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BioRuby 200732 2005 2005 : 719 : GenBank, EMBL, DDBJ, PDB, KEGG, Galperin, M.Y. (2005) The Molecular Biology Database Collection: 2005 update. Nucleic Acids Research, 33: D5-D24. : 129448 : BLAST, FASTA,

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2005 IPA Ruby ::: BioRuby + ChemRuby ::: http://bioruby.org/ + BioRuby:, + ChemRuby: http://bioruby.org/ O B F (http://open-bio.org) BioPerl, BioPython, BioJava,.. (http://open-bio.jp)

BioRuby Ruby Bioinfomatics Blast BioPerl, BioJava, BIoPython Ruby

BioRuby, BioRuby Ruby Bioinfomatics Blast BioPerl, BioJava, BIoPython Ruby Open Bio* O B F -- Open Bio Foundation BioRuby Ensembl BioCaml BioPerl OmniGene BioLisp BioPython GMOD BioConductor BioJava Apollo

未踏成果報告会-fix.key

BioRuby/ChemRuby http://www.tmd.ac.jp/artsci/biol/textbook/celltop.htm 350 280 210 140 2000 / 1 / 27 70 0 1995 96 97 98 99 2000 01 02 03 04 05 RefSeq PDB PubMed PubChem GenPept EMBL UniProt GenBank

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BioRuby (Bio::Sequence ) atgcatgcaaaa codontable.rb seq = Bio::Sequence::NA.new("atgcatgcaaaa") puts seq puts seq.complement puts seq.subseq(3,8) p seq.gc_percent p seq.composition puts seq.translate puts

KNOB Knoppix for Bio Itoshi NIKAIDO

KNOB Knoppix for Bio Itoshi NIKAIDO Linux Grasp the KNOB! grasp 1, (grip). 2,, (understand). [ 2 ] What s KNOB CD Linux Bioinformatics KNOB Why KNOB? Bioinformatics What

IIJ Technical WEEK 2013 - アプリ開発を楽にするRuby PaaS「MOGOK」について

Ruby PaaS MOGOK 2013/11/19 1 IIJ PaaS MOGOK MOGOK PaaS 2 IIJ PaaS MOGOK PaaS MOGOK MOGOK 3 IIJ PaaS 4 IIJ Internet, Backbone, Mobile IIJ GIO 5 IIJ IaaS IIJ GIO SaaS PaaS 6 PaaS Platform

Open Bio* O B F -- Open Bio Foundation BioRuby BioPerl BioPython BioJava BioDAS BioMOBY BioPipe EMBOSS Ensembl OmniGene GMOD GBrowse Apollo OBDA BioCa

BioRuby 片山!俊明! 京大化研バイオインフォマティクスセンター 2003/1/28 infobiologist 第二回研究会 ۆ 伝研 Open Bio* O B F -- Open Bio Foundation BioRuby BioPerl BioPython BioJava BioDAS BioMOBY BioPipe EMBOSS Ensembl OmniGene

スライド 1

BioRuby 入 門 はじめてのプログラム 言 語 Naohisa Goto / 後 藤 直 久 Genome Information Research Center, Research Institute for Microbial Diseases, Osaka Univ. 大 阪 大 学 微 生 物 病 研 究 所 附 属 遺 伝 情 報 実 験 センター Email: ngoto@gen-info.osaka-u.ac.jp

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理解のための教材開発と授業　（宮内）.PDF

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PowerPoint Presentation

DNA 87 ( ) Nucleic Acids ResearchDB RNA 29 94 58 29 18 43 153 : 511 Bio DB Catalog (DBCAT) http://www.infobiogen.fr/services/dbcat/ 2 GenBank MB SRS) DAS) 3 4 5 A A A 6 OGSA-DAI 7 9 DB Medical Encyclopedia

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野岩鉄道の旅

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人芯経営論 ･･･リーダーシップ考②

2009/12/15 2009/11/17 2009/11/16 2009/10/19 2009/10/15 2009/10/1 2009/9/17 2009/9/1 2009/8/17 2009/8/17 2009/8/14 2009/8/12 2009/7/28 2009/7/17 2009/7/15 2009/6/24 2009/6/18 2009/6/15 2009/5/20 2009/5/15

平成１３年度 地域工業活性化支援事業報告書（多摩全域）

はたらく若者ハンドブック

ruby learner - Ruby

ruby learner - Ruby - 27015464 2019 3 Ruby[1] 3 1 2 3 3 ruby learner Ruby 9 Ruby 9 2 3 1 2 3 Github [23] 1 5 1.1................................... 5 2 6 2.1 Ruby.......................................

ジェネリック医薬品販売会社（田辺製薬販売株式会社）の設立に伴う包装変更のご案内

06地図目録.pwd

橡82-93協力員原稿＞授業

17. (1) 18. (1) 19. (1) 20. (1) 21. (1) (3) 22. (1) (3) 23. (1) (3) (1) (3) 25. (1) (3) 26. (1) 27. (1) (3) 28. (1) 29. (1) 2

1. (1) 2. 2 (1) 4. (1) 5. (1) 6. (1) 7. (1) 8. (1) 9. (1) 10. (1) 11. (1) 12. (1) 13. (1) 14. (1) 15. (1) (3) 16. (1) 1 17. (1) 18. (1) 19. (1) 20. (1) 21. (1) (3) 22. (1) (3) 23. (1) (3) 24. 1 (1) (3)

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夏目小兵衛直克

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1 31 1 WEB 10 3,544 429 13 10 22 11 7 WEB 1 2 41.0 15 80.0 20 46.7% 1000 55.8 1000 34.4 21 18.2 1000 23 25 41.0 49.2 29 90.6 42.7 33 56.4% 79.2% 67.4 51.7 37 39 83.7 1 91.0 93.6 9 2 3 1000 96.3 300 1000

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BioRuby入門

BioRuby 入門 後藤直久 2005 年 7 月 9 日 BioRuby とは? バイオインフォマティクスに必要な機能や環境をオブジェクト指向スクリプト言語 Ruby を用いて統合的に実装したライブラリ http://bioruby.org bioruby.org/ バイオインフォマティクス (Bioinformatics) バイオ (bio) : 生物学 インフォマティクス (informatics):

20140602-NBDC-DBCLS-共同研究計画.key

26 NBDC/DBCLS http://jp.linkedin.com/in/toshiakikatayama 2014/6/2 @ NBDC (JST ) 26 NBDC RDF DB 国 内 外 に 散 在 しているライフサイエンス 分 野 のデータやデータベー スについて それらの 共 有 を 強 力 に 促 進 し 公 共 財 として 誰 でもが 自 由 に

KNOB Bio KNOPPIX

KNOPPIX for Bio 1CD Linux Itoshi NIKAIDO KNOB Bio KNOPPIX Knoppix for Bio KNOPPIX JP Itoshi NIKAIDO 2004/01/29 1.1.0 1.3.1 bio OS Mac OS X Xcode/fink Windows Cygwin Linux

KNOB? KNOB KNOB

KNOB Itoshi NIKAIDO itoshi@saitama-med.ac.jp KNOB? KNOB KNOB Bioinformatics? データタイプがいっぱい EMBOSS = 160 aaindexextract,abiview,acdc,acdpretty,acdtable,acdtrace,acdvalid,antigenic,backtranseq,ba nana,biosed,btwisted,cai,chaos,charge,checktrans,chips,cirdna,codcmp,coderet,compseq,

IPA... 3... 4... 7... 8... 8... 10... 11... 13... 14... 21... 21... 23... 27 2

IPA 1 IPA... 3... 4... 7... 8... 8... 10... 11... 13... 14... 21... 21... 23... 27 2 IPA 2011103 3 1 139 2 4 10 4 5 6 7 8 9 2 ID 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 http://www.jpcert.or.jp/research/2008/inoculation_200808.pdf

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Microsoft Word - 4_研究成果の要約(森田).doc

09-01048 Wikipedia Web Web API 1 2 503 3 Wikipedia WordNet 504 1: 3-1 Wikipedia 505 3-2 Wikipedia owl:sameas 506 101 64 52 45 39 34 29 25 22 19 16 13 10 7 4 1 0 2000 4000 6000 8000 10000 12000 14000 16000

IIJ GIO, SaaS, MOGOK

Ruby PaaS MOGOK awazu@iij.ad.jp 2013/02/23 IIJ GIO, SaaS, MOGOK What s MOGOK http://mogok.jp/ What s PaaS? What s MOGOK? MOGOK What s PaaS? MOGOK... What s Cloud? IaaS PaaS SaaS XaaS What s IaaS? Amazon

目次 1. Serverspec とは 1.1. Serverspecとは 1.2. Serverspecで出来る事 2. セットアップ 2.1. 必要なもの 2.2. インストール 3. デモ 3.1. デモ環境について 3.2. テスト対象サーバーの登録 3.3. サンプルテストの中身 3.4.

Serverspec でインフラテスト 2018 年 4 月 20 日株式会社フルマークス大久保和彦 目次 1. Serverspec とは 1.1. Serverspecとは 1.2. Serverspecで出来る事 2. セットアップ 2.1. 必要なもの 2.2. インストール 3. デモ 3.1. デモ環境について 3.2. テスト対象サーバーの登録 3.3. サンプルテストの中身 3.4.

ソフトウェアについて Rev 年 1 月 16 日 このマニュアルでは標準でインストールしているソフトウェアの入手元 インストール方法の概要 インストール場所 についてご案内致します ABySS

このマニュアルでは標準でインストールしているソフトウェアの入手元 インストール方法の概要 インストール場所 についてご案内致します ABySS http://www.bcgsc.ca/platform/bioinfo/software/abyss/ abyss 1.3.4.tar.gz tar xvzf abyss 1.3.4.tar.gz cd abyss 1.3.4./configure prefix=/usr/local/abyss

（タイトル未定）

次世代シーケンシングデータ解析の可能性を拡げる信頼性に優れた道具としての解析システム Takeru for Sequencer シリーズ 2013.10.29 生命医薬情報学連合大会 2013 Luncheon seminar 株式会社ナベンターナショナルセールスマーケテゖング部渡辺理恵 1 今日お話しすること データ解析ソフトウェゕ 使用にあたり発生する問題とそれらへの Takeru による対応

20131004-トーゴーの日 提出用.key

(I) (II) 10:10 http://jp.linkedin.com/in/toshiakikatayama 2013/10/4 @ 2013 CC-BY 2013 licensed under CC 2.1 1. RDF 2. 3. 4. RDF 5. 6. 7. (I) 1. RDF 2. 3. 4. RDF 5. 6. 7.? RDF RDF RDF =

2 Rails pico planner camel case camel pico planner _ pico_planner snake case snake - chain case chain pico planner pico-planner CSS id class 2.3 Rails

2 Rails 2.1 DBMS PicoPlanner SimpleGreeter DBMS Ruby on Rails 3 PostgreSQL MySQL SQLite3 SQLite3 2.2 Web PicoPlanner pico planner 11 2 Rails pico planner camel case camel pico planner _ pico_planner snake

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GitLab + Dokku で作る CI/ CD 環境 Kazuhiro NISHIYAMA 第 78 回 Ruby 関西勉強会 2017/07/29 Powered by Rabbit 2.2.0

GitLab + Dokku で作る CI/ CD 環境 Kazuhiro NISHIYAMA 第 78 回 Ruby 関西勉強会 2017/07/29 Powered by Rabbit 2.2.0 自己紹介 西山和広 id:znz (github, twitter など ) Ruby コミッター 1/25 GitLab + Dokku GitLab GitLab CI Dokku (+ Heroku)

BioRuby の使い方

BioRuby BioRuby Ruby Ruby Perl Ruby http://www.ruby-lang.org/ BioRuby Ruby BioRuby Ruby Ruby Mac OS X UNIX Windows ActiveScriptRuby http://jp.rubyist.net/magazine/?0002-firstprogramming http://jp.rubyist.net/magazine/?firststepruby

Emacs Ruby..

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Office 1 / 43 2 / 43 Access2003 3 / 43 Access2003 1 9 Access2003 4 / 43 5 / 43 6 / 43 7 / 43 8 / 43 9 / 43 10 / 43 11 / 43 12 / 43 13 / 43 14 / 43 15 / 43 16 / 43 17 / 43 18 / 43 19 / 43 20 / 43 21 / 43

プレゼンテーション3

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1 2 3 2004 4 5 6 7 [ ] 2004 12 2 2005 1 2 [ ] 5 [ ] 8 9 22 23 29 23 19 10 11 12 6 13 14 15 16 6000 17 20 20 20 20 6 18 25 25 25 25 25 19 2 20 21 22 23 24 25 NHK 26 27 28 29 30 31 32 33 34 AOR 35 36 CD

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12 20 12 50 12 50 14 00 9/5 14 10 15 10 1 1 4 5 2 3 6 4 9 7 10 8 11 4 13 12 14 14 3 15 17 18 16 3 19 21 23 16 22 20 8 Open College 2015 1 2 2 3 Open College 2015 4 3 Open College 2015 5 4 5 Open College

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24 10 迄 20 6 7 13 () 4 5-10 5-1 3-1 0.5 2-2 2-1 1-20 0.8 2-6 4-51 4-19 1.7 3-17 2-34 4-13 1.4 2-22 3-29 2-7 0.9 6-30 1-1 1-15 0.3 (%) (%) 13 12,418 12,599 98.6 11,886 12,599 94.3 50-16 - % db db 4 622

利用者

Regional SNS 開発環境構築ガイド 2012 年 2 月 29 日 株式会社ネットワーク応用通信研究所 目次 1. はじめに... 1 2. 前提条件... 1 3. 必要なソフトウェア構成... 1 4. ソフトウェアの導入手順... 1 4.1. 必要ファイルのダウンロード... 1 4.2. 環境設定コマンドの実行... 2 4.3. RegionalSNS の実行... 2 4.4.

PowerPoint プレゼンテーション

クックパッドのテスト自動化

JaSST 14 Tohoku クックパッド株式会社 高井 直人 スマホアプリ累計DL数 ios 1,010万 Android 990万 2014年4月時点 パズドラ 2,700万 黒猫 2,500万 Apache Rails 3.2 Ruby 2.0 Unicorn nginx MySQL Redis Memcached Amazon Web Service Ｖ字モデルとＶ

自己紹介 : プロフィール 石井一夫 ( 東京農工大学特任教授 ) 専門分野 : ゲノム科学 バイオインフォマティクス データマイニング 計算機統計学 経歴 : 徳島大学大学院医学研究科博士課程修了後 東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センターリサーチアソシエート 理化学研究所ゲノム科学総合研究セン

フリーソフトウェアを用いたゲノム科学におけるビッグデータ解析 石井一夫東京農工大学農学系ゲノム科学人材育成プログラム 1 自己紹介 : プロフィール 石井一夫 ( 東京農工大学特任教授 ) 専門分野 : ゲノム科学 バイオインフォマティクス データマイニング 計算機統計学 経歴 : 徳島大学大学院医学研究科博士課程修了後 東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センターリサーチアソシエート 理化学研究所ゲノム科学総合研究センター研究員

AcVBA

第2回プロ

【アフィリコード】総合マニュアル

【アフィリコードプラス】総合マニュアル

教室案内.pptx

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2 3-22 23-24 25-1 - - 2 - 2-3 - 1848 1901 1936 3 1960 2005 10 27.8 1-4 - 2 5 A 3000 4-5 - 4 20 120 160 70 10-6 - 12 40 6070 80 20 20 7 5 9 15 130 I U 8 4 2 3-7 - 4 1,600 500 200 48 100 80-8 - - 9 - 1 12

( ) ( ) 20 11 11-13 15 20 21 ( ) 114cm 100cm 85cm () () 11 18 19 19-25 26 ( 1 ) 1 2 10 ( ) () 11 16 19 21 24-13 20 3 20 ( ) ( ) 14 15 19 20 23 29 13 20 4/15 600 400 5 7 1 8 5 7 20 3 1999 1000 100 86

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1 1 1 1 3 4 6 6 14 (1) 14 (2) 15 (3) 16 (4) 16 18 (1) 18 (2) 18 (3) 19 (4) 21 (5) 22 (6) 22 24 24 25 26 28 28 29 31 32 32 33 34 34 35 36 36 36 (1) 37 37 39 40 40 41 41 42 43 43 43 (2) 46 46 46 55 58 60

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トーゴーの日シンポジウム 2016 東大弥生講堂, 5 October 2016 生命科学におけるデータサイエンスの課題と PDB 中村春木 大阪大学蛋白質研究所

トーゴーの日シンポジウム 2016 東大弥生講堂, 5 October 2016 生命科学におけるデータサイエンスの課題と PDB 中村春木 大阪大学蛋白質研究所 harukin@protein.osaka-u.ac.jp http://pdbj.org/, http://wwpdb.org/ , Sir Isaac Newton (1642-1727) 3 11.3 PF ( 理化学研究所計算科学研究機構ホームページから

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1 2 1 1 2 3 1 2 1 2 4 0,76 4 5 0,1 1970 1974 1993 6 7 8 9 4 1920 10 1960 1971 ( ) IC 11 1980 1990 1992 1987 0,269 1996 0,023 2001 2002 1996 1996 1 98 27 70 1 3 7 12 2003 63 2 13 3 5 1 13 5 14 2 14 2 14

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+ Octopress + GitHubPages でブログを作成 Name: さりんじゃー

+ Octopress + GitHubPages でブログを作成 Name: さりんじゃー Twitter: @salinger001101 自己紹介 2 n HN: さりんじゃー n 現在の状況 : n 専門は機械学習 自然言語処理など n 普段はPython 書いてます n 最近 Rのお勉強開始 n Blog:http://salinger.github.com n Twitter:@salinger001101

株式会社ウェッズ

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01-07 章 _4th2 了 18.8.25 6:46 PM ページ 110 110 2060 1569 2059201510 01-07 章 _4th2 了 18.8.25 6:46 PM ページ 111 111 43 26 548 795 254 1 3,686 443 283 1,668 4,129 915 6,712 2710 2730 2710 65 201729 20166,712 3,3834,081

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13th Annual Worlds of Flavor International Conference & Festival z x c v z x c v 2 b n m, m m, b n 3 . 0 1 2 3 4 5. 0 1 2 3 4 4 5 6 7 8 6 7 8 5 9 0 1 2 3 9 0 1 2 3 6 4 5 6 7 8 4 5 6 7 8 9 7 0 1 2 3 9 0

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1990 1990 2007 2000 2007 9 3 46 1 2 1960 1 1984 60 3 1970 4 2000 2003 2009 2011 12007 2 2007 12 25 2 1 2007 10 19 1 5 2007 12 11 3 Bradshaw, J., et. al., 2008. 41982 47 2010 5 2011 2004 2004 1994 5 2009

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