Microsoft PowerPoint _生物配列解析基礎_3回目.pptx
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- きよあつ むこやま
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1 1 古細菌 真正細菌 3 4
2 多くの生物にはDNA修復を行う機 構が備わっており これらをDNA 突然変異 修復系と呼ぶ アルビノのカラス １つのDNAに生じた突然変異によって鎌状赤血球貧血症になる 5 進化の総合説 現在 進化を説明する理論 として最も支持されている のは進化の総合説と呼ばれ るもので 自然選択説や突 然変異説 隔離説 メンデ ルの遺伝子の理論 集団遺 伝学の理論や中立進化説な どを統合したものである 点変異の種類 突然変異 突然変異による遺伝子の変異に よって 様々な形質の持つ個体 が出現する 自然選択 7 環境に適応し 生存に有利な形 質を持つ個体が生き残っていく 8
3 9 中立変異..GATGGCTTCGTACCA.. Asp Gly Phe Val Pro ヘモグロビン遺伝子の 比較 C A A G..GATGGATTCGTGCCA.. Asp Gly Phe Val Pro 9 分子系統樹 分子進化の中立説..GATGGCTTCGTACCA.. Asp Gly Phe Val Pro G C T A..GATGCCTTCGAACCA.. Asp Ala Phe Glu Pro ２ヵ所の突然変異が生じたが アミノ酸配 列は変わらない 中立変異 突然変異によって アミノ酸配列が変化 した このような変異は害がないので 次世代 に伝わりやすい このような変異は 多くの場合 有害であ るので 次世代に伝わりにくい 12 系統樹の作成法 DNAに蓄積する変異は一定の割合で起こっており そのほとんどが自然選択とは無関 係な中立の変異である DNAの配列がどのくらい似ているかを調べることによって 進化的にどの程度近縁で あるかを知ることができる
4 種分岐によって A1, A2, 2 つのオーソログが生じた A 共通祖先遺伝子 B 遺伝子重複によって A, B, 2 つのパラログが生じた A1 B1 A2 B2 B2 A1 2つのゲノム間のオーソログは, 双方向ベストヒットを調べることで同定できる. B1 種 A A2 B2 種 B B2
5 COG データベース Clusters of orthologous groups of proteins ゲノムが解読された生物について アミノ酸配列のオーソログ関係を双方向ベストヒットによって整理したデータベース
6 Thermotoga_maritima CCTAACACATGCAAGTCGAGCGGGGGAA ACTCCCTTCGGGGA 88 Thermotoga_petrophila CCTAACACATGCAAGTCGAGCGGGGGAA ACTCCCTTCGGGGA 89 Aquifex_aeolicus CCTAACACATGCAAGTCGTGCGCAGGGTCGG------CCCCTTTTGGGGC 92 Hydrogenobacter_thermophilus CCTAACACATGCAAGTCGTGCG--GGGT-GG------CTCT Hydrogenobaculum_sp CCTAACACATGCAAGTCGTACGGAGAGTGGGGCA--ACTCA Sulfurihydrogenibium_sp CCTAACACATGCAAGTCGTG-GGGCAGCAGGCTACTACCTTCGGGTAGTA 88 Sulfurihydrogenibium_azorense CCTAACACATGCAAGTCGTG-GGGCAGCAGGCTATTACCTTCGGGTAATA 97 Escherichia_coli CCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAG-AAGCTTGCTTCTTT-- 93 Salmonella_enterica CCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAG-CAGCTTGCTGCTTC-- 83 Burkholderia_mallei CCTTACACATGCAAGTCGAACGGCAGCACGG-----GCTT-CGGCCT Helicobacter_pylori CCTAATACATGCAAGTCGAACG--ATGAAGCTTCTAGCTTGCTAGAGT-- 92 Campylobacter_jejuni CCTAATACATGCAAGTCGAACG--ATGAAGCTTTTAGCTTGCTAGAA Chlamydophila_pneumoniae GATGAGGCATGCAAGTCGAACGGAATAATGACTTCGG-TTGTTAT Bacillus_subtilis CCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGGTGGG---AGCTTGCTCCCT Deinococcus_radiodurans CTTAAGACATGCAAGTCGAACG CGGTCTTCGGAC Thermus_thermophilus CCTAAGACATGCAAGTCGTGCGGGCCGCGGGGT----TTTACTCCGT Pyrococcus_horikoshii ACTAAGCCATGCGAGTCAAGGGGGCGTC CCTTCTGGGAC Bacillus subtilis Thermus thermophilus Deinococcus radiodurans Escherichia coli Burkholderia mallei Sulfurihydrogenibium azorense Sulfurihydrogenibium sp Hydrogenobacter thermophilus Helicobacter pylori Salmonella enterica Campylobacter jejuni Aquifex aeolicus Chlamydophila pneumoniae Thermotoga petrophila Thermotoga maritima Hydrogenobaculum sp Pyrococcus horikoshii 23 24
7
8 30 クラスター分析 cluster analysis 2 つ以上の対象を, それらの間の類似度あるいは非類似度を手がかりにして似たものを集め, いくつかのグループ ( クラスター ) に分類する方法 31 32
9 Bacillus subtilis Bacillus subtilis M. mobile M. pulmonis M. synoviae M. hyopneumoniae 7448 M. hyopneumoniae 232 M. hyopneumoniae J Mesoplasma florum M. mycoides M. penetrans Ureaplasma parvum M. gallisepticum M. genitalium M. pneumoniae Ca. Phytoplasma asteris OY M. hyopneumoniae 232 M. hyopneumoniae 7448 M. hyopneumoniae J M. pulmonis M. synoviae M. mobile M. mycoides Mesoplasma florum Ureaplasma parvum M. penetrans M. gallisepticum M. genitalium M. pneumoniae Ca. Phytoplasma asteris OY イエローストーン国立公園の間欠泉 36
10
11
12 46 (Felsenstein, J. Mol. Evol., 1981))
13 49 50
14
15 57 < 課題の提出方法 > 受講生の方へ のページ 課題提出用 Web mailページへ ( 講義室のみからアクセス可 ) [email protected]を選ぶ 系統樹課題 と入力 氏名 所属 学生証番号 メールアドレス を入力 考察 および本日の講義の感想などを, 記入してください kadai1 と kadai2 を送ってください Escherichia coli 99 Salmonella enterica Campylobacter jejuni Helicobacter pylori Hydrogenobacter thermophilus 99 Aquifex aeolicus Hydrogenobaculum sp Persephonella marina Sulfurihydrogenibium azorense Sulfurihydrogenibium sp Thermus thermophilus Deinococcus radiodurans Thermotoga petrophila Thermotoga maritima 59 DnaE (DNA polymerase III) GyrB (DNA gyrase) Hydrogenobacter thermophilus Hydrogenobaculum sp Aquifex aeolicus Persephonella marina Sulfurihydrogenibium azorense Sulfurihydrogenibium sp Campylobacter jejuni Helicobacter pylori Salmonella enterica Escherichia coli Thermotoga petrophila Thermotoga maritima Thermus thermophilus 96 Deinococcus radiodurans M. hyopneumoniae J M. hyopneumoniae 232 M. hyopneumoniae 7448 M. pulmonis Mhy M. synoviae group M. mobile Mesoplasma florum Mmy M. mycoides group M. genitalium M. pneumoniae Mpn M. gallisepticum group Ureaplasma parvum M. penetrans Ca. Phytoplasma asteris Bacillus subtilis M. hyopneumoniae J M. hyopneumoniae 232 M. hyopneumoniae 7448 M. synoviae M. pulmonis M. mobile M. penetrans Ureaplasma parvum M. gallisepticum M. genitalium M. pneumoniae M. mycoides Mesoplasma florum Ca. Phytoplasma asteris Bacillus subtilis Mhy group Mpn group Mmy group
日本化学療法学会雑誌第57巻第1号
In vitro Streptococcus pneumoniae Escherichia coli in vitro Streptococcus pneumoniae Escherichia coli µs. pneumoniae E. coli µ Key words in vitrostreptococcus pneumoniae Escherichia coli Escherichia coli
修士論文予稿集の雛型
2010 年度第 6 回情報処理学会東北支部研究会 ( 山形大学 ) 資料番号 10-6-A5-1 バクテリアの塩基配列における文字の含量を用いた解析山形大学大学院理工学研究科応用生命システム工学専攻小池公洋 木ノ内誠 1. はじめに近年多くの生物の全ゲノム配列が決定されている 2010 年 3 月現在 バクテリアでは 1400 種以上の全ゲノム配列が決定されている 決定された配列から生命現象を解明するために
分子系統解析における様々な問題について 田辺晶史
分子系統解析における様々な問題について 田辺晶史 そもそもどこの配列を使うべき? そもそもどこの配列を使うべき? 置換が早すぎず遅すぎない (= 多すぎず少なすぎない ) そもそもどこの配列を使うべき? 置換が早すぎず遅すぎない (= 多すぎず少なすぎない ) 連続長は長い方が良い そもそもどこの配列を使うべき? 置換が早すぎず遅すぎない (= 多すぎず少なすぎない ) 連続長は長い方が良い 遺伝子重複が起きていない
- 1 -
- 1 - - 1 - ... 1... 2... 4... 5... 9... 11... 14... 16... 20... 21... 22... 23... 23 - 1 - - 2 - - 3 - - 4 - - 5 - - 6 - - 7 - - 8 - - 9 - ( ) - 10 - - 11 - Pseudomonas aeruginosa Escherichia coli Staphylococcus
E. coli E. coli é H. influenzae Helicobacter pylori
é C.pneumoniae C.trachomatis C.trachomatis 1 é Chlamydia pneumoniae Chlamydia psittaci Chlamydia trachomatis 3 E. coli E. coli é H. influenzae Helicobacter pylori K. pneumoniae L. monocytogenes ü l Staphylococcus
Acecide_ProductsInformation2010PDF.indd
53-0115-00-4PDF 53-0115-00-4PDF INDEX 1 3 9 11 12 16 21 38 39 40 42 43 44 45 46 47 53-0115-00-4PDF 3 1 Critical Semicritical Noncritical Disinfection Sterilization 53-0115-00-4PDF 2 53-0115-00-4PDF O =
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Babesia gibsoni - Babesia gibsoni - Babesia gibsoni - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
国際塩基配列データベース n DNA のデータベース GenBank ( アメリカ :Na,onal Center for Biotechnology Informa,on, NCBI が運営 ) EMBL ( ヨーロッパ : 欧州生命情報学研究所が運営 ) DDBJ ( 日本 : 国立遺伝研内の日
生物情報工学 BioInforma*cs 3 遺伝子データベース 16/06/09 1 国際塩基配列データベース n DNA のデータベース GenBank ( アメリカ :Na,onal Center for Biotechnology Informa,on, NCBI が運営 ) EMBL ( ヨーロッパ : 欧州生命情報学研究所が運営 ) DDBJ ( 日本 : 国立遺伝研内の日本 DNA データバンクが運営
in situ Hex
in situ Hex Sox Sox17Sox18 Sry Sox9 Sox17 Hex Hex N Drosophila O The 5th Conference on ABC Proteins and Ion Channels From Gene to Disease The 5th Conference on ABC Proteins and Ion Channels From Gene
分子系統解析における様々な問題について 田辺晶史
分子系統解析における様々な問題について 田辺晶史 そもそもどこの配列を使うべき? そもそもどこの配列を使うべき? 置換が早すぎず遅すぎない (= 多すぎず少なすぎない ) そもそもどこの配列を使うべき? 置換が早すぎず遅すぎない (= 多すぎず少なすぎない ) 連続長は長い方が良い そもそもどこの配列を使うべき? 置換が早すぎず遅すぎない (= 多すぎず少なすぎない ) 連続長は長い方が良い 遺伝子重複が起きていない
,...~,.'~ 表 2.6.2.2-26 試験管内 PAE 菌株薬剤 MIC (µg/ml) PAE (h) 1 MIC 4 MIC STFX 0.025 0.92 2.35 S. aureus FDA 209-P LVFX 0.20 0.68 2.68 CPFX 0.20 1.05 1.59 SPFX 0.10 0.35 1.07 STFX 0.025 2.33 1.14 E. coli KL-16
no
12 2004.9.3. no.234 2004.9.3. no.234 13 14 2004.9.3. no.234 2004.9.3. no.234 15 16 2004.9.3. no.234 2004.9.3. no.234 17 18 2004.9.3. no.234 19 2004.9.3. no.234 20 2004.9.3. no.234 21 2004.9.3. no.234 22
配付資料 自習用テキスト 解析サンプル配布ページ 2
分子系統樹推定法 理論と応用 2009年11月6日 筑波大 院 生命環境 田辺晶史 配付資料 自習用テキスト 解析サンプル配布ページ http://www.fifthdimension.jp/documents/molphytextbook/ 2 参考書籍 分子系統学 3 参考書籍 統計的モデル選択とベイジアンMCMC 4 祖先的な形質 問題 OTU左の の色は表現型形質の状態を表している 赤と青
7-1（DNA配列から遺伝子を探す）.ppt
DNA 配列の中から遺伝子を探す Blast 解析.6 Query DNA 塩基配列アミノ酸配列 DNA 塩基配列をアミノ酸配列に変換アミノ酸配列 DNA 塩基配列をアミノ酸配列に変換 データベース DNA 塩基配列アミノ酸配列アミノ酸配列 DNA 塩基配列をアミノ酸配列に変換 DNA 塩基配列をアミノ酸配列に変換 1. 2. 3. TATGGCTTA---- T G L TATGGCTTA----
UIプロジェクトX
超好熱性アーキアは遺伝子工学技術 開発にとっての金山である! 九州大学 大学院農学研究院石野良純 アーキアの分子生物学 1 1973 年 1988 年 2012 年 遺伝子組換え技術の開発 PCR 法の開発 ゲノム編集技術の開発 全て原核微生物の分子生物学から始まっている 新たな金 ( 発見 ) を掘り起こす可能性大 アーキア研究は分子生物学者にとっては金山である 超高温環境の遺伝子資源を利用 2
はじめての進化論 河 田 雅 圭 このサイトは 1990年講談社発行の はじめての進化論 の全文を掲載しています 著作権は著者である河田雅圭にあ ります 個人での非商用利用 大学などの教育機関での利用 サークルやセミナーでの利用に限ってコピーを許可しま す すべての本文 図 写真の商用による無断転載を禁止します 引用は河田(1990) はじめての進化論 講談社でお 願いします なを 本内容は 1989年に書かれたものであり
基礎遺伝学
基礎遺伝学 講義資料パート 3 作成者 : 北大農学部 荒木仁志 1 次世代の Genotype frequency 推定 HWE が自然集団で成り立つ 5 条件 1. 集団のサイズが十分に大きい 2.Allele 頻度に性差がない 3. この遺伝子座 (locus) において任意交配 (random mating) 4. 移住がない 5. この遺伝子座において突然変異 自然選択が起きない 2 5.
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" " " " n " n n " n " n n n " n n n n " n LGPSSKQTGKGW-SRIWDN! + +! LN-ITKSAGKGAIMRLGDA! " n -------TGKG--------!! -------AGKG--------! " n w w w " n w w " " " 11 12 " n w w w " n w w A! M! O! A!
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第65回日本化学療法学会東日本支部総会 抄録
鍵 76 Clostridioides difficile C. difficile 77 γ γ Mycobacterium avium 78 79 Clostridium difficile Treponema pallidum 80 81 82 in vitro in vitro 83 鍵 Treponema pallidum 84 Chlamydia trachomatis Mycoplasma
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 表 3 フルオロキノロン 系 抗 菌 剤 の 原 体 流 通 量 ( 実 量 ) 種 類 年 次 原 体 流 通 量 (kg) ERFX OFLX OBFX DFLX DNFX 合 計 牛 豚 鶏 肉 牛
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 資 料 5 家 畜 等 に 使 用 するフルオロキノロン 系 抗 菌 剤 による 薬 剤 耐 性 菌 に 関 する 食 品 健 康 影 響 評 価 について( 案 ) Ⅰ.
Microsoft Word - 11 進化ゲーム
. 進化ゲーム 0. ゲームの理論の分類 これまで授業で取り扱ってきたゲームは 協 ゲームと呼ばれるものである これはプレイヤー同士が独立して意思決定する状況を表すゲームであり ふつう ゲーム理論 といえば 非協力ゲームを表す これに対して プレイヤー同士が協力するという前提のもとに提携形成のパタンや利得配分の在り方を分析するゲームを協 ゲームという もっとも 社会現象への応用可能性も大きいはずなのに
ｋｎｓｐ－０９／ｋｙ０８２８４４１３９０００００５９４２
1 4 17 10 : 50 11 : 50 2 4 17 15 : 00 16 : 00 1 4 17 16 : 00 17 : 00 2 4 18 10 : 50 11 : 50 1 4 17 8:50 9:20 2 4 17 9:20 9:50 3 4 17 9:50 10 : 20 4 4 17 10 : 20 10 : 50 5 4 17 10 : 50 11 : 20 6 4 17 11
（個別のテーマ） 薬剤に関連した医療事故
- 67 - III - 68 - - 69 - III - 70 - - 71 - III - 72 - - 73 - III - 74 - - 75 - III - 76 - - 77 - III - 78 - - 79 - III - 80 - - 81 - III - 82 - - 83 - III - 84 - - 85 - - 86 - III - 87 - III - 88 - - 89
（個別のテーマ） 放射線検査に関連した医療事故
- 131 - III - 132 - - 133 - III - 134 - - 135 - III - 136 - - 137 - III - 138 - - 139 - III - 140 - - 141 - III - 142 - - 143 - III - 144 - - 145 - III - 146 - - 147 - III - 148 - - 149 - III - 150 - -
<4D F736F F F696E74202D F90B695A8947A97F189F090CD8AEE91625F3189F196DA5F8E9197BF2E >
1 2 kiso1 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 AP009356 と入力 National Center for Biotechnology Information http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 13 All Databases データベースの統合検索システム主なデータベースは,PubMed ヌクレオチドシークエンスデータベース タンパク質シークエンスデータベース
スライド 1
平成 23 年度第 2 回データベース講習会 創薬研究における統合データベースの活用 比較ゲノムデータベース Evola, G-compass の活用法 http://hinv.jp/evola/ http://hinv.jp/g-compass/ 産業技術総合研究所バイオメディシナル情報研究センター 原雄一郎 2012 年 1 月 20 日 ( 金 ) 於 : 産業技術総合研究所関西センター 本日の概要
アルゴリズム入門
アルゴリズム入門 第 11 回 ~ パターン認識 (1)~ 情報理工学系研究科 創造情報学専攻 中山英樹 1 今日の内容 パターン認識問題の 1 つ : アラインメント アルゴリズム 再帰 動的計画法 2 パターン認識 音や画像の中に隠れたパターンを認識する 音素 音節 単語 文 基本図形 文字 指紋 物体 人物 顔 パターン は唯一のデータではなく 似通ったデータの集まりを表している 多様性 ノイズ
( )
Web Web 1 3 1 21 11 22 23 24 3 2 3 4 5 1 1 11 22 9 2 3 15 11 22 2 11 21 4 5 ( ) 102 ( ) 1 ( 1 2001 Web 1 5 4 1 1 - 7 - [] - 7 10 11 12 12 1 10 1 12 - [] 1 1 2 Q1 Q2 Q3 Q4 Q5 Q6 Q7 Q8 Q9 Q10 3 1 47
<4D6963726F736F667420576F7264202D2081A193B98BE257656290EA97708CFB8DC08B4B92E88179918D8D878CFB8DC0817A816990568B4B816A81798A6D92E894C5817A2E646F63>
夏目小兵衛直克
39(1906)1222 14(1817) 3(1832)1514(1843) 2628 6 (1853) (1854)3727 3(1856) 1 / 13 5(1858)6(1859) 5(1853) () () () () () () 3(1867)29 504111( 2 / 13 )98 23 18 2(1869)310283 100 50() 58 226 3313200982 5033
スライド 1
DNA を用いた微生物 分析の現場での活用 平成 18 年 10 月 5 日 B 会場 15:30~15:50 三井農林 ( 株 ) 食品総合研究所微生物分析サービス 衛生管理手法の変化 従来の方法 公定法に基づく微生物検査 一般性菌数 大腸菌群の判定など 実際は HACCP や cgmp の導入 大規模 大量生産 流通の多様化 迅速化 安全性追求意識の高まり より正確正確で迅速迅速かつ簡便簡便な微生物検査方法が必要
Perl + α. : DNA, mrna,,
2009 Perl + α. : DNA, mrna,, DNA .. DNA A C G T DNA 2 A-T, C-G DNA NH 2 NH 2 O - O O N P O - O CH 2 O N N O - O P O CH 2 O N O - O O P O NH 2 O - O - N CH 2 O N O OH OH OH DNA or RNA (U) (A) (G) (C)
第82 回日本感染症学会総会学術集会後抄録（II）
Corydoras sterbai Kryptopterus bicirrhis Petitella georgiae Xiphophorus maculatus rpob Xba Mycobacterium szulgai Mycobacterium gordonae M. szulgai M. gordonae M. avium M. szulgai M. gordonae M. szulgai
Slide 1
MEGA5 と Perl を用いた 分子進化解析の基礎 野澤昌文 2012 年 1 月 16 日基礎生物学研究所 ハンズオンセミナー 1 分子進化研究における一般的手法 相同な配列の比較 塩基配列 配列名塩基配列 A A T G G T A C A C B A T G A T A C A C C A T G G T A C A T アミノ酸配列 配列名 アミノ酸配列 A Met Val His B
第十五改正日本薬局方第一追補
316 3 5 7 9 9 9 12 13 14 14 14 23 23 23 24 24 29 29 29 35 37 131 161 173 193 194 198 200 205 3 37 37 37 38 38 38 39 39 40 40 41 42 43 43 45 46 47 48 49 50 51 52 52 53 54 54 54 55 56 58 58 59 60 60 61 61
白金耳ご購読者各位
白金 耳 Vol.28, No.11( 平成 19 年 11 月号 ) ごあんない 坂本雅子 定期講習会報告 ばくと姫の知識箱 基礎講習会報告 バイキン Quiz ( 敬称は略させていただきました ) 講習会 あ ん な い 10 2 3 A B C D 4 5 6 -1 7 8 9 10 11 直接分離培養 糞便検査手順 増菌培養 DHL SIB CIN TCBS Skirrow セレナイトアルカリヘ
核内受容体遺伝子の分子生物学
核内受容体遺伝子の分子生物学 佐賀大学農学部 助教授和田康彦 本講義のねらい 核内受容体を例として脊椎動物における分子生物学的な思考方法を体得する 核内受容体遺伝子を例として脊椎動物における遺伝子解析手法を概観する 脊椎動物における核内受容体遺伝子の役割について理解する ヒトや家畜における核内受容体遺伝子研究の応用について理解する セントラルドグマ ゲノム DNA から相補的な m RNA( メッセンシ
４月号 学会特集号 １２２２４７／１６）一般演題目次
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 48 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 49 60 61 62 63 64 65 66 67 68
相同性配列検索ツール：GHOST-MPと ヒト口腔内メタゲノム解析
並列配列相同性検索プログラム GHOST-MP 講習会 ( 講義編 ) 2015 年 3 月 20 日 東京工業大学大学院情報理工学研究科 角田将典 石田貴士 秋山泰 1 講師紹介 角田将典かくたまさのり 石田貴士いしだたかし 秋山泰あきやまゆたか 東京工業大学大学院情報理工学研究科計算工学専攻 2 本日の予定 13:00-13:05 ごあいさつ 13:05-13:50 GHOST-MP 講習 13:50-14:00
研究成果報告書
様式 C-19 科学研究費補助金研究成果報告書 平成 23 年 3 月 28 日現在 機関番号 :3714 研究種目 : 若手研究 研究期間 :28~21 課題番号 :279342 研究課題名 ( 和文 )Toll-like receptor 1 のリガンド探索および機能解析研究課題名 ( 英文 )Functional analysis of Toll-like receptor 1 研究代表者清水隆
統合失調症発症に強い影響を及ぼす遺伝子変異を，神経発達関連遺伝子のNDE1内に同定した
平成 26 年 10 月 27 日 統合失調症発症に強い影響を及ぼす遺伝子変異を 神経発達関連遺伝子の NDE1 内に同定した 名古屋大学大学院医学系研究科 ( 研究科長 髙橋雅英 ) 精神医学の尾崎紀夫 ( おざきのりお ) 教授らの研究グループは 同研究科神経情報薬理学の貝淵弘三 ( かいぶちこうぞう ) 教授らの研究グループとの共同研究により 統合失調症発症に関連していると考えられている染色体上
(1) GGT阻害剤
(GGT) (glutathione, GSH, -L-Glu-L-Cys-Gly) Cys 1 10 mm GSSG GSH 98% - + H 3 N COO - γ- O H N O N H SH O γ-glu Cys Gly OH - (GGT, EC 2.3.2.2) GGT (GSH) GSX - Glu Cys(X)-Gly 1-2) GGT - 1 hydrolases transferases
生物学入門
第 10 章タンパク質のはたらき これまでの学習で遺伝子はポリペプチド鎖をコードしていることがわかった タンパク質の構造については第 2 章で大まかなことを述べたが ポリペプチド鎖の構造と機能の関係 ポリペプチド鎖とタンパク質の関係を 具体的な例をあげて述べていこう 生物学をあまり知らない人でも ヘモグロビンという名前を聞いたことがあるだろう 赤血球中にある酸素を運搬するタンパク質である 血液を取ってきて赤血球を集めると
4-4 in situ PCR 研究室 in situ PCR 標的菌種と遺伝子 ( 報告年 ) 応用 Dept. of Marine Sciences University of Georgia USA Escherichia coli O157slt II Escherichia coli 16SrDNA Ralstonia eutropha phl (1997,1998,1999,2002)
スライド 1
タンパク質 ( 生化学 1) 平成 29 年 4 月 20 日病態生化学分野 分子酵素化学分野教授 山縣和也 生化学 1のスケジュール 4 月 20 日 講義開始 6 月 1 日 中間試験 9 月 25 日 生化学 1 試験 講義日程 内容は一部変更があります 講義資料 ( 山縣 吉澤分 ): 熊本大学病態生化学 で検索 ID: Biochem2 パスワード :76TgFD3Xc 生化学 1 の合否判定は
Helicobacter pylori H. pylori H. pylori Helicobacter pylori
TitleHelicobacter pylori 感染症 Author(s) 森下, 鉄夫 Journal 歯科学報, 105(1): 22-31 URL http://hdl.handle.net/10130/186 Right Posted at the Institutional Resources for Unique Colle Available from http://ir.tdc.ac.jp/
Microsoft Word - CATNewsVol5NoS4Text doc
COMPLEX ADAPTIVE TRAITS Newsletter DNA gyrase ENX GFLX LFLX CPFX CTX CPZ CAZ CEX CFIX Cell wall synthesis LVFX SM OFLX - KM NFLX AMK NA GM RFP NM TP AZM CP TC DOXY MINO Protein synthesis Vol. 5 No. S 表紙写真
生物物理 Vol. 45 No. 1 (2005) だけ正確なアラインメントが必要な方 (4) 立体構造とアミノ酸配列の関係, あるいは立体構造と機能との関係に興味がある方 2. おもなサービス 2.1 ペアワイズ3Dアラインメントこれは2つの構造をアラインメントする基本的な機能であり,MATRAS
生物物理 45(1),41-44(2005) 立体構造比較サーバ MATRAS の使い方 1. はじめに 奈良先端科学技術大学院大学情報科学研究科川端猛 あるタンパク質と似ている他のタンパク質を探したいとき, まず最初に試みるべきはアミノ酸配列の相同性検索であろう. しかし, 同じファミリーのタンパク質の中でも, アミノ酸配列の一致度が低くなってくると, 配列の類似性だけで議論するのには限界が出てくる.