日本語論文を探す ~ 医中誌 Web ~ 例題 ips 細胞の創薬への応用に関する国内の論文を探す 医中誌 Web い 同時アクセス 医中誌 Web ログイン画面で ログイン ボタンをクリック 検索語を入力し 検索ボタンをクリッ

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1 医学系文献検索 & RefWorks 検索実習 問題 & 解説 講習の進め方 (90 分 ) テーマから文献を探す - 日本語論文を探す : 医中誌 Web 例題 - 英語論文を探す : PubMed 例題 データベース検索結果をインポート 参考文献リストの作成 - RefWorks 自宅からデータベースや電子ジャーナルを利用する : SSL-VPN Gateway サービス 配布資料 検索実習問題 & 解説 リーフレット 文献探しのヒント ~4 医中誌 Web(Ver.5) クイックガイド EndNote Web EndNote RefWorks の主な相違点 データベースの入口 GACoS( ガコス ) 学内 学外 OK 東京大学 OPAC 画面上部の データベース からもリンク この資料に関するお問合せ : 東京大学本部情報基盤課 [ 学術情報リテラシー担当 ] TEL: ( 内線 :649) メール : literacy@lib.u-tokyo.ac.jp

2 日本語論文を探す ~ 医中誌 Web ~ 例題 ips 細胞の創薬への応用に関する国内の論文を探す 医中誌 Web い 同時アクセス 医中誌 Web ログイン画面で ログイン ボタンをクリック 検索語を入力し 検索ボタンをクリック * キーワード つずつ検索するのがおすすめ 検索結果が表示される * 必要に応じて 履歴検索や 絞り込み検索が可能 4 文献番号をクリックすると 詳細画面が表示される 5 本文を探すには メディカルオンライン PDF UT Article Link 等のアイコンをクリック 6 画面右上の終了ボタンをクリックして終了 履歴検索 検索結果を組み合わせた検索が可能 (AND/OR/NOT を選択 ) - の検索結果 - の検索結果 POINT! 検索履歴に表示される TH や AL とは? /TH シソーラス用語 (Thesaurus) を検索 主題による検索が可能 /AL 全項目を検索 ( 例 ) 創薬 /AL タイトルや抄録などに 創薬 という単語 ( 文字列 ) が含まれているものを検索 新薬開発 /TH シソーラス用語としての 新薬開発 というキーワードが付けられているものを検索 医中誌 Web では 自動マッピング機能により 入力語に対応するシソーラス用語があれば 自動的に入力語と合わせて検索される ( 下位のシソーラス語も含めて検索される ) シソーラス用語とは 論文の内容を表すキーワード 専門スタッフがシソーラス ( 上位語 下位語を整理した用語集 ) に基づき 統制されたキーワードを各論文に付与している これによって検索モレを防ぐことや 探したい主題の論文を検索できる (p.9 参照 )

3 ( 前のページから続く ) - 絞り込み検索 0.0- 医学系文献検索 & RefWorks 本部情報基盤課 [ 学術情報リテラシー担当 ] 絞り込み画面 例 : 抄録あり 論文種類 : 解説 日本語 など選び 絞り込み実行 ボタンをクリック 注意 本文あり ( 無料 ) で絞り込めるのは 医中誌が把握している無料文献のみで 大学の購読誌は対象にならない 本文を入手するには これで絞り込むのではなく 検索結果画面で UT Article Link 等をクリックすることをおすすめ ( p.4) 4 検索結果一覧 検索結果一覧は 新しい順 収載誌発行順 などに並べ替え可能 検索結果詳細 印刷 ダウンロード メール送信 クリップボード ( 一時保存 & まとめ印刷 ) 文献管理ツールへデータを保存 5 シソーラス用語 医中誌が作成する 医学用語シソーラス に登録された用語 医中誌フリーキーワード 上記シソーラスには登録されていないが 索引上重要として別途管理されている語 * の付いた語は中心的な主題 ( メジャー統制語 ) チェックタグ 論文の 対象 を表す

4 補足 <Pre 医中誌 > データ 0.0- 医学系文献検索 & RefWorks 本部情報基盤課 [ 学術情報リテラシー担当 ] シソーラス用語などがまだ付与されていない 新しいデータ タイトル 著者名 収録誌の情報 一部については抄録のみが表示 ( 最短で ヶ月で掲載 正式なデータになるには 4~6 ヶ月程度要する ) 補足 アイコンについて 全文を入手するためには有料の場合もあるため 注意が必要 東京大学 OPAC へのリンク 東大に冊子体の雑誌が所蔵されているか検索可能 東京大学 UT Article Link ボタン 本文入手可能なアイコンが無ければこれをクリック 電子ジャーナルへのリンクや 冊子体の所蔵等を確認可能 参照 : 文献探しのヒント データベースの検索結果で本文へのリンクがなかったら? メディカルオンラインデータベースへのリンク FAX FAX で全文を入手可能 FAX 送信申込画面に必要事項を入力し送信すると 記入した FAX 番号に全文が届く ( 自宅の FAX でも OK) PDF 全文入手可能 国立情報学研究所 (NII) の論文情報提供データベース CiNii Articles へのリンク 本文あり フルテキスト (PDF) を入手可能 雑誌によっては有料提供の場合もあり 文献単位で PubMed とリンク 一部の文献については フルテキストの閲覧が可能な場合もあり 文献単位でオンラインジャーナルへリンク 東大で契約している電子ジャーナルの場合 無料で入手可能 文献単位でオンラインジャーナルへリンク 東大で契約している電子ジャーナルの場合 無料で入手可能 補足 My 医中誌 : 検索式の保存 メールアラート (HELP 検索式の保存 メールアラート 参照 ) My 医中誌 のユーザ登録とログインが必要 医中誌 Web のデータ更新 ( 原則毎月 日 6 日 ) の都度 登録した検索式による更新データ分の検索結果がメールで届く 4

5 医中誌 Web の効果的な検索のために 複数検索語の掛け合わせ AND 検索 OR 検索 NOT 検索 胃癌緩和ケア 胃癌 or 胃潰瘍 外科手術 not 内視鏡手術 検索対象の限定 ( 絞り込み条件 ) 絞り込み条件 検索をする前にも ヒトの年齢 動物の種類 出版年 論文の種類等の条件設定が可能 検索項目を限定した検索 検索語入力欄の その他 プルダウンメニューで 特定の項目に限定して検索することが可能 入力欄にタグをつけて検索することも可能 項目タグ入力例備考 著者名 /au 清野宏 /au フリガナでの検索はキヨノヒロシ /au kiyonohiroshi/au 所属機関 /in 東京大学 /in 第一著者のみ 論文タイトル /ti エビデンス /ti 収載誌名 /jn 看護教育学研究 /jn 看教研 /jn 略称も可 ( プルダウンメニューでも可 ) 統制語 ( シソーラス ) /th 花粉症 /th メジャー統制語は花粉症 /mth 4 完全一致検索 [ ] を付けると完全一致検索 不要なものがヒットするのを防ぐ 完全一致の指定ができる項目は 著者名 収録誌名 所属機関名 特集名のみ 例 ) [ 清野宏 ]/AU 著者名 清野宏 のみヒット 清野宏美 等は除外される 5

6 ちょっと上級編 シソーラス用語による検索 自動的にではなく 自分でシソーラスを参照して検索に使う場合 ( シソーラス用語だけで検索する方法 ) 検索例 リラックスに関する論文を シソーラス用語を使って探す メニューバーの シソーラス参照 をクリック キーワードを入力し参照ボタンをクリック 入力したことばから導き出された同義語と候補リストが表示される 候補リストから適切なものを選んでクリック 4 そのシソーラス用語の副標目や上位語 下位語の階層構造が表示される 4 階層構造を確認して 適宜 下位語も検索する を選択し このキーワードで検索 をクリック 思いつくことばを入力 対応するシソーラス用語へ誘導 リラックス のシソーラス用語が リラクゼーション であることがわかる 4 階層 ( ツリー構造 ) の表示 番外篇 : こんな機能も 参考文献リスト内の 掲載雑誌略称の正式な誌名を調べる シソーラス参照画面で 収載誌名 を選択して略称を入力し 参照 をクリック 6

7 英語論文を探す ~ PubMed ~ 例題 ips 細胞 ( 人工多能性幹細胞 ips cell) についての英語論文を探す PubMed P 東大専用入口 検索画面で検索語を入力 ( 必要に応じて 論理演算子 (AND/OR/NOT) を半角大文字で入力 ) Search ボタンをクリック 検索結果一覧が表示される (Display Settings で表示形式を Abstract などに変更可能 ) 4 必要に応じ Filters で絞り込み条件を設定 5 論文名をクリックすると詳細画面が開く 6 本文を見るには Full Text ボタンまたは UT Article Link ボタンをクリック ips cell 精度の高いフレーズ検索の場合は ( ダブルクォーテーション ) が必要 ほとんどの場合は無くても自動的にフレーズ検索 ( 検索式の確認が必要 次ページ参照 ) 表示形式の変更 選択したデータの保存 メール送信など File: データのダウンロード Citation manager: 文献管理ツールへ保存 Clipboard: 一時保存 ( ブラウザの印刷機能でまとめ印刷 ) メール送信 Filters( 絞り込み ) 全解除 4 Filters で条件設定が可能 ( 例 ) Humans Review English Filters の項目画面表示を加除 クリックすると レビュー論文 ( 総説 ) だけに絞り込み 7

8 5 6 データベース側で付与した MeSH 用語 ( シソーラス用語 ) 検索式の確認 検索した後 どのような検索式が実行されたかを Search Details で確認 必要なら修正して再検索 入力した語だけでなく 対応するシソーラス用語でも自動的に検索 参考 : CABG( 冠動脈バイパス術 coronary artery bypass graft) と入力して検索した場合 入力した検索語 (cabg) だけで検索されている このように Mesh 用語を自動的に検索しない場合もあるので注意 MeSH=Medical Subject Headings 米国国立医学図書館作成のシソーラス ( 用語集 ) MeSH Terms( シソーラス用語 ) MeSH に基づいて付与された 論文の内容を表すキーワード 自動マッピング機能により 適切なものがあれば 入力した検索語だけでなく 関連する MeSH Terms でも自動的に検索してくれる 8

9 シソーラス用語をマスターしよう 論文の内容を表すキーワード 専門スタッフがシソーラス ( 上位語 下位語を整理した用語集 ) に基づいて 統制されたキーワードを各論文に付与している これによって検索漏れを防ぐことや 探したい主題の論文に絞り込むことができる 例えば ガンに関する論文を探したい 悪性腫瘍? 癌? 肉腫? 癌腫? 思いついたことばだけで検索するとそのことばが論文のタイトルや抄録等に無ければ ヒットしない 検索モレが生じる 悪性腫瘍 肉腫 癌腫 ひとつの概念に対して表現が複数ある場合 表現を統一 シソーラス用語 ( 統制語 ) 上位語 : 腫瘍 ( 広義 ) ツリー構造 論文 癌 下位語 : 乳癌 ( 狭義 ) : 子宮癌 : 肺癌 : 皮膚癌 精度の高い検索ができる! データベース提供側で各論文にシソーラス用語を付与 検索モレの防止 多様な検索が可能に シソーラス用語 : 癌 補足 My NCBI: 検索式の保存 メールアラート My NCBI のユーザ登録とログインが必要 Sign in to NCBI Register for a NCBI account 指定した頻度で 登録した検索式による更新データ分の検索結果がメールで届く 9

10 複数検索語の掛け合わせ 0.0- 医学系文献検索 & RefWorks 本部情報基盤課 [ 学術情報リテラシー担当 ] PubMed の効果的な検索のために PubMed の場合 検索用の AND 検索 OR 検索 NOT 検索 演算子 (and, or, not など ) は半角大文字で入力 stomach cancer AND nutrition stomach stomach cancer cancer OR OR stomach stomach ulcer ulcer surgery NOT endoscopic surgery 参考 スペースでも AND 検索になるが 例えば egg allergy と入力するとフレーズとして認識されて検索される 論理演算をしたい場合は egg AND allergy と入力すると 指示が明確になる 絞り込み Filters 機能を活用して条件を指定 文献タイプ 言語 動物 / 人間 性別 収録誌の種類 年齢等による限定が可能 検索項目を限定した検索 特定の項目を対象に検索する場合は タグをつけて検索 タグ検索では自動マッピング機能は働かない 項目名 タグ 入力例 備考 smith re[au]( ミドルネームあり ) miyazono k[au] 著者 [au] smith r@[au](smith r だけをヒット ) miyazono kohei[au] 00 年以降ならフルネームでも検索可 所属機関 [ad] university of tokyo[ad] 第一著者のみ 論文タイトル [ti] stomach cancer[ti] 収録誌名 [ta] british medical journal[ta] The は入れない bmj[ta] 略称形も可 出版年 [dp] 0[dp] 008:0[dp] 008/09:0/0[dp] 出版タイプ [pt] review[pt] MeSH [mh] stomach neoplasms[mh] 4 Advanced Search タグを知らなくても プルダウンメニューで検索項目を限定して検索することが可能 検索履歴の掛け合わせ検索が可能です 例 ) # AND # 5 前方一致検索 複数形のような語尾変化などに対応 自動マッピング機能は働かない 例 ) bacter* bacteria bacterium など bacter で始まるものを検索 * もっと詳しく知りたい方は 医学図書館作成のマニュアル PubMed の使い方 を参照 医学図書館ホームページ掲載 0

11 ちょっと上級編 MeSH 検索 : シソーラス用語による検索 トップ画面において Search のプルダウンメニューで検索対象を MeSH に選択 ( または More Resources で MeSH Database をクリック ) 検索語を入力し Search ボタンをクリック 検索結果の MeSH 用語一覧に適切なものがあれば選択して検索 ~ 5 : MeSH 用語をクリックすると 上 下位語 関連語や Subheading( 副標目 ) 等が表示されるので 適宜組み合わせをして検索することも可能 対応する MeSH 用語へ誘導 Subheadings を複数選択する場合の検索方法 MeSH 用語をクリック Subheadings を選択 画面右上の Add to search builder で Subheadings をどのように組合わせるか選択 4 と を繰り替えす ( 画面上部に検索式が表示される 必要なら修正可 ) 5 Search PubMed ボタンをクリック 選択した MeSH 用語の Subheadings( 副標目 ) やツリー構造の表示画面へ 組合せると 多様な検索が可能 選択した MeSH 用語 ( 例.Stomach Neoplasms) で PubMed を検索 選択した MeSH 用語 ( 例.Stomach Neoplasms) を中心主題とする文献を PubMed で検索 チェックを付けなければ下位語も自動的に検索 4 5 MeSH 用語の上位語 下位語表示 Stomach Neoplasms は最下位語として位置づけられている

12 番外篇 : こんな機能も 0.0- 医学系文献検索 & RefWorks 本部情報基盤課 [ 学術情報リテラシー担当 ] 臨床医学分野の文献を 目的のテーマで短時間に検索するのに便利です < アクセス > TOP PubMed Tools Clinical Queries 臨床研究カテゴリー therapy( 治療 ) diagnosis( 診断 ) etiology( 病因 ) prognosis( 予後 ) clinical prediction guides ( 臨床予測指針 ) 論文情報 ( 雑誌名 巻号等 ) から特定の論文をピンポイントで探せます < アクセス > TOP PubMed Tools Single Citation Matcher 例 ) J Allergy Clin Immunol () p. に掲載された論文を探す 雑誌の略称名から正式名称を調べることができます < アクセス > TOP More Resources Journals in NCBI Databases 例 ) 雑誌の略称名 Mol Cancer Res の正式名称を調べる 選択した雑誌名で PubMed を検索 参考 CSLS search(pubmed に専門用語の日本語表示やクラスタリング機能等を搭載した検索システム ) ( 東京大学教養学部附属教養教育高度化機構生命科学高度化部門が提供 )

13 RefWorks を使うには ユーザ登録 学内 / 学外アクセス方法 ここに載っていない情報は GACoS [FAQ] ページ参照 RefWorks ユーザー登録 RefWorks にアクセス 新規アカウントを申し込む をクリック この画面が出たら グループコードを入力 学外からの利用の流れ : SSL-VPN Gateway サービス (GACoS) SSL-VPN Gateway サービスに ECCS アカウントでサインイン ( 使う機能によりグループコードを求められます ) グループコードで利用 推奨 ただし不定期に変更されます その他のサービス RefWorks ログイン 利用 ログアウト サインアウト (GACoS) リモートアクセスにグループコードでログイン RefWorks ログイン 利用 ログアウト 使い方で困ったら : FAQ RefWorks を使うには? を参照 (RefWorks ログイン画面にリンクあり ) ユーザー登録 学内 外からの利用方法 マニュアル等 必要な情報を掲載 問い合わせ : 東京大学附属図書館 ASK サービス フォルダを作る メニューバー下の フォルダの作成 ボタンをクリック 新しいフォルダ名 の欄に フォルダ名を入力 作成ボタンをクリック フォルダ名は半角英数で入力 サブフォルダの作成はここから 作成したフォルダは タブを フォルダの整理および共有 に切り替えると一覧できる 作成したフォルダ名 フォルダ名の変更や削除はここから ( フォルダ名を右クリック またはのアイコンをクリックすると表示 )

14 データベース検索結果をダイレクトにインポート 医中誌 Web の場合 医中誌 Web 検索結果で RefWorks に取り込みたいデータの左端にチェックをつける RefWorks のアイコンをクリック ( 医中誌 Web 利用後は右上の 終了 をクリック )... RefWorks 画面で インポートが完了しました のメッセージが表示される 以降の操作は p.5 レコードをフォルダに移す を参照 医中誌 Web 画面 RefWorks 画面 4

15 レコードをフォルダに移す レコードの左端にチェックを付ける 追加先 のアイコンをクリックして どのフォルダに移すかを選択し クリック 文献管理のコツ! 取り込んだレコードはその都度こまめにフォルダに移しましょう! 複数のフォルダに入れた場合 つのフォルダで削除すると すべてのフォルダから削除される 削除 アイコンではなく フォルダから除去する アイコンをクリックすれば OK 削除 はこちら フォルダに入れたレコードを見るには 画面右の フォルダ 一覧 見たいフォルダ名をクリック 補足 各データベースからのインポート方法を知りたい RefWorks を使うには? のページ参照 (RefWorks ログイン画面にリンクあり ) 取り込んだレコードのバックアップをとる メニューバー レコード エクスポート をクリック エクスポート画面で対象とフォーマットを選択し エクスポート ボタンをクリック RefWorks から電子ジャーナルの論文本文を見るには 取り込んだレコードの ビュー で詳細画面を開き URL をクリック ( または UT Article Link ボタンをクリック ) 取り込んだレコードを編集したい レコードの 編集する をクリック ( 複数レコードの一括編集は グローバル編集 クリック ) レコードの編集画面で適宜修正 追記等を行い 保存する をクリック 手入力で新規レコードを追加したい メニューバー下の レコードの作成 ボタンをクリック 新規作成画面で 出力フォーマット Reference Type( 資料タイプ ) ( 学術論文 新聞記事 書籍等 ) から適切なものを選択すると その資料タイプに沿った項目となるので 必要な項目を入力して 保存する をクリック 5

16 データベース検索結果をテキストファイルからインポート -PubMed の場合 PubMed 検索結果画面で RefWorks に取り込みたいデータの左端にチェックをつける Send to のプルダウンメニューで Citation manager を選択 Create File ボタンをクリック ファイルの保存先がどこになって 4 保存 をクリック ( これが RefWorks に取り込むファイルとなる ) いるか 確認しておくこと. 5 RefWorks 画面で レコード インポート を選択 6 テキストファイルから インポートフィルター/ データソース で NLM PubMed を選択 ( データベース は PubMed が自動選択される) 7 テキストファイルを選択 の参照をクリックし 取り込むファイルを指定 8 インポート先フォルダで既に作成したフォルダの中から任意のフォルダ名を指定して インポート をクリック 9 インポートが完了しました のメッセージが表示される PubMed 画面 4 5 RefWorks 画面 レコード 補足 RefWorks 画面上部メニューバーの 検索 外部データベース PubMed でダイレクトにインポートすることも可能 6

17 参考文献リストの作成 レコード一覧から作成する方法 メニューバー下の 参考文献の作成 ボタンをクリック 出力フォーマットは 投稿する雑誌で指定されている 文献リストの書式を選択 使う書式は 出力フォーマット管理ツール で確認 通常使う お気に入り に加除できる レコード一覧から作成 下からファイルタイプで HTML などを選択 4 エクスポートの対象 は 参考文献リストにしたい文献のフォルダを選択 5 参考文献の作成 をクリック 6 別画面が開き 指定した書式での文献リストが表示される ( コピーして原稿に貼り付けるなどして活用 ) リストが表示されない場合は ポップアップブロックされていることが多い ポップアップブロックを解除すること 参考文献 参考文献の作成 補足 出力フォーマットに対応していない書式の場合は 既存出力フォーマットを流用してカスタマイズすることも可能 その場合はメニューバー 参考文献 出力フォーマットの編集 をクリック 4 フォーマットの全ての一覧はここから 6 リストに必要な書式が無ければ literacy@lib.u-tokyo.ac.jp まで投稿規程の URL をメールでお知らせください 別画面が開かない時は画面右下に出るメッセージをクリック このファイルを開くか保存しますか? で開くをクリック 5 参考文献リストの作成 - 原稿ファイルから作成する方法 論文原稿を Word ファイルで用意する Word のファイル名は 画面右のフォルダ一覧 参考文献リストにしたい文献のフォルダを選択 半角英数で 引用したいレコードの右側にある 引用する アイコン { } をクリック 引用ビュアー 画面が開く 4 引用ビュアーの 選択 ボタンをクリック 5 反転するので コピーして Word ファイルに貼り付け Word ファイルを保存する 原稿ファイル 6 引用ビュアーの 参考文献 ボタンをクリック 7 出力フォーマットは 投稿する雑誌で指定されている文献リストの書式を選択 8 原稿ファイルから作成 をクリックし フォーマット化するファイルは 参照 で5の Word ファイルを指定 9 参考文献の作成 ( 上の図 5) をクリック 0 別の Word ファイルが開き 指定した書式での文献リスト付きで表示される 完成ファイル ( この完成ファイルは 原稿ファイルとは別に 名前をつけて保存 で保存すること )

18 参考文献リストの作成 - 原稿ファイルから作成する方法 ~Write-N-Cite を利用した場合 ~ RefWorks メニューバーの ツール から Write-N-Cite を選択し 適宜ダウンロードおよびインストールする OS および Word のバージョンに注意 Word のファイル名は 論文原稿を Word ファイルで用意する 半角英数で (Word を起動すると アドイン メニューまたはツールバーに Write-N-Cite のアイコンが表示される ) Write-N-Cite のアイコンをクリックすると RefWorks と同様にログイン画面が表示されるので ログイン名 パスワードを入力する 4 Write-N-Cite のメニューバー 通覧 下の フォルダ または すべてのレコード から 引用したいレコードを選択 5 Word 論文の必要な箇所にカーソルをあわせ Write-N-Cite のレコードの左側にある 引用する をクリックすると 引用する文献情報が表示される 6 Word ファイルを上書き保存 原稿ファイル 7 Write-N-Cite のメニューバーから 参考文献 をクリック 8 出力フォーマット で 投稿する雑誌で指定されている 文献リストの書式を選択 9 参考文献の生成 をクリック 0 指定した書式の文献リスト付きで Word 文書が表示されるので 別名で保存する 完成ファイル ( この完成版 Word ファイルは 原稿ファイルとは別に 名前をつけて保存 で保存すること ) RefWorks 画面 Word 画面 4 チェックを入れると常時表示