Perl + α. : DNA, mrna,,

遺伝子発現データの クラスタリングの理論的背景

自己組織化マップ Self-Organization Map (SOM) 自己組織化マップとは? K 平均アルゴリズムは あらかじめクラスター数 K を設定し 互いに近い値を持った各要素が同一クラスターに所属するように所属クラスターを決めてゆく 自己組織化マップは互いに近い値を持った各要素が近くなるように低い次元上にマップする 自己組織化マップは 1988 年に Kohonen が提案した (Kohonen

2

2 3 4 TTT TCT TAT TGT TTC TCC TAC TGC TTA TCA TAA TGA TTG TCG TAG TGG CTT CCT CAT CGT CTC CCC CAC CGC CTA CCA CAA CGA CTG CCG CAG CGG ATT ACT AAT AGT ATC ACC AAC AGC ATA ACA AAA AGA ATG ACG AAG AGG GTT

狂牛病調査第２巻1章，２章.doc

21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 2.1 A LD50/30mg () 10 ND 1 2.8 ND ND ND 11 ND 2.3 1.0 ND ND 11 ND ND 1.3 1.7 ND 13 ND

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Section3 64 1 65 Section 3 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 1 Babara E. Ainsworth et al. Med. Sci. Sports. Exevc.1993 66 67 Section 3 1 10 9 8 1 2 3 4 7 6 5 6 7 5 1 2 3 4 68 69 Section 3 2 70 Section 3

Microsoft PowerPoint - molsim-okamoto-07I

第 11 回分子シミュレーション夏の学校 August 1-3, 2007 拡張アンサンブル法と 生体分子シミュレーション Yuko OKAMOTO( 岡本祐幸 ) 名古屋大学 大学院理学研究科 物理学教室 e-mail: okamoto{a}phys.nagoya-u.ac.jp URL: http://jegog.phys.nagoya-u.ac.jp/tb/ Contents (I) Protein

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" " " " n " n n " n " n n n " n n n n " n LGPSSKQTGKGW-SRIWDN! + +! LN-ITKSAGKGAIMRLGDA! " n -------TGKG--------!! -------AGKG--------! " n w w w " n w w " " " 11 12 " n w w w " n w w A! M! O! A!

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16 11 5 25mg 14 11 18 1 25mg 1 150,000 934 1 2 : 1-235-tumor necrosis factor receptor (human) fusion protein with 236-467-immunoglobulin G1 (human γ1-chain Fc fragment), dimmer : : 1 235 236 467 G 1 γ1

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衛生微生物技術協議会第 39 回研究会 滋賀県大津市 2018 年 7 月 5 日 ( 木 ) 国立感染症研究所ウイルス第 1 部 イム チャンガン 世話人 林 昌宏 アルボウイルスレファレンスセンター 担当ブロック 機関 担当部 課 世話人 国立感染症研究所 ウイルス第 1 部第 2 室林昌宏 北海道 東北ブロック 宮城県保健環境センター 微生物部 関東 甲信越ブロック 東京都健康安全研究センター

日本化学療法学会雑誌第57巻第1号

In vitro Streptococcus pneumoniae Escherichia coli in vitro Streptococcus pneumoniae Escherichia coli µs. pneumoniae E. coli µ Key words in vitrostreptococcus pneumoniae Escherichia coli Escherichia coli

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1 1 2 CADLIVE E-CELL 3 GEM CE/MS MGF WT MGF 4 2 WT E-Cell MASK 5 CE-MS, CE- TOFMS LC-MS 24, 5 9 2 0 6 3 CE-MS CE MS Soga, T. et al. (2002) Anal Chem. 74, 2233-2239 7 CE-MS 859 452, 269, 86 8 4 LC-MS 9

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タンパク質 ( 生化学 1) 平成 29 年 4 月 20 日病態生化学分野 分子酵素化学分野教授 山縣和也 生化学 1のスケジュール 4 月 20 日 講義開始 6 月 1 日 中間試験 9 月 25 日 生化学 1 試験 講義日程 内容は一部変更があります 講義資料 ( 山縣 吉澤分 ): 熊本大学病態生化学 で検索 ID: Biochem2 パスワード :76TgFD3Xc 生化学 1 の合否判定は

,328 C 6426 H 9900 N 1700 O 2008 S , ,

2458 13 4 24 1 11 9 17 1,328 C 6426 H 9900 N 1700 O 2008 S 44 145,000 148,000 10 11 27 2 13 4 24 11 9 17 (1) CD20 B CD20 (2) infusion reaction infusion-associated symptom CD20 B 1 375mg/m 2 1 4 3 Heavy

ウェブ23Brev2

23B 23B.1 23B.1.1 23B.1.2 23B.2 23B.2.1 23B.2.2 a b 23B.3 23B.3.1 23B.3.2 23B.4 23B.4.1 23B.4.2 23B.4.3 23B.5 23B.5.1 23B.5.2 23B.6 23B.6.1 a b c Edman d e 23B.6.2 23B.6.3 23B.7 23B.7.1 a b c 23B.7.2 23B.7.3

バイオ医薬品における特許の現状

18 1 1 2 2 7 1970 3 DNA 4 5 A REMICADE TM 6 6-506120 New York University, Centocor, Inc. 1 1 TNF a A2 TNF b TNF HERCEPTIN TM HUMIRA TM Genentech G HERCEPTIN trastuzumab 1998 FDA HER2 HER2 7 HERCEPTIN HERCEPTIN

Polyoxometalateが有するcysteine検出能の検討及びジスルフィド結合形成反応への展開

チオールを特異的に酸化し 発色する 山形大学理工学研究科バイオ化学工学専攻准教授今野博行 金属酸化物クラスターアニオン ポリオキソメタレート Polyoxometalate (POM) 金属元素に酸素が6個配位した MO6を基本骨格とする金属酸化物 1 nm クラスターアニオン MO6 (octahedron) ( PxMyOz )n 構造 構成元素 対カチオン等を 制御することで 様々な機能性を

（別添）安全性未審査の組換えDNA技術応用食品の検査方法_NIHS 最終版_YF

コムギ (MON71200 MON71100/71300 MON71700 MON71800) の検査方法 コムギ穀粒又は粉砕加工食品を検査対象として 1 検体から 2 併行で DNA を抽出精製する 得られた各 DNA 試料液を用いて 2 ウェル併行で定性リアルタイム PCR を実施する 1. DNA 抽出精製 1.1. 試料の洗浄 粉砕 ( 穀粒の場合 ) コムギ穀粒を試料 ( 重量 ) あたり

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平成 20 年度新技術説明会 アミロイド線維形成阻害剤を用いた アミロイドーシスの治療 熊本大学大学院医学薬学研究部 病態情報解析学分野 講師 城野博史 研究背景 アミロイドーシス 生体内にアミロイド ( ナイロン様の重合物質 ) が沈着し臓器障害を引き起こす病気 ーナイロンの配列に似ているー アミロイドーシスの分類 [ 全身性アミロイドーシス ] 免疫グロブリン性アミロイドーシス 1) AL アミロイドーシス

Nov12_2009.pptx

h"p://www.ebi.ac.uk/tools/emboss/align/index.html UNIPROT TPIS_HUMAN, TPIS_RABIT FASTA Run #########################################! Program: needle# Rundate: Tue Nov 10 02:40:01 2009! #########################################!

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生物物理化学 1 セントラルドグマ (central doguma) DA から蛋白質が作られるまでの道筋 フランシス クリックが提唱した 原核生物と真核生物では 若干関与するタンパク質が異なるが 基本的には同じメカニズムで転写 翻訳 タンパク合成が行われる 原核生物 : 核膜が無い ( 構造的に区別出来る核を持たない ) 細胞 ( これを原核細胞という ) から成る生物で 細菌類や藍藻類がこれに属する

(Quality of Life; QL) QL (Nerve Growth Factor; NGF) NGF PC12 6- (6-HITC) NGF NGF NGF PTP1B 6-HITC PTP1B NGF PTP1B 6-HITC PTP1B 6-HITC NGF 6-HITC 6-HITC in vivo 464-8601 Tel: 052-789-4126 20-Hydroxyecdysone

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アミノ酸代謝 (1) 平成 30 年度 6 月 14 日 1 限病態生化学分野 吉澤達也 アミノ酸代謝 アミノ酸の修飾 食物タンパク質 消化吸収 分解 タンパク質 (20 種類 +α) 遊離アミノ酸 生合成 アミノ酸の生合成 ( 栄養学的非必須アミノ酸 ) 窒素 分解 炭素骨格 非タンパク質性誘導体 ( 神経伝達物質 ホルモン アミノ糖など ) 尿素サイクル 代謝中間体 尿素 糖質 脂質 エネルギー

高齢者の口蓋垂に生じた扁平上皮乳頭腫の1例

日口内誌第 20 巻第 1 号 :8 13,2014,6 月 症例報告 高齢者の口蓋垂に生じた扁平上皮乳頭腫の 1 例 三浦桂一郎 1,2) 朝比奈泉 1) 抄録 : 扁平上皮乳頭腫は, 扁平上皮乳頭腫は, 表面が顆粒状の皮膚や粘膜上皮に発生する良性の上皮性腫瘍である 発生原因として慢性刺激のほか, ヒトパピローマウィルス (HPV) の関与が考えられている 好発部位は, 舌, 口蓋, 口唇, および頬粘膜だが,

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生化学への導入 平成 30 年 4 月 12 日 病態生化学分野教授 ( 生化学 2) 山縣和也 生化学とは 細胞の化学的構成成分 およびそれらが示す化学反応と代謝機序を取り扱う学問 ハーパー生化学 生化学 1 生化学 2 生化学 炭水化物 / 糖 脂質 アミノ酸について勉強します 糖 脂質生化学 2 脂質 アミノ酸 核酸 生化学 1 生化学と医学は密接に関係する 炭水化物 脂質 生化学 蛋白質 核酸

日本化学療法学会雑誌第66巻第2号

173 Table 1.Detection rates of Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Mycoplasma genitalium, Ureaplasma urealyticum, Haemophilus influenzae and adenovirus from male urethritis in Urethritis No.

質量分析計を用いて腸内細菌叢が産生するD-アミノ酸を新発見―高感度ハイスループット・キラルアミノ酸解析でD-アミノ酸研究に新展開―

参考資料 (1) 研究背景 腸内細菌叢と宿主のクロストークにおいて 腸内常在菌により代謝産生される低分子化合物は重要因子である これらの一部は 腸管上皮細胞を直接的に刺激し 大腸管腔内から吸収され血中に移行すれば宿主の細胞に直接的に影響を与える可能性が高い 長年 生体を構成しているのは L- アミノ酸のみと考えられていたが D- アミノ酸が微量ながら存在することが明らかになり 近年 その様々な生理機能や疾病との関わりに注目が集まっている

(1) GGT阻害剤

(GGT) (glutathione, GSH, -L-Glu-L-Cys-Gly) Cys 1 10 mm GSSG GSH 98% - + H 3 N COO - γ- O H N O N H SH O γ-glu Cys Gly OH - (GGT, EC 2.3.2.2) GGT (GSH) GSX - Glu Cys(X)-Gly 1-2) GGT - 1 hydrolases transferases

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平成 22 年度修士論文 プロテアーゼを欠損した枯草菌における組換え 融合タンパク質の発現 Expression of recombinant fusion proteins in protease-deficient Bacillus subtilis 高知工科大学大学院工学研究科 基盤工学専攻物質 環境システム工学コース 1135012 安岡佳江 目次 1. 要約 :Abstract : 2 2.

7-1（DNA配列から遺伝子を探す）.ppt

DNA 配列の中から遺伝子を探す Blast 解析.6 Query DNA 塩基配列アミノ酸配列 DNA 塩基配列をアミノ酸配列に変換アミノ酸配列 DNA 塩基配列をアミノ酸配列に変換 データベース DNA 塩基配列アミノ酸配列アミノ酸配列 DNA 塩基配列をアミノ酸配列に変換 DNA 塩基配列をアミノ酸配列に変換 1. 2. 3. TATGGCTTA---- T G L TATGGCTTA----

生物学入門

第 10 章タンパク質のはたらき これまでの学習で遺伝子はポリペプチド鎖をコードしていることがわかった タンパク質の構造については第 2 章で大まかなことを述べたが ポリペプチド鎖の構造と機能の関係 ポリペプチド鎖とタンパク質の関係を 具体的な例をあげて述べていこう 生物学をあまり知らない人でも ヘモグロビンという名前を聞いたことがあるだろう 赤血球中にある酸素を運搬するタンパク質である 血液を取ってきて赤血球を集めると

37-4.indd

ISSN 0916-3328 東京大学アイソトープ総合センター VOL. 37 NO. 4 2007. 3. 26 アイソトープ総合センターの将来展望 40 18 18 20 3 800 1/3 1300 14 18 20 3 19 2 生きた細胞内の分子過程を 時間 空間計測する蛍光プローブの開発 1. はじめに Fura-2 Fura-2 198 1, 2 3, 4 2. 生体脂質分子の機能とその分析

小角散乱を用いて多機能タンパク質の 機能発現の分子機構を探る

PF 研 究 会 /2008.09.18 多 機 能 タンパク 質 の 機 能 発 現 の 機 構 解 明 における 小 角 散 乱 の 役 割 Role of small-angle scattering in unraveling the recognition mechanism by a multifunctional protein 山 形 大 院 理 工, Yamagata Univ.,

津村漢方雑誌表紙_ol.ai

東京都健康安全研究センター研究年報

東京健安研セ年報 Ann. Rep. Tokyo Metr. Inst.P.H., 57, 77-81, 2006 ペット動物における病原大腸菌の保有実態調査 畠山 薫 *, 奥野ルミ *, 小西典子 ** **, 下島優香子尾畑浩魅 **, 遠藤美代子 * *, 柳川義勢 Research of Diarrheagenic Escherichia coli in Pet animals Kaoru

生物学入門

第 8 章 DNA からタンパク質へ これまではメンデルの要素と遺伝子あるいは DNA を あまり厳密に区別をせずに使ってきた また遺伝子が染色体に載っているとも言ってきた 第 7 章で染色体と DNA の構造の関係を述べたが 染色体に遺伝子が載っているというのはどういうことだろうか? ちょうど今から 50 年前の 1953 年に DNA の構造が明らかになった ここでは DNA の構造が明らかになるまでと

鳥インフルエンザから新型インフルエンザ大流行へ

H1 - H16 N1 - N9 Aquatic birds Poultry Humans Pigs Horses Aquatic mammals Cats Dogs Influenza Branch ( ) 1997 H5N1 18 6 H5N1 HPAI 2004 36,169 7 5 210,431-27 Feb. 2004, Chickens 6, 1 12 Jan.2004 Chickens

26 2 27 1 2 NFE 13.5 8.0 3.8 71.7 1.7 11.5 12.1 1.8 70.5 2.4 11.8 10.6 2.1 68.8 4.4 13.8 7.9 2.3 73.7 0.9 11.7 46.1 1.3 29.4 5.6 3 Defa Li Asian-Aust. J. Anim. Sci. 2002, 15(8), 1191-1197 Corn and brown

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P 1. 2. R H C H, etc. R' n R' R C R'' R R H R R' R C C R R C R' R C R' R C C R 1-1 1-2 3. 1-3 1-4 4. 5. 1-5 5. 1-6 6. 10 1-7 7. 1-8 8. 2-1 2-2 2-3 9. 2-4 2-5 2-6 2-7 10. 2-8 10. 2-9 10. 2-10 10. 11. C

講義資料2012

第 10 章脂質の代謝 10.1 はじめに 長鎖脂肪トリアシルグリセロール 生物化学 中鎖脂肪トリアシルグリセロール 講義資料 膵リパ - ゼ 1,2- ジアシルグリセロール膵リパ - ゼ 管腔内消化 ミセル 2-アシルグリセロール 1-アシルグリセロールイソメラ-ゼ膵リパ-ゼ 小腸上皮 再エステル化 oa アシルoA oa リンパ管 キロミクロン 図 1 脂質の消化と取り込み 10.2 脂肪酸の異化代謝

第十四改正日本薬局方第二追補

461 3 3 3 5 5 6 6 10 18 19 79 81 101 113 127 133 139 145 147 152 153 156 158 165 3 19 20 21 22 22 23 24 25 26 26 27 28 29 29 30 31 dl 32 dl 33 34 34 36 36 37 38 38 38 39 40 42 42 42 43 44 45 46 46 47 48

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1. 核酸と遺伝子 核酸とは ヌクレオチドの重合体で構成される生体高分子 例として DNA( デオキシリボ核酸 ) や RNA( リボ核酸 ) がある 核酸は遺伝情報物質であり いわば生命の 設計図 である 1 遺伝情報と DNA 遺伝情報 : 生物が個体として生命活動を営むのに必要なすべての情報遺伝情報は ヒトの場合染色体 ( ゲノム ) に格納されている 子のゲノムは 両方の親からそれぞれ受け継いだ

島津ジーエルシー総合カタログ2017【固相抽出】

アミノ酸分析キット 固https://solutions.shimadzu.co.jp/glc 241 EZ:faast ( イージーファースト ) LC/MS LC/MS/MS GC/FID GC/MS 分析可能な 60 種以上の脂肪族 芳香族アミノ酸 Chemical Name Abbreviation LOD (nmol/ml) S/N 3:1 FID MS Alanine ALA 1 0.1

九州大学学術情報リポジトリ Kyushu University Institutional Repository 口腔扁平上皮癌細胞由来エクソソームによる癌微小環境制御機構の解析 森岡, 政彦 出版情報 :Kyushu Unive

九州大学学術情報リポジトリ Kyushu University Institutional Repository 口腔扁平上皮癌細胞由来エクソソームによる癌微小環境制御機構の解析 森岡, 政彦 http://hdl.handle.net/2324/1931839 出版情報 :Kyushu University, 2017, 博士 ( 歯学 ), 課程博士バージョン : 権利関係 : 口腔扁平上皮癌細胞由来エクソソームによる

Microsoft Word - ボツリヌス病原体検査マニュアル docx

I ---- 3 1. ---- 4 2. ---- 5 II ---- 12 1. ---- 12 2. ---- 12 3. ---- 16 4. ---- 17 5. ---- 21 6. PCR ---- 25 III ---- 28 IV ---- 32 V ---- 34 VI ---- 35 ---- 10 ---- 12 ---- 15 ---- 24 PCR ---- 26

no

12 2004.9.3. no.234 2004.9.3. no.234 13 14 2004.9.3. no.234 2004.9.3. no.234 15 16 2004.9.3. no.234 2004.9.3. no.234 17 18 2004.9.3. no.234 19 2004.9.3. no.234 20 2004.9.3. no.234 21 2004.9.3. no.234 22

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Microsoft PowerPoint - BIセンターセミナー2013.pptx[読み取り専用]

遺伝子配列解析の基礎 genome=gene+ome DNA 配列からタンパク質へ cgtgctttccacgacggtgacacgcttccctggattggccagactgccttccgggtcactgccatggaggagccgcagtcagatcctagcgtcgagccccctctga gtcaggaaacattttcagacctatggaaactacttcctgaaaacaacgttctgtcccccttgccgtcccaagcaatggatgatttgatgctgtccccggacgatattga

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2014 Aug. 8No.596 http://www.saitama-ctv-kyosai.net 1021 1125 1127 10 10 27 11 11 17 11 11 20 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27

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平成１３年度 地域工業活性化支援事業報告書（多摩全域）