Ipython Notebook の紹介
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- きみのしん ありたけ
- 9 years ago
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1 IPython Notebook の 紹 介 と cerlでの 利 用 計 画 2015/09/15 T. Obina KEKB 制 御 打 ち 合 わせ
2 導 入 を 検 討 した 動 機 :High Level Application リアルタイム 表 示 や 基 本 的 な 操 作 パネルは CSS でOK 高 レベルアプリケーションをどうするか??? 現 在 のcERL/PF/PF-ARでは SAD, root, Matlab などが 使 用 可 能 お 好 きなモノを お 好 きなように 使 って 頂 く 方 針 CSS からの Launcher もあります(GUI が 必 要 なときは X 端 末 エミュ レータが 必 要 ) ちょっと 使 いにくい 例 : QE( 量 子 効 率 ) 測 定 は python script + gnuplot でやっていた 入 射 部 のマッチングは 宮 島 さん 作 成 の Matlab LCS 実 験 では 本 田 さん 赤 木 さん 小 菅 さん 作 成 のroot LCSバンプ 制 御 は 原 田 さん 作 成 の SAD Script これらの 既 存 ソフトウェアを CSS に 移 行 する 必 要 性 は 高 くない Launcher と 操 作 マニュアルは 必 要 実 際 に 移 植 するのはかなり 大 変 現 実 的 にはSADだが 軌 道 計 算 が 不 要 な 場 合 にはちょっと
3 QE 測 定 オプティクスマッチング 例 QE( 量 子 効 率 ) 測 定 例 : 他 のスクリプトで 測 定 を 実 施 して データをファイ ルに 保 存 gnuplot( X 端 末 使 用 ) 5/28 6/25 マッチング 例 :Matlab script やはりX 端 末 測 定 スクリプトと 表 示 は 一 体 caput/get 必 須 SVDや nonlinear fit など
4 LCS 実 験 測 定 例 本 田 さん 赤 木 さん 小 菅 さん 作 成 の root ファイル 保 存 は 別 スクリプトで rootで 解 析 表 示 表 示 は X 端 末 使 用
5 ツール 選 択 の 指 針 : 上 から 順 に 検 討 するべき 本 来 なら 開 発 前 に 関 係 者 全 員 に 周 知 すべき 図 のはずだが 単 機 能 高 速 リアルタイム EPICS IOC Database で 構 成 (DB LINKベース) EPICS IOC Sequencer (CA LINKベース) CSS で 表 示 EPICS Application on IOC or Linux Server Sequence or EPICS Client Application in C/C++/Scripts 多 機 能 低 速 非 リアルタイム EPICS Application on Client (Linux or Windows) Scripts (SAD, ROOT, Python, Matlab, etc) CSS Scripts (Java,Python) CSS or Application で 表 示
6 やりたいことは 何 か Matlabのように 対 話 的 な 解 析 がしたい オフラインのデータ 解 析 あるいはスクリプト 内 から caget/put してデー タを 取 得 しながら 表 示 したい ( 可 能 であれば)DBと 接 続 したい データを 確 認 しながら 不 要 データを 除 外 したりフィット 区 間 を 決 めた りしたい その 他 SVDなど 各 種 計 算 ルーチンのデバッグ 作 業 は 最 小 限 にしたい ネット 上 に 情 報 が 多 くあると 嬉 しい できれば x 端 末 は 避 けたい これらの 要 望 をSADで 実 現 するのは 難 しい(Expertなら 不 可 能 ではない?) しかし Matlab は 有 償!!しかも 高 価 Academic discount 適 用 ならば 安 価 なのに これらの 要 望 解 決 手 段 として IPython Notebook を 評 価 してみた IPython Notebook の 環 境 をcERLおよびPFに 整 備 した 高 速 応 答 やリアルタイム 性 (1~5 秒 程 度 )が 必 要 なモノはCSSに 任 せ る 方 針
7 もちろん Python です IPython Notebook とは IPython : Interactive Python の 略 で 通 常 はコマンドラインで 使 う 対 話 的 シェル 環 境 のこと タブ 補 完 便 利 なコマンド 類 (magic command) %who, %whos, %who_ls %reset %magic 容 易 なヘルプ 表 示?command or command? でのヘルプ 表 示 lsとかcd 等 も 使 える: 標 準 pythonでは 無 理
8 who, whos: 変 数 の 表 示 IPython : magic command 例 whoで 変 数 の 一 覧 表 示 whosでタイプまで 含 めて 表 示 タブ 補 完 ヘルプ 表 示 ここで tab 入 力 すると 補 完 候 補 が 出 る command? でヘルプ(docstring) 表 示
9 reset その 他 reset : ユーザが 定 義 した namespace をクリア その 他 にも 色 々 便 利 な 機 能 はありますが ここで 紹 介 していると 時 間 が 足 りなくなるのでここまで Google 先 生 に 聞 いて 下 さい 山 のように 出 てきます
10 余 談 :デフォルトでの 行 間 デフォルトでは 下 のように 出 力 が1 行 おきになります ずいぶん 前 に 使 ったとき 個 人 的 には 便 利 ではあるが ヒストリ 番 号 も 要 ら ないし デフォルトでは 行 間 が 空 くのも 気 に 食 わない と 思 っていました プロットは matplotlib を 使 っていましたが X 端 末 が 必 須 だし 遅 いし 表 示 は あまり 美 しくないしーーーーーー 後 述 のNotebookで 考 えが 変 わります 行 間 については ipython --nosep で 起 動 すれば 解 決 です
11 IPython Notebook
12 IPython Notebookの 機 能 Webブラウザ 上 での 対 話 的 実 行 環 境 コメント 記 述 可 能 Texフォーマットでの 数 式 入 力 可 html, restructuredtext, Markdown 記 法 なども 使 用 可 能 日 本 語 もOK デフォルトでの 保 存 は.ipynb フォーマット(XML) PDF, html, python script など 各 種 フォーマットに 変 換 可 能 公 開 共 有 が 容 易 cerlでの 例 は 後 ほど プロットした 画 像 は 別 ウィンドウで 表 示 することも 可 能 だが イン ラインでの 表 示 することもできる:こちらがお 勧 め nbviewer 公 開 共 有 サイト Github/Gist に 上 げたipynbファイルを 共 有 するサイト
13 仕 組 み IPython : Decoupled two-process model で 構 築 されている 通 常 の( 古 典 的 な) REPL(Read-Evaluate-Print Loop) の 仕 組 みを 拡 張 し Evaluation を 独 立 したプロセス(kernel)として 実 装 kernel は client からの 要 求 を 処 理 し 結 果 を 返 す これによりIPython はTerminal,Qt console, Notebookなど 様 々なクライ アント 環 境 で 実 行 可 能 IPython Notebook の 場 合 IPython エンジン(kernel) + JSON によるデータ 通 信 (Web Browser) ベースとなるソフトウェア IPython zero-mq Tornado (web server) jquery Bootstrap (front-end framework) MathJax ( 数 式 表 示 ) Jinja2 (template engine) 並 列 化 も 可 能 だが 今 回 はパス
14 起 動 と 終 了 コマンドラインから ipython notebook 実 行 カーネルを 起 動 し デフォルトで localhost:8888 で listen する 自 動 的 にブラウザを 起 動 --no-browser オプションをつけるとカーネルの 起 動 のみ ポート 指 定 オプションあり ブラウザを 終 了 しても カーネルを 実 行 し 続 けることが 可 能 終 了 は Ctrl+C 2 回
15 まずは 簡 単 な 例 を 紹 介 cerl wiki に 記 載 (KEK 内 部 のみアクセス 可 能 ) 最 初 に Web Browser 起 動 したときの 画 面 起 動 したディレクトリに 日 本 語 ファイルがあるとエラー 出 るので 注 意
16 新 しい Notebook の 作 成 :python2
17 新 notebook 入 力 画 面 デフォルトは Code Cell (Cell Cell Type から 変 更 可 能 ) Code :コード 入 力 Enterで 改 行 Shift+Enterで 実 行 Markdown :コメントなど LaTex, html 使 用 可 能 :Level1 ~ 6 まで Markdown や rest で 記 述 可 能 切 り 貼 りや 移 動 ( 順 序 変 更 ) 可 能
18 コード 入 力 最 初 の magic command はプロットした 図 を inline 表 示 するため 入 力 した 後 Shift+Enter で 実 行 される 実 行 中 は 左 のコマンド 番 号 が [*] になる 長 時 間 になって 途 中 で 止 めたいときは kernel メニューから 停 止 可 能 %matplotlib inline import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt x = np.linspace(-1.2, 1.2) y = x**2 図 をインライン 表 示 定 番 のモジュールimport linspace は linear spacing で 配 列 を 生 成 (デフォルトで50 点 ) plt.plot(x,y,'bo-') pyplot.plt ではMatlab like なプロット 指 定 が 可 能 この 例 では 青 色 で シンボルは データ 間 は 線 で 繋 ぐ の 意
19 出 力 ブラウザ 内 に 結 果 が inline 表 示 される 次 のセルで 変 数 プロットや 前 の セルに 戻 って 実 行 も 可 能
20 他 のサンプルに 行 く 前 に NumPy について 説 明 NumPy : Numerical Python 特 徴 ndarray (n-dimentional array) を 基 本 とした 多 次 元 配 列 高 速 演 算 (ベクトル スカラー) Broadcast 機 能 (サイズの 異 なる 配 列 同 士 の 演 算 ) ループを 記 載 しない 配 列 計 算 行 列 演 算 乱 数 フーリエ 変 換 など 基 礎 的 な 数 学 演 算 C/C++, Fortran へのインターフェース IPython Notebook や scipy, pylab, pandas など 各 種 データ 解 析 を する 際 にはこのnumpyが 基 本 となっている 典 型 的 には import numpy as np としてから 使 用 する Matlab/Octave ユーザであれば どうしても Matlab like に 使 いたいなら from pylab import * Numpy for matlab users というページもあるので 関 数 を 対 応 させながら 見 ると 楽
21 ndarray In [1]: import numpy as np In [2]: arr = np.array([[1,2,3],[4,5,6]]) In [3]: arr Out[3]: array([[1, 2, 3], [4, 5, 6]]) In [4]: whos 型 推 定 Variable Type Data/Info arr ndarray 2x3: 6 elems, type `int64`, 48 bytes np module <module 'numpy' from '/ce<...>ages/numpy/ init.pyc'> In [5]: arr*3 各 要 素 の 定 数 倍 Out[5]: array([[ 3, 6, 9], [12, 15, 18]]) In [6]: arr[0] 配 列 要 素 へのアクセス Out[6]: array([1, 2, 3]) In [7]: arr[0][1:] 配 列 要 素 へのアクセス スライス 表 記 Out[7]: array([2, 3]) In [10]: arr2 = np.arange(12) arangeで 連 続 する 数 値 配 列 を 生 成 In [11]: arr2 Out[11]: array([ 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11]) In [12]: arr2.reshape(3,4) 配 列 形 状 の 変 換 Out[12]: array([[ 0, 1, 2, 3], [ 4, 5, 6, 7], [ 8, 9, 10, 11]])
22 その 他 のサンプル(KEK 内 のみ)
23 Notebook 環 境 Jupyter は 多 言 語 対 応 試 してみるなら: try.jupyter.org
24 膨 大 なサンプル
25 cerlでのセットアップ 記 録 KEK 内 からのみアクセス 可 Python 自 体 のコンパイルも 含 めて 実 施 した Tcl/Tk Python pip ATLAS/LAPACK Numpy Scilab, matplotlib Pandas, Pillow(PIL 後 継 ), Sympy EPICS PyVISA
26 cerl 環 境 での 使 用 計 画 まだ 試 験 段 階 みなさんへの 広 報 をし 始 めたところ ipywidgetsは(いまのところ)そんなに 魅 力 は 感 じていない GUIが 使 いたいなら CSS 使 っとけ (いずれ 手 のひらを 返 すかもしれませんが ) 使 用 形 態 :セキュリティ 問 題 もあり 悩 ましいところ サーバー 計 算 機 へログイン + X 端 末 Client 上 のwebブラウザ + SSH 転 送 Client 上 のwebブラウザ + パスワード 認 証 常 時 エンジンを 起 動 しておくべきか リモートマシンにログインしている 状 態 と 同 じなので 何 でもできる 利 点 でもありセキュリティ 上 は 欠 点 でもあり
27 おまけ
28 Python Data Analysis Library Pandas Data Frame という 考 え 方 をメインにしている どちらかというと 統 計 処 理 向 け(Rの 代 替 で 使 っている 人 多 数 ) Time Series データは 扱 いやすい resample も 出 来 る stdev, mean, sum などの 統 計 処 理 はもちろん 可 能 データが 無 い 列 の 処 理 NaN 処 理 が 楽 データを drop / fill 可 能
29 Pandas DataFrame
30 IDE spyder 他 の 環 境 各 種 モジュールがパッケージされたもの Anaconda Enthought Canopy pythonxy EPICS CA が 無 しで 良 いならば お 手 軽 ( 追 加 インストールは 不 可 能 ではないが )
31 notebook converter コマンド ipython nbconvert --to でhtml, PDF, python script などに 変 換 可 能 これを 使 ってhtmlに 変 換 し そのまま web に 乗 せています
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<4D6963726F736F667420576F7264202D20819C486F70658F6F93588ED297708AC7979D89E696CA837D836A83858341838B8169342E33566572816A2E646F63>
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ACAD-DENKI DENKI Ver.12 新 機 能 / 改 善 機 能 アルファテック 株 式 会 社 1 新 機 能 改 善 機 能 一 覧 ACAD-DENKI/EL Ver.12 新 機 能 と 改 善 機 能 新 メニュー/ 新 機 能 拡 張 プロジェクト 管 理 外 部 端 子 コネクタ 端 子 ネット 分 割 化 リアルタイム 線 番 挿 入 改 善 項 目 図 題 情 報 編
WEB版「新・相続対策マスター」（ご利用の手引き）
WEB 版 新 相 続 対 策 マスター ご 利 用 の 手 引 き 株 式 会 社 シャフト MG-16-0412 はじめに WEB 版 新 相 続 対 策 マスター( 以 下 本 シミュレーション)をご 利 用 にあたり 下 記 についてあらかじめ 承 諾 をいただいた 上 で 本 シミュレーションを 利 用 いただくものとします 本 シミュレーションの 計 算 結 果 はあくまでも 概 算 です
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岡 山 大 学 情 報 データベースシステムの 操 作 方 法 1 インターネットブラウザの 設 定 まず ご 利 用 のブラウザ 環 境 に 応 じて 以 下 URL に 記 載 されている 設 定 を 行 ってください この 設 定 をしていない 場 合 岡 山 大 学 情 報 データベースシステムを 利 用 できない 場 合 があります Windows の Internet Explorer7.0
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HumanBridge EHRソリューション 01. 福 来 たネット 端 末 セットアップツール 利 用 手 順 書 (Windows 10 端 末 用 ) V 1.0 1セットアップ 前 に インターネットに 接 続 出 来 るパソコンへ 福 来 たネット 接 続 (VPN)の 設 定 を 施 し 福 来 たネットをご 利 用 するための 設 定 手 順 書 となります ただし 地 域 連 携
Microsoft Word - 操作手順書.doc
さーちずまえばし 操 作 手 順 書 目 次 章 ポータル 画 面.... ポータル 画 面 のレイアウト....2 地 図 を 選 択 する... 2 2 章 基 本 操 作... 3 2. 画 面 構 成... 3 2.2 ヘルプを 表 示 する... 5 2.3 地 図 を 移 動 する... 5 2.4 地 図 を 拡 大 / 縮 小 する... 5 2.5 索 引 図 を 利 用 する...
日 付 部 分 を 入 力 する 今 回 は 3 月 のカレンダーを 作 ります 3 月 は 水 曜 日 からはじまりますので 1 水 曜 日 第 1 週 目 にあたるセル D2 に 1 その 隣 の E2 に 2 と 入 力 しましょう 2 1 2 と 入 力 したセル D2:E2 をドラッグして
デジカメ 写 真 を 使 ったカレンダー 作 り 今 回 このテキストでは Word2003 Excel2003 の 画 像 を 使 って 説 明 していますが 中 の 手 順 の 説 明 は どのバージョンをお 使 いの 方 でも 対 応 ができるようにしています 新 しいバージョンで 簡 単 にできる 作 業 もありますが ご 了 承 ください Excel でカレンダー 部 分 を 作 る Excel
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平 成 27 年 度 施 策 評 価 調 書 施 策 の 名 称 等 整 理 番 号 22 評 価 担 当 課 営 業 戦 略 課 職 氏 名 施 策 名 ( 基 本 事 業 ) 商 業 の 活 性 化 総 合 計 画 の 位 置 づけ 基 本 目 主 要 施 策 4 想 像 力 と 活 力 にあふれたまちづくり 商 業 の 振 興 2 施 策 の 現 状 分 析 と 意 図 施 策 の 対 象 意
以 下 に 手 順 の 流 れを 記 載 します 3ページ 以 降 で 各 項 目 の 手 順 を 説 明 します ( をクリックすると 該 当 ページにジャンプします ) また 15ページに 汎 用 データ 受 入 に 関 する よくあるお 問 い 合 わせをご 紹 介 しています Step1 (
勘 定 奉 行 i8/iシリーズ 汎 用 データ 受 入 の 手 順 書 汎 用 データの 作 成 方 法 を 知 りたい 汎 用 データのフォーマットがわからない 汎 用 データ 受 入 をしたら 受 入 エラーが 発 生 した について 仕 訳 伝 票 データの 受 入 を 例 に 説 明 します 本 手 順 書 では OBC 受 入 形 式 ( ) の 汎 用 データの 受 入 を 受 入 フォーマットに
- 1 - 総 控 負 傷 疾 病 療 養 産 産 女 性 責 帰 べ 由 試 ~ 8 契 約 契 約 完 了 ほ 契 約 超 締 結 専 門 的 知 識 技 術 験 専 門 的 知 識 高 大 臣 専 門 的 知 識 高 専 門 的 知 識 締 結 契 約 満 歳 締 結 契 約 契 約 係 始
部 案 参 照 文 目 1 1 持 可 能 療 険 制 構 築 国 民 険 部 9 部 11 1 5 特 別 15 6 17 7 運 確 18 8 0 9 独 立 10 - 1 - 総 控 負 傷 疾 病 療 養 産 産 女 性 責 帰 べ 由 試 ~ 8 契 約 契 約 完 了 ほ 契 約 超 締 結 専 門 的 知 識 技 術 験 専 門 的 知 識 高 大 臣 専 門 的 知 識 高 専 門
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恵 庭 市 教 員 住 宅 のあり 方 基 本 方 針 平 成 25 年 2 月 恵 庭 市 教 育 委 員 会 目 次 1. 教 員 住 宅 の 現 状 (1) 教 員 住 宅 の 役 割 1 (2) 教 員 住 宅 の 実 態 1 (3) 環 境 の 変 化 1 (4) 教 員 の 住 宅 事 情 1 2 2. 基 本 方 針 の 目 的 2 3.あり 方 検 討 会 議 の 答 申 内 容
Microsoft Word - 操作マニュアル（石油コンビナート_オフラインソフト編）_v0.2.doc
総 務 省 消 防 庁 統 計 調 査 系 システム 操 作 マニュアル 石 油 コンビナート 等 実 態 調 査 業 務 (オフライン オフラインソフト 編 ) 第 0.2 版 平 成 25 年 3 月 総 務 省 消 防 庁 改 訂 履 歴 版 改 訂 日 改 訂 内 容 第 0.1 版 平 成 24 年 1 月 24 日 新 規 作 成 第 0.2 版 平 成 24 年 3 月 2 日 第 4
目 次 JAVIS Appli の 基 本 機 能... 3 JAVIS Appli について... 3 音 声 確 認 機 能 JAVIS Appli( 有 償 版 )の 機 能... 4 音 声 で 読 みの 確 認 をする... 4 辞 書 機 能... 5 単 語 を 登 録 する... 5
アドイン 版 ********************************************* 操 作 説 明 書 ********************************************* 目 次 JAVIS Appli の 基 本 機 能... 3 JAVIS Appli について... 3 音 声 確 認 機 能 JAVIS Appli( 有 償 版 )の 機 能...
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MATRIX TRADER(インストール版) 取扱説明書
インストール 版 MATRIX TRADER チャート 取 扱 説 明 書 目 次 タイトル ページ タイトル ページ チャート メニューの 呼 び 出 し 2 チャートの 追 加 3 画 面 の 説 明 4 MENU の 説 明 6 画 面 表 示 方 法 7 クロスラインの 表 示 8 チャートからの 新 規 注 文 9 コメント 入 力 10 アラートの 設 定 11 左 側 アイコンの 説
目 次 1. 大 学 情 報 データベースシステムの 使 用 方 法 について... 1 1.1.EXCEL 一 括 登 録... 1 1.2.EXCEL ダウンロード... 2 1.2.1. 検 索 条 件 の 指 定 プレビュー... 3 1.2.2.EXCEL ダウンロード(データ 抽 出 あ
大 学 情 報 データベースシステム EXCEL 一 括 登 録 マニュアル 目 次 1. 大 学 情 報 データベースシステムの 使 用 方 法 について... 1 1.1.EXCEL 一 括 登 録... 1 1.2.EXCEL ダウンロード... 2 1.2.1. 検 索 条 件 の 指 定 プレビュー... 3 1.2.2.EXCEL ダウンロード(データ 抽 出 あり)... 5 1.2.3.EXCEL