Kaoru Fukami Yuichi Obata. 1. 2. 3. 4.. 1. 2. 95
情報解析技術室 BRC Annual Report 後列左から 江木 中田 福田 野口 松野 石山 一石 太田 深海室長 岩瀬 年次計画と成果 Ⅰ. リソース情報事業 平成１４年度から開始された実験動物 実験植物の提供業務を支援するシステムの開発を引 き続き行っている また実験動物についてはより多くの特性情報を提供出来かつ検索性のより 優れたシステムを 実験植物については扱うデータタイプを拡張した検索システムを開発した さらに研究用ヒト臍帯血幹細胞 日本人由来不死化細胞株 研究用ヒト間葉系幹細胞といった 新しいリソースの提供開始に伴い その提供業務を支援するシステムの開発を行った 既存の細胞提供業務と提供事務システムについては 利用者からの意見 要望を取り入れ より使いやすいシステムへの 改善を行っている また各リ ソースデータベースに格納さ れた所在情報ならびに特性情 報の更新を随時行い 常に最 新の情報が提供されるように している 当センターが収集してきた 多くのリソースには 研究者 により作成された特性情報が 添付されており それらは研 究を遂行する上で非常に有用 性が高い このように当セン ターは 研究材料とそれに付 随する特性情報を同時に提供 できる利点を持っている こ の利点をさらに高めるため 個体から細胞 遺伝子までの特性情報を有機的に結びつけたデー タベースの作成を計画中である 96
. * 1. Sakaki Y, Watanabe H, Taylor T, Hattori M, Fujiyama A, Toyoda A, Kuroki Y, Itoh T, Saitou N, OOta S, Kim CG, Kitano T, Lehrach H, Yaspo ML, Sudbrak R, Kahla A, Reinhardt R, Kube M, Platzer M, Taenzer S, Galgoczy P, Kel A, Bloecker H, Scharfe M, Nordsiek G, Hellmann I, Khaitovich P, Paabo S, Chen Z, Wang SY, Ren SX, Zhang XL, Zheng HJ, Zhu GF, Wang BF, Zhao GP, Tsai SF, Wu K, Liu TT, Hsiao KJ, Park HS, Lee YS, Cheong JE, Choi SH; Chimpanzee Chromosome 22 Sequencing Consortium. Human versus chimpanzee chromosome-wide sequence comparison and its evolutionary implication. Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 2003; 68:455-460. * 2. Fukami-Kobayashi K, Tateno Y, Nishikawa K; Parallel evolution of ligand specificity between LacI/GalR family repressors and periplasmic sugar-binding proteins. Molecular Biology and Evolution 2003; 20: 267-277. * 3. Watanabe H, Fujiyama A, Hattori M, Taylor TD, Toyoda A, Kuroki Y, Noguchi H, BenKahla A, Lehrach H, Sudbrak R, Kube M, Taenzer S, Galgoczy P, Platzer M, Scharfe M, Nordsiek G, Blocker H, Hellmann I, Khaitovich P, Paabo S, Reinhardt R, Zheng HJ, Zhang XL, Zhu GF, Wang BF, Fu G, Ren SX, Zhao GP, Chen Z, Lee YS, Cheong JE, Choi SH, Wu KM, Liu TT, Hsiao KJ, Tsai SF, Kim CG, OOta S, Kitano T, Kohara Y, Saitou N, Park HS, Wang SY, Yaspo ML, Sakaki Y; DNA sequence and comparative analysis of chimpanzee chromosome 22. Nature. 2004 May 27; 429(6990): 382-388. * 97
4. Kashiwagi K, Fukami-Kobayashi K, Shiba K, Nishikawa K; Construction and characterization of chimeric proteins composed of type-1 and type-2 periplasmic binding proteins MglB and ArgT. Biosci Biotechnol Biochem. 2004; 68(4): 808-813. * 5. Imanishi T, Itoh T, Suzuki Y, O'Donovan C, Fukuchi S, Koyanagi KO, Barrero RA, Tamura T, Yamaguchi-Kabata Y, Tanino M, Yura K, Miyazaki S, Ikeo K, Homma K, Kasprzyk A, Nishikawa T, Hirakawa M, Thierry-Mieg J, Thierry-Mieg D, Ashurst J, Jia L, Nakao M, Thomas MA, Mulder N, Karavidopoulou Y, Jin L, Kim S, Yasuda T, Lenhard B, Eveno E, Suzuki Y, Yamasaki C, Takeda J, Gough C, Hilton P, Fujii Y, Sakai H, Tanaka S, Amid C, Bellgard M, Bonaldo Mde F, Bono H, Bromberg SK, Brookes AJ, Bruford E, Carninci P, Chelala C, Couillault C, de Souza SJ, Debily MA, Devignes MD, Dubchak I, Endo T, Estreicher A, Eyras E, Fukami-Kobayashi K, Gopinath GR, Graudens E, Hahn Y, Han M, Han ZG, Hanada K, Hanaoka H, Harada E, Hashimoto K, Hinz U, Hirai M, Hishiki T, Hopkinson I, Imbeaud S, Inoko H, Kanapin A, Kaneko Y, Kasukawa T, Kelso J, Kersey P, Kikuno R, Kimura K, Korn B, Kuryshev V, Makalowska I, Makino T, Mano S, Mariage-Samson R, Mashima J, Matsuda H, Mewes HW, Minoshima S, Nagai K, Nagasaki H, Nagata N, Nigam R, Ogasawara O, Ohara O, Ohtsubo M, Okada N, Okido T, OOta S, Ota M, Ota T, Otsuki T, Piatier-Tonneau D, Poustka A, Ren SX, Saitou N, Sakai K, Sakamoto S, Sakate R, Schupp I, Servant F, Sherry S, Shiba R, Shimizu N, Shimoyama M, Simpson AJ, Soares B, Steward C, Suwa M, Suzuki M, Takahashi A, Tamiya G, Tanaka H, Taylor T, Terwilliger JD, Unneberg P, Veeramachaneni V, Watanabe S, Wilming L, Yasuda N, Yoo HS, Stodolsky M, Makalowski W, Go M, Nakai K, Takagi T, Kanehisa M, Sakaki Y, Quackenbush J, Okazaki Y, Hayashizaki Y, Hide W, Chakraborty R, Nishikawa K, Sugawara H, Tateno Y, Chen Z, Oishi M, Tonellato P, Apweiler R, Okubo K, Wagner L, Wiemann S, Strausberg RL, Isogai T, Auffray C, Nomura N, Gojobori T, Sugano S; Integrative annotation of 21,037 human genes validated by full-length cdna clones. PLoS Biol. 2004 Jun; 2(6):856-875. * 1. - 27-34 (2003) 2. 1. 2003 No. 2:75-85 98
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