PGIコンパイラ導入手順

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ときなうばら
4 years ago
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1 1 注意この資料は PGI compiler が最新であるときに作成した資料を元にしています PGI compiler 19.4 がリリースされましたがインストール手順や利用手順はと変わりません資料中の 1810 を 194 にを 19.4 に読み替えてください 2019 年 6 月版

2 2 大きく分けて以下の 3 つの方法が利用可能 1. 手元のウェブブラウザでダウンロードして ITOに転送する簡単 2GB 程度のファイルを一時保存しITOへ転送するという手間は発生する SFTPやSCP( というコマンドもしくはそれに方法に対応したソフトウェア ) で転送 2. ITOに導入されているグラフィカルなウェブブラウザを起動しダウンロードする X 転送が必要なためssh 接続ソフトによっては難しい MovaXtermではデフォルト設定でX 転送が有効なはずなのでいきなり利用できるはずである Macのターミナル接続などではsshに-Yオプションを付けるのみで利用できるはずである 3. ITOに導入されているテキストベースのウェブブラウザを起動しダウンロードする elinksというソフトが利用可能全てテキスト表示となるがグラフィカル版と表示される情報は同様情報が並んでいる順番までは同じに見えない部分もあるが

3 3 ウェブブラウザで pgroup.com へアクセス elinks では起動時に入力 $ elinks pgroup.com Free Download を選び次のページへグラフィカルなウェブブラウザの場合 elinks の場合青背景になっている部分 ( リンク ) が選択中であり上下キーで次のリンクを選択することができる Enter で選択先のリンクへページ遷移終了は q(q で確認なしの強制終了 ) の画面例

4 4 ( 必要に応じてページをスクロールさせて ) Linux x86-64 を選び次のページへこのページ以降の画面例は全ての場合 19.4 でも配置はほぼ変わっていないため適当に読み替えること

5 5 グラフィカル版では勝手にダウンロードが始まる始まらない場合は this direct link を選ぶ elinks では待たずに this direct link を選ぶ

6 6 グラフィカルなウェブブラウザの場合はブラウザの設定に従ってそれぞれの方法でファイルを保存する手元の PC にダウンロードした場合は sftp や scp で ITO に転送する elinks の場合は以下の手順に従う ( さらに次のページへつづく ) ファイルをどうするかという問い合わせカーソルキーで Save が緑 + 青になるようにして Enter 保存するファイル名の指定カーソルキーで OK が緑 + 青になるようにして Enter

7 elinks を使う場合のファイルダウンロード手順つづきダウンロード済容量ダウンロード済容量が 2000 を超えて進まない場合やその後エラー画面になってしまう場合おそらく正しくダウンロードできている Abort を選び Q で elinks を終了してしまって良いエラー画面エラーが表示されても

7 7 elinks を使う場合のファイルダウンロード手順つづきダウンロード済容量ダウンロード済容量が 2000 を超えて進まない場合やその後エラー画面になってしまう場合おそらく正しくダウンロードできている Abort を選び Q で elinks を終了してしまって良いエラー画面エラーが表示されてもおそらく正しくダウンロードできている確認方法は md5sum コマンドの結果がチェックサムと一致することあわない場合はダウンロードしたファイルを消してやり直すチェックサム pgilinux x86-64.tar.gz のチェックサムは 47b3fa40170eef9e091632d1611fa0bb

8 8 前提ホームディレクトリ ( ログインして最初の場所 ) に pgilinux x86-64.tar.gz が置いてある状態手順インストール先ディレクトリを作成 :mkdir opt 作業用のディレクトリを作成 :mkdir tmp 入手したインストーラファイルを作業用のディレクトリに展開 : tar zxvf./pgilinux x86-64.tar.gz C tmp インストーラファイルは圧縮ファイルでありこのコマンドで中身 ( インストーラそのもの ) が取り出される作業用ディレクトリに移動 :cd tmp インストーラを起動 :./install

9 9./install Press enter to continue... enter ライセンス情報を読む Do you accept these terms? (accept,decline) accept Please choose install option: 1 Installation directory? [/opt/pgi] ~/opt/pgi ライセンス情報を読む accept Do you wish to update/create links in the 2018 directory? (y/n) y Press enter to continue... enter Do you want to install Open MPI onto you system? (y/n) y 問題が起きたら Ctrl+C でキャンセルし ~/opt/pgi を消してやり直すと良い rm -rf ~/opt/pgi Do you want to enable NVIDIA GPU support in Open MPI? (y/n) y Do you wish to obtain permanent license key or configure license service? (y/n) n Do you want the files in the install directory to be read-only? (y/n) n y にしても構わないのだがあとで更新追加する際に引っかかる可能性あり

10 以下のスクリーンショットは 18.10 の場合 19.4 でもほぼ変わらない.

10 10 以下のスクリーンショットはの場合 19.4 でもほぼ変わらない./install で起動 Enter で次の画面へライセンス条項が表示される一番下までスクロールし accept と入力して Enter ( スクロールはスペースキーの入力などで行う )

11 11 インストール中待つ (# の文字が増えていく ) 1 Single system install を選択インストール先として ~/opt/pgi を指定 Enter キー Java のライセンス条項をスクロールして accept

12 12 ファイルのリンクを作成この後少し待つ ( これまでに選択した情報に基づいて実際のインストール作業が行われている ) MPI のインストール Enter 後 2 つとも y にして少し待つ

13 13 ライセンス関係の処理ここは n にするインストール先ディレクトリを読み取り専用にするかする意味はあまりないので n ( 作業ミスで破壊することを防げる程度 ) 終了

14 14 ファイルの確認 ls ~/opt/pgi 以下に linux86-64, linux86-64-llvm, modulefiles ディレクトリと license 関係のファイルが存在することを確認 modulefile の使用 module load ~/opt/pgi/modulefiles/pgi/19.4 pgcc などのコマンドが利用可能となることを確認バッチジョブスクリプト内でも module load は必要以下は pg まで入力し Tab キーを 2 回押してコマンド補完候補の表示を行った例

15 15 modulefile の利用 :MPI を利用する場合 module load ~/opt/pgi/modulefiles/openmpi/2.1.2/2018 OpenACC 実行環境に関する情報の取得 pgaccelinfo コマンドにより OpenACC 対応 GPU の情報などが得られるがログインノードで実行してもCUDAドライバのバージョン情報しか得られない (GPUが搭載されていないため ) 実際に得られる出力 $ pgaccelinfo CUDA Driver Version: 9010 No accelerators found. Try pgaccelinfo -v for more information サブシステム B を使うバッチジョブ内で実行すると様々な情報が得られる ( 次頁を参照 ) 基本フロントエンド ( ベアメタル ) と大容量フロントエンド ( ベアメタル ) におけるインタラクティブ実行時も OpenACC により GPU を利用可能

16 pgaccelinfo 実行例 ( サブシステム B PGI 19.4) CUDA Driver Version: 9010 NVRM version: NVIDIA UNIX x86_64 Kernel Module Wed Jan 31 22:08:49 PST 2018 Device Number: 0 Device Name: Tesla P100-SXM2-16GB Device Revision Number: 6.0 Global Memory Size: Number of Multiprocessors: 56 Concurrent Copy and Execution: Yes Total Constant Memory: Total Shared Memory per Block: Registers per Block: Warp Size: 32 Maximum Threads per Block: 1024 Maximum Block Dimensions: 1024, 1024, 64 Maximum Grid Dimensions: x x Maximum Memory Pitch: B Texture Alignment: 512B Clock Rate: 1480 MHz Execution Timeout: No Integrated Device: No Can Map Host Memory: Yes Compute Mode: default Concurrent Kernels: Yes ECC Enabled: Yes Memory Clock Rate: 715 MHz Memory Bus Width: 4096 bits L2 Cache Size: bytes Max Threads Per SMP: 2048 Async Engines: 5 Unified Addressing: Yes Managed Memory: Yes Concurrent Managed Memory: Yes Preemption Supported: Yes Cooperative Launch: Yes Multi-Device: Yes PGI Default Target: -ta=tesla:cc60 搭載 GPU 搭載 GPU に対応する -ta オプション 16

17 17 Q:~/opt/pgi ディレクトリを消そうとすると許可がありませんが出て消せない? A: 一部のディレクトリに書き込み権限が付与されていないため手っ取り早く解決する方法は chmod -R u+w ~/opt/pgi を実行してから rm -rf ~/opt/pgi で消すこと

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