ニューロイメージングプラットフォーム (NIMG-PF) ~ 脳活動計測に関するニューロインフォマティクス ~ User s Manual 1

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れんかねぎたや
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1 ニューロイメージングプラットフォーム (NIMG-PF) ~ 脳活動計測に関するニューロインフォマティクス ~ User s Manual 1

2 U U U1.NIMG-PF U U U2.NIMG-PF U U U3. U U U4. U U U5.INDEX U U U6. U U U7. U U U1.1.NIMG-PF U U U1.2. U U U2.1. U U U2.2. U U U2.3. U U U3.1. U U U3.2. U U U3.3. U U U3.4. U U U3.5. U U U3.6. U U U3.7. U U U3.8. U U U3.9. U U U U U4.1. U U U4.2. U U U4.3. U U U4.4. U U U4.5. U U U5.1.PUBLIC U U U5.2.INDEX U U U5.3.PRIVATE U U U6.1. U U U6.2. U U U6.3. 目次についてU... 3 とはU... 3 システムの利用者とその権限 U... 3 を利用するにあたって U... 4 ユーザ登録 U... 4 ログイン U... 5 プロフィールの編集 U... 5 画面構成と基本操作 U... 7 NIMG-PF トップ画面 U... 7 メインメニュー U... 8 SEARCHU... 9 INDEX TREEU... 9 登録アイテムの評価 U... 9 USER MENUU... 9 WHO S ONLINEU THEMESU SITE INFORMATIONU U3.10. メイン画面 U...11 アイテム U アイテムについてU メタ情報 U アイテムタイプ U アイテム登録の注意点 U アイテムの登録法 U について U INDEX,GROUP INDEX および PRIVATE INDEXU の選択 U INDEXの作成と編集 U アイテム登録に関しての補足 U 各種アイテム登録画面 U アイテム間の関連付けU アイテムの編集 ( 公開と非公開 )U その他の機能 U

3 U U U7.1. U U U7.2. U U U B 10B BRAIN COORDINATESU 脳図検索モード U 脳画像 3D BROWSEU B1.NIMG-PF について 7B1.1.NIMG-PFとはニューロイメージングプラットフォーム (NIMG-PF) は XooNIps をベースにインターネット上でニューロイメージングに関する様々なデータの共有を可能するためのデータベースシステムです URL XooNIps をベースにしている NIMG-PF には以下の 3 つの大きな特徴があります * 1 36Bデータベース構築の柔軟さ CMS* 2 をベースとして作成されておりデザイン変更や機能拡張などが容易に行えシステムにあまり精通していない方々でもデータベースの立ち上げができます 37BXooNIps が扱うデータの多様性と拡張性デフォルトで既に様々なデータ形式が備えられていることや新たなデータ形式も扱えるように拡張機能も備えているので数多くのデータを扱うことが可能です 38Bメタ情報の流通機能メタ情報流通の標準プロトコルである OAI-PMH(Open Archives Initiative Protocol for Metadata Harvesting) *3 を実装しており他の XooNIps データベースや XooNIps 以外の OAI-PMH を備えたデータベースとメタ情報を介して協調が可能です *1 以下の部分は下記の URL からの引用 HUhttp://xoonips.sourceforge.jp/manuals/usersman-ja/index.htmlU *2 テキストや画像などのデジタルデータの統合的に管理するシステムの総称 *3 データの自動収集によってメタ情報を交換する 8B1.2. システムの利用者とその権限 39Bモデレータ NIMG-PFの設定などを行う管理者です登録ユーザの管理や公開領域へのアイテム登録について審査を行い承認ないし取り下げを判断します 40B 登録ユーザモデレータに承認されてNIMG-PFを利用できるユーザですアイテムを登録や登録したアイテムの管理が可能ですまた許可を得て 3 登録ユーザゲストユーザモデレータ承認 XooNIps 登録利用アイテム利用

1B グループに参加できます 41Bゲストユーザ登録していないかまだログインをしていないユーザです公開領域に登録されているアイテムの閲覧やゲストユーザの利用が許可されているアイテムのダウンロード操作が可能です 1B2.NIMG-PF を利用するにあたって 9B2.1. ユーザ登録 NIMG-PF ではゲストユーザでもある程度の利用は可能ですが

4 1B グループに参加できます 41Bゲストユーザ登録していないかまだログインをしていないユーザです公開領域に登録されているアイテムの閲覧やゲストユーザの利用が許可されているアイテムのダウンロード操作が可能です 1B2.NIMG-PF を利用するにあたって 9B2.1. ユーザ登録 NIMG-PF ではゲストユーザでもある程度の利用は可能ですがアイテムの登録や登録ユーザに利用を限定したアイテムは利用できません登録ユーザになるためにはアカウント申請を行いモデレータから承認を得る必要がありますトップ画面の Register( 新規登録 ) を選択後アカウント申請画面にて * のマークが付けられている必要事項をUできるだけ英語でU 全て入力し送信してくださいまた学校や企業などの機関などに所属していない場合は所属欄に None と入力してください新規登録 42B 登録の流れ成りすまし登録を防ぐために申請を2 段階にしています最初の申請を行うと正規登録をするための URL が自動的にメールで送られてきます送られてきた URL のリンク先で再度登録申請を行っていただきここで初めてモデレータによる審査が入ります 1 新規登録申請ゲストユーザ 2 登録メールへアカウント登録 URL 自動送信 3 リンク先のアカウント登録 4 承認モデレータ 4

5 10B2.2. ログインアカウントの承認後トップ画面のログイン欄にユーザ名とパスワードを入力しログインしてくださいログイン 1B2.3. プロフィールの編集アカウントの承認後パスワード変更などのプロフィール編集を行うことができますアカウント承認直後は初期設定のパスワードになっているためパスワードの変更を行うようにしてください以下にパスワード変更の例を示します 1 Account をクリック 2 プロフィールの編集をクリック 3 パスワード 2 ヶ所の記入欄に新しいパスワードを入力します新しいパスワードを入力した後画面下にある以上でパスワードの変更完了ですをクリックします 5

6 またその他のプロフィールの変更は 3 の画面にて可能です操作は上記と同様に行ってください 6

7 2B3. 画面構成と基本操作 12B3.1. NIMG-PF トップ画面 < メインメニュー > <Search> <Index Tree> < 登録アイテムの評価 > < 登録ユーザメニュー > < オンラインユーザ > < メインの表示エリア > < テーマ > < サイト情報 > 7

この部位の脳活動を含む資料を検索することができます 7 章に詳細説明があります < チュートリアル >

8 13B3.2. メインメニュー NIMG-PF の各ページの上部に表示されているメニューバーです <NIMG-PF について> NIMG-PF の理念や使用法などが紹介されています <XooNIps モード> NIMG-PF のメイン画面に戻りますまたページ左上のバナーを選択することでも戻ることができます < 脳図検索モード> X,Y,Z の3 方向の脳断面図上で任意の指定した部位についてこの部位の脳活動を含む資料を検索することができます 7 章に詳細説明があります < チュートリアル > ニューロイメージング研究の初心者向けのチュートリアル情報を見ることができます <3D Browse> MRI データベースに関する表示機能ですサルと人の3D-MRI 画像をブラウジングできます詳しくは7 章に説明があります < 言語切り替え> NIMG-PF では英語と日本語に対応しておりそれぞれの国旗バナーをクリックすることで言語を切り替えることができます 8

AND の絞込みや特定のアイテムなどに絞っての検索が可能です検索するキーワードを入力

をクリックするとアイテムごとに日付指定などで更に詳細な検索を行うことができます図.

Index Tree Index Tree は登録アイテムをユーザに分かりやすい形で分類

9 14B3.3. Search キーワードを入力し登録されているアイテムの検索を行うことができます複数キーワード ( 空白区切り ) による AND の絞込みや特定のアイテムなどに絞っての検索が可能です検索するキーワードを入力検索する範囲指定また詳細検索をクリックするとアイテムごとに日付指定などで更に詳細な検索を行うことができます図.Advances Search 15B3.4. Index Tree Index Tree は登録アイテムをユーザに分かりやすい形で分類管理する索引です Index Tree の項目を選択することにより登録アイテム群を検索することができます階層構造になっているので上の階層から下の階層へより細かく絞り込みを行うことができます 16B3.5. 登録アイテムの評価登録されているアイテムは登録ユーザ同士で評価を付けることができます 17B3.6. User Menu 登録ユーザのみに表示されるメニューですアイテム登録やメッセージのやりとりなどはここから行います 9

43BAdd New Item( 新規アイテム登録 ) アイテムの登録を行います詳しくは4 章で説明します 4BUser List( ユーザ一覧 ) NIMG-PF に登録されているユーザを表示します 45BGroup List( グループ一覧 ) NIMG-PF に登録されているグループを表示します 46BNotification( イベント通知機能 ) XOOPS の機能を利用し

10 43BAdd New Item( 新規アイテム登録 ) アイテムの登録を行います詳しくは4 章で説明します 4BUser List( ユーザ一覧 ) NIMG-PF に登録されているユーザを表示します 45BGroup List( グループ一覧 ) NIMG-PF に登録されているグループを表示します 46BNotification( イベント通知機能 ) XOOPS の機能を利用し承認や変更などのイベント通知に関する設定を行います初期設定が全ての通知が行われない設定となっているので注意してください通知の受信先を NIMG-PF 内の受信箱と通常のメールの受信箱で使い分けることができます通知が欲しい項目にチェックを入れる通知先の設定 47BInbox( 受信箱 ) 他のユーザやモデレータからのメッセージを保管しています 48BListing Item( アイテム一覧 ) 登録ユーザが自分自身で登録したアイテムの一覧を表示します 49BEdit Private Tree( プライベートツリー編集 ) プライベートツリーの作成や編集を行います詳しくは5 章で説明します 50BLogout( ログアウト ) ログアウトします 18B3.7. Who s Online 現時刻のログイン状況を表示します 19B3.8. Themes レイアウトなどの概観をいくつかの中から選択し変更することができます 20B3.9. Site Information NIMG-PF についての様々な情報を見ることができます 51BInstructions for Use 動作環境や使用上の注意が書かれています 52BCopyrights NIMG-PF で扱うアイテムやデータの著作権について説明しています 53BPrivacy Policy 登録ユーザの個人情報の扱いが書かれています 10

54B 運用母体運用母体である NIMG-PF 委員会や理化学研究所の脳科学総合研究センター

5BRegistered Item types 登録されているアイテムをアイテムタイプごと ( アイテムタイプについては4

11 54B 運用母体運用母体である NIMG-PF 委員会や理化学研究所の脳科学総合研究センター神経情報基盤センターへの連絡先を載せています 21B3.10. メイン画面トップページの大半のスペースを占めているのがこのメイン画面ですここでは登録されているアイテムの情報などが表示されており大きく3つの項目に分けて情報を表示しています 5BRegistered Item types 登録されているアイテムをアイテムタイプごと ( アイテムタイプについては4 章で説明します ) に検索することができますアイテムのバナーをクリックすると指定したアイテムの一覧が表示されます 56BRanking 登録アイテムの中で閲覧されたアイテムやダウンロードされたアイテムなどをランキングで表示しています 57BUpdate 登録されたアイテムの更新履歴です 11

12 3B4. アイテム 2B4.1. アイテムについてデータ文章などの様々なコンテンツを NIMG-PF に登録しますがこれをアイテムと呼びますアイテムには登録の際にメタ情報 (4.2 参照 ) をつけまた公開レベルに応じて3 種類の索引 (Public Index, Group Index, Private Index 5 章参照 ) をつけます 23B4.2. メタ情報メタ情報 ( メタデータとも呼びます ) は登録作成説明利用承諾などのアイテムの属性に関する情報を指しますアイテムタイプ (4.3 参照 ) ごとに持っている情報が違いますので登録の際に入力するメタ情報の内容が変わってきます 24B4.3. アイテムタイプ登録できるアイテムは全部で9 種類ありますこれらをアイテムタイプと呼び下記のような種類があります 58Binder Binder は特定のテーマに関連する登録アイテムのリストのことで Private Index や Public Index の中に表示されますこれを見れば特定のテーマについてどのようなアイテムが登録されているかがひと目で分かりますニューロイメージングに関する書籍を登録するためのアイテムタイプです ISBN が分かっているものであれば ISBN を入力することにより情報を自動的に取得補完できます論文を登録するためのアイテムタイプです PubMed ID が分かる場合はそれを入力することにより MedLine を通じてメタ情報を自動的に取得補完できます発表資料や講義資料などを登録するためのアイテムタイプです実験に用いた視聴覚刺激のデータや計測生データなどを登録するためのアイテムタイプです刺激提示用プログラムやデータ解析用のプログラムなどを登録するアイテムタイプです賦活部位の座標データを登録するアイテムタイプです座標データを登録することで座標からの論文検索が可能となります実験の前提となるモデルや実験結果から構築されたシミュレータなどを登録するアイテムタイプです 12

13 UIニューロイメージングに関する情報コンテンツを持つ Web ページを登録するためのアイテムタイプです 25B4.4. アイテム登録の注意点アイテムを登録する際には以下の点に注意してください 59B 著作権についてアイテムを登録する際は被験者からデータベースへの登録公開に関する同意を得てまた知的財産権に問題が無いことを確認の上登録を行ってください NIMG-PF に登録されたアイテムについて著作権の移転は行いません登録者自身が著作権者から NIMF-PF でアイテムを複製配布などを行う非独占的な権利を許可していただきます利用者がアイテムをダウンロードして利用する際の許諾条件に関しても登録者自身が著作権者と相談して定めてくださいこの条件の決定には NIJC と NIMG-PF は関与いたしませんもし著作権者からクレームが寄せられた場合にはその旨を登録者に通知し対処していただきます PF 交渉許諾 User アイテム PF A 登録者 A 著作権者 A 利用条件 PF が複製配布する権利公開停止アイテム B 利用条件登録者 B 通知紛争解著作権者 B NIJC PF 委員会クレーム 60B 登録の際の言語設定日本語のみのアイテムを登録する場合は日本語でメタ情報を入力する以外に英文メタ情報について少なくともタイトルを英語で記入しその後に Japanese Only と記して登録してくださいその際日本語のタイトルを [ja][/ja] のコマンドで挟み英語のタイトルを [en][/en] で挟んでください日本語表示の時には日本語のタイトルが英語表示の時には英語のタイトルが表示されます 61BPaperアイテムのpdfデータ Paper アイテムには論文の pdf データを登録することができますが出版社の版権の問題があるためこの pdf データは他のユーザからは見ることができず登録した本人のみが閲覧可能です 62Bアイテムの公開について ( アイテムの公開については 6 章でも説明しています ) アイテムの登録において Private Index のみを選択する場合登録者自身はそのアイテムを利用できますが他のユーザは閲覧利用ができませんアイテムを一般に公開するためには Public Index を一つ以上選択して登録しモデレータの承認 13

を得る必要がありますなお Group Index を選択しグループ管理者の承諾を得れば特定のグループメンバのみが利用できるようになります 26B4.5.

2アイテムのメタ情報を入力します * のマークが付いている項目は必ず入力してくださいメタ情報の項目はアイテム毎に異なるので注意してください.

必要項目の入力が完了しましたらボタンをクリックします 4 4 Register のページで登録内容に間違いがなければをクリックします 5Public Index

14 を得る必要がありますなお Group Index を選択しグループ管理者の承諾を得れば特定のグループメンバのみが利用できるようになります 26B4.5. アイテムの登録法ユーザメニューの新規アイテム登録をクリックし登録を開始しますユーザメニューより新規アイテム登録を選択アイテムの種類を指定します 2アイテムのメタ情報を入力します * のマークが付いている項目は必ず入力してくださいメタ情報の項目はアイテム毎に異なるので注意してくださいアイテムの入る Index を指定します Private の Index を少なくとも一つは指定してください (5 章に詳細説明があります ) 必要項目の入力が完了しましたらボタンをクリックします 4 4 Register のページで登録内容に間違いがなければをクリックします 5Public Index を選択した場合はモデレータからの承諾 ~~ という画面が表示されますのでこれで登録作業は終了ですモデレータが承諾すると全体に公開されますモデレータからの承認可否連絡はイベント通知設定をしなければ送られてきませんイベント通知設定は p.7 参照 14

15 4B5.Index について 27B5.1.Public Index,Group IndexおよびPrivate Index アイテムを登録するときには必ず Index を設定しなければなりませんアイテムの公開レベルに合わせて以下の3つの Index を設定できますまた登録後でもアイテムの Index 設定を変更できます 63BPublic Index 全ユーザが共通に利用する Index ですユーザが一般に公開するアイテムには必ず設定します Index 内の用語はあらかじめ指定されており編集は行えません複数の選択が可能です 64BGroup Index 特定のグループに属するユーザが利用する Index ですグループで利用するアイテムにはこれを設定します Index 内の用語はグループ管理者が作成しており編集は行えません複数の選択が可能です 65BPrivate Index 一般のユーザに公開するかどうかに関わらずこの Index は少なくとも一つは選択しなければなりませんこの Index のみが設定されているアイテムは登録したユーザのみ閲覧できます Private Index は外部からは見ることができません登録ユーザ自身が管理する Index であり新規作成編集などが可能です複数選択が可能です Private Index 登録アイテム A 利用不可利用不可一般のユーザ登録ユーザ Group Index 利用可登録登録アイテム B Public Index アイテム C 利用不可利用可グループに属す利用可るユーザ 15

29B 5.3.Private 28B5.2.Indexの選択 1. 登録アイテムの内容を表す Index を選んでください 2. 付与する Index は複数選択することができます 3. 複数 Index を付与した場合はとれがもっとも近いかなどの順番はなくすべてが同格です 4. 下位 Index を付与しても上位 Index が自動的に付与されることはありません 5.

16 29B 5.3.Private 28B5.2.Indexの選択 1. 登録アイテムの内容を表す Index を選んでください 2. 付与する Index は複数選択することができます 3. 複数 Index を付与した場合はとれがもっとも近いかなどの順番はなくすべてが同格です 4. 下位 Index を付与しても上位 Index が自動的に付与されることはありません 5. 下位 Index と上位 Index を同時に付与することができます 6. 上位下位両方を付与するかあるいはどちらかのみを付与するかはそのアイテムを表すために妥当を思われる Index を登録者が判断してください Index の作成と編集 Private Index は登録ユーザ自身が登録アイテムを効率よく管理できるように自由に作成編集できます下図のように Index として最初は Private のみですがこの階層の下に任意の名前の Index を追加できます Private Index には容量に制限があります ( 公開すれば制限は掛かりません ) Index Tree の Private タブに切り替えます 6BPrivate Indexの作成画面 User Menu の Edit Private Tree を選択すると作成編集画面に移ります 1 現在着目している Index を確認します 2 着目している Index の下に付ける Index 名を入力します 3 をクリックしますまた新たに Index を追加する場合も同様の作業を行います 16

U 編集対象となる U チェックボックスを 67BPrivate Index の編集画面順序の変更

17 U 編集対象となる U チェックボックスを 67BPrivate Index の編集画面順序の変更 Indexの ON で順序を選択可能 Index 名の変更に新しい名前を入力後クリック階層の変更で移動先を選択 5B6. アイテム登録に関しての補足アイテム登録を図解で説明するとともに登録後の編集やアイテム間での関連付けなどの機能を説明します 30B6.1. 各種アイテム登録画面 68Binder 69B 関連するアイテムをならべてひと目で分かるように表示します 70Binderは公開の程度によってPrivate IndexやPublic Indexを付与できます追加したいアイテムにチェックを入れますをクリックしますをクリックします 17

Medline からメタ情報を自動的に取得補完できます Private Index

18 71Book 72BISBNを用いてメタ情報を自動的に取得補完可能 ISBN が判っている場合メタ情報を自動的に取得補完できますが Private Index から必ず一つは Index を指定してください 73BPaper 74BPubMed IDを用いてメタ情報を自動的に取得補完可能 PubMed ID が判っている場合 Medline からメタ情報を自動的に取得補完できます Private Index から必ず一つは Index を指定してください PDF 形式の論文データをこちらよりアップできます 18

19 12B 75BPresentation & Doc 以下の設定等ができます 76B ファイルのDownload 制限オプション ( 誰でも可能 or 登録ユーザのみ ) 7BRead meの添付 78B 利用許諾の設定 Creative Commons にのっとったライセンスの設定 16B 商用利用の可否 17B 修正利用の可否 ( 可能同一利用許諾条件であれば可能不可 ) 18B 独自ライセンスの設定ファイルの種類ファイル作成者ファイルの内容を利用者に簡単に示す Preview や Caption の指定添付ファイルの指定 Download 制限 Read me の設定 Creative Commons ライセンスの設定独自ライセンスの設定関連アイテムの指定 19

20 13B 79BData 以下の設定等ができます 80B ファイルのDownload 制限オプション ( 誰でも可能 or 登録ユーザのみ ) 81BRead meの添付 82B 利用許諾の設定 Creative Commons にのっとったライセンスの設定 19B 商用利用の可否 120B 修正利用の可否 ( 可能同一利用許諾条件であれば可能不可 ) 121B 独自ライセンスの設定ファイルの種類ファイル作成者添付ファイルの指定ファイルの内容を利用者に簡単に示す Preview や Caption の指定 Download 制限 Read me の設定 Creative Commons ライセンスの設定独自ライセンスの設定関連アイテムの指定 20

14B 83BTool 以下の設定等ができます 84B ファイルのDownload 制限オプション ( 誰でも可能 or 登録ユーザのみ ) 85BRead meの添付 86B 利用許諾の設定 Creative Commons にのっとったライセンスの設定 12B 商用利用の可否 123B 修正利用の可否 ( 可能

21 14B 83BTool 以下の設定等ができます 84B ファイルのDownload 制限オプション ( 誰でも可能 or 登録ユーザのみ ) 85BRead meの添付 86B 利用許諾の設定 Creative Commons にのっとったライセンスの設定 12B 商用利用の可否 123B 修正利用の可否 ( 可能同一利用許諾条件であれば可能不可 ) 124B 独自ライセンスの設定ファイルの種類ファイル作成者ファイルの内容を利用者に簡単に示す Preview や Caption の指定添付ファイルの指定 Download 制限 Read me の設定 Creative Commons ライセンスの設定独自ライセンスの設定関連アイテムの指定 21

22 87Brain Coordinates 8B 89B 賦活部位の座標データを登録します脳図検索モードを用いて賦活部位の脳図上の表示座標からの論文検索が可能です登録済みアイテムに座標データを付与する場合対象とするアイテムの ID を入力ベースアイテムの情報 Ex:Paper,Book など Brain Coordinate 情報 22

15B 90BModel 以下の設定等ができます 91B ファイルのDownload 制限オプション ( 誰でも可能 or 登録ユーザのみ ) 92BRead meの添付 93B 利用許諾の設定 Creative Commons にのっとったライセンスの設定 125B 商用利用の可否 126B 修正利用の可否 ( 可能

23 15B 90BModel 以下の設定等ができます 91B ファイルのDownload 制限オプション ( 誰でも可能 or 登録ユーザのみ ) 92BRead meの添付 93B 利用許諾の設定 Creative Commons にのっとったライセンスの設定 125B 商用利用の可否 126B 修正利用の可否 ( 可能同一利用許諾条件であれば可能不可 ) 127B 独自ライセンスの設定ファイルの種類ファイル作成者添付ファイルの指定ファイルの内容を利用者に簡単に示す Preview や Caption の指定 Download 制限 Read me の設定 Creative Commons ライセンスの設定独自ライセンスの設定関連アイテムの指定 23

24 94BURL リンク先のバナーを登録 31B6.2. アイテム間の関連付け既に登録されているアイテムと関連付けを行うことができます関連させるアイテムは Item ID( システムが自動で割り振る ID) で指定します対象となるアイテムの ID をアイテム登録画面の一番下にある記入欄に記入します 1 行につき1つの ID を登録してくださいアイテムの ID が分からない場合はをクリックすると検索画面が新規ウィンドウで起動しその画面にて ID を検索できますここに Item ID を記入関連アイテムの検索 ( 新規ウィンドウが起動 ) Item ID この画面は検索のみであり ID の登録はできません 24

のみが設定されているアイテム ) を編集し公開することができます編集画面にて対象のアイテムに該当する

問題がなければ承認しますこのようにして非公開だったアイテムを公開することができます

25 関連付けたアイテム登録確認画面 32B6.3. アイテムの編集 ( 公開と非公開 ) 95Bアイテムの公開登録ユーザがアイテムを公開するためには Public Index を必ず設定しモデレータに承諾されなければなりません登録ユーザは自分自身が登録したアイテムを編集することができ非公開のアイテム (Private Index のみが設定されているアイテム ) を編集し公開することができます編集画面にて対象のアイテムに該当する Public Index を設定し編集を完了するとその内容に対してモデレータが審査を行い問題がなければ承認しますこのようにして非公開だったアイテムを公開することができますイベント通知の設定を行わなければ審査結果が返ってこないため注意してください 96Bアイテムを公開するための編集の流れ編集したいアイテムのある Private Index を選択します 1 2 編集するアイテムを選択します 3 編集ボタンを選択します 25

4 Public Index Tree にて必要な Index を全てチェックしますメタ情報の編集確認画面へ 5 チェックした Index が設定されます変更内容に誤りがなければ更新をクリックし編集完了 97Bアイテムの非公開アイテムを非公開にするためには Public Index

26 4 Public Index Tree にて必要な Index を全てチェックしますメタ情報の編集確認画面へ 5 チェックした Index が設定されます変更内容に誤りがなければ更新をクリックし編集完了 97Bアイテムの非公開アイテムを非公開にするためには Public Index を一つも設定せず Private Index のみが設定されている状態にしなければなりません上記のアイテムの公開同様に登録後の編集で非公開にすることが可能です上記の4の工程でチェックされている Public Index を外すことで公開から非公開へと設定を変更できますこの場合モデレータの承認はありません 26

27 6B7. その他の機能 3B7.1. Brain Coordinates Brain Coordinates は Paper や Data のような他のアイテム ( ベースアイテムと呼びます ) の情報に脳座標や認知機能などの Brain Coordinates 情報を付加するアイテムです登録済みアイテムに座標データを付与する場合対象とするアイテムの ID を入力ベースアイテムの情報 Ex:Paper,Book など Brain Coordinate 情報 98Bベースアイテム情報の補完ベースアイテムが既に登録されている場合ベースアイテム ID の欄にそのアイテムの ID を入力し Complete ボタンを押すとベースアイテムの情報が自動で入力されますここでベースアイテムの情報に変更を加えても元のベースアイテムには反映されませんのでご注意ください 9Bベースアイテムを新規に登録 10B 新たにベースアイテムを登録する場合アイテムタイプを選択しタイプ毎に指定されている入力欄に必要な情報を入力してくださいこの場合ベースアイテムID は空欄のままにしてくださいこの登録法ではベースアイテムとBrain Coordinatesアイテムの2つが同時に登録されます 27

ID を入力して情報を補完タイプを選択 101Brain Coordinatesアイテム情報ベースアイテムの入力の他に認知機能や脳領域名などの Brain Coordinates アイテムの情報を入力します脳領域名では複数の領域は, ( 半角カンマ ) で区切って入力してください - 直接入力の他に

脳座標リスト形式のどちらを用いても構いません - 脳座標リスト形式は x, y, z のように半角カンマ区切りで座標を書くことができます複数の座標は :( 半角セミコロン ) で区切って記述します例 ) 1, 2, 3: 4, 5, 6: 7, 8, 9 (1, 2, 3) (4, 5, 6) (7, 8, 9) - Add

28 ID を入力して情報を補完タイプを選択 101Brain Coordinatesアイテム情報ベースアイテムの入力の他に認知機能や脳領域名などの Brain Coordinates アイテムの情報を入力します脳領域名では複数の領域は, ( 半角カンマ ) で区切って入力してください - 直接入力の他に右のリストボックスをダブルクリックして追加することも出来ます認知機能引用元は,( 半角カンマ ) 区切りで入力してください脳座標の種類は入力する脳座標が MNI 座標系か Talairach 座標系かを指定します - 標準では詳細不明が選択されており脳座標は仮に Talairach 座標系であるとみなされます脳座標の入力には脳座標脳座標リスト形式のどちらを用いても構いません - 脳座標リスト形式は x, y, z のように半角カンマ区切りで座標を書くことができます複数の座標は :( 半角セミコロン ) で区切って記述します例 ) 1, 2, 3: 4, 5, 6: 7, 8, 9 (1, 2, 3) (4, 5, 6) (7, 8, 9) - Add ボタンを押すと座標が追加されます追加された座標は Remove ボタンで取り除くことが出来ます 102BIndexの扱い Brain Coordinates の登録と同時にベースアイテムを新規登録する場合は Brain Coordinates 登録で設定する Index がベースアイテムにも適用されますが ID で既存のアイテムを選択した場合はベースアイテムの Index には反映されませんので注意してください 28

29 全ての入力が終わったら次へボタンを押して確認画面へ移行してください確認画面でエラーが表示された場合戻るを押して登録画面へ戻りデータの修正を行ってください表示された内容で問題ない場合は登録ボタンを押してください確認画面の例アイテムが問題なく登録されますと以下のような画面が表示されアイテムが登録されます 103Bアニメーションでの説明メインメニューの NIMG-PF についてのリンク先にある本サイトの使い方にて Brain Coordinates の操作説明をアニメーションで行っているものがありますのでそちらも参考にしてください 29

30 34B7.2. 脳図検索モード指定した脳座標に関連するアイテムを検索できるモードです脳の画像をクリックして座標を指定します指定した座標値が表示されますここで直接数値入力して座標を指定することもできます左側の脳領域一覧から脳領域を選んで右側に移動させるとその脳領域が脳画像上で赤く表示されます ( このフォームはデフォルトで非表示になっているので表示ボタンを押して表示させてください ) 指定した座標から半径何ミリメートルの範囲まで検索範囲とするか指定しますこのボタンをクリックすると検索が実行されますアイテムタイプやアイテムのタイトルなどに検索条件をつけたい場合このフォームで指定してください注 ) and 検索脳座標の検索条件とアイテムタイプ等の検索条件の両方にマッチするものを検索します or 検索脳座標の検索範囲とアイテムタイプ等の検索条件のどちらかにマッチする 30

検索を実行すると下記のような検索結果が表示されます先ほどの検索フォームに戻るにはここのタブで表示切替をします 1 件分のアイテムの内容はこのように表示されます次の 10 件の検索結果の表示表示件数の変更アイテムの並び替えができますアイテム1 件ごとに [DETAIL] [INFO] [SPOT] のボタンが用意されています [DETAIL] そのアイテムの詳細ページを表示します

31 検索を実行すると下記のような検索結果が表示されます先ほどの検索フォームに戻るにはここのタブで表示切替をします 1 件分のアイテムの内容はこのように表示されます次の 10 件の検索結果の表示表示件数の変更アイテムの並び替えができますアイテム1 件ごとに [DETAIL] [INFO] [SPOT] のボタンが用意されています [DETAIL] そのアイテムの詳細ページを表示します [INFO] そのアイテムが関係する脳座標の一覧を表示します [SPOT] そのアイテムが関係する脳座標を脳画像上に表示します ([INFO] [SPOT] はクリックする毎に表示 / 非表示を切替えできます ) 104Bアニメーションでの説明メインメニューの NIMG-PF についてのリンク先にある本サイトの使い方にて脳図検索モードの操作説明をアニメーションで行っているものがありますのでそちらも参考にしてください 31

32 35B7.3. 脳画像 3D Browse 脳画像 3D ブラウジングは下記のように 4 種類のパーツで構成されています右上脳の断面位置角度深度の操作フォーム左上脳を上 ( 下 ) から見た画像左下脳を前 ( 後ろ ) から見た画像右下脳を右 ( 左 ) から見た画像 105B 操作フォームの説明データの日時を指定できます設定値を修正した後このボタンをクリックすることで画像が更新されます脳の断面位置を指定できます脳の傾き ( 角度 ) を指定できますノイズレベルを指定できます 32

106Bボタンの説明座標軸を表示座標軸を非表示 ( 立体図の ) 初期画面に戻す ( 平面図の ) 初期画面に戻すメッシュを表示メッシュを非表示立体図を表示平面図を表示皮膚付き画像を表示 ( 人の脳画像版には未実装 ) 皮膚なし画像 ( 脳 ) を表示矢印方向に図を回転矢印方向に図を回転矢印方向に図を回転矢印方向に図を回転矢印方向に図を回転矢印方向に図を回転

33 106Bボタンの説明座標軸を表示座標軸を非表示 ( 立体図の ) 初期画面に戻す ( 平面図の ) 初期画面に戻すメッシュを表示メッシュを非表示立体図を表示平面図を表示皮膚付き画像を表示 ( 人の脳画像版には未実装 ) 皮膚なし画像 ( 脳 ) を表示矢印方向に図を回転矢印方向に図を回転矢印方向に図を回転矢印方向に図を回転矢印方向に図を回転矢印方向に図を回転画像を左右反転画像を上下反転画像の断面軸を上側に移動画像の断面軸を下側に移動 107Bマウス操作座標軸を表示中以下のマウス操作を行うことができますクリックするとクリックした地点を断面軸の原点に設定しますクリック中はクリックした地点の座標値が表示されます断面軸はドラッグして移動させることができます 108Bアニメーションでの説明メインメニューの NIMG-PF についてのリンク先にある本サイトの使い方にて3D-Browse の操作説明をアニメーションで行っているものがありますのでそちらも参考にしてください 33

画面上部 1 管理者設定検索自動振分一覧説明管理者モード / 一般モードの切替を行います詳細については注意事項を参照下さいを押すとメニューが表示されます管理者モードの操作方法は管理者設定編を参照下さいキーワードを元に選択したFAXの文書の検索が出来ます FAX 自動振分の情報を確認

画面上部 1 管理者設定検索自動振分一覧説明管理者モード / 一般モードの切替を行います詳細については注意事項を参照下さいを押すとメニューが表示されます管理者モードの操作方法は管理者設定編を参照下さいキーワードを元に選択したFAXの文書の検索が出来ます FAX 自動振分の情報を確認 imagio Neo221/271/352/452 ML4600 等のメモリー転送機能を利用して JobMagic 上で FAX の確認ができます受信した FAX をメールや回覧板等の JobMagic の他の機能でも利用可能です FAX を一覧表示するメニューの FAX MagicHat(FAX) もしくはメニューバー ( 新着表示 ) の FAX がありますをクリックすると FAX 受信トレイ一覧画面が表示されます

ニューロイメージング プラットフォーム (NIMG-PF) ~ 脳活動計測に関するニューロインフォマティクス ~ User s Manual 1

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