Custom TaqMan Assay Design Tool インターネットオーダー方法 20010/06/01
Custom TaqMan Assay Design Tool 1. Custom TaqMan SNP Genotyping Assays P.5 2. Custom TaqMan Gene Expression Assays P.21 3. カスタムデザインでのオーダー P.30 4. デザイン済みアッセイの再注文 P.35 5. デザイン済みアッセイの閲覧 P.40 6. 関連資料 P.46 2
Custom TaqMan Assay Design Tool Custom TaqMan Assay Design Toolとは? Custom TaqMan SNP Genotyping Assays 及びCustom TaqMan Gene Expression Assaysのデザイン オーダーを行うインターネットツールです 3
Custom TaqMan Assay Design Tool Custom TaqMan Assay Design Tool を利用するには? 以下のサイトへアクセスします https://www5.appliedbiosystems.com/tools/cadt/ ユーザー IDをお持ちでない方は 以下のアプライドバイオシステムズジャパン社ホームページの インターネットオーダーシステムご利用案内 よりユーザー IDの登録をお願いします 以下のサイトへアクセスします http://www.appliedbiosystems.co.jp/website/jp/store/pages.jsp?pgcd=15 4
5 Custom TaqMan SNP Genotyping Assays
Custom TaqMan SNP Genotyping Assays 以下のサイトへアクセスします https://www5.appliedbiosystems.com/tools/cadt/ 6
Custom TaqMan SNP Genotyping Assays Order Custom Genotyping Assays をクリック 7
Custom TaqMan SNP Genotyping Assays 1 つの配列に複数の SNP サイトを入力できますが テ サ インが最適である 1 つのアッセイのみ出荷されます どのターケ ットサイトでアッセイが構築されているかは 後述の SNP Name から判断できます 複数の SNP サイトを入力する場合 SNP 間が 2 塩基以上あいていないとテ サ インすることができません SNP サイト上下流 2bp は N を入力することはできません 配列名を入力英数字および.-,_ で 10 文字以内この名前がチューブに記載されます 特徴的な名前を入力します 塩基配列を入力テキスト情報をコピー後 Ctr+Vでペーストも可 ATGCおよびNで入力 ( 最低 61bp 300bp 以上推奨最大 5000bp) SNPサイトから配列の両端へは30bp 以上確保 SNPサイトの指定例 )[C/T] insertion deletionの指定例 )[ATG/*] 最大 6 塩基まで MNPの指定例 )[TC/CT] 最大 6 塩基まで注意 : 配列内にある目的外のSNPはNでマスクします 8
Custom TaqMan SNP Genotyping Assays 重要 : ヒト Y 染色体上の SNP アッセイは Non-Human 製品としてご注文ください 1 生物種 スケールの選択 2Check Format をクリック 9
Custom TaqMan SNP Genotyping Assays SNP Nameを入力英数字 4 文字以内で入力します SNP Nameはチューブなどには記載されません Name( この例ではSNP001) がチューブやアッセイ情報に記載されます SNP# は5 末端より何番目のSNPであるかを表します 注意 :NでSNPをマスクした場合は そのSNPは数えません 正確に入力した場合 Valid の表示になります 配列中に複数の SNP を入力すると複数の SNP がアッセイの候補になります Submit For Assay Design をクリック 10
Custom TaqMan SNP Genotyping Assays Username/Password は インターネットオーダー用のユーザー ID を使用 (4 ページ参照 ) Username Password を入力後 Login をクリック 11
Assays オーダー方法 デザイン開始 クリックで情報更新 Batch ID デザインの受付番号です Refresh Batch List - クリックするとデザインの最新状況がわかります デザインを開始したお知らせの Email も届きます 12
Assays オーダー方法 デザイン終了 Details デザインの結果です Passed したアッセイをオーダーすることが出来ます Refresh Batch List - クリックするとデザインの最新状況がわかります デザインが終了したお知らせの Email も届きます 13
Assays オーダー方法 Passed デザインのオーダー方法 Batch ID をクリックで Design Results を表示 Batch ID ID をクリックすると Design Results が表示されます Design Results-Passed アッセイをオーダーできます Assay ID-Assay ID は自動的に割り当てられます デザインの時に入力した配列名も表示されます 14
Assays オーダー方法 Passed デザインのオーダー方法 3Order Now をクリック 2 リストを確認 1Add をクリック 15
Assays オーダー方法 Passed デザインのオーダー方法 1Size などを確認 2Add To Basket をクリック Shopping Basket をクリック 16
Assays オーダー方法 Passed デザインのオーダー方法 更新 ショッピングバスケット内の製品の注文数を変更した場合 このボタンを押して下さい 削除 - 注文した製品 1 つ もしくは複数を削除することができます ご注文を先に進める場合 ご注文プロセスを続ける ボタンを押します 17
Assays オーダー方法 Passed デザインのオーダー方法 お支払方法について お支払方法の Purchas Order の表示 Blanket Order の空欄はそのままで変更しないでください お名前は 登録ユーザーのお名前を半角アルファベットでご入力ください お支払方法を入力後 次へをクリックします 18
Assays オーダー方法 Passed デザインのオーダー方法 ご注文を完了するには ご注文をクリックします 内容を修正したい場合は 戻るをクリックします 重要 : ご注文をクリック後 キャンセルすることは出来ません 19
Assays オーダー方法 Passed デザインのオーダー方法 ご注文ボタンを押すとご注文の確認ページが表示されます - ご注文が完了し 受注伝票番号が発行されます - 受注伝票番号が表示されます 番号をお控えください - 印刷用ページボタンを押すと印刷画面が表示されます - ご登録いただいたお客様のe-mailアドレスに確認メールが送信されます 20
21 Custom TaqMan Gene Expression Assays
Custom TaqMan Gene Expression Assays 以下のサイトへアクセスします https://www5.appliedbiosystems.com/tools/cadt/ Order Custom Gene Expression Assays をクリック 22
Custom TaqMan Gene Expression Assays ターゲットの生物種を選択します 入力した配列に対して TaqMan Gene Experssion Assays と同様のバイオインフォマティック解析や他の生物種の転写産物を検出しないオプションを追加する場合には Custom Plus を選択します Custom Plus を選択した場合は納品時には Primer 及び Probe の配列は非公開になります 23
Custom TaqMan Gene Expression Assays Custom Plus を選択した場合は追加で特異性に関して選択を行います インフォマティック解析によって入力した配列のみを検出するアッセイをデザインするか 同じ遺伝子座に存在する他のスプライシングバリアントも検出するアッセイをデザインするかを選択します Custom Plus を選択した場合は Primer 及び Probe の配列は非公開になります ( オプション ) ターゲットの生物種とは別の生物種を 1 種類選択して 別の生物種の転写産物を検出しないアッセイをデザインします トランスジェニック実験に有用です 24
Custom TaqMan Gene Expression Assays 配列名を入力英数字および.-,_ で 10 文字以内この名前がチューブに記載されます 特徴的な名前を入力します 塩基配列を入力テキスト情報をコピー後 Ctr+Vでペーストも可 ATGCおよびNで入力 ( 最低 61bp 300bp 以上推奨最大 5000bp) 配列内にあるSNPはNでマスクターケ ットサイトから配列の両端へは30bp 以上確保 25
Custom TaqMan Gene Expression Assays 1 スケールの選択 2Check Format をクリック 26
Custom TaqMan Gene Expression Assays 正確に入力した場合 Valid の表示になります 1 つの配列に複数のターケ ットサイトを入力できますが テ サ インが最適である 1 つのアッセイのみ出荷されます チューブやアッセイ情報には Name( この例では GA001) が記載されます ターケ ットサイトの上下流 5bp には N を入力することはできません Target の追加が可能 Target 情報の入力 Target(Probeの位置 ) を指定しない場合は Automaticを選択します 自動設定されます Target(Probeの位置 ) を指定する場合は Manualを選択します Target Positionには 5 末端より何塩基目がターケ ットサイトであるかを入力 Target Nameには ターケ ット名を英数字 4 文字以内で入力 複数のTargetを指定しても テ サ インが最適である1つのアッセイのみ出荷されます 27
Custom TaqMan Gene Expression Assays Submit For Assay Design をクリック 28
Custom TaqMan Gene Expression Assays Username/Password は インターネットオーダー用のユーザー ID を使用 (4 ページ参照 ) Username Password を入力後 Login をクリック ご注文の続きは P.12 Assays オーダー方法を参照ください 29
30 カスタムデザインでのオーダー
カスタムデザインでのオーダー 以下のサイトへアクセスします https://www5.appliedbiosystems.com/tools/cadt/ 目的 Assays の Enter Custom Primer/Probe Pair をクリック 31
カスタムデザインでのオーダー Primer/Probe の入れ値を入力します 注 : TaqManGeneExpression 製品のカスタムデザイン画面には Probe2 の入力項目はございません AssayName/Primer/Probe 情報を入力後 Check Format をクリック 32
カスタムデザインでのオーダー 入力に問題がなければ Valid が表示されます 重要 : ヒト Y 染色体上の SNP アッセイは Non-Human 製品としてご注文ください 生物種の選択 他のアッセイの入力は Add New Sequence をクリックオーダーを進めるには Submit をクリック 33
カスタムデザインでのオーダー Username/Password は インターネットオーダー用のユーザー ID を使用 (4 ページ参照 ) Username Password を入力後 Login をクリック ご注文の続きは P.12 Assays オーダー方法を参照ください 34
35 デザイン済みアッセイの再注文
デザイン済みアッセイの再注文 以下のサイトへアクセスします https://www5.appliedbiosystems.com/tools/cadt/ Reorder Existing Custom Assays をクリック 36
デザイン済みアッセイの再注文 Click here to log in をクリック 37
デザイン済みアッセイの再注文 Username/Password は インターネットオーダー用のユーザー ID を使用 (4 ページ参照 ) Username Password を入力後 Login をクリック 38
デザイン済みアッセイの再注文 Search Term(Assay ID 等 ) を入力後 Search をクリック 検索結果 ご注文の続きは P.15 Assays オーダー方法を参照ください 39
40 デザイン済みアッセイの閲覧
デザイン済みアッセイの閲覧 以下のサイトへアクセスします https://www5.appliedbiosystems.com/tools/cadt/ View All Submitted Custom Design Jobs をクリック 41
デザイン済みアッセイの閲覧 Click here to log in をクリック 42
デザイン済みアッセイの閲覧 Username/Password は インターネットオーダー用のユーザー ID を使用 (4 ページ参照 ) Username Password を入力後 Login をクリック 43
デザイン済みアッセイの閲覧 Refresh Batch List をクリック 44
デザイン済みアッセイの閲覧 確認したい Batch ID をクリック Assay ID を確認できます ご注文を行う場合は P.15 Assays オーダー方法を参照ください 45
研究用にのみ使用できます 診断目的およびその手続き上での使用は出来ません The trademarks mentioned herein are the property of Life Technologies Corporation or their respective owners. TaqMan is a registered trademark of Roche Molecular Systems, Inc. 本誌に記載の社名および製品名は 弊社または各社の商標または登録商標です 2010 Life Technologies Japan Ltd,. All rights reserved. 46