たいとる

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1 神経 筋疾患患者レジストリーの運用と展開のための遺伝子 診断システムに関する研究 遺伝子診断に関する情報提供について 分担研究者南成祐 1,2,3 共同研究者村山久美子 2,4 1 国立精神 神経医療研究センター病院臨床検査部遺伝子検査診断室 2 国立精神 神経医療研究センタートランスレーショナルメテ ィカルセンター臨床開発部 3 国立精神 神経医療研究センター神経研究所疾病研究第一部 4 国立精神 神経医療研究センター神経研究所疾病研究第二部

2 分担 ( 南 ) 1. 遺伝子解析部門の検体受付 DNA 調製を遂行 2. 眼咽頭筋ジストロフィー登録に向けた検討 3. 遺伝子検査の情報提供 ( 実施施設など ) 4. 遺伝子診断研究

3 背景 治療 Remudy 患者レジストリー 遺伝子解析部門 ( ジストロフィンシーケンス解析 ) 日常診療としての遺伝子診断

4 遺伝子診断をしたいとき 依頼ルートが様々 保険収載 検査会社 先進医療 自施設ラボ 自由診療 外部の研究ラボ 研究費負担 研究班での対応 無償 ( 先方負担 ) 海外に依頼

5 どうしていますか? インターネットを探す いでんネットなど メーリングリストで質問する 小児神経学会員蔵王セミナー 知っていそうな人に聞く 論文を探して著者にあたる 国内がなさそうなら 海外も探す

6 方法 インターネットに散在する実施施設情報か ら筋疾患に関するものを調査し 紹介する

7 調査対象 1. 検査実施施設 受託情報 検査会社 実施施設データベース ( いでんネット ) 受託代行ネットワーク ( オーファンネット シ ャハ ン ) 学会による情報提供 海外 その他 1. 検査実施者に役立つサイト 各種データベース ( 遺伝子 疾患 変異 多型 ) プライマー設計ツール 変異の悪性度予測ツール スプライシング異常予測ツール その他

8 G&G サイエンス株式会社 検査会社

9 検査会社受託検査 筋疾患項目名 保険適用 方法 SRL LSI G&G BML ファルコラホ コーフ シ ストロフィノハ チー ( 欠失 重複 ) MLPA 福山型 (3 kb 挿入 ) PCR 筋強直性シ ストロフィー 1 型 ササ ンフ ロット * ミトコント リアDNA 点変異 (61 種セット ) PCR-Luminex (10 種セット ) インヘ ータ ー ( 各種 ) PCR-RFLP gfcs ミトコント リアDNA 欠失 ササ ンフ ロット 脊髄性筋萎縮症? 球脊髄性筋萎縮症 PCR CMT1A 型 1B 型 X 型 PCR/ シークエンス * 保険適用の筋疾患 ポンペ病以外は受託がある * 非正式項目

10 いでんネット ( 臨床遺伝医学情報網 ) 年設立 ヒト Germline 遺伝子 染色体検査オンラインデータベース

11 いでんネット ヒト Germline 遺伝子 染色体検査オンラインデータベース 筋疾患 保険収載 登録施設数 ジストロフィノパチー 9 Emery-Dreifuss 型筋ジストロフィー 1 肢帯型筋ジストロフィー 2A 1 福山型先天性筋ジストロフィー 3 Muscle-eye-brain 病, 軽症型 WWS 1 眼咽頭筋ジストロフィー 2 RV 型遠位型ミオパチー 1 筋強直性ジストロフィー 4 糖原病 Ⅱ 型 ( ポンペ病 ) 1 糖原病 Ⅲ 型 1 糖原病 Ⅶ 型 ( 垂井病 ) 1 糖原病 Ⅷ 1 低カリウム性周期性四肢麻痺 1 ミトコンドリア病 登録施設数 MELAS 5 MERRF 2 KSS/CPEO 1 Leigh 症候群 1 神経原性筋萎縮 登録施設数 脊髄性筋萎縮症 5 球脊髄性筋萎縮症 3 家族性 ALS 1 CMT 1A 1 DRPLA 7 日本でただ 1 つの遺伝学的検査実施施設データベース 情報が一部古くなっている ( 登録者が放置 失念 離職?)

12 NPO 法人 オーファンネット ジャパン 年設立 受託業務代行 検査ネットワーキング事業

13 オーファンネット ジャパン提供検査 筋疾患ジストロフィノパチー 遺伝子 DMD 方法 : シーケンス解析全翻訳領域ピンポイント 料金 ( 税込 ) 108,000 円 27,000 円 その他 Barth 症候群 CPT2 欠損症 遺伝子 TAZ CPT2 方法 : シーケンス解析全翻訳領域ピンポイント全翻訳領域ピンポイント 料金 ( 税込 ) 68,000 円 33,000 円 68,000 円 33,000 円 ジストロフィンのシークエンス解析の依頼が可能 検査項目 (= 参加施設 ) の増加が望まれる

14 学術団体による情報提供 名称 小児神経学会 神経学会 提供情報 特殊生化学検査を受託できる機関リスト 2010 年度版 書籍 神経疾患の遺伝子診断ガイドライン 2009 PDF 検査項目の有無 備考 会員ログインが必要 厚労科研費研究班による遺伝子検査の連絡先 : 遺伝性痙性対麻痺 プリオン病 CMT 病 遺伝子医療部門連絡会議 遺伝子医療実施施設検索システム 例えば ミオパチー の遺伝子検査をしている病院を探せる 検査ラボの情報はない 人類遺伝学会 なし 遺伝カウンセリンク 学会 なし 遺伝子診療学会 なし

15 日本小児神経学会 特殊検査を受託できる機関リスト 2010 年度版 筋疾患 保険収載 ジストロフィノパチー 4 施設数方法 multiplex PCR MLPA シーケンス 連鎖解析 福山型筋ジストロフィー 2 3kb 検出 PCR ハフ ロタイフ 顔面肩甲上腕型筋シ ストロフィー 1A 1 サザンブロット PCR 眼咽頭筋ジストロフィー 1 3 塩基リピートPCR 筋強直性ジストロフィー 1 3 塩基リピートPCR 脊髄性筋萎縮症 2 PCR 球脊髄性筋萎縮症 Kennedy 病 1 3 塩基リピートPCR Leigh 症候群 1 9 種変異検索 CPT II 欠損症 1 遺伝子解析 先天代謝異常症 糖原病 Ⅱ 型 ( ポンペ病 ) 3 施設数方法 白血球活性測定 (2 施設 ) 遺伝子解析 (1 施設 ) 変性疾患 先天代謝異常症 奇形症候群 てんかん等の情報は豊富 情報が一部古くなっている (2010 年 ) / 会員ログインが必要

16 疾患 保険収載 検査会社 オーファンネット いでんネット 小児神経学会 1 ジストロフィノパチー MLPA 3? 1 ジストロフィノパチーシーケンス ジストロフィノパチー連鎖解析 Emery-Dreifuss 型筋ジストロフィー 肢帯型筋ジストロフィー 1C 1 4 肢帯型筋ジストロフィー 2A 福山型先天性筋ジストロフィー Muscle-eye-brain 病 軽症型 WWS 1 7 顔面肩甲上腕型筋ジストロフィー 1A 眼咽頭筋ジストロフィー Rimmed vacuole 型遠位型ミオパチー 筋強直性ジストロフィー 1 型 糖原病 Ⅱ 型 ポンペ病 1 12 糖原病 Ⅲ 型 1 13 糖原病 Ⅶ 垂井病 1 14 糖原病 Ⅷ 1 15 Danon 病 1 16 低カリウム性周期性四肢麻痺 1 17 MELAS MERRF KSS/CPEO Leigh 症候群 脊髄性筋萎縮症 1, 2, 3 型 球脊髄性筋萎縮症 家族性 ALS 1 24 CMT 1A DRPLA 7 26 CPT2 欠損症 Prader-Willi 症候群 / Angelman 症候群 2 NCNP

17 海外の状況 GeneTests GENDIA ト ) EDDNAL 国際的検査施設データベース 個別に連絡をとり依頼 GENetic DIAgnostic Network 国際的検査施設ネットワーク ( コーテ ィネー ( 有 ) 胎児生命科学センターを通じて依頼可能 European Directory of DNA diagnostic Laboratories 欧州内検査施設データベース

18 海外の遺伝学的検査データベースの掲載数調査 GeneTable of Neuromuscular Disorders ( 1. 筋ジストロフィー 7. イオンチャンネル筋疾患 13. 遺伝性運動失調症 2. 先天性筋ジストロフィー 8. 悪性高熱 14. HMSN 3. 先天性ミオパチー 9. 代謝性筋疾患 15. 遺伝性対麻痺 4. 遠位型ミオパチー 10. 遺伝性心筋症 16. その他の神経筋疾患 5. その他のミオパチー 11. 先天性筋無力症候群 6. 筋強直症候群 12. 運動ニューロン病 213 疾患 遺伝学的検査 GeneTests GENDIA EDDNAL 提供 依頼先あり なし 筋疾患だけでなく あらゆる遺伝性疾患の依頼先が掲載されている 有償が大半

19 分かったこと 1. 情報が散在していてなおかつ重複もある 2. 非商業サイトは 情報アップデートに難がある 3. 研究室単体での受託情報公開はほとんどない 4. GeneTestsはほとんどの疾患がある ( 有償が大半 ) 5. 検索エンジンでは 受託情報にたどりつきにくい 例 ) 疾患名 & 遺伝子検査 無関係なものが多数ヒット

20 調査対象 1. 検査実施施設 受託情報 検査会社 実施施設データベース ( いでんネット ) 受託代行ネットワーク ( オーファンネット シ ャハ ン ) 学会による情報提供 海外 その他 1. 検査実施者に役立つサイト 各種データベース ( 遺伝子 疾患 変異 多型 ) プライマー設計ツール 変異の悪性度予測ツール スプライシング異常予測ツール その他

21 今後 情報サイトを分かりやすく紹介するリンク集の提供

22 NCNP 遺伝子検査診断室 疾患名保険収載解析項目外部からの利用欠失 重複 MLPA 解析原則不可ジストロフィノパチー DNA 多型連鎖解析可 Emery-Dreifuss 型筋ジストロフィー 翻訳領域シーケンス 原則 筋病理診断例 肢帯型筋ジストロフィー 1C 翻訳領域シーケンス 原則 筋病理診断例 肢帯型筋ジストロフィー 2A 高頻度変異 ( 現在 翻訳領域シーケンス ) 原則 筋病理診断例 福山型先天性筋ジストロフィー 3 kb 挿入配列 PCR 原則不可 顔面肩甲上腕型筋ジストロフィー 3.3 kbリピートの短縮サザン 相談 眼咽頭型筋ジストロフィー 3 塩基リピート 可 X 連鎖性ミオチュブラーミオパチー 翻訳領域シーケンス 原則 筋病理診断例 原則 筋病理診断例 ( 現在 原則受け入れ ) 縁取り空胞を伴う遠位型ミオパチー翻訳領域シーケンス Danon 病 翻訳領域シーケンス 原則 筋病理診断例 MELAS 3243 変異 3271 変異 他 可 MERRF 8344 変異 8356 変異 他 可 CPEO Kearns-Sayre 症候群 欠失 重複 可 Leigh 症候群 8993 変異 可 Leber 病 変異 可 球脊髄性筋萎縮症 Kennedy 病 3 塩基リピート 可 ( 現在 原則不可 ) DRPLA 3 塩基リピート 可 自施設ウェブサイト内に検査受託情報を掲載している 情報が一部古くなっている

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