Microsoft Word - CATNewsVol2No7Text.doc
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- あつとし にかどり
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1 COMPLEX ADAPTIVE TRAITS Newsletter 23 (3) The International Plant & Animal Genome XX Conference Vol. 2 No
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3 DDBJ Sequence Read Archive (DRA) DDBJ Linux BLAST R
4 DDBJ Sequence Read Archive (DRA) DRA International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC) NCBI Sequence Read Archive (SRA) EBI Sequence Read Archive (ERA) (basecall + quality) fastq [ Study, Experiment, Sample, Run D-way spot basecaller
5 BLAST reciprocal best hit Linux BLAST Scientific Linux 6.1 Live USB ncbi blast+blast SELECT RNA-seq trinity TAIR10 unix like cd BLAST SELECT
6 R R multi-fasta N50
7 The International Plant & Animal Genome XX Conference µ
8 (DNARNA ) du linked loop adapter (NEB workshop) RNA-seq Ribo-zero (Epicentre)
9 Pacific Biosciences Workshop
10 Agilent Workshop QTL GWAS
11 GMOD
12 COMPLEX ADAPTIVE TRAITS Newsletter Vol. 2 No. 7 COMPLEX ADAPTIVE TRAITS Newsletter URLhttp://staff.aist.go.jp/t-fukatsu/SGJHome.html
Sequence Read Archive 2013 年年 10 月 25 日 第 10 回シーケンサー利利 用技術講習会 ( 理理研横浜 ) 1
Sequence Read Archive 1 塩基配列列データベース アノテーション DDBJ アセンブリ DDBJ Center アライメント シークエンシングと サンプリング Sequence Read Archive 2 増 大する SRA データ 千兆塩基 目前 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/traces/sra/ 3 SRA は INSDC の 一員 INSDC:
AJACS18_ ppt
1, 1, 1, 1, 1, 1,2, 1,2, 1 1 DDBJ 2 AJACS3 2010 6 414:20-15:20 2231 DDBJ DDBJ DDBJ DDBJ NCBI (GenBank) DDBJ EBI (EMBL-Bank) GEO DDBJ Omics ARchive(DOR) ArrayExpress DTA (DDBJ Trace Archive) DRA (DDBJ
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Sample 2 3 4 5 6 7 8 9 3 18 24 32 34 40 45 55 63 70 77 82 96 118 121 123 131 143 149 158 167 173 187 192 204 217 224 231 17 285 290 292 1 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38
15:0016:30 っ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ 9 10 っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ っ ょ
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塩基配列データベースを中心とした生物学系研究の情報基盤について 国立遺伝学研究所 DDBJセンター助教小笠原理 国立遺伝学研究所 遺伝研スパコン : 目的 1. 国際塩基配列データベース (International Nucleotide Sequence Database : INSD) の構築 2. 大学共同利用機関として 主に生物学医学系研究者への計算機資源の提供 遺伝研スパコン : 構成概略
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Q No.1441 Q No.1442 Vol.33 NO.9 (2009) 30 (614) Q No.1443 Vol.33 NO.9 (2009) 31 (615) Q No.1444 Vol.33 NO.9 (2009) 32 (616) Vol.33 NO.9 (2009) 33 (617) Vol.33 NO.9 (2009) 34 (618) Q No.1445 Vol.33 NO.9
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Vol.14 98 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 62 63 64 65 66 67 68
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塩基配列アーカイブのデータベース構築と統合への貢献 に関する成果報告 (H21 年度 ) 科学技術振興機構バイオインフォマティクス推進センター事業研究開発課題 バイオ情報資源の高準化と共用化 平成 21 年度研究開発実施報告書から抜粋 3.4 DDBJ Read Archive(DRA) 研究計画書
塩基配列アーカイブのデータベース構築と統合への貢献 に関する成果報告 (H21 年度 ) 科学技術振興機構バイオインフォマティクス推進センター事業研究開発課題 バイオ情報資源の高準化と共用化 平成 21 年度研究開発実施報告書から抜粋 3.4 DDBJ Read Archive(DRA) 研究計画書では新世代シーケンサ由来のデータへの取り組みを 国立遺伝学研究所の分担課題の中の 総括 メソッド オントロジーならびに
PowerPoint プレゼンテーション
DDBJ センターにおける 一次データベースの展開 児玉悠一 Kodama Yuichi, Ph.D DDBJ センター アノテータ DDBJ center, annotator http://www.slideshare.net/ddbjslide 現状 課題 対応 現状 DDBJ センターが運営するデータベース アノテーション アクセス制限データベース JGA 個人レベルの遺伝型と表現型 DDBJ
スライド 1
バイオインフォマティクス講習会 S3-01 高速シークエンサ由来配列のアーカイブ DB と解析パイプライン 神沼英里, 望月孝子, 長崎英樹, 児玉悠一, 小笠原理, 大久保公策, 高木利久, 中村保一 国立遺伝学研究所生命情報 DDBJ 研究センター 総合研究大学院大学遺伝学専攻 2013 年 9 月 12 日 ( 木 )9:30-10:10 第 31 回日本植物細胞分子生物学会大会 シンポジウム
The Empirical Study on New Product Concept of the Dish Washer Abstract
The Empirical Study on New Product Concept of the Dish Washer Abstract t t Cluster Analysis For Applications International Conference on Quality 96 in Yokohama Clustering Algorithms