STN新プラットフォーム 化学物質検索 - 基礎
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- まな きちや
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1 STN 新 プラットフォーム 化 学 物 質 検 索 基 礎 2016 年 8 月
2 *** 目 次 *** 1. REGISTRY ファイル 概 要 REGISTRY ファイル - ファイル 概 要... 1 レコード 例 辞 書 検 索 辞 書 検 索 フィールド CAS 登 録 番 号 成 分 CAS 登 録 番 号 検 索 例 1 : CAS 登 録 番 号 の 検 索 化 学 物 質 名 検 索 例 2 : 化 学 物 質 名 検 索 分 子 式 関 連 の 検 索 参 考 : 多 成 分 物 質 の 分 子 式 関 連 検 索 検 索 例 3 : 分 子 式 関 連 の 検 索 検 索 例 4 : 分 子 式 関 連 の 検 索 参 考 : /NC,/CI の 注 意 点 参 考 : CAS 登 録 番 号 の 種 類 検 索 フィールド 一 覧 構 造 検 索 構 造 検 索 構 造 検 索 の 流 れ 検 索 例 5 : 構 造 検 索 構 造 質 問 式 の 修 正 作 図 例 クロスオーバー 検 索 化 学 物 質 のクロスオーバー 検 索 参 考 : CAS ロール 検 索 例 6 : クロスオーバー 検 索 参 考 : CAplus ファイルでの CAS 登 録 番 号 検 索 網 羅 的 な 化 学 物 質 調 査 参 考 : CAplus から REGISTRY ファイルへのクロスオーバー 検 索 参 考 : REGISTRY から CAplus 以 外 のファイルへのクロスオーバー 検 索... 55
3 1. REGISTRY ファイル 概 要
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5 REGISTRY ファイル ファイル 概 要 REGISTRY ファイルは, 化 学 物 質 および 配 列 情 報 と,その 物 性 データ ( 予 想 値, 実 測 値,スペク トルデータ),CAS ロール (スーパーロール), CAplus ファイルの 文 献 数 などを 収 録 するデータベ ースである. ファイル 概 要 製 作 者 収 録 源 収 録 物 質 CAS (Chemical Abstracts Service) (2016 年 8 月 ) Chemical Abstracts, 各 国 の 既 存 化 学 物 質 リスト,CAS 登 録 番 号 サービス, 化 合 物 ライブラリー, 試 薬 カタログ,GENBANK, 他 のデータベースなど 有 機 化 合 物, 無 機 化 合 物,タンパク 質, 核 酸,ポリマー, 配 位 化 合 物, 有 機 金 属 化 合 物, 金 属, 合 金, 鉱 物, 元 素 物 質 同 定 情 報 - CAS 登 録 番 号 - 名 称 - 分 子 式 - クラス 識 別 子 - 構 造 図 収 録 内 容 配 列 情 報 (タンパク 質 核 酸 の 物 質 レコードに 収 録 ) - 配 列 コード - 配 列 長 - 特 徴 表 レコード 構 成 物 性 データ - 実 測 予 想 物 性 値 - スペクトルデータ 化 学 物 質 単 位 収 録 件 数 1.8 億 件 以 上 ( 化 学 物 質 1.1 億 件 以 上, 配 列 6,900 万 件 以 上 ) 収 録 期 間 1800 年 代 初 頭 - 更 新 頻 度 毎 日 特 長 世 界 最 大 の 化 学 物 質 データベース. 当 ファイルに 収 録 されたすべての 物 質 に CAS が CAS 登 録 番 号 を 付 与 してい る.CAS 登 録 番 号 は 物 質 の 識 別 番 号 として 世 界 中 で 利 用 されている. 辞 書 検 索 (CAS 登 録 番 号, 名 称, 分 子 式, 環 データなど),および 構 造 検 索 が 可 能. CAplus ファイルとの 連 携 で 化 学 物 質 に 関 する 文 献 情 報 を 簡 単 に 入 手 すること ができる. CAS 登 録 番 号 とは CAS 登 録 番 号 とは,CAS が 付 与 している 化 学 物 質 を 特 定 するためのユニークな 番 号. 化 学 物 質 の 同 定 は 細 かく 区 別 されており, 一 つの 化 学 物 質 に 一 つの 番 号 が 付 与 される. 番 号 自 体 に 化 学 的 な 意 味 はない. 例 1 : 酢 酸 酢 酸 : 酢 酸 ナトリウム : C で 標 識 された 酢 酸 : 酢 酸 イオン (CH 3 COO - ) : 例 2 : アラニン L-アラニン : D-アラニン : DL-アラニン :
6 REGISTRY ファイルに 収 録 される 化 学 物 質 の 出 典 Chemical Abstracts (CAplus/CA ファイル) に 索 引 されている 特 定 化 学 物 質 * * 分 子 式 や 構 造 が 明 確 な 単 一 の 化 学 物 質 1 CA 収 録 対 象 の 原 文 献 に 記 載 されており 科 学 的 技 術 的 に 新 しい 知 見 があった 化 学 物 質. 2 特 許 実 施 例 中 またはクレーム (1981 年 以 降 ) に 記 載 されており, 新 規 性 改 良 点, 重 要 な 事 項 に 関 連 する 化 学 物 質. 3 実 施 例 由 来 の 場 合 は 何 らかの hard data のある 物 質.( 例 示 物 質 は 索 引 しない) ただし, 以 下 の 特 許 がベーシック 特 許 となった 場 合 には, 実 施 例 中 の hard data のない 物 質 (Prophetic 物 質 ) も 索 引 する 年 1 月 以 降 の CA, DE, EP, FR, GB, JP, RU, US, WO から 発 行 された 特 許 年 の CA, DE, EP, FR, GB, US, WO で 発 行 された 英 語, 仏 語, 独 語 の 特 許 ( 年 は 一 部 収 録 ) 年 の 日 本 語 で 書 かれた 特 許 ( 一 部 収 録 ) Prophetic 物 質 の 定 義 1. 特 許 の 実 施 例 に 記 載 されている hard data のない 特 定 の 化 学 物 質 ( 例 : 反 応 物, 単 離 された 中 間 体, 生 成 物 ) で,クレームには 記 載 されていないもの. 構 造 式 だけでなく, 化 学 物 質 名 で 表 現 されているものや, 表 にまとめられているものも 含 まれる. 2. 新 規 の 用 途 が 報 告 されているが,その 用 途 が 実 証 されていない 既 知 物 質. CASREACT ファイルに 収 録 されている 反 応 中 の 反 応 関 与 物 質 米 国 (TSCA),カナダ (DSL,NDSL),EC (EINECS) 等 の 化 学 物 質 規 制 法 に 基 づく 既 存 化 学 物 質 リストに 収 載 された 物 質 公 的 機 関 や 企 業 からの 依 頼 により CAS 登 録 番 号 を 付 与 した 物 質 (CAS 登 録 番 号 サービス) 登 録 システムの 開 始 時 に 各 種 ハンドブック 類 から 収 載 された 化 学 物 質 - Merck Index - Color Index - Ring Index - Lange: Handbook of Chemistry - Pesticide Index - U.S. Adopted Names - SOCMA Handbook 化 合 物 ライブラリー (CHEMCATS ファイル) から 登 録 された 化 学 物 質 他 のデータベースからの 化 学 物 質 情 報 を 収 録 主 な 収 録 源 データベース 名 - ChemBank (The Broad Institute) - Integrated Spectral Data Base System of Organic Compounds (National Institute of Advanced Industrial Science and Technology in Japan) - NCI 2D, NCI 3D (National Cancer Institute) - Roadrunner (New Mexico Molecular Libraries Screening Center) - Wiley Subscription Services, Inc - UPCMLD Library (University of Pittsburgh Center for Chemical Methodologies and Library Development) - ChemSpider (ChemZoo, Inc.) 2
7 レコード 例 CAS 登 録 番 号 CA 索 引 名 分 子 式 CAplus の 文 献 数 構 造 図 その 他 の 化 学 物 質 名 旧 CA 索 引 名 CA 索 引 名 以 外 の 化 学 物 質 名 削 除 された CAS 登 録 番 号 収 録 源 クラス 識 別 子 CAplus の 資 料 種 類 CAplus の スーパーロール : 実 測 物 性 値 : : 予 想 物 性 値 : 入 力 日 更 新 日 3
8 物 質 タイプごとのレコード 例 配 位 化 合 物 配 位 化 合 物 : 無 機 化 合 物 : 4
9 モノマー 単 位 ポリマー (ホモポリマー) (モノマーの 分 子 式 )x モノマーの 構 造 ポリマー ポリマー 分 類 用 語 : SRU ( 繰 り 返 し 単 位 ) ポリマー ( 繰 り 返 し 単 位 の 分 子 式 )n 繰 り 返 し 単 位 の 構 造 ポリマー ポリマー 分 類 用 語 : 5
10 タンパク 質 アミノ 酸 配 列 タンパク 質 配 列 長 注 記 特 徴 表 配 列 関 連 情 報 * 現 在, 配 列, 配 列 関 連 情 報 は 検 索 できない. 6
11 核 酸 核 酸 配 列 核 酸 配 列 長 核 酸 タイプと 数 配 列 関 連 情 報 特 許 情 報 * 現 在, 配 列, 配 列 関 連 情 報 は 検 索 できない. 7
12 REGISTRY ファイルの 多 成 分 物 質 REGISTRY ファイルでは, 以 下 のような 物 質 が 多 成 分 物 質 として 登 録 されている. - 多 くの 塩 - コポリマー - 付 加 化 合 物 - 合 金 - 混 合 物 - イオン 対 - 金 属 間 化 合 物 - 構 造 不 明 の 無 機 化 合 物 - 元 素 組 成 比 が 非 整 数,または 範 囲 で 示 される 無 機 化 合 物 金 属 塩 ヘテロ 原 子 (O, S, Se, Te, N, P, As) に 結 合 した 水 素 が 金 属 に 置 換 されて 生 成 した 塩 は 遊 離 の 酸 と 金 属 との 多 成 分 物 質 として 登 録 される. 多 成 分 物 質 では, 各 成 分 の 分 子 式 が ピリオドで 区 切 られている. 各 成 分 の 存 在 比 ( 係 数 ) は, 先 頭 に 表 示 される 成 分 が 1 となる 成 分 1 成 分 2 合 金 各 成 分 の 組 成 比 と CAS 登 録 番 号 合 金 : 8
13 モノマー 単 位 ポリマー (コポリマー) コポリマーは, 原 料 ポリマーの 多 成 分 物 質 として 登 録 されている. 各 モノマーの 分 子 式 がピリオドで 区 切 られた 形 で 登 録 される. 成 分 1 成 分 2 成 分 3 ポリマー ポリマー 分 類 用 語 : 9
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15 2. 辞 書 検 索
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17 辞 書 検 索 フィールド 辞 書 検 索 とは, 化 学 物 質 名 や 分 子 式 などの, 構 造 検 索 以 外 の 検 索 手 法 の 総 称 である. REGISTRY ファイルでは, 物 質 に 関 する 多 数 の 検 索 フィールドが 利 用 できる.この 章 では, 主 な 辞 書 検 索 フィールドについて, 検 索 式 の 入 力 方 法 や 検 索 のポイントについて 紹 介 する. 例 - ある 物 質 の CAS 登 録 番 号 から 検 索 したい => CAS 登 録 番 号 検 索 - ある 物 質 の 名 称 から 検 索 したい => 化 学 物 質 名 称 検 索 - 構 造 が 分 かっているが 名 称 が 分 からない 物 質 を 検 索 したい => 分 子 式 と 部 分 名 で 検 索 - 成 分 数 や 特 定 元 素 の 有 無 で 検 索 したい => 分 子 式 関 連 情 報 で 検 索 主 な 検 索 フィールド 検 索 フィールド 内 容 入 力 例 /RN CAS 登 録 番 号 /RN /CRN 成 分 CAS 登 録 番 号 /CRN /CN /MF 化 学 物 質 名 完 全 分 子 式 VITAMIN A/CN *QUINOLINE*/CN C6H6/MF C2H4O2.NA/MF /CMF 成 分 分 子 式 C5H5N/CMF /ELS 元 素 種 X/ELS 1 FE/ELS /NC 成 分 数 C2H4O2/CMF AND PMS/CI AND 4>NC /CI クラス 識 別 子 コード L1 AND PMS/CI 11
18 CAS 登 録 番 号 CAS 登 録 番 号 検 索 REGISTRY ファイルでは 様 々な 情 報 から 物 質 を 検 索 できるが,CAS 登 録 番 号 がわかっている 場 合 は CAS 登 録 番 号 から 検 索 を 行 うのがよい. - 目 的 の 化 学 物 質 のレコード 1 件 が 回 答 として 得 られる. CAS 登 録 番 号 /RN CAS 登 録 番 号 の 検 索 カフェイン (CAS 登 録 番 号 : ) の 検 索 ヒットした 回 答 12
19 成 分 CAS 登 録 番 号 成 分 CAS 登 録 番 号 検 索 ある 物 質 を 成 分 として 含 む 多 成 分 物 質 は,その 物 質 の CAS 登 録 番 号 を, 成 分 CAS 登 録 番 号 (/CRN) で 検 索 する. CAS 登 録 番 号 /CRN 成 分 CAS 登 録 番 号 の 検 索 レコード 例 酢 酸 ナトリウムの CAS 登 録 番 号 成 分 ( 酢 酸 ) の CAS 登 録 番 号 /CRN 単 原 子 フラグメント ( 単 一 の 原 子 のみまたは 水 素 と 単 一 の 原 子 から 成 る 成 分 ) の CAS 登 録 番 号 は 収 録 されない ( 例 :Na,HCl) アクリル 酸 メタクリル 酸 コポリマー の CAS 登 録 番 号 モノマー (メタクリル 酸 ) の CAS 登 録 番 号 /CRN モノマー (アクリル 酸 ) の CAS 登 録 番 号 /CRN 13
20 検 索 例 1 : CAS 登 録 番 号 の 検 索 検 索 例 1 : ピクリン 酸 ( ) およびピクリン 酸 を 含 む 多 成 分 物 質 を 検 索 する. /RN, /CRN で 検 索 する 1. データベースの 選 択 (REGISTRY ファイルを 選 択 する.) 2. CAS 登 録 番 号 および 成 分 CAS 登 録 番 号 検 索 を 実 行 する /RN L /CRN L2 L1 OR L2 L3 ピクリン 酸 を 検 索 する ピクリン 酸 を 含 む 多 成 分 物 質 を 検 索 する (ピクリン 酸 そのものは 含 まれない) L1 と L2 を OR 演 算 子 でまとめる L1 でヒットした 回 答 L2 でヒットした 回 答 例 14
21 化 学 物 質 名 化 学 物 質 名 の 検 索 完 全 名 /CN 完 全 名 で 検 索 * 部 分 名 */CN 部 分 名 で 検 索 完 全 名 ( 記 号 類 やスペースを 含 め, 収 録 されている 通 りの 名 称 ) - /CN は 前 方 一 致, 後 方 一 致, 中 間 一 致 検 索 が 可 能 - カンマ,ハイフンなどの 記 号 類 やスペースも 含 め, 収 録 されている 名 称 と 同 じ 入 力 をしなけ れば 回 答 が 得 られない. CAS Registry Number : 各 枠 の 名 称 が /CN フィールドで 検 索 可 能 部 分 名 の 検 索 - 完 全 名 の 一 部 ( 部 分 名 ) を 用 いて 検 索 する 場 合 は,/CN で 部 分 名 の 中 間 一 致 検 索 を 実 行 する. 上 記 レコード ( ) をヒットさせる 検 索 式 の 例 PARAMOUNT/CN 3,7-DICHLORO-8-QUINOLINECARBOXYLIC ACID/CN 8-QUINOLINECARBOXYLIC ACID*/CN *QUINOLINE*/CN (*CHLORO* AND *CARBOXYLIC ACID*)/CN *CHLORO*/CN AND *CARBOXYLIC ACID*/CN 同 じ 結 果 が 得 られる 参 考 : 化 学 物 質 名 称 の 入 力 のポイント ギリシャ 文 字 や 特 殊 記 号 (アポストロフィーなど) も 検 索 可 能. ( 例 :β-alanine/cn 2 -chloro carboxine/cn) 丸 括 弧 ( ) や 角 括 弧 [ ] を 含 む 名 称 は, 二 重 引 用 符 で 囲 む. ( 例 : ETHANE, [(AZIDOMETHYL)THIO]- /CN) 15
22 検 索 例 2 : 化 学 物 質 名 検 索 検 索 例 2 : 1) 8-Bromo-2,4-quinolinedicarboxylic acid を 検 索 する 2) キノリン 骨 格 に,ブロモ 基 と 2 つのカルボキシル 基 を 有 する 物 質 を 検 索 する. [ 検 索 の 流 れ] 1) 完 全 名 で 検 索 する. 2) 部 分 名 で 検 索 する. 1) 完 全 名 で 検 索 する 1. データベースの 選 択 (REGISTRY ファイルを 選 択 する.) 2. 検 索 しようとする 名 称 が REGISTRY ファイルに 収 録 されているとは 限 らないため, 検 索 前 に EXPLORE INDEX を 利 用 して 名 称 を 確 認 する. 1 完 全 名 を 入 力 2 検 索 したい 完 全 名 に チェックをつける 3 クリックすると, 選 択 した 完 全 名 の 検 索 式 がクエリーパネル に 作 成 される L1 ヒットした L1 の 回 答 16
23 2) キノリン 骨 格 に,ブロモ 基 と 2 つのカルボキシル 基 を 有 する 物 質 の 検 索 3. 複 数 の 部 分 名 を 利 用 する 場 合 は,AND 演 算 子 を 利 用 する. (*QUINOLIN* AND *DICARBOXY* AND *BROMO*)/CN L2 部 分 名 で 検 索 する L2 の 回 答 例 17
24 分 子 式 関 連 の 検 索 分 子 式 の 検 索 完 全 分 子 式 /MF 物 質 全 体 の 分 子 式 を 検 索 成 分 分 子 式 /CMF 多 成 分 物 質 の 各 成 分 の 成 分 分 子 式 を 検 索 * * 単 成 分 物 質 の 場 合 は, 完 全 分 子 式 = 成 分 分 子 式 である. 分 子 式 の 入 力 方 法 分 子 式 の 記 述 は Hill 方 式 に 従 う. - 炭 素 を 含 む 物 質 : 炭 素, 水 素,その 他 の 元 素 (アルファベット 順 ) ( 例 :C4H3N11O6) - 炭 素 を 含 まない 物 質 : すべての 元 素 をアルファベット 順 に 表 記 ( 例 :O2Ti) - 元 素 の 存 在 数 は 元 素 記 号 の 後 ろにスペースを 空 けずに 入 力 ( 存 在 数 1 の 場 合 は 省 略 ) 分 子 式 の 元 素 数 の 後 は,スペースがあってもなくてもよい.ただし, 一 つの 分 子 式 の 中 でスペ ースの 有 無 が 混 在 する 形 での 入 力 はエラーを 生 じる. C4H11NO3.C2H4O2/MF C4 H11 N O3. C2 H4 O2/MF スペースを 含 めた 場 合 は,ピリオド (.) の 前 後 にもスペースを 含 める 必 要 がある.スペースが 無 いと 0 件 になる 括 弧 を 含 む 分 子 式 を 検 索 する 際 は, 二 重 引 用 符 で 全 体 を 囲 む. (C8H8.C2H4)x /MF レコード 例 ( 単 成 分 物 質 ) < 入 力 例 > C6H3CL3O/MF C6 H3 CL3 O/MF * 単 成 分 物 質 の 場 合, 完 全 分 子 式 = 成 分 分 子 式 なので, 下 記 の 式 でもこのレコードはヒットする. C6H3CL3O/CMF 18
25 多 成 分 物 質 の 分 子 式 各 成 分 の 分 子 式 がピリオド (.) で 区 切 られている. 各 成 分 の 記 述 優 先 順 序 は, 以 下 のように 定 義 されている. - 有 機 物 質 の 場 合 1 有 機 成 分 と 無 機 成 分 が 存 在 する 場 合 は, 有 機 成 分 を 優 先 する. 2 炭 素 数 の 多 い 成 分 を 優 先 する. 3 炭 素 数 が 同 じ 場 合 は, 水 素 数 の 多 い 成 分 を 優 先 する. 4 炭 素 および 水 素 数 が 同 じならば, 他 の 元 素 のアルファベット 順 で 決 定 する. - 無 機 物 質 の 場 合 1 元 素 のアルファベット 順 2 1で 決 まらなければ, 原 子 数 が 多 い 方 を 優 先 する. 各 成 分 の 存 在 比 ( 係 数 ) は, 先 頭 の 成 分 を 1 として 表 記 される.( 例 : C2H4O2.1/2Ca) レコード 例 ( 多 成 分 物 質 ) < 入 力 例 > C5H5N.C2H4O2/MF C5 H5 N. C2 H4 O2/MF C5H5N/CMF C2H4O2/CMF 完 全 分 子 式 成 分 分 子 式 成 分 1 成 分 2 19
26 その 他 の 分 子 式 関 連 検 索 フィールド 検 索 フィールド 内 容 入 力 例 /ELS /NC /ELF /ELC /ELC.SUB 元 素 種 各 成 分 の 特 定 元 素 および 元 素 数 成 分 数 物 質 全 体 の 成 分 数 元 素 式 各 成 分 の 構 成 元 素 元 素 数 各 成 分 の 異 なる 元 素 の 種 類 数 物 質 に 対 する 元 素 数 物 質 全 体 の 異 なる 元 素 の 種 類 数 X/ELS P 3/ELS /CRN AND 3/NC C H O/ELF 7-9/ELC ELC.SUB=<3 /CI クラス 識 別 子 CCS/CI /ELS は 元 素 種 のみを 指 定 した 検 索 および 元 素 種 の 数 を 指 定 した 検 索 に 利 用 できる. - 入 力 例 CL/ELS 塩 素 原 子 を 含 む 物 質 を 検 索 M/ELS 金 属 を 含 む 物 質 を 検 索 5 C/ELS 炭 素 原 子 を 5 個 含 む 物 質 を 検 索 2-4 N/ELS 窒 素 原 子 を 2-4 個 含 む 物 質 を 検 索 3- O/ELS 酸 素 原 子 が 3 個 以 上 の 物 質 を 検 索 -3 O/ELS 酸 素 原 子 が 3 個 以 下 の 物 質 を 検 索 元 素 種 と 元 素 数 の 入 力 は 順 不 同 C 5/ELS や O 3-/ELS で も 検 索 できる * X : ハロゲン (F Cl Br I At) M : 金 属 (Ar As At B Br C Cl F H He I Kr N Ne O P Rn S Se Si Te Xe 以 外 の 元 素 ) D : 重 水 素 T : 三 重 水 素 (D, T は H でもヒットする) クラス 識 別 子 (CI) は, 物 質 の 広 いクラス ( 分 類 ) を 示 すコードである. - クラス 識 別 子 の 種 類 クラス 識 別 子 AYS CCS COM *1 CTS *2 GRS *2 IDS MAN MNS MXS PMS RIS RPS TIS UVCB *2 定 義 合 金 配 位 化 合 物 多 成 分 物 質 成 分 概 念 語 登 録 一 般 式 登 録 定 義 の 不 完 全 な 物 質 手 作 業 登 録 鉱 物 混 合 物 ポリマー ラジカルイオン 環 母 核 表 形 式 無 機 化 合 物 組 成 不 明, 組 成 不 定, 複 雑 な 反 応 生 成 物, 生 体 物 質 *1 COM は COMPONENT (COM) /CI で 検 索 できる.(COM/CI ではヒットしない) *2 CAplus ファイルで CAS 登 録 番 号 で 索 引 されない 20
27 参 考 : 多 成 分 物 質 の 分 子 式 関 連 検 索 C5 H5 N C2 H4 O2. 成 分 1 (C5H5N) 成 分 2 (C2H4O2) 成 分 分 子 式 C5H5N/CMF C 5 H 5 N の 成 分 を 含 む 成 分 分 子 式 C2H4O2/CMF C 2 H 4 O 2 の 成 分 を 含 む 元 素 種 C/ELS 炭 素 が 存 在 する ( 数 は 不 定 ) C 5/ELS 炭 素 が 5 個 存 在 する H/ELS 水 素 が 存 在 する ( 数 は 不 定 ) H 5/ELS 水 素 が 5 個 存 在 する N/ELS 窒 素 が 存 在 する ( 数 は 不 定 ) N 1/ELS 窒 素 が 1 個 存 在 する 元 素 種 C/ELS 炭 素 が 存 在 する ( 数 は 不 定 ) C 2/ELS 炭 素 が 2 個 存 在 する H/ELS 水 素 が 存 在 する ( 数 は 不 定 ) H 4/ELS 水 素 が 4 個 存 在 する O/ELS 酸 素 が 存 在 する ( 数 は 不 定 ) O 2/ELS 酸 素 が 2 個 存 在 する 元 素 式 C H N/ELF 炭 素, 水 素, 窒 素 のみ から 成 る 元 素 式 C H O/ELF 炭 素, 水 素, 酸 素 のみ から 成 る 元 素 数 3/ELC 3 種 類 の 元 素 からなる 成 分 を 含 む 元 素 数 3/ELC 3 種 類 の 元 素 からなる 成 分 を 含 む 物 質 全 体 (C5H5N.C2H4O2) 完 全 分 子 式 C5H5N.C2H4O2/MF C 5 H 5 N と C 2 H 4 O 2 から 成 る 物 質 成 分 数 2/NC 2 成 分 物 質 である ( 成 分 数 = 分 子 式 中 のピリオドの 数 + 1) 物 質 に 対 する 元 素 数 4/ELC.SUB 4 種 類 の 元 素 から 成 る 物 質 * 単 成 分 物 質 の 場 合 は, 物 質 全 体 = 成 分 となる. 21
28 検 索 例 3 : 分 子 式 関 連 の 検 索 1 検 索 例 3 : 1) 右 記 の 物 質 を 調 査 する 2) 1) で 得 られた 物 質 を 含 む 多 成 分 物 質 を 検 索 して, 金 属 との 2 成 分 からなる 物 質 に 限 定 する. 3) 回 答 が 多 い 場 合 は, 金 属 をナトリウムに 限 定 する. [ 検 索 の 流 れ] 1) 完 全 分 子 式 (/MF) で 検 索 する. 2-1) 1-1) の 物 質 の 成 分 CAS 登 録 番 号 検 索 を 実 行 し, 多 成 分 物 質 を 得 る. 2-2) 元 素 種 (/ELS) および 成 分 数 (/NC) で 限 定 する. 3) 2-2) の 結 果 が 多 い 場 合 は, 金 属 をナトリウムに 限 定 する. 1) 完 全 分 子 式 で 検 索 する 1. データベースの 選 択 (REGISTRY ファイルを 選 択 する.) 2. Hill 方 式 に 従 って, 分 子 式 を 記 述 し, 完 全 分 子 式 (/MF) 検 索 を 実 行 する. C6 H3 N3 O7/MF L1 L1 の 回 答 中 で 目 的 の 物 質 の CAS 登 録 番 号 を 確 認 する. 目 的 の 物 質 の CAS 登 録 番 号 目 的 の 物 質 22
29 2-1) 1) で 得 られた 物 質 の 多 成 分 物 質 を 検 索 する /CRN L2 多 成 分 物 質 を 検 索 する 2-2) 元 素 種 および 成 分 数 で 限 定 する L2 AND M/ELS AND 2/NC L3 金 属 を 含 む 物 質 および 2 成 分 物 質 に 限 定 する 3) L3 の 結 果 が 多 い 場 合 は, 金 属 をナトリウムに 限 定 する L3 AND NA/ELS L4 ナトリウムを 含 む 物 質 に 限 定 する L4 でヒットした 回 答 2 成 分 ナトリウム C29 H32 Na O8 P. C6 H3 N3 O7 成 分 1 成 分 2 = 2 成 分 * 成 分 数 は 分 子 式 からカウント 2 成 分 ナトリウム 23
30 検 索 例 4 : 分 子 式 関 連 の 検 索 2 検 索 例 4 : ある 決 まったモノマー (CAS 登 録 番 号 : ) を 含 む 3 成 分 ポリマーを 検 索 する.( 残 りの 2 成 分 については 特 に 指 定 しない) [ 検 索 の 流 れ] 1) モノマーの CAS 登 録 番 号 を 成 分 CAS 登 録 番 号 (/CRN) で 検 索 する. 2) 成 分 数 (/NC) で 3 成 分 に 限 定,およびクラス 識 別 子 (/CI) でポリマーに 限 定 する. 1) モノマーの CAS 登 録 番 号 を 成 分 CAS 登 録 番 号 (/CRN) で 検 索 する 1. データベースの 選 択 (REGISTRY ファイルを 選 択 する.) 2. 成 分 CAS 登 録 番 号 (/CRN) 検 索 を 実 行 する /CRN L1 2 成 分 数 (/NC) で 3 成 分 に 限 定,およびクラス 識 別 子 (/CI) でポリマーに 限 定 する. L1 AND 3/NC AND PMS/CI L2 3 成 分 およびポリマー (PMS) に 限 定 L2 でヒットした 回 答 3 成 分 : ポリマー : 24
31 参 考 : /NC,/CI の 注 意 点 /NC ( 成 分 数 ) や /CI (クラス 識 別 子 ) は 物 質 全 体 を 対 象 とした 検 索 フィールドである.そのため, 多 成 分 物 質 の 各 成 分 の 成 分 数 や, 各 成 分 のクラス 識 別 子 は 検 索 できない. レコード 例 3 成 分 から 成 る 物 質 3/NC 多 成 分 物 質 の 成 分 として 配 位 化 合 物 が 含 まれているが, 物 質 全 体 のクラス 識 別 子 として,CCS は 収 録 されていない 25
32 参 考 : CAS 登 録 番 号 の 種 類 削 除 された CAS 登 録 番 号 (Deleted Registry Number : DR) ある 物 質 が 新 規 物 質 である ( 既 存 の CAS 登 録 番 号 の 物 質 とは 一 致 しない) と 判 断 された 場 合, 新 規 の CAS 登 録 番 号 が 付 与 され,REGISTRY ファイルで 新 規 レコードが 作 成 される. しかし 後 になって, 既 存 の CAS 登 録 番 号 の 物 質 と 同 じとわかる 場 合 がある. ( 例 : 登 録 時 に 構 造 情 報 が 不 明 であった 物 質 ( 商 品 名 で 登 録 された 物 質, 天 然 物 など)) - そのような 場 合,REGISTRY ファイルではいずれかのレコードに 統 合 され, 残 りのレコードは データベースから 削 除 される. 削 除 された CAS 登 録 番 号 は, 統 合 後 のレコードの Deleted Registry Numbers フィールドに 収 録 される. - 削 除 された CAS 登 録 番 号 が CAplus/CA ファイルに 索 引 されていた 場 合, 統 合 後 の CAS 登 録 番 号 に 置 換 される.(ただし, 抄 録 など 索 引 以 外 のフィールドに 収 録 されている CAS 登 録 番 号 は 置 換 されない) レコード 例 : 削 除 された CAS 登 録 番 号 を 含 むレコード Deleted Registry Numbers フィールドに 削 除 された CAS 登 録 番 号 が 収 録 されている : 削 除 された CAS 登 録 番 号 を 検 索 すると, 統 合 後 のレコードがヒットする. 上 記 のレコードがヒットする 26
33 優 先 CAS 登 録 番 号 (Preferred Registry Number : PR), 非 優 先 CAS 登 録 番 号 (Alternate Registry Number : AR) 二 つ 以 上 の 構 造 の 表 現 法 を 持 つ 物 質 で,より 優 先 される 構 造 に 対 して 付 与 された CAS 登 録 番 号 を 優 先 CAS 登 録 番 号 と 呼 ぶ.( 例 : 閉 環 (スピロ) 型 構 造 と 開 環 型 構 造 ) レコード 例 : 優 先 構 造 のレコード Alternate Registry Numbers フィールドに 非 優 先 CAS 登 録 番 号 が 収 録 されている レコード 例 : 非 優 先 構 造 のレコード Preferred Registry Numbers フィールドに 優 先 CAS 登 録 番 号 が 収 録 されている REGISTRY ファイルで, 優 先, 非 優 先 どちらの CAS 登 録 番 号 で 検 索 しても, 両 方 のレコード がヒットする. 文 献 検 索 では,REGISTRY ファイルから CAplus ファイルへのクロスオーバー 検 索 を 行 えば すべての CAS 登 録 番 号 (RN, DR, AR, PR) がクロスオーバーされる. 27
34 検 索 フィールド 一 覧 コード 内 容 索 引 単 位 検 索 例 一 般 /CRN /CI /FA /FS /REF.CAPLUS /PCT /RN /SR 成 分 CAS 登 録 番 号 クラス 識 別 子 フィールドの 存 在 ファイルセグメント CAplus ファイルでの 文 献 数 ポリマー 分 類 用 語 CAS 登 録 番 号 収 録 源 句 句 句 単 語 数 値 句 句 単 語, 句 /CRN PMS/CI RSD/FA PROTEIN/FS 50=<REF.CAPLUS POLYESTER/PCT /RN CA/SR 化 学 物 質 名 称 /CN /CNS /HP /ONS 化 学 物 質 名 称 化 学 物 質 名 称 自 然 セグメント 見 出 し 語 母 核 CA 索 引 名 以 外 の 名 称 セグメント 句 単 語 句 単 語 BENZOIC ACID/CN *CYCLIN*/CNS BENZENE/HP ANILINE/ONS 分 子 式 /ATC /CMF /ELC /ELC.SUB /ELF /ELS /MF /NC 原 子 数 成 分 分 子 式 元 素 数 元 素 数 ( 物 質 全 体 ) 元 素 式 元 素 種 分 子 式 成 分 数 数 値 句 数 値 数 値 句 句 句 数 値 5/ATC C5H5N/CMF 7-9/ELC ELC.SUB>=8 C H F O/ELF B/ELS C7H3BR2FO2/MF F/ELS NOT 2>=NC 環 データ /CNR /CNRS /NR /NRRS /NRS 環 の 数 ( 成 分 内 ) 環 系 の 数 ( 成 分 内 ) 最 小 環 の 数 環 系 内 の 環 の 数 環 系 の 数 ( 物 質 全 体 ) 数 値 数 値 数 値 数 値 数 値 CNR=>12 3/CNRS 10/NR 5-6/NRRS 7/NRS 更 新 日 /EDSUB /UPNST /UPST /UPSUB 入 力 日 構 造 以 外 のデータの 更 新 日 構 造 データの 更 新 日 更 新 日 数 値 数 値 数 値 数 値 EDSUB> UPNST>= UPST> UPSUB=
35 3. 構 造 検 索
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37 構 造 検 索 構 造 検 索 コマンド (STR 番 号 は 構 造 質 問 式 に 付 与 される 番 号 ) STR 番 号 / 検 索 タイプ,FULL * * FULL は 省 略 可 能. 検 索 タイプのデフォールトは 部 分 構 造 検 索 (SSS). 検 索 タイプ 構 造 検 索 を 実 行 する 際 に 検 索 タイプを 指 定 することで, 作 図 した 構 造 と 完 全 に 一 致 する 作 図 した 部 分 構 造 を 含 む などの 条 件 を 指 定 することができる. 構 造 質 問 式 検 索 タイプ 回 答 例 完 全 一 致 検 索 (EXA) 構 造 質 問 式 に 完 全 に 一 致 部 分 構 造 検 索 (SSS) (デフォールト) 構 造 質 問 式 に 完 全 に 一 致 他 の 成 分 が 含 まれていてもよい 追 加 の 置 換 基 があってもよい CO2H NH2 NMe2 O C OMe NH2 NO2 コード 検 索 タイプ ヒットする 物 質 入 力 例 EXA 完 全 一 致 検 索 構 造 質 問 式 に 完 全 に 一 致 する 物 質 STR1/EXA STR1/EXA,FULL FAM ファミリー 検 索 (EXA の 回 答 に 加 えて) 他 の 成 分 が 含 まれていてもよい STR1/FAM STR1/FAM,FULL CSS 閉 構 造 部 分 構 造 検 索 (FAM の 回 答 に 加 えて) 可 変 構 造 質 問 式 を 利 用 できる 特 定 の 位 置 に 置 換 基 を 含 めることができる STR1/CSS STR1/CSS,FULL SSS 部 分 構 造 検 索 (デフォールト) (CSS の 回 答 に 加 えて) 追 加 の 置 換 基 が 存 在 してもよい STR1 STR1/SSS,FULL STR1/SSS STR1/FULL 構 造 質 問 式 をアップロードすると, 自 動 的 に 部 分 構 造 検 索 (SSS) を 実 行 する 検 索 式 が 入 力 される. 他 の 検 索 タイプを 指 定 したい 場 合 には, 検 索 式 を 変 更 する. 29
38 検 索 タイプ 別 の 回 答 例 例 1 : 便 利 な 作 図 機 能 を 使 っていない 構 造 質 問 式 ( 結 合 の 種 類 は 不 定 ) EXA 検 索 作 図 していないところはすべて 水 素 が 置 換 立 体 異 性 体, 同 位 体 なども 含 む FAM 検 索 EXA 検 索 の 回 答 のほか,その 多 成 分 物 質 を 含 む 付 加 化 合 物 ポリマー C6H6O3.C8H11N C6H6O3 (C6H6O3.C6H12O)x C6H6O3 C8H11N C6H12O 便 利 な 作 図 機 能 を 使 っていない ため,FAM 検 索 と CSS 検 索 の 結 果 は 同 じになる SSS 検 索 作 図 した 構 造 にあらゆる 置 換 基 を 許 容 ( 多 成 分 物 質 も 含 む) ポリマー (C8H10O3.C3H3N)x C8H10O3 混 合 物 C5H10N2O2S.C10H12O4 C5H10N2O2S C3H3N C10H12O4 30
39 例 2 : 便 利 な 作 図 機 能 ( 可 変 原 子 ) を 利 用 した 構 造 質 問 式 ( 結 合 の 種 類 は 不 定 ) 可 変 原 子 を 利 用 (Q : C,H 以 外 の 元 素 ) EXA 検 索 FAM 検 索 便 利 な 作 図 機 能 ( 可 変 原 子,G グループなど) を 用 いた 場 合 には 利 用 不 可 * エラーメッセージが 表 示 され, 実 行 できない CSS 検 索 作 図 していないところは 水 素 が 置 換 ( 多 成 分 物 質 を 含 む) ポリマー (C6H7NO2.C6H11NO)x C6H7NO2 付 加 化 合 物 C6H6O3.C8H11N C6H6O3 C6H11NO C8H11N SSS 検 索 作 図 した 構 造 にあらゆる 置 換 基 を 許 容 ( 多 成 分 物 質 も 含 む) 塩 混 合 物 C5H10N2O2S.C10H12O4 C12H13N3 C13H11Cl2NO2 31
40 構 造 検 索 の 流 れ 構 造 検 索 は, 下 記 の 流 れで 行 う. STEP 1 : 構 造 検 索 を 行 うデータベースを 選 択 する. - 複 数 のデータベースに 入 り,まとめて 構 造 検 索 することもできる. STEP 2 : 構 造 作 図 画 面 を 起 動 して, 構 造 を 作 図 する. OK ボタンをクリックすると, 構 造 質 問 式 がアップロード される STEP 3 : 検 索 を 実 行 する. - アップロードが 完 了 すると,クエリーパネルに 部 分 構 造 検 索 (SSS) を 行 う 検 索 式 が 自 動 的 に 入 力 されるので,Submit ボタンまたは Enter キーで 検 索 を 実 行 する. STR 番 号 / 検 索 タイプ, 検 索 範 囲 検 索 タイプのデフォールトは 部 分 構 造 検 索 (SSS) 検 索 範 囲 はフルファイル 検 索 (FULL) * STR 番 号 は 構 造 質 問 式 に 対 して 付 与 される 番 号.ヒストリーパネル 中 の STRUCTURES タブで,STR 番 号 と 対 応 する 構 造 図 が 確 認 できる. 32
41 検 索 例 5 : 構 造 検 索 検 索 例 5 : 下 記 のような 部 分 構 造 を 含 む 物 質 をすべて 検 索 する. X : ハロゲン STEP 1 : 構 造 検 索 を 行 うデータベースを 選 択 する. STEP 2 : 構 造 作 図 画 面 を 起 動 して, 構 造 を 作 図 する. < 構 造 作 図 画 面 > *ノード : 構 造 中 に 含 まれる 特 定 の 原 子 や 可 変 原 子 のこと 消 しゴムツール: ノードや 結 合 の 削 除 ペンシルツール: ノードや 結 合 の 作 図 X メニューツール: 可 変 原 子 の 作 図 属 性 パネル アクティブなノード 原 子 パレット アクティブな 環 リングパレット * 各 ツールの 詳 細 は 構 造 作 図 ガイド 参 照 33
42 < 作 図 の 手 順 > ここでは 下 記 の 手 順 で 構 造 を 作 図 する. 1. 環 を 描 く 2. 鎖 を 描 く 3. 原 子 を 変 更 する 4. 結 合 を 変 更 する 1. 環 を 描 く 2 作 図 したい 位 置 までポインタ を 移 動 してクリック 1リングパレットから 作 図 したい 環 を 選 択 4 縮 合 環 を 作 図 する 場 合 は, 結 合 が 赤 くハイライトされている 状 態 でクリックする 3 違 う 環 を 描 きたい 場 合 は 再 度 リングパレットから 選 択 34
43 2. 鎖 を 描 く 1ペンシルツールをクリック 2 結 合 を 描 きたいノードが 赤 く ハイライトされている 状 態 でクリック 3. 原 子 を 変 更 する 2 変 更 したいノードが 赤 く ハイライトされている 状 態 でクリック 1 作 図 したい 原 子 を 選 択 35
44 2 X (ハロゲン) を 選 択 1 X メニューツールをクリック 3 変 更 したいノードが 赤 く ハイライトされている 状 態 でクリック 原 子 メニューツールをクリック すると 原 子 の 一 覧 が 表 示 さ れる ショートカットメニューツール をクリックするとショートカット の 一 覧 が 表 示 される 36
45 4. 結 合 を 変 更 する 変 更 したい 結 合 が 赤 くハイライトされている 状 態 でクリック * 二 重 結 合 三 重 結 合 単 結 合 の 順 に 結 合 が 変 更 される * 結 合 パレットから 結 合 を 選 択 することもできる * 構 造 質 問 式 の 修 正 特 定 部 位 の 削 除 - 消 しゴムツール 直 前 に 行 った 操 作 を 取 り 消 す Undo ツール 誤 って 削 除 元 に 戻 る 37
46 作 図 が 完 了 したら,OK ボタンをクリックする. STEP 3 : 検 索 を 実 行 する. 今 回 は 部 分 構 造 検 索 (SSS) を 行 うので, 自 動 入 力 された 検 索 式 のままでよい クリック 38
47 L1 でヒットした 回 答 ヒット 部 分 は 赤 くハイライトされる 39
48 構 造 質 問 式 の 修 正 STRUCTURES タブから,アップロードした 構 造 質 問 式 を 呼 び 出 して 修 正 することができる. 構 造 図 をクリック 構 造 作 図 画 面 が 起 動 環 はこれ 以 上 縮 環 しない. 丸 で 囲 った 部 分 には 置 換 基 がつかない. という 条 件 で 検 索 するため, 構 造 質 問 式 を 修 正 する. 40
49 縮 環 の 禁 止 2 環 上 にポインタを 移 動 し, 赤 くハイライトされている 状 態 でクリック 縮 環 の 禁 止 を 指 定 した 環 の 結 合 は 太 線 に 変 わる 1 Lock Rings ツールを クリック 置 換 基 の 追 加 の 禁 止 2 置 換 基 の 追 加 を 禁 止 したいノードが 赤 くハイライト されている 状 態 でクリック 置 換 基 の 追 加 を 禁 止 した ノードは 四 角 枠 で 囲 まれる 1 Lock Atoms ツールを クリック 修 正 が 完 了 したら OK ボタンをクリック 41
50 検 索 実 行 クリック L2 でヒットした 回 答 このテキストで 紹 介 していないツールの 使 い 方 については 構 造 作 図 ガイド を 参 照 42
51 作 図 例 例 1 : 下 記 の 条 件 の 物 質 を 検 索 する. 2 つの 構 造 をまとめて 検 索 する. フラグメントの 作 図 R グループツール 環 はこれ 以 上 縮 合 しない. Lock Rings ツール 例 2 : 下 記 の 条 件 の 物 質 を 検 索 する. 環 と COOH 基 の 間 には 炭 素 が 1 つ 入 っても よい. 繰 り 返 しグループツール が 示 す 位 置 のどこかに X (ハロゲン) が 置 換 する. 可 変 置 換 位 置 ツール 例 3 : 下 記 の 条 件 の 物 質 を 検 索 する. 作 図 した 環 (ピリジン 環 と Hy (ヘテロ 環 )) はどちら も 単 環. ピリジン 環 : Lock Rings ツール Hy : 一 般 式 属 性 (Hy を 右 クリックして 表 示 ) Hy は 1-3 個 の 窒 素 と 1-2 個 の 酸 素 を 含 む. 元 素 数 (Hy を 右 クリックして 表 示 ) の 窒 素 は 鎖 でも 環 の 一 部 でもよい. ノードの 属 性 (N を 右 クリックして 表 示 ) 43
52 例 1 例 2 例 3 Monocyclic ( 単 環 ) を 選 択 Ring/Chain を 選 択 元 素 を 指 定 数 を 指 定 Add ボタン を クリック 44
53 4. クロスオーバー 検 索
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55 化 学 物 質 のクロスオーバー 検 索 REGISTRY ファイルと CAplus ファイルは CAS 登 録 番 号 をキーに 関 係 付 けされている. REGISTRY ファイル REGISTRY ファイルで 得 られた 物 質 の 文 献 情 報 を CAplus ファイルで 得 る または クロスオーバー 検 索 または REFX L# SUBX L# CAplus ファイルで 索 引 された 化 学 物 質 の 情 報 を REGISTRY ファイルで 確 認 する CAplus ファイル CAS 登 録 番 号 特 定 の 化 学 物 質 は CAS 登 録 番 号 で 索 引 されている CAS ロール CAS ロールは, 文 献 中 でのその 化 学 物 質 の 役 割 (ロール) をコード 化 したものであり, 特 定 の 化 学 物 質 (CAS 登 録 番 号 ) や 化 合 物 クラス 用 語 ( 統 制 語 ) と 共 に 索 引 されている 45
56 化 学 物 質 の 文 献 調 査 REGISTRY ファイルで 得 られた 物 質 の 文 献 情 報 を 得 るには,REGISTRY から CAplus ファイ ルへのクロスオーバー 検 索 を 実 行 する. 方 法 1 REGISTRY ファイルで をクリックする. 方 法 2 CAplus ファイルで,REFX コマンド (REFX L#) を 実 行 する. REGISTRY ファイルから CAplus ファイルへのクロスオーバー 検 索 の 流 れ Get References ボタンまたは REFX コマンドを 実 行 すると,REGISTRY ファイルの 回 答 集 合 中 の CAS 登 録 番 号 が 抽 出 され,CAplus ファイルで 検 索 される. REGISTRY ファイルで 化 学 物 質 を 検 索 する < 例 > /RN (CAS 登 録 番 号 ) CAFFEINE/CN ( 化 学 物 質 名 称 ) C8H10N4O2/MF ( 分 子 式 ) STR1/SSS,FUL ( 構 造 検 索 ) L1 方 法 1 方 法 2 Get References ボタンをクリックする CAplus ファイルでクロスオーバー 検 索 を 実 行 する REFX L1 REFX L1 (U) CAS ロール/RL Search ボタンをクリックする CAS ロール チェックを 付 けなかった 場 合 : すべての 文 献 を 検 索 チェックを 付 けた 場 合 : 選 択 した CAS ロールを 持 つ 文 献 を 検 索 すべての CAS ロールが 一 覧 に 表 示 されるわけでは ない. 一 覧 にない CAS ロールを 使 用 したい 場 合 には, REFX コマンドを 用 いてクロスオーバーする 46
57 参 考 : CAS ロール CAS ロールは, 文 献 中 でのその 化 学 物 質 の 役 割 (ロール) をコード 化 したもの. CAplus ファイルで, 特 定 の 化 学 物 質 (CAS 登 録 番 号 ) や 化 合 物 クラス 用 語 ( 統 制 語 ) と 共 に CAS ロールが 索 引 されている. コード 英 語 名 定 義 *1 備 考 ANST *2 Analytical Study 分 析 に 関 する 研 究 ANT Analyte 分 析 対 象 AMX Analytical Matrix 分 析 マトリックス ARG Analytical Reagent Use 分 析 試 薬 用 途 ARU Analytical Role, 上 記 以 外 の 分 析 に Unclassified 関 する 研 究 BIOL *2 Biological Study 生 物 学 的 研 究 ADV Adverse Effect, Including Toxicology 副 作 用 ( 毒 性 を 含 む) AGR Agricultural Use 農 業 関 連 用 途 BCP Biochemical Process 生 化 学 的 プロセス BMF Bioindustrial Manufacture 生 化 学 的 工 業 生 産 BPN Biosynthetic Preparation 生 化 学 的 合 成 COS Cosmetic Use 化 粧 品 用 途 DGN Diagnostic Use 診 断 用 途 FFD Food or Feed Use 食 品 または 飼 料 用 途 NPO Natural Product Occurrence 天 然 物 の 起 源 分 布 PAC Pharmacological Activity 薬 理 活 性 PKT Pharmacokinetics 薬 物 動 態 THU Therapeutic Use 医 薬 用 途 BUU Biological Use, 上 記 以 外 の 生 物 関 連 Unclassified 用 途 BSU Biological Study, 上 記 以 外 の 生 物 学 的 Unclassified 研 究 BAC Biological Activity or 生 理 活 性 またはエフェ Effector, Except クター ( 副 作 用 を 除 く) Adverse CMBI *2 Combinatorial Study コンヒ ナトリアル ケミストリー に 関 する 研 究 *2 Formation, 生 成 FORM Nonpreparative ( 意 図 的 合 成 ではない) GFM Geological or 地 質 学 的, 天 文 学 的 Astronomical Formation 生 成 FMU Formation, Unclassified 上 記 以 外 の 生 成 NANO *2 Nanomaterial ナノ 材 料 OCCU *2 Occurrence 起 源 分 布 GOC NPO Geological or Astronomical Occurrence Natural Product Occurrence 地 質 学 的, 天 文 学 的 起 源 分 布 天 然 物 の 起 源 分 布 POL Pollutant 汚 染 物 質 Occurrence, 上 記 以 外 の 起 源 OCU Unclassified 分 布 コード 英 語 名 定 義 備 考 *1 PREP *2,3 Preparation 製 造 BMF Bioindustrial Manufacture 生 化 学 的 工 業 生 産 BPN Biosynthetic Preparation 生 化 学 的 合 成 BYP Byproduct 副 生 成 物 IMF Industrial Manufacture 化 学 的 工 業 生 産 PUR Purification or Recovery 精 製 SPN Synthetic Preparation 化 学 合 成 PROC *2 Process プロセス PEP Physical, Engineering 物 理 的, 工 学 的,また or Chemical Process は 化 学 的 プロセス BCP Biochemical Process 生 化 学 的 プロセス GPR Geological or 地 質 学 的, 天 文 学 的 Astronomical Process プロセス REM Removal or Disposal 除 去 または 処 分 PRPH *2,4 Prophetic Prophetic 物 質 RACT *2 Reactant or Reagent 反 応 物 または 試 薬 RCT Reactant 反 応 物 RGT Reagent 試 薬 USES *2 Uses 用 途 AGR Agricultural Use 農 業 関 連 用 途 ARG Analytical Reagent Use 分 析 試 薬 用 途 CAT Catalyst Use 触 媒 用 途 COS Cosmetic Use 化 粧 品 用 途 DGN Diagnostic Use 診 断 用 途 FFD Food or Feed Use 食 品 または 飼 料 用 途 MOA Modifier or Additive 改 良 剤 または 添 加 物 Use 用 途 POF Polymer in Formulation ポリマー 組 成 物 TEM Technical or Engineered Material 工 学 工 業 材 料 用 途 Use THU Therapeutic Use 医 薬 用 途 BUU NUU Biological Use, Unclassified 上 記 以 外 の 生 物 学 的 用 途 Other Use, Unclassified 上 記 以 外 の 用 途 PRP Properties 物 性 MSC Miscellaneous その 他 *1 表 中 の 備 考 欄 が 空 欄 の CAS ロールの 付 与 年 代 は,1967 年 以 降 *2 4 文 字 コード ( 網 がけのコード) はスーパーロール *3 PREP のロールは CAS 登 録 番 号 索 引 に 付 加 されている 接 尾 辞 P と 対 応 *4 Prophetic 物 質 の 詳 細 は p.2 参 照. 47
58 検 索 例 6 : クロスオーバー 検 索 検 索 例 6 : 検 索 例 5 で 得 られた 物 質 の 合 成 文 献 を 調 べる. ボタンを 使 い,REGISTRY ファイルから CAplus ファイルへクロスオーバーする. クロスオーバーする 際,Preparation ( 合 成 ) にチェックを 入 れることで 合 成 文 献 に 限 定 できる. < 検 索 例 5 の 回 答 集 合 > クリック チェックを 入 れた 回 答 のみを クロスオーバーすることもできる Preparation にチェックを 入 れることで, 合 成 文 献 に 限 定 することができる クリック 48
59 Hit 表 示 形 式 を 選 択 すると,サマリー 表 示 画 面 でヒットした 物 質 の CAS 登 録 番 号 と 構 造 が 確 認 できる 自 動 的 に CAplus ファイルに 入 り, (REFX L#)(U)(PREP)/RL が 実 行 される 参 考 : REFX コマンドを 用 いたクロスオーバー 検 索 上 記 の 検 索 を REFX コマンドを 用 いて 行 うこともできる. REFX コマンドは,ファイルを CAplus ファイルに 切 り 替 えてから 実 行 する. クロスオーバー 検 索 と 同 時 に CAS ロールで 限 定 する 場 合 (REFX L2)(U)PREP/RL * REFX コマンドの 前 後 の 括 弧 は 必 ず 必 要. クロスオーバー 検 索 した 後 に CAS ロールで 限 定 する 場 合 REFX L2 L3 L3 (U) PREP/RL 49
60 L3 でヒットした 回 答 例 ( 詳 細 表 示 ) : : : Show hit structures をクリックすると, ヒットした 物 質 の 構 造 図 が 表 示 される. 一 方,Hide hit structures をクリックす ると, 構 造 図 が 隠 れる. 常 に,ヒットした 物 質 の 構 造 図 を 表 示 す るには,Settings > Display > Specify hit structure の default display で Show hit structures にチェックを 付 ける : 50
61 参 考 : CAplus ファイルでの CAS 登 録 番 号 検 索 CAplus ファイルで 直 接 CAS 登 録 番 号 を 検 索 することもできるが, 検 索 式 により 検 索 対 象 が 異 なる. 検 索 式 によるヒット 対 象 ( 例 : ホルムアルデヒド ( )) CAplus ファイルで 実 行 する 検 索 式 レコードの 記 載 /IT P/IT D/IT DP/IT 標 題 / 抄 録 索 引 P - - (IT) D DP - - * 接 尾 辞 P : 合 成 文 献 D : 非 特 定 誘 導 体 DP : 非 特 定 誘 導 体 の 合 成 文 献 - 比 較 : REGISTRY ファイルから CAplus ファイルへクロスオーバー 検 索 した 場 合 ( 例 : L1 は REGISTRY ファイルでホルムアルデヒド ( ) を 検 索 した 結 果 ) CAplus ファイルで 実 行 する 検 索 式 レコードの 記 載 REFX L1 (REFX L1)(U)PREP/RL 標 題 / 抄 録 索 引 P (IT) D DP 合 成 文 献 を 検 索 ( P OR DP)/IT (REFX /RN)(U)PREP/RL と 同 じ 結 果 である 非 特 定 誘 導 体 の 文 献 を 検 索 ( D OR DP)/IT 非 特 定 誘 導 体 のみ 索 引 された 文 献 を 除 く /IT(NOTU)( D OR DP)/IT < 注 > CAplus ファイルで 直 接 CAS 登 録 番 号 を 検 索 する 場 合,ある CAS 登 録 番 号 が 非 優 先 CAS 登 録 番 号 だった 場 合 に, 優 先 CAS 登 録 番 号 は 自 動 的 には 含 まれない. 51
62 網 羅 的 な 化 学 物 質 調 査 STN 新 プラットフォームでは,REGISTRY ファイル 以 外 にも 構 造 検 索 な 可 能 なファイルがある. ファイルによって, 収 録 源, 収 録 年 代 等 が 異 なるため, 複 数 ファイルを 併 用 することでより 網 羅 的 な 化 学 物 質 調 査 となる. STN 新 プラットフォームで 構 造 検 索 可 能 なファイル (2016 年 8 月 ) ファイル 名 REGISTRY DCR REAXYSFILESub 収 録 内 容 CAplus ファイルに 収 録 された 特 許, 文 献 などから 収 録 された 特 定 物 質 の 物 質 同 定 情 報, 物 性 値 など 世 界 最 大 の 物 質 データベー スであり, 物 質 に 関 する 調 査 には 必 須 CAplus で 物 質 から 文 献 特 許 を 調 査 する 際 に 利 用 する ファイル DWPI 収 録 特 許 中 の 特 定 物 質 の 物 質 同 定 情 報 雑 誌, 特 許 ハンドブック 類 から 収 録 された 特 定 物 質 の 物 質 同 定 情 報 特 長 方 針 の 違 い, 収 録 対 象 国 の 違 い 等 より REGISTRY に 収 録 されていない 物 質 が 得 られ る 可 能 性 がある DWPI で 物 質 から 特 許 調 査 を する 際 に 利 用 するファイル REGISTRY よりも 古 い 年 代 の 情 報 が 収 録 され ている REAXYSFILEBib で 物 質 から 文 献 特 許 を 調 査 す る 際 に 利 用 するファイル レコード 構 成 化 学 物 質 単 位 化 学 物 質 単 位 化 学 物 質 単 位 収 録 期 間 1800 年 初 頭 ~ 1981 年 ~ 1771 年 ~ 収 録 件 数 1 億 8,400 万 件 以 上 270 万 件 以 上 2,730 万 件 以 上 更 新 頻 度 毎 日 週 1~2 回 毎 週 収 録 物 質 有 機 化 合 物 ポリマー 無 機 化 合 物 タンパク 質 核 酸 ファイル 名 MARPAT DWPIM 収 録 内 容 特 長 CAplus ファイルに 収 録 された 特 許 中 のマルクー シュ 構 造 マルクーシュ 構 造 を 対 象 に 構 造 検 索 できる 有 機 化 合 物 有 機 金 属 化 合 物 が 収 録 対 象 DWPI 収 録 特 許 のうち B,C,E セクションに 分 類 された 特 許 中 のマルクーシュ 構 造 マルクーシュ 構 造 を 対 象 に 構 造 検 索 できる MARPAT 収 録 対 象 外 の 無 機 化 合 物 や ポリマーも 収 録 レコード 構 成 マルクーシュ 構 造 単 位 マルクーシュ 構 造 単 位 収 録 期 間 1961 年 ~ 1961 年 ~ 収 録 件 数 113 万 件 以 上 198 万 件 以 上 更 新 頻 度 毎 日 週 1~2 回 収 録 物 質 有 機 化 合 物 ポリマー * 無 機 化 合 物 タンパク 質 核 酸 ( 低 分 子 ) (ペプチド) * B,C セクションのみ 52
63 各 ファイルで 物 質 を 検 索 した 後, 対 応 する 文 献 ファイルにクロスオーバーすることで, 物 質 に 関 する 文 献 情 報 を 得 ることができる. REGISTRY, MARPAT ファイルから CAplus ファイルへは,Get References ボタンまたは REFX コマンドでクロスオーバーできる. REGISTRY MARPAT REFX CAplus DCR, DWPIM ファイルから DWPI ファイルへは,Get References ボタンまたは REFX コマン ドでクロスオーバーできる. DCR DWPIM REFX DWPI REAXYSFILESub ファイルから REAXYSFILEBib ファイルへは,Get References ボタンまた は REFX コマンドでクロスオーバーできる. REAXYSFILESub REFX REAXYSFILEBib REGISTRY, MARPAT および DCR, DWPIM ファイルの 関 係 特 許 請 求 範 囲 [ 特 許 公 報 ] 実 施 例, 特 許 請 求 範 囲 特 許 情 報 ( 書 誌 情 報 や 抄 録 ) は CAplus,DWPI に 収 録 マルクーシュ 構 造 具 体 的 な 化 合 物 F O O MeO C C OMe 一 般 式 で 表 される 構 造 MARPAT DWPIM に 収 録 REGISTRY DCR に 収 録 i-pr N H 明 確 な 構 造 Pr-i MARPAT,DWPIM ファイルを 利 用 すると, 実 施 例 やクレーム 中 に 具 体 的 な 化 合 物 としては 記 載 されていないが,マルクーシュ 構 造 中 の 組 み 合 わせに 含 まれる 構 造 を 検 索 できる. 53
64 参 考 : CAplus から REGISTRY ファイルへのクロスオーバー 検 索 CAplus ファイルの 文 献 に 索 引 されている 化 学 物 質 の 調 査 CAplus ファイルのレコード 中 の 索 引 化 合 物 を REGISTRY ファイルで 確 認 するには,CAplus ファイルから REGISTRY ファイルへのクロスオーバー 検 索 を 実 行 する. 方 法 1 方 法 2 Get Substances ボタンをクリックする REGISTRY ファイルでクロスオーバー 検 索 を 実 行 する SUBX L1 * L1 は CAplus ファイルの 回 答 集 合 例 : 青 色 発 光 ダイオードの 文 献 を 検 索 し, 特 定 の 文 献 に 索 引 されている 化 学 物 質 を 調 査 する. 1. CAplus ファイルで, 青 色 発 光 ダイオードの 文 献 を 検 索 し,その 結 果 から 索 引 されている 物 質 を 確 認 したい 文 献 を 選 択 する. 2 Get Substances ボタンを クリックする 1 L 件 から, 索 引 物 質 を 確 認 したい 文 献 にチェックを 付 ける. ( 複 数 文 献 にチェックを 付 けることも 可 能 ) Get Substances ボタンを 用 いると, 選 択 した 回 答 のみをクロスオーバーすることができる 2. 自 動 的 に REGISTRY ファイルに 入 り,SUBX の 検 索 式 が 実 行 される. 1. で 選 択 した 文 献 のレコード 番 号 が 抽 出 され,SUBX 2015:12090/AN が 実 行 された 54
65 参 考 : REGISTRY から CAplus 以 外 のファイルへのクロスオーバー 検 索 CAS 登 録 番 号 の 収 録 率 が 低 い,または 収 録 されていないファイルで REGISTRY ファイルで 検 索 した 物 質 に 関 する 関 連 情 報 を 調 べる 場 合,Create Term List 機 能 を 利 用 する. REGISTRY ファイルには 物 質 の 同 義 名 も 多 数 収 録 されている. 化 学 物 質 名 をキーとして 利 用 することで,CAS 登 録 番 号 が 収 録 されていないファイルへのクロスオーバー 検 索 ができる. 検 索 の 流 れ Create Term List で REGISTRY ファイルの 回 答 集 合 から 化 学 物 質 名 (CN) および CAS 登 録 番 号 (RN) を 抽 出 する. 抽 出 した 情 報 を 検 索 する. 検 索 例 : クラリスロマイシン ( ) に 関 する 韓 国 特 許 を KRFULL ファイルで 調 査 する. 2 1 REGISTRY ファイルで CAS 登 録 番 号 を 検 索 Create Term List で 複 数 の 項 目 を 同 時 に 抽 出 したい 場 合 は,Advanced を 選 択 する 3 化 学 物 質 名 (CN) および CAS 登 録 番 号 (RN) に チェックを 入 れる 抽 出 されたタームには Q 番 号 が 付 与 される 55
66 Manage Term Lists で 抽 出 した タームの 一 覧 を 確 認 できる クエリーパネルには 自 動 的 に Q 番 号 が 入 力 される KRFULL ファイルに 切 り 替 える そのまま 検 索 すると, 抽 出 した フィールド (RN,CN) が 検 索 フィ ールドとなるため, 検 索 フィールド を 基 本 索 引 (/BI) に 変 更 する : クラリスロマイシンの 化 学 物 質 名 称 ( 同 義 名 を 含 む) および CAS 登 録 番 号 が 含 まれる 特 許 がヒットする : 56
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