Chromeleon 7 for Chromeleon 7.2 全バージョン共通 Build: --- 新しいシーケンスの作成に使用できるワークリストファイル (.wlex) Doc. Nr: FAQ_CM7_2SS_00009 Doc. Ver.: Doc. Type

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1 for.2 全バージョン共通 Build: --- LIMS ワークリストの書式 はじめに Chromeleon では 必要な情報が決められたワークリスト書式 (wlex) で提供される場合 LIMS からシーケンスを作成 できます ワークリストの書式 Chromeleon でシーケンスを使用するために必要なワークリストの書式 (.wlex) は XML ベースの書式です 注入リスト シーケンスで使用するファイル およびシーケンスのプロパティを定義します 使用する要素は以下のとおりです <Worklist> ルート識別子 <Options> ワークリストをインポートするための一般パラメータ <Templates> 関連アイテム ( 装置メソッド 処理メソッド レイアウト 報告書テンプレート ドキュメントなど ) の場所 <Sequence> シーケンスのプロパティおよび注入リストの記述 <Injection> 該当する場合 すべての注入変数およびカスタム変数の記述利用可能な要素および属性の詳細は 以下の表をご覧ください 特に記述されていない限り 要素および属性はすべて必須です Options の要素属性 allowappendinjections deleteworklist reonerror 既定設定では シーケンスが既存の場合 シーケンスの作成は中断されます この属性を true に設定すると 注入は既存のシーケンスに追加されます true に設定すると シーケンスが正常に作成された場合 ワークリストは削除されます true に設定すると シーケンスの作成中にエラーを引き起こしたワークリストは名前が変更され ファイル拡張子が "wlex.failed" になります 例 : Options allowappendinjections="false" deleteworklist="true" reonerror="true"/> Page 1 of 7

2 for.2 全バージョン共通 Build: --- Templates の要素以下のメンバ要素があります AssociatedItem: 指定したシーケンスにコピーする関連アイテム ( 装置メソッド 処理メソッド 表示設定 報告書テンプレート ドキュメント ) の名前および URL を記述します 関連アイテムの名前が URL で指定する名前と同じでない場合は そのアイテムの名前が変更されます ( 属性 : url) CustomVariable: シーケンスまたは注入を記述する際に使用するカスタム変数の短縮名を記述します url は 希望のカスタム変数がグローバルカスタム変数リストで指定されているデータ保管庫を参照します ( 属性 : url) 属性 url 関連アイテムまたはカスタム変数の名前 関連アイテムまたはカスタム変数のデータ保管庫の Chromeleon URL 例 : <Templates> <AssociatedItem ="PAH340" url="chrom://localhost/chromeleonlocal/templates/pah340.instmeth"/> <CustomVariable ="LimsSampleID" url="chrom://localhost/chromeleonlocal"/> </Templates> Page 2 of 7

3 for.2 全バージョン共通 Build: --- Sequence の要素属性 url comment preferredviewsettings preferredreporttemplate preferredchannel submitsignature reviewsignature approvesignature 生成するシーケンスの名前 シーケンスを生成するフォルダの場所 指定された場所にある既存のシーケンスが上書きされることは決してありません allowappendinjections 属性が true に設定されている場合 ( 上記参照 ) はワークリストで指定された注入が既存シーケンスに追加され それ以外の場合はシーケンスの作成が中断されます シーケンスのプロパティに追加するコメント シーケンスの注入を開くときに使用する表示設定 シーケンスの注入を開くときに使用する報告書テンプレート 注入リストで既定設定で表示されるチャンネル クロマトグラフィースタジオで注入を開くときにも表示されます true に設定すると 認証ユーザーはシーケンスに電子署名し 提出できます true に設定すると 認証ユーザーはシーケンスを電子的に照査できます true に設定すると 認証ユーザーはシーケンスを電子的に承認できます 以下のメンバ要素があります CustomVariable: シーケンスまたは注入に追加するカスタム変数およびその値を記述します カスタム変数は あらかじめ Template 要素で指定しておく必要があります ( 属性 : value) 属性 value カスタム変数の名前 ワークリストの値は常に文字列で表現されます ただし シーケンスの作成中に対応するカスタム変数値パーサによって解析され カスタム変数のタイプによっては中断エラーが発生する可能性があります Instrument: シーケンスに指定する装置のホストおよび名前を記述します ( 属性 : host) 属性 host 装置の名前 装置のホスト Page 3 of 7

4 for.2 全バージョン共通 Build: --- 例 : Sequence ="DEMO340" url="chrom://localhost/chromeleonlocal/importtest/" comment="pah hair analytic" preferredviewsettings="default DAD" preferredreporttemplate="default DAD" preferredchannel="uv_vis_1" submitsignature="true" approvesignature="true"> Instrument ="PAH HPLC1" host="localhost"/> Page 4 of 7

5 for.2 全バージョン共通 Build: --- Injection の要素 属性 type 注入の名前 注入の種類 level レベル ( 校正レベル ) position 注入の位置 位置の正しい書式は 使用するオートサンプラによって異なります この属性が空の場合 ユーザーはシーケンス作成後に手動で位置を設定できます いずれにしろ 位置が指定されていない場合 警告が生成されます volume 注入量 (μl 単位 ) instrumentmethod processingmethod 注入の処理に使用する装置メソッドの名前 指定したメソッドが存在しない場合 警告が表示されます クロマトグラフィーデータの処理に使用する処理メソッドの名前 指定したメソッドが存在しない場合 警告が表示されます weight 重み ( 重み係数 ) dilution 希釈 ( 率 ) intstd replicateid comment 内部標準量 レプリケート ID コメント spikegroup " 添加グループ " 例 : Injection ="Sample1" type="unknown" position="26" volume="20" instrumentmethod="pah340" processingmethod="demo340" comment="pah hair sample, ID "/> Page 5 of 7

6 for.2 全バージョン共通 Build: --- ワークリストからのシーケンスの作成 : 例 <?xml version="1.0" encoding="utf-8"?> <!--ワークリストファイルの例 --> Worklist xmlns=" version="1.0"> <Options allowappendinjections="false" deleteworklist="true" reonerror="true"/> <Templates> <AssociatedItem ="PAK_TEST" url="chrom://localhost/chromeleonlocal/templates/pak_test.instmeth"/> <AssociatedItem ="PAK_TEST" url="chrom://localhost/chromeleonlocal/templates/pak_test.procmeth"/> <AssociatedItem ="Default" url="chrom://localhost/chromeleonlocal/templates/default.layout"/> <AssociatedItem ="PAK_TEST" url="chrom://localhost/chromeleonlocal/templates/pak_test.report"/> <AssociatedItem ="LimsFormat.pdf" url="chrom://localhost/chromeleonlocal/demo340.seq/limsformat.pdf.file"/> <CustomVariable ="LimsSampleID" url="chrom://localhost/chromeleonlocal"/> <CustomVariable ="Comment" url="chrom://localhost/chromeleonlocal"/> </Templates> <Sequence ="PAK_TEST" url="chrom://localhost/chromeleonlocal/importtest/" comment="pah hair analytic" preferredviewsettings="default" preferredreporttemplate="pak_test" preferredchannel="uv_vis_1" submitsignature="true" approvesignature="true"> Instrument ="HPLC1" host="localhost"/> CustomVariable ="Comment" value="seq-id "/> <Injection ="Standard1" type="standard" level="01" position="1" volume="20" instrumentmethod="pak_test" processingmethod="pak_test" weight="1.0" dilution="1.0" intstd="1.0" replicateid="" comment="check PAK-Standard-1"> </Injection> Page 6 of 7

7 for.2 全バージョン共通 Build: --- <Injection ="Injection1" type="unknown" level="" position="26" volume="20" instrumentmethod="pak_test" processingmethod="pak_test" weight="1.0" dilution="1.0" intstd="1.0" replicateid="" comment="pak hair sample, ID "> <CustomVariable ="LimsSampleID" value="id "/> </Injection> </Sequence> </Worklist> Page 7 of 7

8 for.2 全バージョン共通 Build: --- お問い合わせ先サーモフィッシャーサイエンティフィック株式会社カスタマーサポート本部テクニカルサポート Tel: