Microsoft PowerPoint - 6_TS-0891(TS-0835(Custom TaqMan Assay Design Tool利用方法修正5.pptx

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1 Custom TaqMan Assay Design Tool インターネットオーダー方法 20010/06/01

2 Custom TaqMan Assay Design Tool 1. Custom TaqMan SNP Genotyping Assays P.5 2. Custom TaqMan Gene Expression Assays P カスタムデザインでのオーダー P デザイン済みアッセイの再注文 P デザイン済みアッセイの閲覧 P 関連資料 P.46 2

3 Custom TaqMan Assay Design Tool Custom TaqMan Assay Design Toolとは? Custom TaqMan SNP Genotyping Assays 及びCustom TaqMan Gene Expression Assaysのデザインオーダーを行うインターネットツールです 3

4 Custom TaqMan Assay Design Tool Custom TaqMan Assay Design Tool を利用するには? 以下のサイトへアクセスしますユーザー IDをお持ちでない方は以下のアプライドバイオシステムズジャパン社ホームページのインターネットオーダーシステムご利用案内よりユーザー IDの登録をお願いします以下のサイトへアクセスします 4

5 5 Custom TaqMan SNP Genotyping Assays

6 Custom TaqMan SNP Genotyping Assays 以下のサイトへアクセスします 6

7 Custom TaqMan SNP Genotyping Assays Order Custom Genotyping Assays をクリック 7

8 Custom TaqMan SNP Genotyping Assays 1 つの配列に複数の SNP サイトを入力できますがテサインが最適である 1 つのアッセイのみ出荷されますどのターケットサイトでアッセイが構築されているかは後述の SNP Name から判断できます複数の SNP サイトを入力する場合 SNP 間が 2 塩基以上あいていないとテサインすることができません SNP サイト上下流 2bp は N を入力することはできません配列名を入力英数字および.-,_ で 10 文字以内この名前がチューブに記載されます特徴的な名前を入力します塩基配列を入力テキスト情報をコピー後 Ctr+Vでペーストも可 ATGCおよびNで入力 ( 最低 61bp 300bp 以上推奨最大 5000bp) SNPサイトから配列の両端へは30bp 以上確保 SNPサイトの指定例 )[C/T] insertion deletionの指定例 )[ATG/*] 最大 6 塩基まで MNPの指定例 )[TC/CT] 最大 6 塩基まで注意 : 配列内にある目的外のSNPはNでマスクします 8

9 Custom TaqMan SNP Genotyping Assays 重要 : ヒト Y 染色体上の SNP アッセイは Non-Human 製品としてご注文ください 1 生物種スケールの選択 2Check Format をクリック 9

10 Custom TaqMan SNP Genotyping Assays SNP Nameを入力英数字 4 文字以内で入力します SNP Nameはチューブなどには記載されません Name( この例ではSNP001) がチューブやアッセイ情報に記載されます SNP# は5 末端より何番目のSNPであるかを表します注意 :NでSNPをマスクした場合はそのSNPは数えません正確に入力した場合 Valid の表示になります配列中に複数の SNP を入力すると複数の SNP がアッセイの候補になります Submit For Assay Design をクリック 10

11 Custom TaqMan SNP Genotyping Assays Username/Password はインターネットオーダー用のユーザー ID を使用 (4 ページ参照 ) Username Password を入力後 Login をクリック 11

12 Assays オーダー方法デザイン開始クリックで情報更新 Batch ID デザインの受付番号です Refresh Batch List - クリックするとデザインの最新状況がわかりますデザインを開始したお知らせのも届きます 12

13 Assays オーダー方法デザイン終了 Details デザインの結果です Passed したアッセイをオーダーすることが出来ます Refresh Batch List - クリックするとデザインの最新状況がわかりますデザインが終了したお知らせのも届きます 13

14 Assays オーダー方法 Passed デザインのオーダー方法 Batch ID をクリックで Design Results を表示 Batch ID ID をクリックすると Design Results が表示されます Design Results-Passed アッセイをオーダーできます Assay ID-Assay ID は自動的に割り当てられますデザインの時に入力した配列名も表示されます 14

15 Assays オーダー方法 Passed デザインのオーダー方法 3Order Now をクリック 2 リストを確認 1Add をクリック 15

16 Assays オーダー方法 Passed デザインのオーダー方法 1Size などを確認 2Add To Basket をクリック Shopping Basket をクリック 16

17 Assays オーダー方法 Passed デザインのオーダー方法更新ショッピングバスケット内の製品の注文数を変更した場合このボタンを押して下さい削除 - 注文した製品 1 つもしくは複数を削除することができますご注文を先に進める場合ご注文プロセスを続けるボタンを押します 17

18 Assays オーダー方法 Passed デザインのオーダー方法お支払方法についてお支払方法の Purchas Order の表示 Blanket Order の空欄はそのままで変更しないでくださいお名前は登録ユーザーのお名前を半角アルファベットでご入力くださいお支払方法を入力後次へをクリックします 18

19 Assays オーダー方法 Passed デザインのオーダー方法ご注文を完了するにはご注文をクリックします内容を修正したい場合は戻るをクリックします重要 : ご注文をクリック後キャンセルすることは出来ません 19

20 Assays オーダー方法 Passed デザインのオーダー方法ご注文ボタンを押すとご注文の確認ページが表示されます - ご注文が完了し受注伝票番号が発行されます - 受注伝票番号が表示されます番号をお控えください - 印刷用ページボタンを押すと印刷画面が表示されます - ご登録いただいたお客様のアドレスに確認メールが送信されます 20

21 21 Custom TaqMan Gene Expression Assays

Custom TaqMan Gene Expression Assays 以下のサイトへアクセスします https://www5.

22 Custom TaqMan Gene Expression Assays 以下のサイトへアクセスします Order Custom Gene Expression Assays をクリック 22

23 Custom TaqMan Gene Expression Assays ターゲットの生物種を選択します入力した配列に対して TaqMan Gene Experssion Assays と同様のバイオインフォマティック解析や他の生物種の転写産物を検出しないオプションを追加する場合には Custom Plus を選択します Custom Plus を選択した場合は納品時には Primer 及び Probe の配列は非公開になります 23

24 Custom TaqMan Gene Expression Assays Custom Plus を選択した場合は追加で特異性に関して選択を行いますインフォマティック解析によって入力した配列のみを検出するアッセイをデザインするか同じ遺伝子座に存在する他のスプライシングバリアントも検出するアッセイをデザインするかを選択します Custom Plus を選択した場合は Primer 及び Probe の配列は非公開になります ( オプション ) ターゲットの生物種とは別の生物種を 1 種類選択して別の生物種の転写産物を検出しないアッセイをデザインしますトランスジェニック実験に有用です 24

25 Custom TaqMan Gene Expression Assays 配列名を入力英数字および.-,_ で 10 文字以内この名前がチューブに記載されます特徴的な名前を入力します塩基配列を入力テキスト情報をコピー後 Ctr+Vでペーストも可 ATGCおよびNで入力 ( 最低 61bp 300bp 以上推奨最大 5000bp) 配列内にあるSNPはNでマスクターケットサイトから配列の両端へは30bp 以上確保 25

26 Custom TaqMan Gene Expression Assays 1 スケールの選択 2Check Format をクリック 26

27 Custom TaqMan Gene Expression Assays 正確に入力した場合 Valid の表示になります 1 つの配列に複数のターケットサイトを入力できますがテサインが最適である 1 つのアッセイのみ出荷されますチューブやアッセイ情報には Name( この例では GA001) が記載されますターケットサイトの上下流 5bp には N を入力することはできません Target の追加が可能 Target 情報の入力 Target(Probeの位置 ) を指定しない場合は Automaticを選択します自動設定されます Target(Probeの位置 ) を指定する場合は Manualを選択します Target Positionには 5 末端より何塩基目がターケットサイトであるかを入力 Target Nameにはターケット名を英数字 4 文字以内で入力複数のTargetを指定してもテサインが最適である1つのアッセイのみ出荷されます 27

28 Custom TaqMan Gene Expression Assays Submit For Assay Design をクリック 28

29 Custom TaqMan Gene Expression Assays Username/Password はインターネットオーダー用のユーザー ID を使用 (4 ページ参照 ) Username Password を入力後 Login をクリックご注文の続きは P.12 Assays オーダー方法を参照ください 29

30 30 カスタムデザインでのオーダー

カスタムデザインでのオーダー以下のサイトへアクセスします https://www5.appliedbiosystems.

31 カスタムデザインでのオーダー以下のサイトへアクセスします目的 Assays の Enter Custom Primer/Probe Pair をクリック 31

32 カスタムデザインでのオーダー Primer/Probe の入れ値を入力します注 : TaqManGeneExpression 製品のカスタムデザイン画面には Probe2 の入力項目はございません AssayName/Primer/Probe 情報を入力後 Check Format をクリック 32

33 カスタムデザインでのオーダー入力に問題がなければ Valid が表示されます重要 : ヒト Y 染色体上の SNP アッセイは Non-Human 製品としてご注文ください生物種の選択他のアッセイの入力は Add New Sequence をクリックオーダーを進めるには Submit をクリック 33

34 カスタムデザインでのオーダー Username/Password はインターネットオーダー用のユーザー ID を使用 (4 ページ参照 ) Username Password を入力後 Login をクリックご注文の続きは P.12 Assays オーダー方法を参照ください 34

35 35 デザイン済みアッセイの再注文

デザイン済みアッセイの再注文以下のサイトへアクセスします https://www5.

36 デザイン済みアッセイの再注文以下のサイトへアクセスします Reorder Existing Custom Assays をクリック 36

37 デザイン済みアッセイの再注文 Click here to log in をクリック 37

38 デザイン済みアッセイの再注文 Username/Password はインターネットオーダー用のユーザー ID を使用 (4 ページ参照 ) Username Password を入力後 Login をクリック 38

39 デザイン済みアッセイの再注文 Search Term(Assay ID 等 ) を入力後 Search をクリック検索結果ご注文の続きは P.15 Assays オーダー方法を参照ください 39

40 40 デザイン済みアッセイの閲覧

デザイン済みアッセイの閲覧以下のサイトへアクセスします https://www5.appliedbiosystems.

41 デザイン済みアッセイの閲覧以下のサイトへアクセスします View All Submitted Custom Design Jobs をクリック 41

42 デザイン済みアッセイの閲覧 Click here to log in をクリック 42

43 デザイン済みアッセイの閲覧 Username/Password はインターネットオーダー用のユーザー ID を使用 (4 ページ参照 ) Username Password を入力後 Login をクリック 43

44 デザイン済みアッセイの閲覧 Refresh Batch List をクリック 44

45 デザイン済みアッセイの閲覧確認したい Batch ID をクリック Assay ID を確認できますご注文を行う場合は P.15 Assays オーダー方法を参照ください 45

46 研究用にのみ使用できます診断目的およびその手続き上での使用は出来ません The trademarks mentioned herein are the property of Life Technologies Corporation or their respective owners. TaqMan is a registered trademark of Roche Molecular Systems, Inc. 本誌に記載の社名および製品名は弊社または各社の商標または登録商標です 2010 Life Technologies Japan Ltd,. All rights reserved. 46

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