ChemBioDraw 14 化学構造描画 検索クエリー作成を行う最新の化学ソフトパッケージ ChemBioDraw 14 は 高度な物性予測ツールと ChemDraw ActiveX/Plugin を使用した Web との統合環境を提供します 化学の専門家を対象とした構造描画パッケージです Sci

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1 2014/9/5 版 ChemBioOffice シリーズは 化学構造作画機能を中心とした化学研究のための製品です 以下のような特徴 製品ラインナップがあります 化学構造式の描画をはじめ 分子モデリング 化学情報データベースの構築などを可能にする 様々なアプリケーションを包含した高機能なパッケージソフトウェア 化学研究者の研究業務を幅広く支援 パソコン上であらゆる化学情報を統合管理でき 化学 バイオなどに関する様々な研究開発を効率化 拡張性に優れた製品構成により デスクトップからネットワークを利用した全社的な活用まで 様々なシ ーンに対応 ChemBioOffice 2014 生化学文書作成 分子モデリング データベース構築を行う最上位化学ソフトパッケージ ChemBioOffice 2014 は ChemBioDraw ChemBio3D ChemBioFinder,ChemBioViz SciFinder 連携を搭載した最上位パッケージです 製品の日本語マニュアルは PDF で提供されます 無償ソフトウェアとして MestReNova Lite GAMESS を提供 ただし 無償提供ソフトウェアのサポートは ありません 構成プログラム ChemBioDraw SciFinder 連携 ChemBio3D ChemBioFinder ChemBioViz ChemDraw/Excel CombiChem/Excel ChemBioFinder for Office ChemScript オンラインデータベース (3 ヵ月間 ) 内容化学量論計算 バイオツール 化学命名機能 NMR シフト予測 ClogP 予測機能を持つ二次元化学構造作画ソフトウェア ChemBioDraw から SciFinder に構造を自動的に転送し検索可能 OpenGL による美しいグラフィック表示 MM2 MM3 などの分子力学計算 GAMESS を搭載 インターフェースとして MOPAC2009 Jaguar Gaussian09 Autodock Conflex をサポート ( 各プログラムは 別途購入が必要 ) 簡単な操作で本格的な化学情報データベースを構築可能 ChemBioFinder データベースの検索結果をグラフ化する便利なツール 統計解析機能やヒストグラム 一次直線 二次曲線 三次曲線などの作成が可能 Excel 上で化学構造式を検索 表示が可能 Excel 上でコンビナトリアルライブラリを作成可能 Word や PowerPoint に含まれる化学構造式を一括して検索することが可能 ChemFinder 用に Python を拡張した高機能プログラム言語 構造検索可能な化学関係の参考資料データベース集 日本及び世界の試薬データ (ChemACX) 低分子データ (ChemINDEX) 反応データ (ChemRXN) NCI データを収録 1

2 ChemBioDraw 14 化学構造描画 検索クエリー作成を行う最新の化学ソフトパッケージ ChemBioDraw 14 は 高度な物性予測ツールと ChemDraw ActiveX/Plugin を使用した Web との統合環境を提供します 化学の専門家を対象とした構造描画パッケージです SciFinder 連携 TLC プレート 電気泳動作画ツールを備えています バイオ関係の描画に便利なフルカラー BioDraw ツール Biopolymer ツール アノテーション パスウェイ プラスミドマップ作画機能も備えています 三次元モデリングソフト (ChemBio3D Pro) と化学情報管理ソフト (ChemBioFinder ) が含まれています ChemBio3D Pro は 計算手法として拡張ヒュッケル MM2 をサポートしています ChemBioFinder には データグラフ化機能 ChemBioViz が含まれています 新機能として 生体高分子ビルダーの機能強化 (IUPAC コード入力 Clean Up Biopolymer コマンド ) 化学命名機能強化 ( 高分子化合物 ) を提供 ChemBioOffice から CombiChem ツールと ChemScript を削除し ChemBio3D を Pro に変えた製品です Mac 版は 別途購入の必要があります 機能データベースホットリンク物性予測化学名称命名機能 NMR シフト予測化学量論計算ホットキーの拡張 MS Office との連携 SciFinder 連携その他 内容画面上で構造式を描くだけで 自動的にインターネット上のデータベースを検索 化学構造式から生成された化学物質名 化学式 分子量 化学物性をリアルタイムに更新 構造式に変更を加えるとそれを即座に反映 Molecular Networks の機能により Pka,LogP,LogS を予測電荷を含む化合物 塩基性化合物 対称性の高い構造 無機物質 有機金属系化合物などにも対応 プロトン NMR の化学シフトと分割パターンがより正確になり 炭素 13NMR シフト予測では 予測精度が向上 作画した反応式に基づく 理論収量などの計算を簡単に行う事が可能 結合の変更に便利なショートカットなど さらに多くのホットキーを追加 ChemDraw/Excel とChemBioFinder/Office により Excel 上で化学構造が操作でき Word や PowerPoint に含まれる構造式も簡単に検索可能 ChemBioDraw からSciFinder に構造を自動的に転送し検索可能 三次元モデリングツール 化学データベース 各種 ActiveX/Plug-in も付属 < 命名 物性予測 NMR 関連処理などの専門的な製品をご希望の方に > 富士通では 専門性に特化した製品も販売しております 化合物命名は ACD/Name NMR 処理と予測は ACD/Spectrus 化学構造式を基に物性 ADME 毒性を詳細に評価する場合は ACD/Percepta をご検討ください 詳しくは 下記ホームページをご覧ください 主な ACD/Labs 製品 NMR スペクトルからの化合物構造推定 :2000 万件以上のデータベース付 (Structure Elucidator Suite) 1D & 2D NMR 同時解析 &NMR スペクトル予測 & データベース構築 (NMR Workbook Suite) NMR シフト予測 : 核種 H,C,P,N,F,2D(NMR Predictor Suite) 各種スペクトルの基本処理 解析 :NMR LC/GC-MS Chromato Optical に対応 (Spectrus Processor) MS スペクトル帰属 LC/MS 成分解析 (MS Workbook Suite) 各種物性予測 : 水溶解性 沸点 LogD LogP pka 等 (Percepta PhysChem Suite Predictor) ADME 毒性予測 :P450 Genotoxicity Carcinogenicity 等 (Percepta Drug Suite Predictors) 2

3 ChemDraw Pro 14 二次元化学構造作画機能だけの製品です 構造式の整形 TLC 電気泳動作画ツールがあります ISIS など他アプリケーションとの互換性が必要な場合にお選びください <ChemDraw Pro のみの機能 :ChemDraw Std には 以下の機能はありません > 薄層クロマト 電気泳動 バイオポリマー作画ツール Draw Curve( ペンツール ) Mass Fragmentation ツール 反応作画ツール, 物性計算 化学構造の整形 ニックネームの定義 注釈の入力 ポリマー表現 独自の Template や Style Sheet 作成 反応の原子対応指定 マーカシュ構造の展開 代替基 可変代替基 構造 Query 指定 三次元検索設定 置換基の結合位置指定 Link Node 指定 Paste SMILES,SLN の作成, 立体異性の表示開くことができるファイル形式 :JCAMP (JDX, DX), Galactic Industries (SPC) ファイル形式を指定して保存 :Connection Table, Chemical Markup Language, ISIS (SKC, TGF, RXN), MDL MolFile (MOL), MDL RGFile (RGF), Structure-Data file (SD) Mac 版は 別途購入の必要があります ChemDraw Std 14 化学構造作画のための基本製品です 主な機能 : 単結合 二重結合 多重結合 立体結合作画 原子ラベル 置換基ラベル日本語入力テンプレートによる作画 反応 矢印作画 触媒の表記 アミノ酸の作画 カーボンナノチューブ作画軌道 括弧 円 球作画 オブジェクトの反転 整列 色塗り機能 Mac 版は 別途購入の必要があります 開くことができるファイル形式 :GIF,BMP,JPEG,ISIS,MDL,PNG,SMD,TIFF,WinMetafile,Enhanced Metafile ファイル形式を指定して保存 :GIF,BMP,JPEG,PNG,Postscript,TIFF,WinMetafile,Enhanced Metafile,SVG ChemBio3D 14 分子モデリング作成 視覚化 分析パッケージ ChemBio3D 14.0 は ワークステーションに匹敵する分子表面画像と厳密な計算方法をデスクトップコンピュータで実現します 蛋白質向け並列計算用 MMFF94 力場を提供 ChemDraw Pro も付属しています Windows 版のみのご提供です 機能内容 ChemDraw の統合二次元構造と三次元構造を同時に編集 ChemBio3D アプリケーションに統合された ChemBioDraw ウィンドウで構造を作画すると同時に ChemBio3D の構造に反映 モデルエクスプローラ巨大な分子構造を解析するための階層ツリー形式の表示 PDB ファイルをインポートし 鎖状 グループを確認 この機能により きめ細かな作業が可能 二面角ドライバー配座探索ツールにより MM2 エネルギーグラフを作成 自動分子重ね合わせ複数の分子を選択すると ChemBio3D が自動的に対象分子に重ね合わせ 計算 Gaussian GAMESS では 計算したスペクトル図を表示 MOPAC2009 Jaguar GAMESS Gaussian インターフェースを使用して物性を計算 Autodock Conflex インターフェースを装備 MOPAC2009 Jaguar Gaussian Autodock Conflex 本体は 別途購入が必要 ChemBio3D だけでは MOPAC Jaguar Gaussian Autodock Conflex 使用不可 モデル表示水素結合 水素原子 孤立電子対 蛋白質関係特有の表示を強化 3

4 MOPAC 2009 for ChemBio3D 14 半経験的分子軌道法ソフトウェア最新版 MOPAC2009 MOPAC 2009 for ChemBio3D 14 は ChemBio3D 14 と連携して MOPAC 計算を実行します MOZYME 機能 PM6 を含みます 教育機関向けは 無償です ChemBio3D 14 が必須です 本製品単独では 動作しません ChemBio3D 専用製品です ChemACX データベース 試薬情報と製品安全データシートの統合パッケージ (1 年間ごとの契約製品 ) ChemACX Web 版は 日本国内の試薬会社の情報を含む世界中の試薬会社 680 社のカタログデータベースです 構造式 試薬名 別名など文字情報 数値情報などを 1 回の検索で指定できます 11,138,606 件の単品化合物と 6,084,360 件の製品 502,026 件の CAS 番号を収録しています 化学構造を 3,751,082 件含みます (ChemACX での情報 ) ご注文時には ライセンス数分のメールアドレスを富士通までご連絡ください 社内で利用可能な ChemACX Oracle 版 SD File 版も別途購入可能です データベース ChemACX ChemSCX ChemMSDX 内容和光純薬 Sigma-Aldrich Fisher Acros Alfa Aesar TCI America など大手試薬会社のカタログを収録 試薬の購入に必要な情報を迅速に入手可能 大手スクリーニング化合物販売会社のカタログを収録 検索も可能 研究で使用される化学物質に対し 20,000 以上の化学物質安全データシート ( 米国版 ) を提供 ChemINDEX データベース 一般的化学化合物と反応のデータベースパッケージ (1 年間ごとの契約製品 ) ChemINDEX Web 版は 広範囲な化学情報ライブラリです この有機反応と低分子物性データベースは 化学情報の参考資料として利用できます データベース ChemINDEX ChemRXN NCI AIDS 内容 78,730 件の低分子化合物についての物性データを含む Infochem GmbH 製 ChemSelect 及び ISI の ChemSelect のサブセット 合計 29,000 件以上の反応を収録した有機反応データベース 抗がん剤投与量と効果の関係を収録した 223,644 件のデータベースを提供 NCI( 国立癌研究所 ) がまとめた AIDS 抗ウィルス化合物のデータベース < エンタープライズ製品 > 研究基幹システムとしての電子ノート (E-NotebookEnterprise) 環境や BioAssay,BioSAR, 富士通独自開発の試薬在庫管理システム (ZyCoaG) を多数のお客様に提供しております ( 使用データベースは Oracle) 4

5 < 年間サイトライセンス > 割安な価格で導入可能な企業 団体単位のサイトライセンスもご提供しております ご希望の場合は お問い合わせください < 導入時の操作説明会 トレーニング 運用支援 > 古い ChemBioOffice シリーズの製品をお持ちの場合は 割安な移行価格でご希望の製品の最新版をお求めいただけます 富士通では デスクトップ製品 Enterprise 製品などに対してお客様先での説明会 教育サービス を提供できます ご希望の場合は お問い合わせください サービス名 : ChemOffice WebServer スタートアップサービス型名 : SV1A363G01 サービス名 : ChemOffice WebServer 設計 / 適用型名 : SV1A363J02 データベースは Web 版のため DVD などの媒体での提供はありません ChemBioOfice に添付されている ChemACX 等は 3 ヵ月間のみの無償提供版です 期限後は 製品版の ChemACX14 ChemINDEX14 をご購入ください 同時起動ライセンス ( コンカレントライセンス ネットワークライセンス ) は 廃止になりました V14 ではハイブリッド版の提供はありません Mac 版は別途ライセンスを購入する必要があります DVD 媒体での提供内容 ( 日本語版 ) 製品インストール手引書 (50 ヘ ーシ ) ChemBioDraw ChemBioFinder,ChemBio3D などの操作手引書 機能個別解説書 (200 ヘ ーシ ) ChemBioDraw 活用ガイド (1 章 2 章 PDF 形式 ) 富士通監修による日本語ユーザーガイド (PDF 形式 ): 現在 校正中のため暫定版での提供となります 1. ChemBioDraw 14.0 ユーザーズガイド Windows/Macintosh 版 334 ヘ ーシ (6,029kB) 2. ChemBio3D 14.0 ユーザーズガイド Windows 版 332 ヘ ーシ (6,380kB) 3. ChemBioFinder 14.0 ユーザーズガイド Windows 版 319 ヘ ーシ (6,107kB) 4. ChemBioFinder for Office 14.0 ユーザーズガイド Windows 版 19 ヘ ーシ (648kB) 上記の製品構成は富士通の提供する商品であり 他の販売会社の構成情報とは異なることがあります Windows 動作環境 : Windows 7 Professional and Ultimate (32 bit) Windows 7 Professional and Ultimate (64 bit) Windows 8.1 Microsoft Internet Explorer 9.0,10.x,11.x Mozilla Firefox 27.0 Google Chrome 32.x RAM:1GB (32bit) 2GB (64bit) Microsoft Office 2007 (32bit) Microsoft Office 2010 (32bit) Microsoft Office 2013 (32bit).Net Framework 4.0 Macintosh 動作環境 :(ChemBioDraw, ChemDraw のみ ) Mac OS X 10.9 Microsoft Office 2011,Safari 7.0 (64 bit), Firefox 27.0 (64 bit),google Chrome 32.x 富士通株式会社テクニカルコンピューティング ソリューション事業本部 HPC アプリケーション統括部 千葉県千葉市美浜区中瀬 幕張システムラボラトリ TEL: FAX: contact-tcsupport@cs.jp.fujitsu.com URL: 5

6 ソフトウェア構成表 製品名 ChemBioOffice ChemBioDraw ChemDraw ChemDraw ChemBio3D ChemScript 含まれる機能 Pro Std ChemBioDraw Win/Mac ChemDraw Pro Win/Mac ChemDraw Std Win/Mac ChemDraw ActiveX/Plugin Pro Win/Mac Chem3D ActiveX/Plugin Pro Win ChemDraw ActiveX/Plugin Viewer Win/Mac Chem3D ActiveX/Plugin Viewer Win ChemBio3D Win Chem3D Pro Win ChemBioFinder Win ChemBioFinder Std Win ChemBioViz Win ChemDraw/Excel Win ChemBioFinder/Office Win CombiChem/Excel Win Search SciFinder Win/Mac CDSL for Site License Customers ios BioDraw Win/Mac Biopolymer Toolbar Win/Mac Paste Sequences Win/Mac TLC/Gel Electrophoresis Win/Mac ChemProp Win/Mac ChemNMR Win/Mac Name=Struct Win/Mac clogp (BioByte) Win/Mac pka, LogD, LogS (Mol. Networkers) Win Database Hotlink Win/Mac ChemBio3D Hotlink Win ChemScript Win Mnova Lite Win Gaussian/Jaguar/MOPAC I/F Win Autodock/Conflex I/F Win GAMESS Win Win Win/Mac Win/Mac Win/Mac Win Win 6