LS-DYNA 利用の手引第 1 版東京工業大学学術国際情報センター 2017 年 9 月 25 日

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かずきこうじょう
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1 LS-DYNA 利用の手引第 1 版東京工業大学学術国際情報センター 2017 年 9 月 25 日

2 目次 1. はじめに利用できるバージョン概要マニュアル 1 2. TSUBAME3 での利用方法 LS-DYNA の実行 TSUBAME3 にログインバージョンの切り替えインタラクティブノードでの LS-DYNA の起動 / 実行バッチジョブスケジューラー UGE による実行ライセンスの確認 8 3. 改定履歴 9 i

3 1. はじめに本書は LS-DYNA を東京工業大学学術国際情報センターの TSUBAME で利用する方法について説明していますまた TSUBAME を利用するにあたっては TSUBAME 利用の手引きもご覧下さいサーバの利用環境や注意事項などが詳細に記述されていますのでよく読んでください LS-DYNA の国内販売元の株式会社 JSOL では,LS-DYNA に関する Web ページを公開しています次のアドレスを参照してください利用できるバージョン TSUBAME3 で利用可能な最新バージョンについては TSUBAME 計算サービス Web ページのシステム構成 >アプリケーションソフトウェアをご確認下さい [ アプリケーションソフトウェア ] 研究に支障がない限りバグ修正の入っている最新版をご利用下さい 1.2. 概要 LS-DYNA は非線形有限要素法をベースとする先進の CAE ソフトウェアです様々な産業分野, 目的に応じた解析に適用可能な高度な汎用性を有しています製品設計の基本となる構造解析から流体構造連成問題などの複雑な解析などをひとつのソフトウェアでカバーすることができます豊富な材料物性モデルライブラリーを有しており, 様々な材料をモデル化することが可能ですスケーラブルな領域分割型並列計算機能により大規模モデルを高速に処理しますまた GUI の LS-PrePost は LS-DYNA と合わせて無償提供されている先進的なプリポストツールになりますユーザインターフェースは効率的かつ直感的に扱えるようにデザインされています LS-PrePost は高速なレンダリングと XY プロットを実現するために OpenGL グラフィックスを利用します 1.3. マニュアル LS-DYNA Support 1

4 2. TSUBAME3 での利用方法 2.1. LS-DYNA の実行 TSUBAME3 にログイン次のコマンドを入力し TSUBAME3 にログインしてください SSH 鍵を利用する場合 $ ssh login.t3.gsic.titech.ac.jp -l USER-ID i 鍵ファイル SSH 鍵 X 転送を利用する場合 $ ssh login.t3.gsic.titech.ac.jp -l USER-ID i 鍵ファイル -YC ssh オプションについては SSH の man page をご確認くださいバージョンの切り替え module コマンドで module ファイルを読み込むことでバージョンの切り替えが可能です TSUBAME3.0 利用の手引きの 3.1. 利用環境の切換え方法の方法で切り替えが可能です読み込めるバージョンについては TSUBAME 計算サービス Web ページのシステム構成 >アプリケーションソフトウェアをご確認下さい [ アプリケーションソフトウェア ] インタラクティブノードでの LS-DYNA の起動 / 実行ログインノードは計算ノードとは別構成となっておりログインノード上でアプリケーションを実行することは想定されておりませんログインノードに負荷がかからないように TSUBAME3.0 利用の手引きの 4.3 インタラクティブジョブの投入の方法でインタラクティブ利用 ( 計算ノードに接続して直接コマンド実行 ) を行ってください以下のコマンドで計算ノードに接続します $ qrsh -g [TSUBAME3 グループ ] -l [ 資源タイプ ]=[ 個数 ] -l h_rt=[ 経過時間 ] CUI の場合は以下のコマンドを実行してくださいコマンドは下表をご確認ください $ cd < 利用したいディレクトリ > $ module load lsdyna/r9.1.0 $< コマンド名 > i=< 入力ファイル > 表 1 LS-DYNA コマンドプログラム SMP 単精度版コマンド名 smpdynas 2

5 SMP 倍精度版 MPP 単精度版 MPP 倍精度版 smpdynad mppdynas mppdynad 表 2 MPP 実行後処理用プログラム l2a コマンドプログラム MPP 単精度版 MPP 倍精度版コマンド名 l2as l2ad GUI の場合は以下の方法で実施してください qrsh で接続したノードから直接 X 転送を行う場合は下記の手順にて接続くださいなお f_node のみが対象となります (1) qrsh コマンドの実行 (2) 別のターミナルから qrsh で割り当てられたノードへの ssh 接続コマンド実行例例では 2 時間接続で割り当てノードとして r0i0n0 が割り当てられた場合を想定しております割り当てノードはコマンド実行時に空いているノードですので明示的にノードを指定することはできません #qrsh の実行 $ qrsh -g [TSUBAME3 グループ ] -l f_node=1 -l h_rt=2:0:0 Thu Sep 21 08:17:19 JST 2017 r0i0n0:~> #qrsh を実行したターミナルはそのままで別のターミナルを立ち上げてください # 以下は TSUBAME にログインした後となります Last login: Thu Sep 21 08:16: from XXX.XXX.XXX.XXX login0:~> ssh r0i0n0 YC r0i0n0:~> module load lsdyna/r9.1.0 lsprepost/4.3 r0i0n0:~> lsprepost Livermore Software Technology Corporation L S - P R E P O S T Advanced Pre- and Post-Processor for LS-DYNA 3

LS-PrePost(R) V4.3.11-04Jul2017 LSTC Copyright (C) 1999-2014 All Rights Reserved OpenGL version 1.4 (4.2.0 - Build 10.

6 LS-PrePost(R) V Jul2017 LSTC Copyright (C) All Rights Reserved OpenGL version 1.4 ( Build ) 図 1 LS-PrePost の起動画面メニューバーの File > Exit をクリックすると終了しますバッチジョブスケジューラー UGE による実行 LS-DYNA はバッチジョブで利用する場合の例を以下に示します SMP 単精度版 $ cd < 入力データを置いてあるディレクトリ > run_smps_r9.1.0.sh を実行する場合 4

7 $ qsub run_smps_r9.1.0.sh SMP 倍精度版 $ cd < 入力データを置いてあるディレクトリ > run_smpd_r9.1.0.sh を実行する場合 $ qsub run_smpd_r9.1.0.sh MPP 単精度版 $ cd < 入力データを置いてあるディレクトリ > run_mpps_r node-avx2.sh を実行する場合 $ qsub run_mpps_r node-avx2.sh MPP 倍精度版 $ cd < 入力データを置いてあるディレクトリ > run_mppd_r node-avx2.sh を実行する場合 $ qsub run_mppd_r node-avx2.sh スクリプト例 :SMP 単精度版 #!/bin/bash #$ -cwd #$ -V #$ -l h_node=1 #$ -l h_rt=0:30:0. /etc/profile.d/modules.sh module load cuda/ module load lsdyna/r9.1.0 export base_dir=/home/4/t3-test00/isv/lsdyna cd $base_dir/smp_s export exe=smpdynas #export LSTC_LICENSE=network #export LSTC_MEMORY=auto export NCPUS=4 5

8 export OMP_NUM_THREADS=${NCPUS} export INPUT=$base_dir/sample/airbag_deploy.k ${exe} i=${input} ncpus=${ncpus} スクリプト例 :SMP 倍精度版 #!/bin/bash #$ -cwd #$ -V #$ -l h_node=1 #$ -l h_rt=0:30:0. /etc/profile.d/modules.sh module load cuda/ module load lsdyna/r9.1.0 export base_dir=/home/4/t3-test00/isv/lsdyna cd $base_dir/smp_d export exe=smpdynad #export LSTC_LICENSE=network #export LSTC_MEMORY=auto export NCPUS=4 export OMP_NUM_THREADS=${NCPUS} export INPUT=$base_dir/sample/airbag_deploy.k ${exe} i=${input} ncpus=${ncpus} スクリプト例 :MPP 単精度版 #!/bin/bash #$ -cwd #$ -V #$ -l h_node=1 #$ -l h_rt=0:30:0. /etc/profile.d/modules.sh 6

9 module load cuda/ module load lsdyna/r9.1.0 mpt/2.16 export base_dir=/home/4/t3-test00/isv/lsdyna cd $base_dir/mpp_s export exe=mppdynas_avx2 export dbo=l2as_avx2 #export LSTC_LICENSE=network #export LSTC_MEMORY=auto export NCPUS=4 export OMP_NUM_THREADS=1 export INPUT=$base_dir/sample/airbag_deploy.k export MPI_BUFS_PER_PROC=512 export MPI_REMSH=ssh mpiexec_mpt -v -np 4 dplace -s1 ${exe} i=${input} ncpus=${ncpus} ${dbo} binout* スクリプト例 :MPP 倍精度版 #!/bin/bash #$ -cwd #$ -V #$ -l h_node=1 #$ -l h_rt=0:30:0. /etc/profile.d/modules.sh module load cuda/ module load lsdyna/r9.1.0 mpt/2.16 export base_dir=/home/4/t3-test00/isv/lsdyna cd $base_dir/mpp_d export exe=mppdynad_avx2 export dbo=l2ad_avx2 7

10 #export LSTC_LICENSE=network #export LSTC_MEMORY=auto export NCPUS=4 export OMP_NUM_THREADS=1 export INPUT=$base_dir/sample/airbag_deploy.k export MPI_BUFS_PER_PROC=512 export MPI_REMSH=ssh mpiexec_mpt -v -np 4 dplace -s1 ${exe} i=${input} ncpus=${ncpus} ${dbo} binout* スクリプトは利用者の環境に合わせて変更してくださいインプットファイルはシェルスクリプト内で INPUT=< インプットファイル名 > として指定しますライセンスの確認 LS-DYNA のライセンス利用状況を以下のコマンドで確認できます $ lstc_qrun -r 詳細な使用状況を確認する場合は以下のオプションで実行ください $ lstc_qrun R 現在契約しているライセンス数については下記のページをご確認ください 8

11 3. 改定履歴改定番号改定日付内容 v1 3/14/2018 初版 9

目次 LS-DYNA 利用の手引き 1 1. はじめに利用できるバージョン概要 1 2. TSUBAME での利用方法使用可能な LS-DYNA の実行 4 (1) TSUBAMEにログイン 4 (2) バージョンの切り替え 4 (3) インタラ

目次 LS-DYNA 利用の手引き 1 1. はじめに利用できるバージョン概要 1 2. TSUBAME での利用方法使用可能な LS-DYNA の実行 4 (1) TSUBAMEにログイン 4 (2) バージョンの切り替え 4 (3) インタラ LS-DYNA 利用の手引東京工業大学学術国際情報センター 2016.04 version 1.10 目次 LS-DYNA 利用の手引き 1 1. はじめに 1 1.1 利用できるバージョン 1 1.2 概要 1 2. TSUBAME での利用方法 1 2.1 使用可能な 1 2.2 LS-DYNA の実行 4 (1) TSUBAMEにログイン 4 (2) バージョンの切り替え 4 (3) インタラクティブ実行

LS-DYNA 利用の手引 第 1 版 東京工業大学学術国際情報センター 2017 年 9 月 25 日

LS-DYNA 利用の手引第 1 版東京工業大学学術国際情報センター 2017 年 9 月 25 日