Chromeleon 7 for Chromeleon 7.2 全バージョン共通 Build: --- 新しいシーケンスの作成に使用できるワークリストファイル (.wlex) Doc. Nr: FAQ_CM7_2SS_00009 Doc. Ver.: Doc. Type

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しまなあいきょう
5 years ago
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1 for.2 全バージョン共通 Build: --- LIMS ワークリストの書式はじめに Chromeleon では必要な情報が決められたワークリスト書式 (wlex) で提供される場合 LIMS からシーケンスを作成できますワークリストの書式 Chromeleon でシーケンスを使用するために必要なワークリストの書式 (.wlex) は XML ベースの書式です注入リストシーケンスで使用するファイルおよびシーケンスのプロパティを定義します使用する要素は以下のとおりです <Worklist> ルート識別子 <Options> ワークリストをインポートするための一般パラメータ <Templates> 関連アイテム ( 装置メソッド処理メソッドレイアウト報告書テンプレートドキュメントなど ) の場所 <Sequence> シーケンスのプロパティおよび注入リストの記述 <Injection> 該当する場合すべての注入変数およびカスタム変数の記述利用可能な要素および属性の詳細は以下の表をご覧ください特に記述されていない限り要素および属性はすべて必須です Options の要素属性 allowappendinjections deleteworklist reonerror 既定設定ではシーケンスが既存の場合シーケンスの作成は中断されますこの属性を true に設定すると注入は既存のシーケンスに追加されます true に設定するとシーケンスが正常に作成された場合ワークリストは削除されます true に設定するとシーケンスの作成中にエラーを引き起こしたワークリストは名前が変更されファイル拡張子が "wlex.failed" になります例 : Options allowappendinjections="false" deleteworklist="true" reonerror="true"/> Page 1 of 7

2 for.2 全バージョン共通 Build: --- Templates の要素以下のメンバ要素があります AssociatedItem: 指定したシーケンスにコピーする関連アイテム ( 装置メソッド処理メソッド表示設定報告書テンプレートドキュメント ) の名前および URL を記述します関連アイテムの名前が URL で指定する名前と同じでない場合はそのアイテムの名前が変更されます ( 属性 : url) CustomVariable: シーケンスまたは注入を記述する際に使用するカスタム変数の短縮名を記述します url は希望のカスタム変数がグローバルカスタム変数リストで指定されているデータ保管庫を参照します ( 属性 : url) 属性 url 関連アイテムまたはカスタム変数の名前関連アイテムまたはカスタム変数のデータ保管庫の Chromeleon URL 例 : <Templates> <AssociatedItem ="PAH340" url="chrom://localhost/chromeleonlocal/templates/pah340.instmeth"/> <CustomVariable ="LimsSampleID" url="chrom://localhost/chromeleonlocal"/> </Templates> Page 2 of 7

3 for.2 全バージョン共通 Build: --- Sequence の要素属性 url comment preferredviewsettings preferredreporttemplate preferredchannel submitsignature reviewsignature approvesignature 生成するシーケンスの名前シーケンスを生成するフォルダの場所指定された場所にある既存のシーケンスが上書きされることは決してありません allowappendinjections 属性が true に設定されている場合 ( 上記参照 ) はワークリストで指定された注入が既存シーケンスに追加されそれ以外の場合はシーケンスの作成が中断されますシーケンスのプロパティに追加するコメントシーケンスの注入を開くときに使用する表示設定シーケンスの注入を開くときに使用する報告書テンプレート注入リストで既定設定で表示されるチャンネルクロマトグラフィースタジオで注入を開くときにも表示されます true に設定すると認証ユーザーはシーケンスに電子署名し提出できます true に設定すると認証ユーザーはシーケンスを電子的に照査できます true に設定すると認証ユーザーはシーケンスを電子的に承認できます以下のメンバ要素があります CustomVariable: シーケンスまたは注入に追加するカスタム変数およびその値を記述しますカスタム変数はあらかじめ Template 要素で指定しておく必要があります ( 属性 : value) 属性 value カスタム変数の名前ワークリストの値は常に文字列で表現されますただしシーケンスの作成中に対応するカスタム変数値パーサによって解析されカスタム変数のタイプによっては中断エラーが発生する可能性があります Instrument: シーケンスに指定する装置のホストおよび名前を記述します ( 属性 : host) 属性 host 装置の名前装置のホスト Page 3 of 7

4 for.2 全バージョン共通 Build: --- 例 : Sequence ="DEMO340" url="chrom://localhost/chromeleonlocal/importtest/" comment="pah hair analytic" preferredviewsettings="default DAD" preferredreporttemplate="default DAD" preferredchannel="uv_vis_1" submitsignature="true" approvesignature="true"> Instrument ="PAH HPLC1" host="localhost"/> Page 4 of 7

5 for.2 全バージョン共通 Build: --- Injection の要素属性 type 注入の名前注入の種類 level レベル ( 校正レベル ) position 注入の位置位置の正しい書式は使用するオートサンプラによって異なりますこの属性が空の場合ユーザーはシーケンス作成後に手動で位置を設定できますいずれにしろ位置が指定されていない場合警告が生成されます volume 注入量 (μl 単位 ) instrumentmethod processingmethod 注入の処理に使用する装置メソッドの名前指定したメソッドが存在しない場合警告が表示されますクロマトグラフィーデータの処理に使用する処理メソッドの名前指定したメソッドが存在しない場合警告が表示されます weight 重み ( 重み係数 ) dilution 希釈 ( 率 ) intstd replicateid comment 内部標準量レプリケート ID コメント spikegroup " 添加グループ " 例 : Injection ="Sample1" type="unknown" position="26" volume="20" instrumentmethod="pah340" processingmethod="demo340" comment="pah hair sample, ID "/> Page 5 of 7

6 for.2 全バージョン共通 Build: --- ワークリストからのシーケンスの作成 : 例 <?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>  Worklist xmlns=" version="1.0"> <Options allowappendinjections="false" deleteworklist="true" reonerror="true"/> <Templates> <AssociatedItem ="PAK_TEST" url="chrom://localhost/chromeleonlocal/templates/pak_test.instmeth"/> <AssociatedItem ="PAK_TEST" url="chrom://localhost/chromeleonlocal/templates/pak_test.procmeth"/> <AssociatedItem ="Default" url="chrom://localhost/chromeleonlocal/templates/default.layout"/> <AssociatedItem ="PAK_TEST" url="chrom://localhost/chromeleonlocal/templates/pak_test.report"/> <AssociatedItem ="LimsFormat.pdf" url="chrom://localhost/chromeleonlocal/demo340.seq/limsformat.pdf.file"/> <CustomVariable ="LimsSampleID" url="chrom://localhost/chromeleonlocal"/> <CustomVariable ="Comment" url="chrom://localhost/chromeleonlocal"/> </Templates> <Sequence ="PAK_TEST" url="chrom://localhost/chromeleonlocal/importtest/" comment="pah hair analytic" preferredviewsettings="default" preferredreporttemplate="pak_test" preferredchannel="uv_vis_1" submitsignature="true" approvesignature="true"> Instrument ="HPLC1" host="localhost"/> CustomVariable ="Comment" value="seq-id "/> <Injection ="Standard1" type="standard" level="01" position="1" volume="20" instrumentmethod="pak_test" processingmethod="pak_test" weight="1.0" dilution="1.0" intstd="1.0" replicateid="" comment="check PAK-Standard-1"> </Injection> Page 6 of 7

7 for.2 全バージョン共通 Build: --- <Injection ="Injection1" type="unknown" level="" position="26" volume="20" instrumentmethod="pak_test" processingmethod="pak_test" weight="1.0" dilution="1.0" intstd="1.0" replicateid="" comment="pak hair sample, ID "> <CustomVariable ="LimsSampleID" value="id "/> </Injection> </Sequence> </Worklist> Page 7 of 7

8 for.2 全バージョン共通 Build: --- お問い合わせ先サーモフィッシャーサイエンティフィック株式会社カスタマーサポート本部テクニカルサポート Tel:

Chromeleon 6 for Chromeleon 6.8 SR15 Build: --- 新しいシーケンスの作成に使用できるワークリストファイル (.wle) Doc. Nr: CM6_68150_0020 Doc. Ver.: Doc. Type: Guide

Chromeleon 6 for Chromeleon 6.8 SR15 Build: --- 新しいシーケンスの作成に使用できるワークリストファイル (.wle) Doc. Nr: CM6_68150_0020 Doc. Ver.: Doc. Type: Guide for.8 SR15 Build: --- LIMS ワークリストの書式はじめに Chromeleon における LIMS データ ( シーケンス ) 読取りフォーマットをワークリスト (WLE ファイル ) といいますワークリストファイル形式で LIMS から情報を出力して頂ければ Chromeleon でインポートできますそのため LIMS からワークリスト形式で出力できるように LIMS