Microsoft PowerPoint - 3_SDTMの基礎.pptx

Transcription

1 SDTMの 基 礎 2014 年 12 月 4 日 製 薬 協 データサイエンス 部 会 タスクフォース2 サブチーム1

2 参 考 資 料 SDTM (Version 1.4) SDTM Implementation Guide (Version 3.2) CDASH (Version 1.1) SAS SDTMサンプルデータ 2

3 目 次 1. SDTMの 概 要 2. 基 本 構 造 3. General Observation Classes 4. Special-Purpose Domains 5. Trial Design 6. Relationships 7. SDTMへのマッピング およびマッピング 時 の 留 意 点 3

4 目 次 1. SDTMの 概 要 2. 基 本 構 造 3. General Observation Classes 4. Special-Purpose Domains 5. Trial Design 6. Relationships 7. SDTMへのマッピング およびマッピング 時 の 留 意 点 4

5 SDTMとは 当 局 申 請 時 に 提 出 する 臨 床 試 験 データセットの 標 準 モデル ( Study Data Tabulation Model ) SDTMは 紙 CRF EDCや 臨 床 検 査 データ ECG 等 の 電 子 転 送 データと 少 しの 加 工 ( 派 生 ) 変 数 が 含 まれる SDTMに 格 納 するべきデータはSDTMガイダンス 文 書 に 従 うも のとし 依 頼 者 の 判 断 で 変 数 を 追 加 してはいけない 欠 測 値 は 欠 測 のままとし データを 補 完 してはいけない CRF EDC Lab ECG DB データセット(SDTM) 5

6 SDTM 関 連 ドキュメント 2つのドキュメントにより 構 成 されている 1SDTM(モデルガイダンス) 2SDTM Implementation Guide( 実 装 ガイド) * SDTM IG と 呼 ばれる 6

7 SDTM IG の 構 成 各 ドメインの 標 準 を 説 明 した 実 装 ガイド SDTM 標 準 の 臨 床 試 験 データセットの 構 成 構 造 および フォーマットを 導 くためのもの Section Theme 1 Introduction 2 Fundamentals of the SDTM 3 Submitting Data in Standard Format 4 Assumptions For Domain Models 5 Models for Special-Purpose Domains 6 Domain Models Based on the General Observation Classes 7 Trial Design Datasets 8 Representing Relationships and Data 7

8 目 次 1. SDTMの 概 要 2. 基 本 構 造 3. General Observation Classes 4. Special-Purpose Domains 5. Trial Design 6. Relationships 7. SDTMへのマッピング およびマッピング 時 の 留 意 点 8

9 クラスとドメイン Interventions CM: Concomitant Medications EX: Exposure EC: Exposure as Collected PR: Procedures SU: Substance Use Events AE: Adverse Events CE:Clinical Events DS: Disposition DV:Deviations HO: Healthcare Encounters MH: Medical History Findings DA:Drug Accountability DD: Death Details EG: Electrocardiogram IE: Inclusion/Exclusion Criteria Not Met IS: The Immunogenicity Specimen Assessments LB: Laboratory Test Results MB MS:Microbiology MI: Microscopic Findings MO Morphology PC PP:Pharmacokinetics PE: Physical Exam QS: Questionnaires RP: Reproductive System Findings SC:Subject Characteristics SS: Subect Status TU TR TS: Oncology Domains VS: Vital Signs Special Purpose CO:Comments DM:Demographics SE:Subject Elements SV:Subject Visits Relationships SUPPQUAL RELREC Trial Design TE:Trial Elements TA:Trial Arms TV:Trial Visits TX:Trial Sets(X) TI:Trial Inclusion/Exclusion TS:Trial Summary 9

10 クラスとドメイン Interventions Findings CM: Concomitant Medications DA:Drug Accountability EX: Exposure DD: Death Details EC: Exposure as Collected EG: Electrocardiogram PR: Procedures SU: Substance Use IE: Inclusion/Exclusion Criteria Not Met IS: The Immunogenicity Specimen Assessments LB: Laboratory Test Results General Observation Classes Events AE: Adverse Events CE:Clinical Events DS: Disposition DV:Deviations HO: Healthcare Encounters MH: Medical History MB MS:Microbiology MI: Microscopic Findings MO Morphology PC PP:Pharmacokinetics PE: Physical Exam QS: Questionnaires RP: Reproductive System Findings SC:Subject Characteristics SS: Subect Status TU TR TS: Oncology Domains VS: Vital Signs Special Purpose CO:Comments DM:Demographics SE:Subject Elements SV:Subject Visits Relationships Special-Purpose Domains SUPPQUAL RELREC Trial Design TE:Trial Elements TA:Trial Arms TV:Trial Visits TX:Trial Sets(X) TI:Trial Inclusion/Exclusion TS:Trial Summary 10

11 SDTM IG 各 ドメインの 変 数 の 定 義 SDTM IGでは 各 データセットで 使 用 される 変 数 の 定 義 (メタデータ)について 説 明 している メタデータは Define-XML というデータモデルガイダンスとして 当 局 に 提 出 する 主 なメタデータ 属 性 は 以 下 の 通 り 11

12 SDTM IG 各 ドメインの 変 数 の 定 義 SDTM IGでは 各 データセットで 使 用 される 変 数 の 定 義 (メタデータ)について 説 明 している メタデータは Define-XML というデータモデルガイダンスとして 当 局 に 提 出 する 主 なメタデータ 属 性 は 以 下 の 通 り 変 数 名 8 文 字 まで 変 数 ラベル 40 文 字 まで 文 字 or 数 字 値 や 変 数 の 表 示 形 式 役 割 識 別 子 トピック 修 飾 子 タイミング ルール その 変 数 が 必 須 か 否 かの 定 義 Required(Req): 必 須 Null 非 許 容 Expected(Exp): 必 須 Null 許 容 Permissible(Per): 任 意 12

13 Controlled Terminology (CT) すべてのCDISC データモデルに 対 応 した 用 語 体 系 NCI EVS によって 管 理 され,CDISC による 新 しい 標 準,プロセ ス, 手 順 の 開 発 に 応 じて3ヶ 月 毎 に 更 新 されている. ( 13

14 Controlled Terminology (CT) すべてのCDISC データモデルに 対 応 した 用 語 体 系 NCI EVS によって 管 理 され,CDISC による 新 しい 標 準,プロセ ス, 手 順 の 開 発 に 応 じて3ヶ 月 毎 に 更 新 されている. ( 14

15 Controlled Terminology (CT) すべてのCDISC データモデルに 対 応 した 用 語 体 系 NCI EVS によって 管 理 され,CDISC による 新 しい 標 準,プロセ ス, 手 順 の 開 発 に 応 じて3ヶ 月 毎 に 更 新 されている. ( 15

16 Controlled Terminology (CT) SDTM IGにて 各 変 数 毎 に 用 いるべきCTが 規 定 されている 使 用 したCTはメタデータの 一 部 として 記 録 する 16

17 Controlled Terminology (CT) SDTM IGにて 各 変 数 毎 に 用 いるべきCTが 規 定 されている 使 用 したCTはメタデータの 一 部 として 記 録 する 外 部 コードリストの 名 称 依 頼 者 独 自 のCT またはCDISCのCT チームが 今 後 開 発 するであろうCT 17

18 SDTM 一 般 的 な 変 数 : 識 別 子 18

19 SDTM 一 般 的 な 変 数 : 識 別 子 SEQは 代 理 キーで 全 てのGeneral Observation ClassesのデータセットにおいてSTUDYID USUBJID DOMAIN SEQの4 個 のキーでレコードをユニーク に 識 別 するために 作 られた 19

20 SDTM 一 般 的 な 変 数 :トピック その 中 オブザーベーションの 主 役 となる 変 数 クラスによりトピックの 接 尾 辞 が 決 まっている Class Topic Example Intervention Class ( 介 入 オブザーベーションクラス) --TRT CMTRT( 併 用 薬 名 ) EXTRT( 治 験 薬 名 ) Event Class ( 事 象 オブザーベーションクラス) Findings Class ( 観 察 / 検 査 オブザーベーションクラス) --TERM -- TESTC D AETERM( 有 害 事 象 名 ) MHTERM( 既 往 合 併 症 名 ) LBTESTCD( 臨 床 検 査 名 ) VSTESTCD(バイタル 検 査 名 ) Demographics ( 被 験 者 背 景 ドメイン) Comments (コメントドメイン) SUBJID COVAL 被 験 者 ID コメント 本 文 20

21 SDTM 一 般 的 な 変 数 :トピック その 中 オブザーベーションの 主 役 となる 変 数 クラスによりトピックの 接 尾 辞 が 決 まっている Class Topic --にはドメインコードに 基 づく Example 2 文 字 が 接 頭 語 として 入 る Intervention Class ( 介 入 オブザーベーションクラス) --TRT CMTRT( 併 用 薬 名 ) EXTRT( 治 験 薬 名 ) Event Class ( 事 象 オブザーベーションクラス) Findings Class ( 観 察 / 検 査 オブザーベーションクラス) --TERM -- TESTC D AETERM( 有 害 事 象 名 ) MHTERM( 既 往 合 併 症 名 ) LBTESTCD( 臨 床 検 査 名 ) VSTESTCD(バイタル 検 査 名 ) Demographics ( 被 験 者 背 景 ドメイン) Comments (コメントドメイン) SUBJID COVAL 被 験 者 ID コメント 本 文 21

22 SDTM 一 般 的 な 変 数 : 修 飾 子 レコードの 特 徴 や 結 果 を 示 す 変 数 目 的 に 応 じて5つのサブクラスに 分 類 される サブクラス 変 数 の 例 目 的 Grouping Qualifiers (グループ 化 修 飾 子 ) Result Qualifiers ( 結 果 修 飾 子 ) Synonym Qualifiers ( 同 義 語 修 飾 子 ) Record Qualifiers (レコード 修 飾 子 ) Variable Qualifiers ( 変 数 修 飾 子 ) CAT SCAT ORRES STRESC TRT/ TERM MODIFY DECOD AE REASND AESLIFE DM AGE SEX RACE ORRES ORRESSU ORNRHI ORNRLO DOSE DOSU 同 一 ドメイン 内 のオブザーベーションを グループ 化 する トピック 変 数 に 関 連 する 結 果 を 示 す オブザーベーションで 特 定 の 変 数 に 代 替 名 を 指 定 する レコード 全 体 への 追 加 属 性 を 定 義 する 特 定 の 変 数 をさらに 変 更 もしくは 説 明 する 22

23 SDTM 一 般 的 な 変 数 : 修 飾 子 レコードの 特 徴 や 結 果 を 示 す 変 数 目 的 に 応 じて5つのサブクラスに 分 類 される サブクラス 変 数 の 例 の 臨 床 検 査 結 果 を 入 力 する 目 的 Grouping Qualifiers (グループ 化 修 飾 子 ) Result Qualifiers ( 結 果 修 飾 子 ) Synonym Qualifiers ( 同 義 語 修 飾 子 ) Record Qualifiers (レコード 修 飾 子 ) Variable Qualifiers ( 変 数 修 飾 子 ) CAT SCAT ORRES STRESC TRT/ TERM MODIFY DECOD AE REASND AESLIFE DM AGE SEX RACE ORRES ORRESSU ORNRHI ORNRLO DOSE DOSU LBORRESの 場 合 オリジナル 単 位 例 : 120 <1 POS 同 一 ドメイン 内 のオブザーベーションを グループ 化 する トピック 変 数 に 関 連 する 結 果 を 示 す オブザーベーションで 特 定 の 変 数 に 代 替 名 を 指 定 する レコード 全 体 への 追 加 属 性 を 定 義 する 特 定 の 変 数 をさらに 変 更 もしくは 説 明 する 23

24 SDTM 一 般 的 な 変 数 :タイミング 24

25 SDTM 一 般 的 な 変 数 :タイミング ISO8601の 例 : Dec 15, 2003, 13:14:17 PM T13:14:17 25

26 SDTM 変 数 の 分 類 その 変 数 が 必 須 であるか 任 意 であるかを 定 義 する Core 略 語 説 明 Required ( 必 須 ) Expected ( 要 望 ) Permissible (オプション) Req Exp Perm データセットに 必 ず 含 まれ ヌル 値 のレコードは 許 容 されない データセットに 必 ず 含 まれる データが 収 集 されな かった 場 合 はヌル 値 を 許 容 する Nullの 場 合 は define.xmlにコメントすべき 該 当 するデータが 収 集 導 出 された 場 合 にドメインに 作 成 される 変 数 の 値 が 全 てヌル 値 であった 場 合 依 頼 者 の 判 断 でその 変 数 を 作 成 するかを 決 めること ができる データが 収 集 されている 場 合 は 必 ず 変 数 を 作 成 する 26

27 オブザーベーションと 変 数 の 構 成 General Observation Classes Events Adverse Events 識 別 子 トピック 修 飾 子 変 数 の 順 番 も 標 準 の 一 部 である 修 飾 子 タイミング 27

28 目 次 1. SDTMの 概 要 2. 基 本 構 造 3. General Observation Classes 4. Special-Purpose Domains 5. Trial Design 6. Relationships 7. SDTMへのマッピング およびマッピング 時 の 留 意 点 28

29 General Observation Classes Interventions CM: Concomitant Medications EX: Exposure EC: Exposure as Collected PR: Procedures SU: Substance Use Events AE: Adverse Events CE:Clinical Events DS: Disposition DV:Deviations HO: Healthcare Encounters MH: Medical History Findings DA:Drug Accountability DD: Death Details EG: Electrocardiogram IE: Inclusion/Exclusion Criteria Not Met IS: The Immunogenicity Specimen Assessments LB: Laboratory Test Results MB MS:Microbiology MI: Microscopic Findings MO Morphology PC PP:Pharmacokinetics PE: Physical Exam QS: Questionnaires RP: Reproductive System Findings SC:Subject Characteristics SS: Subect Status TU TR TS: Oncology Domains VS: Vital Signs Special Purpose Interventions CO:Comments Events Findings DM:Demographics SE:Subject の3つの Elements 一 般 クラ SV:Subject スから Visits 成 り 試 験 期 間 中 に 集 められ た Relationships 情 報 のほとんど が 入 力 される SUPPQUAL RELREC 共 通 Trial の 識 Design 別 子 タ イミング 変 数 を 有 TE:Trial Elements TA:Trial する Arms 変 数 名 には TV:Trial ドメインコードに Visits 基 TX:Trial づく2 Sets(X) 文 字 が 接 頭 TI:Trial 語 として Inclusion/Exclusion 入 る TS:Trial Summary 29

30 General Observation Classes Identifier Topic Qualifier Timing STUDYID / 試 験 識 別 子 DOMAIN / ドメイ ン 略 語 USUBJID / 被 験 者 識 別 子 ( 全 申 請 試 験 ) SEQ / シーケ ンス 番 号 Interventionsクラス TRT / 治 療 名 Eventsクラス TERM / 報 告 用 語 Findingsクラス TESTCD / 測 定 検 査 または 試 験 の 省 略 名 Topicに 応 じ たQualifier VISITNUM / ビジット 番 号 VISIT / ビジット 名 VISITDY / 計 画 されたビジットのスタディ デイ TAETORD / 計 画 されたARM 中 のElement 順 EPOCH / Epoch DTC / 取 得 日 時 STDTC / 開 始 日 時 ENDTC / 終 了 日 時 DY / スタディ デイ STDY / 開 始 スタディ デイ ENDY / 終 了 スタディ デイ DUR / 持 続 時 間 TPT / 計 画 された 時 点 名 TPTNUM / 計 画 された 時 点 番 号 ELTM / 参 照 時 点 からの 計 画 された 経 過 時 間 TPTREF / 参 照 時 点 RFTDTC / 参 照 時 点 の 日 時 STRF / 参 照 期 間 からの 相 対 開 始 時 ENRF / 参 照 期 間 からの 相 対 終 了 時 EVLINT / 評 価 間 隔 STRTPT / 参 照 時 点 からの 相 対 開 始 時 STTPT / 参 照 時 点 開 始 日 時 ENRTPT / 参 照 時 点 からの 相 対 終 了 時 30

31 General Observation Classes Identifier Topic Qualifier Timing STUDYID / 試 験 識 別 子 DOMAIN / ドメイ ン 略 語 USUBJID / 被 験 者 識 別 子 ( 全 申 請 試 験 ) SEQ / シーケ ンス 番 号 これら4 個 の 識 別 子 は 必 須 Interventionsクラス TRT / 治 療 名 CM/EX/SU Eventsクラス TERM / 報 告 用 語 AE/DS/MH/ DV/CE Findingsクラス TESTCD / 測 定 検 査 または 試 験 の 省 略 名 EG/IE/LB/PE/QS/SC/V S/DA/TU/TR/DR/MB/ MS/PC/PP/FA Topicに 応 じ たQualifier IGで 制 限 され れている 一 部 の 変 数 以 外 は General Observation Classesのどの ドメインでも 追 加 可 能 VISITNUM / ビジット 番 号 VISIT / ビジット 名 VISITDY / 計 画 されたビジットのスタディ デイ TAETORD / 計 画 されたARM 中 のElement 順 EPOCH / Epoch DTC / 取 得 日 時 STDTC / 開 始 日 時 ENDTC / 終 了 日 時 DY / スタディ デイ STDY / 開 始 スタディ デイ ENDY / 終 了 スタディ デイ DUR / 持 続 時 間 TPT / 計 画 された 時 点 名 TPTNUM / 計 画 された 時 点 番 号 ELTM / 参 照 時 点 からの 計 画 された 経 過 時 間 TPTREF / 参 照 時 点 RFTDTC / 参 照 時 点 の 日 時 STRF / 参 照 期 間 からの 相 対 開 始 時 ENRF / 参 照 期 間 からの 相 対 終 了 時 EVLINT / 評 価 間 隔 STRTPT / 参 照 時 点 からの 相 対 開 始 時 STTPT / 参 照 時 点 開 始 日 時 ENRTPT / 参 照 時 点 からの 相 対 終 了 時 31

32 目 次 1. SDTMの 概 要 2. 基 本 構 造 3. General Observation Classes 4. Special-Purpose Domains 5. Trial Design 6. Relationships 7. SDTMへのマッピング およびマッピング 時 の 留 意 点 32

33 Demographics Interventions Findings CM: Concomitant Medications DA:Drug Accountability EX: Exposure DD: Death Details EC: Exposure as Collected EG: Electrocardiogram PR: Procedures SU: Substance Use IE: Inclusion/Exclusion Criteria Not Met 被 験 者 の 基 本 的 な 特 性 について 説 明 IS: The Immunogenicity Specimen Assessments するドメイン LB: Laboratory Test Results Events MO Morphology 規 定 された 構 造 で 標 準 化 されたオブ PC PP:Pharmacokinetics ザーベーションのセットが PE: Physical 含 Exam まれなけ ればならない AE: Adverse Events CE:Clinical Events DS: Disposition DV:Deviations HO: Healthcare Encounters MH: Medical History MB MS:Microbiology MI: Microscopic Findings QS: Questionnaires RP: Reproductive System Findings SC:Subject Characteristics SS: Subect Status TU TR TS: Oncology Domains VS: Vital Signs Special Purpose CO:Comments DM:Demographics SE:Subject Elements SV:Subject Visits Relationships SUPPQUAL RELREC Trial Design TE:Trial Elements TA:Trial Arms TV:Trial Visits TX:Trial Sets(X) TI:Trial Inclusion/Exclusion TS:Trial Summary 33

34 Demographics Identifier Topic Qualifier Timing STUDYID / 試 験 識 別 子 DOMAIN / ドメイン 略 語 USUBJID / 被 験 者 識 別 子 ( 全 申 請 試 験 ) SUBJID / 被 験 者 識 別 子 ( 試 験 内 ) RFSTDTC / 被 験 者 の 参 照 開 始 日 時 RFENDTC / 被 験 者 の 参 照 終 了 日 時 RFXSTDTC / 初 回 試 験 の 治 療 開 始 日 時 RFXENDTC / 初 回 試 験 の 治 療 終 了 日 時 RFICDTC / 同 意 取 得 日 RFPENDTC / 治 験 終 了 日 DTHDTC / 死 亡 日 DTHFL / 被 験 者 死 亡 フラグ SITEID / 施 設 識 別 子 INVID / 治 験 責 任 医 師 等 識 別 子 INVNAM / 治 験 責 任 医 師 等 名 BRTHDTC / 生 年 月 日 AGE / 年 齢 AGEU / 年 齢 単 位 SEX / 性 別 RACE / 人 種 ETHNIC / 民 族 ARMCD / 計 画 されたARMコード ARM / 計 画 されたARMの 記 述 ACTARMCD / 実 際 のARMコード ACTARM / 実 際 のARMの 記 述 COUNTRY / 国 DMDTC /Demographicの 取 得 日 時 DMDY / 取 得 のス タディ デイ 赤 :Req 橙 :Exp 黒 :Perm 34

35 Demographics Identifier Topic Qualifier Timing STUDYID / 試 験 識 別 子 DOMAIN / ドメイン 略 語 USUBJID / 被 験 者 識 別 子 ( 全 申 請 試 験 ) 赤 :Req 橙 :Exp 黒 :Perm SUBJID / 被 験 者 識 別 子 ( 試 験 内 ) RFSTDTC / 被 験 者 の 参 照 開 始 日 時 RFENDTC / 被 験 者 の 参 照 終 了 日 時 RFXSTDTC / 初 回 試 験 の 治 療 開 始 日 時 DMDTC /Demographicの 取 参 照 開 得 始 日 時 = 投 与 開 始 日 と なることが DMDY 多 い / 取 得 のス RFXENDTC / 初 回 試 験 の 治 療 終 了 日 タディ デイ 時 参 照 終 了 日 = 被 験 者 の 試 RFICDTC / 同 意 取 得 日 験 終 了 が 決 定 した 日 最 終 RFPENDTC / 治 験 終 了 日 治 験 薬 投 与 日 など DTHDTC / 死 亡 日 DTHFL / 被 験 者 死 亡 フラグ SITEID / 施 設 識 別 ACTARM 子 INVID / 治 験 責 任 医 師 等 識 別 子 割 付 せず:NOT ASSIGNED INVNAM / 治 験 責 任 医 師 等 名 BRTHDTC / 生 年 スクリーニング 月 日 不 適 格 :SCREEN FAILURE AGE / 年 齢 投 与 せず:NOT TREATED AGEU / 年 齢 単 位 SEX / 性 別 RACE / 人 種 ETHNIC / 民 族 ARMCD / 計 画 されたARMコード ARM / 計 画 されたARMの 記 述 ACTARMCD / 実 際 のARMコード ACTARM / 実 際 のARMの 記 述 COUNTRY / 国 35

36 スタディ デイ 変 数 スタディ デイ 変 数 ( DY, STDY, ENDY)は 被 験 者 の 参 照 開 始 日 付 (RFSTDTC)をDay1として 起 算 した 相 対 日 数 で 記 述 する RFSTDTC DTC STDTC ENDTC 参 照 開 始 日 ( 投 与 開 始 日 と なることが 多 い) DY, STDY, ENDY Day 0 は 存 在 しない イベント 発 生 日 DTC >= RFSTDTCの 場 合 : DY = DTC RFSTDTC + 1 DTC < RFSTDTCの 場 合 : DY = DTC RFSTDTC 36

37 目 次 1. SDTMの 概 要 2. 基 本 構 造 3. General Observation Classes 4. Special-Purpose Domains 5. Trial Design 6. Relationships 7. SDTMへのマッピング およびマッピング 時 の 留 意 点 37

38 Trial Design Datasets Interventions Findings CM: Concomitant Medications DA:Drug Accountability EX: ICH ExposureE3で 要 求 されている DD: Death Details全 体 的 EC: Exposure as Collected EG: Electrocardiogram な 臨 床 試 験 の 計 画 とデザインを 説 明 するためのもの PR: Procedures SU: Substance Use IE: Inclusion/Exclusion Criteria Not Met IS: The Immunogenicity Specimen Assessments LB: Laboratory Test Results 個 々の 被 験 者 からではなく プロ MB MS:Microbiology MI: Microscopic Findings Events トコールから 得 られる MO Morphology 情 報 に 基 づ AE: Adverse Events PC PP:Pharmacokinetics CE:Clinical いて Events 作 成 する PE: Physical Exam DS: Disposition 異 なる 試 験 のデザインを QS: Questionnaires 比 較 し DV:Deviations RP: Reproductive System Findings HO: Healthcare Encounters SC:Subject Characteristics MH: Medical History SS: Subect Status たり 計 画 の 治 療 と 実 際 の 治 療 を 比 較 するのに 有 用 TU TR TS: Oncology Domains VS: Vital Signs Special Purpose CO:Comments DM:Demographics SE:Subject Elements SV:Subject Visits Relationships SUPPQUAL RELREC Trial Design TE:Trial Elements TA:Trial Arms TV:Trial Visits TX:Trial Sets(X) TI:Trial Inclusion/Exclusion TS:Trial Summary 38

39 Trial Designの 概 念 (TE,TA,TV) Screening Epoch Run-in Epoch Treatment Epoch Trial Epochs 計 画 された 被 験 者 の 参 加 期 間 Placebo arm A arm Barm Trial Visits Trial Elements Screen Run-in Placebo Screen Run-in Drug A Screen Run-in Drug B Screen Run-in Placebo Drug A Drug B 試 験 開 始 前 に 作 成 Trial Arms(TA) 個 々のArmのElementの 名 称 順 番 Armに 含 ま れるための 条 件 などを 記 載 する 実 際 のデータはDMドメイ ンに 保 管 Trial Visit(TV) 個 々のArmの 計 画 された Visitを 記 載 する 実 際 のデータはSVドメイン に 保 管 Trial Elements(TE) 各 Elementの 開 始 と 終 了 のルールを 記 載 する 実 際 のデータはSEドメイ ンに 保 管 39

40 Trial Designの 概 念 (TI TS TD) TI(Trial Inclusion/Exclusion Criteria) 選 択 基 準 除 外 基 準 を 記 載 TS(Trial Summary Information ) 試 験 概 要 (フェーズ 実 施 計 画 書 のタイトル 設 計 目 標 )を 記 載 TD(Trial Disease Assessments) 有 効 性 の 評 価 の 時 期 を 記 載 40

41 目 次 1. SDTMの 概 要 2. 基 本 構 造 3. General Observation Classes 4. Special-Purpose Domains 5. Trial Design 6. Relationships 7. SDTMへのマッピング およびマッピング 時 の 留 意 点 41

42 Relationships Interventions Findings CM: Concomitant Medications DA:Drug Accountability EX: Exposure DD: Death Details EC: Exposure as Collected PR: Procedures EG: Electrocardiogram データセットまたはレコード 間 の IE: Inclusion/Exclusion Criteria Not Met IS: The Immunogenicity Specimen Assessments 関 係 性 を 示 す 場 合 に 使 用 する SU: Substance Use LB: Laboratory Test Results ( 非 標 準 変 数 と 親 ドメインの 関 連 付 MB MS:Microbiology MI: Microscopic Findings Events け 異 なるドメインのレコード MO Morphology 間 の 関 AE: Adverse Events PC PP:Pharmacokinetics CE:Clinical 連 付 け Events 等 ) PE: Physical Exam DS: Disposition QS: Questionnaires DV:Deviations RP: Reproductive System Findings HO: Healthcare Encounters SC:Subject Characteristics MH: Medical History SS: Subect Status TU TR TS: Oncology Domains VS: Vital Signs Special Purpose CO:Comments DM:Demographics SE:Subject Elements SV:Subject Visits Relationships SUPPQUAL RELREC Trial Design TE:Trial Elements TA:Trial Arms TV:Trial Visits TX:Trial Sets(X) TI:Trial Inclusion/Exclusion TS:Trial Summary 42

43 Related Records(RELREC) RELRECデータセットは 1 個 別 のドメインでユニークなレコードを 関 連 付 ける 例 ) 特 定 の 有 害 事 象 に 対 する 特 定 の 併 用 薬 剤 2 関 連 するレコードを 結 びつけるための 変 数 として RDOMAIN IDVAR IDVARVALを 使 用 する 43

44 RELRECデータセットの 変 数 変 数 名 変 数 ラベル 説 明 STUDYID Study Identifier 試 験 におけるユニークな 識 別 子 RDOMAIN Related Domain 親 ドメインを 表 す2 文 字 の 略 語 USUBJID IDVAR IDVARVAL RELTYPE RELID Unique Subject Identifier Identifying Variable Identifying Variable Value Relationship Type Relationship Identifier 申 請 の 対 象 となった 全 ての 試 験 にわたってユニークな 被 験 者 を 識 別 するID 親 レコードを 特 定 するGeneral Observation Classデータセット の 識 別 変 数 の 名 称 例 ) SEQ GRPID 識 別 変 数 の 値 レコードの 階 層 レベルを 識 別 する 値 はONEかMANYのど ちらかである データセット 間 の 関 係 を 特 定 するときのみ 必 要 関 係 を 識 別 するUSUBJID 内 のユニーク 値 同 じRELIDを 持 つ 同 じUSUBJIDに 対 する 全 てのレコードが 関 係 する/ 対 応 する と 考 えられる 44

45 RELRECの 例 被 験 者 0001の 入 院 レコード(HOSEQ = 1)は 有 害 事 象 (AESEQ = 7) と 結 びついている これらのレコードはRELID AEHOSP1によって 関 連 付 けられている STUDYID DOMAIN USUBJID IDVAR IDVARVAL RELTYPE RELID HO HOSEQ 1 AEHOSP AE AESEQ 7 AEHOSP HO HOSEQ 2 AEHOSP AE AESEQ 11 AEHOSP2 被 験 者 001の 入 院 レコード(HOSEQ = 2)は 有 害 事 象 (AESEQ = 11)と 結 びついている これらのレコードはRELID AEHOSP2によって 関 連 付 けられている 45

46 Supplemental Qualifiers(SUPPQUAL) SDTMは 親 ドメイン( 標 準 )に 非 標 準 の 変 数 を 追 加 して はいけない Supplemental Qualifiersでは 1 既 存 のSDTM 変 数 がないデータを 扱 う 2 標 準 と 非 標 準 のドメインの 両 方 を 利 用 する データセットの 名 前 はSUPP 例 )AEのSupplemental QualifiersはSUPPAE 46

47 SUPPQUALデータセットの 変 数 変 数 名 変 数 ラベル 説 明 STUDYID Study Identifier 試 験 におけるユニークな 識 別 子 RDOMAIN Related Domain Abbreviation 親 ドメインを 表 す2 文 字 の 略 語 USUBJID Unique Subject Identifier 親 レコードのUSUBJID IDVAR IDVARVAL QNAM QLABEL Identifying Variable Identifying Variable Value Qualifier Variable Name Qualifier Variable Label 親 レコードを 識 別 する 親 データセットの 中 にある 識 別 変 数 例 ) SEQ GRPID 親 レコードの 識 別 変 数 の 値 修 飾 子 変 数 の 短 い 名 称 (8 文 字 以 下 ) 親 ドメインからのデータで 見 る ドメイン 内 のカラム 名 として 使 われる 多 くはスポンサー 使 用 データ セットの 変 数 名 となる QNAMの 長 い 名 称 orラベル (40 文 字 未 満 ) 多 くはスポンサー 使 用 データセットの 変 数 ラベルとなる QVAL Data Value QNAMの 結 果 回 答 値 などを 示 す QORIG QEVAL Origin Evaluator データの 期 限 起 源 を 示 す 例 ) CRF, ASSIGNED, DERIVED 主 観 的 な( 個 人 かグループの 評 価 者 によって 判 定 された) 結 果 にだ け 使 用 される 47

48 SUPPQUALの 例 Domain = HO (Events) HO Events Dataset HOSPITALIZATION Was the subject hospitalized during this study? HOTERM Yes No Not submitted Hospital Name: General Hospital PROVNM Adminssion Date: 2001/5/4 HOSTDTC Discharge Date: 2001/12/4HOENDTC Duration of Hospitalization: 1 Hours Days WeeksHODUR AE Reported for this Episode? Yes No AEREPF Meds Prescribed? Yes No MEDSFL Procedures Performed? Yes No PROCFL Any Time in Special Unit? Yes(specify below) No SPUNFL Specialized Unit Tpe ICU ER CARDIAC REHAB SPUNCD Visit Related to Study Medical Condition? Yes No RLCNDF STUDYID DOMAIN USUBJID HOSEQ HOTERM HOSTDTC HOENDTC HODUR HO Hospitalization P1W SUPPHO Events Dataset STUDYID DOMAIN USUBJID IDVAR IDVARVAL QNAM QLABEL QVAL QORIG QEVAL HO HOSEQ 1 AEREPF AE Reported This Episode? Y CRF HO HOSEQ 1 MEDSFL Meds Prescribed? Y CRF HO HOSEQ 1 PROCFL Procedures Performed? Y CRF HO HOSEQ 1 PROVNM Provider Name General Hosp CRF HO HOSEQ 1 SPUNCD Specialized Unit Type ICU CRF HO HOSEQ 1 SPUNFL Any Time in Spec. Unit Y CRF HO HOSEQ 1 RLCNDF Related to Study Cond.? Y CRF 48

49 目 次 1. SDTMの 概 要 2. 基 本 構 造 3. General Observation Classes 4. Special-Purpose Domains 5. Trial Design 6. Relationships 7. SDTMへのマッピング およびマッピング 時 の 留 意 点 49

50 CRFとRaw Data STUDYID SCDTC BRTHDTC SEX SEXCD ETHNIC ETHNICCD RACE RACECD RACEOTHI NSUPPDM CDISC01 15Oct2003 1Nov1936Female 1Not Hispanic or Latino 2White 1 SAS SDTMサンプルデータ より 引 用 50

51 SDTM 仕 様 書 (マッピング 仕 様 書 ) SDTMの 各 項 目 の 導 出 元 変 換 式 を 規 定 する 主 にSDTM IGとControlled Terminologyを 参 照 して 作 成 する 51

52 SDTM 仕 様 書 (マッピング 仕 様 書 ) SDTMの 各 項 目 の 導 出 元 変 換 式 を 規 定 する 主 にSDTM IGとControlled Terminologyを 参 照 して 作 成 する SDTMの 変 数 BRTHDTC (Data/Time of Birth) はDB のフィールド BRTHDTC( 生 年 月 日 ) を 参 照 する RAWデータをSDTM likeのデー タベースとして 構 築 しておくことで マッピングの 効 率 が 上 がる SDTMの 変 数 AGE(Age) は RFSTDTC( 被 験 者 の 参 照 開 始 日 時 ) および BRTHDTC ( 生 年 月 日 ) より 導 出 する 52

53 SDTMデータセット STUDYID DOMAIN USUBJID SUBJID RFSTDTC RFENDTC SITEID BRTHDTC AGE AGEU SEX CDISC01 DM CDISC YEARS F CDISC01 DM CDISC YEARS F CDISC01 DM CDISC YEARS F RACE ETHNIC ARMCD ARM COUNTRY WHITE NOT HISPANIC OR LATINO WONDER20 Miracle Drug 20 mg USA BLACK OR AFRICAN AMERICAN NOT HISPANIC OR LATINO WONDER10 Miracle Drug 10 mg USA WHITE NOT HISPANIC OR LATINO SCRNFAIL Screen Failure USA 53

54 SDTMデータセット SDTMの 日 付 型 は 国 際 標 準 ISO8601 形 式 (yyyy-mm-dd)を 用 い る STUDYID DOMAIN USUBJID SUBJID RFSTDTC RFENDTC SITEID BRTHDTC AGE AGEU SEX CDISC01 DM CDISC YEARS F CDISC01 DM CDISC YEARS F CDISC01 DM CDISC YEARS F RACE ETHNIC ARMCD ARM COUNTRY WHITE NOT HISPANIC OR LATINO WONDER20 Miracle Drug 20 mg USA BLACK OR AFRICAN AMERICAN NOT HISPANIC OR LATINO WONDER10 Miracle Drug 10 mg USA WHITE NOT HISPANIC OR LATINO SCRNFAIL Screen Failure USA データは 原 則 英 語 COUNTRY など 従 来 の 国 内 試 験 では 使 用 し ない 変 数 が 必 須 とされ ている 54

55 SDTMへのマッピングまとめ CRF PMDAに 提 出 Define.XML DB CDASHが 推 奨 されている SDTMデータセット Raw Data データセットに 対 応 するメタデータも 併 せて 提 出 する SDTM 仕 様 書 (マッピング 仕 様 書 ) 55

56 Define.XML Define.XMLはメタデータを 集 約 したXML(Extensible Markup Language) 形 式 のファイル 様 々なシステム 環 境 で 読 み 取 り 可 能 なファイル 形 式 SDTM(ADaM)データの 内 容 ( 変 数, 構 造, 内 容 等 )を 定 義 する 56

57 Define.XML Variable Label Key Type Len Controlled Terms or Origin Derivation/Comment Define.XMLはメタデータを gth Format 集 約 したXML(Extensible Markup Language) Domain 形 式 のファイル text 2["DM" = Assigned Abbreviation "Demographics"] 様 々なシステム 環 境 で 読 <Domain み 取 Abbreviation り 可 能 (DM)> なファイル 形 式 2 text 14 Derived Concatenation of STUDYID and SDTM(ADaM)データの Identifier 内 容 ( 変 数, 構 造, 内 SUBJID 容 等 )を 定 義 する STUDYID Study Identifier 1 text 7 Protocol DOMAIN USUBJID Unique Subject SUBJID Subject Identifier for the Study RFSTDTC Subject Reference Start Date/Time text 6 CRF Page 3 date ISO8601 Derived RFSTDTC = first date/time of study drug, for safety subject. Null for screen failures. RFENDTC Subject Reference End Date/Time date ISO8601 Derived RFENDTC = termination date, for safety subjects. Null for screen failures. SITEID Study Site text 3 CRF Page 3 Identifier BRTHDTC Date/Time of Birth date ISO8601 CRF Page 6 AGE Age integer 2 Derived Age at Subject Reference Start Date/Time (RFSTDTC - BRTHDTC). For the complete algorithm see the referenced external document. Complex Algorithms (complexalgorithms.pdf) AGEU Age Units text 5 Assigned Defaulted to YEARS 57

58 Define.XML Variable Label Key Type Len Controlled Terms or Origin Derivation/Comment Define.XMLはメタデータを gth Format 集 約 したXML(Extensible Markup Language) Domain 形 式 のファイル text 2["DM" = Assigned Abbreviation "Demographics"] 様 々なシステム 環 境 で 読 <Domain み 取 Abbreviation り 可 能 (DM)> なファイル 形 式 2 text 14 Derived Concatenation of STUDYID and SDTM(ADaM)データの Identifier 内 容 ( 変 数, 構 造, 内 SUBJID 容 等 )を 定 義 する STUDYID Study Identifier 1 text 7 Protocol DOMAIN USUBJID Unique Subject SUBJID Subject Identifier for the Study RFSTDTC Subject Reference Start Date/Time RFENDTC Subject Reference End Date/Time text 6 CRF Page 3 CRF: 直 接 CRFで 集 めたもの または 事 前 にCRFに 注 釈 をつけているもの(VISIT SITEID 等 ) date ISO8601 Derived RFSTDTC = first date/time of study drug, for safety subject. Null for screen failures. date ISO8601 Derived RFENDTC = termination date, for safety subjects. Null for screen failures. SITEID Study Site text 3 CRF Page 3 edt: 電 Identifier 子 データを 臨 床 検 査 施 設 等 から 受 け 取 ったもの BRTHDTC Date/Time of Birth date ISO8601 CRF Page 6 AGEDerived: Age導 出 値 integer 2 Derived Age at Subject Reference Start Assigned: 個 別 の 判 断 による 値 (スポンサーが 追 加 した 判 定 結 果 コーディング 結 果 ) Protocol:プロトコルからの 値 Date/Time (RFSTDTC - BRTHDTC). For the complete algorithm see the referenced external document. Complex Algorithms (complexalgorithms.pdf) AGEU Predecessor: Age Units 他 のデータセットの text変 数 をコピーしたもの 5 Assigned Defaulted to YEARS 58

59 CDASHとSDTM CDASH (Clinical Data Acquisition Standards Harmonization) データ 収 集 の 標 準 化 を 促 進 する 収 集 データと 提 出 用 データ(SDTM)との 間 のトレーサ ビリティの 確 保 を 容 易 にする CDASH DB SDTM 当 局 収 集 提 出 データ 収 集 の 標 準 データ 提 出 の 標 準 59

60 CDASHとSDTMのトレーサビリティ SDTM SDTM Define.XML Variable Label Key Type Len Controlled Terms or Origin Derivation/Comment gth Format STUDYID Study Identifier 1 text 7 Protocol DOMAIN Domain text 2["DM" = Assigned Annotated Abbreviation CRF "Demographics"] <Domain Abbreviation (DM)> USUBJID Unique Subject Identifier 2 text 14 Derived Concatenation of STUDYID and SUBJID SUBJID Subject Identifier text 6 CRF Page 3 for the Study RFSTDTC Subject Reference Start Date/Time date ISO8601 Derived RFSTDTC = first date/time of study drug, for safety subject. Null for screen failures. RFENDTC Subject Reference date ISO8601 Derived RFENDTC = termination date, End Date/Time CDASHはSDTMと for safety 同 subjects. じドメインを Null for screen failures. 使 用 している Define.XMLを 介 して 容 易 にデー タのOriginを 辿 ることが 可 能 60

61 CDASHとSDTMの 関 係 性 1 SDTMのドメインごとに CRFが 構 成 されている わけではない 1つのCRFが 複 数 の SDTMドメインで 構 成 さ れる 場 合 もある 61

62 CDASHとSDTMの 関 係 性 2 Visit 1 Laboratory Test Results Visit 2 Visit 3 複 数 のCRFに 散 在 してい る 同 じトピックのデータを SDTMの 単 一 ドメインとし てまとめる LB:Laboratory Test Results 62

63 CDASHとSDTMの 関 係 性 3 STUDYID SUBJID SITEID Study Drug Administration Infusion ECSTDTC YYYY-MM-DDTHH:MM:SS Oxaliplatin Start Date Start Time End Date End Time DD-MM-YYYY HH:MM:SS DD-MM-YYYY HH:MM:SS 複 数 のフィールドで 収 集 するデータをSDTMに 格 納 する 際 にISO8601 形 式 で 連 結 する ECENDTC YYYY-MM-DDTHH:MM:SS 63

64 CDASHとSDTMの 関 係 性 4 AE:Adverse Events(non-CDASH) STUDYID SUBJID SITEID Adverse Events Where there any Adverse Events? Start Date DD-MM-YYYY End Date DD-MM-YYYY Treatment stopped Action Taken Rescue med given AEACN Subject moved to CCU Y N CRFデザインの 際 には Controlled Terminologyを 用 いることでマッピングが 容 易 になる AE:Adverse Events(CDASH) Action Taken with Study Dose Reduced Treatment AEACN Drug Withdrawn Dose Not Changed Other Action Taken Physical Therapy ordered AEACNOTH Subject moved to home care Oter, Specify: Concomitant treatment given? AECONTRT Y N 64

65 おわりに CDISC 対 応 を 円 滑 に 進 めるための 基 礎 として SDTM ガイダンス 文 書 への 理 解 を 深 めることが 必 要 不 可 欠 です 次 回 勉 強 会 ではCustom Domains 作 成 など 応 用 的 な 内 容 を 取 り 扱 う 予 定 です その 他 テーマのご 要 望 がございましたらアンケートに てご 提 案 下 さい 65