H30専門科目問題冊子表紙

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しおりひのと
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1 平成 30 年度大学院理学系研究科博士前期課程 ( 生物科学専攻 ) 第 1 次募集入学試験問題専門科目試験時間 :13:00~16:30 配点 ( 合計 ):400 点問題は, 問題 I 問題 X まで, 全部で 10 題あります. 問題 I~ 問題 III ( 生化学 ( タンパク質化学を含む )) および問題 IV~ 問題 VI( 分子細胞生物学 ( 遺伝学発生生物学を含む )) は, 必ず解答しなさい. 問題 I ~ 問題 VI に加えて, 問題 VII 問題 VIII( 有機化学物理化学 ) と問題 IX 問題 X( 生態学進化系統学 ) のどちらかを選択して, 合計 8 題に解答しなさい. 注意 (1) 解答用紙を 8 枚配付します. 配付された解答用紙の枚数を確認しなさい. 不足の場合は速やかに申し出なさい. (2) 各解答用紙の所定の欄に, 受験番号と氏名を必ず記入しなさい. (3) 解答は, 選択した問題ごとに, それぞれ別の解答用紙に記入しなさい. 解答用紙の所定の欄に, 問題番号 ( ローマ数字 ) を必ず記入しなさい. (4) 解答用紙の表面に解答を書ききれない場合には, 裏面を使用しなさい. 計算や下書きは, 問題冊子の余白を使用しなさい.

TCA サイクルが行われるオルガネラの名称を答えなさい. 問 3. 反応系 1,2 の名称を答えなさい. 問 4.

2 問題 I. 下の図は, グルコースおよび脂肪酸の代謝過程を表している. この図を見て, 問 1~ 問 6 に答えなさい. 図グルコース, 脂肪酸の代謝問 1. 図中のア ~ キの化合物の名称を答えなさい. 問 2.TCA サイクルが行われるオルガネラの名称を答えなさい. 問 3. 反応系 1,2 の名称を答えなさい. 問 4. ピルビン酸をアに変換する多酵素複合体に関する問 (1) と (2) に答えなさい. (1) 多酵素複合体の名称を答えなさい. (2) 太古から毒物として知られているヒ素は, 多酵素複合体に作用し毒性を発揮する. 作用機構を説明しなさい. 1

3 問 5. アをキに変換する酵素に関する問 (1)~(3) に答えなさい. (1) 酵素の名称を答えなさい. (2) あるホルモンが脂肪組織のアデノシン 3,5 環状一リン酸 (camp) 濃度を上昇させると, この酵素はリン酸化され, 活性が阻害される.cAMP 濃度を上昇させるホルモンの名称を答えなさい. (3) この酵素は, あるホルモンによって合成が促進される. ホルモンの名称を答えなさい. 問 6. 脂肪酸に関する問 (1) と (2) に答えなさい. (1) 炭素数 16 の飽和脂肪酸の名称を答えなさい. (2)(1) の脂肪酸が完全に酸化される場合, 何分子の ATP が生成されるか答えなさい. ただし,NADH から 3 個,FADH 2 から 2 個, アセチル CoA から 12 個の ATP が生成されるとし, 途中の計算式も記述すること. 2

4 問題 II. 下の図は葉緑体チラコイド膜の模式図である. 葉緑体におけるエネルギー変換に関する以下の問 1 問 6 に答えなさい. 問 1. 下の図の ( ア ) ( ス ) にあてはまる最も適当な語を答えなさい. ただし, ( ア ),( イ ),( ウ ),( エ ) は複合体,( シ ) と ( ス ) は区画を示す. また,( オ ), ( カ ),( ク ),( ケ ) は略号ではなく, 名称で答えなさい. + H + 4 H + H 2 O ½ + 2 H + 4 H + 図チラコイド膜のモデル光合成における電子伝達系では, 可動性電子キャリアである ( カ ) は,( イ ) からの電子で還元されて ( オ ) になって,( ウ ) を経て ( ク ) へと電子を運ぶが, 電子が ( ク ) へ 2 個移動するたびに,4 個の H + が ( シ ) から ( ス ) へと移動して,H + の濃度勾配を形成する. 問 2.( ア ) で受容した光エネルギーが化学エネルギーに変換される場所を図の記号で 2 つ答えなさい. 問 3. 図の説明文で示した H + 濃度勾配の形成機構について, 問 (1) と (2) に答えなさい. (1) この機構は何とよばれているか, 名称を答えなさい. (2) ミトコンドリアにおいても同様の機構が存在する. ミトコンドリアにおいて, 図中の ( ウ ) に相当する複合体は何か答えなさい. 3

5 問 4. チラコイド膜の内側と外側の H + 濃度勾配を利用して合成される物質の名称を 1 つ答えなさい. 問 5. タンパク質 ( ケ ) は, カルビン回路の酵素であるフルクトースビスホスファターゼ (FBP アーゼ ) とセドヘプツロースビスホスファターゼ (SBP アーゼ ) を活性化する. その機構を説明しなさい. 問 6. カルビン回路で ( サ ) を補酵素として用いる反応について, 触媒する酵素名と反応式を書きなさい. 4

6 問題 III. 下表は, アオの 5 種類のアミノ酸の側鎖の構造と,a- カルボキシル基,a- アミノ基, アミノ酸側鎖, それぞれの酸解離定数の負の常用対数 (pk a ) の値をまとめたものである. この表を必要に応じて参考にしながら, 問 1~ 問 7 に答えなさい. アミノ酸側鎖の構造 pk a a- カルボキシル基 a- アミノ基アミノ酸側鎖ア H イ HS-CH ウ HOOC-CH エ H 3 N-(CH 2 ) オ問 1. リシンのカルボキシル基とアスパラギン酸のアミノ基が脱水縮合して得られるジペプチドは,pH により 5 通りのイオン構造をとり得る. このジペプチドについて, 問 (1) (3) に答えなさい. (1)pH1.0 の条件下で最も多く存在する分子種 A の構造式を書きなさい. (2) 等電点の状態にある分子種 B の構造式を書きなさい. (3)A, B 以外のイオン構造の分子種を, 負電荷が大きい順 ( または正電荷が小さい順 ) に C, D, E とする.A E を, 低 ph から高 ph に変わるに従って生じる順に並べなさい. 問 2. アスパラギン酸およびグリシンの等電点を, それぞれ求めなさい. 問 3. グリシンは緩衝液によく利用されている. グリシンの緩衝領域 ( 緩衝作用が有効な ph の範囲 ) を答えなさい. 問 4.pH7.4 のシステイン水溶液中において, プロトンを解離しているチオール基のモル濃度は, 解離していないそれの何倍か答えなさい. ただし, 活量係数は 1 とみなして計算しなさい. 5

7 問 5. ジンクフィンガーと呼ばれるタンパク質の構造モティーフにおいて, 亜鉛イオンに四面体配位しているアミノ酸をアオの中からすべて選びなさい. 問 6. ポリユビキチン鎖のうち, プロテアソームによるタンパク質分解のシグナルになるものは, どのアミノ酸と, どのアミノ酸がアミド結合することで鎖長伸長しているか. アオの中からすべて選びなさい. 問 7.(A) (G) のうち, 正しい事柄を述べているものをすべて選びなさい. (A) ヒトの体内には,a-アミノ酸しか存在しない. (B) ヒトの体内には,L 型アミノ酸しか存在しない. (C) 細菌が生産する抗生物質の中には,D 型アミノ酸を含むものがある. (D) 細菌が生産する抗生物質の中には,L 型アミノ酸を含むものがある. (E) 細菌は, リボゾームで起こる翻訳により,D 型アミノ酸を含むタンパク質を生合成できる. (F) ヒトは, リボゾームで起こる翻訳により,D 型アミノ酸を含むタンパク質を生合成できる. (G) 高等植物は, ヒトの必須アミノ酸をすべて生合成できる. 6

8 問題 IV. 動物細胞における細胞内シグナル伝達系に関する下の文を読み, 問 1~ 問 5 に答えなさい. ホルモンや細胞増殖因子などの細胞外メッセンジャー分子は, 細胞に存在する特異的な結合タンパク質であるアアアを介して細胞内シグナル伝達系を活性化する. ある種のアアアは,(a) ヘテロ三量体 G タンパク質に作用し, イイイを結合した活性型 αサブユニットとβγサブユニットへの解離を促進する. イイイ結合型 αサブユニットにより活性化されたシグナル伝達酵素は,(b) アデノシン 3,5 環状一リン酸 (camp) やイノシトール 1,4,5-トリスリン酸 (IP 3 ) などのウウウを生成し, これらのウウウが細胞内を拡散することにより, シグナルが伝達される. 一方, アアア型タンパク質チロシンキナーゼは, 細胞外にリガンド結合ドメイン, 細胞内に触媒ドメインをもつ. この酵素の作用によって (c) リン酸化されたチロシン残基は, エエエドメインやオオオドメインによって特異的に認識される.Grb2 はエエエドメインをもち, タンパク質間相互作用の仲介を主な機能とするタンパク質である. このようなタンパク質は, カカカタンパク質と呼ばれる.Grb2 には Sos が結合し,(d)Sos は, 単量体 G タンパク質の一種である Ras を活性型に変換する. 問 1. 上の説明文のアアア ~ キカキに入る最も適当な語を, それぞれ答えなさい. 問 2. 上の説明文の下線部 (a) に関して,α,β,γ のうち, 細胞膜に局在するための脂質修飾を受けるサブユニットをすべて答えなさい. 問 3. 上の説明文の下線部 (b) に関して,cAMP の生成を触媒する酵素の名称と IP 3 の生成を触媒する酵素の名称を答えなさい. また, 細胞内シグナル伝達における camp の役割と IP 3 の役割を説明しなさい. 問 4. 上の説明文の下線部 (c) の構造式を示しなさい. 問 5. 上の説明文の下線部 (d) に関して,Sos などの, 単量体 G タンパク質を活性型に変換するタンパク質の総称を答えなさい. また, 単量体 G タンパク質には, その不活性化を調節するタンパク質も知られている. 単量体 G タンパク質の酵素活性を促進し, 活性型から不活性型への変換を促進するタンパク質の総称を答えなさい. 7

9 問題 V.PCR 実験に関する次の問 1~ 問 4 に答えなさい. 問 1. 大腸菌 DNA ポリメラーゼ I (pola) 遺伝子のコーディングシーケンス ( タンパク質に翻訳される, 開始コドンから終止コドンまでの塩基配列 ) 全長を含む領域を PCR で増幅したい. 下に大腸菌ゲノム上の pola 遺伝子の開始コドンおよび終止コドン付近の塩基配列を示す. 開始コドンおよび終止コドンには, 下線を付した. この情報をもとに, 上記の領域を増幅するための, 各 15 塩基長の PCR プライマーをひと組設計し, それらの塩基配列を記しなさい. 5 -cacggacattatggttcagatcccccaaaa - ( 途中省略 ) - gggatcaggcgcactaagattcgcctgaac-3 問 2.PCR 実験では, アニーリングの温度をプライマーの T m (DNA が熱変性する温度 ) 以下にする必要がある. その理由を説明しなさい. また, 反対にアニーリング温度が低すぎると, どのような不都合が生じるかを説明しなさい. 問 3.PCR 産物の長さを知るにはどのような実験をすればよいか説明しなさい. 問 4. マウス DNA ポリメラーゼ α(polα) 遺伝子のコーディングシーケンス全長を増幅する場合,PCR の鋳型にはゲノム DNA ではなく cdna を用いる必要がある. その理由を説明しなさい. 8

問題 Ⅵ. 上皮細胞間の結合に関する下の図を見て, 問 1~ 問 4 に答えなさい. 図上皮細胞間の結合問 1. 密着結合 (tight junction) について説明しなさい. 問 2. 図中 A~Cに密着結合以外の上皮細胞間の結合様式の模式図を示した. 密着結合以外の上皮細胞間の結合様式 A~Cの名称をそれぞれ答えなさい.

10 問題 Ⅵ. 上皮細胞間の結合に関する下の図を見て, 問 1~ 問 4 に答えなさい. 図上皮細胞間の結合問 1. 密着結合 (tight junction) について説明しなさい. 問 2. 図中 A~Cに密着結合以外の上皮細胞間の結合様式の模式図を示した. 密着結合以外の上皮細胞間の結合様式 A~Cの名称をそれぞれ答えなさい. ただし,Cは6つの膜貫通型タンパク質から構成され, 細胞外ドメインで隣り合った細胞の同じタンパク質と結合し, 細胞質間の小分子の通過を許容するチャネル構造を形成している. 問 3. 問 2 で答えた結合様式 A~C を構成するタンパク質の名称をそれぞれ 1 つ答えなさい. 問 4. 基底膜を構成する基質分子の名称を 3 つ答えなさい. 9

11 問題 VII. 以下の (A)~(C) の反応について生成物の構造式を示し, 反応機構を説明しなさい. (A) O + N H H + (B) CHO + O OH - (C) + CH 3 CH 2 OH H + O 10

12 問題 VIII. 次の問 1~ 問 4 に答えなさい. 問 1.(1)~(5) の過程における, エンタルピー差 (DH), エントロピー差 (DS), 及びギブスの自由エネルギー差 (DG) の符号を < 0,> 0,= 0 で答えなさい. (1) 閉じ込められた理想気体が真空中に自由拡散した. (2) 塩化ナトリウムを蒸留水に溶解させた ( 吸熱反応 ). (3) 変性タンパク質が refolding した. (4) 窒素ガスと水素ガスからアンモニアガスが生成した (N 2 + 3H 2 2NH 3 ). (5) 等温過程において理想気体が膨張した. 問 2. ペプチド結合が生成するには, 生体内標準条件で 2.1 kj mol -1 のエネルギーが必要である. 一方, この反応を ATP の加水分解反応のエネルギーを用いて駆動したとすると,300 アミノ酸からなるタンパク質 1 mol を合成するために, 何分子以上の ATP が必要か答えなさい. ただし, 生体内標準条件での ATP の加水分解反応の標準反応ギブスエネルギーは-30.5 kj mol -1 とする. 問 3. 肺に入った空気は最終的に肺胞に入り, 肺胞から酸素が血液中に拡散する. 肺胞の平均半径は cm であり, 内部の空気はモル百分率で 14% の酸素を含んでいる. 肺胞内の圧力が 1 気圧 ( Pa), 温度が 37 であるとして, 肺胞 1 個当たりの酸素分子数を計算しなさい. ただし, 気体定数 R = 8.31 J mol -1 K -1 とする. 問 4.1 mol の理想気体 ( 単原子 ) が 400 K から 300 K までの冷却中に,2 気圧から 6 気圧に圧縮された. この過程における, 内部エネルギー変化 (DU), 及びエントロピー変化 (DS) を計算しなさい. ただし,log e 2 = 0.69,log e 3 = 1.1,log e 5 = 1.6 とする. 11

13 問題 IX. 生物進化に関する下の文を読み, 問 1 問 6 に答えなさい. ある生物種に特有な現象 ( 反応行動など ) を起こすことに直接関係する要因を近接要因と呼び, その現象をもつ種がなぜ進化のなかで栄えたかに関する要因を究極要因と呼ぶ. 温帯や亜熱帯の鳥は春に繁殖するものが多く, 秋に繁殖する鳥はほとんどいない. 生理学者は, 鳥は春に生殖ホルモンの分泌が盛んになることを明らかにした.(a) 鳥に春にホルモン分泌を盛んにさせる直接的な要因が近接要因である. しかし,(b) 近接要因の研究をどれだけ詰めても, なぜ多くの鳥が秋ではなく, 春に合わせて繁殖の準備をするのかは明らかにできない. ランダムに生じる ( ア ) は過去において, 秋に生殖ホルモン分泌が始まるような遺伝子をもった個体も生じさせたかもしれない. そういう種がいないのは,( イ ) によって, こうした個体が滅び, 春に繁殖する遺伝子だけが残った結果なのである.(c) これは鳥にとって春の繁殖が秋の繁殖よりも有利なためであるが, その理由が究極要因である. 問 1. 章中の ( ア ) と ( イ ) にあてはまる語句を答えなさい. 問 2. 章中の ( イ ) は, ある 3 つの条件が満たされれば必ず作動し, ほかにどのような条件も必要とせずに自立的に進む. この 3 つの条件をあげなさい. 問 3. 下線部 (a) の近接要因が具体的に何であるかを答えなさい. 問 4. 下線部 (b) の鳥の春繁殖についての近接要因の研究では, どのようなことが調べられるべきかを 1 つ答えなさい. 問 5. 下線部 (c) の究極要因は 2 つ考えられるが, その 2 つを答えなさい. 問 6. あなたが知っている生物の行動や反応を 1 つあげて, その近接要因と究極要因が何であるかを, 想定も含めてわかる範囲で説明しなさい. 12

14 問題 X. ある生物 X の時刻 t における個体数を x(t), 生物 Y の時刻 t における個体数を y(t) とし, それらの時間変化がそれぞれ以下の方程式 dx dt = rx 1 x K dy = ry y a dt ( ) 1 y K (1) (2) で与えられるとする. ただし r, K, a は正の定数で,a<K とする. 以下の問 1 問 5 に答えなさい. 問 1.x(t) に関する方程式 (1) は一般に何とよばれるか. また, 方程式 (1) における定数 r, K は一般に何とよばれるか. それぞれの名称を書きなさい. 問 2.x(t) および y(t) の平衡状態をそれぞれ求めなさい. 問 3.X の初期個体数が x(0) = x 0 であるとき,x(t) を求めなさい. 問 4. 任意の初期個体数 y(0) = y 0 から出発したときの Y の個体数 y(t) の経時的な変化について説明しなさい. 問 5.y(t) に関する方程式 (2) はアリー効果を考慮した式の 1 つの例である. アリー効果とは何か, 簡潔に説明しなさい. また, アリー効果は具体的にどのような原因によって生じるか, 例を 2 つ挙げなさい. 13

平成20年度　神戸大学　大学院理学研究科　化学専攻　入学試験問題

平成20年度　神戸大学　大学院理学研究科　化学専攻　入学試験問題化学 Ⅰ- 表紙平成 31 年度神戸大学大学院理学研究科化学専攻入学試験化学 Ⅰ 試験時間 10:30-11:30(60 分 ) 表紙を除いて 7 ページあります問題 [Ⅰ]~ 問題 [Ⅵ] の中から 4 題を選択して解答しなさい各ページ下端にある選択する選択しないのうち該当する方を丸で囲みなさい各ページに ( 用紙上端 ) と ( 用紙下端 ) を記入しなさいを誤って記入すると採点の対象とならないことがあります