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1 研究開発の現場で役に立つ PC クラスタを作るために考えてきたこと 岐阜工業高等専門学校建築学科准教授柴田良一

2 はじめに自己紹介 グリッドや PC クラスタとの関わり 経歴 専門 豊橋技術科学大学大学院システム情報工学岐阜工業高等専門学校建築学科准教授 大規模構造物の構造解析でしたが現在はグリッドや PC クラスタ あくまで グリッドや PC クラスタはユーザーであり 手段だと思っています連絡先

3 役に立つ PC クラスタ 役に立つ PC クラスタを作るには あくまで手段自分の目的を達成すれば 何でも良い コストが問題経費と時間を節約して 効果を発揮する 目的を明確にアプリケーション志向のシステム設計

4 PC クラスタの階層構成 PC クラスタを理解するうえでの階層構成 3: アプリケーション層 オープンソースのアプリや商用の大規模アプリ 2: ミドルウエア層 ユーザー認証とジョブスケジューリング機能 1: システム基盤層 OS の起動制御や並列計算機構の構成 0: ハードウエア層 標準の PC の活用とネットワーク構成

5 どんな PC クラスタを作るかーその 1 アプリケーション志向で考える 3: アプリケーション層 並列処理か分散処理 どちらで効果を得るか並列処理 : 大規模問題を分担して高速に分散処理 : 小規模問題を多数処理するか 2: ミドルウエア層 誰が作って 誰が管理して 誰が利用するか最も単純なら ユーザー認証は最低限ジョブスケジューリングの効果に期待

6 どんな PC クラスタを作るかーその 2 1: システム基盤層 コストや目的を合わせて OS を選択慣れや経験も考慮して無理のない選択アプリを動作させることを第 1 目的に 0: ハードウエア層 まずは一般的な PC を数台からハイエンド PC では相当の計算能力ネットワークはギガイーサで十分 構築に手間取っては 効率化の意味がない

7 今日の話題 [3] 話題 3 PCクラスタでの活用を想定した CAEアプリケーションの例 :DEXCS [2] [1] 話題 1 Linuxをベースにした PCクラスタの構築 話題 2 Windowsをベースにした PCクラスタの構築 [0] 話題 0 一般的な研究開発の現場にある PCとネットワーク環境

8 話題 0:PC とネットワーク環境 0: ハードウエア層 一般的な PC を活用します OS の起動形式 HDD デュアルブート CD/USB からのブートネットブート 環境に合わせて選択 ネットワーク形式組織の LAN に接続した形式で可能 DNS の流用や利便性の向上試験的に独立させることも可能ネットワーク構築などに工夫

9 話題 0: 計算機の準備 まずは 手持ちの計算機 (PC) からはじめてみる オフィスのパソコンの旧式だめもとで 使わなくなった PC を気兼ねなく まずは試してみる CAD 端末群や研修室の PC 転用まとまった台数の PC があると効果も大きいし やりがいも

10 今日の話題 [3] 話題 3 PCクラスタでの活用を想定した CAEアプリケーションの例 :DEXCS [2] [1] 話題 1 Linuxをベースにした PCクラスタの構築 話題 2 Windowsをベースにした PCクラスタの構築 [0] 話題 0 一般的な研究開発の現場にある PCとネットワーク環境

11 話題 1:Linux による PC クラスターその 1 Linux-PC クラスタを選択する前提条件 コストの中で時間よりも経費が厳しいとにかく安価に試してみたい オープンソースの活用技術を獲得したい自主的な問題解決を基本に考える 何となく Unix/Linux のほうが使いやすいこれまでの経験と業務の内容に対応して

12 話題 1:Linux による PC クラスターその 2 Linux-PC クラスタの良いところ システム構築のライセンス料が不要台数分だけ経費は大きくなるので深刻 ハードウエアを選ばず旧式 PC でも可能 Linux が動作する PC であればなんでも オープンソースでシステムの改良が可能ソースレベルのチューニングも出来る

13 話題 1:Linux による PC クラスターその 3 Linux-PC クラスタの悪いところ 構築に時間と技術が必要です改善はされていますがそれでも 努力が必要 旧式の PC だとそれなりの性能手間がかかる割りに性能が出ないことも 手が入る分だけ手を入れてしまう手段であった PC クラスタが目的となって

14 話題 1:Linux による PC クラスターその 4 Linux-PC クラスタの構成要素 2: ミドルウエア層 フリーで手軽に利用できるもの柴田のお薦めは Sun Grid Engine 構築も運用も容易で拡張性も高い 1: システム基盤層 OS は Linux なら何でも利用可能お薦めは CentOS フリーの RedHat 系で利用者も多い

15 話題 1:Linux による PC クラスターその 5 システム基盤層の構築 旧式 PC を集めて HDD に普通にインストール現用 PC を CD/USB 起動で転用することも可能 インストールのポイントパッケージは全て入れておく方が楽セキュリティ関連は全て外しておくネットワークの設定は LAN に合わせる Linux の利用運用技術はある程度は必要です

16 話題 1:Linux による PC クラスターその 6 ミドルウエア層の構築 パッケージを入手してインストールドキュメントは英語ですが簡単にできます インストールのポイントユーザー認証のしくみを考える管理ホストと実行ホストの役割を考える NFS をベースにしたシステム構成を理解する 多少の慣れは必要ですが 努力の甲斐はあります

17 話題 1:Linux による PC クラスターその 7 Linux-PC クラスタ構築の情報 0 から自力で進めるのは手間がかかります何らかの助言を受ければスムーズに進みます グリッド協議会グリッドトレーニングで構築の演習システム構築の作業を具体的に説明します 岐阜高専共同研究さらに具体的な支援は共同研究の中で ( 是非 )

18 話題 1:Linux による PC クラスターその 8 Linux-PC クラスタを拡張する方法 折角作った PC クラスタをさらに展開する遠隔地から利用できるように遠隔地の PC クラスタを連結したい VPN の活用が有効組織のセキュリティポリシー範囲の活用さらに大規模な PC クラスタを実現グリッドへの展開計算機資源の有効活用へ

19 話題 1:Linux による PC クラスターその 9 Linux-PC クラスタの実例紹介岐阜高専と A.T.WORKS[ との共同研究 AT-GRID の構築 CentOS と SunGridEngine を用いた PC クラスタ VPN で富山 A.T.WORKS と岐阜高専を連結全体で ATWORKS 製サーバ 100 台構成で運用中 AT-GRID の特徴商用のグリッドサービスを目標上記プロトタイプシステムで基盤技術を検証

20 話題 1:Linux による PC クラスターその 10 AT-GRID の展開ウエブインターフェイスによる利用公開を可能にするセキュリティ確保さらなる計算ホストの増強を計画中高密度集積サーバを利用したクラスタ All in One で利用できる PC クラスタ これらを踏まえた上で PC クラスタでの計算サービスを限定公開予定並列アプリケーションのサービスを提供予定コンシューマーサービスとしてのグリッド

21 今日の話題 [3] 話題 3 PCクラスタでの活用を想定した CAEアプリケーションの例 :DEXCS [2] [1] 話題 1 Linuxをベースにした PCクラスタの構築 話題 2 Windowsをベースにした PCクラスタの構築 [0] 話題 0 一般的な研究開発の現場にある PCとネットワーク環境

22 話題 2:Windows による PC クラスターその 1 Windows-PC クラスタを選択する前提条件 コストの中で経費よりも時間の制約が厳しいとにかく確実に早急に試してみたい サポートのある安定して安心できるシステムサービスとして PC クラスタを導入したい 常用している Windows の環境と連続させたい活用と運用を考えて シームレスな利用

23 話題 2:Windows による PC クラスターその 2 Windows-PC クラスタを選択する良いところ インストーラーで簡単に構築できます様々なモジュールを一括でインストール 商用のアプリケーションを活用できます有名なものは殆ど動作するそうです Windows デスクトップ上で Excel との連携普段のパソコンの感覚で PC クラスタを利用

24 話題 2:Windows による PC クラスターその 3 Windows-PC クラスタを選択する悪いところ 商用ソフトなのでライセンスが必要です計算ノードの台数分になるのでそれなりです 64bitCPU が必要になり新しい PC が必要ですその成果は能力に反映するので良いのですが 不具合があったときサポートを待つ必要がブラックボックスとする気楽さはありますが

25 話題 2:Windows による PC クラスターその 4 Windows-PC クラスタの構成要素 2: ミドルウエア層 Compute Cluster Pack:CCP MPI や PC クラスタツールをパッケージ 1: システム基盤層 Windows Server 2003 Compute Cluster Edition CCE と言い Windows Server のサブセット

26 話題 2:Windows による PC クラスターその 5 システム基盤層の構築 1: ネットワークの準備クラスタ専用のサブネットを構築 2:WindowsServer2003R2 のインストール一般的な WS2003R2 と同様 3:CCE のインストール WS2003R2 と同等で 5GB の HDD 容量 4:AD Node の設定 Windows 特有で最も困るところ最低限の設定は容易に可能

27 話題 2:Windows による PC クラスターその 6 ミドルウエア層の構築 5:Head NodeでのCCPのインストールインストーラーで指示に従って 6:Compute NodeでのCCPのインストール同様に可能 RISの自動インストール可能 ADがあれば簡単にノードを追加できます 7:PCクラスタの設定ネットワークの構成を設定する計算用や管理用に別のNICを持つ場合に対応

28 話題 2:Windows による PC クラスターその 7 Windows-PC クラスタ構築の情報 サービスとして購入することができます自力で進めることももちろん可能です Windows HPC コンソーシアムユーザーグループの情報です 岐阜高専共同研究プロトタイプの CCS クラスタを構築 ( 連携を )

29 話題 2:Windows による PC クラスターその 8 Windows-PC クラスタ実例紹介 手元の PC で構築したプロトタイプシステム システム構築は非常に簡単 Windows Server がインストールできれば 姫野ベンチでの速度検証 Athlon の PC を用いて 1 台で 881MFlops 2 台で 1243MFlops

30 今日の話題 [3] 話題 3 PCクラスタでの活用を想定した CAEアプリケーションの例 :DEXCS [2] [1] 話題 1 Linuxをベースにした PCクラスタの構築 話題 2 Windowsをベースにした PCクラスタの構築 [0] 話題 0 一般的な研究開発の現場にある PCとネットワーク環境

31 話題 3:PC クラスタのアプリケーションーその 1 PC クラスタ導入を成功させるには目標を明確に定めたシステム構築が必要 対象となる業務の中で何が問題なのか業務のプロファイルからポイントを探す計算機処理と手作業との配分 業務のワークフローの中でどう組み込むか通常の環境と異質な場合には敬遠される利用者の本当のニーズを汲み取る努力

32 話題 3:PC クラスタのアプリケーションーその 2 アプリケーションによる PC クラスタの選択 並列処理でピーク性能を必要とする場合 例 : 大規模有限要素法解析旧式のPCではそれなりの性能に PC 間のネットワーク性能に依存 分散処理でスループットを求める場合 例 : 最適化設計問題旧式のPCでも台数があれば有用 VPNを経由した広域連携でも動作

33 話題 3:PC クラスタのアプリケーションーその 3 オープンソースによる PC クラスタ構築 システム基盤層とミドルウエア層は容易情報工学分野で積極的に開発が進むシステム構築に若干のノウハウが必要 アプリケーション層は自分で解決する目的に応じたアプリケーションを用意するこれまでのプログラムを並列化する アプリケーションをどう用意するかがポイント

34 話題 3:PC クラスタのアプリケーションーその 4 オープンソースによるアプリケーション 例えば CAEの場合 プリ処理 数値解析 ポスト処理 モデル作成 並列処理 可視化 数値解析のフリーなシステムは提供されているがプリポスト処理を含めた統合システムは少ない そこで デンソーと岐阜高専との共同研究によりポータブルな CAE システム DEXCS を開発

35 話題 3:PC クラスタのアプリケーションーその 5 DEXCS:Digital Engineering on Extensible CD System CD で PC を起動するだけで利用でき PC クラスタとの連携を可能にする CAE システム

36 話題 3:PC クラスタのアプリケーションーその 6 Blender: フリーの3DCGソフト CADデータの活用 STLファイルの読み込み 数値解析のモデル作成に応用モデル生成機能の追加 1: 節点密度制御 2: メッシュデータファイルの生成の欠陥を検出

37 話題 3:PC クラスタのアプリケーションーその 7 ADVENTURE: オープンソースの数値解析システム設計用大規模計算力学システム開発プロジェクトで公開 次の特徴を持つ 1: 数百 ~1 億自由度メッシュによる丸ごと解析 2: 超並列計算機環境でも 90% を超える高い並列効率 3: 様々な計算環境への優れた移植性 4: ライセンスフリー / オープンソース 5: 拡張性と保守性 : モジュール構造と I/O の標準化詳細は

38 話題 3:PC クラスタのアプリケーションーその 8 ParaView: オープンソースの可視化ソフトウエア 次の特徴を持つ 1: 固体流体などの様々な表現形式に対応 2: 多くのプラットホームで動作 3: 多数の解析データや形状データに対応

39 話題 3:PC クラスタのアプリケーションーその 9 DEXCS と PC クラスタとの連携 PC クラスタと同じアプリケーションでテスト小規模データで予備解析で準備を進め詳細データを PC クラスタで実行解析結果を手元の可視化ソフトで確認 ウエブインターフェイスによるグリッド利用 CAE アプリケーションに対応したカスタマイズ 将来的には 意識せずに PC クラスタを利用できる

40 まとめ : お役に立てれば ユーザーの立場で 手段としての PC クラスタを 条件によって色々な手段があります予算 目的 アプリケーション まずは 手の届くところから始めましょう チームワークで進めることが大切ですハード ソフト アプリ ネット 様々な得意分野を生かして連携しましょう グリッド協議会や各種学会で人的連携を作ろう

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