたい論文情報のチェックボックスをクリック マークリストに追加 ボタンをクリック 画面右上の マークリスト をクリックし 出力方法を選択 レコードの出力ステップ : レコードを選択ステップ : フィールド ( 出力項目 ) を選択ステップ : 出力方法 手段を選択 RefWorks テキスト参照 マークリストから削除