PubMed 入 門 本 日 のテーマ PubMed 検 索 の 基 礎 的 なコツを 理 解 する 講 習 会 で 使 用 するデータベースの 入 口 サイト http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/ 東 大 所 属 者 向 け の PubMed マニュアル 医 学 看 護 系 でよく 使 う ものはこちらから! データベース 検 索 の 前 に 探 したい 内 容 の 論 文 を 適 切 に 見 つけ 出 すには どんな 言 葉 を 検 索 キーワードにするか が 重 要 PICO(PECO)の 設 定 : 問 題 の 定 式 化 疑 問 点 を 明 確 にする P (Patient 患 者 対 象 ) : 誰 に I (Intervention 介 入 ) : 何 をすると 何 によって E(Exposure 要 因 ) C (Comparison 比 較 ) : 何 と 比 べて O (Outcome 結 果 効 果 ) :どのような 結 果 になるのか ピックアップしたキーワードを 用 語 集 や 辞 典 などで 引 き 同 義 の 専 門 用 語 も 控 えておくとよい 参 考 ライフサイエンス 辞 書 オンラインサービス http://lsd.pharm.kyoto-u.ac.jp/cgi-bin/lsdproj/ejlookup04.pl ( 生 命 科 学 分 野 の 研 究 者 グループ LSD プロジェクト 提 供 の 専 門 用 語 辞 書 ) 先 人 達 の 生 み 出 した 沢 山 の 知 を 踏 まえて 新 しい 問 題 解 決 のカギを 見 つけよう! この 資 料 に 関 するお 問 い 合 わせ: 東 京 大 学 講 習 会 担 当 TEL: 0-584-667( 内 線 :667) E-mail: medkoshu@m.u-tokyo.ac.jp
まずは 検 索 してみる~キーワード 検 索 ~ P: 妊 婦 に I: 弾 性 ストッキングを 着 用 させると C:させない 場 合 と 比 べて O: 下 肢 静 脈 瘤 の 発 生 が 減 るのか Case Study 妊 婦 の 静 脈 瘤 対 策 として 弾 性 ストッキングの 着 用 があるが 実 はあまり 効 果 が 検 証 されていないらしい 先 行 研 究 がないか PubMed で 論 文 を 探 してみよう PICO の 設 定 P ( 対 象 ) : 誰 に I ( 介 入 ) : 何 をしたら C ( 比 較 ) : 何 と 比 べて O( 結 果 効 果 ):どうなるのか キーワード P:pregnant woman OR pregnancy I:elastic stocking O:varicose veins 検 索 画 面 で 検 索 語 を 入 力 ( 必 要 に 応 じて 論 理 演 算 子 (AND/OR/NOT)を 半 角 大 文 字 で 入 力 ) Search ボタンをクリック 検 索 結 果 一 覧 が 表 示 される ( 表 示 形 式 やソート 順 はプルダウンメニューから 適 宜 選 択 可 能 ) 4 Filters で 絞 り 込 み 条 件 を 設 定 5 論 文 名 をクリックすると 詳 細 画 面 が 開 く 6 本 文 を 見 るには Full Text ボタンまたは UTokyo Article Link ボタンをクリック 言 い 換 えができる 用 語 は OR 組 み 合 わせて 使 いたい 用 語 は AND でつないでおくと わかりやすい http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?otool=ijputmlib 東 大 専 用 入 口 入 力 の 注 意 点 複 数 の 語 を フレーズとして 検 索 したい 場 合 は (ダブルクォーテーション) 逆 にばらばらの 言 葉 として 検 索 したい 場 合 は AND を 付 けて 明 確 化 ほとんどの 場 合 はなくても 自 動 的 に 検 索 表 示 形 式 の 設 定 選 択 したデータの 保 存 メール 送 信 など File:データのダウンロード Citation manager: 文 献 管 理 ツールへの 保 存 Clipboard: 一 時 保 存 (ブラウザの 印 刷 機 能 でまとめて 印 刷 ) E-Mail:メール 送 信
Filter で 絞 り 込 み 条 件 の 設 定 が 可 能 Additional で 項 目 の 追 加 もできる( 下 記 参 照 ) 4 Filters( 絞 り 込 み)の 変 更 解 除 5 論 文 の 種 類 研 究 デザインの 指 定 (レビュー 臨 床 試 験 等 ) Filters の 項 目 画 面 表 示 の 加 除 を 設 定 抄 録 電 子 ジャーナルの 有 無 PubMed からのリンクがあるかどうかで 絞 り 込 む 東 大 の 電 子 ジャーナル 契 約 は 反 映 しないので 注 意 出 版 時 期 の 限 定 ヒトまたは 動 物 絞 り 込 みたい 項 目 に チェックを 入 れて Show をクリックすると 検 索 結 果 一 覧 画 面 に 選 択 肢 が 表 示 される 記 事 のテーマ 収 載 誌 の 種 類 対 象 年 齢 プルダウンメニューで 検 索 項 目 を 指 定 言 語 性 別
6 データベース 側 で 付 与 した MeSH 用 語 (シソーラス 用 語 ) 中 でも 論 文 の 中 心 的 主 題 を 表 す キーワード(Major Topic)には* が 付 与 されている 検 索 式 の 確 認 検 索 した 後 実 際 にはどのような 検 索 式 が 実 行 されたかを 検 索 結 果 一 覧 画 面 の Search details で 確 認 する See more をクリックすると 詳 細 画 面 が 表 示 されるので 必 要 に 応 じて 検 索 式 を 修 正 して 再 検 索 Search ボタンで 再 検 索 URL ボタンをクリックすると 検 索 結 果 画 面 URL に 検 索 式 が 追 加 される その URL をブックマークしておけば ブックマークを 開 くだけで 簡 単 に 再 検 索 が 可 能 MeSH Terms(シソーラス 用 語 ) MeSH(Medical Subject Headings: 米 国 国 立 医 学 図 書 館 作 成 の 医 学 主 題 用 語 集 )に 基 づいて 付 与 された 論 文 の 主 題 を 表 す キーワード PubMed には 自 動 マッピング 機 能 が 搭 載 さ れており 入 力 したキーワードに 対 応 する MeSH 用 語 があれば その MeSH 用 語 を 検 索 システムが 自 動 的 に 補 って 入 力 語 と 併 せ て 検 索 してくれる ただし 対 応 する MeSH 用 語 がない 言 葉 も あるので 要 注 意 ( 例 )CABG 冠 動 脈 バイパス 術 の 略 称 4
PubMed の 効 果 的 な 検 索 のために 複 数 検 索 語 の 掛 け 合 わせ AND 検 索 OR 検 索 NOT 検 索 論 理 演 算 子 (AND / OR / NOT)は 半 角 大 文 字 で 入 力 stomach cancer AND nutrition stomach cancer OR stomach ulcer surgery NOT endoscopic surgery AND 検 索 はスペースでも 可 能 だが egg allergyと 入 力 すると フレーズとして 認 識 されて 検 索 される フレーズではなくAND 検 索 として 明 確 化 したい 場 合 は egg AND allergyと 入 力 する 検 索 対 象 の 限 定 ( 絞 り 込 み 条 件 ) 検 索 結 果 一 覧 画 面 左 側 のFilters 機 能 で 条 件 を 指 定 する 絞 り 込 みの 項 目 は 記 事 の 種 類 抄 録 / 電 子 ジャーナルの 有 無 出 版 時 期 言 語 性 別 年 齢 収 載 誌 の 種 類 (Core clinical, Dental, Nursingの 種 ) など P. Additional filters 参 照 検 索 項 目 を 限 定 した 検 索 検 索 キーワードが 特 定 の 項 目 にのみ 含 まれるものを 検 索 したい 場 合 は タグを 付 けて 検 索 する タグ 検 索 では 自 動 マッピング 機 能 は 働 かない 項 目 タグ 入 力 例 備 考 著 者 名 [au] yamamoto n[au] ミドルネームありの 場 合 はsmith rc[au] smith r@[au]だとsmith Rだけがヒットする yamamoto noriko[au] 00 年 以 降 出 版 の 文 献 はフルネーム 検 索 可 所 属 機 関 [ad] university of tokyo[ad] 第 一 著 者 のみ 論 文 タイトル 収 載 誌 名 [ti] [ta] child care[ti] international nursing review[ta] int nur rev[ta] 雑 誌 名 冒 頭 にTheなどが 付 く 場 合 冠 詞 は 除 く 略 誌 名 でも 検 索 可 出 版 年 [dp] 04[dp] 範 囲 指 定 する 場 合 は009:04[dp] 出 版 形 態 [pt] review[pt] MeSH 用 語 [mh] Nutrition Therapy[mh] 4 Advanced Search プルダウンメニューで 検 索 項 目 を 限 定 して 検 索 することが 可 能 検 索 履 歴 が 一 覧 表 示 され ヒット 件 数 を 確 認 しながらの 検 索 や 検 索 履 歴 の 掛 け 合 わせ 検 索 ができる 5 前 方 一 致 検 索 複 数 形 のような 語 尾 変 化 も 一 括 して 検 索 できる ただし 自 動 マッピング 機 能 は 働 かない ( 例 )nurs* nurse, nurses, nursingなどnursで 始 まる 語 がすべてヒットする PubMed についてより 詳 しく 知 りたい 方 は 医 学 図 書 館 作 成 PubMed の 使 い 方 をご 覧 ください http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/manual/pubmedmanual.pdf 5
シソーラス 用 語 による 検 索 ~MeSH 検 索 ~ 自 動 マッピング 機 能 を 使 わず 自 分 で MeSH 用 語 を 調 べて 検 索 に 用 いることができる トップ 画 面 でプルダウンメニューから MeSH を 選 択 (または More Resources から MeSH Database を 選 択 ) 検 索 語 を 入 力 して Search ボタンをクリック MeSH 候 補 語 が 表 示 されるので 用 語 をクリックして 詳 細 表 示 4 詳 細 画 面 のリンクから 各 データベースを 選 択 検 索 を 実 行 できる MeSH 用 語 だけ 検 索 4 副 標 目 :MeSH 用 語 と 組 み 合 わせる 副 次 的 用 語 選 んだ 副 標 目 と 組 み 合 わせた 検 索 語 が 検 索 ボックスに 入 力 される 検 索 式 を 作 成 後 下 の Search PubMed で 検 索 実 行 作 った 検 索 式 に 対 す る 絞 り 込 み 条 件 Major Topic に 限 定 下 位 語 を 含 めない NLM MeSH Browser MeSH 用 語 に 関 する 詳 細 情 報 が 参 照 できる 精 密 な 検 索 を 行 う 際 は Annotation, Scope note 等 を 要 確 認 MeSH 用 語 の 新 設 年 調 べたい 年 代 より 新 しく 設 定 された 用 語 の 場 合 は Previous Indexing も 要 確 認 MeSH 用 語 の 上 位 語 下 位 語 を 表 示 ツリー 構 造 になって おり つの 用 語 が 複 数 の ツ リ ー に 存 在 する 場 合 もある Major Topic だけ 検 索 6
番 外 編 : 知 っておくとちょっと 便 利 なツール Clinical Queries EBM に 役 立 てられる 文 献 を 短 時 間 でキーワード 検 索 するの に 便 利 です < アクセス > TOP PubMed Tools Clinical Queries Single Citation Matcher 論 文 情 報 ( 雑 誌 名 巻 号 等 )から 特 定 の 論 文 をピンポイントで 探 せます < アクセス > TOP PubMed Tools Single Citation Matcher Category ( 臨 床 研 究 カテゴリー) Etiology( 病 因 ) Diagnosis( 診 断 ) Therapy( 治 療 ) Prognosis( 予 後 ) Clinical prediction guides( 臨 床 予 測 指 針 ) Scope ( 検 索 の 範 囲 と 傾 向 ) Narrow: specific search (ノイズが 少 ない) Broad: sensitive search ( 漏 れが 少 ない) 例 ) J Allergy Clin Immunol () p. に 掲 載 された 論 文 を 探 す NLM Catalog 参 考 文 献 リストなどに 記 載 され た 雑 誌 の 省 略 形 から 正 式 名 称 を 調 べることができます < アクセス > TOP More Resources Journals in NCBI Databases 例 ) 雑 誌 の 略 称 名 Mol Cancer Res の 正 式 名 称 を 調 べる 選 択 した 雑 誌 名 で PubMed を 検 索 参 考 CSLS search(pubmed に 専 門 用 語 の 日 本 語 表 示 やクラスタリング 機 能 等 を 搭 載 した 検 索 システム) http://www.csls.c.u-tokyo.ac.jp/csls/index.html ( 東 京 大 学 教 養 学 部 附 属 教 養 教 育 高 度 化 機 構 生 命 科 学 高 度 化 部 門 が 提 供 ) 7