Library Pocket Guide 2017.4 PubMed PubMed は アメリカの国立医学図書館 (NLM:National Library of Medicine) の National Center for Biotechnology Information(NCBI) が 作成公開している世界最大級の医学文献データベースです MEDLINE の文献情報の他 関連分野の文献情報も探せます I. PubMed とは医学 看護学 歯学 獣医学 ヘルスケア分野の文献データベースです 1940 年代後半に出版された雑誌論文の情報を探せます 詳しくは PubMed の Fact Sheet (http://www.nlm.nih.gov/pubs/factsheets/pubmed.html) をご覧ください II. 検索する 画面上部の検索ボックスにキーワードを入れて検索します 検索ボックス PubMed のシソーラス用語を調べるには MeSH Database を使います PubMed で探せる雑誌は Journals in NCBI Databases で確認できます PubMed Tutorials には PubMed の使い方が掲載されています Clinical Queries は次の 3 つについて手早く探す際に便利です 疑問の種類 ( 治療 診断 病因 予後) システマティックレビュー 遺伝医学分野 1/8
検索結果の件数が左上に表示されます 検索結果は出版年の新しい順に並びます Summary Abstract に変更すると 抄録も一覧表示できます 2 つ以上のキーワードを組み合わせて検索する場合は Advanced へ 選択した論文をファイルにする 印刷する 文献検索管理ソフトへ移動する場合は Send to をクリック 結果を論文の種類対象者年齢等絞り込む場合 タイトル ( 青字のリンク ) をクリック すると 1 件ずつ詳細な画面に もう少し下に 自分が入れたキーワードがどのように検索されたかを示す Search Details が表示されます e-journal 図書館に雑誌があるか の確認はこのアイコンをクリックします この例では influenza と検索しました それ以外の言葉にも変化させながら検索している様子がわかります Publication Types, MeSH Terms については 次ページで説明します 2/8
PubMed のキーワード集 (MeSH) を使って検索する 1) MeSH について検索結果を詳細画面にすると abstract の下に Publication Types, MeSH Terms と書かれていて クリックすると下図のような言葉のリストが表示される場合があります これは PubMed で各論文に付与しているキーワード :MeSH(Medical Subject Headings) です PubMed では 独自のキーワード集 :MeSH データベースを作成していて 論文の内容にあった MeSH を選び 各論文に付与します この論文の内容を表す MeSH です 論文で主に書かれている内容を示す MeSH には * がついています 例えば 乳がんについて書いた論文 1は breast cancer 論文 2は breast neoplasm と書いていた場合 両方に breast neoplasms という MeSH を付与しています これによって 言葉は異なる 2 つの論文を breast neoplasms という MeSH を使って検索することで探し当てることができます 2) MeSH を使って検索するまずは自分が考えている概念に近い MeSH を MeSH データベース (PubMed のシソーラス用語を探すデータベース ) で探します 検索ボックスの上に PubMed と書かれたプルダウンタブがありますので ここで MeSH を選択し 思いつく英単語を入れてから Search ボタンをクリックして MeSH データベースを表示させます 3/8
MeSH の詳細画面が表示されます その MeSH について 特定の角度から見た論文を探すときは ここにチェックを入れます Restrict to MeSH major Topic をチェックすると この MeSH を主に扱った論文だけに絞り込めます これらの言葉が PubMed で検索されたとき PubMed は自動的に相当する MeSH に置き換えて検索します ( ここでの場合 Rhinitis, Allergic ) MeSH は大きな概念から小さな概念へと木が枝分かれしていく構造になっています ここでは複数の枝 にこの MeSH があることがわかります 詳細表示した MeSH で PubMed を検索します 画面右の Add to search builder search Pubmed の順にボタンを押すと PubMed の検索結果画面に切り替わります 4/8
Add to search builder Search PubMed の順でクリックすると この MeSH で PubMed を検索します ここでは subheadings の therapy にチェックを入れてから Add to search builder をクリックしたので 季節性鼻アレルギーの治療の側面からこの MeSH を検索する式ができました III. 2 つ以上の言葉を組み合わせて検索する 1) Advanced Search 画面 2 つ以上の言葉を組み合わせて検索するには Advanced Search を使います 検索ボックス著者名に 雑誌名が といった指定をした検索も可 検索結果の履歴がここに表示されます 2) 論理演算子で検索結果を組み合わせる 検索履歴に示された各検索の番号 (# で始まる番号 ) を論理演算子 (AND, OR, NOT) で組み合わせて検索をします 検索式は検索ボックスに直接入力するか 次の方法で論理演算子を選択しながら入力します ( 例 1)#1 AND #2 ( 例 2)#1 OR #2 ( 例 3)#1 NOT #2 両方の検索結果を含むものを探す 両方の検索結果を足す #1 であって #2 ではないもの #1 の検索結果 #2 の検索結果 #1 の検索結果 #2 の検索結果 #1 の検索結果 #2 の検索結果 5/8
各検索結果の Add をクリックすると 上の検索ボックスに検索式が入力されていきます AND はプルダウンすると OR,NOT も選択できます 組み合わせる検索式はここに入力されます AND, OR,NOT を選びます Add をクリックしてから Builder で論理演算子を選択します IV. 検索結果を表示 印刷 エクスポートする 検索結果をファイルにまとめてダウンロード メールで送る あるいは RefWorks 等の文献管理ソフトに入れるには Send to からメニューを選択します 文献管理ソフトへ入れる場合 は Citation manager を選択 RefWorks には一度に 200 件まで文献を追加できます V. My NCBI MyNCBI にアカウントを作ると 検索結果や検索式を保存 表示項目のカスタマイズ 保存した検索式の検索結果を定期的にメールで知らせる等 便利な機能が使えるようになります アカウントの作成は画面右上の Sign in to MyNCBI から行います 6/8
1) 新規アカウント作成 あるいは Google アカウントでログイン新規にアカウントを作成する場合は Sign in directory to NCBI の Google アカウントで利用する場合は Register for an NCBI account こちらから をクリックし 登録を行います Sign in with Google より Google のアカウント ID とパスワードで MY NCBI を使用することもできま PubMed にアカウントを作成する場す 合はこちらから ログイン後に PubMed 画面右上に表示される My NCBI をクリックすると 登録した検索式の編集 フィルター設定 検索履歴の確認等ができる管理画面が表示されます 2) 検索式の保存 検索式を保存するには 保存したい検索式を検索ボックスに表示させたまま Create alert をクリックして画面に従って操作します あるいは Advanced Search の History から最終検索式 ( 自分の見たい結果が出た式 ) の番号の上でマウスを左クリックします 検索式を作る時と同じリスト (Options) が表示されます 一番したに Save in My NCBI とあるので ここをクリックします 保存する画面が表示されますので 名前を付けて Save します 7/8
検索式を保存する際に 定期的に検索結果をメール受け取るかどうかの設定画面が開きますので必要に応じて設定します 3) フィルターの設定検索結果の右側に表示されるフィルターの設定は MyNCBI にログインして行います 研究方法 言語 対象等 自分が使い易い絞込項目を設定できます Manage Filter をクリックすると My NCBI の管理画面が開き ここで設定できます 8/8