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1 ISSN No.413 November Graph PET TOPICS Post historic doodles on clay

2 研 究 最 前 線 マーケティングや金融 サイバー攻撃からの防御 医療診断や生命科学 脳科学など さまざまな分野において ビッグデータを解析することのニーズが高まっている ビッグデータ解析で重要なグラフ処理の計算速度を競うスーパーコンピュータ スパコン の 国際的な性能ランキングGraph500において 2015年7月に 京 が1年ぶりに世界1位に輝いた 王座奪還をどのようにして成し遂げたのか 理研計算科学研究機構 プログラム構成モデル研究チームの 丸山直也チームリーダー TL と上野晃司 研修生 東京工業大学大学院博士課程 に聞いた 京 がGraph500で世界1位を奪還 Graph500 はモナコグランプリ だ TOP500 で競われる課題は 足し レースに例えれば 直線コースで最高速 スパコンの国際的な性能ランキングで 算や掛け算を順番に行っていくというコ 度を競うようなもので ハードウエアの は 1993 年に始まった TOP500 が有名 ンピュータが得意な問題です 自動車 最高性能が反映されやすいという特徴 図 1 巨大なグラフ 上図は枝が約 1万 6000 本のグラフ Graph500 の課題は 枝が 16 兆本もある巨大なグラフである 丸山 TL と上野さんたちは その巨大グラフに対する幅優先探索問題を 0.45 秒で解くことに成功した 02 R I KE N NE WS 2015 N ovem be r

3 STUDIO CAC TL TOP Graph F Graph TOP500 TL Graph Graph RIKEN NEWS 2015 November 03

4 GTEPS 1 K computer 82, ,621 2 Sequoia IBM 98, ,751 3 Mira IBM 49, ,982 5Graph TEPSGraph500 1 G ,582GTEPS 38,621GTEPS2 4 JUQUEEN IBM 16, ,848 5 Fermi CINECA IBM 8, , A NUDT 8, ,061 7 Turing GENCI IBM 4, ,427 7 Blue Joule IBM 4, ,427 7 DIRAC IBM 4, ,427 7 Zumbrota EDF IBM 4, ,427 7 Avoca IBM 4, , Graph , TL20146 Graph S equoiaibm 21 5 CPU CPU CPU CPU Graph500 7 TOP RIKEN NEWS 2015 November

5 RIKEN NEWS 2015 November 05 Graph500 TL TOP500CPU TOP500 Graph500 TOP500 4 Graph500 1 TL Twitter SNS 1000 Graph500 1 TL Graph500 IBM IBM Graph500 TL Graph500 Graph Graph500 1 STUDIO CAC

6 CDBTL TL TL 4 卵母細胞における染色体の分かれ方 TL TL DNA RIKEN NEWS 2015 November

7 RIKEN NEWS 2015 November mm 3 TL TL TL Jan Ellenberg TL2012 CDB DNA

8 Aurora B Aurora C Aurora B/C PP2A-B56 3 Aurora B Aurora BAurora C PP2A-B56 Aurora B 3 Aurora B Aurora B 4 3 Aurora B Aurora BAurora C Aurora BC Aurora BC PP2A-B56 TL Aurora BC Aurora BC TL RIKEN NEWS 2015 November

9 RIKEN NEWS 2015 November TL TL TL TL 3 33 TL

10 PET PETFDG PET FDGPET PET PET PET PET PET PET PETPositron Emission Tomography PET PET F[ 18 F]FDG FDG FDGFDG FDG FDG [ 18 F]AA-7 [ 18 F]FDG SUV FDG PET PET TL CMISWilliam Ewan HumeTL20154 CLST TL R&D 2010CMIS PET 1AA-7FDGPET AA-7 は がん組織に集積し 炎症部位には集積していない 膵臓に高い集積が見られる FDG は がん組織だけでなく 炎症部位にも集積している 10 RIKEN NEWS 2015 November

11 SUV 3.0 SUV :04-0:24 0:24-0:44 0:44-1:04 1:05-1:25 0 2AA-7PET 投与直後から 1 時間 25 分後までの変化を示している ( 左 ) 動物実験 ( 図 1) で高い集積が見られた膵臓には集積していない 腎臓に集積が見られるが 時間の経過につれて速やかに膀胱へ排出されていく 脳には特異的な集積は見られない ( 右 ) LAT1 LAT1 LAT1 PETPET PET F LAT1 F 18 F PET LAT1 18 FHOT PET HOT g kgpet g1001g 18 F 110HOT 2 HOT HOT TL [ 18 F]AA-7AA-7 FDG 1AA-7 1 AA-7 AA-7 FDG AA-7 AA-7 AA-7 RIKEN NEWS 2015 November 11

12 理研産業連携本部イノベーション推進センター新規 PET 診断薬研究チームの児玉和也チームリーダー ( 左 長瀬産業 ) と野崎聡副チームリーダー ( 理研ライフサイエンス技術基盤研究センターイメージング応用研究グループ健康 病態科学研究チーム研究員 ) AA- 3FDG 3 AA-PET AA PET Gd-MRI [ 18 F]AA-7 [ 18 F]FDG SUV 5.5 3AA-7FDGPET MRI 画像で白っぽい部分が腫瘍である FDG は脳全体に集積しているため 腫瘍部分を判別しにくい AA-7は腫瘍部分にのみ集積している 0 FACBC AA-7PET PET CTMRI CTMRI LAT1 AA-7 PET FDG PETAA-7 PETAA-7 12 RIKEN NEWS 2015 November

13 TOPICS NIH OIST F Web shirutsudoi@riken.jp RIKEN NEWS 2015 November 13

14 TOPICS RIKEN NEWS 2015 November

15 km X RIKEN NEWS 2015 November 15

16 Post historic doodles on clay Adam Phillips No.413 November Tel riken_news@riken.jp RIKEN Tel kifu-info@riken.jp

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