PubMed と Web of Science 検索実習問題 & 解説 講習内容 テーマや著者名から雑誌論文を探す : - 英語論文 ( 医学 生命科学系 ): PubMed 例題 1 - ( 参考 )UTokyo Article Link の使い方 - 英語論文 ( 全分野 ): Web of Science コアコレクション 例題 2 例題 3 他のデータベースも GACoS から利用可能! 論文等のデータを整理して参考文献リストを作る :RefWorks ( 別冊テキスト ) 自宅からデータベースや電子ジャーナルを利用する ( レポート 論文支援ブック 別冊参照) SSL-VPN Gateway サービス 配布資料 PubMed と Web of Science 検索実習問題 & 解説 ( この資料 ) 文献リストをサクッと作成 :RefWorks を使うには レポート 論文支援ブック : ここから始めよう 自宅からデータベースや電子ジャーナルを使うには?( レポート 論文支援ブック 別冊 ) Web of Science クイック レファレンス ガイド データベースの入口 GACoS( ガコス ) 学内 学外 OK http://www.dl.itc.u-tokyo.ac.jp/gacos/index.html TREE 画面上部にもリンクがあります この資料に関するお問合せ : 東京大学本部情報基盤課 [ 学術情報リテラシー担当 ] TEL: 03-5841-2649( 内線 :22649) メール : literacy@lib.u-tokyo.ac.jp 1
テーマから雑誌論文を探す ~ PubMed ~ 例題 1 ips 細胞 (ips cell) についての英語論文を探す 検索結果に UTokyo Article Link ボタンが出る (p.4 参照 ) PubMed 学内から GACoS のデータベースの先頭文字 P から http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?otool=ijputmlib 東大専用入口 学外から 東大専用入口は SSL-VPN Gateway サービス またはフリーアクセス http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ 1 検索画面で検索語を入力 ( 必要に応じて 論理演算子 (AND/OR/NOT) を半角大文字で入力 ) 2 Search ボタンをクリックすると 検索結果一覧が表示される 3 必要に応じ Filters で絞り込み条件を設定 4 論文名をクリックすると詳細画面が開く 5 本文を見るには Full Text ボタンまたは UTokyo Article Link ボタンをクリック 1 2 精度の高いフレーズ検索の場合は ( ダブルクォーテーション ) が必要 ほとんどの場合は無くても自動的にフレーズ検索 ( 検索式の確認が必要 次ページ参照 ) 並べ替えなど画面表示変更はここから レビュー論文 ( 総説 ) に絞り込み 3 Filters( 絞り込み ) 全解除 過去 5 年間の論文に絞り込み ( 日付範囲指定も可能 ) 選択したデータの保存 メール送信などができる 画面に表示させる Filters の項目を加除 File: データのダウンロード Citation manager: 文献管理ツールへ保存 Clipboard: 一時保存 ( ブラウザの印刷機能でまとめ印刷 ) E-Mail: メール送信 2
4 2016. 7- 論文準備のための文献検索 :PubMed と Web of Science 本部情報基盤課 [ 学術情報リテラシー担当 ] 5 入力した語 ips cell が入っていないがヒットした なぜ? p. 4 参照 データベース側で付与した MeSH 用語 ( シソーラス用語 ) 検索式の確認 ( 検索結果一覧画面の右下 Search details の See more をクリックする ) 検索した後 どのような検索式が実行されたかを Search Details で確認 必要なら修正して再検索 入力した語だけでなく 対応するシソーラス用語でも自動的に検索 参考 : CABG( 冠動脈バイパス術 coronary artery bypass graft) と入力して検索した場合 MeSH=Medical Subject Headings 米国国立医学図書館作成のシソーラス ( 用語集 ) 入力した検索語 (cabg) だけで検索されている このように MeSH 用語を自動的に検索しない場合もあるので注意 MeSH Terms( シソーラス用語 ) MeSH に基づいて付与された 論文の内容を表すキーワード 自動マッピング機能により 適切なものがあれば 入力した検索語だけでなく 関連する MeSH Terms でも自動的に検索してくれる 3
( 参考 ) UTokyo Article Link の使い方 CiNii Articles 等の文献検索ツールを検索した時に 本文へのリンクが無い場合は UTokyo Article Link ボタンをクリックしてください 検索している論文を 東京大学で利用できる電子ジャーナルや東京大学 OPAC で探してくれるサービスです 各種データベースで表示される UTokyo Article Link ボタンや Full text@utokyo リンクを押すと本文が読めるサイトへジャンプする 電子ジャーナルで本文が入手できない場合にも その他のリンクが表示され そこから入手できる MyOPAC から 紙の雑誌のコピーを入手する 次ページ その他のオンライン情報源で見られる場合もある OAIster JAIRO は海外 国内の機関リポジトリの横断検索 機関リポジトリとは : 研究機関が研究成果 ( 論文など ) を公開しているサイト 4
MyOPAC から紙の雑誌のコピーを入手する MyOPAC には UTokyo Account( 東京大学アカウント ) または図書館アカウントでログイン 学外からもログインできます MyOPAC の画面例 有料 有料 雑誌の場合は必ず所蔵巻号を確認する ( 年次は 所蔵巻号の最初と最後の記録のみです ) 所蔵巻号の見方 : ( 例 )65-83 65 巻 ( または号 ) から 83 巻 ( または号 ) までは全部所蔵している ( 例 )65(1-2),66-83 65 巻は 1-2 号しか所蔵していない ( つまり 3 号以降は所蔵していない ) が 66 巻から 83 巻までは全部所蔵している MyOPAC 文献取寄サービス 有料 他キャンパスにあるなら紙のコピーで取寄可能 必要なページだけスキャンした PDF ファイルを学内からのみ閲覧可能 東大で所蔵していなくても他大学にあれば取寄可能 ボタンをクリックすると申込画面へ 事前申請が必要 ( 所属学部の図書館へ ) 最後は必ず ブラウザを閉じて終了! MyOPAC 文献取寄サービス利用申請書 ----------------- ----------------- これ 1 枚! 有料のサービスを利用するにはあらかじめ申請が必要 MyOPAC から本の予約 取寄をする 無料 所蔵館と請求記号をメモして図書館へ MyOPAC 予約 / 取寄サービス 無料 貸出中なら予約可能 他キャンパスから取り寄せて借りることも可能 5
PubMed ちょっと上級編 MeSH 検索 : シソーラス用語による検索 1 トップ画面において Search のプルダウンメニューで検索対象を MeSH に選択 ( または More Resources で MeSH Database をクリック ) 2 検索語を入力し Search ボタンをクリック 3 検索結果の MeSH 用語一覧に適切なものがあれば選択して検索 1 ~ 5 : MeSH 用語をクリックすると 上 下位語 関連語や Subheading( 副標目 ) 等が表示されるので 適宜組み合わせをして検索することも可能 1 2 1 対応する MeSH 用語へ誘導 3 Subheadings を複数選択する場合の検索方法 1 MeSH 用語をクリック 2 Subheadings を選択 3 画面右上の Add to search builder で Subheadings をどのように組合わせるか選択 4 2 と 3 を繰り返す ( 画面上部に検索式が表示される 必要なら修正可 ) 5 Search PubMed ボタンをクリック 3 選択した MeSH 用語の Subheadings( 副標目 ) やツリー構造の表示画面へ 組合せると 多様な検索が可能 選択した MeSH 用語 ( 例.Stomach Neoplasms) で PubMed を検索 2 選択した MeSH 用語 ( 例.Stomach Neoplasms) を中心主題とする文献を PubMed で検索 チェックを付けなければ下位語も自動的に検索 4 MeSH 用語の上位語 下位語表示 Stomach Neoplasms は最下位語として位置づけられている 5 6
1 複数検索語の掛け合わせ AND 検索 2016. 7- 論文準備のための文献検索 :PubMed と Web of Science 本部情報基盤課 [ 学術情報リテラシー担当 ] PubMed の効果的な検索のために OR 検索 PubMed の場合 検索用の演算子 (and, or, not など ) は半角大文字で入力 NOT 検索 stomach cancer AND nutrition stomach stomach cancer cancer OR OR stomach stomach ulcer ulcer surgery NOT endoscopic surgery 参考 スペースでも AND 検索になるが 例えば egg allergy と入力するとフレーズとして認識されて検索される 論理演算をしたい場合は egg AND allergy と入力すると 指示が明確になる 2 絞り込み Filters 機能を活用して条件を指定 文献タイプ 言語 動物 / 人間 性別 収録誌の種類 年齢等による限定が可能 ブラウザを閉じた後もしばらく Filter が残るため 検索終了後は適宜解除すること 3 検索項目を限定した検索 特定の項目を対象に検索する場合は タグをつけて検索 タグ検索では自動マッピング機能は働かない 項目名 タグ 入力例 備考 smith re[au]( ミドルネームあり ) takeda h[au] 著者 [au] smith r@[au](smith rだけをヒット ) takeda hiroyuki[au] 2002 年以降ならフルネームでも検索可 所属機関 [ad] university of tokyo[ad] 第一著者のみ 論文タイトル [ti] stomach cancer[ti] 収録誌名 [ta] british medical journal[ta] The は入れない bmj[ta] 略称形も可 出版年 [dp] 2012[dp] 2008:2011[dp] 2008/09:2011/03[dp] 出版タイプ [pt] review[pt] MeSH [mh] stomach neoplasms[mh] 4 Advanced Search タグを知らなくても プルダウンメニューで検索項目を限定して検索することが可能 検索履歴の掛け合わせ検索が可能です 例 ) #1 AND #2 5 前方一致検索 複数形のような語尾変化などに対応 自動マッピング機能は働かない 例 ) bacter* bacteria bacterium など bacter で始まるものを検索 * もっと詳しく知りたい方は 医学図書館作成のマニュアル PubMed の使い方 を参照 医学図書館ホームページ掲載 http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/ 7
例題 2 2016. 7- 論文準備のための文献検索 :PubMed と Web of Science 本部情報基盤課 [ 学術情報リテラシー担当 ] テーマから雑誌論文を探す ~ Web of Science コアコレクション ~ 日本海のプランクトンについての英語論文を探す Web of Science コアコレクション ( 全分野 ) 学内から GACoS 定番データベース から 学外から SSL-VPN Gateway サービス 1 トピック欄等に検索語を入力し 検索ボタンをクリック 2 検索結果一覧が表示される ( 適宜 絞り込み 並び替えなど ) 3 論文タイトルをクリックすると 詳細画面が表示される 4 本文を見るには全文オプションをクリック ( 出版社のサイトボタンが無い場合は UTokyo Article Link をクリック ) 1 トピック欄での入力例 自動マッピング機能はないので 類義語は適宜 OR 検索が必要 or は小文字で OK でくくると フレーズ検索 * をつけると 部分一致検索 *plankton* japan sea トピック と タイトル の欄では検索語のスペルのバリエーションと複数形は自動検索される フレーズ検索ではこの自動機能が無効になるので この場合は * で部分一致検索が必要例 : 被引用数が多い順に表示 2 3 4 p. 4 参照 文献管理ツールへ保存 (RefWorks は東大で契約 所属者は無料で利用可能 ) ここで本文が見られる 被引用数 この論文を引用している文献 引用文献 この論文が引用した文献 関連レコード この論文と引用文献が共通している文献 (Related Records) 8
著者名検索 例題 3 坪井俊 ( つぼいたかし ) 先生の論文を探す 苗字名前のイニシャル * イニシャルの前方一致検索で フルネームもイニシャルのみもヒット 著者名で検索後 必要に応じて 論文掲載誌の分野 ( Web of Science の分野 研究分野 ) などで絞り込み 所属機関名は 論文発表時の 所属機関となるので注意 検索結果をまとめて印刷 ダウンロード等 検索で見つけた論文を マークリスト に入れておくと 最後にまとめて印刷 ダウンロード等ができる 3 2 1 ステップ 1: レコードを選択ステップ 2: フィールド ( 出力項目 ) を選択ステップ 3: 出力方法 手段を選択 RefWorks テキスト参照 9
参考 引用文献検索 2016. 7- 論文準備のための文献検索 :PubMed と Web of Science 本部情報基盤課 [ 学術情報リテラシー担当 ] 検索例ワトソンとクリックによる DNA 二重螺旋構造の論文を 引用している文献を探す Watson, JD.; Crick, FHC. Molecular Structure of Nucleic Acids: A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid. Nature. 1953, 171(4356), p.737-738. 1 検索画面の切替から 引用文献検索 をクリック 2 著者名 出版物名 出版年等を入力 3 検索ボタンをクリック 4 該当する文献にチェックを付けて選び 選択した文献で検索 ボタンをクリック 5 引用文献検索の結果 (4 で選択した文献を引用している論文の一覧 ) が表示される 1 切り替える 引用文献検索 こんなときに * キーワード検索がうまくいかないとき * ある論文や図書などがどの論文に何回引用されたか知りたいとき! 雑誌論文だけでなく 図書も検索 OK!Web of Science 収録対象外の資料も検索 OK 2 苗字名前のイニシャル * 雑誌名 ( 省略形 ) や書名を入力 * を付けて検索の幅を広げる 雑誌名省略形は 短縮形リストを表示 で確認 図書の時は重版により出版年が複数あり得るので空欄に 3 4 最終的な検索の前に文献の候補が表示される 検索条件の追加も可能 ( 厳密にしすぎないことを推奨 ) 引用のバリエーションがある場合は ここに複数の候補が表示される 同一文献であっても 引用した人によって書名の書き方が異なる場合や 出版年の違い 雑誌論文の Volume Page を間違えて引用された場合などがあり得るので 注意して選ぶ 10
Web of Science コアコレクションの効果的な検索のために 1 複数検索語の掛け合わせ AND 検索 OR 検索 NOT 検索 genetic (and) resource genetic or heritable genetic not genetic counseling AND 検索 NEAR 検索 フレーズ検索 and 複数の検索語が含まれるレコードを検索 near 複数の検索語が指定した語数内にあるレコードのみ検索 ( 指定なしは 15 語以内 ) フレーズ 複数の検索語が入力したとおりの語順に並んでいるレコードのみ検索 検索結果多 少 /( スラッシュ ) の後に指定の数字 genetic near/10 resource 2 検索結果の絞り込み 絞り込み条件を指定 Web of Science の分野 ドキュメントタイプ 研究分野 著者名 グループ著者名 編集者 出版物名 シリーズタイトル 出版年 所属機関 - 拡張 助成金提供機関 言語 国 / 地域 ESI 上位の論文 オープンアクセス ( の可否 ) による限定が可能 Web of Science の分野 と 研究分野 は共に論文掲載誌の分野 ( 論文そのものの分野ではない ) で Web of Science の分野 のほうがやや細かい区分となっている 条件ごとに上位 5 項目を表示 それ以降を見る場合は その他のオプション をクリック 3 検索履歴の利用 検索履歴の掛け合わせ検索が可能 例 ) #1 AND #2 #1 OR #3 ( ユーザ登録をすれば 検索履歴の保存が可能 ) 4 前方一致検索 語尾変化などに対応 部分一致も可能 例 ) histor* history historical など histor で始まるものを検索 単数形と複数形 (computer computers) 米国式英国式綴りのバリエーション (color colour) などは * なしでもトピック タイトルは自動検索される ただしフレーズ検索では無効になるので注意 5 アラートサービス (Web of Science ユーザ登録 サインインが必要 ) 検索アラート : 検索結果一覧画面または検索履歴画面で [ アラートを作成 ] をクリックすると 指定した頻度で 保存した検索式を自動的に実行し 登録してあるメールアドレスにお知らせが届きます 引用アラート : 論文詳細画面右側の [ 引用アラートの作成 ] をクリックすると Web of Science 収録の別の論文がその論文を引用した場合 (= 被引用数が増えた場合 ) に 登録してあるメールアドレスにお知らせが届きます * もっと詳しく知りたい方は 画面右上の ヘルプ をご覧ください 11
その他の国内雑誌論文 新聞記事データベース 学内から GACoS 定番データベースから CiNii Articles 学外から SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービスまたは CiNii Articles に直接アクセスして サイトライセンス個人 ID で利用日本国内で発行された学術論文 学協会誌 大学の研究紀要を中心とした論文情報データベース ( 国立情報学研究所提供 ) ざっさくプラス 学内から GACoS さ から 学外から SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス同時アクセス数 :20 名まで 旧名称 雑誌記事索引集成データベース 明治期から現在までの国内総合雑誌 地方雑誌等の記事が検索できる CiNii Articles との横断検索可能 J-STAGE 学内 学外 OK GACoS J から ( 東京大学契約分は学内のみ ) 科学技術振興機構 (JST) 提供 国内の学会が発行する電子ジャーナルを閲覧できる 記事検索 誌名検索 引用文献参照機能がある ジャーナル一覧で Free マークのものは学外からでも利用 OK 医中誌 Web 学内から GACoS い から 学外から SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス同時アクセス数 :15 名まで 国内医学文献の抄録誌である 医学中央雑誌 の Web 版 国内の大学 学協会 研究所 病院などから発行されている雑誌 営業誌 学会等の会議録 講演集 公共資料などを収録 メディカルオンライン 学内から GACoS め から 学外から SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス 医学関連学会誌 学術専門誌の検索 アブストラクト閲覧 フルテキスト閲覧ができる 日経 BP 記事検索サービス 学内のみ GACoS に から 日経 BP 社が発行する雑誌のバックナンバー記事を テキスト形式または PDF 形式で閲覧できる 雑誌の表紙 発行日 企業名などからの記事検索も可能 法律判例文献情報 (D1-Law.com) 学内のみ GACoS ほ から 国内の法律 判例に関する文献情報を収録した文献データベース 判例編と文献編 ( 図書 雑誌論文等 ) を指定して検索できる 現行法規 判例体系 ともリンクしている 朝日新聞 聞蔵 II ビジュアル 学内から GACoS あ から 学外から SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス同時アクセス数 :4 名まで 毎日新聞 毎索 読売新聞 ヨミダス歴史館 日経各紙 日経テレコン 21 学内から GACoS ま から 学外から SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス同時アクセス数 :2 名まで 学内から GACoS よ から 学外から SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス同時アクセス数 :4 名まで 学内から GACoS に から 学外から SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス同時アクセス数制限あり アクセスできない場合 時間をおいて再度お試し下さい 12
その他の英語雑誌論文 新聞記事データベース Engineering Village 学内から GACoS E から 学外から SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス 理工学分野の文献データベース PsycINFO [EBSCOhost から利用 ] 心理学分野の文献データベース 学内から GACoS P から 学外から SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス SocINDEX [EBSCOhost から利用 ] 社会学分野の文献データベース 学内から GACoS S から 学外から SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス ERIC [EBSCOhost から利用 ] 教育学分野の文献データベース 無料公開版もあり 学内から GACoS E から 学外から (EBSCOhost 版の場合 ) SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス JSTOR 学内から GACoS J から 学外から SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス 人文社会科学系の代表的な学術雑誌のバックナンバーを集積したデータベース Artemis Literary Sources 学内から GACoS A から 学外から SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス作家の評伝 ( 作品一覧 ) 文芸評論 作品情報などを収録したデータベース MLA International Bibliography も検索可能 LexisNexis Academic 学内から GACoS L から 学外から SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス New York Times など世界各国の新聞記事などを収録したデータベース pressreader 学内から GACoS P から 学外から SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス同時アクセス数 :20 名まで 世界各国の新聞を紙面イメージのまま閲覧可能 発行日当日の記事および最大 90 日分まで遡って閲覧可能 Artemis Primary Sources 学内から GACoS A から 学外から SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス 以下のデータベースを横断検索できる 17th and 18th Century Burney Collection 19th Century British Newspapers Eighteenth Century Collections Online The Financial Times Historical Archive The Making of the Modern World Nineteenth Century Collections Online Times Digital Archive Smithsonian Collections Online 13
各種ツールの役割の違い RefWorks について : GACoS FAQ RefWorks を使うには? ( 講習会テキストも掲載 ) http://www.dl.itc.u-tokyo.ac.jp/gacos/faq/refw.html Mendeley について : GACoS FAQ Mendeley を使うには? ( 講習会テキストも掲載 ) http://www.dl.itc.u-tokyo.ac.jp/gacos/faq/men.html 14