thermofisher.com Silencer Select pre-designed / validated sirna 検索マニュアル 2018 年 10 月版 The world leader in serving science
Silencer Select sirna の保証内容 Silencer Select predesigned sirna: 同一ターゲット遺伝子に対する 2 種類の Silencer Select predesigned sirna を同時にご購入頂いた場合 2 種類ともに mrna レベルで 70% 以上のノックダウンを保証致します *1 保証レベルを満たさない場合 1 回限り無償で別デザインの sirna を提供致します Silencer Select validated sirna: 1 種類の sirna から mrna レベルで 80% 以上のノックダウンを保証致します *1 保証レベルを満たさない場合 1 回限り無償で別デザインの sirna を提供致します 保証の際 以下の条件がクリアしていることを確認してください : 導入効率の確認として Positive control sirna を設定し 80% 以上のノックダウンが得られた *2 sirna は 5nM 以上の濃度で導入 mrna のチェックは導入後 48 時間後 リアルタイム PCR 法による確認方法を推奨 保証の依頼およびお問い合わせはテクニカルサポート部までご連絡下さい : 電話 :0120-477-392 メール :jptech@thermofisher.com *1: タンパク質 / フェノタイプレベルでの保証は行っておりません *2: 蛍光標識 sirna を用いた導入効率のチェックは不正確なため Positive control sirna の結果のみ有効とさせて頂いております 2
sirna の検索 Thermo Fisher Scientific ホームページ (http://www.thermofisher.com/jp/ja/home.html) の上部のメニューのオンラインオーダーにカーソルを置くとプルダウンメニューが展開されます メニュー内から Silencer Select をクリックします 3
sirna の検索 Ambion シリーズの Silencer Select sirnas の画面の Silencer Select RNAi の検索のボタンをクリックします 4
sirna の検索 : 検索ツール画面の確認 表示された画面を下にスクロールすると検索ツールが表示されます 検索ツールは sirna と Silencer Select sirna が選択された状態になっています Silencer Select sirna を購入の場合は 7 ページに進みます 5
sirna の検索 : sirna のタイプ選択 Silencer Select sirna だけでなく 4 種類の sirna タイプからご希望の sirna をご選択できます ディホルトでは Silencer Select sirnaが選択されていますが ご希望に応じてその他のタイプのsiRNAも選択することができます : Silencer Select sirna : 最新のデザインアルゴリズムとLNA 化学修飾により低濃度で高い抑制効果が得られるsiRNAです 細胞レベルのRNAi 実験に最もお薦めのsiRNAです Ambion In Vivo sirna : Silencer Select sirnaに追加の化学修飾が施されたsirnaです ( 配列はSilencer Select sirnaと同じです ) 追加の化学修飾によりRNase 耐性が強化され 血清中の安定性が改善されています In Vivo 実験に最適なsiRNAです Stealth RNAi sirna : 25bpサイズからなるユニークで特異性の高いsiRNAです 細胞毒性誘導を抑える化学修飾が施されています Unmodified sirna : 非修飾タイプのsiRNAです Silencer Select sirnaとはデザイン ( 配列 ) が異なります Ambion の旧 sirna(silencer sirna) をご希望の場合に選択します 6
sirna の検索 対象の生物種を選択し Enter target information のボックスに検索キーワードを入力し Search をクリックして検索します 検索キーワードの入力 sirna ID 遺伝子シンボル名 Entrez Gene ID UniGene ID RefSeq アクセッション番号 GenBank mrna アクセッション番号 Protein ID など 7
sirna の検索 : ( オプション )Multiple Target Search 複数のターゲットの sirna をまとめて検索することが可能です Enter target information ボックスの下の Enter/Upload Multiple Targets リンクをクリックします Multiple Target Search 画面が表示されます 検索には 2 つのオプションがあります Option 1 : では Enter Keywords のボックスに複数の検索キーワードを入力して検索を行います Option 2 : キーワードをリスト化したファイルをアップロードして検索を行えます ファイルは 拡張子が.txt.txtN(N は数字 ) または.vcf の ANSI ファイルがご利用可能です 8
sirna の検索 : 検索結果 検索結果が表示されます 多くの場合 1 つのターゲット遺伝子に対して複数の sirna がリストアップされます まず 1~3 のポイントについて確認をしてください 1 2 3 1 Validated の印が付いている sirna は実際に細胞へ導入し その抑制効果が検証済みの sirna です 印のない sirna は未検証の Predesigned sirna です Validated / Predesigned sirna は価格 / 保証内容が異なります 2 Transcript Type を確認します Silencer Select sirna には noncoding RNA を標的とする sirna もあります mrna をノックダウンする場合は必ず Transcript Type が Coding になっていることを確認してください 3 Availability では Inventoried と Made-to-Order があります Inventoried は本社に合成済みの sirna が在庫されているため納期が短く 1nmol スケールの購入が可能です ( まとめて 4 本購入時のみ ) Made-to-Order はご注文頂いてから合成を行います Mouse/Rat の sirna はほとんどが Made-to-Order です 9
sirna の検索 : 検索結果から得られる情報 I 検索結果の画面からヒットした sirna に対する追加情報が確認できます View Details: 標的遺伝子情報や sirna のデザインポジションが確認できます Related Assays: リアルタイム PCR 解析用の TaqMan Assay カートに追加してこの画面から注文することが可能です TaqMan Gene Expression Assay: 標的の mrna のノックダウンレベルを定量することができます TaqMan sirna Assay: この sirna を定量することができます ( 注 : 通常の RNAi 実験では使用しないことが多いです ) 10
sirna の検索 : 検索結果から得られる情報 II 検索結果の画面からヒットした sirna に対する追加情報が確認できます Related Antibodies: 標的遺伝子のタンパク質に対する抗体のリストが確認できます Western Blot をはじめとした抗原 / 抗体反応をベースとしたアッセイに使用できる抗体が確認できます Related Controls: sirna 実験に必要な Nagative Control sirna および Positive Control sirnas が確認できます Negative control sirna は必須になります Positive control sirna は必須ではありませんが 導入条件の検討や導入効率のモニターにご利用頂くと便利です ( 注 : インターネットからは購入できません ) 11
sirna の検索 : 検索結果から得られる情報 III 検索結果の画面からヒットした sirna に対する追加情報が確認できます Validated : 抑制効果の検証した際の結果および実験条件が表示されます 注 : Validated sirna のみの情報です predesigned sirna にはこの情報はありません View Assay on Map: sirna のデザインされているポジションを感覚的に確認することができます バリアント RNA との相関性の確認もできます 12
sirna の注文 : sirna の純度 / サイズの確認と変更 sirna の純度 / サイズを変更することが可能です ディホルトは Standard / 5nmol に設定されています 変更する場合は をクリックして 変更画面を開き 希望の純度 / サイズに変更してください 純度 / サイズの変更は以下のラインナップから選択できます : Standard: 培養細胞への導入に十分な純度です HPLC: 培養細胞 /In vivo 両方に使用できる純度です HPLC-IVR: In vivo 導入用の最も高純度な精製です HPLC 精製の他 透析 / フィルター滅菌 / エンドトキシンチェックを行っています 注 : 1nmol / Standard は Inventoried sirna のみのサービスで 1 回の注文で 4 種類以上の sirna を購入される場合のみ選択可能です 13
sirna の注文 : 製品をカートに追加 購入を決定した sirnaのチェックボックスにチェックを入れ クリックします を 画面右上のカートに製品が加えられていることを確認し カートマークをクリックします クリック 製品がカートに加えられるとカート内の製品数が表示されます 14
sirna の注文 : 製品をカートに追加 カート内の製品リストが表示されます 注文手続きを始めるをクリックします 購入を見直したい製品はチェックボックスにチェックを入れてリストから削除することが可能です カート チェックボックスにチェックを入れると削除ボタンがアクティブになります この状態で削除ボタンをクリックするとチェックを入れた製品はリストから削除されます 注文手続きに関しては 別途のご注文マニュアルをご参照ください クリック 15
研究用にのみ使用できます 診断目的およびその手続き上での使用は出来ません 2018 Thermo Fisher Scientific Inc. All rights reserved. All trademarks are the property of Thermo Fisher Scientific and its subsidiaries unless otherwise specified. TaqMan is a registered trademark of Roche Molecular Systems, Inc., used under permission and license. 本誌に記載の社名および製品名は 弊社または各社の商標または登録商標です 記述内容は改良のため予告なく変更される場合がありますので ご了承下さい 16