Microsoft Word -

Size: px
Start display at page:

Download "Microsoft Word -"

Transcription

1 平成 22 年度修士論文 プロテアーゼを欠損した枯草菌における組換え 融合タンパク質の発現 Expression of recombinant fusion proteins in protease-deficient Bacillus subtilis 高知工科大学大学院工学研究科 基盤工学専攻物質 環境システム工学コース 安岡佳江

2 目次 1. 要約 :Abstract : 2 2. はじめに :Introduction : 3 3. 材料と方法 :Materials & Methods : 5 4. 結果 :Results : 9 5. 考察 :Discussion : 謝辞 :Acknowledgement : 参考文献 :References : 付録 :Appendix : 17-1-

3 1. 要旨 :Abstract 本研究室では スギ花粉症の主要な抗原タンパク質である Cry j1 Cry j2 のT 細胞エピトープを用いるスギ花粉症ワクチンの開発を行っており 枯草菌中で T 細胞エピトープを発現させる実験を行っている しかし 枯草菌は強いプロテアーゼ活性を持っているため目的タンパク質の安定した発現が難しい そこで 9 つのプロテアーゼを欠損させた枯草菌株を用いタンパク質の発現量の増大と安定化を試みた スギ花粉症の主要アレルゲンタンパク質 Cry j1 Cry j2 の T 細胞エピトープと これを安定化させ その発現を確認するためのコレラ毒素 B サブユニット (CTB) との融合タンパク質遺伝子 (ctb-cry j1-cry j2) を設計した プロモーターには複数のプロモーターの複合体である mwp を用いた 次に 作製した融合遺伝子を大腸菌と枯草菌のシャトルベクターである phy300plk へ挿入し 作製した組換えプラスミドを大腸菌で発現させプラスミドの確認を行った この組換えプラスミドをエレクトロポレーション法により枯草菌 (168 trpc2) およびプロテアーゼ欠損枯草菌 (KA8XA) へ導入し 融合タンパク質を発現させた CTB に対する抗体を用いたウエスタンブロッティング法及び SDS-ポリアクリルアミドゲル電気泳動後のクーマシーブルー色素によるタンパク質の染色により融合タンパク質の発現を確認し プロテアーゼの影響を比較した -2-

4 2. はじめに :Introduction 現在 日本国民の 20% 以上がスギ花粉症に罹患していると考えられており 国民病とも言われている 花粉症の根治療法に減感作療法がある これは患者にアレルゲン ( 花粉タンパク質 ) を少量ずつ長期にわたり投与し免疫寛容 ( 特定の抗原に対し免疫反応が起こらなくなる現象 ) を誘導し治療する方法である しかし 強いアレルギー反応が生じる可能性があることから 投与量を厳密にコントロールしなければならず 治療期間も長期間の通院が必要など患者に負担をかける 免疫寛容はアレルゲン中の部分アミノ酸配列である抗原決定基が免疫リンパ球の一種である T 細胞に作用することによって起こる そこで T 細胞によって認識される抗原決定基 (T 細胞エピトープ ) を植物等で作らせ それを経口ワクチンとして使用する取り組みが試みられている アレルゲン自体を用いず アレルギーを引き起こす IgE 抗体や B 細胞に対する抗原決定基を含まないようにあらかじめ設計した T 細胞エピトープを投与できるため アナフィラキシーショックといった副作用がなく 安全性が期待できる 形質転換能を持つ枯草菌 (Bacillus subtilis) は 異種タンパク質の発現宿主として利用されている (1, 2) 枯草菌は大腸菌(Escherichia coli) と異なり外来遺伝子をゲノムへ取り込む能力があり 一度ゲノムに組み込まれた遺伝子は世代を経ても受け継がれる また 枯草菌は納豆菌と同種であるため 経口投与しても安全性が高いと考えられる Cry j1 Cry j2 はスギ花粉に存在するスギ花粉症の主要な抗原タンパク質である ヒトの T 細胞エピトープは同定されており (3) 本研究室は Cry j1 では 5 つ Cry j2 では7つの主要ヒト T 細胞エピトープを結合させたものを作製し使用している (4) コレラ毒素 B サブユニット (CTB) は コレラ毒素 (CT) を構成している 2 つのサブユニットのうち 標的細胞へ結合するためのサブユニットであり 抗原に対する特異免疫応答を高める免疫賦活作用を持っているとされ 補助タンパク質として利用されている (5) ここでは CTB を 発現された T 細胞エピトープを安定化させるとともに ウエスタンブロッティングによる検出マーカーとして使用した 先にも述べたが 枯草菌は形質転換能を持っており異種タンパク質の発現宿主として利用されている しかし 枯草菌は強いプロテアーゼ活性を持っているため目的タンパク質の安定した発現が難しい そこで 枯草菌の持つプロテアーゼの内いくつかを欠損させた枯草菌株が作製され それを用いた異種タンパク質の発現が行われている (6) 関口らの作製した Bacillus subtilis KA8AX は 9 つのプロテアーゼを欠損させた枯草菌株である (7) 本研究はこの Bacillus subtilis KA8AX 株を用いタンパク質の発現量の増大と安定化を試みた 抗原としてスギ花粉症の主要アレルゲンタンパク質 Cry j1 Cry j2 の T 細胞エピ -3-

5 トープを用いた これを安定化させ その発現を確認するためのコレラ毒素 B サブユニット (CTB) との融合タンパク質遺伝子 (ctb-cry j1-cry j2) を設計した プロモーターには Bacillus brevis 由来の強力なプロモーターであり複数のプロモーターの複合体である mwp を用いた 次に 作製した融合遺伝子を大腸菌と枯草菌のシャトルベクターである phy300plk へ挿入し 作製した組換えプラスミドを大腸菌で発現させプラスミドの確認を行った この組換えプラスミドをエレクトロポレーション法により枯草菌 (Bacillus subtilis 168 trpc2) およびプロテアーゼ欠損枯草菌 (Bacillus subtilis KA8AX) へ導入し 融合タンパク質を発現させた CTB に対する抗体を用いたウエスタンブロッティング法及び SDS-ポリアクリルアミドゲル電気泳動後のクーマシーブルー (CBB) 色素によるタンパク質の染色により融合タンパク質の発現を確認し プロテアーゼの影響を比較した -4-

6 3. 材料と方法 :Materials & Methods 使用菌株及びプラスミド Table1 本実験で使用した枯草菌株 菌株 遺伝子型 Bacillus subtilis 168 trpc2 trpc2 ( 親株 ) Bacillus subtilis KA8AX trpc2 Δepr ΔwprA Δmpr ΔnprB ( プロテアーゼ欠損株 ) bpr npre vpr apre aprx::spc Table 1 に本実験で使用した枯草菌株の遺伝子型をまとめている Bacillus subtilis 168 trpc2 株は親株であり 実験で汎用されている通常株である Bacillus subtilis KA8AX 株は 8 種類の細胞外プロテアーゼ及び 1 種類の細胞内プロテアーゼを欠損させたプロテアーゼ欠損枯草菌株で 信州大学の関口順一教授より分与されたものを使用した Escherichia coli JM109 及び PHY300PLK はタカラバイオから購入した 使用培地 LB 培地及び SOC 培地を使用した 培地の組成は付録に示した 3.1. Bam HI-mwp-ctb-cry j1-cry j2-bgl Ⅱ 融合遺伝子の作製融合遺伝子の作製には DNA ポリメラーゼとして KOD -Plus- Ver.2 (TOYOBO) を使用し 装置は GeneAmp 9700 を用いた なお Table 2 に従い PCR 反応液を調製し Table 3 の反応条件で PCR を行った Bam HI-mwp-ctb-cry j1-cry j2 融合遺伝子は 制限酵素 Bam HI 認識配列と cry j2 認識配列を付加するため Bam HI-mwp-Fw (5 - CGC GGA TCC AAC TTG GCT GTT GTA AAC TTT -3 ) と cry j2-cry j1-rv(5 - CGC CGC AAT AAT GCC CGG GCC GAA CTG GTT G -3 ) のプライマーペアを用い作製した PCR の鋳型として 同じ研究室の韓により作製された phash-mwp-rbs-ctb-cry j1を用いた (8) cry j2-bglⅡ 融合遺伝子の作製は Bgl Ⅱ 認識配列を付加するため cry j2-fw(5 - GGC ATT ATT GCG GCG TAT CAG AAC CCG GCG -3 ) と BglⅡ-cry j2-rv(5 - GGA TCT AGA TTA GAA ATA GCC GTT CGC -3 ) のプライマーペアを使用し 鋳型として鄒が作製した pet28a-ctb-cry j2 を用い作製した (4) -5-

7 Table 2 PCR 反応液組成 10 Buffer Buffer for KOD -Plus- Ver.2 5μl 2 mm dntps 5μl (0.2 mm) 25 mm MgSO4 3μl (1.5 mm) Forward Primer 0.15μl (final 0.3μM) Reverse Primer 0.15μl (final 0.3μM) Template DNA 100 ng KOD -Plus- (1U/μl) 1μl 超純水 to 50μl Table 3 KOD ポリメラーゼにおける PCR 反応条件 Step Temperature Time Cycle number min sec sec アニーリング温度は Forward Primer と Reverse Primer の Tm 値の平均 -5 で設定 2 伸長時間は ターゲット鎖長 1 kbp あたり 1 min で設定した 次に 上で作製した Bam HI-mwp-ctb-cry j1-cry j2 融合遺伝子と cry j2-bgl Ⅱ 融合遺伝子を結合させるため オーバーラップ PCR を行った まず 両遺伝子を鋳型としてアニーリング温度 53.0 でプライマーを入れずに PCR を 8 サイクル行った後 BamHI-mwp-Fw(5 - CGC GGA TCC AAC TTG GCT GTT GTA AAC TTT -3 ) BglⅡ-cry j2-rv(5 - GGA TCT AGA TTA GAA ATA GCC GTT CGC -3 ) のプライマーを加え PCR を 28 サイクル行い BamHI-mwp-ctb-cry j1-cry j2-bglⅡ 融合遺伝子を作製した なお プライマーの配列についての詳細は付録に示している 作製した融合遺伝子はアガロースゲル電気泳動により目的のバンドサイズであるか確認した後 QIAprep PCR Purification Kit (QIAGEN) を用いメーカープロトコルに従い精製した 3.2. phy300- mwp-ctb-cry j1-cry j2 組み換えプラスミドの作製 作製した融合遺伝子 (BamHI-mwp-ctb-cry j1-cry j2-bglⅡ) を大腸菌 (E. coli) と枯草菌 (B. subtilis) の両方で増殖できる phy300plk シャトルベクターに挿入した 融合 -6-

8 遺伝子の両端の Bam HI と Blg II 部位 及びベクターのクローニングサイトにある Bam HI と Blg II 部位を切断するために 融合遺伝子とベクターを別々に Bam HI と BglⅡ 制限酵素の共存下で 30 4h 処理した 処理した融合遺伝子とベクターを 3:1 のモル比で混合し TaKaRa DNA Ligation Kit (Mighty Mix) を使用し 16 12h 反応することによって両者を結合させた 作製した phy300- mwp-ctb-cry j1-cry j2 組み換えプラスミドをカルシウム法によって E. coli JM109 株に導入し 形質転換された大腸菌コロニーを LB 平板培地 ( アンピシリン 50μg/ml) で一晩培養により選択した 3.3. 形質転換の確認及びプラスミドの精製 phy300- mwp-ctb-cry j1-cry j2 組み換えプラスミドが E. coli JM109 株に導入されたことを確認するためコロニー PCR を行った 以下の PCR 反応液組成及び反応条件により PCR を行った Table 4 コロニー PCR 反応液組成 10 Ex Taq Buffer 5μl dntps Mixture 4μl BamHⅠ-mwp-Fw 0.15μl (final 0.3μM) BglⅡ-cry j2-rv 0.15μl (final 0.3μM) Template DNA TaKaRa Ex Taq 0.5μl 超純水 to 50μl 滅菌済みの楊枝でコロニーを少量かきとり PCR チューブに入れた Table 5 コロニー PCR における PCR 反応条件 Step Temperature Time Cycle number min sec sec sec 5 4 プラスミド中の挿入 DNA を PCR によって確認した後 QIAprep Spin Miniprep Kit (QIAGEN) を用いて phy300- mwp-ctb-cry j1-cry j2 組み換えプラスミドをメーカープロトコルに従い精製した 3.4. 組み換えプラスミドの枯草菌 (B. subtilis) への導入 -7-

9 精製した phy300- mwp-ctb-cry j1-cry j2 組み換えプラスミドを エレクトロポレーション法を用い B. subtilis 168trpC2 株及び B. subtilis KA8AX 株に導入した 遺伝子導入装置には Electro Cell Manipulator 600 (BTX) を使用した B. subtilis 168 trpc2 及び B. subtilis KA8AX コンピテントセル (100μl) と phy300-mwp-ctb -cry j1-cry j2 組み換えプラスミド (240 ng) を 間隔 0.2 cmのキュベットに入れ 186 Ω 2.5 kv の条件でエレクトロポレーションを行った コンピテントセルを 2 ml SOC 培地に加え 1 h 160 rpm で振とう培養した後 テトラサイクリン (0.4 mg/ml) を 2μl 加え 30 min 培養し 遠心分離した 上清 100μl と沈殿をよく撹拌し LB 平板培地 ( テトラサイクリン 10μg/ml) に塗布し 37 で一晩静置培養した なお コンピテントセルの調製法は付録に示している phy300- mwp-ctb-cry j1-cry j2 組み換えプラスミドが B. subtilis 168 trpc2 株及び B. subtilis KA8AX 株に導入されたことを確認するため 3.3. の方法を用いてコロニー PCR を行った 3.5. 発現タンパク質の検出クーマシーブリリアントブルー (CBB) 染色によりタンパク質を ウェスタンブロッティングにより組換え融合タンパク質を検出した 枯草菌の培養は LB 液体培地 ( テトラサイクリン10μg/ml) 中で37 ( または27 ) で振とう培養により行った まず CTB-Cry j1-cry j2 融合タンパク質をSDS-ポリアクリルアミドゲル電気泳動法 (SDS-PAGE) によって分離した ゲルにはe-PAGEL (ATTO) を使用し 200 V 17 maで90 min 電気泳動した ウェスタンブロッティングではタンパク質を分離したゲルのタンパク質をPVDF メンブレンに転写した ( 転写条件 :200 V 117 ma 90 min) そして メンブレンに転写した目的タンパク質に 一次抗体であるヤギ血清由来のAnti-cholera toxin B subunit ( フナコシ ) の5000 倍希釈液を反応させた そして この一次抗体を抗原とする二次抗体である ロバ血清由来のAnti-rabbit Ig horseradish peroxidase linked (Amersham Bioscienses) の25000 倍希釈液を反応させた 抗体との反応にはSNAP i.d. タンパク質検出装置 ( ミリポア ) を使用した その後 二次抗体に結合している酵素 (HRP) と反応発光試薬 (ECL Western blotting analysis system(ge Healthcare)) をメンブレン上で反応させ その発光をフィルム (Hyperfilm TM ECL High performance chemiluminescence film: GE Healthcare) に感光させて タンパク質を検出した -8-

10 4. 結果 :Results 4.1. BamHⅠ-mwp-ctb-cry j1-cry j2-bglⅡ 融合遺伝子の作製スギ花粉タンパク質 T 細胞エピトープを含む融合抗原タンパク質を枯草菌 (B. subtilis) 内で発現させるための融合タンパク質遺伝子を作製した まず既に作製されている phash-mwp-rbs-ctb-cry j1プラスミドと pet28a-ctb-cry j2 プラスミドを鋳型として PCR 反応を行い それぞれ BamHI-mwp-ctb-cry j1-cry j2 cry j2-bglⅡ を作製した 次にこれらの PCR 産物を結合させるため 両者を鋳型にオーバーラップ PCR を行い BamHI-mwp-ctb-cry j1-cry j2-bglⅡ 融合遺伝子を作製した Fig.1 各融合遺伝子を鋳型とする PCR 産物のアガロースゲル電気泳動 M:200bp Marker 1: BamHI-mwp-ctb-cry j1-cry j2 (908bp) 2: cry j2-bglⅡ (279bp) 3: BamHI-mwp-ctb-cry j1-cry j2-bglⅡ(1187bp) Fig.1 が示すように レーン1に BamHI-mwp-ctb-cry j1-cry j2 (908bp) レーン 2に cry j2-bglⅡ (279bp) 各融合遺伝子の大きさに相当する位置にバンドが確認できた これらを鋳型としてオーバーラップ PCR を行い レーン3の BamHI-mwp-ctb-cry j1-cry j2-bglⅡ(1187bp) に相当する位置にバンドを確認した -9-

11 4.2. phy300- mwp-ctb-cry j1-cry j2 組み換えプラスミドの作製作製したBamHI-mwp-ctb-cry j1-cry j2-bglⅡ 融合遺伝子と 大腸菌と枯草菌のシャトルベクターである phy300plk プラスミドを BamHⅠと BglⅡで消化し 両者を DNA ライゲースにより結合し 大腸菌に導入した Fig2. phy300- mwp-ctb-cry j1-cry j2 で形質転換された大腸菌のコロニー PCR による PCR 産物のアガロースゲル電気泳動 M: 200bp Marker 4~6: 各コロニーの PCR 産物 phy300- mwp-ctb-cry j1-cry j2 組み換えプラスミドが大腸菌 (E.coli JM109 株 ) に導入されたことを確認するため プライマーとして BamHⅠ-mwp-Fw BglⅡ -cry j2-rv を用いてコロニー PCR を行った Fig.2 が示すように レーン 4~6 に BamHI-mwp -ctb-cry j1-cry j2-bglⅡ(1187bp) に相当するバンドが確認できた よって phy300 への BamHI-mwp-ctb-cry j1-cry j2-bglⅡ 融合遺伝子の挿入が認められた -10-

12 4.3. 組み換えプラスミドの枯草菌 (B. subtilis) への導入得られた phy300- mwp-ctb-cry j1-cry j2 を用いて枯草菌 (B. subtilis 168 trpc2 株 ) 及び プロテアーゼ欠損枯草菌株 (B. subtilis KA8AX 株 ) を形質転換した 形質転換には エレクトロポレーション法を用いて行った Fig.3 phy300- mwp-ctb-cry j1-cry j2 で形質転換された枯草菌のコロニー PCR による PCR 産物のアガロースゲル電気泳動 M: 200bp Marker 1~3: 各コロニーの PCR 産物 (B. subtilis KA8AX 株 ) 3 4: 各コロニーの PCR 産物 (B. subtilis 168 trpc2 株 ) BamHI-mwp-ctb-cry j1-cry j2-bglⅡ 組み換えプラスミドが枯草菌 (B. subtilis 168 trpc2 株 B. subtilis KA8AX 株 ) に導入されたかを確認するため プライマーとして BamHⅠ-mwp-Fw BglⅡ-cry j2-rv を用いてコロニー PCR を行った その結果 Fig.3 に示すように それぞれの菌株で BamHI-mwp -ctb-cry j1-cry j2-bglⅡ(1187bp) に相当するバンドが確認できた よって BamHI-mwp-ctb-cry j1-cry j2-bglⅡ 組み換えプラスミドが枯草菌 (B. subtilis 168 trpc2 株 ) 及び プロテアーゼ欠損枯草菌株 (B. subtilis KA8AX 株 ) に導入されたことが分かった -11-

13 4.4. 発現タンパク質の検出 phy300- mwp-ctb-cry j1-cry j2 で形質転換した枯草菌 (B. subtilis 168 trpc2 株 ) 及び プロテアーゼ欠損枯草菌株 (B. subtilis KA8AX 株 ) を 37 と 27 で培養し CTB-Cry j1-cry j2 融合タンパク質が発現されたかどうかを SDS-ポリアクリルアミドゲル電気泳動と ウェスタンブロッティング法により確認した ウェスタンブロッティングの一次抗体には抗コレラ毒素 B サブユニット抗体を用いた なお CBB 染色によるタンパク質の検出結果は付録に記載した 培養温度 27 kda B.168 KA8AX 培養時間 (A) CTB-Cry j1-cry j2 (B) (32.5 kda) (C) CTB-Cry j1-cry j2 (32.5 kda) (D) 12h 16h 24h 12h 16h 24h 12h 16h 24h 12h 16h 24h Fig.4 (a). 培養温度 27 で発現された CTB-Cry j1-cry j2 融合タンパク質のウェスタンブロッティング (A) B168 株 phy300 (B) B168 株 phy300- mwp-ctb-cry j1-cry j2 (C) KA8AX 株 phy300 (D) KA8AX 株 phy300- mwp-ctb-cry j1-cry j2 Fig.4(a) では phy300- mwp-ctb-cry j1-cry j2 で形質転換した枯草菌 (168 trpc2 株 KA8AX 株 ) とともに 対照として mwp-ctb-cry j1-cry j2 遺伝子と持たない phy300 で形質転換した枯草菌を同じ条件で培養した CTB-Cry j1-cry j2 融合タンパク質の予想される分子量は 32.5 kda であるが 対照の B168 trpc 株 (A) 及び対照の KA8AX 株 (C) では 32.5 kda のバンドは見えなかった しかし 融合タンパク質遺伝子を持つ phy300 で形質転換した B168 trpc 株 (B) では 培養時間 時間にわずかに融合タンパク質と思われるバンドが見られた このバンドは融合タンパク質遺伝子を持つ phy300 で形質転換した KA8AX 株 (D) の -12-

14 16-24 時間培養では明瞭に認めれられた kda 付近に濃いバンドが確認できたが このバンドは融合タンパク質遺伝子を挿入していない phy300 を導入した枯草菌でも確認できるため 用いた抗体の非特異的結合であると考えられた kda B.168 KA8AX 培養温度 CTB-Cry j1 -Cry j 培養時間 8h 24h 8h 24h Fig.4 (b). 培養温度 37 で発現された CTB-Cry j1-cry j2 融合タンパク質のウェスタンブロッティング Fig.4(b) は培養温度 37 における B168 株と KA8AX 株での CTB-Cry j1-cry j2 融合タンパク質のウェスタンブロッティングである B168 株は 培養 8 時間ではわずかに 32.5 kda の融合タンパク質のバンドを確認できたが 培養 24 時間ではバンドは確認できなくなった それに対し KA8AX 株では B168 株に比べて濃いバンドが見られ 培養 24 時間でも培養 8 時間の時とバンドの濃さに変化がなかった -13-

15 5. 考察 :Discussion 枯草菌 (B168 trpc2) 及びプロテアーゼ欠損枯草菌 (KA8AX) へスギ花粉症抗原を含む融合タンパク質遺伝子を持つプラスミドを導入した 培養によって融合タンパク質の発現を確認し プロテアーゼの影響を評価した 培養温度 37 では B168 株によって発現された組換えタンパク質は培養 8 時間目にわずかに認められたが 培養 24 時間ではまったく確認できなかった プロテアーゼによって分解されたものと考えられる それに対して プロテアーゼを欠損した KA8AX 株では 発現タンパク質の量が B168 株に比べてはるかに多く 培養 24 時間でも培養 8 時間の時とその量はほとんど変わらず 発現したタンパク質が安定であることが明らかとなった 培養温度 27 でもほぼ同じ傾向であった 培養温度 27 及び 37 での組換えタンパク質の発現量やその安定性の比較は今後検討する必要がある また 付録に示した発現タンパク質のクーマシーブリリアントブルー染色では 32 kda 付近に菌体タンパク質の濃いバンドが存在するため ほぼ同じ分子量の組換えタンパク質を染色で検出することは困難であった そのため 発現された組換えタンパク質の量を定量することができなかった 今後の課題である 枯草菌内で抗原タンパク質を発現させワクチンとして使用するためには 発現したタンパク質の量とその安定性は重要である プロテアーゼ欠損枯草菌株を用いることで発現タンパク質の発現量の増大及び安定化に非常に寄与できるといえる -14-

16 6. 謝辞 :Acknowledgement プロテアーゼ欠損枯草菌株 (Bacillus subtilis KA8AX) を分与していただいた信州大学の関口順一教授 本研究を行うにあたり ご指導頂きました高知工科大学の榎本恵一教授に心から感謝申し上げます 7. 参考文献 :References 1) Ohashi Y, Ohshima H, Tsuge K, Itaya M (2003) Far different levels of gene expression provided by an oriented cloning system in Bacillus subtilis and Escherichia coli. FEMS Microbiol. Lett.: 221, ) Ferreira LC, Ferreira RC, Schumann W (2005) Bacillus subtilis as a tool for vaccine development: from antigen factories to delivery vectors. An. Acad. Bras. Ciênc.: 77, ) Sone T, Morikubo K, Miyahara M, Komiyama N, Shimizu K, Tsunoo H, and Kino K (1998) T cell epitopes in Japanese cedar (Cryptomeria japonica) pollen allergens: choice of major T cell epitopes in cry j 1 and cry j 2 toward design of the peptidebased immunotherapeutics for the management of Japanese cedar pollinosis. J. Immunol.: 161, ) 鄒艶霜 (2006) Recombinantly engineered proteins containing cholera toxin B subunit as a functional and structural element. 高知工科大学博士学位論文 5) Kim T-G, Huy N-X, Kim M-Y, Jeong D-K, Jang Y-S, Yang M-S, Langridge WHR and Lee JY (2008) Immunogenicity of a cholera toxin B subunit porphyromonas gingivalis fimbrial antigen fusion protein expressed in E.coli. Mol. Biotechnol.: 41, ) Wu X-C, Lee W, Tran L and Wong S-L (1991) Engineering a Bacillus subtilis expression-secretion system with a strain deficient in six extracellular proteases. J. Bacteriol.:

17 7) Kodama T, Endo K, Sawada K, Ara K, Ozaki K, Kakeshita H, Yamane K and Sekiguchi J (2007) Bacillus subtilis AprX involved in degradation of a heterologous protein during the late stationary growth phase. J. Biosci. Biotechnol: ) 韓梅梅 (2009) Expression of recombinant T-cell epitopes in the cell and on the surface of Bacillus subtilis. 高知工科大学博士学位論文 -16-

18 8. 付録 :Appendix CBB 染色によるタンパク質確認 培養温度 :37 B.168 kda KA8AX kda 培養時間 培養時間 培養温度 :27 B.168 kda KA8AX kda 培養時間 培養時間 -17-

19 phy300plk ベクター DNA の制限酵素サイト コンピテントセルの調製法 枯草菌 (B. subtilis 168 trpc2) 及びプロテアーゼ欠損枯草菌株 (B. subtilis KA8AX 株 ) を LB 液体培地 2ml に植菌し 37 で 12 時間振とう培養した さらに この前培養液 2ml を LB 液体培地 200ml に加え 波長 600nm での濁度 1.5~2.0 になるまで約 6 時間振とう培養した 培養液を 250ml の冷却した遠心管に移し 4000rpm 10min 4 で遠心分離した 上清を捨て冷却したオートクレーブ済み超純水 200ml で沈殿を懸濁後 同じ遠心管を利用し 4000rpm 10min 4 で遠心分離した 上清を捨て再びオートクレーブ済み超純水 100ml で懸濁後同様に遠心分離した 上清を捨てオートクレーブ済み超純水 100ml で懸濁後 50ml 遠心管 2 本に分注し 4000rpm 10min 4 で遠心分離した 上清を捨てそれぞれに 30%PEG( ポリエチレングリコール )1ml を入れ懸濁し 1.5ml チューブに 100μl ずつ分注し ドライアイス入りエタノールに入れ凍結させた その後 -80 で保存した -18-

20 Bam HI-mwp-ctb-cry j1-cry j2 融合遺伝子作製に用いたプライマー 下線部はそれぞれ mwp と cry j1 の配列に相当する部分を表す 赤字部分は制限酵素部位 緑字は cry j2 を表している Primer1: BamHⅠ-mwp-Fw 5 - CGC GGA TCC AAC TTG GCT GTT GTA AAC TTT -3 (30bp) Primer2: cry j2-cryj1-rv 5 - CGC CGC AAT AAT GCC CGG GCC GAA CTG GTT G -3 (31bp) cry j2-bglⅡ 融合遺伝子作製に用いたプライマー 下線部は cry j2 の配列に相当する部分を表す 赤字部分は制限酵素部位 青字部分はストップコドンを表している Primer3: cry j2-fw 5 - GGC ATT ATT GCG GCG TAT CAG AAC CCG GCG -3 (30bp) Primer4: BglII-cry j2-rv 5 - GGA TCT AGA TTA GAA ATA GCC GTT CGC -3 (27bp) mwp プロモーターの塩基配列 aac ttg gct gtt gta aac ttt gaa aat gca tta gga aat taa cct aat tca agc aag att atg agg ttt tga acc aaa ttg gaa aaa ggt tca gtc gtg aca gcc cgc cat atg gcc cct ata ata cgc att gtg gcg gat gtc act tcg tac ata atg gac agg tga ata acg aac cac gaa aaa aac ttt aaa ttt ttt tcg aag gcg ccg caa ctt ttg att cgc tca ggc gtt taa tag gat gtc aca cga aaa acg ggg aat tgt gta aaa aag att cac gaa ttc tag cag ttg tgt tac act agt gat tgt tgc att tta cac aat act gaa tat act aga gat ttt taa cac aaa aag cga ggc ttt cct gcg aaa gga gga aat tga tta tg (381bp including HindⅢ, EcoRⅠ restriction site 下線部はリボソーム結合部位 赤字は開始コドンをそれぞれ示している ) ctb の塩基配列 aca cct caa aat att act gat ttg tgt gca gaa tac cac aac aca caa ata cat acg cta aat gat aag ata ttt tcg tat aca gaa tct cta gct gga aaa aga gag atg gct atc att act ttt aag aat ggt gca act ttt caa gta gaa gta cca ggt agt caa cat ata gat tca caa aaa aaa gcg att gaa agg atg aag gat acc ctg agg att gca tat ctt act gaa gct aaa gtc gaa aag tta tgt gta tgg -19-

21 aat aat aaa acg cct cat gcg att gcc gca att agt atg gca aat (103 amino acid, 309 bp) cry j1 の塩基配列 cag aac cgt atg aaa ctg gcg gat tgc gcg gtg ggc ttc ggc agc aaa atg ccg atg tat att gcg ggc tat aaa acg ttc gat ggc cgt ccg tgc gtg ttc att aaa cgt gtg agc aac gtg att att cat ggc ctg cat ctg tat ggc agc atg aaa gtg acg gtg gcg ttc aac cag ttc ggc ccg (63 amino acid, 189bp) cry j2 の塩基配列 ggc att att gcg gcg tat cag aac ccg gcg agc tgg aaa cag ttc gcg aaa ctg acg ggc ttc acg ctg atg ggc att gat att ttc gcg agc aaa aac ttc cat ctg cag aaa aac acg att ggc acg ggc agc cgt gcg gaa gtg agc tat gtg cat gtg aac ggc gcg aaa ttc tgc aaa gat att aaa ctg agc gat att agc ctg aaa ctg acg agc ggc aaa att gcg agc tgc ctg aac gat aac gcg aac ggc tat ttc (89 amino acid, 267bp) 培地 LB 培地 Tryptone 10g Bacto yeast extract 5 g NaCl 5g 脱イオン水 1L ph 7.2 SOC 培地 Tryptone 20 g Bacto yeast extract 5 g NaCl 0.5 g 250mM KCl 10.0ml 2M MgCl2 10.0ml 1M Glucose 20.0ml 脱イオン水 1L ph

2

2 2 3 4 TTT TCT TAT TGT TTC TCC TAC TGC TTA TCA TAA TGA TTG TCG TAG TGG CTT CCT CAT CGT CTC CCC CAC CGC CTA CCA CAA CGA CTG CCG CAG CGG ATT ACT AAT AGT ATC ACC AAC AGC ATA ACA AAA AGA ATG ACG AAG AGG GTT

More information

2

2 1 2 / SCAR Sequence characterized amplified region DNA DNA 34 ( GSW100 SP2-002 SR2-015 SR3-004 11-22-1 11-22-2 11-24-3 11-24-4 11-191-1 12-217-1 12-249-1 14-218-21 04/05-29 04/05-66 04/05-73 12-202-2 (LP)

More information

syoku10_10.indd

syoku10_10.indd 690 64 10 2010 I Pythium Pythium Pythium 1 2 Qualitative and Quantitative Detection of Plant Pathogens. Pythium By Koji KAGEYAMA PCR Pythium Pythium 2006 II PCR PCRPolymerase Chain ReactionDNA PCR 2005PCR

More information

LA PCR™i n vitro Cloning Kit

LA PCR™i n vitro Cloning Kit 研究用 LA PCR in vitro Cloning Kit 説明書 v201201da 本キットは Cassette および Cassette Primer を使用することにより cdna やゲノム上の未知領域を特異的に増幅させる従来の PCR in vitro Cloning Kit に 長鎖 DNA を効率良く増幅する LA PCR Technology を応用したシステムです これにより

More information

BKL Kit (Blunting Kination Ligation Kit)

BKL Kit (Blunting Kination Ligation Kit) 製品コード 6126/6127 BKL Kit (Blunting Kination Ligation Kit) 説明書 PCR 産物を平滑末端ベクターにクローニングする場合 使用するポリメラーゼ酵素の種類により 3' 末端に余分に付加された塩基を除去し さらに 5' 末端をリン酸化する必要があります 本製品は これらの一連の反応を簡便に短時間に行うためのキットです PCR 産物の末端平滑化とリン酸化を同時に行うことにより

More information

(別添)安全性未審査の組換えDNA技術応用食品の検査方法_NIHS 最終版_YF

(別添)安全性未審査の組換えDNA技術応用食品の検査方法_NIHS 最終版_YF コムギ (MON71200 MON71100/71300 MON71700 MON71800) の検査方法 コムギ穀粒又は粉砕加工食品を検査対象として 1 検体から 2 併行で DNA を抽出精製する 得られた各 DNA 試料液を用いて 2 ウェル併行で定性リアルタイム PCR を実施する 1. DNA 抽出精製 1.1. 試料の洗浄 粉砕 ( 穀粒の場合 ) コムギ穀粒を試料 ( 重量 ) あたり

More information

無細胞タンパク質合成試薬キット Transdirect insect cell

無細胞タンパク質合成試薬キット Transdirect insect cell 発現プラスミドの構築 1. インサート DNA の調製開始コドンは出来るだけ 5'UTR に近い位置に挿入して下さい 経験的に ptd1 の EcoRV/KpnI サイトへのライゲーション効率が最も高いことを確認しています 本プロトコルに従うと インサートサイズにも依りますが 90% 以上のコロニーがインサートの挿入されたクローンとして得られます 可能な限り EcoRV/KpnI サイトへ挿入されるお奨めします

More information

クルマエビホワイトスポット病の防除対策 Table 1. List of WSSV confirmed naturally and/or experimentally infected host species クルマエビホワイトスポット病の防除対策 Fig. 8. Disease control in shrimp hatchery. に 組換え大腸菌で発現した WSSV 構造タンパク質 第

More information

Microsoft Word -

Microsoft Word - 平成 20 年度修士卒業論文 Pseudoalteromonas のヴィオラセイン合成酵素遺伝子 vioa のクローニングと発現 Cloning and expression of the violacein-synthesizing enzyme gene vioa from Pseudoalteromonas. 高知工科大学大学院 工学研究科基盤工学専攻 1115002 阿波連毅成 2009 年

More information

TaKaRa PCR Human Papillomavirus Typing Set

TaKaRa PCR Human Papillomavirus Typing Set 研究用 TaKaRa PCR Human Papillomavirus Typing Set 説明書 v201703da 本製品は さまざまなタイプの Human Papillomavirus(HPV) において塩基配列の相同性の高い領域に設定したプライマーを consensus primer として用いることにより HPV の E6 と E7 を含む領域 (228 ~ 268 bp) を共通に PCR

More information

Chromatin Immunoprecipitation (ChIP)

Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) 山根美穂 020617 調整する試薬類 11 % Formaldehyde Solution Formaldehyde* 11 % (v/v) 100mM EDTA-Na (ph 8.0) EGTA-Na 0.5mM 50mM *use 16 % Formaldehyde (Methanol free) (PSI/ コスモバイオ

More information

PowerPoint プレゼンテーション

PowerPoint プレゼンテーション 衛生微生物技術協議会第 39 回研究会 滋賀県大津市 2018 年 7 月 5 日 ( 木 ) 国立感染症研究所ウイルス第 1 部 イム チャンガン 世話人 林 昌宏 アルボウイルスレファレンスセンター 担当ブロック 機関 担当部 課 世話人 国立感染症研究所 ウイルス第 1 部第 2 室林昌宏 北海道 東北ブロック 宮城県保健環境センター 微生物部 関東 甲信越ブロック 東京都健康安全研究センター

More information

PrimeSTAR® Mutagenesis Basal Kit

PrimeSTAR® Mutagenesis Basal Kit PrimeSTAR Mutagenesis Basal Kit 説明書 v201107da 目次 I. キットの内容...3 II. 保存...3 III. 本システムの原理...3 IV. プライマー設計について...5 V. 操作...8 VI. 実験例...10 VII. トラブルシューティング...13 VIII. 関連製品...13 IX. 注意...13 2 PrimeSTAR Mutagenesis

More information

■リアルタイムPCR実践編

■リアルタイムPCR実践編 リアルタイム PCR 実践編 - SYBR Green I によるリアルタイム RT-PCR - 1. プライマー設計 (1)Perfect Real Time サポートシステムを利用し 設計済みのものを購入する ヒト マウス ラットの RefSeq 配列の大部分については Perfect Real Time サポートシステムが利用できます 目的の遺伝子を検索して購入してください (2) カスタム設計サービスを利用する

More information

Tox

Tox Gel Shift Assay Systems No. TB110J 2000 9 E3050 E3300 I. 2 II. 2 III. A. 3 B. 3 IV. A. 4 B. 4 V. A. 5 B. HeLa Nuclear Extract DNA 6 C. AP2 Extract DNA 7 D. DNA- 7 VI. VII. VIII. IX. 8 8 9 13 X. A. 14 B.

More information

Mighty TA-cloning Kit/Mighty TA-cloning Kit for PrimeSTAR

Mighty TA-cloning Kit/Mighty TA-cloning Kit for PrimeSTAR 製品コード 6028 製品コード 6029 Mighty TA-cloning Kit ( 製品コード 6028) Mighty TA-cloning Kit for PrimeSTAR ( 製品コード 6029) 説明書 Taq DNA ポリメラーゼなどをベースとする PCR 酵素を用いて得られた増幅産物のほとんどは その 3 末端にデオキシリボアデノシン (da) が一塩基付加されています これらの

More information

プロトコール集 ( 研究用試薬 ) < 目次 > 免疫組織染色手順 ( 前処理なし ) p2 免疫組織染色手順 ( マイクロウェーブ前処理 ) p3 免疫組織染色手順 ( オートクレーブ前処理 ) p4 免疫組織染色手順 ( トリプシン前処理 ) p5 免疫組織染色手順 ( ギ酸処理 ) p6 免疫

プロトコール集 ( 研究用試薬 ) < 目次 > 免疫組織染色手順 ( 前処理なし ) p2 免疫組織染色手順 ( マイクロウェーブ前処理 ) p3 免疫組織染色手順 ( オートクレーブ前処理 ) p4 免疫組織染色手順 ( トリプシン前処理 ) p5 免疫組織染色手順 ( ギ酸処理 ) p6 免疫 < 目次 > 免疫組織染色手順 ( 前処理なし ) p2 免疫組織染色手順 ( マイクロウェーブ前処理 ) p3 免疫組織染色手順 ( オートクレーブ前処理 ) p4 免疫組織染色手順 ( トリプシン前処理 ) p5 免疫組織染色手順 ( ギ酸処理 ) p6 免疫組織染色手順 ( ギ酸処理後 マイクロウェーブまたはオートクレーブ処理 )p7 抗原ペプチドによる抗体吸収試験 p8 ウエスタン ブロッティング

More information

A, B 2 B 5 A C A ADP A G ADP ADP G camp B GM A B CTB Tochikubo et al., 1998 CTB CTB Dertzbaugh & Elson, 1993a; Yu et al., 1994; Shi et al., 1995 CTB C

A, B 2 B 5 A C A ADP A G ADP ADP G camp B GM A B CTB Tochikubo et al., 1998 CTB CTB Dertzbaugh & Elson, 1993a; Yu et al., 1994; Shi et al., 1995 CTB C 2004 Analysis of the expression of cholera toxin B-subunit gene 1065010 2004 8 26 1 A, B 2 B 5 A C A ADP A G ADP ADP G camp B GM A B CTB Tochikubo et al., 1998 CTB CTB Dertzbaugh & Elson, 1993a; Yu et

More information

2

2 栽培用パパイヤ種子における未承認遺伝子組換えパパイヤの検査法 本検査法はパパイヤの種子を対象とする GM quicker2(nippon GENE 社 ) を用い 種子粉砕物 1 点につき1 点又は2 点の DNA を抽出 精製する 得られた DNA 試料液を 内在性遺伝子検出用プライマー対 プローブ及び組換え遺伝子検出用プライマー対 プローブを用いたリアルタイム PCR に供し 内在性遺伝子と組換え体由来遺伝子の検出の可否により

More information

cDNA cloning by PCR

cDNA cloning by PCR cdna cloning/subcloning by PCR 1. 概要 2014. 4 ver.1 by A. Goto & K. Takeda 一般的に 細胞または組織由来の RNA から作製した cdna(cdna pool) から 特定の cdna をベクターに組み込む操作を cdna cloning と呼ぶ その際 制限酵素認識配列を付与したオリゴ DNA primer を用いた PCR

More information

表紙/151708H

表紙/151708H ! " # $ % & ' ( ) ! #! $! " % & " ' " # * + $ %, &! & ', '! " # $ (! " # $ )! " # $ !!$ "! " # $ #! " # $ $! " # $ %! " # $ ! " # " 1 $ 2 " $ % 3 & % ' ( 4 ( ) * ' + 5, -. 6 / 0 0 +, 1 -. 2 3 /! /!%!!

More information

2

2 種子における未承認遺伝子組換えパパイヤ (PRSV-YK) の検査法について 本検査法ではパパイヤ種子を検査対象とし DNA 抽出精製は 以下の GM quicker2( ニッポン ジーン社 ) を用いる 1 検体から2 反復で DNA を抽出し 各抽出 DNA 試料液を用いてリアルタイム PCR を用いた定性 PCR 法を実施する Ⅰ. 試料の準備 検査に用いるパパイヤ種子は 破砕粒や他の混入物を取り除いた完全粒とし

More information

Multiplex PCR Assay Kit Ver. 2

Multiplex PCR Assay Kit Ver. 2 研究用 Multiplex PCR Assay Kit Ver. 2 説明書 v201510da マルチプレックス PCR は 一つの PCR 反応系に複数のプライマー対を同時に使用することで 複数の遺伝子領域を同時に増幅する方法です マルチプレックス PCR を行うことで 試薬や機材の節約による経済性 同時検出による迅速性でのメリットに加え 貴重なサンプルの有効利用も可能です 本キットは高速にプライミングする酵素とプライマーのアニーリングの特異性を極限まで高めた反応液組成とを組み合わせたマルチプレックス

More information

東京都健康安全研究センター研究年報

東京都健康安全研究センター研究年報 東京健安研セ年報 Ann. Rep. Tokyo Metr. Inst.P.H., 57, 77-81, 2006 ペット動物における病原大腸菌の保有実態調査 畠山 薫 *, 奥野ルミ *, 小西典子 ** **, 下島優香子尾畑浩魅 **, 遠藤美代子 * *, 柳川義勢 Research of Diarrheagenic Escherichia coli in Pet animals Kaoru

More information

< F2D82CD82B682DF82C E E6A7464>

< F2D82CD82B682DF82C E E6A7464> I 50 ml 1.5 ml SS PCR TaKaRa EX Taq Hot Start Version PCR PCR 27 50 ml SS 1,500 rpm400 g1 SS 50 ml 5 ml 3 ml 28 SS 1 25 24 1,000 rpm180 g3 29 1 ml 1.5 ml 5,000rpm2,430 g5 SS D.W. 100 µl 100 5 10,000 rpm5

More information

手順 ) 1) プライマーの設計 発注変異導入部位がプライマーのほぼ中央になるようにする 可能であれば 制限酵素サイトができるようにすると確認が容易になる プライマーは 25-45mer で TM 値が 78 以上になるようにする Tm= (%GC)-675/N-%mismatch

手順 ) 1) プライマーの設計 発注変異導入部位がプライマーのほぼ中央になるようにする 可能であれば 制限酵素サイトができるようにすると確認が容易になる プライマーは 25-45mer で TM 値が 78 以上になるようにする Tm= (%GC)-675/N-%mismatch Mutagenesis 目的 ) 既存の遺伝子に PCR を利用して変異を導入する 1 点変異導入方法 ) Quik Change Site-Directed Mutagenesis Kit(Stratagene) のプロトコールを流用 http://www.stratagene.com/products/showproduct.aspx?pid=131 Kit 中では DNA polymerase

More information

1. 腸管出血性大腸菌 (EHEC) の系統解析 上村健人 1. はじめに近年 腸管出血性大腸菌 (EHEC) による食中毒事件が度々発生しており EHEC による食中毒はその症状の重篤さから大きな社会問題となっている EHEC による食中毒の主要な汚染源の一つとして指摘されているのが牛の糞便である

1. 腸管出血性大腸菌 (EHEC) の系統解析 上村健人 1. はじめに近年 腸管出血性大腸菌 (EHEC) による食中毒事件が度々発生しており EHEC による食中毒はその症状の重篤さから大きな社会問題となっている EHEC による食中毒の主要な汚染源の一つとして指摘されているのが牛の糞便である 1. 腸管出血性大腸菌 (EHEC) の系統解析 上村健人 1. はじめに近年 腸管出血性大腸菌 (EHEC) による食中毒事件が度々発生しており EHEC による食中毒はその症状の重篤さから大きな社会問題となっている EHEC による食中毒の主要な汚染源の一つとして指摘されているのが牛の糞便である これまでの報告によれば EHEC を糞便中に保有する牛は 0.6~11.9% といわれており 牛枝肉汚染の機会となり得ると畜場における解体処理が公衆衛生上重要視されている

More information

DNA 抽出条件かき取った花粉 1~3 粒程度を 3 μl の抽出液 (10 mm Tris/HCl [ph8.0] 10 mm EDTA 0.01% SDS 0.2 mg/ml Proteinase K) に懸濁し 37 C 60 min そして 95 C 10 min の処理を行うことで DNA

DNA 抽出条件かき取った花粉 1~3 粒程度を 3 μl の抽出液 (10 mm Tris/HCl [ph8.0] 10 mm EDTA 0.01% SDS 0.2 mg/ml Proteinase K) に懸濁し 37 C 60 min そして 95 C 10 min の処理を行うことで DNA 組換えイネ花粉の飛散試験 交雑試験 1. 飛散試験 目的 隔離圃場内の試験区で栽培している組換えイネ S-C 系統 及び AS-D 系統の開花時における花粉の飛散状況を確認するため 方法 (1) H23 年度は 7 月末からの低温の影響を受け例年の開花時期よりも遅れ 試験に用いた組換えイネの開花が最初に確認されたのは S-C 系統 及び AS-D 系統ともに 8 月 13 日であった そこで予め準備しておいた花粉トラップ

More information

Multiplex PCR Assay Kit

Multiplex PCR Assay Kit 研究用 Multiplex PCR Assay Kit 説明書 v201510da マルチプレックス PCR は 一つの PCR 反応系に複数のプライマー対を同時に使用することで 複数の遺伝子領域を同時に増幅する方法です マルチプレックス PCR を行うことで 試薬や機材の節約による経済性 同時検出による迅速性でのメリットに加え 貴重なサンプルの有効利用も可能です しかし マルチプレックス PCR

More information

問 1. 次の文章を読み 以下の設問 (1)~(3) に答えよ タンパク質 X の N 末端にヒスチジンタグを付加し これを大腸菌で大量発現して精製する実験を計画している (1) その準備として 遺伝子 x を PCR で増幅し T7 プロモーターを持つベクター (pet28a) の NdeI と

問 1. 次の文章を読み 以下の設問 (1)~(3) に答えよ タンパク質 X の N 末端にヒスチジンタグを付加し これを大腸菌で大量発現して精製する実験を計画している (1) その準備として 遺伝子 x を PCR で増幅し T7 プロモーターを持つベクター (pet28a) の NdeI と 2016 年 7 月 17 日実施 2017 年度 ( 夏季 ) 理学研究科博士課程前期課程生命理学専攻入学試験問題 ( 生命理学 ) [ 注意 ] 合図があるまでこのページをめくらないこと すべての解答用紙に受験番号を記入すること 解答はすべて解答用紙に記入し 問題 1 問につき解答用紙 1 枚を使用すること 解答用紙の裏面を使用してもよいが その場合には裏面にも解答が記入されていることを 表面の下部に

More information

製品コード 3372 研究用 pcold GST DNA 説明書 v201909da

製品コード 3372 研究用 pcold GST DNA 説明書 v201909da 研究用 pcold GST DNA 説明書 v201909da タンパク質の構造や機能の解明はポストゲノムの重要な研究対象であり 効率の良いタンパク質生産システムはポストゲノム解析に必須の基盤技術です 組換えタンパク質の生産には大腸菌を宿主とする発現系が広く利用されています しかしながら 大腸菌発現系は扱いやすく低コストである反面 遺伝子によっては発現できない あるいは発現タンパク質が不溶化するという問題が起こることがあります

More information

Human Cell-Free Protein Expression System

Human Cell-Free Protein Expression System 研究用 Human Cell-Free Protein Expression System 説明書 v201807da Human Cell-Free Protein Expression System は ヒト細胞株由来の細胞抽出液を利用した無細胞タンパク質合成システムです 本システムの Cell Lysate には in vitro でのタンパク質合成反応に必要な各種因子 ( リボソーム 翻訳開始

More information

PowerPoint プレゼンテーション

PowerPoint プレゼンテーション 2013 年 11 月 20 日 ( 水 ) バイオ情報解析演習 ウェブツールを活用した生物情報解析 (4) 遺伝子のクローニング設計 有用物質生産菌を合理的に作ろう! 設計 試作 ベンチテスト 完成 プラスミド 効率的な代謝経路を設計する 文献調査代謝パスウェイの探索代謝シミュレーション 実際に微生物に組み込む データベースから有用遺伝子を探索する遺伝子組換え技術 培養をして問題点を突き止める 培養代謝物量

More information

Expression Vector pLEAD DNA, pre-digested マニュアル (第4版)

Expression Vector pLEAD DNA, pre-digested マニュアル (第4版) 組換えタンパク質発現用ベクター Expression Vector plead DNA, pre-digested マニュアル ( 第 4 版 ) Code No. 315-06801 Code No. 312-06811 NIPPON GENE CO., LTD. 目次 Ⅰ 製品説明 2 Expression Vector plead DNA の発現システムについて 2 Expression Vector

More information

DNA Blunting Kit

DNA Blunting Kit 研究用 DNA Blunting Kit 説明書 v201508da DNA Blunting Kit は T4 DNA Polymerase の 5' 3' polymerase 活性と 3' 5' exonuclease 活性を利用して DNA の末端を平滑化することにより 突出末端の DNA でも簡単に平滑末端のベクターにライゲーションできるシステムです DNA が 5' 突出末端の場合は 5'

More information

TaKaRa PCR Human Papillomavirus Detection Set

TaKaRa PCR Human Papillomavirus Detection Set 研究用 TaKaRa PCR Human Papillomavirus Detection Set 説明書 v201703da 本製品は子宮頸癌において最も高頻度に検出される Human Papillomavirus(HPV)16 18 および 33 型をそれぞれ特異的に増幅し 検出するセットです HPV16 18 および 33 型の E6 を含む領域 (140 bp ただし HPV33 型は 141

More information

Microsoft Word - FMB_Text(PCR) _ver3.doc

Microsoft Word - FMB_Text(PCR) _ver3.doc 2.PCR 法による DNA の増幅 現代の分子生物学において その進歩に最も貢献した実験法の1つが PCR(Polymerase chain reaction) 法である PCR 法は極めて微量の DNA サンプルから特定の DNA 断片を短時間に大量に増幅することができる方法であり 多大な時間と労力を要した遺伝子クローニングを過去のものとしてしまった また その操作の簡便さから 現在では基礎研究のみならず臨床遺伝子診断から食品衛生検査

More information

Perl + α. : DNA, mrna,,

Perl + α. : DNA, mrna,, 2009 Perl + α. : DNA, mrna,, DNA .. DNA A C G T DNA 2 A-T, C-G DNA NH 2 NH 2 O - O O N P O - O CH 2 O N N O - O P O CH 2 O N O - O O P O NH 2 O - O - N CH 2 O N O OH OH OH DNA or RNA (U) (A) (G) (C)

More information

大学院博士課程共通科目ベーシックプログラム

大学院博士課程共通科目ベーシックプログラム 平成 30 年度医科学専攻共通科目 共通基礎科目実習 ( 旧コア実習 ) 概要 1 ). 大学院生が所属する教育研究分野における実習により単位認定可能な実習項目 ( コア実習項目 ) 1. 組換え DNA 技術実習 2. 生体物質の調製と解析実習 3. 薬理学実習 4. ウイルス学実習 5. 免疫学実習 6. 顕微鏡試料作成法実習 7. ゲノム医学実習 8. 共焦点レーザー顕微鏡実習 2 ). 実習を担当する教育研究分野においてのみ単位認定可能な実習項目

More information

In vivo へのトライ

In vivo へのトライ アデノウイルスベクターによる RNAi 特長 高い感染能を利用し 効率よく一過性の RNAi 実験が行える 広い動物種に用いることができ 増殖細胞だけでなく静止期の細胞にも感染 発現できる 神経系を含む多くの分化 未分化動物培養細胞をターゲットにすることができ さらに動物個体への直接注入 投与による遺伝子発現が可能である 原理説明 アデノウイルスは最もよく研究されているウイルスのひとつである

More information

Pyrobest ® DNA Polymerase

Pyrobest ® DNA Polymerase Pyrobest DNA Polymerase 説明書 v201102da 対活Pyrobest DNA Polymerase は Pyrococcus sp. 由来の 3' 5' exonuclease 活性 (proof reading 活性 ) を有する耐熱性 α 型 DNA ポリメラーゼです α 型 DNA ポリメラーゼは Pol I 型ポリメラーゼ (Taq DNA ポリメラーゼなど )

More information

pCold™ TF DNA

pCold™ TF DNA 研究用 pcold TF DNA 説明書 v201810da タンパク質の構造や機能の解明はポストゲノムの重要な研究対象で 効率のよいタンパク質生産システムはポストゲノム解析に必須の基盤技術です 組換えタンパク質の生産には大腸菌を宿主とする発現系が広く利用されています しかしながら 大腸菌発現系は扱いやすく 低コストである反面 遺伝子によっては発現できない あるいは発現タンパク質が不溶化するという問題が起こることがあります

More information

3'-Full RACE Core Set

3'-Full RACE Core Set 研究用 3'-Full RACE Core Set 説明書 v201703da RNA の解析において RT-PCR を利用することにより目的の領域を増幅した後 クローニングやシーケンスを行うことが可能です しかしながら mrna から完全長の cdna を得ることは困難であることが多く この様な場合 得られた cdna の情報を元にさらに上流や下流をクローニングする RACE(Rapid Amplification

More information

SPP System Set,SPP System I,SPP System II,SPP System III,SPP System IV

SPP System Set,SPP System I,SPP System II,SPP System III,SPP System IV 研究用 SPP System Set ( 製品コード 3366) SPP System I ( 製品コード 3367) SPP System II ( 製品コード 3368) SPP System III ( 製品コード 3369) SPP System IV ( 製品コード 3370) 説明書 v201612da 目次 I. 製品説明...3 II. 内容...4 III. 保存...4 IV.

More information

Bacterial 16S rDNA PCR Kit

Bacterial 16S rDNA PCR Kit 研究用 Bacterial 16S rdna PCR Kit 説明書 v201802da 微生物の同定は 形態的特徴 生理 生化学的性状 化学分類学的性状などを利用して行われますが これらの方法では同定までに時間を要します また 同定が困難な場合や正しい結果が得られない場合もあります 近年 微生物同定にも分子生物学を利用した方法が採用されるようになり 微生物の持つ DNA を対象として解析を行う方法が活用されています

More information

2011 年度森基金研究成果報告書 巨大 DNA を接合伝達で伝播する枯草菌ベクターの開発 政策 メディア研究科博士課程 2 年一之瀬太郎 Introduction 遺伝子組み変え技術は分子生物学研究において必須の技術である しかし, ゲノムサイズの巨大な DNA を大腸菌の遺伝子工学的手法で取り扱

2011 年度森基金研究成果報告書 巨大 DNA を接合伝達で伝播する枯草菌ベクターの開発 政策 メディア研究科博士課程 2 年一之瀬太郎 Introduction 遺伝子組み変え技術は分子生物学研究において必須の技術である しかし, ゲノムサイズの巨大な DNA を大腸菌の遺伝子工学的手法で取り扱 2011 年度森基金研究成果報告書 巨大 DNA を接合伝達で伝播する枯草菌ベクターの開発 政策 メディア研究科博士課程 2 年一之瀬太郎 Introduction 遺伝子組み変え技術は分子生物学研究において必須の技術である しかし, ゲノムサイズの巨大な DNA を大腸菌の遺伝子工学的手法で取り扱うには制限がある 慶應大学の板谷らにおけるゲノムデザイングループでは, DNA 相同組換えの頻度と効率に優れる枯草菌を利用することで,

More information

より低コストなPCR-DGGE解析手法

より低コストなPCR-DGGE解析手法 より低コストな PCR-DGGE 解析手法 M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 M 株式会社リーゾ 茨城県つくば市天久保 2-9-2-B201 http://www.rizo.co.jp/ 45 にはじめに手法のポイントはじめ手法の詳細留意点その他1 壌中の微 物相を解析する 法は 別して 微 物を培養してその性質を調 べる 法 ( 培養法 ) と 培養を経ずに微 物群を直接調べる 法(

More information

MightyAmp™ DNA Polymerase Ver.3

MightyAmp™ DNA Polymerase Ver.3 研究用 MightyAmp DNA Polymerase Ver.3 説明書 v201805da MightyAmp DNA Polymerase は 究極の反応性を追求して開発された PCR 酵素であり 通常の PCR 酵素では増幅が困難な PCR 阻害物質を多く含むクルードな生体粗抽出液を用いる場合にも その強力な増幅能により良好な反応性を示します MightyAmp DNA Polymerase

More information

ISOSPIN Plasmid

ISOSPIN Plasmid プラスミド DNA 抽出キット ISOSPIN Plasmid マニュアル ( 第 5 版 ) Code No. 318-07991 NIPPON GENE CO., LTD. I 製品説明 ISOSPIN Plasmid( アイソスピンプラスミド ) は スピンカラムを用いて簡単に大腸菌から高純度なプラスミド DNA を抽出できるキットです 本キットは カオトロピックイオン存在下で DNA がシリカへ吸着する原理を応用しており

More information

発現ベクターによるRNAi

発現ベクターによるRNAi 発現ベクターによる RNAi 特長 合成 sirna を導入した場合に比べ 長期に RNAi 効果を観察できる 細胞中に高効率で sirna を発現させることが可能 研究目的に応じて任意のベクターが選択できる 原理及び説明遺伝子発現をノックダウンする手法としてRNA 干渉作用 (RNAi) が注目されている RNAi は二本鎖 RNA(dsRNA) を細胞に導入することにより 標的遺伝子のmRNAを分解し

More information

高齢者の口蓋垂に生じた扁平上皮乳頭腫の1例

高齢者の口蓋垂に生じた扁平上皮乳頭腫の1例 日口内誌第 20 巻第 1 号 :8 13,2014,6 月 症例報告 高齢者の口蓋垂に生じた扁平上皮乳頭腫の 1 例 三浦桂一郎 1,2) 朝比奈泉 1) 抄録 : 扁平上皮乳頭腫は, 扁平上皮乳頭腫は, 表面が顆粒状の皮膚や粘膜上皮に発生する良性の上皮性腫瘍である 発生原因として慢性刺激のほか, ヒトパピローマウィルス (HPV) の関与が考えられている 好発部位は, 舌, 口蓋, 口唇, および頬粘膜だが,

More information

「組換えDNA技術応用食品及び添加物の安全性審査の手続」の一部改正について

「組換えDNA技術応用食品及び添加物の安全性審査の手続」の一部改正について ( 別添 ) 最終的に宿主に導入された DNA が 当該宿主と分類学上同一の種に属する微生物の DNA のみである場合又は組換え体が自然界に存在する微生物と同等の遺伝子構成である場合のいずれかに該当することが明らかであると判断する基準に係る留意事項 最終的に宿主に導入されたDNAが 当該宿主と分類学上同一の種に属する微生物のDNAのみである場合又は組換え体が自然界に存在する微生物と同等の遺伝子構成である場合のいずれかに該当することが明らかであると判断する基準

More information

遺伝子発現データの クラスタリングの理論的背景

遺伝子発現データの クラスタリングの理論的背景 自己組織化マップ Self-Organization Map (SOM) 自己組織化マップとは? K 平均アルゴリズムは あらかじめクラスター数 K を設定し 互いに近い値を持った各要素が同一クラスターに所属するように所属クラスターを決めてゆく 自己組織化マップは互いに近い値を持った各要素が近くなるように低い次元上にマップする 自己組織化マップは 1988 年に Kohonen が提案した (Kohonen

More information

pBAsi DNA シリーズ

pBAsi DNA シリーズ 研究用 pbasi DNA シリーズ 説明書 v201603da 目次 I. 製品説明と原理... 3 II. 準備 : ヘアピン型 RNA を発現させるための DNA 合成... 5 III. pbasi ベクターへのヘアピン型 RNA 発現のための合成 DNA の挿入... 6 III-1. 必要な器具 装置... 6 III-2. 用意するもの... 6 III-3. ベクターおよびインサート

More information

pCold™ ProS2 DNA

pCold™ ProS2 DNA 研究用 pcold ProS2 DNA 説明書 v201810da タンパク質の構造や機能の解明はポストゲノムの重要な研究対象で 効率の良いタンパク質生産システムはポストゲノム解析に必須の基盤技術です 組換えタンパク質の生産には大腸菌を宿主とする発現系が広く利用されています しかしながら 大腸菌発現系は扱いやすく 低コストである反面 遺伝子によっては発現できない あるいは発現タンパク質が不溶化するという問題が起こることがあります

More information

Microsoft Word - ボツリヌス病原体検査マニュアル docx

Microsoft Word - ボツリヌス病原体検査マニュアル docx I ---- 3 1. ---- 4 2. ---- 5 II ---- 12 1. ---- 12 2. ---- 12 3. ---- 16 4. ---- 17 5. ---- 21 6. PCR ---- 25 III ---- 28 IV ---- 32 V ---- 34 VI ---- 35 ---- 10 ---- 12 ---- 15 ---- 24 PCR ---- 26

More information

Mutan-Express Km Enzyme/Oligo Set, Vector/Host Set

Mutan-Express Km Enzyme/Oligo Set, Vector/Host Set 製品コード 6090 製品コード 6091 Site-directed mutagenesis system Mutan -Express Km Enzyme/Oligo Set( 製品コード 6090 ) Vector/Host Set( 製品コード 6091 ) 説明書 New Site-Directed Mutagenesis System Mutan-Express Km は ODA 法 (

More information

Microsoft PowerPoint - レッドカーペットレポート(薬学部).pptx

Microsoft PowerPoint - レッドカーペットレポート(薬学部).pptx H21 年度なってみたかー! 女性サイエンティストへのレッドカーペット 知りたかろ? くすりの効き目と遺伝子の関係 ~ 薬物代謝酵素 CYP2C19の遺伝子多型 ~ 2 年上野希枝 2 年桶田慧子 2 年大寺真未 2 年塚本舞 熊本大学薬学部薬物治療学研究室 8 月 4 日 5 日 背景 : 遺伝子と薬の関わり 医薬品の効果や副作用発現の個人差は 臨床上最も重要な問題の一つである 既存薬に対して有効性を示さない患者が通常

More information

DNA/RNA調製法 実験ガイド

DNA/RNA調製法 実験ガイド DNA/RNA 調製法実験ガイド PCR の鋳型となる DNA を調製するにはいくつかの方法があり 検体の種類や実験目的に応じて適切な方法を選択します この文書では これらの方法について実際の操作方法を具体的に解説します また RNA 調製の際の注意事項や RNA 調製用のキット等をご紹介します - 目次 - 1 実験に必要なもの 2 コロニーからの DNA 調製 3 増菌培養液からの DNA 調製

More information

Bacterial 16S rDNA PCR Kit

Bacterial 16S rDNA PCR Kit 研究用 Bacterial 16S rdna PCR Kit 説明書 v201307da 微生物の同定は 形態的特徴 生理 生化学的性状 化学分類学的性状などを利用して行われますが これらの方法では同定までに時間を要します また 同定が困難な場合や正しい結果が得られない場合もあります 近年 微生物同定にも分子生物学を利用した方法が採用されるようになり 微生物の持つ DNA を対象として解析を行う方法が活用されています

More information

TaKaRa PCR FLT3/ITD Mutation Detection Set

TaKaRa PCR FLT3/ITD Mutation Detection Set 研究用 TaKaRa PCR FLT3/ITD Mutation Detection Set 説明書 v201706da 本製品は FLT3 (FMS-like tyrosine kinase 3) 遺伝子の JM(Juxtamembrane) 領域周辺に起こる Internal Tandem Duplication(ITD) 変異の有無を検出するためのセットです FLT3 遺伝子の ITD 変異は

More information

Microsoft Word - Gateway technology_J1.doc

Microsoft Word - Gateway technology_J1.doc テクノロジー Gateway の基本原理 テクノロジーは λ ファージが大腸菌染色体へ侵入する際に関与する部位特異的組換えシステムを基礎としています (Ptashne, 1992) テクノロジーでは λ ファージの組換えシステムのコンポーネントを改変することで 組み換え反応の特異性および効率を高めています (Bushman et al, 1985) このセクションでは テクノロジーの基礎となっている

More information

Microsoft Word - H18年度生命工学報告書 Astro ver.3

Microsoft Word - H18年度生命工学報告書 Astro ver.3 1. Rotavirus Norovirus Adenovirus Astrovirus Sapovirus 5 1) Human Astrovirus HastV 1975 Madeley Cosgrove EM RNA 30nm 5 6 Fig. 1 2) HastV 8 3 5 HastV ELISA Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay RIA Radio immunoassay

More information

Microsoft Word - 【番号日付入り】通知

Microsoft Word - 【番号日付入り】通知 写 食安監発 1120 第 1 号 平成 26 年 11 月 20 日 都道府県 各保健所設置市衛生主管部 ( 局 ) 長殿 特別区 厚生労働省医薬食品局食品安全部監視安全課長 ( 公印省略 ) 腸管出血性大腸菌 O26 O103 O111 O121 O145 及び O157 の検査法について 食品中からの腸管出血性大腸菌の検査法については 平成 24 年 12 月 17 日付け食安監発 1217

More information

PrimeSTAR® HS DNA Polymerase

PrimeSTAR® HS DNA Polymerase 研究用 PrimeSTAR HS DNA Polymerase 説明書 v201309da PrimeSTAR HS DNA Polymerase は タカラバイオが独自に開発した高い正確性と高い増幅効率を併せ持つ DNA polymerase です 本酵素は非常に強力な 3-5 exonuclease 活性を有し DNA 合成において抜群の校正力を示す一方 Taq DNA Polymerase に優る高い増幅効率も示します

More information

untitled

untitled 非結核性抗酸菌のハウスキーピング遺伝子解析による同定 山本宣和, 向川純, 三宅啓文, 福田貢, 貞升健志, 甲斐明美 Identification of Mycobacterium Species by Nucleic Acid Sequencing Determination of House Keeping Genes Nobukazu YAMAMOTO, Jun MUKAIGAWA, Hirofumi

More information

バイオ医薬品における特許の現状

バイオ医薬品における特許の現状 18 1 1 2 2 7 1970 3 DNA 4 5 A REMICADE TM 6 6-506120 New York University, Centocor, Inc. 1 1 TNF a A2 TNF b TNF HERCEPTIN TM HUMIRA TM Genentech G HERCEPTIN trastuzumab 1998 FDA HER2 HER2 7 HERCEPTIN HERCEPTIN

More information

「組換えDNA技術応用食品及び添加物の安全性審査の手続」の一部改正について

「組換えDNA技術応用食品及び添加物の安全性審査の手続」の一部改正について 食安基発 0627 第 3 号 平成 26 年 6 月 27 日 各検疫所長殿 医薬食品局食品安全部基準審査課長 ( 公印省略 ) 最終的に宿主に導入されたDNAが 当該宿主と分類学上同一の種に属する微生物のDNAのみである場合又は組換え体が自然界に存在する微生物と同等の遺伝子構成である場合のいずれかに該当することが明らかであると判断する基準に係る留意事項について 食品 添加物等の規格基準 ( 昭和

More information

取扱説明書

取扱説明書 19-02 One-step RT-PCR Kit RT-PCR Quick Master Mix (Code No. PCR-311F) 取扱説明書 TOYOBO CO., LTD. Life Science Department OSAKA JAPAN A3647K - 目次 - [1] はじめに 1 [2] 製品内容 2 [3] 使用方法 3 [4] 実施例 5 [5] 関連プロトコル 6 [6]

More information

論文題目  腸管分化に関わるmiRNAの探索とその発現制御解析

論文題目  腸管分化に関わるmiRNAの探索とその発現制御解析 論文題目 腸管分化に関わる microrna の探索とその発現制御解析 氏名日野公洋 1. 序論 microrna(mirna) とは細胞内在性の 21 塩基程度の機能性 RNA のことであり 部分的相補的な塩基認識を介して標的 RNA の翻訳抑制や不安定化を引き起こすことが知られている mirna は細胞分化や増殖 ガン化やアポトーシスなどに関与していることが報告されており これら以外にも様々な細胞諸現象に関与していると考えられている

More information

O-157(ベロ毒素1 型、2 型遺伝子)One Shot PCR Typing Kit Ver.2

O-157(ベロ毒素1 型、2 型遺伝子)One Shot PCR Typing Kit Ver.2 食品 環境分析用 O-157( ベロ毒素 1 型 2 型遺伝子 ) One Shot PCR Typing Kit Ver.2 説明書 v201811da O157:H7 をはじめとする腸管出血性大腸菌 (EHEC) は 血便と激しい腹痛を伴う出血性大腸炎 さらには溶血性尿毒症症候群を引き起こす病原性大腸菌の一群です これらの重篤な症状の原因は EHEC が産生する細胞毒素であるベロ毒素です EHEC

More information

<4D F736F F D D838D B83588C9F8DB F4390B394C5816A8DB782B591D682A62E646F63>

<4D F736F F D D838D B83588C9F8DB F4390B394C5816A8DB782B591D682A62E646F63> ( 別添 ) ノロウイルスの検出法 目次 Ⅰ ノロウイルスの RT-PCR 法 1 1. 必要な器具と試薬 2. 操作上の注意 3. 食品の処理 4. ふん便材料の処理 5. QIAamp Viral RNA Mini キットによるRNAの抽出 6. DNase 処理 7. RT 反応 8. 1st PCR 9. Nested PCR 法 10. PCR 結果の判定 Ⅱ ハイブリダイゼーション 11

More information

Western BLoT Immuno Booster

Western BLoT Immuno Booster 研究用 Western BLoT Immuno Booster 説明書 v201211 Western BLoT Immuno Booster は 抗体の反応性を増強させる成分を含む溶液で 抗体の希釈液に用いるだけで 抗原抗体反応を促進します 本製品は ウェスタンブロット ELISA 等の各種イムノアッセイに対応しており 各アッセイにおいて数倍から数十倍の検出感度向上が期待できます 西洋ワサビペルオキシダーゼ

More information

DNA Fragmentation Kit

DNA Fragmentation Kit 研究用 DNA Fragmentation Kit 説明書 v201712da 本製品は 超音波破砕装置などの特殊な装置を使用せず 酵素処理によってゲノム DNA 等の長鎖 DNA をランダムに断片化し さらに平滑化するためのキットです 平滑化した断片はそのまま平滑末端ベクターに組み込むことができます また 平滑化を必要としない場合は 断片化までで反応を止めることもできます メチル化 DNA 濃縮や高速シーケンス解析のための前処理にも

More information

PrimeScript® One Step RT-PCR Kit Ver. 2 (Dye Plus)

PrimeScript® One Step RT-PCR Kit Ver. 2 (Dye Plus) 研究用 PrimeScript One Step RT-PCR Kit Ver. 2 (Dye Plus) 説明書 v201312da PCR(Polymerase Chain Reaction) は 目的とする DNA 領域をはさむ 2 種のプライマーを用いて特定の DNA 塩基配列を増幅する反応です PCR 法は原理的に DNA を増幅する反応であり RNA は直接の鋳型とはなりえませんが 逆転写酵素によって

More information

Western BLoT Rapid Detect

Western BLoT Rapid Detect 研究用 Western BLoT Rapid Detect 説明書 v201212 Western BLoT Rapid Detect は 標識二次抗体の代わりに独自の IgG Detector(HRP labeled) を利用して一次抗体を検出するウェスタンブロッティング専用の検出試薬キットです 本製品を利用することで 標識二次抗体を用いて検出する従来法ではできなかった迅速検出 高感度検出 シグナルの増強

More information

[ ]...1 [ ] Inverse PCR...2 [ ]...3 [ ]...4 Plasmid PCR Primer...4 PCR...5 PCR 2nd-site mutation...5 Plasmid...6 [ ]...8 Inverse PCR Dpn I

[ ]...1 [ ] Inverse PCR...2 [ ]...3 [ ]...4 Plasmid PCR Primer...4 PCR...5 PCR 2nd-site mutation...5 Plasmid...6 [ ]...8 Inverse PCR Dpn I 06-12 KOD - Plus- Mutagenesis Kit (Code No. SMK-101) TOYOBO CO., LTD. Life Science Department OSAKA JAPAN 0 [ ]...1 [ ] Inverse PCR...2 [ ]...3 [ ]...4 Plasmid.....4 PCR Primer...4 PCR...5 PCR 2nd-site

More information

Bacterial 16S rDNA Clone Library Construction Kit

Bacterial 16S rDNA Clone Library Construction Kit 研究用 Bacterial 16S rdna Clone Library Construction Kit 説明書 v201303da_2 Bacterial 16S rdna Clone Library Construction Kit は 環境中のバクテリアの群集構造を解析する手法の 1 つである 16S rdna Clone Library 法を効率良く行うために開発された タカラバイオ独自のシステムです

More information

PrimeScript®One Step RT-PCR Kit Ver. 2

PrimeScript®One Step RT-PCR Kit Ver. 2 PrimeScript One Step RT-PCR Kit Ver. 2 説明書 v201112da PCR(Polymerase Chain Reaction) は 目的とする DNA 領域をはさむ 2 種のプライマーを用いて特定の DNA 塩基配列を増幅する反応です PCR 法は原理的に DNA を増幅する反応であり RNA は直接の鋳型とはなりえませんが 逆転写酵素によって RNA から

More information

Quick guide_GeneArt Primer and Construct Design Tool_v1(Japanese)

Quick guide_GeneArt Primer and Construct Design Tool_v1(Japanese) GeneArt Primer and Construct Design Tool: GeneArt Seamless Cloning and Assembly Kit 編 released 11//01 1 The world leader in serving science 目次 キットの種類と特徴 GeneArt Primer and Construct Design Tool のご使用方法

More information

No. 1 Ⅰ. 緒言現在我国は超高齢社会を迎え それに伴い 高齢者の健康増進に関しては歯科医療も今後より重要な役割を担うことになる その中でも 部分欠損歯列の修復に伴う口腔内のメンテナンスがより一層必要となってきている しかし 高齢期は身体機能全般の変調を伴うことが多いため 口腔内環境の悪化を招く

No. 1 Ⅰ. 緒言現在我国は超高齢社会を迎え それに伴い 高齢者の健康増進に関しては歯科医療も今後より重要な役割を担うことになる その中でも 部分欠損歯列の修復に伴う口腔内のメンテナンスがより一層必要となってきている しかし 高齢期は身体機能全般の変調を伴うことが多いため 口腔内環境の悪化を招く 学位論文内容の要約 甲第 692 号論文提出者金野弘靖 論文題目 口腔レンサ球菌における環状ヌクレオチドの働きについて No. 1 Ⅰ. 緒言現在我国は超高齢社会を迎え それに伴い 高齢者の健康増進に関しては歯科医療も今後より重要な役割を担うことになる その中でも 部分欠損歯列の修復に伴う口腔内のメンテナンスがより一層必要となってきている しかし 高齢期は身体機能全般の変調を伴うことが多いため 口腔内環境の悪化を招くことに成り易い

More information

未経産採卵

未経産採卵 [ 報文 ] PCR 法による低温増殖性乳酸菌 Lactobacillus sakei UONUMA の判別 西脇俊和 下條明新潟県農業総合研究所食品研究センター Discrimination of the Psychrotrophic Lactic Acid Bacteria Lactobacillus sakei UONUMA Strains using PCR Analysis Toshikazu

More information

DNA Ligation Kit <Mighty Mix>

DNA Ligation Kit <Mighty Mix> 製品コード 623 研究用 DNA Ligation Kit < Mighty Mix > 説明書 v21512da DNA フラグメントのライゲーションは 遺伝子操作実験で頻繁に行う操作です DNA 間の結合には T4 DNA Ligase が用いられますが DNA の末端構造によって反応速度は著しく異なります そのため DNA の末端形状にあわせて加える酵素量や反応時間を調節する必要があります

More information

Microsoft PowerPoint - 4_河邊先生_改.ppt

Microsoft PowerPoint - 4_河邊先生_改.ppt 組換え酵素を用いた配列部位 特異的逐次遺伝子導入方法 Accumulative gene integration system using recombinase 工学研究院化学工学部門河邉佳典 2009 年 2 月 27 日 < 研究背景 > 1 染色体上での遺伝子増幅の有用性 動物細胞での場合 新鮮培地 空気 + 炭酸ガス 使用済み培地 医薬品タンパク質を生産する遺伝子を導入 目的遺伝子の多重化

More information

エキノコックス症

エキノコックス症 マラリア 1 目次 I. マラリアの概説 1) マラリアとは - 世界と日本における状況 - 2) マラリアの病態 3) マラリアの診断と治療 II. マラリア検査の進め方 1) マラリアの顕微鏡による形態診断 2) マラリアの迅速診断キットによる検査 3) マラリアの遺伝子検査 III. 参考文献 IV. 検査の問い合わせ V. 執筆者一覧 2 I. マラリアの概説 1) マラリアとは - 世界と日本における状況

More information

Microsoft Word - ケミストリープロトコル_v5_2012_Final.doc

Microsoft Word - ケミストリープロトコル_v5_2012_Final.doc GenomeLab GeXP Genetic Analysis System Sequenci Chemistry Protocol シークエンスケミストリープロトコル V.5 1. 反応試薬と消耗品について 1-1. 弊社供給試薬 製品名製品番号保存条件 DTCS クイックスタートキット (100 反応 ) 608120-20 DTCS クイックスタートキットに含まれている試薬キット内の試薬はミネラルオイル以外

More information

2012 年度 修士論文 ブレビバチルスへの β アガラーゼ遺伝子導入 およびネオアガロオリゴ糖生産 Cloning of β-agarase gene to Brevibacillus and production of neoagarooligosaccharides 高知工科大学大学院工学研究

2012 年度 修士論文 ブレビバチルスへの β アガラーゼ遺伝子導入 およびネオアガロオリゴ糖生産 Cloning of β-agarase gene to Brevibacillus and production of neoagarooligosaccharides 高知工科大学大学院工学研究 2012 年度 修士論文 ブレビバチルスへの β アガラーゼ遺伝子導入 およびネオアガロオリゴ糖生産 Cloning of β-agarase gene to Brevibacillus and production of neoagarooligosaccharides 高知工科大学大学院工学研究科 基盤工学専攻物質 環境システム工学コース 1155003 小田達 1 目次 緒言 1 章ブレビバチルスへのβ

More information

アレルギー物質を含む食品の検査方法について①

アレルギー物質を含む食品の検査方法について① 資料 2-6 アレルギー物質を含む食品の検査方法について平成 22 年 9 月 10 日消食表第 286 号各都道府県知事 各保健所設置市市長 各特別区区長宛消費者庁次長通知 アレルギー物質を含む食品については 特定のアレルギー体質を持つ方の健康危害の発生を防止する観点から 平成 13 年 4 月からその表示について法的に義務化しているところであり アレルギー物質を含む食品の検査方法について 平成

More information

Site-directed mut agenesis system Mutan-K Enzyme Set

Site-directed mut agenesis system Mutan-K Enzyme Set 製品コード 6060 Site-directed mutagenesis system Mutan -K Enzyme Set 説明書 Mutan - K は Kunkel 法 1 )2 ) をシステム化し Site-directed mutagenesis 3 )4 ) を行なえるようにしたキットです このキットによって DNA の塩基置換 欠失 挿入などが行なえ 遺伝子やタンパク質の機能解析 構造改変などに威力を発揮します

More information

遺伝子検査の基礎知識

遺伝子検査の基礎知識 リアルタイム PCR( インターカレーター法 ) 実験ガイドこの文書では インターカレーター法 (TB Green 検出 ) によるリアルタイム PCR について 蛍光検出の原理や実験操作の流れなどを解説します 実際の実験操作の詳細については 各製品の取扱説明書をご参照ください - 目次 - 1 蛍光検出の原理 2 実験に必要なもの 3 実験操作法 4 結果の解析 1 1 蛍光検出の原理 インターカレーターによる蛍光検出の原理

More information

PrimeSTAR® GXL DNA Polymerase

PrimeSTAR® GXL DNA Polymerase 研究用 PrimeSTAR GXL DNA Polymerase 説明書 v201308da PrimeSTAR GXL DNA Polymerase は PrimeSTAR HS DNA Polymerase を改良し さらに独自の伸長因子を組み合わせることにより PCR パフォーマンスを飛躍的に向上させた 画期的な High Fidelity PCR 酵素です 非常に高い正確性を維持しながら これまでの

More information

MB-lecture12.pptx

MB-lecture12.pptx タンパク質の発現精製方法 目的遺伝子 タンパク質発現に用いる生物種のプロモーター例 )Lac (E. coli) ADH1 (S. cerevisiae) Promoter STOP タンパク発現用プラスミド マーカー遺伝子 ( 薬事耐性など ) 複製開始点 198 培地中のラクトース E. coli lac promoter E. coli でのタンパク質発現の例 pet system T7 RNA

More information

PrimeScript® RT-PCR Kit

PrimeScript® RT-PCR Kit PrimeScript RT-PCR Kit 説明書 v201110da PCR(Polymerase Chain Reaction) は 目的とする DNA 領域をはさむ 2 種のプライマーを用いて特定の DNA 塩基配列を増幅する反応です PCR 法は原理的に DNA を増幅する反応であり RNA は直接の基質とはなりえませんが 逆転写酵素によって RNA から cdna を合成後 目的領域を

More information

ノロウイルス検査におけるエコーウイルス 9 型 Hill 株を用いた核酸検出効率の評価 木田浩司, 溝口嘉範, 濱野雅子, 葛谷光隆, 藤井理津志 ( ウイルス科 )

ノロウイルス検査におけるエコーウイルス 9 型 Hill 株を用いた核酸検出効率の評価 木田浩司, 溝口嘉範, 濱野雅子, 葛谷光隆, 藤井理津志 ( ウイルス科 ) ノロウイルス検査におけるエコーウイルス 9 型 Hill 株を用いた核酸検出効率の評価 木田浩司, 溝口嘉範, 濱野雅子, 葛谷光隆, 藤井理津志 ( ウイルス科 ) 岡山県環境保健センター年報 37, 107 ー 110, 2013 調査研究 ノロウイルス検査におけるエコーウイルス 9 型 Hill 株を用いた核酸検出効率の評価 Evaluation of Nucleic acid Detection

More information

ChIP Reagents マニュアル

ChIP Reagents マニュアル ChIP Reagents ~ クロマチン免疫沈降 (ChIP) 法用ストック溶液セット ~ マニュアル ( 第 1 版 ) Code No. 318-07131 NIPPON GENE CO., LTD. 目次 Ⅰ 製品説明 1 Ⅱ セット内容 1 Ⅲ 保存 2 Ⅳ 使用上の注意 2 Ⅴ 使用例 2 < 本品以外に必要な試薬 機器など> 2 1) 磁気ビーズと一次抗体の反応 3 2)-1 細胞の調製

More information

PanaceaGel ゲル内細胞の観察 解析方法 1. ゲル内細胞の免疫染色 蛍光観察の方法 以下の 1-1, 1-2 に関して ゲルをスパーテルなどで取り出す際は 4% パラホルムアルデヒドで固定してから行うとゲルを比較的簡単に ( 壊さずに ) 取り出すことが可能です セルカルチャーインサートを

PanaceaGel ゲル内細胞の観察 解析方法 1. ゲル内細胞の免疫染色 蛍光観察の方法 以下の 1-1, 1-2 に関して ゲルをスパーテルなどで取り出す際は 4% パラホルムアルデヒドで固定してから行うとゲルを比較的簡単に ( 壊さずに ) 取り出すことが可能です セルカルチャーインサートを 1. ゲル内細胞の免疫染色 蛍光観察の方法 以下の 1-1, 1-2 に関して ゲルをスパーテルなどで取り出す際は 4% パラホルムアルデヒドで固定してから行うとゲルを比較的簡単に ( 壊さずに ) 取り出すことが可能です セルカルチャーインサートを用いた培養ではインサート底面をメス等で切り取ることで またウェルプレートを用いた培養ではピペットの水流でゲル ( 固定後 ) を底面から浮かすことで 回収しやすくなります

More information

医薬品タンパク質は 安全性の面からヒト型が常識です ではなぜ 肌につける化粧品用コラーゲンは ヒト型でなくても良いのでしょうか? アレルギーは皮膚から 最近の学説では 皮膚から侵入したアレルゲンが 食物アレルギー アトピー性皮膚炎 喘息 アレルギー性鼻炎などのアレルギー症状を引き起こすきっかけになる

医薬品タンパク質は 安全性の面からヒト型が常識です ではなぜ 肌につける化粧品用コラーゲンは ヒト型でなくても良いのでしょうか? アレルギーは皮膚から 最近の学説では 皮膚から侵入したアレルゲンが 食物アレルギー アトピー性皮膚炎 喘息 アレルギー性鼻炎などのアレルギー症状を引き起こすきっかけになる 化粧品用コラーゲンの原料 現在は 魚由来が中心 かつては ウシの皮膚由来がほとんど BSE 等病原体混入の危険 人に感染する病原体をもたない アレルギーの問題は未解決 ( むしろ問題は大きくなったかもしれない ) アレルギーを引き起こす可能性 医薬品タンパク質は 安全性の面からヒト型が常識です ではなぜ 肌につける化粧品用コラーゲンは ヒト型でなくても良いのでしょうか? アレルギーは皮膚から 最近の学説では

More information

蛋白質科学会アーカイブ メチオニン要求株を使わないセレノメチオニン標識蛋白質のつくりかた

蛋白質科学会アーカイブ メチオニン要求株を使わないセレノメチオニン標識蛋白質のつくりかた メチオニン要求株を使わないセレノメチオニン標識蛋白質のつくりかた 産業技術総合研究所 中村努 石川一彦 ( 投稿日 2008/7/29 再投稿日 2008/8/21 受理日 2008/8/27 修正日 2013/11/29) キーワード : セレノメチオニン 生合成阻害 X 線結晶構造解析 概要 X 線結晶構造解析において初期位相を決定する際 セレン原子による異常散乱を利用することが広く行われている

More information

pRI 201 DNA シリーズ

pRI 201 DNA シリーズ 研究用 pri 201 DNA シリーズ ( 植物形質転換用高発現ベクター ) 説明書 v201703da pri 201 DNA シリーズは pri 101 DNA シリーズ ( 製品コード 3262/3263) よりも更に高い形質転換植物における外来遺伝子の発現を目的としたベクターです カリフラワーモザイクウイルス (CaMV) の 35S プロモーターの下流に ADH(Alcohol Dehydrogenase)

More information

1-4. 免疫抗体染色 抗体とは何かリンパ球 (B 細胞 ) が作る物質 特定の ( タンパク質 ) 分子に結合する 体の中に侵入してきた病原菌や毒素に結合して 破壊したり 無毒化したりする作用を持っている 例 : 抗血清馬などに蛇毒を注射し 蛇毒に対する抗体を作らせたもの マムシなどの毒蛇にかまれ

1-4. 免疫抗体染色 抗体とは何かリンパ球 (B 細胞 ) が作る物質 特定の ( タンパク質 ) 分子に結合する 体の中に侵入してきた病原菌や毒素に結合して 破壊したり 無毒化したりする作用を持っている 例 : 抗血清馬などに蛇毒を注射し 蛇毒に対する抗体を作らせたもの マムシなどの毒蛇にかまれ 1. 血液細胞の免疫蛍光染色とフローサイトメトリー解析 1-1. フローサイトメトリー ( Flow Cytometory ) とは細胞浮遊液をフローセル内を高速で流し 個々の細胞の形質等についてレーザー光を用いて解析する研究手法 フローサイトメーター( Flow Cytometer ) フローサイトメトリーにおいて使用する細胞解析用の装置今回は BD Accuri C6 を使用する 1-2. フローサイトメーターで何ができるか?

More information