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みいかのあき
5 years ago
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1 R のインストールと超入門 R とは? R ダウンロード R のインストール R の基本操作 R 終了データの読み込みパッケージの操作 R とは? Rはデータ解析マイニングを行うフリーソフトである Rはデータ解析の環境でもあり言語でもあるニュージーランドのオークランド (Auckland) 大学の統計学科のRobert Gentlemanと Ross Ihakaにより開発がはじめられ 1997 年からは多くの賛同者が加えられ開発され続けているオープンソース方式のデータ解析処理の専用ソフトである R 本体はデータの簡単な操作環境プログラミング環境パッケージの操作環境を提供する複雑のデータ解析やマイニングを行うためには既存のパッケージをインストールして用いるかそれともプログラミング組むことになる R は平均年 2 回のバージョンアップを行っている 2009 年 3 月の現在の最新バージョンはである Rに用いる数千個のパッケージがインターネット上で公開されている Rのユーザは近年急速に増えている Rの大きいメリットはフリーであることとデータ解析のパッケージの豊富さである欠点はコマンドで主な操作を行う点であるこれは Excel や SPSS のようにメニューとシートの操作に慣れている方に対しては慣れるまでは苦痛に感じるであろうしかし脳のトレーニングとしては Rは Excel SPSS のようなデータ解析ソフトよりよいであろう R のダウンロード Rの生まれた故郷はニュージーランドであるが多くの国にミラーサイトがある R 本家のサイトはである.

日本では会津大学東京大学筑波大学にミラーサイトがある ftp://ftp.u-aizu.ac.jp/pub/lang/r/cran/bin/ ftp://ftp.ecc.u-tokyo.ac.jp/cran/ http://cran.md.tsukuba.ac.jp/ R はこれらのサイトからダウンロードすることができる R は,UNIX,Windows, Mac など主な OS に対応するバージョンがある.

2 日本では会津大学東京大学筑波大学にミラーサイトがある ftp://ftp.u-aizu.ac.jp/pub/lang/r/cran/bin/ ftp://ftp.ecc.u-tokyo.ac.jp/cran/ R はこれらのサイトからダウンロードすることができる R は,UNIX,Windows, Mac など主な OS に対応するバージョンがある. ここでは筑波大学のミラーサイトから Windows 32 ビットマシン用をダウンロードしてインストールする手順を説明する (1)Webブラウザを起動しにアクセスすると次ん画面が開かれる (2)[Windows] をクリックすると次の画面が開かれる (3) [base] をクリックすると次の画面が開かれ最新バージョンのダウンロードページに辿りつく

3 (4)[Download R2.*.* fow Windows] をクリックするとダウンロードのダイアログボックスが開かれる (5)[ 保存 (s)] ボタンを押すと保存場所を指定するダイアログボックスが開かれる (6) 保存場所を指定し画面の [ 保存 (s)] のボタンを押すとダウンロードが始まる

4 (7) ダウンロードが終わるとダウンロードの完了画面が開かれる [ 閉じる ] ボタンを押すとダウンロード作業が終了する R のインストール (1) ダウンロードして保存したフォルダにアクセスするとダウンロードしたセットアップファイル [R-2.*.*-Win32] が確認できる

5 (2) セットアップファイル [R-2.*.*-Win32] をクリックするとインストールの最初画面が開かれる (3) インストールの最初画面の [ 実行 (R)] ボタンを押すと次の画面が開かれる (4) 日本語が指定されているので [OK] ボタンを押すと次の画面が開かれる (5) 指示の通り他のアプリケーションを終了し [ 次へ (N)>] ボタンを押すと次の画面が開かれる

6 (6) [ 次へ (N)>] ボタンを押すと次の画面が開かれる (7) インストールするフォルダを指定し [ 次へ (N)>] ボタンを押すと次の画面が開かれる (8) インストールする項目をチェックし [ 次へ (N)>] ボタンを押す初心者は特にしてせずにそのまま [ 次へ (N)>] ボタンを押すことを薦める

7 (9) そのまま [ 次へ (N)>] ボタンを押すと次の画面が開かれる (10) そのまま [ 次へ (N)>] ボタンを押すと次の画面が開かれる (11) そのまま [ 次へ (N)>] ボタンを押すとインストールが始まる

をクリックすると R が開かれる開かれた初期画面を次に示 R は画面の上部のメニューと赤色の >

8 (12) インストールが終了すると次のお画面が開かれる (13) [ 完了 (F)] ボタンを押して終了するインストールが成功するとディスクトップに Rのアイコンのコピーが作成される R の基本操作 Rの起動デスクトップのアイコンすをクリックすると R が開かれる開かれた初期画面を次に示 R は画面の上部のメニューと赤色の > の右側に数値やデータ処理の関数をキーボードーで入力する方法でデータの作成や処理を行う赤色の > がある画面をR のコンソール画面と呼ぶ略してコンソールと呼ぶ

[Save ] ボタンを押して保存する保存するフォルダは特に指定せずに開かれたフォルダで構わない保存が終わったら [OK] ボタンを押し Rgui

9 開かれた画面の日本語文字が文字化けしたときはまず画面の上部のメニューの編集 GUI ふリファレンスをクリックし Rgui の設定エディターを開く次に Rgui の設定エディター画面で文字フォントを日本語の文字フォント MS Mincho か MS Gothic を指定する続いて画面下部の [Save ] ボタンを押して保存する保存するフォルダは特に指定せずに開かれたフォルダで構わない保存が終わったら [OK] ボタンを押し Rgui の設定エディターを終了する Rのコンソールデータの入力と計算処理を行うその画面コピーを次に示す赤色はキーボード-から入力したものでありブル色は返された結果である

上に作動するパッケージの使用環境を提供している 2009 年 4 月の現在 CRAN というサイトだけで1700 以上のパッケージが公開されている CRAN 以外に生物情報学

10 R の終了メニューのファイル終了をクリックするか RGui 画面の右上のをクリックすると作業スペースの保存を確認する画面が開かれる保存しないと作業内容が保存されない [ はい (Y)] のボタンを押すと作業内容を保存し Rが終了するデータの読み込み小規模のデータであればコンソール上で直接入力することができるパッケージの操作 R は R 上に作動するパッケージの使用環境を提供している 2009 年 4 月の現在 CRAN というサイトだけで1700 以上のパッケージが公開されている CRAN 以外に生物情報学 (bioinformatics) 関連のパッケージが BioConductorというサイトに多数公開されている正確な統計はとっていないが流通されているパッケージは2000を超えているのは確かである

R をインストールする際に広く使用されているいくつかのパッケージは自動的にインストールされているこれらに関しては読み込む操作さえすればパッケージを利用することが可能であるインストールされているパッケージは次のコマンドで確認することができる > installed.

11 R をインストールする際に広く使用されているいくつかのパッケージは自動的にインストールされているこれらに関しては読み込む操作さえすればパッケージを利用することが可能であるインストールされているパッケージは次のコマンドで確認することができる > installed.packages() パッケージの読み込み ( ロード ) 作業は関数 library require を用いるパッケージ MASS を読み込む例を次に示す > library(mass) パッケージのインストールとロードはメニューバーのパッケージを用いて行うことが可能であるパッケージのインストールはパッケージをローカルにダウンロードしてインストール方法とインターネット上で公開しているサイトから直接ネット上でインストールする方法があるローカルにダウンロードしたパッケージをインストールするのには上記のメニューのローカルにある zip ファイルからのパッケージのインストールをクリックし zip 形式で圧縮されているパッケージを読み込むことでインストールできるインターネット上でインストールするためにはまずダウンロードサイトを選択することが必要であるパッケージの数が最も多いのは CRAN である多くの国々にミラーサイトを置いてあるメニューパッケージ CRAN ミラーサイトの設定をクリックすると次のミラーサイトのリスト画面が開かれる

jp でボート番号が 2020 である場合は次のようなコマンドを実行する必要がある > Sys.setenv("http_proxy"="http:// proxy.syokuba.ac.

12 現時点では日本には3つのミラーサイトがある上記のように一つを選択して [OK] ボタンを押しメニューパッケージパッケージのインストールをクリックすると次のようなパッケージのリスト画面が開かれる一つあるは複数のパッケージを選択し [OK] ボタンを押すとインストールが始まる大学や企業団体のネットワークがインターネット接続にプロキシ (proxy) を用いる場合は次のような 1 行のコマンドを実行する必要があるたとえば某職場のポロキシの IP アドレスが proxy.syokuba.ac.jp でボート番号が 2020 である場合は次のようなコマンドを実行する必要がある > Sys.setenv("http_proxy"=" proxy.syokuba.ac.jp:2020 ") コンソール上でコマンドを用いてパッケージをインストールすることも可能である例としてパッケージ randomforest と ada4 をインストールするコマンドを次に示す > install.packages(c("randomforest","ada4")) 筑波大学のミラーサイトからパッケージをインストールするコマンドの例を次に示す

13 > install.packages(c("randomforest","ada4"),repos=" tsukuba.ac.jp/") パッケージのアンインストール関数 remove.packages を用いる

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