NBDC-DBCLS-共同研究計画.key
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- きょういち さわい
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1 26 NBDC/DBCLS NBDC (JST )
2 26 NBDC RDF DB 国 内 外 に 散 在 しているライフサイエンス 分 野 のデータやデータベー スについて それらの 共 有 を 強 力 に 促 進 し 公 共 財 として 誰 でもが 自 由 に 活 用 できるようにするとともに 生 物 種 や 個 々の 目 的 やプロ ジェクトを 超 えて 幅 広 い 統 合 化 を 実 現 することにより データがよ り 多 くの 分 野 の 研 究 者 開 発 者 技 術 者 に 簡 便 に 利 活 用 できるよう にして データの 価 値 を 最 大 化 することを 目 指 すものです
3 = 3.0 RDF ID : ID URL Ontology: Linked Data: Ontology RDF
4 : RDF RDF: Resource Description Framework (Subject) - (Predicate) - (Object) - ID () - () - ID () () s RDF p o <> <> <>/ RDF < rdf:type so: < rdfs:label APOE. RDF ID = RDF
5 : SPARQL SPARQL: SPARQL Protocol and RDF Query Language RDF name RDF SELECT?gene?name?drug?effect WHERE {?gene rdf:type so: ?gene rdfs:label?name.?gene :dose?drug.?drug :has_effect?effect. } effect gene drug RDF
6 (OWL, RDF, RDFS, DC, SKOS, OBO,...) W3C RDF (RDF/XML, Turtle, TriG,...) RDF W3C SPARQL 1.1 SPARQL RDF (REST API, HTML, CSS, JavaScript, JSON,...) (NGS,,...)
7 25 DB TogoDB TogoWS TogoTable OReFiL BioHackathon SPARQLthon DB OpenID LSQA Galaxy TogoGenome TogoStanza GGGenome GGRNA SRA RefEx Bodyparts 3D LODQA OntoFinder OntoFactory PubAnnotation TogoDoc inmexes Allie Colil TV
8 26 NBDC/DBCLS NBDC/DBCLS 1. RDF RDF 2. RDF 3. RDF 4. /
9 NBDC/DBCLS 2. DB P DB RDF 1. RDF RDF W3C-HCLS DB FALDO Identifiers.org BioHackathon / SPARQLthon DDBJ/EBI/NCBI/UniProt RDF 3. DB QA 4. / (NBDC/DDBJ )
10 NBDC/DBCLS 1. RDF RDF RDF DB RDF
11 NBDC/DBCLS 1. RDF RDF RDF DB RDF RDF ( )
12 NBDC/DBCLS 2. DB P DB RDF BioHackathon TogoGenome/MicrobeDB.jp/CyanoBase/MBGD TogoStanza NBDC/DBCLS SPARQLthon = TPP RDF TPP RDF
13 NBDC/DBCLS (TPP) RDF 2. DB P DB RDF - RDF - RDF - TPP RDF - SPARQLthon - BioHackathon RDF summit TPP 2 SPARQLthon 1 TPP 5 RDF RDF INSDC <-> Ensembl RDF 11 BioHackathon
14 NBDC/DBCLS NGS DDBJ RefEx RNAi, CRISPR SPARQL RDF BioPortal TogoStanza 3. DB QA
15 NBDC/DBCLS - NGS RDF DB α - IBM - TV - DB - 3. DB QA
16 NBDC/DBCLS RDF RDF DB - DB 4. / (NBDC/DDBJ )
17 26 RDF summit 5/17-20 ( ) INSDC, Ensembl RDF SPARQLthon 6/ DBCLS 7/ /5 BioHackathon / biohackathon-jp@googlegroups.com
20131004-トーゴーの日 提出用.key
(I) (II) 10:10 http://jp.linkedin.com/in/toshiakikatayama 2013/10/4 @ 2013 CC-BY 2013 licensed under CC 2.1 1. RDF 2. 3. 4. RDF 5. 6. 7. (I) 1. RDF 2. 3. 4. RDF 5. 6. 7.? RDF RDF RDF =
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09-01048 Wikipedia Web Web API 1 2 503 3 Wikipedia WordNet 504 1: 3-1 Wikipedia 505 3-2 Wikipedia owl:sameas 506 101 64 52 45 39 34 29 25 22 19 16 13 10 7 4 1 0 2000 4000 6000 8000 10000 12000 14000 16000
1 RDF @JST Linked Open Data RDF SPARQL 2016/10/7 . @prefix : . 20140426-TogoDBシステム概説書
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オントロジ入門
Web Web 2004-01-23 XML XML Web WG Web ( ) Web (RDF RDF ) (OWL) ( ) WG ( ) 2004-01-23 2 Web Web Web XML ( ) 2004-01-23 3 Web Web 2 Web HTML(XHTML) ( ) Web ( ) 2 Web 2004-01-23 4 2 Web Web (XHTML) (RDF)
_bodik.key
RDF Gnavi() WWW 4 www Resource Description Framework rdfs:type schema:website http://city.fukuoka.lg.jp schema:about schema:lastreviewed rdfs:label db:fukuoka "2015-2-1"^^xsd:date rdfs:label
Purl.jp 管理・運用方針
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Web Web 1 Web XML DB Web EAI 2 RDF RDF Schema DAML+OIL OWL (Web Ontology Language) 3 Resource Description Framework (RDF) W3C XML http://www.net.intap.or.jp/intap/s-web/
Innovation Linked Open Data Resource Description Framework Uniform Resource Identifier Open Government 25 5 23 2011 25 2013 6 26 2014 3 ...1 ICT 2...4...4.....5..6..9..9 13 15 15 22 24 26 26 27 29 32 43
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4,650 4,492 9,142 2,603 2,691 5,294 4,391 4,226 8,617 3,685 3,861 7,546 3,290 3,359 6,649 5,539 5,728 11,267 4,013 3,763 7,776 4,075 4,054 8,129 3,206 3,379 6,585 3,483 3,319 6,802 2,565 2,808 5,373 3,141
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WINET情報
WINETCONTENTS 1 2 3 Q&A Q A 4 Q A 5 Q A 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 No. 10. 1. 11. 2. 12. 3. 4. 13. 5. 14. 6. 7. 15. 8. 9. 16. 33 17. 33. 34. 35. 18. 19. 36.
Web SOAP Internet Web REST SOAP REST 3 REST SOAP 4
XML Day Web2.0 REST SOAP SOAP REST WADL, WSDL2.0 REST SOAP " " 2006 12 11 XML Web2.0 SOAP REST 2 Web SOAP Internet Web REST SOAP REST 3 REST SOAP 4 REST Representational State Transfer REST Web URL XML
P-12 P-13 3 4 28 16 00 17 30 P-14 P-15 P-16 4 14 29 17 00 18 30 P-17 P-18 P-19 P-20 P-21 P-22
1 14 28 16 00 17 30 P-1 P-2 P-3 P-4 P-5 2 24 29 17 00 18 30 P-6 P-7 P-8 P-9 P-10 P-11 P-12 P-13 3 4 28 16 00 17 30 P-14 P-15 P-16 4 14 29 17 00 18 30 P-17 P-18 P-19 P-20 P-21 P-22 5 24 28 16 00 17 30 P-23
20110325-ob14-ktym-revised.key
BioRuby 10 http://bioruby.org/ 46th SIG-MBI / 14th Open Bio 2011/3/25-26 @ JAIST 2000 BioPerl KEGG, GenBank Perl BioPerl BioPerl Ruby BioRuby 2000 2001 BOSC - Bioinformatics Open Source
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i 1. TogoDocClient... 1 1.1.... 2 2.... 3 2.1.... 3 2.2.... 3 2.2.1. (Windows)... 3 2.2.2. (Mac OS X)... 3 2.3.... 3 2.4.... 3 2.5.... 4 2.6.... 4 3.... 5 3.1.... 5 3.1.1. Article Explorer... 5 3.1.2....
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SPARQL Semantic Web Stack (2007) SPARQL とは? RDF データを検索するためのクエリ言語 (RDBMS における SQL に相当 ) http://www.w3.org/tr/rdf-sparql-query/ http://www.asahi-net.or.jp/~ax2skmtn/internet/rdf/rdf-sparql-query.html ( 日本語訳
- 1 - - 0.5%5 10 10 5 10 1 5 1
- - - 1 - - 0.5%5 10 10 5 10 1 5 1 - 2 - - - - A B A A A B A B B A - 3 - - 100 100 100 - A) ( ) B) A) A B A B 110 A B 13 - 4 - A) 36 - - - 5 - - 1 - 6-1 - 7 - - 8 - Q.15 0% 10% 20% 30% 40% 50% 60% 70%
地域と文化資産
11 2005 1980 151 20 65 1 6 37 7 A D E F G H - 2 - 2005 8 6 10:00 10:30 2-432 A D 7 E 8 1-F 1-G - 3 - 2005 H 1970 2005 8 26-4 - A B D E F G H 3 7 8 1 5 6 1 10-5 - 2005 10 1 5 6 1 1 30 2 3 5 3 2 1 2005 8
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 http://www.moj.go.jp/press/090130-1.html 55 56 57
1. 2001 10 2 480 2003 8 1.6 5 2. 90 3. 4. 5. 5 60 6. 1 2 2 2 4 5 5 6 6 6 7 10 10 10 12 12 12 14 14 15 15 60 15 17 17 18 2001 10 2 480 2003 8 1.6 5 1 1.8 3.6 1 6.8 1.5 3 3 5 6065 70 5 1.22004 1 1 2002 4
IC RDFOWL PIM DB ID GIS RFID 2 ID ID ID XML web.xml GIS,PIM G-XML OWL RDF XML WSDL REST XML ID
YRP IC RDFOWL PIM DB ID GIS RFID 2 ID ID ID XML web.xml GIS,PIM G-XML OWL RDF XML WSDL REST XML 1 3 4 5 6 7 ID ID IC ID ID XML ID RFID ID 1ID ID IP ID ISO ID 2. RFID ARFID BRFID AIC 2 ID 3 3. ID IDIC IC
セマンティックWebはWeb2.0を超えることができるか
1 セマンティックWEBとW3C 慶 應 義 塾 大 学 環 境 情 報 学 部 World Wide Web Consortium 萩 野 達 也 セマンティックWEB Tim Berners-Leeが1998 年 ごろに 提 唱 しはじめる 機 械 的 処 理 可 能 なメタデータ 空 間 Timの1989 年 のWebの 提 案 書 に 始 まる 2 セマンティックWEBで 実 現 したいこと
20 Covert Channel
20 Covert Channel 200602824 1 4 2 6 2.1 Covert Channel..................... 6 2.1.1................. 6 2.1.2 Covert Channel........ 7 2.2...................... 7 2.3.................... 8 2.4..................
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DNA 87 ( ) Nucleic Acids ResearchDB RNA 29 94 58 29 18 43 153 : 511 Bio DB Catalog (DBCAT) http://www.infobiogen.fr/services/dbcat/ 2 GenBank MB SRS) DAS) 3 4 5 A A A 6 OGSA-DAI 7 9 DB Medical Encyclopedia
Lotus Domino XML活用の基礎!
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2016 年度春学期 Web インテリジェンス論 SPARQL 講義概要 SPARQL とは? RDF ストア GraphDB による SPARQL 検索方法 Turtle 基本的なクエリ FILTER, OPTIONAL, DISTINCT, UNION, LIMIT, ORDER BY, GROUP BY, MAX, AVG, SUM, COUNT, リモートの SPARQL エンドポイントへのクエリ
RDF WI2 Matono matono@example.com Taro urn:isbn:0123 urn:pin:am RDF hgp://www.w3.org/designissues/notakon3 urn:isbn:0123
農林金融2015年5月号
4 5 4 4 4 4 2014 5 14 7 2050 1412 15 3 19 1800 1 1 2 2 2 126 2 3 1 2 1 2 3 4 1 1 2 2 1 1 2014 3 2 126 2 2 3 1 40 30 20 10 0 2014 26 287 339 393 399 361 2 2 11 1 3 25 4 4 5 5 19898993 96 3 2000 1 1 1 5
表紙.PDF
2 3 4 2001 2010 33 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 H18 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 300 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 410-8601 055-934-4747 Fax 055-933-1412
untitled
0120-888-089 0120-919-498 160-83381-26-1TEL. 03-3349-3111 URL http://www.sjnk.co.jp/ 160-83381-26-1 TEL. 03-3349-3111 URL http://www.sompo-japan.co.jp/ 100-89653-7-3 TEL. 0120-919-498 URL http://www.nipponkoa.co.jp/
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Linked Data の現状と日本の課題 武田英明 国立情報学研究所東京大学人工物工学研究センター takeda@nii.ac.jp Linked Data とは何か Linked Data の現状 Linking Open Data (LOD) Linked Data の使い方 検索エンジン ブラウザ アプリ 日本における Linked Dataの課題 Linked Data 3 Linked
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セマンティック Web 技術に触れてみよう! RDF/SPARQL ハンズオン勉強会 ~ オープンデータから LinkedData までを総ざらい ~ LOD について 2013/12/21 コンテキスト コンピューティング研究部会サブリーダー小林茂 アジェンダ オープンデータについて オープンガバメント セマンティック Web 技術 (RDF,SPARQL) RDF とは RDF の表現形式 :
file://\\Toro\chibao\ORF2004\1124-orf-sw\Printable.html
第 2 フェーズを迎えた Semantic Web by 福重貴雄 (W3C 訪問研究員 / 松下電器産業株式会社 ) Table of contents 第 2フェーズを迎えた Semantic Web 1. Semantic Webとは Semantic Webとは これまでのWeb Semantic Web による解決策 RDF (Resource Description Framework)
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a bit SPARQL advanced (@yayamamo) (BIND/VALUES) Federated Queries (SERVICE) CONSTRUCT ASK DESCRIBE Turtle prefix WEB API SPAQL http://www.w3.org/tr/sparql11-query/ p118 SPARQL :taro foaf:knows / foaf:interest?t.?t
Demo 1
2005 6 11 (motom@green.ocn.ne.jp) http://www.knowledge-synergy.com/ Demo 1 IT 2 Web ( ) Dublin Core Title Creator Subject Description Publisher Contributor Date Type Format Identifier Source Language Relation
<95F18D908F91955C8E862E707562>
千 葉 県 職 員 自 主 研 究 活 性 化 事 業 庁 内 SNSの 可 能 性 に 関 する 実 証 実 験 について 2007.3 千 葉 県 職 員 自 主 研 究 グループ CHIPS 研 究 会 ... 5... 9... 9... 9... 10 SNS... 13... 13... 13... 14... 17... 17... 17... 17... 18 4 SNS... 19
分散情報システム構成法
Web Information System Design No.9 Resource Description Framework 萩野達也 1 文書 vs データ Web 上の文書 インターネット上のハイパーテキストシステムとして成功 HTML は広く使われるようになった 人が読む文書が大量にある ( ありすぎ?) HTML をインターフェイスとする便利なアプリケーションもある 文書の意味を理解せずに検索エンジンが処理をして関連するページを見つける
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WEB WEB 2 3 4 6 7 8 10 11 12 13 15 16 IT UX UI Logic UI Logic DB WEBAPI IT UX UI UI Logic UI Logic API DB DB WEBAPI xunit OS IT JavaScript UI Logic UI Logic Objective-C Swift HTML PHP Ruby Python JavaScript
22 58 2 2013 9 2007 2007 2001 2009 3 2010 2010 2 2 2010
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