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Transcription:

Applied Biosystems TaqMan SNP Genotyping Assays インターネット検索方法 2010/04/23

目次 TaqMan SNP Genotyping Assays の概要 --------------- 3 検索方法の流れ --------------- 4 TaqMan SNP Genotyping Assays 検索方法 --------------- 5 TaqMan SNP Genotyping Assays オーダー方法 --------------- 11 そのほかの検索方法 --------------- 19 2

TaqMan SNP Genotyping Assays の概要 SNPスクリーニング 疾患関連遺伝子候補領域探索 遺伝子絞込みのファインマッピング研究に最適 SNP 領域を検出するPCRプライマーとアレルを識別するTaqManプローブを1 本のチューブで提供 ゲノムDNAと試薬に混合するだけなので 条件検討やアッセイ構築の必要がありません 高い再現性と信頼性に優れた正確な結果を提供する 試薬デザイン TaqMan SNP Genotyping Assays は 高い信頼性をもつSNPタイピング試薬です 簡便なアッセイで再現性の高いSNPタイピングが可能です プライマーと 2 種類のTaqManプローブを利用してリアルタイムPCRシステムで解析します 目的のアッセイは およそ450 万種類のTaqMan SNP Genotyping Assaysから簡単に選択できます 遺伝子名やキーワード ゲノム領域など 様々な情報から目的のアッセイを簡単に検索できます 3

検索方法の流れ TaqMan SNP Genotyping Assay を検索するには? 以下のサイトへアクセスします https://products.appliedbiosystems.com/ab/en/us/adirect/ab?cmd=abgtk eywordsearch&catid=600769 ユーザー IDをお持ちでない方は 以下のアプライドバイオシステムズジャパン社ホームページの インターネットオーダーシステムご利用案内 よりユーザー IDの登録をお願いします 以下のサイトへアクセスします http://www.appliedbiosystems.co.jp/website/jp/store/pages.jsp?pgcd=15 4

TaqMan SNP Genotyping Assays 検索方法 キーワード検索 1 1. Keyword Search を選択します 2. Inのプルダウンメニュー をクリックして必要に応じて検索情報フィールドを選択します 3. Search forにキーワードを入力します キーワードの一部しか分からない場合は 入力したキーワードの後に * を入力することで曖昧検索ができます 4. 動物種を指定します 5. 必要に応じて 該当するチェックボックスをチェックします 6. Search ボタンをクリックします 5

TaqMan SNP Genotyping Assays 検索方法 キーワード検索 2 6. 検索結果が表示されます 使用した検索キーワードと検索結果が表示されます Inventoried または Made-to-Order の表示 アッセイタイプの表示 6 Assay ID リンクをクリックし 着目する SNP のより詳細な情報を確認

TaqMan SNP Genotyping Assays 検索方法 キーワード検索 3 アッセイタイプの確認 Availability が Made to Order のアッセイ TaqMan SNP Genotyping Assays, non-inventoried Availability が Inventoried のアッセイ TaqMan Drug Metabolism Genotyping Assays もしくは TaqMan SNP Genotyping Assays, Inventoried TaqMan SNP Genotyping Assays, non-inventoried TaqMan Drug Metabolism Genotyping Assays TaqMan SNP Genotyping Assays, Inventoried 注 )non-inventoried Assays Inventoried Assays Drug Metabolism Genotyping Assays は 商品番号 価格 反応数および納期に違いがあります 7

TaqMan SNP Genotyping Assays 検索方法 キーワード検索 4 7. アッセイの詳細情報画面 Alignment Map をクリックすると NCBI ゲノム地図上でアッセイのマップ情報が確認できます ( 次ページ ) アッセイ ID アッセイ ID に対応する各種情報の表示 db SNP に登録されている SNP 情報 (ssxxxxxx) NCBI ゲノム上での SNP の位置 マイナーアレルフリケンシー (SNP の頻度情報 情報のあるアッセイのみ ) ポリモリフィズム (A/G 等 ) 8

TaqMan SNP Genotyping Assays 検索方法 Aligment Map Aligment Map での確認 Aligment Map で NCBI ゲノムにマップされた情報をグラフィカルに確認することが出来ます 9

TaqMan SNP Genotyping Assays 検索方法 検索結果へ Return to Search Results で検索結果画面に戻ります 10

TaqMan SNP Genotyping Assays オーダー方法 1 ログインしていない場合は Store Log In します 11

TaqMan SNP Genotyping Assays オーダー方法 2 Username/Password は インターネットオーダー用のユーザー ID を使用 (4 ページ参照 ) Username Password を入力後 Login をクリック 12

TaqMan SNP Genotyping Assays オーダー方法 3 2Add to Basket をチェック 1 必要なアッセイのチェックボックスをチェック 13

TaqMan SNP Genotyping Assays オーダー方法 4 ShoppingBasket をクリック 14

TaqMan SNP Genotyping Assays オーダー方法 5 数量の更新 ショッピングバスケット内の製品の注文数を変更した場合 このボタンを押して下さい 削除 - 注文した製品 1 つ もしくは複数を削除することができます ご注文を先に進める場合 次へ ボタンを押します 検索した製品の詳細情報を見ることができます 数量を変更することができます 15 Mase to Order アッセイは スケールを変更することができます

TaqMan SNP Genotyping Assays オーダー方法 6 出荷情報 ページが表示されます お支払方法を確認後 次へをクリックして ご注文を続けます お支払方法について : お支払方法の Purchase Order の表示 Blanket Order の空欄はそのままで変更しないでください お名前には 登録ユーザーのお名前を半角のアルファベットでご入力下さい 16

TaqMan SNP Genotyping Assays オーダー方法 7 ご注文の確認を行います ご注文を完了するには ご注文 ボタンをクリックします 内容を修正したい場合は 戻る ボタンをクリックします 17

TaqMan SNP Genotyping Assays オーダー方法 8 ご注文ボタンを押すとご注文の確認ページが表示されます - ご注文が完了し 受注伝票番号が発行されます - 受注伝票番号が表示されます 番号をお控えください - 印刷用ページボタンを押すと印刷画面が表示されます - ご登録いただいたお客様のe-mailアドレスに確認メールが送信されます 18

TaqMan SNP Genotyping Assays 検索方法 Advanced Search 1 キーワード検索機能の Advanced Search を利用する場合 キーワード検索画面の Advanced Search をクリックすると 下記のようなオプションキーワード入力画面が出てくるので必要に応じて複数のキーワードを追加入力します 19

TaqMan SNP Genotyping Assays 検索方法 Advanced Search 2 キーワード検索機能でさらに条件を絞りこむ場合 検索対象を選択 All SNP Genotyping Assays Limit Assay Sets to: AB-Validated Assays HapMap JSNP DME SNP Type を選択 マイナーアレル頻度を選択 20

TaqMan SNP Genotyping Assays 検索方法 Batch ID サーチ 1 Batch ID での検索機能を利用する場合 Batch ID サーチの機能を利用すれば 複数のアッセイを同時に検索することが出来ます 検索したい SNP が複数あり 対応する db SNP ID 情報を持っているような場合に効果的です Batch ID サーチには 複数の ID を直接入力する検索方法 ( オプション 1) と 保存されたファイルを読み込みませて検索する方法 ( オプション 2) があります 1. Batch ID Search をクリックします 21

TaqMan SNP Genotyping Assays 検索方法 Batch ID サーチ 2 Batch ID での検索機能を利用する場合 2. オプション 1: 複数の ID を入力します ( コンマ スペース リターンで区切る ) 3. オプション 2: 参照 ボタンをクリックして お客様のローカル PC に保存されている ID リスト もしくは以前にサーチして得られたアッセイリストの Export ファイルを読み込みます Supported IDs dbsnp reference cluster or assay ID: < 例 > "rs2956" or "ss2985015" JSNP ID: < 例 > "IMS-JST016078" Celera hcv: < 例 > "hcv2697070" AB Assay ID: < 例 > "C 2697070_1_" Gene symbol: < 例 > "CALCA"* RefSeq accession number: < 例 > "NM_005795" Celera Gene (hcg): < 例 > "hcg31426" 4. Search ボタンをクリックします 22 検索後のご注文方法は P.11 オーダー方法を参照ください

研究用にのみ使用できます 診断目的およびその手続き上での使用は出来ません The PCR process and 5' nuclease process are covered by patents owned by Roche Molecular Systems, Inc. and F. Hoffmann-La Roche Ltd. TaqMan is a registered trademark of Roche Molecular Systems, Inc. 本誌に記載の社名および製品名は 弊社または各社の商標または登録商標です 23