はじめての医学系論文の探し方 医中誌 Web の基本的な検索の流れ 例題 1 高脂血症に関する国内の論文を探す 医中誌 Web 同時アクセス 12 い http://login.jamas.or.jp/enter.html 1 医中誌 Web (Ver.4) ログイン画面で ログインボタンをクリック 2 アドバンスドモードを選択 * 検索対象年変更可 新規検索 の検索語入力欄に高脂血症と入力し 検索ボタンをクリック ( 適宜条件設定 ) 4 検索結果の表示 ( 適宜 絞り込み検索等 ) 5 文献番号をクリックすると 詳細画面が表示される 6 本文を探すには UT Article Link 等のアイコンをクリック 7 画面右上の終了ボタンをクリックし その後ログアウトボタンをクリックして終了 ネットでアカテ ミック p.22 絞り込み検索画面 ( 例 : 原著論文 老人 合併症などの条件を追加 ) 注意 同じ項目内で条件を複数選択 OR 検索 異なる項目間で条件を選択 AND 検索 検索対象年の変更 検索履歴を掛け合わせて新たな検索も可能 ( 例 : #1 AND #2) 入力上の注意 著者名は 姓と名前の間にスペース不要例 ) 大江和彦 ohekazuhiko フレーズ検索例 ) blood pressure 検索対象の限定も可 p.6 参照 入力した 高脂血症 で全項目を検索するだけでなく 対応するシソーラス用語 脂質異常症 とその下位語からも自動的に検索してくれる /TH シソーラス用語 (Thesaurus) を検索 /AL 全項目 ( タイトル 抄録等 ) を検索 1
4 検索結果一覧 印刷 ダウンロード メール送信 クリップボード ( 一時保存 & まとめ印刷 ) 文献管理ツールへデータを保存 (RefWorks EndNote EndNote Web) 5 6 シソーラス用語 論文の内容を表すキーワード 専門スタッフがシソーラス ( 上位語 下位語を整理した用語集 ) に基づき 統一されたキーワードを各論文に付与している これによって検索モレを防ぐことや 探したい主題の論文に絞り込むことができる (p.6 参照 ) * が付いたものは メジャー統制語 中心主題に付される 補足 <Pre 医中誌 > データ シソーラス用語などがまだ付与されていない 新しいデータ タイトル 著者名 収録誌の情報 一部については抄録のみが表示 ( 最短で 1 ヶ月で掲載 正式なデータになるには 4~6 ヶ月程度要する ) 2
補足 アイコンについて 全文を入手するためには有料の場合もあるため 注意が必要 東京大学 OPAC へのリンク 東大に冊子体の雑誌が所蔵されているか検索可能 東京大学 UT Article Link ボタン 電子ジャーナルへのリンクや 冊子体の所蔵等も確認可能 メディカルオンラインデータベースへのリンク FAX FAX で全文を入手可能 FAX 送信お申込画面に必要事項を入力し送信すると 記入した FAX 番号に全文が届く ( 自宅の FAX でも OK) PDF 全文入手可能 国立情報学研究所 (NII) の論文情報提供データベース CiNii へのリンク 本文あり フルテキスト (PDF) を入手可能 雑誌によっては有料提供の場合もあり 文献単位で PubMed とリンク 一部の文献については フルテキストの閲覧が可能場合もあり 文献単位でオンラインジャーナルへリンク 東大で契約している電子ジャーナルの場合 無料で入手可能 文献単位でオンラインジャーナルへリンク 東大で契約している電子ジャーナルの場合 無料で入手可能 科学技術振興機構 (JST) の電子アーカイブへのリンク フルテキスト (PDF) が入手可能 補足 ボタンについて 本文入手なアイコンが無かったら UT Article Link アイコンをクリックしてください 本文へのリンクが表示される場合もあります 手順については リーフレット 文献探しのヒント 5 の p.4 をご覧ください
医中誌 Web の効果的な検索のために 1 複数検索語の掛け合わせ AND 検索 OR 検索 NOT 検索 胃癌緩和ケア 胃癌 or 胃潰瘍 外科手術 not 内視鏡手術 2 検索対象の限定 絞り込み検索 検索対象の限定 出版年 論文の種類 研究デザイン等で限定ができます 絞り込み検索 動物の種類 年齢 診断 治療 出版年 論文の種類等で絞り込みができます 検索項目を限定した検索 検索語入力欄のプルダウンメニューで特定の項目を設定し 検索することが可能です 入力欄にタグをつけて検索することも可能です 項目名タグ入力例備考 著者名 /au 大江和彦 /au ohekazuhiko/au 所属機関 /in 東京大学 /in 第一著者のみ 論文タイトル /ti 糖尿病 /ti 収録誌名 /jn 日本消化器外科学会雑誌 /jn 日整会誌 /jn 略称形も可 ( プルダウンメニューでも検索可 ) 統制語 ( シソーラス ) /th リラクゼーション /th メジャー統制語は /mth 4 履歴検索 検索履歴の掛け合わせ検索が可能です 例 ) #1 AND #2 5 完全一致検索 [ ] を付けると完全一致検索が可能 不要なものがヒットするのを防ぎます 完全一致の指定ができる項目は 著者名 収録誌名 所属機関名 特集名のみです 例 ) [ 内科 ]/jn 雑誌 内科 のみヒット 4
ちょっと上級編 シソーラス用語を使った検索 自動的にではなく 自分でシソーラスを参照して検索に使う場合 ( シソーラス用語だけで検索する方法 ) 例題 2 リラックスに関する論文をシソーラス用語を使って探す 1 候補語辞書の参照 でメニューから シソーラス を選択 キーワードを入力し参照ボタンをクリック 2 入力したことばから導き出された同義語と 見出し語 (= 統制語 シソーラス用語 ) が表示される シソーラス ボタンをクリックすると シソーラス用語の階層関係を確認できる 4 適当なものを選んでチェックし 採用ボタンをクリックする 5 新規検索 の検索語入力欄にシソーラス用語が入る 検索ボタンをクリック ( 以降は p.1 参照 ) 思いつくことばを入力 1 2 対応するシソーラス用語へ誘導 リラックス のシソーラス用語が リラクゼーション であることがわかる 4 階層 ( ツリー構造 ) の表示 シソーラス用語が検索式に入るので 検索ボタンをクリック シソーラス用語 リラクゼーション とその下位語 休息 が付与されたデータを検索 5 番外篇 : こんな機能もあります 次の参考文献の雑誌タイトルの正式名称を調べる 堀江義則, 石井裕正 : 重症型アルコール性肝炎の全国調査. 日消誌 99 : 126-1, 2002 5
PubMed の基本的な検索の流れ PubMed 例題 stomach cancer( 胃癌 ) についての英語論文を探す P http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?otool=ijputmlib 東大専用入口 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez 1 検索画面で検索語を入力 ( 必要に応じて 論理演算子 (AND/OR/NOT) を半角大文字で入力 ) 2 Limits で適宜絞り込み条件を設定 Search ボタンをクリック 4 検索結果一覧が表示される (Display Settings で表示形式を Abstract などに適宜選択可能 ) 5 論文名をクリックすると詳細画面が開く ネットでアカテ ミック p.22 6 本文を見るには Full Text ボタンまたは UT Article Link ボタンをクリック 精度の高いフレーズ検索の場合は ( ダブルクォーテーション ) が必要 例 ) blood pressure 殆どの場合は無くても自動的に検索 表示形式の設定 1 2 著者名は 苗字名前の頭文字 (+ ミドルネームの頭文字 例 ) suzuki a 2002 年以降はフルネームでも検索可能複数の検索語の掛け合わせ例 ) growth hormone OR gh 論理演算子 (AND OR NOT) は大文字 選択したデータの保存 メール送信など File: データのダウンロード Clipboard: 一時保存 ( ブラウザの印刷機能でまとめて印刷 ) E-Mail: メール送信 4 Limits( 絞り込み ) の変更 解除 クリックすると レビュー論文 ( 総説 ) だけが見られる 6 5 データベース側で付与した MeSH 用語 ( シソーラス用語 ) 6
検索式の確認 検索した後 どのような検索式が実行されたかを Search details で確認できる 必要なら修正して再検索 2011.1- はじめての医学系論文の探し方情報基盤センター学術情報リテラシー係 入力した stomach cancer で全項目を検索するだけでなく 対応するシソーラス用語 stomach neoplasms からも自動的に検索してくれる 参考 : CABG と入力して検索した場合 MeSH=Medical Subject Headings 米国国立医学図書館作成のシソーラス 入力した検索語 (CABG) だけで検索されいる MeSH 用語を自動的に検索しない場合もあるので注意 MeSH Terms( シソーラス用語 ) MeSH に基づいて付与された 論文の内容を表すキーワード 自動マッピング機能により 適切なものがあれば 入力した検索語だけでなく MeSH Terms からも自動的に検索 シソーラス用語をマスターしよう 論文の内容を表すキーワード 専門スタッフがシソーラス ( 上位語 下位語を整理した用語集 ) に基づいて 統制されたキーワードを各論文に付与している これによって検索漏れを防ぐことや 探したい主題の論文に絞り込むことができる 例えば ガンに関する論文を探したい 悪性腫瘍? 癌? 肉腫? 癌腫? 思いついたことばだけで検索するとそのことばが論文のタイトルや抄録等に無ければ ヒットしない 検索モレが生じる 悪性腫瘍 肉腫 癌腫 ひとつの概念に対して表現が複数ある場合 表現を統一 シソーラス用語 ( 統制語 ) 上位語 : 腫瘍 ( 広義 ) ツリー構造 論文 癌 下位語 : 乳癌 ( 狭義 ) : 子宮癌 : 肺癌 : 皮膚癌 精度の高い検索ができる! データベース提供側で各論文にシソーラス用語を付与 検索モレの防止 多様な検索が可能に シソーラス用語 : 癌 7
PubMed の効果的な検索のために 1 複数検索語の掛け合わせ AND 検索 OR 検索 NOT 検索 stomach cancer AND nutrition stomach stomach cancer cancer OR OR stomach stomach ulcer ulcer surgery NOT endoscope surgery 参考 スペースでも AND 検索しますが 例えば egg allergy と入力するとフレーズとして検索します 論理演算をしたい場合は egg AND allergy と入力すると 指示が明確になります 2 絞り込み Limits 機能を活用して条件を指定 文献タイプ 言語 動物 人間 性別 収録誌の種類 年齢等による限定が可能です 検索項目を限定した検索 特定の項目を対象に検索する場合は タグをつけて検索します タグ検索は自動マッピング機能は働きません 項目名 タグ 入力例 備考 smith re[au]( ミドルネームあり ) shimizu t[au] 著者 [au] smth r@[au](smith r だけをヒット ) shimizu takao[au] 2002 年以降ならフルネームでも検索可 所属機関 [ad] university of Tokyo[ad] 第一著者のみ 論文タイトル [ti] stomach cancer[ti] 収録誌名 [ta] british medical journal[ta] The は入れない bmj[ta] 略称形も可 出版年 [dp] 2010[dp] 2008:2010[dp] 2008/09:2010/0[dp] 出版タイプ [pt] review[pt] MeSH [mh] stomach neoplasms[mh] 4 Advanced Search タグを知らなくても プルダウンメーニューで検索項目を限定して検索することが可能です 検索履歴の掛け合わせ検索が可能です 例 ) #1 AND #2 5 前方一致検索 複数形のような語尾変化などに対応 自動マッピング機能は働きません 例 ) bacter* bacteria bacterium など bacterで始まるものを検索 * もっと詳しく知りたい方は 医学図書館作成のマニュアル PubMed の使い方 をご覧ください GACoS や医学図書館 HP に掲載 8
ちょっと上級編 MeSH 検索 : シソーラス用語による検索 1 トップ画面において Search のプルダウンメニューで検索対象を MeSH に選択 ( または More Resources で MeSH Database をクリック ) 2 検索語を入力し Search ボタンをクリック 検索結果の MeSH 用語一覧に適当なものがあれば 対応する Links から PubMed を選択して検索 1 ~ 5 : MeSH 用語をクリックすると 上 下位語 関連語や Subheading( 副標目 ) 等が表示されるので 適宜組み合わせをして検索することも可能 1 2 対応する MeSH 用語へ誘導 選択した MeSH 用語 ( 例.Stomach Neoplasms) で PubMed を検索 1 選択した MeSH 用語の Subheadings( 副標目 ) やツリー構造の表示画面へ 組合せると 多様な検索が可能 Subheadings を複数選択した場合の検索方法 1 MeSH 用語をクリック 2 Subheadings を複数選択 画面右上の Sendto から Search box with AND 等で Subheadings をどのように組合わせるか選択 4 画面上部に検索式が表示される ( 必要なら修正可 ) 5 Search PubMed ボタンをクリック 選択した MeSH 用語 ( 例.Stomach Neoplasms) を中心主題とする文献を PubMed で検索 チェックを付けなければ下位語も自動的に検索 2 MeSH 用語の上位語 下位語表示 Stomach Neoplasms は最下位語として位置づけられている 4 5 9
番外篇 : こんな機能もあります 1 2 1 臨床医学分野の文献を 目的のテーマで短時間に検索するのに便利です < アクセス > TOP PubMed Tools Clinical Queries 臨床研究カテゴリー therapy( 治療 ) diagnosis( 診断 ) etiology( 病因 ) prognosis( 予後 ) clinical prediction guides ( 臨床予測指針 ) 2 論文情報 ( 雑誌名 巻号等 ) から特定の論文をピンポイントで探せます < アクセス > TOP PubMed Tools Single Citation Matcher 例 ) J Allergy Clin Immunol 12(1) p. 11 に掲載された論文を探す 雑誌の略称名から正式名称を調べることができます < アクセス > TOP More Resources Journals in NCBI Databases 例 ) 雑誌の略称名 Mol Cancer Res の正式名称を調べる 選択した雑誌名で PubMed を検索 参考 CSLS search(pubmed に専門用語の日本語表示機能などを搭載した検索システム ) http://www.csls.c.u-tokyo.ac.jp/csls-search ( 東京大学生命科学構造化センター ) この資料に関するお問合せ : 東京大学情報基盤センター学術情報リテラシー係 TEL: 0-5841-2649( 内線 :22649) E-mail: literacy@lib.u-tokyo.ac.jp 10