はじめての医学系論文の探し方 1 日本語論文を探す ~ 医中誌 Web ~ 例題 1 高脂血症の食事療法に関する国内の論文を探す 医中誌 Web 同時アクセス 12 い http://login.jamas.or.jp/enter.html (2011 年 12 月 22 日 ver.5 第二段階リリース ) Ver.4 2012 年 1 月末クローズ予定 1 医中誌 Web ログイン画面で Ver.5 にログイン ボタンをクリック 2 検索語を入力し 検索ボタンをクリック * キーワード 1 つずつ検索するのがおすすめ 3 検索結果が表示される * 必要に応じて 履歴検索や 絞り込み検索が可能 4 文献番号をクリックすると 詳細画面が表示される 5 本文を探すには メディカルオンライン PDF UT Article Link 等のアイコンをクリック 6 画面右上の終了ボタンをクリックして終了 2-1 2-2 3-1 履歴検索 検索結果を組み合わせた検索が可能 (AND/OR/NOT を選択 ) 2-1 の検索結果 2-2 の検索結果 POINT! 検索履歴に表示される TH や AL とは? /TH シソーラス用語 (Thesaurus) を検索 主題による検索が可能 /AL 全項目を検索 ( 例 ) 食事療法 /AL タイトルや抄録などに 食事療法 という単語 ( 文字列 ) が含まれているものを検索 食事療法 /TH シソーラス用語としての 食事療法 というキーワードが付けられているものを検索 医中誌 Web では 自動マッピング機能により 入力語に対応するシソーラス用語があれば 自動的に入力語と合わせて検索される シソーラス用語とは 論文の内容を表すキーワード 専門スタッフがシソーラス ( 上位語 下位語を整理した用語集 ) に基づき 統制されたキーワードを各論文に付与している これによって検索モレを防ぐことや 探したい主題の論文を検索できる (p.7 参照 ) 1
( 前のページから続く ) 3-2 絞り込み検索 絞り込み検索画面 例 : 論文種類 : 解説 日本語 ヒト など条件指定して 絞り込み実行 ボタンをクリック 4 検索結果一覧 検索結果詳細 印刷 ダウンロード メール送信 クリップボード ( 一時保存 & まとめ印刷 ) 文献管理ツールへデータを保存 (RefWorks EndNote EndNote Web) シソーラス用語 医中誌が作成する 医学用語シソーラス に登録された用語 医中誌フリーキーワード 上記のシソーラスには登録されていないが 索引上重要として別途管理されている語 * の付いた語は中心的な主題 ( メジャー統制語 ) チェックタグ 論文の 対象 を表す 5 2
補足 <Pre 医中誌 > データ シソーラス用語などがまだ付与されていない 新しいデータ タイトル 著者名 収録誌の情報 一部については抄録のみが表示 ( 最短で 1 ヶ月で掲載 正式なデータになるには 4~6 ヶ月程度要する ) 補足 アイコンについて 全文を入手するためには有料の場合もあるため 注意が必要 東京大学 OPAC へのリンク 東大に冊子体の雑誌が所蔵されているか検索可能 東京大学 UT Article Link ボタン 本文入手可能なアイコンが無ければこれをクリック 電子ジャーナルへのリンクや 冊子体の所蔵等を確認可能 参照 : 文献探しのヒント 2 データベースの検索結果で本文へのリンクがなかったら? メディカルオンラインデータベースへのリンク FAX FAX で全文を入手可能 FAX 送信申込画面に必要事項を入力し送信すると 記入した FAX 番号に全文が届く ( 自宅の FAX でも OK) PDF 全文入手可能 国立情報学研究所 (NII) の論文情報提供データベース CiNii へのリンク 本文あり フルテキスト (PDF) を入手可能 雑誌によっては有料提供の場合もあり 文献単位で PubMed とリンク 一部の文献については フルテキストの閲覧が可能な場合もあり 文献単位でオンラインジャーナルへリンク 東大で契約している電子ジャーナルの場合 無料で入手可能 文献単位でオンラインジャーナルへリンク 東大で契約している電子ジャーナルの場合 無料で入手可能 科学技術振興機構 (JST) の電子アーカイブへのリンク フルテキスト (PDF) が入手可能 例題 1- 応用 子供のアトピー性皮膚炎の治療に関する論文を探す 3
医中誌 Web の効果的な検索のために 1 複数検索語の掛け合わせ AND 検索 OR 検索 NOT 検索 胃癌緩和ケア 胃癌 or 胃潰瘍 外科手術 not 内視鏡手術 2 検索対象の限定 ( 絞り込み条件 ) 絞り込み条件 検索をする前にも ヒトの年齢 動物の種類 出版年 論文の種類等の条件設定が可能 3 検索項目を限定した検索 検索語入力欄の その他 プルダウンメニューで 特定の項目に限定して検索することが可能 入力欄にタグをつけて検索することも可能 項目タグ入力例備考 著者名 /au 清野宏 /au kiyonohiroshi/au フリガナでの検索はキヨノヒロシ /au 所属機関 /in 東京大学 /in 第一著者のみ 論文タイトル /ti エビデンス /ti 収載誌名 /jn 看護教育学研究 /jn 看教研 /jn 略称も可 ( プルダウンメニューでも可 ) 統制語 ( シソーラス ) /th 花粉症 /th メジャー統制語は花粉症 /mth 4 完全一致検索 [ ] を付けると完全一致検索 不要なものがヒットするのを防ぐ 完全一致の指定ができる項目は 著者名 収録誌名 所属機関名 特集名のみ 例 ) [ 清野宏 ]/AU 著者名 清野宏 のみヒット 清野宏美 等は除外される 4
ちょっと上級編 シソーラス用語による検索 自動的にではなく 自分でシソーラスを参照して検索に使う場合 ( シソーラス用語だけで検索する方法 ) 例題 2 リラックスに関する論文をシソーラス用語を使って探す 1 メニューバーの シソーラス参照 をクリック キーワードを入力し参照ボタンをクリック 2 入力したことばから導き出された同義語と候補リストが表示される 3 候補リストから適切なものを選んでクリック 4 そのシソーラス用語の副標目や上位語 下位語の階層構造が表示される 4 階層構造を確認して 適宜 下位語も検索する を選択し このキーワードで検索 をクリック 思いつくことばを入力 1 2 対応するシソーラス用語へ誘導 3 リラックス のシソーラス用語が リラクゼーション であることがわかる 4 階層 ( ツリー構造 ) の表示 番外篇 : こんな機能も 参考文献リスト内の 掲載雑誌略称の正式な誌名を調べる シソーラス参照画面で 収載誌名 を選択して略称を入力し 参照 をクリック 5
PubMed の基本的な検索の流れ 例題 3 PubMed stomach cancer( 胃癌 ) についての英語論文を探す P GACoS にリンクしている東大専用入口から利用すると UT Article Link ( リーフレット 文献探しのヒント 2 参照 ) ボタンが表示され 電子ジャーナルへのアクセス等に案内される http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?otool=ijputmlib 東大専用入口 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ 1 検索画面で検索語を入力 ( 必要に応じて 論理演算子 (AND/OR/NOT) を半角大文字で入力 ) 2 Limits で適宜絞り込み条件を設定 3 Search ボタンをクリック 4 検索結果一覧が表示される (Display Settings で表示形式を Abstract などに適宜選択可能 ) 5 論文名をクリックすると詳細画面が開く 6 本文を見るには Full Text ボタンまたは UT Article Link ボタンをクリック 1 2 3 精度の高いフレーズ検索の場合は ( ダブルクォーテーション ) が必要 例 ) blood pressure ほとんどの場合は無くても自動的にフレーズ検索 ( 検索式の確認が必要 次ページ参照 ) 表示形式の設定 Limits 画面で条件設定が可能 ( 例 ) Humans English MEDLINE 選択したデータの保存 メール送信など File: データのダウンロード Clipboard: 一時保存 ( ブラウザの印刷機能でまとめて印刷等 ) E-Mail: メール送信 Limits( 絞り込み ) の変更 解除 4 クリックすると レビュー論文 ( 総説 ) だけが見られる 5 6 データベース側で付与した MeSH 用語 ( シソーラス用語 ) 6
検索式の確認 検索した後 どのような検索式が実行されたかを Search details で確認できる 必要なら修正して再検索 2012.1- はじめての医学系論文の探し方情報基盤センター学術情報リテラシー係 入力した stomach cancer で全項目を検索するだけでなく 対応するシソーラス用語 stomach neoplasms からも自動的に検索している 参考 : CABG( 冠動脈バイパス術 coronary artery bypass graft) と入力して検索した場合 入力した検索語 (CABG) だけで検索されている このように MeSH 用語を自動的に検索しない場合もあるので注意 MeSH=Medical Subject Headings 米国国立医学図書館作成のシソーラス MeSH Terms( シソーラス用語 ) MeSH に基づいて付与された 論文の内容を表すキーワード 自動マッピング機能により 適切なものがあれば 入力した検索語だけでなく MeSH Terms からも自動的に検索 シソーラス用語をマスターしよう 論文の内容を表すキーワード 専門スタッフがシソーラス ( 上位語 下位語を整理した用語集 ) に基づいて 統制されたキーワードを各論文に付与している これによって検索漏れを防ぐことや 探したい主題の論文に絞り込むことができる 例 例えば ガンに関する論文を探したい 悪性腫瘍? 癌? 肉腫? 癌腫? 思いついたことばだけで検索するとそのことばが論文のタイトルや抄録等に無ければ ヒットしない 検索モレが生じる 悪性腫瘍 肉腫 癌腫 ひとつの概念に対して表現が複数ある場合 表現を統一 シソーラス用語 ( 統制語 ) 上位語 : 腫瘍 ( 広義 ) ツリー構造 論文 癌 下位語 : 乳癌 ( 狭義 ) : 子宮癌 : 肺癌 : 皮膚癌 精度の高い検索ができる! データベース提供側で各論文にシソーラス用語を付与 検索モレの防止 多様な検索が可能に シソーラス用語 : 癌 7
PubMed の効果的な検索のために 1 複数検索語の掛け合わせ PubMed の場合 検索用の演算子 (and, or, not など ) は半角大文字で入力 AND 検索 OR 検索 NOT 検索 stomach cancer AND nutrition stomach stomach cancer cancer OR OR stomach stomach ulcer ulcer surgery NOT endoscopic surgery 参考 スペースでも AND 検索しますが 例えば egg allergy と入力するとフレーズとして検索します 論理演算をしたい場合は egg AND allergy と入力すると 指示が明確になります 2 絞り込み Limits 機能を活用して条件を指定 文献タイプ 言語 動物 人間 性別 収録誌の種類 年齢等による限定が可能 3 検索項目を限定した検索 特定の項目を対象に検索する場合は タグをつけて検索 タグ検索は自動マッピング機能は働かないため注意 項目名 タグ 入力例 備考 smith re[au]( ミドルネームあり ) miyazono k[au] 著者 [au] smith r@[au](smith rだけをヒット ) miyazono kohei[au] 2002 年以降ならフルネームでも検索可 所属機関 [ad] university of Tokyo[ad] 第一著者のみ 論文タイトル [ti] stomach cancer[ti] 収録誌名 [ta] british medical journal[ta] The は入れない bmj[ta] 略称形も可 出版年 [dp] 2011[dp] 2009:2011[dp] 2009/09:2011/03[dp] 出版タイプ [pt] review[pt] MeSH [mh] stomach neoplasms[mh] 4 Advanced Search タグを知らなくても プルダウンメニューで検索項目を限定して検索することが可能 検索履歴の掛け合わせ検索が可能 例 ) #1 AND #2 5 前方一致検索 複数形のような語尾変化などに対応 自動マッピング機能は働かないため注意 例 ) bacter* bacteria bacterium など bacterで始まるものを検索 * もっと詳しく知りたい方は 医学図書館作成のマニュアル PubMed の使い方 をご覧ください GACoS や医学図書館 HP に掲載 8
ちょっと上級編 MeSH 検索 : シソーラス用語による検索 1 トップ画面において Search のプルダウンメニューで検索対象を MeSH に選択 ( または More Resources で MeSH Database をクリック ) 2 検索語を入力し Search ボタンをクリック 3 検索結果の MeSH 用語一覧に適切なものがあれば選択して検索 1 ~ 5 : MeSH 用語をクリックすると 上 下位語 関連語や Subheading( 副標目 ) 等が表示されるので 適宜組み合わせをして検索することも可能 1 対応する MeSH 用語へ誘導 1 3 2 Subheadings を複数選択する場合の検索方法 1 MeSH 用語をクリック 2 Subheadings を選択 3 画面右上の Add to search builder で Subheadings をどのように組合わせるか選択 4 2 と 3 を繰り替えす ( 画面上部に検索式が表示される 必要なら修正可 ) 5 Search PubMed ボタンをクリック 選択した MeSH 用語の Subheadings( 副標目 ) やツリー構造の表示画面へ 組合せると 多様な検索が可能 選択した MeSH 用語 ( 例.Stomach Neoplasms) で PubMed を検索 3 2 選択した MeSH 用語 ( 例.Stomach Neoplasms) を中心主題とする文献を PubMed で検索 チェックを付けなければ下位語も自動的に検索 4 5 MeSH 用語の上位語 下位語表示 Stomach Neoplasms は最下位語として位置づけられている 9
番外篇 : こんな機能も 1 2 3 1 臨床医学分野の文献を 目的のテーマで短時間に検索するのに便利です < アクセス > TOP PubMed Tools Clinical Queries 臨床研究カテゴリー therapy( 治療 ) diagnosis( 診断 ) etiology( 病因 ) prognosis( 予後 ) clinical prediction guides ( 臨床予測指針 ) 2 論文情報 ( 雑誌名 巻号等 ) から特定の論文をピンポイントで探せます < アクセス > TOP PubMed Tools Single Citation Matcher 例 ) J Allergy Clin Immunol 123(1) p.3 11 に掲載された論文を探す 3 雑誌の略称名から正式名称を調べることができます < アクセス > TOP More Resources Journals in NCBI Databases 例 ) 雑誌の略称名 Mol Cancer Res の正式名称を調べる 選択した雑誌名で PubMed を検索 参考 CSLS search(pubmed に専門用語の日本語表示やクラスタリング機能等を搭載した検索システム ) http://www.csls.c.u-tokyo.ac.jp/csls/index.html ( 東京大学教養学部附属教養教育高度化機構生命科学高度化部門が提供 ) この資料に関するお問合せ : 東京大学情報基盤センター学術情報リテラシー係 TEL: 03-5841-2649( 内線 :22649) E-mail: literacy@lib.u-tokyo.ac.jp 10