Microsoft Word - PubMed.JP操作マニュアル_1.07.docx

日 本 語 で PubMed 検 索 PubMed.JP 操 作 マニュアル Ver1.0.7 世 界 最 大 級 の 医 学 生 物 学 文 献 データベース PubMed(パブメド)を 日 本 語 で 検 索 できる Windows アプリケーション 日 本 語 で PubMed 検 索 PubMed.JP がついに 登 場! トラストメディカル 株 式 会 社

目 次 1. はじめに... 3 1.1. 概 要... 3 1.2. 主 な 機 能... 3 1.3. 動 作 環 境... 3 2. 準 備... 4 2.1. インストール... 4 2.2. 起 動... 4 2.3. シリアル 番 号 の 入 力... 5 2.4. 終 了... 5 2.5. アンインストール... 5 3. 使 い 方...6 3.1. 先 ず 検 索 してみましょう... 6 3.2. 検 索 結 果 を PubMed で 確 認 する... 6 3.3. 辞 書 展 開 語 毎 のヒット 件 数 を 確 認 する... 9 3.4. 辞 書 展 開 語 を 複 数 指 定 した 検 索... 9 3.5. その 他 検 索 オプションの 指 定... 10 3.5.1. 検 索 方 法... 10 3.5.2. 発 行 年... 11 3.5.3. 日 本 語 文 献... 12 3.5.4. フリーフルテキスト... 12 3.6. 検 索 語 の 履 歴... 12 3.7. 検 索 の 履 歴 表 示... 14 3.8. 標 題 一 覧 ウインドウの 表 示... 15 3.9. 標 題 一 覧 ウインドウの 更 新... 16 3.10. 該 当 文 献 の 表 示... 16 3.11. 表 題 一 覧 の 活 用... 17 日 本 語 で PubMed 検 索 に 関 するお 問 い 合 わせは 下 記 までお 願 いします ホームページ:http://pubmed.web.fc2.com/index.html メール:oda@neatnet.jp 2

1. はじめに 1.1. 概 要 日 本 語 で PubMed 検 索 PubMed.JP は PubMed(アメリカ 国 立 医 学 図 書 館 の 国 立 生 物 工 学 情 報 センター:NCBI が 運 営 する 無 料 の 文 献 検 索 サービス)を 日 本 語 キーワードで 検 索 する 文 献 検 索 プログラムです PubMed に 掲 載 されている 文 献 情 報 ( 書 誌 情 報 や 抄 録 )は 全 て 英 語 で 書 かれており 文 献 を 検 索 する 為 には 英 語 のキーワードを 指 定 する 必 要 があります しかし 専 門 性 が 高 く 日 々 変 化 する 医 薬 用 語 を 的 確 に 翻 訳 する 事 は 非 常 に 困 難 な 作 業 で 世 界 最 大 級 の 文 献 デー タベースが 十 分 生 かされていないのが 日 本 の 現 状 と 言 えます このような 問 題 を 解 決 するために 生 まれたのが 日 本 語 で PubMed 検 索 (PubMed.JP)です PubMed.JP には 医 薬 用 同 義 語 辞 書 が 搭 載 されており 入 力 した 用 語 を 自 動 的 に 翻 訳 して PubMed を 検 索 してくれます PubMed.JP により 今 まで 他 のツールで 翻 訳 していた 煩 わしい 作 業 が 不 要 になり 誰 でも 簡 単 に 文 献 検 索 ができるようになります 更 に PubMed.JP の 同 義 語 展 開 機 能 により 一 度 の 検 索 で 複 数 の 同 義 語 による 検 索 が 可 能 となり より 網 羅 性 が 高 く 漏 れ の 少 ない 検 索 結 果 が 得 られます また 発 行 年 指 定 日 本 語 文 献 指 定 フリーフルテキストの 有 無 等 PubMed でよく 使 われる 検 索 オプションを PubMed.JP の 画 面 から 指 定 することで 検 索 結 果 を 絞 り 込 むことができます 1.2. 主 な 機 能 入 力 した 用 語 を 日 本 語 から 英 語 へ 翻 訳 更 に 同 義 語 展 開 して PubMed を 検 索 します すべての 展 開 語 を OR 演 算 したヒット 件 数 と 展 開 語 毎 のヒット 件 数 を 表 示 します 検 索 結 果 のタイトル 一 覧 を PubMed.JP のウインドウに 表 示 します 検 索 結 果 を PubMed の Web 画 面 で 見 ることができます 複 数 のキーワードを 指 定 すると 同 義 語 展 開 結 果 に 対 する AND 検 索 を 行 います フリーワード 検 索 フレーズ 検 索 タイトル 内 検 索 を 選 択 できます 文 献 の 発 行 年 を 指 定 して 絞 り 込 むことができます 日 本 語 文 献 フリーフルテキスト 付 文 献 に 絞 り 込 むことができます 文 献 標 題 一 覧 を Excel へコピーやファイルへエクスポートすることができます 1.3. 動 作 環 境 動 作 OS:WindowsXP SP3 WindowsVista SP2(32/64bit) Windows7(32/64bit) インターネット 接 続 環 境 を 有 すること.NET Framework2.0 以 上 がインストールされていること (.NET Framework の 入 手 先 ) http://www.microsoft.com/downloads/details.aspx?familyid=0856eacb-4362-4b0d-8edd-a ab15c5e04f5&displaylang=ja 3

2. 準 備 2.1. インストール 圧 縮 ファイルを 解 凍 すると PubMed.JP と 言 うフォルダができますので 任 意 の 場 所 にコ ピーしてください 2.2. 起 動 PubMedJP.exe をダブルクリックして 起 動 します 操 作 の 詳 細 はウインドウ 上 部 の 情 報 表 示 ボタンをクリックしてオンラインマニュアルを 参 照 してください 情 報 表 示 ボタン 4

2.3. シリアル 番 号 の 入 力 PURIN を 起 動 して 初 めて 文 献 を 検 索 するとシリアル 番 号 入 力 画 面 が 表 示 されます 1 既 にシリアル 番 号 をお 持 ちの 方 は10 桁 のシリアル 番 号 を 入 力 して 次 へ ボタンを 押 してください 2 まだシリアル 番 号 をお 持 ちでない 場 合 後 で 入 力 する ボタンを 押 して 下 さい シリアル 番 号 注 :シリアル 番 号 と 有 効 期 限 及 びシリアル 番 号 の 入 手 方 法 に 関 しては ウインドウ 上 部 の 情 報 表 示 ボタンを 押 すと 確 認 できます 2.4. 終 了 ウインドウ 上 部 右 にある 印 の 部 分 をクリックしてください 2.5. アンインストール インストール 時 作 成 した PubMed.JP と 言 うフォルダを 削 除 してください 5

3. 使 い 方 3.1. 先 ず 検 索 してみましょう 探 したい 文 献 のキーワードを 検 索 語 エリアに 入 力 して Enter キーを 押 すか 文 献 総 数 検 索 ボタンを 押 すと キーワードを 翻 訳 し 更 に 同 義 語 展 開 し PubMed を 検 索 します 検 索 し た 結 果 は PubMed 検 索 結 果 に 辞 書 展 開 結 果 とヒットした 文 献 数 が 表 示 されます なおキー ワードをスペースで 区 切 り 複 数 指 定 すると AND 検 索 になります 注 : 入 力 したキーワードが 翻 訳 できない 場 合 ウインドウ 下 部 に 英 語 に 翻 訳 できませんでした と 表 示 されます その 場 合 には 他 の 用 語 を 入 力 するか 英 単 語 を 入 力 し 再 検 索 して 下 さい 3.2. 検 索 結 果 を PubMed で 確 認 する 検 索 した 結 果 を PubMed で 確 認 する 為 には PubMed 検 索 結 果 に 表 示 された 検 索 結 果 を ダブルクリックしてください Web ブラウザが 起 動 され PubMed の 検 索 結 果 一 覧 画 面 が 表 示 さ れます なお 起 動 されるブラウザは Windows 規 定 の Web ブラウザとなります 6

注 :PURIN に 表 示 されているヒット 件 数 と PubMed でのヒット 件 数 が 異 なる 場 合 があります ヒント:PubMed.JP から Web ブラウザ 経 由 で PubMed を 表 示 すると PubMed に 検 索 履 歴 が 残 ります 更 に 高 度 な 検 索 が 必 要 な 場 合 PubMed の 画 面 で 引 き 続 き 検 索 することができます Limits 絞 込 み 検 索 ができます Advanced search 検 索 履 歴 表 示 と 履 歴 同 士 の 演 算 ができます ヒント: 検 索 結 果 を 日 本 語 に 翻 訳 したい 場 合 Web ブラウザの 機 能 を 使 い 検 索 結 果 一 覧 等 を 翻 訳 することができます なお 機 械 翻 訳 ですので 正 しく 翻 訳 されない 場 合 があります 7

注 :ブラウザの 設 定 によっては Live Search で 翻 訳 と 表 示 される 場 合 があります 注 :あらかじめ FoxLingo アドオンをインストールしておいてください 8

3.3. 辞 書 展 開 語 毎 のヒット 件 数 を 確 認 する 辞 書 展 開 語 毎 のヒット 件 数 を 確 認 する 場 合 キーワードが 入 力 された 状 態 で キーワード 別 一 覧 ボタンを 押 してください PubMed 検 索 結 果 に 辞 書 展 開 した 用 語 毎 のヒット 件 数 が 表 示 されます 表 示 された 用 語 をダブルクリックすると Web ブラウザが 起 動 され PubMed の 検 索 結 果 一 覧 画 面 が 表 示 されます 3.4. 辞 書 展 開 語 を 複 数 指 定 した 検 索 PubMed 検 索 結 果 のチェックボックスにチェックを 入 れ PubMed へ ボタンを 押 すと 選 択 した 用 語 の OR 演 算 をした 検 索 結 果 が Web ブラウザに 表 示 されます 全 て 選 択 選 択 9

選 択 解 除 ボタンを 押 すと 全 てのチェックボックスを ON/OFF することができます なお 総 数 のチェックボックスが ON の 場 合 総 数 の 結 果 一 覧 が 表 示 されます 注 : 検 索 結 果 チェックボックスが 全 て OFF の 場 合 ウインドウ 下 に 文 献 検 索 した 用 語 をチェ ックしてください( 複 数 可 ) とメッセージが 表 示 され 検 索 結 果 が Web ブラウザに 表 示 され ません 3.5. その 他 検 索 オプションの 指 定 3.5.1. 検 索 方 法 次 の3つの 検 索 方 法 を 設 定 することができます 通 常 : 普 通 に PubMed 検 索 をする 場 合 と 同 じフリーワード 検 索 です フレーズ: 熟 語 や 文 章 を 検 索 する 場 合 単 語 の 順 番 通 りに 完 全 一 致 するものだけを 検 索 しま す タイトル 内 検 索 : 文 献 の 表 題 に 含 まれている 用 語 のみを 検 索 します ヒント: 通 常 検 索 では PubMed の 辞 書 (MeSH)による 用 語 補 完 が 働 き(automatic term mapping) ヒット 件 数 が 多 くなる 場 合 があります そのようなときにフレーズ 検 索 を 使 うと PubMed 側 での 用 語 補 完 が OFF になり ヒット 件 数 を 抑 えることが 出 来 ます 注 :フレーズ 検 索 では 複 数 の 用 語 をスペース 区 切 りで 指 定 する AND 検 索 はサポートされていま せん 複 数 用 語 の AND 検 索 をするときは 各 用 語 毎 に 検 索 をし PubMed の Advanced search 機 能 を 使 い 検 索 履 歴 の 演 算 をしてください 10

3.5.2. 発 行 年 発 行 年 フィールドを 指 定 することで 文 献 の 発 行 年 を 指 定 できます 注 :PubMed の 絞 込 み 検 索 画 面 (Limits)で Dates が 指 定 されている 場 合 PubMed 側 の 設 定 が 優 先 されます 11

3.5.3. 日 本 語 文 献 日 本 語 チェックボックスを ON にすると 日 本 語 で 書 かれた 文 献 に 絞 り 込 めます 注 :PubMed の 絞 込 み 検 索 画 面 (Limits)で Languages が 指 定 されている 場 合 PubMed 側 の 設 定 が 優 先 されます 3.5.4. フリーフルテキスト フリーフルテキスト チェックボックスを ON にすると フリーフルテキストが 入 手 可 能 な 文 献 に 絞 り 込 めます 注 :PubMed の 絞 込 み 検 索 画 面 (Limits)で TextOption が 指 定 されている 場 合 PubMed 側 の 設 定 が 優 先 されます ヒント: 日 本 語 と フリーフルテキスト チェックボックスを 同 時 に ON にすると 日 本 語 且 つフリーフルテキストが 入 手 可 能 な 文 献 に 絞 り 込 めます 3.6. 検 索 語 の 履 歴 検 索 語 エリア 右 側 をクリックすると 過 去 に 検 索 した 用 語 の 履 歴 が 表 示 されます プルダウ ンリストから 用 語 を 選 択 すると 選 択 した 用 語 が 検 索 語 エリアにコピーされます 12

注 : 検 索 語 の 履 歴 は PubMed.JP を 終 了 するとクリアされます 13

3.7. 検 索 の 履 歴 表 示 文 献 検 索 を 行 うとウインドウ 下 部 にある 検 索 の 履 歴 エリアに 検 索 条 件 とヒット 件 数 が 履 歴 として 残 ります 検 索 の 履 歴 をマウスで 選 択 すると 検 索 条 件 に 入 力 された 用 語 と 選 択 した オプション 及 び PubMed 検 索 結 果 が 再 現 されます 注 : 検 索 の 履 歴 は PubMed.JP を 終 了 するとクリアされます 14

3.8. 標 題 一 覧 ウインドウの 表 示 PubMed.JP は PubMed の 検 索 結 果 一 覧 を 表 示 する 標 題 一 覧 ウインドウを 表 示 することがで きます TITLE VIEW アイコンをクリックすると 非 表 示 になっていた 標 題 一 覧 がウインド ウ 右 側 に 表 示 されます また 標 題 一 覧 を 押 すと 選 択 した 用 語 の OR 演 算 をした 結 果 一 覧 が 表 示 されます なお 総 数 のチェックボックスが ON の 場 合 総 数 の 結 果 一 覧 が 表 示 されます 注 : 検 索 結 果 チェックボックスが 全 て OFF の 場 合 ウインドウ 下 に 文 献 検 索 した 用 語 をチェ ックしてください( 複 数 可 ) とメッセージが 表 示 され 標 題 一 覧 ウインドウの 表 示 は 変 化 しま せん ここをクリック 検 索 条 件 を 選 択 してから 表 題 一 覧 を 押 してください 15

3.9. 標 題 一 覧 ウインドウの 更 新 標 題 一 覧 ウインドウ 上 部 にあるボタンを 押 すと 表 示 内 容 が 更 新 されます > を 押 すと 次 のリストが 表 示 されます < を 押 すと 前 のリストが 表 示 されます を 押 すと 最 後 のリストが 表 示 されます を 押 すと 先 頭 のリストが 表 示 されます 表 示 数 を 選 択 すると 一 度 に 表 示 される 件 数 が 変 更 されます 3.10. 該 当 文 献 の 表 示 標 題 一 覧 ウインドウで 見 たい 文 献 をダブルクリックすると Web ブラウザが 起 動 され PubMed の Abstract 画 面 が 表 示 されます 16

3.11. 表 題 一 覧 の 活 用 表 題 一 覧 ウインドウで 文 献 を 選 択 してマウス 右 ボタンをクリックすると 以 下 のメニューが 表 示 されます ブラウザで 表 示 Web ブラウザが 起 動 され PubMed の Abstract 画 面 が 表 示 されます コピー 選 択 された 文 献 の 書 誌 情 報 がクリップボードにコピーされます すべてコピー 標 題 一 覧 に 表 示 されている 全 ての 文 献 書 誌 情 報 がクリップボードにコピーさ れます 名 前 を 付 けて 保 存 標 題 一 覧 に 表 示 されている 全 ての 文 献 書 誌 情 報 がテキストファイルに 保 存 されます ヒント:クリップボードにコピーされた 文 献 書 誌 情 報 を Excel にペーストすると 標 題 一 覧 に 表 示 されている 項 目 が Excel のセルに 分 割 されて 貼 り 付 けられます また 保 存 したテキス トファイルを Excel にドラッグ&ドロップしても 同 様 です 17