H26 年度 スーパーコンピュータの高速化技法入門 演習用資料 2015 年 1 月 21 日大阪大学サイバーメディアセンター 日本電気株式会社
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- さやな ことじ
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1 H26 年度 スーパーコンピュータの高速化技法入門 演習用資料 2015 年 1 月 21 日大阪大学サイバーメディアセンター 日本電気株式会社
2 Page 2 本資料は, 東北大学サイバーサイエンスセンターと NEC の共同により作成され, 大阪大学サイバーメディアセンターの環境で実行確認を行い, 修正を加えたものです. 無断転載等は, ご遠慮下さい.
3 SX-ACE の計算ノード構成 全 1536ノード構成 1ノードあたり 1CPU(4core) メモリ 1ノードあたり 64G バイト ( 共有 ) ACE キューで最大 1024core(256 ノード ) まで利用可能 スーパーコンピュータ SX-ACE 全 1536 ノード 1コア 64ギガFLOPS 1ノードあたりベクトルプロセッサ 4core 共有物理メモリ 64ギガバイト 1 クラスタ (512 ノード ) 1 クラスタ (512 ノード ) 1 クラスタ (512 ノード ) Page 3
4 SX-ACE の CPU 構成 演算性能 256GFLOPS(64GFLOPS/ コア 4 コア ) メモリバンド幅 256GB/s (16GB/s/ ポート 16 ポート ) core #0 SPU 256GB/s VPU 64GFLOPS ADB(1MB) 256GFLOPS core core core #1 #2 #3 IOI/F RCU I/O ポート 専用ネットワークポート crossbar 256GB/s MMC MMC MMC MMC MMC MMC MMC MMC MMC MMC MMC MMC MMC MMC MMC MMC SPU:ScalarProcessingUnit VPU:VectorProcessingUnit ADB:AssignableDataBuffer RCU:RemoteAccessControlUnit MMC:Main MemoryControll er Memory (64GB) 256GB/s (16 ポート )
5 行列積のプログラムを使った課題 オリジナルコードのコンパイルと実行 性能解析 (ftrace の利用 ) アンローリング outerunrol 指示行 ( 指示行による最適化 ) 自動インライン展開 ( コンパイルオプションによる最適化 ) 行列積ライブラリ ( コンパイラによる最適化 ) 自動並列化 ( コンパイルオプションによる最適化 ) Page 5
6 演習問題の構成 ディレクトリ構成 super/ --practice_1 オリジナルコード実行環境 --practice_2 性能解析 (ftrace) 演習問題 --practice_3 outerunrol 指示行演習問題 --practice_4 自動インライン展開演習問題 --practice_5 行列積ライブラリ `--practice_6 自動並列化 Page 6
7 プログラム最適化の流れ プログラムの性能の把握性能解析ツールでの情報採取 性能ボトルネックサブルーチン ループの把握 サブルーチンの性能は十分か? MFLOPS VLEN V.Op.Ratio MFLOPS ~10GF VLEN ~100 V.Op.Ratio ~98% は 改善の余地あり 性能改善策 コンパイルオプション 指示行 ソースコード修正 指示行とは コンパイラは 最適化を行う上でソースコード上からは判断できない条件があった場合 最適化を抑止します ユーザーが明示的に指示行で条件を与えてあげることにより 最適化を促進させることが可能になります Page 7
8 1. 演習問題 : オリジナルコード 目的 現状のプログラムの性能を把握する 手順 コンパイル ( リストの確認 ) 実行 ( 結果 性能の確認 ) ディレクトリ practice_1 Page 8
9 1. オリジナルコード : コンパイル (1) コンパイラオプション コンパイラバージョン表示 (-V) 編集リスト 変形リストを採取 (-R2) 詳細診断メッセージを表示 (-Wf,-pvctlfull msg) sxf90-v-cvopt-r2-wf,-pvctlfull msgmat_tune0.f コンパイル方法 %./comp.sx.sh Page 9
10 1. オリジナルコード : コンパイル (2) 変形リスト (mat_tune0.l) 25 do j=1,n 26!cdir nounroll 27 do k=1,n 28 do i=1,n.!cdir nodep.!cdir on_adb(a,b). do i = 1, a(i,j)=a(i,j)+b(i,k)*c(k,j) 30 end do 31 end do 32 end do 編集リスト (mat_tune0.l) V: ベクトル化対象ループ 25: > do j=1,n 26:!cdir nounroll 27: > do k=1,n 28: ---- V > do i=1,n 29: A a(i,j)=a(i,j)+b(i,k)*c(k,j) 30: ---- V end do 31: end do 32: end do Page 10
11 1. オリジナルコード : 実行 ジョブファイル (run.sx.sh) #!/bin/ csh #PBS -q ACE -q ジョブクラス名を指定 #PBS -l cpunum_job =4,elapstim_req=0:10:00,memsz_job=1GB -l 使用 CPU 数 経過時間 メモリ容量の申告 #PBS -j o -N p1 -sx-sample -jo 標準エラー出力を標準出力と同じファイルへ出力する cd $PBS_O_WORKDIR -N ジョブ名を指定 timex./a.out NQSⅡ オプション 実行 %qsubrun.sx.sh Request******.cmcsubmittedtoqueue:ACE. ***** はジョブ番号 Page 11
12 1. オリジナルコード : 実行結果 結果ファイル (p1-sx-sample.o*** *) 約 25GFLOPS **** ProgramInformation ***** Real Time (sec) : User Time (sec) : Sys Time (sec) : Vector Time(sec) : Inst.Count : V.Inst.Count : V.Element Count : V.Load ElementCount : FLOP Count : MOPS : MFLOPS : A.V.Length : V.Op. Ratio (%) : Memory Size(MB) : MIPS : I-Cache (sec) : O-Cache (sec) : Bank Conflict Time CPUPort Conf.(sec) : MemoryNetworkConf.(sec) : ADB Hit ElementRatio (%) : プログラムインフォメーションの出力 Page 12
13 2. 演習問題 : 性能解析 (ftrace の利用 ) 目的 性能解析ツール ftrace を使い 性能情報を採取する 手順 ソースコードの修正 (ftrace_region の挿入 ) コンパイルオプションの追加 (-ftrace) 実行 ( 結果 性能の確認 ) ディレクトリ practice_2 Page 13
14 2. 性能解析 (ftrace の利用 ): ソースコード修正 mat_tune0.f へ ftrace_region を挿入 プログラムの局所的な部分の性能を知りたい場合に使用する 通常の ftrace はサブルーチン単位での情報を表示 ループ単位で細かく情報採取が可能 callftrace_region_begin/end で測定したい区間をはさむ コメントを外す 23 t1=etime(cp1) 24! call ftrace_reg ion_begin('ma in-loop' ) 25 do j=1,n 26 do k=1,n 27 do i=1,n 28 a(i,j)=a(i,j)+b(i,k 29 enddo 30 enddo 31 enddo 32! call ftrace_reg ion_end('mai n-loop' ) Page 14
15 2. 性能解析 (ftrace の利用 ): コンパイルオプションの追加 -ftrace を comp.sx.sh に追加 sxf90-v-cvopt-r2-wf,-pvctlfull msgmat_tune0.f-ftrace コンパイルオプションの意味 -ftrace 簡易性能解析機能を利用する 注意 -ftrace オプションは測定オーバーヘッドが生じるため 実行回数の多いサブルーチンがある場合には 実行時間が延びます そのため 常に使用することはお勧めしません Page 15
16 2. 性能解析 (ftrace の利用 ): コンパイルと実行 コンパイル %./comp.sx.sh 実行 %qsubrun.sx.sh Page 16
17 2. 性能解析 (ftrace の利用 ): 実行結果 結果ファイル (p2-sx-sample.o*** *) 約 40GFLOPS * * FTRACEANALYSIS LIST * * Exec ution Date :MonJan 19 17:05: Tota l CPU Time :0:00'00"92 5 (0.925sec.) ftrace の情報 ftrace_region の情報 PROC.NAME FREQUENCYEXCLU SIVE AVER.TIME MOPS MFLOPS V.OP VER. A VECTOR I-CACHE O-CACHE BANK CONFLICT ADB HIT TIME[ sec]( %) [msec] RATIO.LEN V TIME MISS MISSCPU PORTNETWO RK ELEM.% main _ (100.0) tota l (100.0) Main-loop (99.9) matrix_size= 2048 p_name user(sec) moda check mat_tune0.f_ D+04 プログラムの出力 (GFlops) Page 17
18 3. 演習問題 :outerunrol 指示行 目的 アウターアンローリング指示行の使い方を理解する 4 段アウターアンロールを行う 手順 ソースコードの修正 コンパイル ( リストの確認 ) 実行 ( 結果 性能の確認 ) ディレクトリ practice_3 Page 18
19 3.outerunrol 指示行 : ソースコード修正 mat_tune0.f を mat_tune.f にコピーしてから mat_tune.f を修正 %cpmat_t une0.fmat_t une.f %vi mat_t une.f 4 段 outerunrol 指示行の挿入例 25 doj=1,n 26!cdirouterunro ll=4 27 dok=1,n 28 doi=1,n 29 a(i,j)=a(i,j)+b(i,k)*c(k,j) 30 enddo 31 enddo 32 enddo 段数は 2 のべき乗の値のみ有効 Page 19
20 1. オリジナルコード : コンパイル (2) 変形リスト (mat_tune0.l) 25 do j=1,n 26 cdirouterunroll! =4 27 do k=1,n 28 i=1,n do 29 i,j)=a( i,j)+b( a( i,k)*c( k,j) 30 end do 31 end do. do, k 4= 1, cdirnodep!. cdiron_adb! (a,b). i= 1, do i,j) = i,j) a( a( + b(i,k)*dble (c(k,j)) + b(i,k+1)* dble (c(k+1,. 1 + b(i,k+2)* j)) dble (c(k+2,j)) + b(i,k+3)* dble (c(k+3,j)). enddo. enddo 32 end do 4 段アウターアンロールが行われる 配列 a のメモリアクセスの回数が 1/4 になるため高速化される
21 3.outerunrol 指示行 : 実行結果 結果ファイル (p3-sx-sample.o*** *) 約 40GFLOPS オリジナル ( 演習 1) の 1.6 倍の性能向上 **** ProgramInformation ***** RealTime (sec) : UserTime (sec) : Sys Time (sec) : VectorTime(sec) : Inst.Count : V.Inst.Count : V.Element Count : V.Load ElementCount : FLOPCount : MOPS : MFLOPS : A.V.Length : V.Op. Ratio (%) : Page 21
22 4. 演習問題 : 自動インライン展開 目的 自動インライン展開のオプションの使い方を理解する 手順 インライン展開前の性能の確認 コンパイル ( リストの確認 ) 実行 ( 結果 性能の確認 ) インライン展開後の性能の確認 コンパイルスクリプトへオプション追加 再コンパイル ( リストの確認 ) 再実行 ( 結果 性能の確認 ) ディレクトリ practice_4 Page 22
23 4. 自動インライン展開 : インライン展開前のコンパイル コンパイル sxf90-v-cvopt-r2-wf,-pvctlfull msgmat_tune1.fmul. f %./comp.sx.sh 編集リスト (mat_tune1.l) サブルーチン呼び出しがあり ベクトル化ができていない LINE LEVEL( NO.): DIAGNOSTIC MESSAGE 27 vec ( 3):Unvectorizedloop. 28 opt (1017):Subroutine call prevents optimization. 28 vec ( 10):Vectorizationobstructiveprocedure reference.:mul 25:+-----> do j=1,n 26: +----> do k=1,n 27: +----> doi=1,n 28: call mul(n,moda,i, j, k, a, b, c) 29: enddo 30: enddo 31: endo Page 23
24 4. 自動インライン展開 : インライン展開前の実行結果 実行 %qsubrun.sx.sh 結果ファイル (p4-sx-sample.o*** *) 約 0.034GFLOPS **** ProgramInformation ***** Real Time(sec) : User Time(sec) : Sys Time(sec) : VectorTime (sec) : Inst. Count : V. Inst. Count : V. Element Count : V. Load ElementCount : 6582 FLOP Count : MOPS : MFLOPS : A. V. Length : V. Op.Ratio(%) : Page 24
25 4. 自動インライン展開 : コンパイルオプションの追加 -piexpin=mul. fを comp.sx.sh に追加 sxf90-v-cvopt-r2-wf,-pvctlfull msgmat_tune1.fmul. f piexpin=mul.f コンパイルオプションの意味 -pi 自動インライン展開を有効にする expin=filename.f 展開元のサブルーチンが含まれるファイル (filename.f) を指定する Page 25
26 4. 自動インライン展開 : コンパイルオプションの追加 コンパイル %./comp.sx.sh インライン展開され ベクトル化できた 27 vec( 1): Vectorized loop. 27 vec( 29): ADB is used for array.: a 27 vec( 29): ADB is used for array.: b 28 opt Procedure (1222): mul expanded inline.. do k 4 = 1, 1024,. cdirnodep! 4 段アウターアンローリングも行われている. cdiron_adb! (a,b). i= 1, do i,j) = i,j) a( a( + i,k)*dble b( (c(k,j)) + b(i,k+1)* dble (c(k+1,. 1 dble (c(k+2,j)) + b(i,k+2)* + dble b(i,k+3)* (c(k+3,j)). enddo. enddo 31 enddo 25: > do j=1,n 26: V> do k=1,n 27: ---- V > do i=1,n 28: A I call mul(n, moda, i, j, k, 29: ---- V enddo 30: V enddo 31: enddo Page 26
27 4. 自動インライン展開 : インライン展開後の実行結果 実行 %qsubrun.sx.sh 結果ファイル (p4-sx-sample.o*** *) 約 42GFLOPS **** ProgramInformation ***** Real Time(sec) : User Time(sec) : Sys Time(sec) : VectorTime (sec) : Inst. Count : V. Inst. Count : V. Element Count : V. Load ElementCount : FLOP Count : MOPS : MFLOPS : A. V. Length : V. Op.Ratio(%) : Page 27
28 5. 演習問題 : 行列積ライブラリの利用 目的 行列積ライブラリの性能を確認する 手順 コンパイルスクリプトの修正 コンパイル ( リストの確認 ) 実行 ( 結果 性能の確認 ) ディレクトリ practice_5 Page 28
29 5. 行列積ライブラリの利用 : プログラム修正 mat_tune0.f を mat_tune.f にコピーしてから mat_tune.f を修正 %cpmat_t une0.fmat_t une.f %vi mat_t une.f( 配列 Cの型を real(4) からreal(8) に変更する ) 4 implicit -h,o-z) real(8)(a 5 parameter ( n=2048, moda=0 6 real(8) a(n+moda,n),b(n+mod 7 real(4) a,n) c(n+mod コンパイル %./comp.sx.sh 4 implicit -h,o-z) real(8)(a 5 parameter ( n=2048, moda=0 6 real(8) a(n+moda,n),b(n+mod 7 real(8) a,n) c(n+mod Page 29
30 5. 行列積ライブラリの利用 : リストの確認 メッセージ 編集 変形リスト (mat_tune.l) 行列積ライブラリへ変換 コンパイラが認識できる演算パターンでは ライブラリへの置換が行われる 28 opt (1800): Idiom detected (matrix multiply). 25 do j=1,n 26 do k=1,n 27 do i=1,n 28 a(i,j)=a(i,j)+b(i,k)*c(k,j) 29 enddo 30 enddo 31 enddo. call vdmxqa (b, 1, 2048, c, 1, 2048, a, 1, 2 : 25: * > do j=1,n 26: * > do k=1,n 27: ---- V > do i=1,n 28: a(i,j)=a(i,j)+b(i,k)*c(k,j 29: ---- V enddo 30: * enddo 31: * enddo Page 30
31 5. 行列積ライブラリの利用 : 実行結果 実行 %qsubrun.sx.sh 結果ファイル (p5-sx-sample.o*** *) 約 56GFLOPS **** ProgramInformation ***** Real Time(sec) : User Time(sec) : Sys Time(sec) : VectorTime (sec) : Inst. Count : V. Inst. Count : V. Element Count : V. Load ElementCount : FLOP Count : MOPS : MFLOPS : A. V. Length : V. Op.Ratio(%) : Page 31
32 6. 演習問題 : 自動並列化 (1) 目的 自動並列化機能を利用する 手順 コンパイルスクリプトの修正 コンパイル ( リストの確認 ) 実行 ( 結果 性能の確認 ) ディレクトリ practice_6 Page 32
33 6. 自動並列化 : コンパイル コンパイルスクリプトの修正 修正前 sxf90-v-cvopt-r2-wf,-pvctlfull msgmat_tune0.f 修正後 (-Pauto を追加 ) sxf90-v-cvopt-r2-wf,-pvctlfull msgmat_tune0.f-pauto コンパイル %./comp.sx.sh Page 33
34 6. 自動並列化 : 編集 変形リストの確認 自動並列化 DO ループをサブルーチンに抜き出して 並列化を行う サブルーチン名 _$n(n は 1,2,3 ) 25 do j=1,n 26 dok=1,n 27 do i=1,n 28 a(i,j)=a(i,j)+b(i,k)*c(k,j) 29 endo 30 enddo 31 enddo. callmain_$2 (a,b,c) LINE FORTRAN STATEMENT. subroutine main_$2.!cdir pardo for, nobar =(entry,exit).!cdir nodep. do j= 1,2048. do k=1, 512.!cdir nodep.!cdir on_adb(a,b). doi = 1, a(i,j) = a(i,j) + b(i,(k-1)*4+1)*dble(c(k-1)*4+1,j)) +b. 1 (i,(k-1)*4+2)*dble(c((k-1)*4+2,j))+ b(i,(k-1)*4+3)*. 2 dble(c(k-1)*4+3,j)+ b(i,(k-1)*4+4)*dble(c((k-1)*4+4. 3,j)). enddo. enddo. enddo. end 25mul ( 10): Parallel routine generated: 25mul ( 1): ParallelizedbyPARDO. main_$2 25:P-----> do j=1,n 26: V----> dok=1,n 27: V----> doi=1,n 28: A a(i,j)=a(i,j)+b(i,k)*c(k,j) 29: V---- endo 30: V---- enddo 31:P----- enddo P: 自動並列化対象ループ Page 34
35 6. 自動並列化 : 実行結果 実行 %qsubrun.sx.sh 結果ファイル (p6-sx-sample.o*** *)(4 タスクで実行 ) 約 55GFLOPS( 自動並列化前 ( 演習 3) の約 1.4 倍の性能向上 ) ****** Prog ram formation In ***** * Real Time sec) ( : User Time sec) ( : Sys Time sec) ( : Vecto r Time (sec) : Inst. Count : V. st. In unt Co : V. ement El Count : V. ad LoEle ment ount C : FLOP Count : MOPS : MFLOP S : MOPS (con curren t) : MFLOP S (con curren t) : A. Lengt V. h : V.. Op Rati o (%) : Memor y Size (MB) : Max oncurr C ent oc. Pr : 4. Conc. Tim e(>= )(sec) 1 : Conc. Tim e(>= )(sec) 2 : Conc. Tim e(>= )(sec) 3 : Conc. Tim e(>= )(sec) 4 : Page 35
36 よく使うコンパイラオプション リスト制御 オプション名 サブオプション 内容 -V コンパイラのバージョン情報を表示する -R 2 コンパイラによる変形リスト 編集リストを出力する 5 コンパイラによる編集リストを出力する -Wf,-L[list] fmtlist summary objlist コンパイラによる最適化処理およびベクトル化処理に関する各種レポート リストを出力することを指定する -Wf,-pvctlfull msg 詳細な診断メッセージを出力することを指定する 最適化レベル -C vopt( 規定値 ) 最大限の最適化処理と規定レベルのベクトル化処理を行うことを指定する hopt 最大限の最適化処理およびベクトル化処理を行うことを指定する vsafe 最適化処理およびベクトル化処理を行うが 副作用を伴う可能性のある機能は抑止することを指定する ssafe ベクトル化処理を抑止し 副作用を伴う可能性のある最適を行わないことを指定する -O extendreorder 命令の並べ換えを行う範囲を広くして より強力な命令並べ替えの最適化を行う -pi auto 規定値 ( ) 手続きの自動インライン展開を行うことを指定する noauto 明示的なインライン展開を行うことを指定する line=α 自動インライン展開の対象となる手続きの最大行数を指定する nest=β 自動インライン展開の対象となる手続きのネストの深さを指定する exp= 手続き名 指定された手続きがインライン展開の対象となることを指定する expin= ファイル名 指定されたファイルにインライン展開の対象となる手続きがあることを指定する -Wf きめ細かなオプションを指定する -pvctlchgpwr べき算 R1**R2 を EXP(R2*LOG(R1)) に置き換えることを指定する -pvctlexpand=n ループ長がn 以下のループを展開することを指定する -pvctlnoloopchg ループ入れ換えによるベクトル化を行わないことを指定する 並列化 -Pauto 自動並列化機能を使用することを指定する -Popenmp OpenMP 機能を使用すことを指定する ( 並列化対象サブルーチンのみ ) -e C どうかチェックを行う 実行時に配列要素参照の添字の値が その配列に対して許される範囲内にあるか デバッグ R 配列要素参照および配列部分参照において 添字あるいは部分配列添字の値が許される範囲内にあるかどうかチェックを行う -Wf -initstack=zero スタックに割付ける領域を 0で初期化することを指定する -initheap=zero ヒープに割付ける領域を 0で初期化することを指定する 性能解析 -ftrace SX の性能分析ツール FTRACE 対応の実行ファイルを作成することを指定する Page 36
37 よく使う指示行 指示行 vector/novector nodep outerunrol[=n] loopchg/noloopchg expand[=n] shortloop select(vector concur) on_adb[( 識別子 )] 内容直後のDO ループをベクトル化する / しないことを指定する DO ループ内データ依存関係が不明な場合 ベクトル化不可の依存がないものとしてベクトル化 / 最適化を行う 外側ループのアンローリングを許可するループ入れ換えによるベクトル化を行なうことを指定する 直後のDO ループをベクトル化する / しない展開することを指定する 直後のDO ループのループ長が レジスタ長 (256) 以下であることを指定する 直後のDO ループに対して ベクトル化を優先させるか 並列化を優先させるかを指定する 直後のループ中の配列のベクトルロード ストアにおいて 配列を ADB にバッファリングする Page 37
38 ライブラリ コンパイラが自動的に置き換えるもの 行列積パターン ソースコード修正により使用できるもの ASL/SX( 科学技術計算ライブラリ ) 行列演算 FFT など Mathkeisan BLAS ライブラリ Page 38
39 おすすめコンパイルオプション プログラムを初めてスーパーコンピュータ (SX-ACE) で実行する場合 既定値レベルの最適化 ベクトル化 (-Cvopt) ベクトル化の状態を表示する編集リストの採取 (-R2) ベクトル化が行われなかった場合の詳細メッセージ出力 (-pvctlfull msg) sxf90-v-cvopt-r2-wf,-pvctlfull msg プログラムファイル名 正常終了した場合 -Chopt を使用して -Cvopt の結果と比較 sxf90-v-chopt-r2-wf,-pvctlfull msg プログラムファイル名 Page 39
40 デバッグ用コンパイルオプション 正常終了したが 結果がおかしい場合 副作用を伴う可能性のある最適化を抑止 (-Cvsafe) sxf90-v Cvsafe-R2-Wf,-pvctlfull msg プログラムファイル名 異常終了 (Segmentationfault) した場合 デバッグ用オプションで分析 配列外参照をチェック (-ec -er オプション ) ベクトル化 最適化が抑止されるため 実行時間が長くなる エラー終了したファイル ( サブルーチン ) のみにオプションをつけた方がよい sxf90-v-cvopt-r2-wf,-pvctlfull msg-ec プログラムファイル名 初期化漏れのチェック スタックに割り付ける領域を NaN で初期化する 初期化漏れの変数をアクセスするとアボートさせることができる sxf90-v ー Pmulti-Cvopt-R2-Wf,-pvctlfull msg, initstack=nan プログラムファイル名 Page 40
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<4D F736F F F696E74202D D F95C097F D834F E F93FC96E5284D F96E291E85F8DE391E52E >
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サイバーメディアセンター 大規模計算機システムの利用
サイバーメディアセンター 大規模計算機システムの利用 大阪大学情報推進部情報基盤課 本日のプログラム I. システムのご紹介 II. 利用方法の解説 実習 i. システムへの接続 ii. プログラムの作成 コンパイル iii. ジョブスクリプトの作成 iv. ジョブスクリプトの投入 III. 利用を希望する方へ 2/56 SX-ACE NEC 製のベクトル型スーパーコンピュータ ノード毎 1 クラスタ
CPU Levels in the memory hierarchy Level 1 Level 2... Increasing distance from the CPU in access time Level n Size of the memory at each level 1: 2.2
FFT 1 Fourier fast Fourier transform FFT FFT FFT 1 FFT FFT 2 Fourier 2.1 Fourier FFT Fourier discrete Fourier transform DFT DFT n 1 y k = j=0 x j ω jk n, 0 k n 1 (1) x j y k ω n = e 2πi/n i = 1 (1) n DFT
appli_HPhi_install
2018/3/7 HΦ version 3.0.0 インストール手順書 (Linux 64 ビット版 ) 目次 1. アプリケーション概要...- 1-2. システム環境...- 1-3. 必要なツール ライブラリのインストール...- 1-1 cmake...- 2-2 numpy...- 3-4. アプリケーションのインストール...- 4-5. 動作確認の実施...- 5 - 本手順書は HΦ
演習１： 演習準備
演習 1: 演習準備 2013 年 8 月 6 日神戸大学大学院システム情報学研究科森下浩二 1 演習 1 の内容 神戸大 X10(π-omputer) について システム概要 ログイン方法 コンパイルとジョブ実行方法 OpenMP の演習 ( 入門編 ) 1. parallel 構文 実行時ライブラリ関数 2. ループ構文 3. shared 節 private 節 4. reduction 節
TSUBAME2.0 における GPU の 活用方法 東京工業大学学術国際情報センター丸山直也第 10 回 GPU コンピューティング講習会 2011 年 9 月 28 日
TSUBAME2.0 における GPU の 活用方法 東京工業大学学術国際情報センター丸山直也第 10 回 GPU コンピューティング講習会 2011 年 9 月 28 日 目次 1. TSUBAMEのGPU 環境 2. プログラム作成 3. プログラム実行 4. 性能解析 デバッグ サンプルコードは /work0/gsic/seminars/gpu- 2011-09- 28 からコピー可能です 1.
memo
計数工学プログラミング演習 ( 第 3 回 ) 2017/04/25 DEPARTMENT OF MATHEMATICAL INFORMATICS 1 内容 ポインタの続き 引数の値渡しと参照渡し 構造体 2 ポインタで指されるメモリへのアクセス double **R; 型 R[i] と *(R+i) は同じ意味 意味 R double ** ポインタの配列 ( の先頭 ) へのポインタ R[i]
スパコンに通じる並列プログラミングの基礎
2018.09.10 furihata@cmc.osaka-u.ac.jp ( ) 2018.09.10 1 / 59 furihata@cmc.osaka-u.ac.jp ( ) 2018.09.10 2 / 59 Windows, Mac Unix 0444-J furihata@cmc.osaka-u.ac.jp ( ) 2018.09.10 3 / 59 Part I Unix GUI CUI:
スパコンに通じる並列プログラミングの基礎
2018.06.04 2018.06.04 1 / 62 2018.06.04 2 / 62 Windows, Mac Unix 0444-J 2018.06.04 3 / 62 Part I Unix GUI CUI: Unix, Windows, Mac OS Part II 2018.06.04 4 / 62 0444-J ( : ) 6 4 ( ) 6 5 * 6 19 SX-ACE * 6
VXPRO R1400® ご提案資料
Intel Core i7 プロセッサ 920 Preliminary Performance Report ノード性能評価 ノード性能の評価 NAS Parallel Benchmark Class B OpenMP 版での性能評価 実行スレッド数を 4 で固定 ( デュアルソケットでは各プロセッサに 2 スレッド ) 全て 2.66GHz のコアとなるため コアあたりのピーク性能は同じ 評価システム
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PE-Expert4 統合開発環境 PE-ViewX 及び パワエレ専用ライブラリ PEOS バージョンアップのお知らせ Myway プラス株式会社 220-0022 神奈川県横浜市西区花咲町 6-145 横浜花咲ビル TEL.045-548-8836 FAX.045-548-8832 http://www.myway.co.jp/ E-mail: sales@myway.co.jp 拝啓貴社ますますご清栄のこととお喜び申し上げます
演習準備
演習準備 2014 年 3 月 5 日神戸大学大学院システム情報学研究科森下浩二 1 演習準備の内容 神戸大 FX10(π-Computer) 利用準備 システム概要 ログイン方法 コンパイルとジョブ実行方法 MPI 復習 1. MPIプログラムの基本構成 2. 並列実行 3. 1 対 1 通信 集団通信 4. データ 処理分割 5. 計算時間計測 2 神戸大 FX10(π-Computer) 利用準備
PowerPoint プレゼンテーション
各種計算機アプリケーション性能比較 目次. はじめに. 行列積計算.QDR 積計算 4.N 体問題計算 5. 多次元積分計算 5. 次元積分計算 5. 次元積分計算 5. 4 次元積分計算 5.4 5 次元積分計算 5.5 6 次元積分計算 平成 6 年度第 四半期 . はじめに 今までと少し性質の異なるグラフィックボードが使用できる様になったので従来のアプリケーションで性能比較を実施しました 主に使用した計算機は以下のものです
Microsoft Word - matlab-coder-code-generation-quick-start-guide-japanese-r2016a
MATLAB コードを使用した C コードの生成クイックスタートガイド (R2016a) 最初のスタンドアロン C コードの生成 スタンドアロン C コードを生成するには [ ビルド ] を [ ソースコード ] [ スタティックライブラリ ] [ ダイナミックライブラリ ] または [ 実行ファイル ] のいずれかに切り替えます MATLAB Coder を使用することで MATLAB コードから
Fortran 勉強会 第 5 回 辻野智紀
Fortran 勉強会 第 5 回 辻野智紀 今回のお品書き サブルーチンの分割コンパイル ライブラリ 静的ライブラリ 動的ライブラリ モジュール その前に 以下の URL から STPK ライブラリをインストールしておいて下さい. http://www.gfd-dennou.org/library/davis/stpk 前回参加された方はインストール済みのはず. サブルーチンの分割コンパイル サブルーチンの独立化
memo
計数工学プログラミング演習 ( 第 3 回 ) 2016/04/26 DEPARTMENT OF MATHEMATICAL INFORMATICS 1 内容 ポインタ malloc 構造体 2 ポインタ あるメモリ領域 ( アドレス ) を代入できる変数 型は一致している必要がある 定義時には値は不定 ( 何も指していない ) 実際にはどこかのメモリを指しているので, #include
コードのチューニング
OpenMP による並列化実装 八木学 ( 理化学研究所計算科学研究センター ) KOBE HPC Spring School 2019 2019 年 3 月 14 日 スレッド並列とプロセス並列 スレッド並列 OpenMP 自動並列化 プロセス並列 MPI プロセス プロセス プロセス スレッドスレッドスレッドスレッド メモリ メモリ プロセス間通信 Private Private Private
Microsoft Word _001b_hecmw_PC_cluster_201_howtodevelop.doc
RSS2108-PJ7- ユーサ マニュアル -001b 文部科学省次世代 IT 基盤構築のための研究開発 革新的シミュレーションソフトウエアの研究開発 RSS21 フリーソフトウエア HEC ミドルウェア (HEC-MW) PC クラスタ用ライブラリ型 HEC-MW (hecmw-pc-cluster) バージョン 2.01 HEC-MW を用いたプログラム作成手法 本ソフトウェアは文部科学省次世代
Microsoft Word - HOKUSAI_system_overview_ja.docx
HOKUSAI システムの概要 1.1 システム構成 HOKUSAI システムは 超並列演算システム (GWMPC BWMPC) アプリケーション演算サーバ群 ( 大容量メモリ演算サーバ GPU 演算サーバ ) と システムの利用入口となるフロントエンドサーバ 用途の異なる 2 つのストレージ ( オンライン ストレージ 階層型ストレージ ) から構成されるシステムです 図 0-1 システム構成図
修士論文
AVX を用いた倍々精度疎行列ベクトル積の高速化 菱沼利彰 1 藤井昭宏 1 田中輝雄 1 長谷川秀彦 2 1 工学院大学 2 筑波大学 1 目次 1. 研究背景 目的 2. 実装, 実験環境 3. 実験 - 倍々精度ベクトル演算 - 4. 実験 - 倍々精度疎行列ベクトル積 - 5. まとめ 多倍長精度計算フォーラム 2 目次 1. 研究背景 目的 2. 実装, 実験環境 3. 実験 - 倍々精度ベクトル演算
Hphi実行環境導入マニュアル_v1.1.1
HΦ の計算環境構築方法マニュアル 2016 年 7 月 25 日 東大物性研ソフトウェア高度化推進チーム 目次 VirtualBox を利用した HΦ の導入... 2 VirtualBox を利用した MateriAppsLive! の導入... 3 MateriAppsLive! への HΦ のインストール... 6 ISSP スパコンシステム B での HΦ の利用方法... 8 各種ファイルの置き場所...
演習1
神戸市立工業高等専門学校電気工学科 / 電子工学科専門科目 数値解析 2019.5.10 演習 1 山浦剛 (tyamaura@riken.jp) 講義資料ページ http://r-ccs-climate.riken.jp/members/yamaura/numerical_analysis.html Fortran とは? Fortran(= FORmula TRANslation ) は 1950
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26 FIPP FAPP I/O LAMMPS LJ atomic fluid 32,000 atoms for 100 timesteps FX10 4 16 / (FIPP) FIPP fipp - C - d dir/ - Ihwm,call - i10 mpiexec./a.out GUI, fipppx - A - d dir/ - Ihwm,cpu,balance,call,src
SuperH RISC engineファミリ用 C/C++コンパイラパッケージ V.7～V.9 ご使用上のお願い
ツールニュース RENESAS TOOL NEWS 2014 年 02 月 01 日 : 140201/tn1 SuperH RISC engine ファミリ用 C/C++ コンパイラパッケージ V.7~V.9 ご使用上のお願い SuperH RISC engine ファミリ用 C/C++ コンパイラパッケージ V.7~V.9の使用上の注意事項 4 件を連絡します 同一ループ内の異なる配列要素に 同一の添え字を使用した場合の注意事項
RX ファミリ用 C/C++ コンパイラ V.1.00 Release 02 ご使用上のお願い RX ファミリ用 C/C++ コンパイラの使用上の注意事項 4 件を連絡します #pragma option 使用時の 1 または 2 バイトの整数型の関数戻り値に関する注意事項 (RXC#012) 共用
RX ファミリ用 C/C++ コンパイラ V.1.00 Release 02 ご使用上のお願い RX ファミリ用 C/C++ コンパイラの使用上の注意事項 4 件を連絡します #pragma option 使用時の 1 または 2 バイトの整数型の関数戻り値に関する注意事項 (RXC#012) 共用体型のローカル変数を文字列操作関数で操作する場合の注意事項 (RXC#013) 配列型構造体または共用体の配列型メンバから読み出した値を動的初期化に用いる場合の注意事項
スライド 1
計算科学が拓く世界スーパーコンピュータは何故スーパーか 学術情報メディアセンター中島浩 http://www.para.media.kyoto-u.ac.jp/jp/ username=super password=computer 講義の概要 目的 計算科学に不可欠の道具スーパーコンピュータが どういうものか なぜスーパーなのか どう使うとスーパーなのかについて雰囲気をつかむ 内容 スーパーコンピュータの歴史を概観しつつ
演習2
神戸市立工業高等専門学校電気工学科 / 電子工学科専門科目 数値解析 2017.6.2 演習 2 山浦剛 (tyamaura@riken.jp) 講義資料ページ h t t p://clim ate.aic s. riken. jp/m embers/yamaura/num erical_analysis. html 曲線の推定 N 次多項式ラグランジュ補間 y = p N x = σ N x x
4 倍精度基本線形代数ルーチン群 QPBLAS の紹介 [index] 1. Introduction 2. Double-double algorithm 3. QPBLAS 4. QPBLAS-GPU 5. Summary 佐々成正 1, 山田進 1, 町田昌彦 1, 今村俊幸 2, 奥田洋司
![4 倍精度基本線形代数ルーチン群 QPBLAS の紹介 [index] 1. Introduction 2. Double-double algorithm 3. QPBLAS 4. QPBLAS-GPU 5. Summary 佐々成正 1, 山田進 1, 町田昌彦 1, 今村俊幸 2, 奥田洋司](/thumbs/97/131936032.jpg "4 倍精度基本線形代数ルーチン群 QPBLAS の紹介 [index] 1. Introduction 2. Double-double algorithm 3. QPBLAS 4. QPBLAS-GPU 5. Summary 佐々成正 1, 山田進 1, 町田昌彦 1, 今村俊幸 2, 奥田洋司")
4 倍精度基本線形代数ルーチン群 QPBLAS の紹介 [index] 1. Introduction 2. Double-double algorithm 3. QPBLAS 4. QPBLAS-GPU 5. Summary 佐々成正 1, 山田進 1, 町田昌彦 1, 今村俊幸 2, 奥田洋司 3 1 1 日本原子力研究開発機構システム計算科学センター 2 理科学研究所計算科学研究機構 3 東京大学新領域創成科学研究科
スライド 1
RL78/G13 周辺機能紹介安全機能 ルネサスエレクトロニクス株式会社 ルネサス半導体トレーニングセンター 2013/08/02 Rev. 0.00 00000-A コンテンツ 安全機能の概要 フラッシュ メモリ CRC 演算機能 RAM パリティ エラー検出機能 データの保護機能 RAM ガード機能 SFR ガード機能 不正メモリ アクセス機能 周辺機能を使用した安全機能 周波数検出機能 A/D
組込み Linux の起動高速化 株式会社富士通コンピュータテクノロジーズ 亀山英司 1218ka01 Copyright 2013 FUJITSU COMPUTER TECHNOLOGIES LIMITED
組込み Linux の起動高速化 株式会社富士通コンピュータテクノロジーズ 亀山英司 1218ka01 組込み Linux における起動高速化 組込み Linux の起動時間短縮について依頼あり スペック CPU : Cortex-A9 ( 800MB - single) RAM: 500MB 程度 要件 起動時間 画出し 5 秒 音出し 3 秒 終了時間 数 ms で電源断 1 課題と対策 問題点
Microsoft Word - 計算科学演習第1回3.doc
スーパーコンピュータの基本的操作方法 2009 年 9 月 10 日高橋康人 1. スーパーコンピュータへのログイン方法 本演習では,X 端末ソフト Exceed on Demand を使用するが, 必要に応じて SSH クライアント putty,ftp クライアント WinSCP や FileZilla を使用して構わない Exceed on Demand を起動し, 以下のとおり設定 ( 各自のユーザ
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2 3 Page 4 5 6 A-1B-1 C0 D0 E0 F0 G0 A0 B0 C1 D1 E1 F1 G1 A1 B1 C2 D2 E2 F2 G2 A2 B2 C3 D3 E3 7 F3 G3 A3 B3 C4 D4 E4 F4 G4 A4 B4 C5 D5 E5 F5 G5 A5 B5 C6 D6 E6 F6 G6 A6 B6 C7 8 Page 9 1 2 3 1 2 10 1 11
スライド 1
ver. 2018/4/13 プログラミング 計算機利用上の Tips 補足資料 分類 項目 ページ 計算機利用 ホスト計算機への接続方法 Unix (Linux) の基本的なコマンド容量制限についてターミナルで文字を大きくする方法 xtermで文字を大きくする方法 Fortran プログラミングについて最近あった事例 : コンパイル 実行時のエラーコンパイルオプションプログラムは正しそうなのに エラーが出る場合データファイルは正しそうなのに
Microsoft PowerPoint - 演習1：並列化と評価.pptx
講義 2& 演習 1 プログラム並列化と性能評価 神戸大学大学院システム情報学研究科横川三津夫 yokokawa@port.kobe-u.ac.jp 2014/3/5 RIKEN AICS HPC Spring School 2014: プログラム並列化と性能評価 1 2014/3/5 RIKEN AICS HPC Spring School 2014: プログラム並列化と性能評価 2 2 次元温度分布の計算
Agenda GRAPE-MPの紹介と性能評価 GRAPE-MPの概要 OpenCLによる四倍精度演算 (preliminary) 4倍精度演算用SIM 加速ボード 6 processor elem with 128 bit logic Peak: 1.2Gflops
Agenda GRAPE-MPの紹介と性能評価 GRAPE-MPの概要 OpenCLによる四倍精度演算 (preliminary) 4倍精度演算用SIM 加速ボード 6 processor elem with 128 bit logic Peak: 1.2Gflops ボードの概要 Control processor (FPGA by Altera) GRAPE-MP chip[nextreme
この時お使いの端末の.ssh ディレクトリ配下にある known_hosts ファイルから fx.cc.nagoya-u.ac.jp に関する行を削除して再度ログインを行って下さい
20150901 FX10 システムから FX100 システムへの変更点について 共通... 1 Fortran の変更点... 2 C/C++ の変更点... 4 C の変更点... 5 C++ の変更点... 7 共通 1. プログラミング支援ツールの更新 -FX システムについて旧バージョンのプログラミング支援ツールは利用できません 下記からダウンロードの上新規インストールが必要です https://fx.cc.nagoya-u.ac.jp/fsdtfx100/install/index.html
Intel® Compilers Professional Editions
2007 6 10.0 * 10.0 6 5 Software &Solutions group 10.0 (SV) C++ Fortran OpenMP* OpenMP API / : 200 C/C++ Fortran : OpenMP : : : $ cat -n main.cpp 1 #include 2 int foo(const char *); 3 int main()
インテル(R) Visual Fortran Composer XE 2013 Windows版 入門ガイド
Visual Fortran Composer XE 2013 Windows* エクセルソフト株式会社 www.xlsoft.com Rev. 1.1 (2012/12/10) Copyright 1998-2013 XLsoft Corporation. All Rights Reserved. 1 / 53 ... 3... 4... 4... 5 Visual Studio... 9...
ex05_2012.pptx
2012 年度計算機システム演習第 5 回 2012.05.25 高水準言語 (C 言語 ) アセンブリ言語 (MIPS) 機械語 (MIPS) コンパイラ アセンブラ 今日の内容 サブルーチンの実装 Outline } ジャンプ 分岐命令 } j, jr, jal } レジスタ衝突 回避 } caller-save } callee-save 分岐命令 ( 復習 ) } j label } Jump
. (.8.). t + t m ü(t + t) + c u(t + t) + k u(t + t) = f(t + t) () m ü f. () c u k u t + t u Taylor t 3 u(t + t) = u(t) + t! u(t) + ( t)! = u(t) + t u(
3 8. (.8.)............................................................................................3.............................................4 Nermark β..........................................
この方法では, 複数のアドレスが同じインデックスに対応づけられる可能性があるため, キャッシュラインのコピーと書き戻しが交互に起きる性のミスが発生する可能性がある. これを回避するために考案されたのが, 連想メモリアクセスができる形キャッシュである. この方式は, キャッシュに余裕がある限り主記憶の
計算機システム Ⅱ 演習問題学科学籍番号氏名 1. 以下の分の空白を埋めなさい. CPUは, 命令フェッチ (F), 命令デコード (D), 実行 (E), 計算結果の書き戻し (W), の異なるステージの処理を反復実行するが, ある命令の計算結果の書き戻しをするまで, 次の命令のフェッチをしない場合, ( 単位時間当たりに実行できる命令数 ) が低くなる. これを解決するために考案されたのがパイプライン処理である.
Microsoft PowerPoint - OS07.pptx
この資料は 情報工学レクチャーシリーズ松尾啓志著 ( 森北出版株式会社 ) を用いて授業を行うために 名古屋工業大学松尾啓志 津邑公暁が作成しました 主記憶管理 主記憶管理基礎 パワーポイント 27 で最終版として保存しているため 変更はできませんが 授業でお使いなる場合は松尾 (matsuo@nitech.ac.jp) まで連絡いただければ 編集可能なバージョンをお渡しする事も可能です 復習 OS
Insert your Title here
マルチコア マルチスレッド環境での静的解析ツールの応用 米 GrammaTech 社 CodeSonar によるスレッド間のデータ競合の検出 2013 GrammaTech, Inc. All rights reserved Agenda 並列実行に起因する不具合の摘出 なぜ 並列実行されるプログラミングは難しいのか データの競合 デッドロック どのようにして静的解析ツールで並列実行の問題を見つけるのか?
目次 LS-DYNA 利用の手引き 1 1. はじめに 利用できるバージョン 概要 1 2. TSUBAME での利用方法 使用可能な LS-DYNA の実行 4 (1) TSUBAMEにログイン 4 (2) バージョンの切り替え 4 (3) インタラ
LS-DYNA 利用の手引 東京工業大学学術国際情報センター 2016.04 version 1.10 目次 LS-DYNA 利用の手引き 1 1. はじめに 1 1.1 利用できるバージョン 1 1.2 概要 1 2. TSUBAME での利用方法 1 2.1 使用可能な 1 2.2 LS-DYNA の実行 4 (1) TSUBAMEにログイン 4 (2) バージョンの切り替え 4 (3) インタラクティブ実行
内容 インテル Advisor ベクトル化アドバイザー入門ガイド Version インテル Advisor の利用 ワークフロー... 3 STEP1. 必要条件の設定... 4 STEP2. インテル Advisor の起動... 5 STEP3. プロジェクトの作成
内容 インテル Advisor ベクトル化アドバイザー入門ガイド Version 1.0 1. インテル Advisor の利用... 2 2. ワークフロー... 3 STEP1. 必要条件の設定... 4 STEP2. インテル Advisor の起動... 5 STEP3. プロジェクトの作成と設定... 7 STEP4. ベクトル化に関する情報を取得する... 9 STEP5. ループ処理の詳細を取得する...
Microsoft PowerPoint - 計算機言語 第7回.ppt
計算機言語第 7 回 長宗高樹 目的 関数について理解する. 入力 X 関数 f 出力 Y Y=f(X) 関数の例 関数の型 #include int tasu(int a, int b); main(void) int x1, x2, y; x1 = 2; x2 = 3; y = tasu(x1,x2); 実引数 printf( %d + %d = %d, x1, x2, y);
第8回講義（2016年12月6日）
2016/12/6 スパコンプログラミング (1) (Ⅰ) 1 行列 - 行列積 (2) 東京大学情報基盤センター准教授塙敏博 2016 年 12 月 6 日 ( 火 ) 10:25-12:10 2016/11/29 講義日程 ( 工学部共通科目 ) 1. 9 月 27 日 ( 今日 ): ガイダンス 2. 10 月 4 日 l 並列数値処理の基本演算 ( 座学 ) 3. 10 月 11 日 : スパコン利用開始
第９回 配列(array)型の変数
第 12 回 配列型の変数 情報処理演習 ( テキスト : 第 4 章, 第 8 章 ) 今日の内容 1. 配列の必要性 2. 配列の宣言 3. 配列変数のイメージ 4. 配列変数を使用した例 5. 範囲を超えた添字を使うと? 6. 多次元配列変数 7. 多次元配列変数を使用した例 8. データのソーティング 9. 今日の練習問題 多数のデータ処理 1. 配列の必要性 ( テキスト 31 ページ )
製品開発の現場では 各種のセンサーや測定環境を利用したデータ解析が行われ シミュレーションや動作検証等に役立てられています しかし 日々収集されるデータ量は増加し 解析も複雑化しており データ解析の負荷は徐々に重くなっています 例えば自動車の車両計測データを解析する場合 取得したデータをそのまま解析
ホワイトペーパー Excel と MATLAB の連携がデータ解析の課題を解決 製品開発の現場では 各種のセンサーや測定環境を利用したデータ解析が行われ シミュレーションや動作検証等に役立てられています しかし 日々収集されるデータ量は増加し 解析も複雑化しており データ解析の負荷は徐々に重くなっています 例えば自動車の車両計測データを解析する場合 取得したデータをそのまま解析に使用することはできず
&A : A = k j 1: 4-way., A set x, way y, way y LRU y, way., A (x,y).,,, L1( 1) L2, L3 3. L1., L2,L3., TLB(Translation Lookaside Buffer). OS,. TLB, ( ),
1?,. 1,.,,. n-way (n ). 1, 4-way, n-way n (way).,., 1., ( set x ) (x), n., 2, 2 s, 2 l (, s, l )., s + l s., s,., n s. n. s + l way, (set,way)., way,. way, LRU(Least Recently Used, ). way. way, (,...).
Microsoft PowerPoint - 03_What is OpenMP 4.0 other_Jan18
OpenMP* 4.x における拡張 OpenMP 4.0 と 4.5 の機能拡張 内容 OpenMP* 3.1 から 4.0 への拡張 OpenMP* 4.0 から 4.5 への拡張 2 追加された機能 (3.1 -> 4.0) C/C++ 配列シンタックスの拡張 SIMD と SIMD 対応関数 デバイスオフロード task 構 の依存性 taskgroup 構 cancel 句と cancellation
gengo1-8
問題提起その 1 一文字ずつ文字 ( 数字 ) を読み込み それぞれの文字が何回入力されたかを数えて出力するプログラム int code, count_0=0, count_1=0, count_2=0, count_3=0,..., count_9=0; while( (code=getchar())!= EOF ){ } switch(code){ case 0 : count_0++; break;
システムソリューションのご紹介
HP 2 C 製品 :VXPRO/VXSMP サーバ 製品アップデート 製品アップデート VXPRO と VXSMP での製品オプションの追加 8 ポート InfiniBand スイッチ Netlist HyperCloud メモリ VXPRO R2284 GPU サーバ 製品アップデート 8 ポート InfiniBand スイッチ IS5022 8 ポート 40G InfiniBand スイッチ
memo
計数工学プログラミング演習 ( 第 4 回 ) 2016/05/10 DEPARTMENT OF MATHEMATICA INFORMATICS 1 内容 リスト 疎行列 2 連結リスト (inked ists) オブジェクトをある線形順序に並べて格納するデータ構造 単方向連結リスト (signly linked list) の要素 x キーフィールド key ポインタフィールド next x->next:
Microsoft PowerPoint - ARCEMB08HayashiSlides.ppt [互換モード]
![Microsoft PowerPoint - ARCEMB08HayashiSlides.ppt [互換モード]](/thumbs/93/113153048.jpg "Microsoft PowerPoint - ARCEMB08HayashiSlides.ppt [互換モード]")
演算 / メモリ性能バランスを考慮した CMP 向けオンチップ メモリ貸与法の提案 九州大学 林徹生今里賢一井上弘士村上和彰 1 発表手順 背景 目的 演算 / メモリ性能バランシング 概要 アクセスレイテンシの削減とオーバーヘッド 提案手法の実現方法 着目する命令 (Cell プロセッサへの ) 実装 性能評価 姫野ベンチマーク Susan@MiBench おわりに 2 チップマルチプロセッサ (CMP)
040312研究会HPC2500.ppt
2004312 e-mail : m-aoki@jp.fujitsu.com 1 2 PRIMEPOWER VX/VPP300 VPP700 GP7000 AP3000 VPP5000 PRIMEPOWER 2000 PRIMEPOWER HPC2500 1998 1999 2000 2001 2002 2003 3 VPP5000 PRIMEPOWER ( 1 VU 9.6 GF 16GB 1 VU
Microsoft PowerPoint - KHPCSS pptx
KOBE HPC サマースクール 2018( 初級 ) 9. 1 対 1 通信関数, 集団通信関数 2018/8/8 KOBE HPC サマースクール 2018 1 2018/8/8 KOBE HPC サマースクール 2018 2 MPI プログラム (M-2):1 対 1 通信関数 問題 1 から 100 までの整数の和を 2 並列で求めなさい. プログラムの方針 プロセス0: 1から50までの和を求める.
Microsoft Word - appli_SMASH_tutorial_2.docx
チュートリアル SMASH version 2.2.0 (Linux 64 ビット版 ) 本チュートリアルでは 量子化学計算ソフトウェア SMASH バージョン 2.2.0 について ソフトウェアの入手 / 実行モジュール作成 / 計算実行 / 可視化処理までを例示します 1. ソフトウェアの入手以下の URL よりダウンロードします https://sourceforge.net/projects/smash-qc/files/smash-2.2.0.tgz/download
インテル(R) Visual Fortran コンパイラ 10.0
インテル (R) Visual Fortran コンパイラー 10.0 日本語版スペシャル エディション 入門ガイド 目次 概要インテル (R) Visual Fortran コンパイラーの設定はじめに検証用ソースファイル適切なインストールの確認コンパイラーの起動 ( コマンドライン ) コンパイル ( 最適化オプションなし ) 実行 / プログラムの検証コンパイル ( 最適化オプションあり ) 実行
スパコンに通じる並列プログラミングの基礎
2016.06.06 2016.06.06 1 / 60 2016.06.06 2 / 60 Windows, Mac Unix 0444-J 2016.06.06 3 / 60 Part I Unix GUI CUI: Unix, Windows, Mac OS Part II 0444-J 2016.06.06 4 / 60 ( : ) 6 6 ( ) 6 10 6 16 SX-ACE 6 17
ex04_2012.ppt
2012 年度計算機システム演習第 4 回 2012.05.07 第 2 回課題の補足 } TSUBAMEへのログイン } TSUBAMEは学内からのログインはパスワードで可能 } } } } しかし 演習室ではパスワードでログインできない設定 } 公開鍵認証でログイン 公開鍵, 秘密鍵の生成 } ターミナルを開く } $ ssh-keygen } Enter file in which to save
スライド 1
知能制御システム学 画像処理の高速化 OpenCV による基礎的な例 東北大学大学院情報科学研究科鏡慎吾 swk(at)ic.is.tohoku.ac.jp 2007.07.03 リアルタイム処理と高速化 リアルタイム = 高速 ではない 目標となる時間制約が定められているのがリアルタイム処理である.34 ms かかった処理が 33 ms に縮んだだけでも, それによって与えられた時間制約が満たされるのであれば,
Microsoft PowerPoint - 1_コンパイラ入門セミナー.ppt
インテルコンパイラー 入門セミナー [ 対象製品 ] インテル C++ コンパイラー 9.1 Windows* 版インテル Visual Fortran コンパイラー 9.1 Windows* 版 資料作成 : エクセルソフト株式会社 Copyright 1998-2007 XLsoft Corporation. All Rights Reserved. 1 インテル コンパイラー入門 本セミナーの内容
GPUを用いたN体計算
単精度 190Tflops GPU クラスタ ( 長崎大 ) の紹介 長崎大学工学部超高速メニーコアコンピューティングセンターテニュアトラック助教濱田剛 1 概要 GPU (Graphics Processing Unit) について簡単に説明します. GPU クラスタが得意とする応用問題を議論し 長崎大学での GPU クラスタによる 取組方針 N 体計算の高速化に関する研究内容 を紹介します. まとめ
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計算機システムの基礎 ( 第 10 回配布 ) 第 7 章 2 節コンピュータの性能の推移 (1) コンピュータの歴史 (2) コンピュータの性能 (3) 集積回路の進歩 (4) アーキテクチャ 第 4 章プロセッサ (1) プロセッサの基本機能 (2) プロセッサの構成回路 (3) コンピュータアーキテクチャ 第 5 章メモリアーキテクチャ 1. コンピュータの世代 計算する機械 解析機関 by
スライド 1
本日 (4/25) の内容 1 並列計算の概要 並列化計算の目的 並列コンピュータ環境 並列プログラミングの方法 MPI を用いた並列プログラミング 並列化効率 2 並列計算の実行方法 Hello world モンテカルロ法による円周率計算 並列計算のはじまり 並列計算の最初の構想を イギリスの科学者リチャードソンが 1922 年に発表 < リチャードソンの夢 > 64000 人を円形の劇場に集めて
RL78開発環境移行ガイド RL78ファミリ間の移行 (コンパイラ編：コンパイラオプション・アセンブラオプション)(CA78K0R→CC-RL)
RL78 開発環境移行ガイド RL78 ファミリ間の移行 ( コンパイラ編 : コンパイラ アセンブラ ) (CA78K0R CC-RL) 2016/12/28 R20UT3418JJ0101 ソフトウェア事業部ソフトウエア技術部ルネサスシステムデザイン株式会社 はじめに 本資料は RL78 ファミリ用 C コンパイラ CA78K0R 用のプロジェクトを RL78 ファミリ用 C コ ンパイラ CC-RL
about MPI
本日 (4/16) の内容 1 並列計算の概要 並列化計算の目的 並列コンピュータ環境 並列プログラミングの方法 MPI を用いた並列プログラミング 並列化効率 2 並列計算の実行方法 Hello world モンテカルロ法による円周率計算 並列計算のはじまり 並列計算の最初の構想を イギリスの科学者リチャードソンが 1922 年に発表 < リチャードソンの夢 > 64000 人を円形の劇場に集めて
(Microsoft PowerPoint \215u\213`4\201i\221\272\210\344\201j.pptx)
AICS 村井均 RIKEN AICS HPC Summer School 2012 8/7/2012 1 背景 OpenMP とは OpenMP の基本 OpenMP プログラミングにおける注意点 やや高度な話題 2 共有メモリマルチプロセッサシステムの普及 共有メモリマルチプロセッサシステムのための並列化指示文を共通化する必要性 各社で仕様が異なり 移植性がない そして いまやマルチコア プロセッサが主流となり
Notes and Points for TMPR454 Flash memory
表紙 TMPR454 内蔵 Flash メモリ対応版手順書 株式会社 DTS インサイト ご注意 (1) 本書の内容の一部または 全部を無断転載することは禁止されています (2) 本書の内容については 改良のため予告なしに変更することがあります (3) 本書の内容について ご不明な点やお気付きの点がありましたら ご連絡ください (4) 本製品を運用した結果の影響については (3) 項にかかわらず責任を負いかねますのでご了承ください
Microsoft PowerPoint ppt
仮想マシン (2), コード生成 http://cis.k.hosei.ac.jp/~asasaki /lect/compiler/2007-1204.pdf ( 訂正版 ) 1 概要 仮想マシン 概要 ( 復習 ) 制御命令 出力命令 コード生成 式のコード生成 文 文の列のコード生成 記号表 2 演習で作るコンパイラの例 test.hcc Int main() { int i j; i = 3;
(速報) Xeon E 系モデル 新プロセッサ性能について
( 速報 ) Xeon E5-2600 系モデル新プロセッサ性能について 2012 年 3 月 16 日 富士通株式会社 2012 年 3 月 7 日 インテル社より最新 CPU インテル Xeon E5 ファミリー の発表がありました この最新 CPU について PC クラスタシステムの観点から性能検証を行いましたので 概要を速報いたします プロセッサインテル Xeon プロセッサ E5-2690
memo
数理情報工学演習第一 C プログラミング演習 ( 第 5 回 ) 2015/05/11 DEPARTMENT OF MATHEMATICAL INFORMATICS 1 今日の内容 : プロトタイプ宣言 ヘッダーファイル, プログラムの分割 課題 : 疎行列 2 プロトタイプ宣言 3 C 言語では, 関数や変数は使用する前 ( ソースの上のほう ) に定義されている必要がある. double sub(int
$ cmake --version $ make --version $ gcc --version 環境が無いあるいはバージョンが古い場合は yum などを用いて導入 最新化を行う 4. 圧縮ファイルを解凍する $ tar xzvf gromacs tar.gz 5. cmake を用
本マニュアルの目的 Linux サーバー版 Gromacs インストールマニュアル 2015/10/28 本マニュアルでは 単独ユーザが独占的に Linux サーバー (CentOS 6.6) を使用して Gromacs ジョブを実行するための環境構築方法と Winmostar のリモートジョブ機能による計算手順を示しています つまり複数ユーザが共同使用する計算サーバー等は対象外です そのため計算環境は全てユーザのホームディレクトリ配下で行う構築することを想定しています
Fujitsu Standard Tool
XcalableMP ワークショップ COARRAY の便利な使い方 2017 年 10 月 31 日富士通株式会社 ) 次世代 TC 開発本部原口正寿 COARRAY 仕様 Fortran 2008 に組み込まれた分散並列機能 指示文とサービスサブルーチンではなく 文法として組み込まれた [, ] ( 角括弧 ) によるプロセス間通信と 同期のための文 アトミックサブルーチンなど組込み手続 SPMDモデル(Single
Microsoft PowerPoint - 演習２：MPI初歩.pptx
演習 2:MPI 初歩 - 並列に計算する - 2013 年 8 月 6 日 神戸大学大学院システム情報学研究科計算科学専攻横川三津夫 MPI( メッセージ パッシング インターフェース ) を使おう! [ 演習 2 の内容 ] はじめの一歩課題 1: Hello, world を並列に出力する. 課題 2: プロセス 0 からのメッセージを受け取る (1 対 1 通信 ). 部分に分けて計算しよう課題
並列・高速化を実現するための 高速化サービスの概要と事例紹介
第 4 回 AVS 可視化フォーラム 2019 並列 高速化を実現するための 高速化サービスの概要と事例紹介 株式会社アーク情報システム営業部仮野亮ソリューション技術部佐々木竜一 2019.08.30 はじめに アーク情報システムの紹介 高速化サービスとは? 事例紹介 コンサルティングサービスについて アーク情報システムの紹介 設立 資本金 :1987 年 10 月 :3 億 600 万円 従業員数
プログラミング実習I
プログラミング実習 I 05 関数 (1) 人間システム工学科井村誠孝 m.imura@kwansei.ac.jp 関数とは p.162 数学的には入力に対して出力が決まるもの C 言語では入出力が定まったひとまとまりの処理 入力や出力はあるときもないときもある main() も関数の一種 何かの仕事をこなしてくれる魔法のブラックボックス 例 : printf() 関数中で行われている処理の詳細を使う側は知らないが,
hpc141_shirahata.pdf
GPU アクセラレータと不揮発性メモリ を考慮した I/O 性能の予備評価 白幡晃一 1,2 佐藤仁 1,2 松岡聡 1 1: 東京工業大学 2: JST CREST 1 GPU と不揮発性メモリを用いた 大規模データ処理 大規模データ処理 センサーネットワーク 遺伝子情報 SNS など ペタ ヨッタバイト級 高速処理が必要 スーパーコンピュータ上での大規模データ処理 GPU 高性能 高バンド幅 例
Slides: TimeGraph: GPU Scheduling for Real-Time Multi-Tasking Environments
計算機アーキテクチャ第 11 回 マルチプロセッサ 本資料は授業用です 無断で転載することを禁じます 名古屋大学 大学院情報科学研究科 准教授加藤真平 デスクトップ ジョブレベル並列性 スーパーコンピュータ 並列処理プログラム プログラムの並列化 for (i = 0; i < N; i++) { x[i] = a[i] + b[i]; } プログラムの並列化 x[0] = a[0] + b[0];
情報処理概論（第二日目）
情報処理概論 工学部物質科学工学科応用化学コース機能物質化学クラス 第 8 回 2005 年 6 月 9 日 前回の演習の解答例 多項式の計算 ( 前半 ): program poly implicit none integer, parameter :: number = 5 real(8), dimension(0:number) :: a real(8) :: x, total integer
UNIX 初級講習会 （第一日目）
情報処理概論 工学部物質科学工学科応用化学コース機能物質化学クラス 第 3 回 2005 年 4 月 28 日 計算機に関する基礎知識 Fortranプログラムの基本構造 文字や数値を画面に表示する コンパイル時のエラーへの対処 ハードウェアとソフトウェア ハードウェア 計算, 記憶等を行う機械 ソフトウェア ハードウェアに対する命令 データ ソフトウェア ( 命令 ) がないとハードウェアは動かない
プログラミングI第6回
プログラミング 1 第 6 回 ポインタ (3) -- ポインタの応用 関数の引数 配列を引数にする ( 前期教科書 P1) man 関数への引数 ( 後期教科書 P136) 動的メモリ割り当て ( 後期教科書 P133) この資料にあるサンプルプログラムは /home/course/prog1/publc_html/7/hw/lec/sources/ 下に置いてありますから 各自自分のディレクトリにコピーして
PowerPoint プレゼンテーション
高性能計算基盤 第 7 回 CA1003: 主記憶共有型システム http://arch.naist.jp/htdocs-arch3/ppt/ca1003/ca1003j.pdf Copyright 2019 奈良先端大中島康彦 1 2 3 4 マルチスレッディングとマルチコア 5 6 7 主記憶空間の数が 複数 か 1 つ か 8 ただしプログラムは容易 9 1 つの主記憶空間を共有する場合 10
Microsoft Word ●書式付IO性能_杉崎_ _更新__ doc
2.2.3. 書式付 I/O 性能 上智大学南部伸孝富士通株式会社内藤俊也 杉崎由典 1. はじめに I/O 処理に要する時間の内訳は システムの実 I/O 時間 + ランタイムの書式処理時間となっている プログラムを用いた書式付 I/O 時間を富士通コンパイラで評価した所 システム時間が約 12% であり ランタイム時間が約 88% ということが確認された 即ち 書式付 I/O 性能は ランタイムの性能に大きく影響される
1. TSUBAME2.0 通常実行まで 1.1. 環境設定 (MPI ライブラリ & コンパイラ ) 最新の Open MPI と Intel コンパイラを使用するため,${HOME}/.bashrc 等で環境変数 ( パス等 ) を設定します. ~ 設定例 ~ export SELECT_MPI
プロファイルツール実行例アプリ ntchem-rimp2 2013 年 9 月 3 日日本電気株式会社 0. はじめに 本ドキュメントでは, アプリ ntchem-rimp2 におけるプロファイルツール連携の作業履歴を記 載します. 目次 1. TSUBAME2.0 通常実行まで... 2 1.1. 環境設定 (MPI ライブラリ & コンパイラ )... 2 1.2. コンパイルとソース修正...
OSIV/MSP SIMPLIA/TF-DATATOOL 簡易帳票出力オプション ソフトウェア説明書
システム名 ソフトウェア略称 MSP TF-DATAREV23 適用 V23L20 バージョン レベル 製品コード A9316847-2320-1 ソフトウェア説明書 OSⅣ/MSP SIMPLIA/TF-DATATOOL 簡易帳票出力オプション V23 まえがき 本ソフトウェア説明書は, SIMPLIA/TF-DATATOOL 簡易帳票出力オプション V23 について説明したものです. ソフトウェアの使用に先立ち,
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ARM 用統合開発環境 EWARM アドオンツール C-RUN のご紹介 2015.1 IAR システムズ株式会社 www.iar.com C-RUN 概要 www.iar.com C-RUN とは? 統合開発環境 EWARM のデバッグ機能が強化されました C-RUN はデバッグ効率アップを目的としたアドオンツールです 単体テスト時の動的解析が簡単 & 安価に可能です 従来の解析ツール 開発プロセスの変更が必要
アプリケーション アクセラレー ションおよび最適化の設定情報 と統計情報の表示
CHAPTER 6 アプリケーションアクセラレーションおよび最適化の設定情報と統計情報の表示 この章では show コマンドについて説明します このコマンドを使用すると ACE のアプリケーションアクセラレーションおよび最適化に関連した情報および統計情報を表示できます show コマンドでは このコマンドを実行したコンテキストに関連した情報が表示されます この章では 各コマンドについて コマンド出力も含めて説明します
Microsoft PowerPoint - OpenMP入門.pptx
OpenMP 入門 須田礼仁 2009/10/30 初版 OpenMP 共有メモリ並列処理の標準化 API http://openmp.org/ 最新版は 30 3.0 バージョンによる違いはあまり大きくない サポートしているバージョンはともかく csp で動きます gcc も対応しています やっぱり SPMD Single Program Multiple Data プログラム #pragma omp