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- きみお ふくだ
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2 MPI Hello World I ( ) Hello World II ( ) I ( ) II ( ) ( sendrecv) π ( ) MPI fortran C wget yaguchi/riken2012/enshu2.zip unzip enshu2.zip 2 / 52
3 FORTRAN 3 / 52
4 MPI program main use mpi mpif.h i m p l i c i t none integer : : nprocs, myrank, i e r r c a l l m p i i n i t ( i e r r ) MPI c a l l mpi comm size (MPI COMM WORLD, nprocs, i e r r ) c a l l mpi comm rank (MPI COMM WORLD, myrank, i e r r ) c a l l m p i f i n a l i z e ( i e r r ) MPI end program main myrank fortran/template.f90 4 / 52
5 mpi init(ierr) MPI mpi comm size(mpi COMM WORLD,nprocs,ierr) nprocs MPI COMM WORLD MPI COMM WORLD mpi comm rank(mpi COMM WORLD,myrank,ierr) myrank MPI COMM WORLD mpi finalize(ierr) MPI 5 / 52
6 Hello World! hello world from hello world myrank hello world from 0 hello world from 2 hello world from 3 hello world from 1 mpifrtpx hello. f90 pjsub job. sh./a.out 6 / 52
7 Technical Computing Suite / a. out 7 / 52
8 #!/bin/sh #PJM -L rscgrp=school #PJM -L node=8 #PJM -L elapse=3:00 #PJM -j school = mpiexec n 4. / a. out fortran/job.sh 8 / 52
9 pjsub p j s t a t pjdel Hello World pjsub job. sh [INFO] PJM 0000 pjsub Job 1057 submitted job.sh.oxxxx XXXX hello world 9 / 52
10 mpi send(buff,count,datatype,dest,tag,comm,ierr) buff: count: datatype: MPI CHARACTER, MPI INTEGER, MPI DOUBLE PRECISION dest: tag: 0 comm: MPI COMM WORLD ierr: 10 / 52
11 mpi recv(buff,count,datatype,source,tag,comm,status,ierr) buff: count: datatype: MPI CHARACTER, MPI INTEGER, MPI DOUBLE PRECISION source: tag: comm: MPI COMM WORLD status: MPI STATUS SIZE. ierr: 11 / 52
12 Hello World (Part II) 0 0 hello world from 16 myrank hello world from 2 hello world from 3 hello world from 1 12 / 52
13 mpi wtime() double precision mpi barrier c a l l mpi barrier (MPI COMM WORLD, i e r r ) time0 = mpi wtime ( ) c a l l mpi barrier (MPI COMM WORLD, i e r r ) time1 = mpi wtime ( ) time1-time0 0 mpi barrier(comm,ierr) comm 13 / 52
14 mpi send 0 0 mpi wtime 1, 2, 4 n n p i [(i n)/p + 1, ((i + 1) n)/p] 14 / 52
15 program main use mpi i m p l i c i t none integer : : i, nprocs, myrank, i e r r integer, parameter : : n=10000 double precision : : v ( n ), w( n ) double precision : : res c a l l m p i i n i t ( i e r r ) c a l l mpi comm size (MPI COMM WORLD, nprocs, i e r r ) c a l l mpi comm rank (MPI COMM WORLD, myrank, i e r r ) do i=1,n v(i) = dsin(i*0.1d0) w(i) = dcos(i*0.1d0) end do res = 0.0d0 do i=1,n res = res + v(i)*w(i) end do p r i n t, res c a l l m p i f i n a l i z e ( i e r r ) end program main fortran/innerproduct.f90 15 / 52
16 reduction mpi reduce(sendbuff, recvbuff, count, datatype, op, root, comm, ierr) sendbuff: recvbuff: count: datatype: MPI DOUBLE PRECISION op: MPI SUM, MPI PROD, MPI MAX, MPI MIN root: comm: ierr: 16 / 52
17 allreduce mpi allreduce(sendbuff, recvbuff, count, datatype, op, comm, ierr) mpi reduce sendbuff: recvbuff: count: datatype: MPI DOUBLE PRECISION op: MPI SUM, MPI PROD, MPI MAX, MPI MIN root: ( ) comm: ierr: 17 / 52
18 broadcast mpi bcast(buff, count, datatype, root, comm, ierr) root buff buff buff: root count: datatype: MPI DOUBLE PRECISION root: comm: ierr: 18 / 52
19 mpi reduce 0 mpi bcast 0 mpi allreduce 19 / 52
20 send/recv mpi isend(buff,count,datatype,dest,tag,comm,request,ierr) mpi send mpi wait/mpi waitall buff: count: datatype: MPI CHARACTER, MPI INTEGER, MPI DOUBLE PRECISION dest: tag: comm: MPI COMM WORLD request: ierr: 20 / 52
21 mpi irecv(buff,count,datatype,source,tag,comm,request,ierr) mpi isend mpi wait/mpi waitall buff: count: datatype: MPI CHARACTER, MPI INTEGER, MPI DOUBLE PRECISION source: tag: comm: MPI COMM WORLD request: ierr: 21 / 52
22 mpi wait(request, status, ierr) isend/irecv request: status: isend ierr: mpi waitall(count, request, status, ierr) isend/irecv count: request: status: isend (MPI STATUS SIZE, ). ierr: 22 / 52
23 mpi sendrecv(sendbuff, sendcount, sendtype, dest, sendtag, recvbuff, recvcount, recvtype, source, recvtag, comm, status, ierr) sendbuff: sendcount: sendtype: MPI DOUBLE PRECISION dest: source sendtag: recvbuff: recvcount: recvtype: MPI DOUBLE PRECISION source: dest recvtag: comm: status: ierr: 23 / 52
24 a isend irecv, wait, waitall a sendrecv a hint: myrank 24 / 52
25 program main use mpi i m p l i c i t none integer : : i, nprocs, myrank, i e r r integer, parameter : : n=10 integer : : a ( n ) c a l l m p i i n i t ( i e r r ) c a l l mpi comm size (MPI COMM WORLD, nprocs, i e r r ) c a l l mpi comm rank (MPI COMM WORLD, myrank, i e r r ) do i =1,n a ( i ) = i + myrank 10 end do do i =1,n p r i n t, myrank, i, a ( i ) end do c a l l m p i f i n a l i z e ( i e r r ) end program main fortran/swap.f90 25 / 52
26 π MPI Init 26 / 52
27 program pi i m p l i c i t none integer, parameter : : n = integer : : i double precision : : x, dx, p dx = 1.0d0 / dble ( n ) p = 0.0d0 do i = 1,n x = dble ( i ) dx p = p + 4.0d0 / ( 1. 0 d0 + x 2) dx end do p r i n t, p end program fortran/pi.f90 27 / 52
28 C 28 / 52
29 MPI #include mpi. h i n t main ( i n t argc, char argv ) { i n t nprocs, myrank ; M P I I n i t (&argc,&argv ) ; MPI Comm size (MPI COMM WORLD,&nprocs ) ; MPI Comm rank (MPI COMM WORLD,&myrank ) ; mpi.h MPI MPI Finalize ( ) ; return 0; } MPI myrank c/template.c 29 / 52
30 MPI Init(&argc, &argv) MPI MPI Comm size(mpi COMM WORLD, &nprocs) nprocs MPI COMM WORLD MPI COMM WORLD MPI Comm rank(mpi COMM WORLD, &myrank) myrank MPI COMM WORLD MPI Finalize() MPI 30 / 52
31 Hello World! hello world from hello world myrank hello world from 0 hello world from 2 hello world from 3 hello world from 1 mpifccpx hello. c pjsub job. sh./a.out 31 / 52
32 Technical Computing Suite / a. out 32 / 52
33 #!/bin/sh #PJM -L rscgrp=school #PJM -L node=8 #PJM -L elapse=3:00 #PJM -j school = mpiexec n 4. / a. out fortran/job.sh 33 / 52
34 pjsub p j s t a t pjdel Hello World pjsub job. sh [INFO] PJM 0000 pjsub Job 1057 submitted job.sh.oxxxx XXXX hello world 34 / 52
35 int MPI Send(void * buff, int count, MPI Datatype datatype, int dest, int tag, MPI Comm comm) buff: count: datatype: MPI CHAR, MPI INT, MPI DOUBLE dest: tag: 0 comm: MPI COMM WORLD 35 / 52
36 int MPI Recv(void *buff, int count, MPI Datatype datatype, int source, int tag, MPI Comm comm, MPI Status *status) buff: count: datatype: MPI CHAR, MPI INT, MPI DOUBLE source: tag: comm: MPI COMM WORLD status: 36 / 52
37 Hello World (Part II) 0 0 hello world from 16 myrank hello world from 2 hello world from 3 hello world from 1 #include string. h char s t r [ 1 7 ] ; strcpy ( str, hello world from ) ; strcpy ( str, ) ; 37 / 52
38 double MPI Wtime() double MPI Barrier MPI Barrier (MPI COMM WORLD) time0 = MPI Wtime ( ) MPI Barrier (MPI COMM WORLD) time1 = MPI Wtime ( ) time1-time0 0 int MPI Barrier(comm) comm 38 / 52
39 MPI Send 0 0 MPI Wtime 1, 2, 4 n n p i [(i n)/p, ((i + 1) n)/p 1] 39 / 52
40 #include mpi. h #include stdio. h #include math. h i n t main ( i n t argc, char argv ) { i n t i, nprocs, myrank ; const i n t n=10000; double v [ n ], w[ n ] ; double res ; M P I I n i t (&argc,&argv ) ; MPI Comm size (MPI COMM WORLD,&nprocs ) ; MPI Comm rank (MPI COMM WORLD,&myrank ) ; for(i=0;i n;i++){ v[i] = sin(i*0.1); w[i] = cos(i*0.1); } res = 0.0; for(i=0;i n;i++){ res = res + v[i]*w[i]; } p r i n t f ( %f \n, res ) ; MPI Finalize ( ) ; return 0; } c/innerproduct.c 40 / 52
41 reduction int MPI Reduce(void *sendbuff, void *recvbuff, int count, MPI Datatype datatype, MPI Op op, int root, MPI Comm comm) sendbuff: recvbuff: count: datatype: MPI DOUBLE op: MPI SUM, MPI PROD, MPI MAX, MPI MIN root: comm: 41 / 52
42 allreduce int MPI Allreduce (void *sendbuff, void *recvbuff, int count, MPI Datatype datatype, MPI Op op, MPI Comm comm) mpi reduce sendbuff: recvbuff: count: datatype: MPI DOUBLE op: MPI SUM, MPI PROD, MPI MAX, MPI MIN root: ( ) comm: 42 / 52
43 broadcast int MPI Bcast( void *buff, int count, MPI Datatype datatype, int root, MPI Comm comm ) root buff buff buff: root count: datatype: MPI DOUBLE root: comm: 43 / 52
44 MPI Reduce 0 MPI Bcast 0 MPI Allreduce 44 / 52
45 Send/Recv int MPI Isend(void *buff, int count, MPI Datatype datatype, int dest, int tag, MPI Comm comm, MPI Request *request) MPI Send MPI Wait/MPI Waitall buff: count: datatype: MPI DOUBLE dest: tag: comm: MPI COMM WORLD request: 45 / 52
46 int MPI Irecv(void *buff, int count, MPI Datatype datatype, int source, int tag, MPI Comm comm, MPI Request *request) MPI Isend MPI Wait/MPI Waitall buff: count: datatype: MPI DOUBLE source: tag: comm: MPI COMM WORLD request: 46 / 52
47 int MPI Wait(MPI Request *request, MPI Status *status) isend/irecv request: status: isend int MPI Waitall(int count, MPI Request request[], MPI Status status[]) isend/irecv count: request: status: isend. 47 / 52
48 int MPI Sendrecv(void *sendbuff, int sendcount, MPI Datatype sendtype, int dest, int sendtag, void *recvbuff, int recvcount, MPI Datatype recvtype, int source, int recvtag, MPI Comm comm, MPI Status *status) sendbuff: sendcount: sendtype: MPI DOUBLE dest: source sendtag: recvbuff: recvcount: recvtype: MPI DOUBLE source: dest recvtag: comm: status: 48 / 52
49 a Isend Irecv, Wait, Waitall a Sendrecv a hint: myrank 49 / 52
50 #include mpi. h #include stdio. h # include math. h i n t main ( i n t argc, char argv ) { i n t i, nprocs, myrank ; const i n t n=10; i n t a [ n ] ; M P I I n i t (&argc,& argv ) ; MPI Comm size (MPI COMM WORLD,&nprocs ) ; MPI Comm rank (MPI COMM WORLD,&myrank ) ; for ( i =0; i <n ; i ++){ a [ i ] = i + myrank 10; } for ( i =0; i <n ; i ++){ p r i n t f ( %d, %d, %d \n, myrank, i, a [ i ] ) ; } MPI Finalize ( ) ; return 0; } c/swap.c 50 / 52
51 π MPI Init 51 / 52
52 #include stdio.h i n t main ( i n t argc, char argv ) { const i n t n= ; i n t i ; double x, dx, p ; dx = 1. 0 / ( double ) n ; p = 0. 0 ; for ( i =0; i <n ; i ++){ x = ( double ) i dx ; p = p / (1 + x x ) dx ; } p r i n t f ( %16.14 f \n, p ) ; return 0; } c/pi.c 52 / 52
para02-2.dvi
2002 2 2002 4 23 : MPI MPI 1 MPI MPI(Message Passing Interface) MPI UNIX Windows Machintosh OS, MPI 2 1 1 2 2.1 1 1 1 1 1 1 Fig. 1 A B C F Fig. 2 A B F Fig. 1 1 1 Fig. 2 2.2 Fig. 3 1 . Fig. 4 Fig. 3 Fig.
Microsoft PowerPoint - 演習２：MPI初歩.pptx
演習 2:MPI 初歩 - 並列に計算する - 2013 年 8 月 6 日 神戸大学大学院システム情報学研究科計算科学専攻横川三津夫 MPI( メッセージ パッシング インターフェース ) を使おう! [ 演習 2 の内容 ] はじめの一歩課題 1: Hello, world を並列に出力する. 課題 2: プロセス 0 からのメッセージを受け取る (1 対 1 通信 ). 部分に分けて計算しよう課題
演習準備 2014 年 3 月 5 日神戸大学大学院システム情報学研究科森下浩二 1 RIKEN AICS HPC Spring School /3/5
演習準備 2014 年 3 月 5 日神戸大学大学院システム情報学研究科森下浩二 1 演習準備の内容 神戸大 FX10(π-Computer) 利用準備 システム概要 ログイン方法 コンパイルとジョブ実行方法 MPI 復習 1. MPIプログラムの基本構成 2. 並列実行 3. 1 対 1 通信 集団通信 4. データ 処理分割 5. 計算時間計測 2 神戸大 FX10(π-Computer) 利用準備
untitled
RIKEN AICS Summer School 3 4 MPI 2012 8 8 1 6 MPI MPI 2 allocatable 2 Fox mpi_sendrecv 3 3 FFT mpi_alltoall MPI_PROC_NULL 4 FX10 /home/guest/guest07/school/ 5 1 A (i, j) i+j x i i y = Ax A x y y 1 y i
演習準備
演習準備 2014 年 3 月 5 日神戸大学大学院システム情報学研究科森下浩二 1 演習準備の内容 神戸大 FX10(π-Computer) 利用準備 システム概要 ログイン方法 コンパイルとジョブ実行方法 MPI 復習 1. MPIプログラムの基本構成 2. 並列実行 3. 1 対 1 通信 集団通信 4. データ 処理分割 5. 計算時間計測 2 神戸大 FX10(π-Computer) 利用準備
MPI usage
MPI (Version 0.99 2006 11 8 ) 1 1 MPI ( Message Passing Interface ) 1 1.1 MPI................................. 1 1.2............................... 2 1.2.1 MPI GATHER.......................... 2 1.2.2
Microsoft PowerPoint - KHPCSS pptx
KOBE HPC サマースクール 2018( 初級 ) 9. 1 対 1 通信関数, 集団通信関数 2018/8/8 KOBE HPC サマースクール 2018 1 2018/8/8 KOBE HPC サマースクール 2018 2 MPI プログラム (M-2):1 対 1 通信関数 問題 1 から 100 までの整数の和を 2 並列で求めなさい. プログラムの方針 プロセス0: 1から50までの和を求める.
Microsoft PowerPoint _MPI-03.pptx
計算科学演習 Ⅰ ( 第 11 回 ) MPI を いた並列計算 (III) 神戸大学大学院システム情報学研究科横川三津夫 yokokawa@port.kobe-u.ac.jp 2014/07/03 計算科学演習 Ⅰ:MPI を用いた並列計算 (III) 1 2014/07/03 計算科学演習 Ⅰ:MPI を用いた並列計算 (III) 2 今週の講義の概要 1. 前回課題の解説 2. 部分配列とローカルインデックス
WinHPC ppt
MPI.NET C# 2 2009 1 20 MPI.NET MPI.NET C# MPI.NET C# MPI MPI.NET 1 1 MPI.NET C# Hello World MPI.NET.NET Framework.NET C# API C# Microsoft.NET java.net (Visual Basic.NET Visual C++) C# class Helloworld
2 T 1 N n T n α = T 1 nt n (1) α = 1 100% OpenMP MPI OpenMP OpenMP MPI (Message Passing Interface) MPI MPICH OpenMPI 1 OpenMP MPI MPI (trivial p
22 6 22 MPI MPI 1 1 2 2 3 MPI 3 4 7 4.1.................................. 7 4.2 ( )................................ 10 4.3 (Allreduce )................................. 12 5 14 5.1........................................
Microsoft PowerPoint _MPI-01.pptx
計算科学演習 Ⅰ MPI を いた並列計算 (I) 神戸大学大学院システム情報学研究科谷口隆晴 yaguchi@pearl.kobe-u.ac.jp この資料は昨年度担当の横川先生の資料を参考にさせて頂いています. 2016/06/23 MPI を用いた並列計算 (I) 1 講義概要 分散メモリ型計算機上のプログラミング メッセージ パシング インターフェイス (Message Passing Interface,MPI)
Microsoft PowerPoint - 演習1：並列化と評価.pptx
講義 2& 演習 1 プログラム並列化と性能評価 神戸大学大学院システム情報学研究科横川三津夫 yokokawa@port.kobe-u.ac.jp 2014/3/5 RIKEN AICS HPC Spring School 2014: プログラム並列化と性能評価 1 2014/3/5 RIKEN AICS HPC Spring School 2014: プログラム並列化と性能評価 2 2 次元温度分布の計算
コードのチューニング
ハイブリッド並列 八木学 ( 理化学研究所計算科学研究機構 ) 謝辞 松本洋介氏 ( 千葉大学 ) KOBE HPC Spring School 2017 2017 年 3 月 14 日神戸大学計算科学教育センター MPI とは Message Passing Interface 分散メモリのプロセス間の通信規格(API) SPMD(Single Program Multi Data) が基本 -
C/C++ FORTRAN FORTRAN MPI MPI MPI UNIX Windows (SIMD Single Instruction Multipule Data) SMP(Symmetric Multi Processor) MPI (thread) OpenMP[5]
![C/C++ FORTRAN FORTRAN MPI MPI MPI UNIX Windows (SIMD Single Instruction Multipule Data) SMP(Symmetric Multi Processor) MPI (thread) OpenMP[5]](/thumbs/73/69613550.jpg "C/C++ FORTRAN FORTRAN MPI MPI MPI UNIX Windows (SIMD Single Instruction Multipule Data) SMP(Symmetric Multi Processor) MPI (thread) OpenMP[5]")
MPI ( ) snozawa@env.sci.ibaraki.ac.jp 1 ( ) MPI MPI Message Passing Interface[2] MPI MPICH[3],LAM/MPI[4] (MIMDMultiple Instruction Multipule Data) Message Passing ( ) (MPI (rank) PE(Processing Element)
PowerPoint プレゼンテーション
計算科学演習 I 第 8 回講義 MPI を用いた並列計算 (I) 2013 年 6 月 6 日 システム情報学研究科計算科学専攻 山本有作 今回の講義の概要 1. MPI とは 2. 簡単な MPI プログラムの例 (1) 3. 簡単な MPI プログラムの例 (2):1 対 1 通信 4. 簡単な MPI プログラムの例 (3): 集団通信 共有メモリ型並列計算機 ( 復習 ) 共有メモリ型並列計算機
目 目 用方 用 用 方
大 生 大 工 目 目 用方 用 用 方 用 方 MS-MPI MPI.NET MPICH MPICH2 LAM/MPI Ver. 2 2 1 2 1 C C++ Fortan.NET C# C C++ Fortan 用 行 用 用 用 行 用 言 言 言 行 生 方 方 一 行 高 行 行 文 用 行 If ( rank == 0 ) { // 0 } else if (rank == 1) {
¥Ñ¥Ã¥±¡¼¥¸ Rhpc ¤Î¾õ¶·
Rhpc COM-ONE 2015 R 27 12 5 1 / 29 1 2 Rhpc 3 forign MPI 4 Windows 5 2 / 29 1 2 Rhpc 3 forign MPI 4 Windows 5 3 / 29 Rhpc, R HPC Rhpc, ( ), snow..., Rhpc worker call Rhpc lapply 4 / 29 1 2 Rhpc 3 forign
120802_MPI.ppt
CPU CPU CPU CPU CPU SMP Symmetric MultiProcessing CPU CPU CPU CPU CPU CPU CPU CPU CPU CPU CPU CPU CP OpenMP MPI MPI CPU CPU CPU CPU CPU CPU CPU CPU CPU CPU MPI MPI+OpenMP CPU CPU CPU CPU CPU CPU CPU CP
I I / 47
1 2013.07.18 1 I 2013 3 I 2013.07.18 1 / 47 A Flat MPI B 1 2 C: 2 I 2013.07.18 2 / 47 I 2013.07.18 3 / 47 #PJM -L "rscgrp=small" π-computer small: 12 large: 84 school: 24 84 16 = 1344 small school small
演習 II 2 つの講義の演習 奇数回 : 連続系アルゴリズム 部分 偶数回 : 計算量理論 部分 連続系アルゴリズム部分は全 8 回を予定 前半 2 回 高性能計算 後半 6 回 数値計算 4 回以上の課題提出 ( プログラム + 考察レポート ) で単位
演習 II ( 連続系アルゴリズム ) 第 1 回 : MPI 須田研究室 M2 本谷徹 motoya@is.s.u-tokyo.ac.jp 2012/10/05 2012/10/18 補足 訂正 演習 II 2 つの講義の演習 奇数回 : 連続系アルゴリズム 部分 偶数回 : 計算量理論 部分 連続系アルゴリズム部分は全 8 回を予定 前半 2 回 高性能計算 後半 6 回 数値計算 4 回以上の課題提出
MPI MPI MPI.NET C# MPI Version2
MPI.NET C# 2 2009 2 27 MPI MPI MPI.NET C# MPI Version2 MPI (Message Passing Interface) MPI MPI Version 1 1994 1 1 1 1 ID MPI MPI_Send MPI_Recv if(rank == 0){ // 0 MPI_Send(); } else if(rank == 1){ // 1
Microsoft PowerPoint - 講義：片方向通信.pptx
MPI( 片方向通信 ) 09 年 3 月 5 日 神戸大学大学院システム情報学研究科計算科学専攻横川三津夫 09/3/5 KOBE HPC Spring School 09 分散メモリ型並列計算機 複数のプロセッサがネットワークで接続されており, れぞれのプロセッサ (PE) が, メモリを持っている. 各 PE が自分のメモリ領域のみアクセス可能 特徴数千から数万 PE 規模の並列システムが可能
NUMAの構成
メッセージパッシング プログラミング 天野 共有メモリ対メッセージパッシング 共有メモリモデル 共有変数を用いた単純な記述自動並列化コンパイラ簡単なディレクティブによる並列化 :OpenMP メッセージパッシング 形式検証が可能 ( ブロッキング ) 副作用がない ( 共有変数は副作用そのもの ) コストが小さい メッセージパッシングモデル 共有変数は使わない 共有メモリがないマシンでも実装可能 クラスタ
コードのチューニング
MPI による並列化実装 ~ ハイブリッド並列 ~ 八木学 ( 理化学研究所計算科学研究センター ) KOBE HPC Spring School 2019 2019 年 3 月 14 日 MPI とは Message Passing Interface 分散メモリのプロセス間の通信規格(API) SPMD(Single Program Multi Data) が基本 - 各プロセスが 同じことをやる
Sae x Sae x 1: 1. {x (i) 0 0 }N i=1 (x (i) 0 0 p(x 0) ) 2. = 1,, T a d (a) i (i = 1,, N) I, II I. v (i) II. x (i) 1 = f (x (i) 1 1, v(i) (b) i (i = 1,
( ) 1 : ( ) Sampling/Imporance resampling (SIR) Kiagawa (1993, 1996), Gordon(1993) EnKF EnKF EnKF 1CPU 1core 2 x = f (x 1, v ) y = h (x, w ) (1a) (1b) PF p(x y 1 ) {x (i) 1 }N i=1, p(x y ) {x (i) }N i=1
スライド 1
計算科学演習 MPI 基礎 学術情報メディアセンター情報学研究科 システム科学専攻中島浩 目次 プログラミングモデル SPMD 同期通信 / 非同期通信 MPI 概論 プログラム構造 Communicator & rank データ型 タグ 一対一通信関数 1 次元分割並列化 : 基本 基本的考え方 配列宣言 割付 部分領域交換 結果出力 1 次元分割並列化 : 高速化 通信 計算のオーバーラップ 通信回数削減
Microsoft PowerPoint MPI.v...O...~...O.e.L.X.g(...Q..)
MPI プログラミング Information Initiative Center, Hokkaido Univ. MPI ライブラリを利用した分散メモリ型並列プログラミング 分散メモリ型並列処理 : 基礎 分散メモリマルチコンピュータの構成 プロセッサエレメントが専用のメモリ ( ローカルメモリ ) を搭載 スケーラビリティが高い 例 :HITACHI SR8000 Interconnection
スライド 1
計算科学演習 MPI 基礎 学術情報メディアセンター 情報学研究科 システム科学専攻 中島浩 目次 プログラミングモデル SPMD 同期通信 / 非同期通信 MPI 概論 プログラム構造 Communicator & rank データ型 タグ 一対一通信関数 1 次元分割並列化 : 基本 基本的考え方 配列宣言 割付 部分領域交換 結果出力 1 次元分割並列化 : 高速化 通信 計算のオーバーラップ
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I 9 MPI (II) 2012 6 14 .. MPI. 1-3 sum100.f90 4 istart=myrank*25+1 iend=(myrank+1)*25 0 1 2 3 mpi_recv 3 isum1 1 isum /tmp/120614/sum100_4.f90 program sum100_4 use mpi implicit none integer :: i,istart,iend,isum,isum1,ip
Microsoft PowerPoint - 講義：コミュニケータ.pptx
コミュニケータとデータタイプ (Communicator and Datatype) 2019 年 3 月 15 日 神戸大学大学院システム情報学研究科横川三津夫 2019/3/15 Kobe HPC Spring School 2019 1 講義の内容 コミュニケータ (Communicator) データタイプ (Datatype) 演習問題 2019/3/15 Kobe HPC Spring School
Microsoft PowerPoint - S1-ref-F.ppt [互換モード]
![Microsoft PowerPoint - S1-ref-F.ppt [互換モード]](/thumbs/86/94184661.jpg "Microsoft PowerPoint - S1-ref-F.ppt [互換モード]")
課題 S1 解説 Fortran 言語編 RIKEN AICS HPC Summer School 2014 中島研吾 ( 東大 情報基盤センター ) 横川三津夫 ( 神戸大 計算科学教育センター ) MPI Programming 課題 S1 (1/2) /a1.0~a1.3, /a2.0~a2.3 から局所ベクトル情報を読み込み, 全体ベクトルのノルム ( x ) を求めるプログラムを作成する
演習１： 演習準備
演習 1: 演習準備 2013 年 8 月 6 日神戸大学大学院システム情報学研究科森下浩二 1 演習 1 の内容 神戸大 X10(π-omputer) について システム概要 ログイン方法 コンパイルとジョブ実行方法 OpenMP の演習 ( 入門編 ) 1. parallel 構文 実行時ライブラリ関数 2. ループ構文 3. shared 節 private 節 4. reduction 節
OpenMP¤òÍѤ¤¤¿ÊÂÎó·×»»¡Ê£±¡Ë
2011 5 26 scalar Open MP Hello World Do (omp do) (omp workshare) (shared, private) π (reduction) scalar magny-cours, 48 scalar scalar 1 % scp. ssh / authorized keys 133. 30. 112. 246 2 48 % ssh 133.30.112.246
<4D F736F F F696E74202D C097F B A E B93C782DD8EE682E890EA97705D>
並列アルゴリズム 2005 年後期火曜 2 限青柳睦 Aoyagi@cc.kyushu-u.ac.jp http//server-500.cc.kyushu-u.ac.jp/ 11 月 29( 火 ) 7. 集団通信 (Collective Communication) 8. 領域分割 (Domain Decomposition) 1 もくじ 1. 序並列計算機の現状 2. 計算方式およびアーキテクチュアの分類
nakao
Fortran+Python 4 Fortran, 2018 12 12 !2 Python!3 Python 2018 IEEE spectrum https://spectrum.ieee.org/static/interactive-the-top-programming-languages-2018!4 Python print("hello World!") if x == 10: print
OpenMP¤òÍѤ¤¤¿ÊÂÎó·×»»¡Ê£±¡Ë
2012 5 24 scalar Open MP Hello World Do (omp do) (omp workshare) (shared, private) π (reduction) PU PU PU 2 16 OpenMP FORTRAN/C/C++ MPI OpenMP 1997 FORTRAN Ver. 1.0 API 1998 C/C++ Ver. 1.0 API 2000 FORTRAN
smpp_resume.dvi
2 MPI sin@mikilab.doshisha.ac.jp MPIMPI(Message Passing Interface) MPI UNIX WindowsMac OS, MPI MPI MPI 2 MPI i j j i MPI 34. MPI PVM MPI PVM MPI PVM(Parallel Virtual Machine) PVM MPI MPI PVM MPI MPI Message
OpenMP¤òÍѤ¤¤¿ÊÂÎó·×»»¡Ê£²¡Ë
2013 5 30 (schedule) (omp sections) (omp single, omp master) (barrier, critical, atomic) program pi i m p l i c i t none integer, parameter : : SP = kind ( 1. 0 ) integer, parameter : : DP = selected real
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![Microsoft PowerPoint - MPIprog-C2.ppt [互換モード]](/thumbs/61/45436034.jpg "Microsoft PowerPoint - MPIprog-C2.ppt [互換モード]")
MPI によるプログラミング概要 ( その ) C 言語編 RIKEN AICS HPC Summer School 01 中島研吾 ( 東大 情報基盤センター ) 横川三津夫 ( 神戸大学 計算科学教育センター ) 1 概要 MPI とは MPI の基礎 :Hello World 全体データと局所データ グループ通信 (Collective Communication) 1 対 1 通信 (Peer-to-Peer
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![Microsoft PowerPoint - MPIprog-F2.ppt [互換モード]](/thumbs/88/116349618.jpg "Microsoft PowerPoint - MPIprog-F2.ppt [互換モード]")
MPI によるプログラミング概要 ( その ) Fortran 言語編 RIKEN AICS HPC Summer School 01 中島研吾 ( 東大 情報基盤センター ) 横川三津夫 ( 神戸大学 計算科学教育センター ) 1 概要 MPI とは MPI の基礎 :Hello World 全体データと局所データ グループ通信 (Collective Communication) 1 対 1 通信
joho07-1.ppt
0xbffffc5c 0xbffffc60 xxxxxxxx xxxxxxxx 00001010 00000000 00000000 00000000 01100011 00000000 00000000 00000000 xxxxxxxx x y 2 func1 func2 double func1(double y) { y = y + 5.0; return y; } double func2(double*
chap2.ppt
2. メッセージ通信計算 2.1 メッセージ通信プログラミングの基本 プログラミングの選択肢 特別な並列プログラミング言語を設計する occam (Inmos, 1984, 1986) 既存の逐次言語の文法 / 予約語をメッセージ通信を処理できるように拡張する 既存の逐次言語を用い メッセージ通信のための拡張手続のライブラリを用意する どのプロセスを実行するのか メッセージ通信のタイミング 中身を明示的に指定する必要がある
44 6 MPI 4 : #LIB=-lmpich -lm 5 : LIB=-lmpi -lm 7 : mpi1: mpi1.c 8 : $(CC) -o mpi1 mpi1.c $(LIB) 9 : 10 : clean: 11 : -$(DEL) mpi1 make mpi1 1 % mpiru
43 6 MPI MPI(Message Passing Interface) MPI 1CPU/1 PC Cluster MPICH[5] 6.1 MPI MPI MPI 1 : #include 2 : #include 3 : #include 4 : 5 : #include "mpi.h" 7 : int main(int argc,
I
I 1 2016.07.21 MPI OpenMP 84 1344 gnuplot Xming Tera term cp -r /tmp/160721 chmod 0 L x L y 0 k T (x, t) k: T t = k 2 T x 2 T t = s s : heat source 1D T (x, t) t = k 2 T (x, t) x 2 + s(x) 2D T (x,
XcalableMP入門
XcalableMP 1 HPC-Phys@, 2018 8 22 XcalableMP XMP XMP Lattice QCD!2 XMP MPI MPI!3 XMP 1/2 PCXMP MPI Fortran CCoarray C++ MPIMPI XMP OpenMP http://xcalablemp.org!4 XMP 2/2 SPMD (Single Program Multiple Data)
スライド 1
Parallel Programming in MPI part 2 1 1 Today's Topic ノンブロッキング通信 Non-Blocking Communication 通信の完了を待つ間に他の処理を行う Execute other instructions while waiting for the completion of a communication. 集団通信関数の実装 Implementation
Microsoft PowerPoint 並列アルゴリズム04.ppt
並列アルゴリズム 2005 年後期火曜 2 限 青柳睦 Aoyagi@cc.kyushu-u.ac.jp http://server-500.cc.kyushu-u.ac.jp/ 11 月 8 日 ( 火 ) 5. MPI の基礎 6. 並列処理の性能評価 1 もくじ 1. 序並列計算機の現状 2. 計算方式およびアーキテクチュアの分類 3. 並列計算の目的と課題 4. 数値計算における各種の並列化
XMPによる並列化実装2
2 3 C Fortran Exercise 1 Exercise 2 Serial init.c init.f90 XMP xmp_init.c xmp_init.f90 Serial laplace.c laplace.f90 XMP xmp_laplace.c xmp_laplace.f90 #include int a[10]; program init integer
スライド 1
目次 2.MPI プログラミング入門 この資料は, スーパーコン 10 で使用したものである. ごく基本的な内容なので, 現在でも十分利用できると思われるものなので, ここに紹介させて頂く. ただし, 古い情報も含まれているので注意が必要である. 今年度版の解説は, 本選の初日に配布する予定である. 1/20 2.MPI プログラミング入門 (1) 基本 説明 MPI (message passing
ex01.dvi
,. 0. 0.0. C () /******************************* * $Id: ex_0_0.c,v.2 2006-04-0 3:37:00+09 naito Exp $ * * 0. 0.0 *******************************/ #include int main(int argc, char **argv) double
XACC講習会
www.xcalablemp.org 1 4, int array[max]; #pragma xmp nodes p(*) #pragma xmp template t(0:max-1) #pragma xmp distribute t(block) onto p #pragma xmp align array[i] with t(i) int array[max]; main(int argc,
1.ppt
/* * Program name: hello.c */ #include int main() { printf( hello, world\n ); return 0; /* * Program name: Hello.java */ import java.io.*; class Hello { public static void main(string[] arg)
DKA ( 1) 1 n i=1 α i c n 1 = 0 ( 1) 2 n i 1 <i 2 α i1 α i2 c n 2 = 0 ( 1) 3 n i 1 <i 2 <i 3 α i1 α i2 α i3 c n 3 = 0. ( 1) n 1 n i 1 <i 2 < <i
149 11 DKA IEEE754 11.1 DKA n p(x) = a n x n + a n 1 x n 1 + + a 0 (11.1) p(x) = 0 (11.2) p n (x) q n (x) = x n + c n 1 x n 1 + + c 1 x + c 0 q n (x) = 0 (11.3) c i = a i a n (i = 0, 1,..., n 1) (11.3)
ex01.dvi
,. 0. 0.0. C () /******************************* * $Id: ex_0_0.c,v.2 2006-04-0 3:37:00+09 naito Exp $ * * 0. 0.0 *******************************/ #include int main(int argc, char **argv) { double
<4D F736F F F696E74202D D F95C097F D834F E F93FC96E5284D F96E291E85F8DE391E52E >
SX-ACE 並列プログラミング入門 (MPI) ( 演習補足資料 ) 大阪大学サイバーメディアセンター日本電気株式会社 演習問題の構成 ディレクトリ構成 MPI/ -- practice_1 演習問題 1 -- practice_2 演習問題 2 -- practice_3 演習問題 3 -- practice_4 演習問題 4 -- practice_5 演習問題 5 -- practice_6
ÊÂÎó·×»»¤È¤Ï/OpenMP¤Î½éÊâ¡Ê£±¡Ë
2015 5 21 OpenMP Hello World Do (omp do) Fortran (omp workshare) CPU Richardson s Forecast Factory 64,000 L.F. Richardson, Weather Prediction by Numerical Process, Cambridge, University Press (1922) Drawing
main() {... } main() { main() { main() {......... } } } main() { main() { main() {......... } } } main() { if(rank==)... } main() { if(rank==)... } main() { if(rank==x)... } P(N) P(N) / P(M) * ( M / N
86
86 86 86 main() {... } main() { main() { main() {......... } } } 86 main() { main() { main() {......... } } } main() { if(rank==)... } main() { if(rank==)... } main() { if(rank==x)... } 86 P(N) P(N) /
openmp1_Yaguchi_version_170530
並列計算とは /OpenMP の初歩 (1) 今 の内容 なぜ並列計算が必要か? スーパーコンピュータの性能動向 1ExaFLOPS 次世代スハ コン 京 1PFLOPS 性能 1TFLOPS 1GFLOPS スカラー機ベクトル機ベクトル並列機並列機 X-MP ncube2 CRAY-1 S-810 SR8000 VPP500 CM-5 ASCI-5 ASCI-4 S3800 T3E-900 SR2201
PowerPoint プレゼンテーション
AICS 公開ソフトウェア講習会 15 回 表題通信ライブラリと I/O ライブラリ 場所 AICS R104-2 時間 2016/03/23 ( 水 ) 13:30-17:00 13:30-13:40 全体説明 13:40-14:10 PRDMA 14:10-14:40 MPICH 14:40-15:10 PVAS 15:10-15:30 休憩 15:30-16:00 Carp 16:00-16:30
Ｃ言語によるアルゴリズムとデータ構造
Algorithms and Data Structures in C 4 algorithm List - /* */ #include List - int main(void) { int a, b, c; int max; /* */ Ÿ 3Ÿ 2Ÿ 3 printf(""); printf(""); printf(""); scanf("%d", &a); scanf("%d",
58 7 MPI 7 : main(int argc, char *argv[]) 8 : { 9 : int num_procs, myrank; 10 : double a, b; 11 : int tag = 0; 12 : MPI_Status status; 13 : 1 MPI_Init
![58 7 MPI 7 : main(int argc, char *argv[]) 8 : { 9 : int num_procs, myrank; 10 : double a, b; 11 : int tag = 0; 12 : MPI_Status status; 13 : 1 MPI_Init](/thumbs/57/39896772.jpg "58 7 MPI 7 : main(int argc, char *argv[]) 8 : { 9 : int num_procs, myrank; 10 : double a, b; 11 : int tag = 0; 12 : MPI_Status status; 13 : 1 MPI_Init")
57 7 MPI MPI 1 1 7.1 Bcast( ) allocate Bcast a=1 PE0 a=1 PE1 a=1 PE2 a=1 PE3 7.1: Bcast 58 7 MPI 7 : main(int argc, char *argv[]) 8 : { 9 : int num_procs, myrank; 10 : double a, b; 11 : int tag = 0; 12
double float
2015 3 13 1 2 2 3 2.1.......................... 3 2.2............................. 3 3 4 3.1............................... 4 3.2 double float......................... 5 3.3 main.......................
A/B (2018/06/08) Ver kurino/2018/soft/soft.html A/B
A/B (2018/06/08) Ver. 1.0 kurino@math.cst.nihon-u.ac.jp http://edu-gw2.math.cst.nihon-u.ac.jp/ kurino/2018/soft/soft.html 2018 6 8 A/B 1 2018 6 8 2 1 1 1.1 OHP.................................... 1 1.2
115 9 MPIBNCpack 9.1 BNCpack 1CPU X = , B =
115 9 MPIBNCpack 9.1 BNCpack 1CPU 1 2 3 4 5 25 24 23 22 21 6 7 8 9 10 20 19 18 17 16 X = 11 12 13 14 15, B = 15 14 13 12 11 16 17 18 19 20 10 9 8 7 6 21 22 23 24 25 5 4 3 2 1 C = XB X dmat1 B dmat2 C dmat
Platypus-QM β ( )
Platypus-QM β (2012.11.12) 1 1 1.1...................................... 1 1.1.1...................................... 1 1.1.2................................... 1 1.1.3..........................................
Microsoft PowerPoint - MPIprog-F1.ppt [互換モード]
![Microsoft PowerPoint - MPIprog-F1.ppt [互換モード]](/thumbs/89/98092870.jpg "Microsoft PowerPoint - MPIprog-F1.ppt [互換モード]")
MPI によるプログラミング概要 ( その 1) Fortran 言語編 RIKEN AICS HPC Summer School 2015 中島研吾 ( 東大 情報基盤センター ) 横川三津夫 ( 神戸大 計算科学教育センター ) 1 本 school の目的 並列計算機の使用によって, より大規模で詳細なシミュレーションを高速に実施することが可能になり, 新しい科学の開拓が期待される 並列計算の目的
(Microsoft PowerPoint \211\211\217K3_4\201i\216R\226{_\211\272\215\342\201j.ppt [\214\335\212\267\203\202\201[\203h])
![(Microsoft PowerPoint \211\211\217K3_4\201i\216R\226{_\211\272\215\342\201j.ppt [\214\335\212\267\203\202\201[\203h])](/thumbs/101/148628642.jpg "(Microsoft PowerPoint \211\211\217K3_4\201i\216R\226{_\211\272\215\342\201j.ppt [\214\335\212\267\203\202\201[\203h])")
RIKEN AICS Summer School 演習 3 4 MPI による並列計算 2012 年 8 月 8 日 神戸大学大学院システム情報学研究科山本有作理化学研究所計算科学研究機構下坂健則 1 演習の目標 講義 6 並列アルゴリズム基礎 で学んだアルゴリズムのいくつかを,MPI を用いて並列化してみる これを通じて, 基本的な並列化手法と,MPI 通信関数の使い方を身に付ける 2 取り上げる例題と学習項目
2 2.1 Mac OS CPU Mac OS tar zxf zpares_0.9.6.tar.gz cd zpares_0.9.6 Mac Makefile Mekefile.inc cp Makefile.inc/make.inc.gfortran.seq.macosx make
Sakurai-Sugiura z-pares 26 9 5 1 1 2 2 2.1 Mac OS CPU......................................... 2 2.2 Linux MPI............................................ 2 3 3 4 6 4.1 MUMPS....................................
課題 S1 解説 C 言語編 中島研吾 東京大学情報基盤センター
課題 S1 解説 C 言語編 中島研吾 東京大学情報基盤センター 内容 課題 S1 /a1.0~a1.3, /a2.0~a2.3 から局所ベクトル情報を読み込み, 全体ベクトルのノルム ( x ) を求めるプログラムを作成する (S1-1) file.f,file2.f をそれぞれ参考にする 下記の数値積分の結果を台形公式によって求めるプログラムを作成する
Microsoft Word - 計算科学演習第1回3.doc
スーパーコンピュータの基本的操作方法 2009 年 9 月 10 日高橋康人 1. スーパーコンピュータへのログイン方法 本演習では,X 端末ソフト Exceed on Demand を使用するが, 必要に応じて SSH クライアント putty,ftp クライアント WinSCP や FileZilla を使用して構わない Exceed on Demand を起動し, 以下のとおり設定 ( 各自のユーザ
Cプログラミング - 第8回 構造体と再帰
C 8 ( ) C 1 / 30 n! a n+2 = a n+1 + a n ( ) C 2 / 30 #include struct student{ char name[20]; int math; int phys; ; int main(void){ struct student a, b; struct student c={"frank", 90; ( ) C 3 /
(Basic Theory of Information Processing) Fortran Fortan Fortan Fortan 1
(Basic Theory of Information Processing) Fortran Fortan Fortan Fortan 1 17 Fortran Formular Tranlator Lapack Fortran FORTRAN, FORTRAN66, FORTRAN77, FORTRAN90, FORTRAN95 17.1 A Z ( ) 0 9, _, =, +, -, *,
I J
I 065763J 8 7 7 31 jikken/ +----- accumulation_demupa.c +----- accumulation_rain.c +----- frequency_demupa.c +----- frequency_rain.c +----- go.sh +----- graph_maker.sh +----- mesure-ryudai/ 2007/4/1 2007/6/30
内容に関するご質問は まで お願いします [Oakforest-PACS(OFP) 編 ] 第 85 回お試しアカウント付き並列プログラミング講習会 ライブラリ利用 : 科学技術計算の効率化入門 スパコンへのログイン テストプログラム起動 東京大学情報基盤セ
![内容に関するご質問は まで お願いします [Oakforest-PACS(OFP) 編 ] 第 85 回お試しアカウント付き並列プログラミング講習会 ライブラリ利用 : 科学技術計算の効率化入門 スパコンへのログイン テストプログラム起動 東京大学情報基盤セ](/thumbs/95/125947898.jpg "内容に関するご質問は まで お願いします [Oakforest-PACS(OFP) 編 ] 第 85 回お試しアカウント付き並列プログラミング講習会 ライブラリ利用 : 科学技術計算の効率化入門 スパコンへのログイン テストプログラム起動 東京大学情報基盤セ")
内容に関するご質問は ida@cc.u-tokyo.ac.jp まで お願いします [Oakforest-PACS(OFP) 編 ] 第 85 回お試しアカウント付き並列プログラミング講習会 ライブラリ利用 : 科学技術計算の効率化入門 スパコンへのログイン テストプログラム起動 東京大学情報基盤センター特任准教授伊田明弘 1 講習会 : ライブラリ利用 [FX10] スパコンへのログイン ファイル転送
Fundamental MPI 1 概要 MPI とは MPI の基礎 :Hello World 全体データと局所データタ グループ通信 (Collective Communication) 1 対 1 通信 (Point-to-Point Communication)
MPI 超 入門 (FORTRAN 編 ) 東京大学情報基盤センター Fundamental MPI 1 概要 MPI とは MPI の基礎 :Hello World 全体データと局所データタ グループ通信 (Collective Communication) 1 対 1 通信 (Point-to-Point Communication) Fundamental MPI 2 MPI とは (1/2)
Microsoft PowerPoint - MPIprog-C1.ppt [互換モード]
![Microsoft PowerPoint - MPIprog-C1.ppt [互換モード]](/thumbs/89/98092878.jpg "Microsoft PowerPoint - MPIprog-C1.ppt [互換モード]")
MPI によるプログラミング概要 ( その 1) C 言語編 RIKEN AICS HPC Summer School 2015 中島研吾 ( 東大 情報基盤センター ) 横川三津夫 ( 神戸大 計算科学教育センター ) 1 本 school の目的 並列計算機の使用によって, より大規模で詳細なシミュレーションを高速に実施することが可能になり, 新しい科学の開拓が期待される 並列計算の目的 高速
£Ã¥×¥í¥°¥é¥ß¥ó¥°(2018) - Âè11²ó – ½ÉÂꣲ¤Î²òÀ⡤±é½¬£² –
(2018) 11 2018 12 13 2 g v dv x dt = bv x, dv y dt = g bv y (1) b v 0 θ x(t) = v 0 cos θ ( 1 e bt) (2) b y(t) = 1 ( v 0 sin θ + g ) ( 1 e bt) g b b b t (3) 11 ( ) p14 2 1 y 4 t m y > 0 y < 0 t m1 h = 0001
<4D F736F F F696E74202D C097F B A E B93C782DD8EE682E890EA97705D>
並列アルゴリズム 2005 年後期火曜 2 限 青柳睦 Aoyagi@cc.kyushu-u.ac.jp http://server-500.cc.kyushu-u.ac.jp/ 10 月 18( 火 ) 4. 数値計算における各種の並列化 5. MPI の基礎 1 講義の概要 並列計算機や計算機クラスターなどの分散環境における並列処理の概論 MPI および OpenMP による並列計算 理工学分野の並列計算アルゴリズム
1.overview
村井均 ( 理研 ) 2 はじめに 規模シミュレーションなどの計算を うためには クラスタのような分散メモリシステムの利 が 般的 並列プログラミングの現状 半は MPI (Message Passing Interface) を利 MPI はプログラミングコストが きい 標 性能と 産性を兼ね備えた並列プログラミング 語の開発 3 並列プログラミング 語 XcalableMP 次世代並列プログラミング
Excel97関数編
Excel97 SUM Microsoft Excel 97... 1... 1... 1... 2... 3... 3... 4... 5... 6... 6... 7 SUM... 8... 11 Microsoft Excel 97 AVERAGE MIN MAX SUM IF 2 RANK TODAY ROUND COUNT INT VLOOKUP 1/15 Excel A B C A B
OpenMP (1) 1, 12 1 UNIX (FUJITSU GP7000F model 900), 13 1 (COMPAQ GS320) FUJITSU VPP5000/64 1 (a) (b) 1: ( 1(a))
OpenMP (1) 1, 12 1 UNIX (FUJITSU GP7000F model 900), 13 1 (COMPAQ GS320) FUJITSU VPP5000/64 1 (a) (b) 1: ( 1(a)) E-mail: {nanri,amano}@cc.kyushu-u.ac.jp 1 ( ) 1. VPP Fortran[6] HPF[3] VPP Fortran 2. MPI[5]
エラー処理・分割コンパイル・コマンドライン引数
L10(2017-12-05 Tue) : Time-stamp: 2017-12-17 Sun 11:59 JST hig. recv/send http://hig3.net ( ) L10 (2017) 1 / 21 IP I swallow.math.ryukoku.ac.jp:13 = 133.83.83.6:13 = : IP ( = ) (well-known ports), :. :,.
II ( ) prog8-1.c s1542h017%./prog8-1 1 => 35 Hiroshi 2 => 23 Koji 3 => 67 Satoshi 4 => 87 Junko 5 => 64 Ichiro 6 => 89 Mari 7 => 73 D
II 8 2003 11 12 1 6 ( ) prog8-1.c s1542h017%./prog8-1 1 => 35 Hiroshi 2 => 23 Koji 3 => 67 Satoshi 4 => 87 Junko 5 => 64 Ichiro 6 => 89 Mari 7 => 73 Daisuke 8 =>. 73 Daisuke 35 Hiroshi 64 Ichiro 87 Junko
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MPI によるプログラミング概要 課題 S1 S2 出題 Fortran 編 2012 年夏季集中講義中島研吾 並列計算プログラミング (616-2057) 先端計算機演習 (616-4009) 1 本授業の理念 より 並列計算機の使用によって, より大規模で詳細なシミュレーションを高速に実施することが可能になり, 新しい科学の開拓が期待される 並列計算の目的 高速 大規模 大規模 の方が 新しい科学
超初心者用
3 1999 10 13 1. 2. hello.c printf( Hello, world! n ); cc hello.c a.out./a.out Hello, world printf( Hello, world! n ); 2 Hello, world printf n printf 3. ( ) int num; num = 100; num 100 100 num int num num
08 p Boltzmann I P ( ) principle of equal probability P ( ) g ( )g ( 0 ) (4 89) (4 88) eq II 0 g ( 0 ) 0 eq Taylor eq (4 90) g P ( ) g ( ) g ( 0
08 p. 8 4 k B log g() S() k B : Boltzmann T T S k B g g heat bath, thermal reservoir... 4. I II II System I System II II I I 0 + 0 const. (4 85) g( 0 ) g ( )g ( ) g ( )g ( 0 ) (4 86) g ( )g ( 0 ) 0 (4
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MPI によるプログラミング概要 ( その 1) C 言語編 RIKEN AICS HPC Summer School 2014 中島研吾 ( 東大 情報基盤センター ) 横川三津夫 ( 神戸大 計算科学教育センター ) 1 本 school の目的 並列計算機の使用によって, より大規模で詳細なシミュレーションを高速に実施することが可能になり, 新しい科学の開拓が期待される 並列計算の目的 高速
01_OpenMP_osx.indd
OpenMP* / 1 1... 2 2... 3 3... 5 4... 7 5... 9 5.1... 9 5.2 OpenMP* API... 13 6... 17 7... 19 / 4 1 2 C/C++ OpenMP* 3 Fortran OpenMP* 4 PC 1 1 9.0 Linux* Windows* Xeon Itanium OS 1 2 2 WEB OS OS OS 1 OS
かし, 異なったプロセス間でデータを共有するためには, プロセス間通信や特殊な共有メモリ領域を 利用する必要がある. このためマルチプロセッサマシンの利点を最大に引き出すことができない. こ の問題はマルチスレッドを用いることで解決できる. マルチスレッドとは,1 つのプロセスの中に複 数のスレッド
0 並列計算について 0.1 並列プログラミングライブラリのメッセージパッシングモデル並列プログラムにはメモリモデルで分類すると, 共有メモリモデルと分散メモリモデルの 2 つに分けられる. それぞれ次のような特徴がある. 共有メモリモデル複数のプロセスやスレッドが事項する主体となり, 互いに通信や同期を取りながら計算が継続される. スレッド間の実行順序をプログラマが保証してやらないと, 思った結果が得られない.
86 8 MPIBNCpack 15 : int n, myid, numprocs, i; 16 : double pi, start_x, end_x; 17 : double startwtime = 0.0, endwtime; 18 : int namelen; 19 : char pro
85 8 MPIBNCpack 1CPU BNCpack MPIBNCpack 1 1 8.1 5.2 (5.1) f (a), f (b), f (x i ) PE reduce 1 0 1 1 + x 2 dx = π 4 mpi-int.c mpi-int-gmp.c mpi-int.c 2 : #include 3 : #include "mpi.h" 5 : 6 : #include
A/B (2018/10/19) Ver kurino/2018/soft/soft.html A/B
A/B (2018/10/19) Ver. 1.0 kurino@math.cst.nihon-u.ac.jp http://edu-gw2.math.cst.nihon-u.ac.jp/ kurino/2018/soft/soft.html 2018 10 19 A/B 1 2018 10 19 2 1 1 1.1 OHP.................................... 1
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005 9 7 1 1.1 1 Hello World!! 5 p r i n t f ( H e l l o World!! \ n ) ; 7 return 0 ; 8 } 1: 1 [ ] Hello World!! from Akita National College of Technology. 1 : 5 p r i n t f ( H e l l o World!! \ n ) ;
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( ) ( ) ( ) A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 (OUS) 9 26 1 / 28 ( ) ( ) ( ) A B C D Z a b c d z 0 1 2 9 (OUS) 9