Microsoft PowerPoint - CEコースPubMedＱ＆Ａ用.ppt

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1 第 16 回医学図書館研究会 継続教育コース 文献検索講習中級編 ~ こわくないシソーラス ~ PubMed 編 静岡県立静岡がんセンター医学図書館山崎むつみサーチャー 1 級 ライフサイエンス情報専門員上級 1

2 目的 到達点 目的 PubMed のシソーラス :MeSH を使って簡単な検索ができる 到達点 MeSH が何であるか言える 適切な MeSH を調べる時にはどこをみればよいかわかる 検索に MeSH が必要である理由がわかる MeSH での検索における注意点がわかる PubMed での実際の操作がわかる 2

3 PubMed 検索基礎の確認 クエリーボックスは Search Box は マジックボックス 検索結果を表示 Limits で絞り込み Advanced Search 画面で 絞り込み 履歴確認 History で確認 (Preview も ) 3

4 PubMed 最初の画面 サーチボックス トップページは 平成 22 年 2 月 3 日に 変更になっています 4

5 サーチボックスはマジックボックス 平成 22 年 2 月 3 日より Limits リンクが追加になっています Gastric cancer コトバを入力して ボタンをクリック 大文字 / 小文字の区別なし 論理演算子 (AND OR NOT ) も使える スペースで区切ってコトバを並べるとANDと同じ でフレーズ検索 著者名 雑誌名 ISSN PMID 検索も可能 2010/2/3 5

6 検索結果画面 平成 22 年 2 月 3 日よりLimitsリンクが追加になっています Sort by : 表示順序 検索履歴へのリンク 6 6

7 絞り込み Limits History( 履歴 ) は Advanced Search から Advance Searchぺージは平成 22 年 2 月 3 日に変更になっています Limitsページが独立ページになりました 7

8 Limit で絞り込み ( 固定 ) 平成 22 年 2 月 3 日に Limitsページとして独立しました 項目に追加がありました 使い方は同じです 1 チェックを入れる 2Search をクリック 8

9 Limits のかかった検索結果画面 平成 22 年 2 月 3 日に Limits 制限の表示場所の変更 がありました 9

10 絞り込み > Limits 検索ごとの絞り込み Advance Search ぺージは 平成 22 年 2 月 3 日に 項目変更になっています Limits ページが 絞り込みの固定 独立ページになりました 10

11 History( 履歴 ) # 番号 : PubMed 検索だけではない 11

12 History で確認 クリックすると 検索結果画面になる 履歴を消したいとき ( 履歴は 8 時間で消去 ) Clear History は表示されている履歴のみ消去 (# 番号は継続することもあり ) 検索結果 1 つだけなら # 番号を左クリック Delete を選択 履歴番号から全部消去なら ツール インターネットオプション 削除 Cookie の削除 2010/2/3 12

13 Advanced Search を続けるならば 13

14 サーチボックスの裏側では Details Advanced Search では Search の検索結果画面にも 14

15 サーチボックスの裏側 Details 自動用語マッピング 15

16 こわくないシソーラス PubMed 編 16

17 シソーラス (Thesaurus) とは (1) 索引, 検索用の構造化された統制語彙集. ディスクリプタ 非ディスクリプタおよびそれらの関係 ( 同義 階層 関連関係 ) を表す記号 意味の範囲を表すスコープノート等から構成される. 様々な文献語や着想語で表される概念に対し 一貫して索引付けに用いるディスクリプタを明示し 更にその体系統制語 (controlled vocabulary) と構造を明示することで 検索効率の向上を図ることを目的とする. (2) 略 (3) 言語研究や自然言語処理用の構造化された語彙体系. 様々な表現 表記を一つのコトバに統一 概念の体系と構造が明確にされている 日本図書館情報学会用語辞典編集委員会編 ; 図書館情報学用語辞典第 3 版, 丸善 ( 東京 )2007. より引用 2010/2/3 17

18 シソーラス (Thesaurus) 阿部信一 :JMLA 第 15 回医学図書館基礎研修会講義 5 情報検索 1 より改変 18

19 コトバ : 言葉 キーワード 主題をあらわすコトバ 検索語 検索につかうコトバ 索引語 索引につかうコトバ 統制語 概念や範囲が規定されているコトバ 自然語 自由語 おもいつくままのコトバ 19

20 PubMed のシソーラス MeSH Medcial Subject Headings NLM のシソーラス 毎年更新されている 20

21 MeSH の主な構成要素 Main Headings : 主標目 ディスクリプタ (Descriptor) ターム (term) 階層構造 Subheadings: 副標目 サブヘディング 限定句 (Qualifiers) 階層構造 Supplementary Concept Records: SCRs 以前は Supplementary Chemical Records 化学物質 薬物などが登録されている 毎週更新 Publication Type Publication Characteristics 出版形態 MeSH Term 21

22 実際に見てみましょう < 実習 1> サーチボックスに といれ Search をクリックします

23 * がついているのは Major Topic Intestinal Neoplasms / drug therapy* ディスクリプタ サブヘディング SCRs と MeSH Term [Pharmacological Action] 23

24 Subheadings MeSH DB より 主題を限定することができる例 ) がんの薬物療法 各ディスクリプタ毎に使える種類が違う 24

25 * がついているのは Major Topic Intestinal Neoplasms / drug therapy* ディスクリプタ サブヘディング SCRs と MeSH Term [Pharmacological Action] 25

26 Pharmacological Action 薬効のMeSH(1996 年 ~) 通常の MeSH との区別: Substances: に化学物質とともに表記 検索時は [PA] をつける 26

27 Main Headings の階層構造 (Tree Structure) 1 カテゴリー A. Anatomy B. Organisms C. Diseases D. Chemical and Drugs E. Analytical, Diagnostic and Therapeutic Techniques and Equipment F. Psychiatry and Psychology G. Biological Sciences H. Physical Sciences I. Anthropology, Education, Sociology and Social Phenomena J. Technology and Food and Beverages K. Humanities L. Information Science M. Persons N. Health Care V. Publication Characteristics Z. Geographic Locations 27

28 Main Headings の階層構造 (Tree Structure)2 上位語 下位語 28

29 Main Headings の階層構造 (Tree Structure)2 Exploding : (Explode) 下位語 下位のコトバ ( 概念 ) を含む 29

30 SubHeadings の階層構造 30

31 MeSH(Medical Subject Headings) とは シソーラス様々な表現 表記を一つのコトバに統一 Main headings, Subheadings, SCRs, Publication Type 等 Major Topic 中心的主題を表す MeSH ターム Subheadings ディスクリプタの概念に則した絞り込み Main headings のカテゴリ - 階層構造コトバの持つ概念の位置 関係を明確化 subheadings もグループ構造あり 31

32 こわくないシソーラス PubMed 編 32

33 MeSH を使いこなすには 1MeSH タームのつき方 選び方を知る 2MeSH 検索のポイントを知る 阿部信一 :JMLA 第 15 回医学図書館基礎研修会講義 5 情報検索 1 より借用 33

34 MeSH タームのつき方 選びかた 参考にするもの MeSH DB MeSH Browser その他 34

35 実際に見てみましょう MeSH DB 1 DB を MeSH にします どちらでも OK 2gastric cancer をいれます 35

36 36

37 MeSH DB 用語の説明 つけることのできるサブヘディング この用語が主題中心 (Major Topic) になっているものだけ限定するか? 下位語を含めないで検索するか? (Explode しないようにするか?) この用語への参照用語リスト 階層構造 37

38 MeSH DB から MeSH Browser へ MeSH DB から 左クリックする NLM MeSH Browser 38

39 MeSH Browser の Descriptor Data Annotation ( 索引者への注意事項 ) Scope Note 用語の説明 Allowable Qualifiers つけることのできるサブヘディングス PubMed の検索に直行できないのでブラウザの戻るを使って MeSHDB に戻って検索 並列関係も表示した階層構造 39

40 DB vs Browser 項目 MeSH DB MeSH Browser 索引者用指向検索者用索引注意事項 PubMed 検索に PubMed 検索とは検索リンクリンクしていないスペルミス対応 ( 対応していない ) 階層表示 副標目 該当 MeSH のみ 付与可能で実際に文献のあるもの 該当 MeSH の並列関係も表示 付与可能なもの 副標目表現 Subheadings Qualifiers 40

41 MeSH のつき方と選び方ポイント 選び方チェックポイント このMeSHタームの説明を確認したか 何年からMeSHタームになっているか そのサブヘディングは使えるか 階層構造を確認したか ( 上位 下位 並列 ) 他の用語で適切なものがあるか セットで使うような注意事項はあるか 41

42 こわくないシソーラス PubMed 編 42

43 MeSH 検索の実際 MeSH タームを探す MeSH タームの確認をする MeSH タームで検索をする a. MeSH DB から b. サーチボックスへ直接入力 c. Preview/index から d. Citation からの検索など 検索結果の検証 43

44 実習 3 新型インフルエンザについて 1 新型インフルエンザを MeSH で調べる 2 MeSH DB から PubMed のサーチボックスへ上げる 3 検索をする サーチボックスを Clear してから直接入力で検索 44

45 実習 3 新型インフルエンザについて H1N1 を N1H1 と間違えて入れていますが 45

46 左クリックする 検索語とするには PubMed PubMed Major Topic MeSH Browser で確認するには NLM MeSH Browser この MeSH タームは 2006 年からつけられた Influenza A Virus は以前の MeSH ターム 46

47 今年 5 月 1 日に MeSH を変更 既存のタームに Influenza A virus, H1N1 subtype エントリーターム Swine-Origin Influenza A H1N1 Virus を追加 既存のタームから INFLUENZA A VIRUS エントリータームの Swine Influenza Virus を削除 47

48 MeSH DB サーチボックス & 検索 もちろん 手で入力して Search も可能 MeSH ターム [MeSH] MeSH ターム [mh] 48

49 複数 MeSH の検索 一つ一つ検索して # 番号をつくる History または Preview で AND OR 一本の検索式を作る 49

50 実習 4 肥満 2 型糖尿病の治療 肥満 糖尿病 治療 obesity diabetes therapy 糖尿病 (diabetes) MeSH 確認 2 型糖尿病あるか? 治療 (therapy) 肥満 (obesity) subheadings? MeSH 確認 50

51 MeSH の確認 51

52 52

53 53

54 MeSH Broweser の確認 54

55 Therapy の確認 MeSH DB 55

56

57 同様に obesity も検索 Hitory をみながら AND 57

58 実習 5 H1N1 A 型インフルエンザの タミフル投与による副作用 今回の条件 MeSH タームだけを使用します タミフル投与による副作用 subheading=adverse effects ターム毎の検索式で 58

59 1 MeSH でタミフル :tamiflu 59

60 2 まずは検索してみます 60

61 3 新型インフルエンザを MeSH で確認して検索 61

62 4 History で確認して検索結果番号で AND 検索 62

63 結果の 7 件 63

64 MeSH にとらわれずに検索してみると 64

65 MeSH がついていない [PubMed - as suppled by publisher] 出版社からのデータ [PubMed - in process] NLM で索引作業中 [PubMed - indexed for MEDLINE] 索引作業済み MEDLINE データ [PubMed ] MEDLINE 収録外データ MeSH が付いている 65

66 MeSH 検索注意点 検索でヒットしないもの MeSHがついていない MeSHが変わっている AND 検索の場合の 制約 66

67 新規性 vs 広さ vs 的確さ Gastric cancer Stomach Neoplasms[ Mesh] 24,220 60,306 4,526 19,694 40, 検索結果 67

68 MeSH が変わった時 しっかり補完されているもの Online Note がついていないものは 要注意 Online Note がついているものは補完されている 検索 68

69 MeSH 付与年外 新型インフルエンザ 2006~ Influenza A Virus, H1N1 Subtype 1977 ~ 2005 Influenza A Virus 1968 ~ 1976 Orthomyxoviridae 69

70 MeSH 付与年外 MeSH Browser Online Note がついていません

71 MeSH 付与年外 2005 年より前の 420 件のうち出版年の一番古いものにもすでに現在の MeSH がついていました 420 件のうち 2006 年以後に登録されたものは 10 件だけでした 71

72 AND 検索による制約 例 ) 変異型クロイツフェルト ヤコブ病でも認知症になるか? 変異型クロイツフェルト ヤコブ病 variant creutzfeldt-jakob disease variant CJD vcjd MeSHターム=Creutzfeldt-jakob Syndrome 認知症 :Dementia MeSH ターム =Dementia 検索式 : variant creutzfeldt-jakob OR variant CJD OR vcjd AND Creutzfeldt-jakob Syndrome[majr] AND Dementia[majr] 72

73 検索をしました が なにが問題かおわかりになりますか? 検索 変異型クロイツフェルト ヤコブ病 同じ? 変異型クロイツフェルト ヤコブ病 AND 認知症 73

74 MeSH DB Exploding : (Explode) デフォルトで下位のコトバ ( 概念 ) を含む 74

75 どういうことでしょうか? variant creutzfeldt-jakob Disesase AND Dementia 75

76 Explode しない MeSH を選ぶ AND 76

77 この場合の検索式の例 検索式 : "variant creutzfeldt-jakob" OR "variant CJD" OR "vcjd" AND Creutzfeldt-jakob Syndrome[majr] AND Dementia[majr:noexp] 77

78 その他検索結果への注意点結果が多過ぎる時 メジャートピックにしてみる 下位語を含まないにしてみる 適切な検索語か? 安易にNOT 検索をしない 少ない時 スペルミスをしていないか? 文字のみに捉われていないか 掛け合わせを減らしてみる 検索語概念を広げてみる 78

79 MeSH も弱点がある MeSHの弱点を補えばよい タイトル 抄録に範囲限定した自由語検索やフレーズ検索を追加する gastric cancer [TIAB] 79

80 こわくないシソーラス PubMed 編 80

81 MeSH が怖くなくなるには MeSHを知る PubMedを知る 新しい情報を得る MeSHのつき方を知る 81

82 MeSH を知る 82

83 MeSH Home 83

84 PubMed を知る 84

85 PubMed を知る 85

86 新しい情報を得る 86

87 MeSH のつき方を知る 適合論文の MeSH タームを見る 人の検索式を見るガイドラインの検索式など 出典 :Minds: 膵癌 日本膵臓学会膵癌診療 GL 作成小委員会編 / 医療 GJ(06 年 ) CQ1-1 検索式 (2)PubMed( 87

88 おわりに シソーラス用語をつかった検索は 主題の専門家ではない私たち図書館員にとって 核心にせまった検索をするための重要な Tool の 1 つとなります 怖がらずに仲良くなりましょう 88

89 謝辞 今回のプログラム作成にあたりましては 慈恵会医科大学の阿部様 JMLA 教育委員会の諏訪部様ガイドラインWGの河合様第 16 回医学図書館研究会継続教育コース実行委員の皆さまに大変 世話になりました ありがとうございました 89