統計分析ソフトによる統計分析Ｒ　初歩の初歩（１）

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R と R commander のインストールと統計解析 R の推奨数理統計計算と graphics の為の言語環境多様な統計手法 ( 公開

5 数理統計解析言語 : R R の歴史 R は完全なプログラム言語起源はかつてのベル研究所 ( アメリカ ) の Chambers 等が対話的な統計解析環境として開発した S 言語システムに遡る S はベル研究所のテューキ学派の人々が開発したデータ解析とグラフィックスの為のプログラミング環境統計解析, 確率シミュレーション, グラフィックスの為のプログラム言語 Becker & ChambersによりS ベル研究所 (1984); S 言語を独自に実装 (1991); オープンソースソフトとして公開 (1995) R の由来 (2 説存在 ) i. Ross Ihaka & Robert Gentlemanのinitial ii. Sの縮小版 i.e., reduced version of S Copyright (C). All Rights Reserved.

6 数理統計解析言語 : R R の長所短所長所特筆すべき点は,open source の software であり GPL(GNU 一般公衆利用許諾契約書 ) に基づく一般公開された free software R の source code はすべて free download 可能 R に black box はない故, 何がどのように計算されているか, 完全に精査可能 R は多様な OS 或いは platform に対応 (Mac OS X, Windows, UNIX(Linux etc.)) 短所完全な GUI に欠ける Programming Code は compile されず実行時に解釈され, 稀に R の動作が遅くなるような場合が有り得る Copyright (C). All Rights Reserved.

7 数理統計解析言語 : R CRAN CRAN とは Comprehensive R Archive Network の略 R の source code や異なる OS 用の binary data を提供するサーバーの network 中核となるサーバーの address ここには様々な統計解析手法を実現する為に開発された数百ものpackage(library) が公開されているさらに各種 manual 等のdocument 類, 関連する software 等が搭載されている Copyright (C). All Rights Reserved.

R のインストール Step 1: http://cran.r-project.

R のインストール Step 3 実行をクリックセキュリティに関する警告は無視して

24 R commander R は簡単な計算機能数値計算関数 data 解析手法から最新の数理統計解析手法 program, simulation 用の tool, シンプルな plot 作図から複雑な graphics 機能を提供新しい統計手法や新しい graphics 等の追加機能,Package が公開され,free によりこれらの download が可能, 更に,user が自由に機能を拡張可能 ( その数, 数千種類!) しかしながら,R は一部の user に対して致命的欠点をもたらす R の操作には基本的に command 入力により実行従って,program 経験が少ない user にとっては敷居の高い software として認識されるこの欠点を補う為に Excel の如く容易に menu 選択を実行することにより R を操作可能にするという画期的な package が John Fox 教授 (McMaster 大学 ) により開発される : R Commander (A Basic-Statistics GUI for R) Copyright (C). All Rights Reserved.

25 R commander のインストール Step メニューのパッケージからパッケージのインストールを選択 CRAN mirrorが表示される適当な場所を選択 Packagesが表示されるのでR Commander Rcmdr を選択 RcmdrのInstall 開始, 完了後,Rcmdrを起動の為にConsoleに library(rcmdr) を入力必要なpackagesのInstallが要求され承諾 Copyright (C). All Rights Reserved.

R commander のインストール Step Install 完了後パッケージを

29 R による統計解析 R の画面 & 基本 command Console R に命令を送る window 直接入力可 Script (Editor) R の command を保存できるノート作成した program はここから保存 Graphics Graphics 出力用の window Graphics の保存,copy ができる. help() on line help! Input a<-b # 引数 (argument)a へ b を input # #comment out q() R の quit( 終了 ) 引数 #Program 中の変数, 独立変数 Copyright (C). All Rights Reserved.

R による統計解析外部データの input csv ファイルを読み込み, 簡単な統計解析を行う ( 詳細は次ページ参照 ) ファイルからディレクトリの変更

31 R による統計解析外部データの input 以降外部データとして csv ファイル (beer.csv) を読み込み, これの簡単な統計解析を行う (beer.csv: ある地区の郊外にあるコンビニ店舗のビール売上データ ; 2001 年 10 月 1 日 ~2002 年 6 月 30 日の期間中, 毎日のビール売上金額 ( 単位 : 円 ) が記録されている外部ファイル (CSV ファイル ) からのデータフレーム作成ビール販売額データ.xls を CSV ファイルへ変換ビール販売額データ.xls ファイルを開くファイルメメニューから名前を付けて保存として CSV 形式を選択すれば CSV ファイルへ変換可能 Input a<-b # 引数 (argument)a へ b を input # 記号以降は comment out,i.e., 無視される CSV ファイルから入力 > setwd( ) # データ (beer.csv) が格納されている directory を ( ) へ指定 > data<-read.csv( beer.csv, header=true) Copyright (C). All Rights Reserved.

33 R による統計解析計算与えられたデータの統計量の計算 ( 引数 (argument): a,b) data 内のある変数に絞る command a<-data 名 $ 変数名主要関数 ( 引数 ) # 意味 sum(a) # 総和 mean(a) # 平均 median(a) # 中央値 var(a) # 不偏分散 sd(a) # 標準偏差 max(a) # 最大値 min(a) # 最小値 cor(a,b) # 相関係数, 但し NA 含まず cor(a,b,use = complete.obs ) # 相関係数, 欠損値を含むケース ( 行 ) は予め取り除かれる cor(a,b,use = pairwise.complete.obs ) # 相関係数, 対応列対から欠損値を含む行に相当する要素を取り除いて計算する ( 従って各要素毎に使われる変数の長さが異なる可能性がある ) IQR(a) # 四分位偏差 quantile(a) # quantile range(a) # 範囲 Copyright (C). All Rights Reserved.

34 R による統計解析計算与えられたデータに対する統計量の計算欠損値 (missing value) の処理該当データの欠如をあらわす RではNA (Not Availableの意 ) によりあらわされる実際, 実データには何らかの理由によりデータが欠如していることが稀ではない R の殆どの関数はデータに NA が存在しても問題がなく, NA がある場合の処理の為に, 特別な引数 ( 論理値 )na.rm がある Ex. mean(a, na.rm = TRUE) Copyright (C). All Rights Reserved.

R による統計解析 Graphics Histogram 与えられたデータに対してヒストグラムを描く Ex.

38 R commander による統計解析外部データ (beer.csv) の input データデータのインポートテキストファイルデータセット名を入力 : beer ファイル内に変数名あり : 欠損値の記号 : 空欄 (default: NA ) データファイルの場所 : ローカルファイルシステム (default) フィールドの区切り記号 : カンマ (csvファイル) 小数点の記号 : ピリオド Copyright (C). All Rights Reserved.

48 関連文献 R に関する参考文献間瀬茂数学を発展させるコンピュータソフト : 統計解析言語環境 R, 数学セミナー (2010) 渋谷政昭 + 柴田里程訳 S 言語データ解析とグラフィックスのためのプログラミング環境 I, II A.Zuur/E.Ieno/E.Meesters 著石田基広 / 石田和枝訳 R 初心者のための ABC, Springer U.Ligges 著石田基広訳 R の基礎とプログラミング技法, Springer W.N.Venables/B.D.Ripley 著伊藤幹夫 / 戸瀬信之訳他 S-PLUS による統計解析第 2 版, Springer 舟尾暢男著 The R Tips データ解析環境 R の基本技グラフィックス活用集第 2 版, Ohmsha Copyright (C). All Rights Reserved.

Microsoft Word - index.html

Microsoft Word - index.html R のインストールと超入門 R とは? R ダウンロード R のインストール R の基本操作 R 終了データの読み込みパッケージの操作 R とは? Rはデータ解析マイニングを行うフリーソフトである Rはデータ解析の環境でもあり言語でもあるニュージーランドのオークランド (Auckland) 大学の統計学科のRobert Gentlemanと Ross Ihakaにより開発がはじめられ 1997

統計分析ソフトによる統計分析 Ｒ 初歩の初歩（１）

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