ISSN 1349-1229 No.413 November 2015 11 Graph5001 10 PET TOPICS 13 2015 14 16 Post historic doodles on clay
研 究 最 前 線 マーケティングや金融 サイバー攻撃からの防御 医療診断や生命科学 脳科学など さまざまな分野において ビッグデータを解析することのニーズが高まっている ビッグデータ解析で重要なグラフ処理の計算速度を競うスーパーコンピュータ スパコン の 国際的な性能ランキングGraph500において 2015年7月に 京 が1年ぶりに世界1位に輝いた 王座奪還をどのようにして成し遂げたのか 理研計算科学研究機構 プログラム構成モデル研究チームの 丸山直也チームリーダー TL と上野晃司 研修生 東京工業大学大学院博士課程 に聞いた 京 がGraph500で世界1位を奪還 Graph500 はモナコグランプリ だ TOP500 で競われる課題は 足し レースに例えれば 直線コースで最高速 スパコンの国際的な性能ランキングで 算や掛け算を順番に行っていくというコ 度を競うようなもので ハードウエアの は 1993 年に始まった TOP500 が有名 ンピュータが得意な問題です 自動車 最高性能が反映されやすいという特徴 図 1 巨大なグラフ 上図は枝が約 1万 6000 本のグラフ Graph500 の課題は 枝が 16 兆本もある巨大なグラフである 丸山 TL と上野さんたちは その巨大グラフに対する幅優先探索問題を 0.45 秒で解くことに成功した 02 R I KE N NE WS 2015 N ovem be r
STUDIO CAC 1979 2012 TL TOP50020116 11120157 4 Graph5002011 F1 20123 20456 Graph5001 16 1 3 2 TOP500 TL 11010 1 Graph500 7 4 1 2 0 2 3 1 0Graph500 111 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 2 1 0 0 1 1 1 0 0 0 3 1 0 0 0 1 1 0 0 0 4 0 1 1 0 0 0 0 1 0 5 0 0 1 1 0 0 0 0 1 6 0 0 1 1 0 0 0 0 1 7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 0 1 0 0 0 0 9 0 0 0 0 0 1 1 0 0 3 210 0 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 32 32 32 96 1 1 1 1 1 1 1 1 1 9 432 8 2 5 3 6 9 9 3 2 1 31013329690 119 7 4 1 0 8 2 5 3 6 RIKEN NEWS 2015 November 03
GTEPS 1 K computer 82,944 40 38,621 2 Sequoia IBM 98,304 41 23,751 3 Mira IBM 49,152 40 14,982 5Graph500 20157 TEPSGraph500 1 G10 20141119,582GTEPS 38,621GTEPS2 4 JUQUEEN IBM 16,384 38 5,848 5 Fermi CINECA IBM 8,192 37 2,567 6 2A NUDT 8,192 36 2,061 7 Turing GENCI IBM 4,096 36 1,427 7 Blue Joule IBM 4,096 36 1,427 7 DIRAC IBM 4,096 36 1,427 7 Zumbrota EDF IBM 4,096 36 1,427 7 Avoca 28828882944 132 1 11 320 0 32 01 320 2 32 140 32 314 0123 33 32 33296 IBM 4,096 36 1,427 191 96987 Graph5001 1 11 3232 32321,024 32 TL20146 Graph5001 11 S equoiaibm 21 5 CPU CPU CPU CPU Graph500 7 TOP500 04 RIKEN NEWS 2015 November
RIKEN NEWS 2015 November 05 Graph500 TL TOP500CPU TOP500 Graph500 TOP500 4 Graph500 1 TL Twitter SNS 1000 Graph500 1 TL Graph500 IBM 20157 2IBM 2016 1 Graph500 TL Graph500 Graph500 2015714 Graph500 1 STUDIO CAC
CDBTL 20157 TL TL 4 卵母細胞における染色体の分かれ方 TL TL 1 2 122 2346 DNA 46 06 RIKEN NEWS 2015 November
RIKEN NEWS 2015 November 07 1030 11 0.1mm 3 TL 2 2 3 4 8 TL TL 20075 Jan Ellenberg 4 11 4 TL2012 CDB DNA 2 2 1978 2007 2012
Aurora B Aurora C Aurora B/C PP2A-B56 3 Aurora B Aurora BAurora C PP2A-B56 Aurora B 3 Aurora B Aurora B 4 3 Aurora B Aurora BAurora C Aurora BC Aurora BC PP2A-B56 TL Aurora BC Aurora BC TL 16275 4 08 RIKEN NEWS 2015 November
RIKEN NEWS 2015 November 09 120 2 167 34 45 TL TL 5 80 5 TL TL 3 33 TL 5 201571 2015529
PET PETFDG PET FDGPET PET PET PET PET PET PET PETPositron Emission Tomography PET PET 18 18 F[ 18 F]FDG FDG FDGFDG FDG FDG [ 18 F]AA-7 [ 18 F]FDG SUV 2.0 0.2 FDG PET PET 20124 TL CMISWilliam Ewan HumeTL20154 CLST TL R&D 2010CMIS PET 1AA-7FDGPET AA-7 は がん組織に集積し 炎症部位には集積していない 膵臓に高い集積が見られる FDG は がん組織だけでなく 炎症部位にも集積している 10 RIKEN NEWS 2015 November
SUV 3.0 SUV 80 0 0:04-0:24 0:24-0:44 0:44-1:04 1:05-1:25 0 2AA-7PET 投与直後から 1 時間 25 分後までの変化を示している ( 左 ) 動物実験 ( 図 1) で高い集積が見られた膵臓には集積していない 腎臓に集積が見られるが 時間の経過につれて速やかに膀胱へ排出されていく 脳には特異的な集積は見られない ( 右 ) LAT1 LAT1 LAT1 PETPET PET F LAT1 F 18 F PET LAT1 18 FHOT PET HOT g kgpet g1001g 18 F 110HOT 2 HOT HOT TL 100 10 [ 18 F]AA-7AA-7 FDG 1AA-7 1 AA-7 AA-7 FDG AA-7 AA-7 AA-7 RIKEN NEWS 2015 November 11
理研産業連携本部イノベーション推進センター新規 PET 診断薬研究チームの児玉和也チームリーダー ( 左 長瀬産業 ) と野崎聡副チームリーダー ( 理研ライフサイエンス技術基盤研究センターイメージング応用研究グループ健康 病態科学研究チーム研究員 ) 2 2 510 AA- 3FDG 3 AA-PET AA-7 352016 1 PET Gd-MRI [ 18 F]AA-7 [ 18 F]FDG SUV 5.5 3AA-7FDGPET MRI 画像で白っぽい部分が腫瘍である FDG は脳全体に集積しているため 腫瘍部分を判別しにくい AA-7は腫瘍部分にのみ集積している 0 FACBC AA-7PET PET CTMRI CTMRI LAT1 AA-7 PET FDG PETAA-7 PETAA-7 12 RIKEN NEWS 2015 November
TOPICS 2015101 2015930 195019743 19744 1980 20137 2015101 1947 NIH 20034 20074 20124 OIST 2015 2009 2 201512192 11319 20151219 143517001355 3F 1-2 2016211 133016001300 9-10 2016319 133016001300 1-3-1 Web http://www.aics.riken.jp/shirutsudoi shirutsudoi@riken.jp RIKEN NEWS 2015 November 13
TOPICS 195758 1 1 323 5 2 1991 1950 1953 12 1 13 3 2 14 RIKEN NEWS 2015 November
195611181 53 1957129 357 12 61 4 2 2 4195961 5 74km 6 6 7 14 197274 2 X 3 4 5 6 RIKEN NEWS 2015 November 15
Post historic doodles on clay Adam Phillips 23 4 56 2 31 5 No.413 November 2015 27115 351-019821 Tel048-467-4094Emailriken_news@riken.jp http://www.riken.jp RIKEN 2015-011 2017 Tel048-462-4955Emailkifu-info@riken.jp http://www.riken.jp/